LONB - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

LONB - Archaeal Lon protease

UniProt:	Q9HSC3	Sequences: MSNESTNDAPPDDDPDDPEPSVDHDDTDGLQDDPADSVDDAGEVDDLENLGSDVGVEGDVSIDEDNAEDDLLGGLRIDDTSDITVPDRLVDQVIGQEAAREIVKRAAKQHRHVMMIGSPGTGKSLLAKAMSRLLPKESLQDVLVYHNPDDSNEPKVRTVPAGKGEQIVDAHKEEARKRNQMRSFLMWIMILLAVGYALLIATPARPLLALLSAAGIYLLFRYTNRGSDAMVPKLLINNADRQVAPFEDATGAHAGAMLGDVRHDPFQSGGMATPSHERVEAGSIQKANKGVLFIDEINTLDVRSQQKLMTAIQEGEFSITGQSERSSGAMVQTEAVPCDFIMVAAGNMDAMENMHPALRSRIKGYGYEVYMDDTIEDTPDMRRKYARFVAQEVEKDGNLPHFAPDAIRELILEAKRRAGRKDSLTLKLRDLGGLVRVAGDIARSEGHDLTQRSDVLEAKKRSRSIEQQFVDNYIQRRKDYELGTTSEEAVGRVNGLAVMGGDSGIMLPVMAEITPAQSQEEGRIYATGQLKEMAEEAVENVSAIIKKFSDENMSEKDTHIQFVQAGEGGVDGDSASITVATAVISALEDIPVAQELAMTGSLSVRGDVLPVGGVTHKIEAAAKAGCERVIIPKANEDDVMIEDEYEEQIEIIPVTHISEVLDVALVGEPEKDSLVDRLKSITGKALDSASDSGTTGGNPSPQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	702 (598)
Sequences:	736 (524)
Seq/√Len:	21.4

HALSA - LONB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
402_F	450_T	5.640	1.00
447_H	454_D	4.773	1.00
581_T	660_V	4.599	1.00
611_V	614_V	4.463	1.00
515_P	586_A	4.295	1.00
508_P	511_A	4.005	1.00
506_M	510_M	3.955	1.00
505_I	508_P	3.854	1.00
506_M	511_A	3.798	1.00
577_I	660_V	3.755	1.00
577_I	581_T	3.675	1.00
633_K	655_T	3.604	1.00
505_I	510_M	3.566	1.00
505_I	511_A	3.513	1.00
510_M	516_A	3.329	1.00
508_P	516_A	3.315	1.00
596_L	652_I	3.264	1.00
506_M	516_A	3.258	1.00
164_G	234_L	3.244	1.00
548_F	684_K	3.156	1.00
506_M	509_V	3.138	1.00
131_S	134_L	3.110	1.00
624_A	627_E	3.099	1.00
533_M	571_D	3.079	1.00
504_G	508_P	3.075	1.00
685_A	689_A	3.043	0.99
603_S	607_D	2.987	0.99
403_A	451_Q	2.978	0.99
482_L	603_S	2.937	0.99
681_I	685_A	2.897	0.99
269_G	273_T	2.873	0.99
508_P	520_E	2.793	0.99
593_A	626_C	2.778	0.99
655_T	659_E	2.724	0.99
577_I	608_V	2.696	0.99
548_F	658_S	2.672	0.99
445_E	454_D	2.652	0.99
590_I	683_G	2.637	0.99
658_S	684_K	2.633	0.98
504_G	510_M	2.625	0.98
595_E	626_C	2.563	0.98
505_I	516_A	2.531	0.98
101_E	461_R	2.525	0.98
511_A	516_A	2.521	0.98
311_A	338_C	2.516	0.98
504_G	511_A	2.504	0.98
510_M	520_E	2.483	0.98
508_P	513_I	2.452	0.98
506_M	520_E	2.451	0.98
376_E	423_S	2.427	0.97
511_A	520_E	2.422	0.97
159_V	167_I	2.414	0.97
508_P	515_P	2.410	0.97
140_Q	158_T	2.407	0.97
623_K	644_E	2.395	0.97
505_I	509_V	2.374	0.97
503_S	506_M	2.369	0.97
423_S	475_Q	2.325	0.97
598_M	660_V	2.294	0.96
115_M	127_A	2.270	0.96
511_A	515_P	2.255	0.96
622_A	648_Q	2.233	0.96
504_G	509_V	2.189	0.95
505_I	520_E	2.180	0.95
509_V	516_A	2.172	0.95
503_S	508_P	2.153	0.95
623_K	642_E	2.152	0.95
504_G	516_A	2.127	0.94
258_L	304_S	2.110	0.94
386_A	407_I	2.091	0.94
510_M	513_I	2.086	0.94
456_L	460_K	2.059	0.93
509_V	520_E	2.026	0.93
506_M	515_P	2.007	0.92
578_T	660_V	1.996	0.92
412_L	640_M	1.992	0.92
610_P	634_A	1.992	0.92
142_V	156_V	1.990	0.92
511_A	514_T	1.979	0.92
558_T	583_V	1.966	0.92
513_I	516_A	1.963	0.92
578_T	581_T	1.949	0.91
441_I	461_R	1.940	0.91
123_K	345_A	1.938	0.91
581_T	598_M	1.917	0.91
156_V	336_V	1.880	0.90
673_S	677_R	1.870	0.89
145_Y	157_R	1.866	0.89
592_V	595_E	1.864	0.89
506_M	513_I	1.860	0.89
490_V	588_E	1.853	0.89
295_D	298_N	1.849	0.89
505_I	513_I	1.845	0.89
596_L	663_V	1.844	0.89
618_I	631_I	1.832	0.88
389_V	410_L	1.829	0.88
249_A	283_S	1.823	0.88
130_M	134_L	1.822	0.88
409_E	456_L	1.807	0.88
577_I	598_M	1.807	0.88
416_R	619_E	1.802	0.88
516_A	520_E	1.793	0.87
577_I	602_L	1.776	0.87
662_D	668_E	1.759	0.86
377_D	415_K	1.753	0.86
676_D	691_D	1.729	0.85
401_H	449_L	1.721	0.85
105_R	367_Y	1.721	0.85
510_M	515_P	1.699	0.84
576_S	602_L	1.692	0.84
636_E	653_P	1.691	0.84
508_P	514_T	1.679	0.83
439_G	450_T	1.673	0.83
296_E	350_A	1.628	0.81
509_V	513_I	1.626	0.81
402_F	455_V	1.622	0.81
441_I	457_E	1.617	0.81
670_E	676_D	1.612	0.81
497_A	509_V	1.601	0.80
674_L	680_S	1.601	0.80
163_K	166_Q	1.592	0.80
283_S	286_K	1.581	0.79
526_A	535_E	1.580	0.79
678_L	691_D	1.568	0.79
131_S	135_P	1.559	0.78
611_V	615_T	1.559	0.78
679_K	682_T	1.555	0.78
503_S	516_A	1.544	0.78
139_L	243_V	1.543	0.78
503_S	509_V	1.541	0.78
505_I	512_E	1.532	0.77
503_S	510_M	1.510	0.76
654_V	659_E	1.508	0.76
523_R	526_A	1.503	0.76
427_K	430_D	1.496	0.76
508_P	512_E	1.491	0.75
126_L	130_M	1.490	0.75
372_D	472_N	1.488	0.75
504_G	520_E	1.483	0.75
580_A	602_L	1.474	0.74
385_Y	414_A	1.466	0.74
333_T	336_V	1.461	0.74
127_A	131_S	1.454	0.73
504_G	515_P	1.446	0.73
366_G	433_G	1.430	0.72
285_Q	337_P	1.427	0.72
178_R	183_S	1.418	0.71
505_I	515_P	1.415	0.71
420_R	479_D	1.413	0.71
503_S	511_A	1.398	0.70
681_I	686_L	1.388	0.70
676_D	682_T	1.384	0.70
367_Y	440_D	1.377	0.69
528_G	565_A	1.375	0.69
670_E	691_D	1.354	0.68
451_Q	454_D	1.351	0.68
682_T	691_D	1.349	0.68
377_D	640_M	1.347	0.67
456_L	643_D	1.345	0.67
514_T	547_K	1.338	0.67
374_T	472_N	1.338	0.67
270_G	273_T	1.336	0.67
315_G	339_D	1.324	0.66
515_P	520_E	1.321	0.66
134_L	137_E	1.320	0.66
377_D	412_L	1.305	0.65
690_S	693_G	1.303	0.65
450_T	455_V	1.302	0.65
568_G	571_D	1.297	0.64
552_N	688_S	1.296	0.64
150_D	153_E	1.294	0.64
403_A	449_L	1.292	0.64
531_K	562_F	1.290	0.64
101_E	464_S	1.289	0.64
506_M	512_E	1.286	0.64
590_I	686_L	1.286	0.64
493_V	592_V	1.283	0.64
284_I	338_C	1.283	0.64
422_D	637_D	1.277	0.63
309_M	609_L	1.273	0.63
685_A	688_S	1.271	0.63
420_R	638_D	1.270	0.63
133_L	137_E	1.263	0.62
488_E	666_V	1.263	0.62
601_S	609_L	1.260	0.62
237_N	241_R	1.259	0.62
643_D	647_E	1.255	0.62
509_V	515_P	1.252	0.62
385_Y	389_V	1.245	0.61
672_D	688_S	1.244	0.61
377_D	382_R	1.241	0.61
408_R	584_I	1.240	0.61
121_T	372_D	1.240	0.61
490_V	589_D	1.238	0.61
167_I	232_P	1.233	0.60
238_N	241_R	1.230	0.60
138_S	243_V	1.225	0.60
293_F	345_A	1.223	0.60
333_T	340_F	1.223	0.60
495_G	511_A	1.214	0.59
143_L	159_V	1.210	0.59
348_M	352_E	1.210	0.59
502_D	506_M	1.205	0.59
115_M	123_K	1.204	0.58
409_E	412_L	1.202	0.58
680_S	685_A	1.202	0.58
393_V	401_H	1.197	0.58
678_L	685_A	1.196	0.58
285_Q	338_C	1.191	0.58
630_I	657_I	1.187	0.57
142_V	336_V	1.187	0.57
103_V	369_V	1.182	0.57
171_H	232_P	1.179	0.57
510_M	514_T	1.164	0.56
236_I	281_A	1.162	0.56
477_R	558_T	1.157	0.55
130_M	293_F	1.155	0.55
592_V	665_L	1.151	0.55
662_D	669_P	1.141	0.54
581_T	664_A	1.138	0.54
118_S	123_K	1.134	0.54
138_S	570_V	1.132	0.54
537_A	577_I	1.132	0.54
672_D	678_L	1.127	0.53
532_E	571_D	1.115	0.53
670_E	679_K	1.112	0.52
484_T	489_A	1.112	0.52
507_L	510_M	1.101	0.52
577_I	654_V	1.099	0.52
457_E	461_R	1.098	0.51
422_D	479_D	1.094	0.51
615_T	640_M	1.090	0.51
440_D	444_S	1.086	0.51
488_E	593_A	1.085	0.51
385_Y	392_E	1.084	0.51
661_L	665_L	1.082	0.50
183_S	497_A	1.081	0.50
410_L	434_L	1.078	0.50
250_T	314_E	1.071	0.50
154_P	333_T	1.068	0.49
689_A	693_G	1.066	0.49
675_V	680_S	1.063	0.49
251_G	254_A	1.059	0.49
121_T	125_L	1.058	0.49
665_L	683_G	1.057	0.49
129_A	134_L	1.054	0.48
598_M	659_E	1.053	0.48
408_R	640_M	1.053	0.48
515_P	583_V	1.052	0.48
678_L	682_T	1.052	0.48
493_V	582_A	1.049	0.48
147_N	154_P	1.048	0.48
584_I	661_L	1.046	0.48
523_R	549_S	1.046	0.48
143_L	235_L	1.046	0.48
124_S	127_A	1.043	0.48
407_I	455_V	1.042	0.48
343_V	452_R	1.042	0.48
506_M	514_T	1.040	0.48
124_S	131_S	1.039	0.47
672_D	676_D	1.035	0.47
333_T	338_C	1.034	0.47
399_L	442_A	1.034	0.47
598_M	630_I	1.034	0.47
165_E	237_N	1.032	0.47
516_A	546_K	1.030	0.47
445_E	457_E	1.028	0.47
346_G	361_R	1.028	0.47
432_G	436_R	1.027	0.47
525_Y	530_L	1.021	0.46
687_D	691_D	1.019	0.46
455_V	458_A	1.018	0.46
590_I	667_G	1.018	0.46
429_R	433_G	1.013	0.46
402_F	406_A	1.012	0.46
142_V	158_T	1.011	0.46
670_E	678_L	1.005	0.45
571_D	578_T	0.999	0.45
577_I	657_I	0.991	0.44
529_Q	539_E	0.986	0.44
501_G	506_M	0.980	0.44
489_A	492_R	0.978	0.43
408_R	560_I	0.976	0.43
237_N	240_D	0.974	0.43
495_G	548_F	0.972	0.43
670_E	687_D	0.964	0.43
470_V	526_A	0.963	0.42
676_D	687_D	0.962	0.42
405_D	451_Q	0.960	0.42
143_L	232_P	0.959	0.42
670_E	682_T	0.957	0.42
507_L	511_A	0.954	0.42
504_G	513_I	0.952	0.42
142_V	337_P	0.951	0.42
504_G	507_L	0.950	0.42
433_G	436_R	0.949	0.42
406_A	409_E	0.948	0.41
614_V	631_I	0.946	0.41
503_S	515_P	0.934	0.41
172_K	231_V	0.934	0.41
514_T	520_E	0.934	0.41
561_Q	580_A	0.933	0.40
380_D	384_K	0.930	0.40
526_A	530_L	0.927	0.40
661_L	683_G	0.925	0.40
413_E	417_R	0.924	0.40
139_L	244_A	0.923	0.40
495_G	658_S	0.923	0.40
499_M	571_D	0.920	0.40
502_D	508_P	0.918	0.40
502_D	505_I	0.917	0.39
375_I	426_L	0.917	0.39
294_I	344_A	0.912	0.39
477_R	616_H	0.909	0.39
549_S	553_M	0.906	0.39
588_E	667_G	0.903	0.39
512_E	516_A	0.902	0.39
130_M	135_P	0.900	0.38
312_I	342_M	0.896	0.38
167_I	336_V	0.894	0.38
155_K	334_E	0.892	0.38
537_A	571_D	0.892	0.38
214_A	475_Q	0.891	0.38
281_A	285_Q	0.891	0.38
684_K	687_D	0.889	0.38
168_V	234_L	0.886	0.37
452_R	671_K	0.886	0.37
228_D	275_S	0.884	0.37
234_L	559_H	0.883	0.37
676_D	680_S	0.883	0.37
388_F	428_L	0.879	0.37
520_E	526_A	0.878	0.37
654_V	660_V	0.876	0.37
522_G	526_A	0.875	0.37
268_S	273_T	0.874	0.37
615_T	618_I	0.872	0.37
425_T	439_G	0.869	0.36
327_S	330_M	0.866	0.36
390_A	394_E	0.866	0.36
581_T	592_V	0.862	0.36
224_N	660_V	0.861	0.36
630_I	653_P	0.859	0.36
463_R	642_E	0.858	0.36
548_F	656_H	0.856	0.36
438_A	455_V	0.852	0.35
525_Y	651_I	0.851	0.35
550_D	690_S	0.851	0.35
237_N	242_Q	0.846	0.35
630_I	661_L	0.845	0.35
602_L	660_V	0.842	0.35
497_A	507_L	0.842	0.35
198_L	208_L	0.840	0.35
248_D	295_D	0.839	0.35
115_M	121_T	0.839	0.35
584_I	683_G	0.839	0.35
293_F	406_A	0.836	0.34
523_R	527_T	0.831	0.34
326_S	329_A	0.830	0.34
527_T	530_L	0.829	0.34
374_T	659_E	0.829	0.34
93_V	638_D	0.826	0.34
169_D	383_R	0.822	0.34
389_V	453_S	0.820	0.33
592_V	661_L	0.820	0.33
342_M	591_P	0.815	0.33
405_D	452_R	0.814	0.33
526_A	529_Q	0.812	0.33
633_K	636_E	0.811	0.33
526_A	660_V	0.809	0.33
389_V	435_V	0.809	0.33
578_T	630_I	0.806	0.33
602_L	608_V	0.805	0.33
143_L	291_V	0.802	0.32
561_Q	661_L	0.802	0.32
271_M	402_F	0.802	0.32
211_L	610_P	0.801	0.32
148_P	178_R	0.798	0.32
595_E	652_I	0.798	0.32
681_I	691_D	0.796	0.32
130_M	369_V	0.796	0.32
688_S	692_S	0.796	0.32
595_E	627_E	0.795	0.32
118_S	342_M	0.794	0.32
553_M	587_L	0.794	0.32
281_A	298_N	0.794	0.32
569_G	577_I	0.793	0.32
634_A	651_I	0.792	0.32
293_F	343_V	0.791	0.32
630_I	660_V	0.791	0.32
206_P	210_L	0.791	0.32
513_I	520_E	0.790	0.32
651_I	655_T	0.789	0.32
420_R	637_D	0.786	0.31
406_A	535_E	0.785	0.31
520_E	527_T	0.781	0.31
683_G	691_D	0.780	0.31
382_R	411_I	0.780	0.31
426_L	560_I	0.778	0.31
581_T	630_I	0.776	0.31
608_V	654_V	0.774	0.31
525_Y	529_Q	0.773	0.31
212_S	261_V	0.773	0.31
537_A	611_V	0.771	0.31
630_I	633_K	0.770	0.31
593_A	652_I	0.770	0.31
528_G	537_A	0.767	0.30
505_I	514_T	0.765	0.30
419_G	642_E	0.764	0.30
261_V	611_V	0.763	0.30
98_A	111_R	0.762	0.30
407_I	439_G	0.761	0.30
277_E	548_F	0.761	0.30
378_T	389_V	0.759	0.30
681_I	689_A	0.758	0.30
253_H	256_A	0.757	0.30
388_F	393_V	0.757	0.30
263_H	429_R	0.756	0.30
667_G	683_G	0.754	0.30
519_Q	525_Y	0.754	0.30
548_F	571_D	0.753	0.30
576_S	598_M	0.753	0.30
686_L	689_A	0.753	0.30
503_S	520_E	0.752	0.30
589_D	649_I	0.750	0.29
255_G	306_Q	0.750	0.29
378_T	381_M	0.749	0.29
215_G	420_R	0.748	0.29
669_P	683_G	0.748	0.29
532_E	653_P	0.748	0.29
360_S	430_D	0.747	0.29
188_I	317_F	0.745	0.29
286_K	651_I	0.743	0.29
543_A	547_K	0.742	0.29
186_M	539_E	0.741	0.29
503_S	513_I	0.740	0.29
406_A	618_I	0.739	0.29
676_D	679_K	0.735	0.29
111_R	298_N	0.732	0.28
679_K	685_A	0.731	0.28
407_I	410_L	0.731	0.28
680_S	693_G	0.730	0.28
235_L	281_A	0.730	0.28
610_P	653_P	0.729	0.28
483_G	570_V	0.729	0.28
512_E	520_E	0.729	0.28
503_S	507_L	0.726	0.28
471_D	524_I	0.726	0.28
443_R	682_T	0.724	0.28
329_A	439_G	0.724	0.28
348_M	561_Q	0.723	0.28
98_A	102_I	0.721	0.28
467_Q	471_D	0.721	0.28
113_V	191_L	0.720	0.28
284_I	311_A	0.720	0.28
504_G	512_E	0.718	0.28
142_V	288_N	0.717	0.28
253_H	483_G	0.716	0.28
151_S	399_L	0.715	0.27
477_R	658_S	0.714	0.27
267_Q	271_M	0.711	0.27
363_K	570_V	0.711	0.27
467_Q	470_V	0.710	0.27
682_T	687_D	0.710	0.27
181_M	247_E	0.709	0.27
443_R	488_E	0.709	0.27
501_G	504_G	0.709	0.27
398_N	443_R	0.709	0.27
578_T	611_V	0.708	0.27
537_A	580_A	0.705	0.27
444_S	589_D	0.705	0.27
490_V	654_V	0.705	0.27
509_V	514_T	0.704	0.27
587_L	590_I	0.702	0.27
546_K	560_I	0.702	0.27
149_D	376_E	0.702	0.27
412_L	415_K	0.700	0.27
99_A	121_T	0.699	0.27
372_D	601_S	0.698	0.27
269_G	337_P	0.697	0.27
175_A	178_R	0.697	0.27
550_D	554_S	0.697	0.27
186_M	191_L	0.696	0.26
128_K	633_K	0.695	0.26
673_S	676_D	0.693	0.26
97_E	651_I	0.693	0.26
249_A	252_A	0.692	0.26
220_F	223_T	0.691	0.26
94_I	428_L	0.690	0.26
103_V	237_N	0.690	0.26
123_K	576_S	0.689	0.26
201_A	569_G	0.689	0.26
595_E	683_G	0.689	0.26
189_M	560_I	0.688	0.26
175_A	471_D	0.686	0.26
667_G	686_L	0.686	0.26
514_T	532_E	0.686	0.26
157_R	167_I	0.683	0.26
421_K	587_L	0.682	0.26
121_T	472_N	0.681	0.26
520_E	523_R	0.681	0.26
349_D	571_D	0.680	0.26
171_H	174_E	0.680	0.26
108_K	439_G	0.679	0.26
194_V	490_V	0.679	0.26
93_V	431_L	0.678	0.26
169_D	319_I	0.677	0.26
411_I	486_S	0.677	0.26
388_F	391_Q	0.676	0.25
685_A	691_D	0.676	0.25
405_D	446_G	0.676	0.25
523_R	530_L	0.674	0.25
157_R	381_M	0.673	0.25
301_D	329_A	0.673	0.25
501_G	505_I	0.672	0.25
321_G	368_E	0.672	0.25
271_M	360_S	0.670	0.25
96_Q	371_M	0.670	0.25
246_F	608_V	0.670	0.25
286_K	317_F	0.668	0.25
291_V	485_T	0.668	0.25
94_I	375_I	0.667	0.25
377_D	411_I	0.666	0.25
547_K	584_I	0.666	0.25
592_V	663_V	0.666	0.25
129_A	143_L	0.663	0.25
127_A	130_M	0.662	0.25
186_M	234_L	0.662	0.25
145_Y	232_P	0.661	0.25
124_S	134_L	0.661	0.25
183_S	412_L	0.660	0.25
385_Y	431_L	0.660	0.25
348_M	373_D	0.660	0.25
533_M	611_V	0.658	0.25
679_K	691_D	0.657	0.24
532_E	586_A	0.657	0.24
411_I	415_K	0.653	0.24
669_P	676_D	0.652	0.24
158_T	339_D	0.652	0.24
316_E	337_P	0.651	0.24
537_A	581_T	0.651	0.24
106_A	320_T	0.650	0.24
378_T	382_R	0.650	0.24
121_T	538_V	0.649	0.24
286_K	393_V	0.647	0.24
126_L	131_S	0.646	0.24
477_R	539_E	0.645	0.24
536_E	563_V	0.645	0.24
580_A	584_I	0.643	0.24
128_K	132_R	0.643	0.24
537_A	660_V	0.643	0.24
294_I	299_T	0.641	0.24
408_R	412_L	0.640	0.24
489_A	583_V	0.640	0.24
673_S	689_A	0.639	0.24
360_S	363_K	0.639	0.24
267_Q	270_G	0.637	0.24
270_G	311_A	0.637	0.24
563_V	604_V	0.636	0.23
520_E	530_L	0.636	0.23
144_V	279_V	0.635	0.23
314_E	420_R	0.635	0.23
403_A	675_V	0.634	0.23
309_M	601_S	0.634	0.23
256_A	280_E	0.634	0.23
473_Y	550_D	0.634	0.23
507_L	516_A	0.633	0.23
251_G	299_T	0.632	0.23
276_H	416_R	0.632	0.23
114_M	544_I	0.630	0.23
427_K	460_K	0.630	0.23
141_D	162_G	0.629	0.23
299_T	304_S	0.629	0.23
438_A	673_S	0.629	0.23
247_E	411_I	0.629	0.23
100_R	340_F	0.628	0.23
143_L	157_R	0.627	0.23
299_T	490_V	0.626	0.23
288_N	485_T	0.625	0.23
128_K	343_V	0.625	0.23
203_P	586_A	0.624	0.23
112_H	190_I	0.623	0.23
485_T	672_D	0.622	0.23
340_F	414_A	0.622	0.23
455_V	538_V	0.621	0.23
258_L	369_V	0.621	0.23
133_L	654_V	0.620	0.23
467_Q	503_S	0.620	0.23
114_M	497_A	0.619	0.23
167_I	427_K	0.619	0.23
337_P	442_A	0.619	0.23
386_A	410_L	0.619	0.23
593_A	651_I	0.618	0.23
215_G	338_C	0.616	0.23
194_V	526_A	0.616	0.23
431_L	655_T	0.616	0.23
210_L	273_T	0.615	0.22
454_D	462_S	0.614	0.22
668_E	679_K	0.614	0.22
235_L	340_F	0.613	0.22
376_E	418_A	0.613	0.22
375_I	378_T	0.611	0.22
279_V	319_I	0.611	0.22
536_E	604_V	0.610	0.22
261_V	279_V	0.610	0.22
676_D	683_G	0.610	0.22
184_F	192_L	0.610	0.22
370_Y	468_Q	0.609	0.22
182_R	336_V	0.608	0.22
453_S	582_A	0.608	0.22
453_S	457_E	0.607	0.22
570_V	588_E	0.607	0.22
375_I	381_M	0.607	0.22
268_S	561_Q	0.607	0.22
683_G	690_S	0.607	0.22
472_N	475_Q	0.606	0.22
128_K	166_Q	0.606	0.22
232_P	293_F	0.606	0.22
265_P	459_K	0.606	0.22
278_R	586_A	0.606	0.22
197_A	479_D	0.606	0.22
676_D	685_A	0.605	0.22
258_L	410_L	0.605	0.22
247_E	296_E	0.604	0.22
103_V	113_V	0.604	0.22
211_L	657_I	0.603	0.22
631_I	639_V	0.602	0.22
285_Q	364_G	0.602	0.22
234_L	283_S	0.601	0.22
514_T	524_I	0.601	0.22
123_K	426_L	0.601	0.22
402_F	435_V	0.600	0.22
484_T	510_M	0.598	0.22
186_M	215_G	0.598	0.22
401_H	435_V	0.598	0.22
104_K	614_V	0.598	0.22
647_E	650_E	0.597	0.22
131_S	293_F	0.597	0.22
596_L	628_R	0.595	0.22
162_G	455_V	0.595	0.22
556_K	584_I	0.595	0.22
236_I	435_V	0.594	0.22
385_Y	410_L	0.594	0.22
247_E	376_E	0.594	0.22
205_R	209_A	0.594	0.22
151_S	235_L	0.594	0.22
538_V	583_V	0.593	0.21
95_G	99_A	0.592	0.21
123_K	457_E	0.591	0.21
484_T	603_S	0.591	0.21
492_R	611_V	0.590	0.21
161_A	236_I	0.589	0.21
393_V	595_E	0.589	0.21
152_N	280_E	0.588	0.21
526_A	586_A	0.588	0.21
286_K	589_D	0.588	0.21
113_V	677_R	0.587	0.21
349_D	459_K	0.587	0.21
269_G	346_G	0.586	0.21
97_E	101_E	0.586	0.21
309_M	527_T	0.586	0.21
126_L	429_R	0.585	0.21
536_E	579_V	0.585	0.21
201_A	387_R	0.584	0.21
571_D	615_T	0.584	0.21
298_N	368_E	0.583	0.21
109_Q	168_V	0.583	0.21
676_D	681_I	0.582	0.21
571_D	643_D	0.582	0.21
275_S	588_E	0.581	0.21
167_I	261_V	0.581	0.21
479_D	587_L	0.581	0.21
112_H	495_G	0.580	0.21
299_T	344_A	0.580	0.21
329_A	608_V	0.579	0.21
273_T	346_G	0.578	0.21
347_N	623_K	0.578	0.21
673_S	679_K	0.578	0.21
435_V	490_V	0.578	0.21
581_T	602_L	0.577	0.21
652_I	687_D	0.577	0.21
396_D	436_R	0.576	0.21
96_Q	99_A	0.576	0.21
382_R	406_A	0.576	0.21
132_R	446_G	0.576	0.21
646_E	649_I	0.575	0.21
187_W	211_L	0.575	0.21
515_P	610_P	0.574	0.21
97_E	647_E	0.574	0.21
137_E	294_I	0.573	0.21
174_E	636_E	0.573	0.21
386_A	455_V	0.572	0.21
167_I	251_G	0.572	0.21
106_A	605_R	0.572	0.21
592_V	626_C	0.571	0.20
234_L	608_V	0.570	0.20
232_P	393_V	0.570	0.20
126_L	432_G	0.570	0.20
117_G	122_G	0.570	0.20
269_G	330_M	0.569	0.20
630_I	656_H	0.568	0.20
404_P	450_T	0.568	0.20
320_T	323_S	0.568	0.20
622_A	641_I	0.566	0.20
587_L	683_G	0.565	0.20
127_A	134_L	0.564	0.20
670_E	684_K	0.564	0.20
110_H	341_I	0.563	0.20
389_V	402_F	0.563	0.20
650_E	692_S	0.563	0.20
502_D	511_A	0.562	0.20
343_V	532_E	0.562	0.20
357_A	651_I	0.562	0.20
312_I	340_F	0.561	0.20
163_K	311_A	0.560	0.20
237_N	462_S	0.560	0.20
90_V	421_K	0.560	0.20
522_G	557_D	0.560	0.20
467_Q	483_G	0.559	0.20
188_I	610_P	0.559	0.20
551_E	692_S	0.559	0.20
381_M	547_K	0.558	0.20
520_E	525_Y	0.558	0.20
278_R	515_P	0.557	0.20
563_V	579_V	0.556	0.20
114_M	359_R	0.556	0.20
209_A	213_A	0.556	0.20
222_Y	410_L	0.555	0.20
367_Y	560_I	0.555	0.20
114_M	121_T	0.555	0.20
360_S	414_A	0.554	0.20
234_L	237_N	0.554	0.20
523_R	586_A	0.554	0.20
174_E	544_I	0.553	0.20
191_L	412_L	0.553	0.20
309_M	358_L	0.553	0.20
208_L	570_V	0.553	0.20
399_L	434_L	0.553	0.20
527_T	558_T	0.553	0.20
105_R	662_D	0.553	0.20
453_S	525_Y	0.552	0.20
432_G	435_V	0.552	0.20
349_D	590_I	0.551	0.20
254_A	307_K	0.551	0.20
360_S	385_Y	0.551	0.20
111_R	432_G	0.551	0.20
358_L	361_R	0.551	0.20
643_D	650_E	0.551	0.20
169_D	454_D	0.551	0.20
381_M	451_Q	0.551	0.20
433_G	440_D	0.550	0.20
136_K	671_K	0.550	0.20
238_N	471_D	0.549	0.20
548_F	553_M	0.549	0.20
394_E	524_I	0.549	0.20
208_L	623_K	0.548	0.19
481_E	686_L	0.548	0.19
309_M	594_Q	0.548	0.19
670_E	681_I	0.548	0.19
107_A	593_A	0.547	0.19
165_E	239_A	0.547	0.19
407_I	654_V	0.546	0.19
182_R	261_V	0.545	0.19
433_G	684_K	0.544	0.19
410_L	435_V	0.543	0.19
238_N	502_D	0.543	0.19
630_I	663_V	0.543	0.19
157_R	360_S	0.542	0.19
377_D	385_Y	0.542	0.19
298_N	495_G	0.542	0.19
469_F	472_N	0.541	0.19
538_V	605_R	0.541	0.19
651_I	682_T	0.541	0.19
448_D	644_E	0.541	0.19
362_I	692_S	0.540	0.19
435_V	439_G	0.540	0.19
331_V	336_V	0.540	0.19
316_E	644_E	0.540	0.19
507_L	512_E	0.539	0.19
680_S	691_D	0.539	0.19
283_S	631_I	0.538	0.19
172_K	541_V	0.538	0.19
311_A	649_I	0.538	0.19
679_K	683_G	0.538	0.19
489_A	611_V	0.538	0.19
90_V	441_I	0.538	0.19
450_T	531_K	0.537	0.19
647_E	667_G	0.537	0.19
579_V	604_V	0.537	0.19
257_M	304_S	0.536	0.19
363_K	429_R	0.536	0.19
618_I	626_C	0.536	0.19
126_L	433_G	0.536	0.19
131_S	137_E	0.536	0.19
582_A	611_V	0.536	0.19
104_K	444_S	0.535	0.19
216_I	261_V	0.535	0.19
645_Y	648_Q	0.535	0.19
536_E	620_A	0.535	0.19
156_V	418_A	0.535	0.19
242_Q	681_I	0.534	0.19
99_A	103_V	0.533	0.19
296_E	411_I	0.533	0.19
211_L	454_D	0.533	0.19
348_M	622_A	0.532	0.19
142_V	215_G	0.532	0.19
296_E	618_I	0.532	0.19
285_Q	340_F	0.531	0.19
123_K	545_I	0.531	0.19
299_T	307_K	0.531	0.19
415_K	640_M	0.530	0.19
396_D	450_T	0.530	0.19
611_V	616_H	0.529	0.19
115_M	657_I	0.528	0.19
246_F	525_Y	0.528	0.19
390_A	401_H	0.528	0.19
411_I	455_V	0.527	0.19
137_E	422_D	0.527	0.19
428_L	523_R	0.527	0.19
482_L	528_G	0.527	0.19
434_L	543_A	0.525	0.19
370_Y	561_Q	0.524	0.19
121_T	417_R	0.524	0.19
447_H	693_G	0.523	0.18
201_A	571_D	0.523	0.18
315_G	385_Y	0.523	0.18
115_M	616_H	0.522	0.18
186_M	336_V	0.521	0.18
200_I	407_I	0.521	0.18
678_L	687_D	0.520	0.18
651_I	659_E	0.520	0.18
204_A	561_Q	0.520	0.18
169_D	172_K	0.518	0.18
420_R	434_L	0.518	0.18
423_S	654_V	0.517	0.18
200_I	545_I	0.517	0.18
322_Q	543_A	0.517	0.18
198_L	225_R	0.517	0.18
111_R	341_I	0.517	0.18
419_G	615_T	0.516	0.18
298_N	523_R	0.515	0.18
159_V	234_L	0.515	0.18
199_L	281_A	0.515	0.18
618_I	640_M	0.514	0.18
339_D	434_L	0.513	0.18
103_V	261_V	0.513	0.18
526_A	634_A	0.513	0.18
283_S	468_Q	0.513	0.18
258_L	560_I	0.512	0.18
408_R	589_D	0.512	0.18
426_L	497_A	0.512	0.18
212_S	258_L	0.511	0.18
121_T	426_L	0.511	0.18
419_G	552_N	0.511	0.18
558_T	561_Q	0.510	0.18
316_E	675_V	0.510	0.18
142_V	285_Q	0.510	0.18
492_R	531_K	0.510	0.18
438_A	490_V	0.510	0.18
344_A	364_G	0.510	0.18
421_K	640_M	0.510	0.18
271_M	319_I	0.509	0.18
257_M	342_M	0.509	0.18
273_T	610_P	0.508	0.18
504_G	514_T	0.508	0.18
452_R	460_K	0.508	0.18
537_A	587_L	0.508	0.18
210_L	434_L	0.507	0.18
230_M	254_A	0.507	0.18
137_E	387_R	0.507	0.18
107_A	438_A	0.506	0.18
553_M	625_G	0.506	0.18
366_G	442_A	0.506	0.18
107_A	254_A	0.505	0.18
366_G	426_L	0.505	0.18
123_K	194_V	0.505	0.18
521_E	570_V	0.505	0.18
522_G	623_K	0.505	0.18
569_G	581_T	0.505	0.18
388_F	401_H	0.503	0.18
220_F	368_E	0.503	0.18
298_N	571_D	0.503	0.18
393_V	598_M	0.503	0.18
434_L	443_R	0.503	0.18
111_R	356_P	0.503	0.18
610_P	614_V	0.502	0.18
427_K	644_E	0.502	0.18
210_L	525_Y	0.502	0.18
297_I	605_R	0.502	0.18
156_V	650_E	0.501	0.18
428_L	467_Q	0.501	0.18
454_D	467_Q	0.501	0.18
119_P	164_G	0.501	0.18
537_A	590_I	0.501	0.18
315_G	481_E	0.501	0.18
367_Y	379_P	0.501	0.18
529_Q	558_T	0.500	0.18
376_E	394_E	0.500	0.18

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4fwgA	3	0.7877	100	0.528	Contact Map
3k1jA	4	0.8048	100	0.629	Contact Map
3m6aA	3	0.6681	100	0.839	Contact Map
1z0wA	3	0.2892	100	0.874	Contact Map
1xhkA	2	0.2507	100	0.884	Contact Map
3wu4A	3	0.265	100	0.895	Contact Map
2x36A	3	0.2635	100	0.899	Contact Map
2c9oA	3	0.4402	99.9	0.919	Contact Map
1g8pA	1	0.416	99.8	0.923	Contact Map
4r7yA	3	0.4729	99.7	0.931	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0157 seconds.