Q9HSB1 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HSB1 - Dolichol-P-glucose synthetase

UniProt:	Q9HSB1	Sequences: MSETAVEVSVVLPAYNEADTIDATVHTTVETLAGFLPAGSFEVIVAEDGCDDDTPARADALAAEQSAVRHLHSEQRLGRGGALNAAFDVADGDTLVYFDTDLATDMRHLETLVERVRTGSADVATGSRWMPGETADRPAKRGIPSRVFNGAVRTLLGSSVRDHQCGFKALSRSAFEALVDDVADEHWFWDTELLVRAQRQGFDVEEFAVDWTPKGDSKVDLVRDVFGMGSQILRCFWEFSVRPYANRRTGLAVGSLLSVVAFALMFVYIDVEAFVDAVANADPVFVAAGAVVYALSWPLRGRRYGDILAELGYREDVWFLTGAVFISQTGNLVIPARAGDAIRAYVVKARRSVPYTTGFASLAVERVFDLLTITVLAGGVLVALSAFAPSTVTELAATATGDSLTGPASAAVQQATVVSTVVGAIAVSTVAVIVWSARTDTNYARRVVAWTSDDSYVELVASVVEQFVGDIQQVAVNGRAFAWIGVSSVVIWTIDVATALLVFVAFGLDLSAVGLVAVGFFAVSVGNLSKVIPGPPGGVGVYEAAFAAIVSTLLPVSFGTAVGIAIVDHIVKNVVTVAGGAVSMMTLNVSLTEAVDGRDADLVADRESAVGVDD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	614 (502)
Sequences:	229 (175)
Seq/√Len:	7.8

HALSA - Q9HSB1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
524_S	531_V	3.579	0.94
143_I	146_R	3.340	0.92
527_N	531_V	3.104	0.89
143_I	147_V	2.980	0.86
224_D	228_M	2.944	0.86
228_M	231_Q	2.933	0.85
519_G	531_V	2.809	0.83
143_I	148_F	2.777	0.82
524_S	527_N	2.701	0.80
148_F	151_A	2.680	0.80
215_G	220_D	2.663	0.79
524_S	528_L	2.571	0.77
519_G	524_S	2.570	0.77
143_I	149_N	2.567	0.76
283_P	286_V	2.543	0.76
224_D	231_Q	2.517	0.75
255_S	263_A	2.475	0.74
227_G	231_Q	2.460	0.73
519_G	527_N	2.367	0.70
246_N	250_G	2.350	0.70
148_F	152_V	2.347	0.69
144_P	148_F	2.338	0.69
528_L	531_V	2.316	0.68
227_G	230_S	2.270	0.67
217_S	221_L	2.255	0.66
225_V	228_M	2.215	0.65
263_A	270_D	2.205	0.64
526_G	531_V	2.203	0.64
209_V	214_K	2.197	0.64
146_R	149_N	2.178	0.63
148_F	153_R	2.173	0.63
367_V	374_T	2.173	0.63
245_A	250_G	2.155	0.62
425_I	432_V	2.131	0.62
257_L	263_A	2.060	0.59
421_V	427_V	2.059	0.59
524_S	532_I	2.034	0.58
421_V	428_S	2.029	0.58
256_L	263_A	2.024	0.57
211_W	214_K	2.009	0.57
209_V	213_P	2.008	0.57
425_I	428_S	1.983	0.56
459_L	466_Q	1.971	0.55
367_V	372_T	1.956	0.55
263_A	266_F	1.954	0.55
259_V	263_A	1.950	0.54
137_R	140_K	1.892	0.52
149_N	153_R	1.876	0.51
251_L	256_L	1.859	0.51
146_R	151_A	1.855	0.51
421_V	425_I	1.849	0.50
209_V	212_T	1.814	0.49
225_V	231_Q	1.813	0.49
263_A	267_V	1.811	0.49
151_A	154_T	1.800	0.48
245_A	251_L	1.787	0.48
528_L	532_I	1.781	0.48
357_T	360_A	1.778	0.48
151_A	155_L	1.770	0.47
355_Y	359_F	1.769	0.47
519_G	528_L	1.756	0.47
144_P	147_V	1.753	0.46
415_A	428_S	1.744	0.46
231_Q	234_R	1.737	0.46
250_G	254_G	1.735	0.46
521_F	526_G	1.731	0.46
144_P	149_N	1.711	0.45
260_V	263_A	1.696	0.44
152_V	155_L	1.684	0.44
245_A	252_A	1.673	0.43
255_S	262_F	1.653	0.43
245_A	256_L	1.652	0.42
251_L	263_A	1.651	0.42
245_A	248_R	1.633	0.42
352_S	355_Y	1.632	0.42
262_F	265_M	1.630	0.42
248_R	252_A	1.627	0.41
372_T	375_V	1.624	0.41
420_T	428_S	1.615	0.41
246_N	252_A	1.612	0.41
226_F	234_R	1.609	0.41
425_I	429_T	1.600	0.40
249_T	263_A	1.593	0.40
149_N	152_V	1.590	0.40
374_T	377_A	1.590	0.40
228_M	234_R	1.585	0.40
215_G	219_V	1.582	0.40
523_V	529_S	1.574	0.39
367_V	370_L	1.562	0.39
462_S	466_Q	1.552	0.39
362_L	367_V	1.552	0.39
250_G	266_F	1.552	0.39
356_T	360_A	1.551	0.39
413_Q	428_S	1.550	0.38
136_D	140_K	1.549	0.38
366_R	369_D	1.547	0.38
354_P	363_A	1.543	0.38
522_A	527_N	1.539	0.38
247_R	250_G	1.536	0.38
412_V	429_T	1.525	0.38
258_S	267_V	1.518	0.37
366_R	372_T	1.509	0.37
282_D	285_F	1.503	0.37
228_M	232_I	1.500	0.37
414_Q	424_A	1.492	0.36
146_R	152_V	1.489	0.36
147_V	152_V	1.488	0.36
416_T	425_I	1.476	0.36
147_V	153_R	1.476	0.36
246_N	266_F	1.475	0.36
263_A	268_Y	1.472	0.36
516_V	531_V	1.471	0.36
246_N	263_A	1.436	0.34
252_A	263_A	1.414	0.33
218_K	221_L	1.412	0.33
426_A	429_T	1.412	0.33
372_T	377_A	1.406	0.33
413_Q	426_A	1.406	0.33
262_F	267_V	1.402	0.33
224_D	232_I	1.392	0.33
224_D	227_G	1.384	0.32
245_A	249_T	1.383	0.32
351_R	368_F	1.382	0.32
361_S	371_L	1.373	0.32
256_L	262_F	1.372	0.32
413_Q	425_I	1.370	0.32
364_V	367_V	1.368	0.32
215_G	218_K	1.363	0.32
366_R	370_L	1.363	0.32
516_V	524_S	1.362	0.32
355_Y	372_T	1.359	0.31
246_N	268_Y	1.357	0.31
521_F	524_S	1.356	0.31
519_G	526_G	1.340	0.31
368_F	375_V	1.334	0.31
371_L	374_T	1.328	0.30
250_G	253_V	1.327	0.30
411_A	415_A	1.325	0.30
427_V	431_A	1.319	0.30
256_L	276_D	1.318	0.30
420_T	429_T	1.314	0.30
421_V	429_T	1.309	0.30
295_L	299_L	1.301	0.29
519_G	530_K	1.295	0.29
425_I	431_A	1.289	0.29
224_D	234_R	1.283	0.29
521_F	530_K	1.281	0.29
278_V	281_A	1.275	0.29
518_V	521_F	1.274	0.29
258_S	263_A	1.272	0.29
364_V	373_I	1.272	0.29
355_Y	366_R	1.258	0.28
217_S	227_G	1.258	0.28
144_P	151_A	1.256	0.28
364_V	372_T	1.251	0.28
526_G	530_K	1.250	0.28
148_F	155_L	1.250	0.28
439_T	443_Y	1.250	0.28
279_A	285_F	1.250	0.28
245_A	263_A	1.247	0.28
24_T	102_L	1.244	0.28
337_R	348_K	1.241	0.28
366_R	373_I	1.240	0.27
242_R	257_L	1.239	0.27
245_A	254_G	1.238	0.27
527_N	530_K	1.236	0.27
428_S	432_V	1.234	0.27
411_A	428_S	1.231	0.27
259_V	262_F	1.229	0.27
279_A	282_D	1.227	0.27
258_S	270_D	1.225	0.27
519_G	532_I	1.222	0.27
360_A	367_V	1.218	0.27
421_V	431_A	1.215	0.27
255_S	259_V	1.210	0.27
138_P	143_I	1.205	0.26
355_Y	373_I	1.205	0.26
414_Q	428_S	1.203	0.26
367_V	373_I	1.203	0.26
420_T	427_V	1.199	0.26
523_V	530_K	1.198	0.26
360_A	372_T	1.198	0.26
355_Y	360_A	1.194	0.26
336_A	348_K	1.193	0.26
140_K	143_I	1.192	0.26
236_F	245_A	1.190	0.26
247_R	252_A	1.190	0.26
436_S	443_Y	1.188	0.26
363_A	375_V	1.188	0.26
467_F	471_I	1.188	0.26
244_Y	268_Y	1.186	0.26
268_Y	276_D	1.180	0.26
362_L	372_T	1.177	0.25
17_E	48_D	1.177	0.25
459_L	474_V	1.168	0.25
292_V	298_P	1.168	0.25
516_V	519_G	1.165	0.25
245_A	268_Y	1.164	0.25
418_V	425_I	1.163	0.25
456_Y	472_Q	1.161	0.25
412_V	430_V	1.161	0.25
143_I	151_A	1.160	0.25
361_S	372_T	1.158	0.25
256_L	264_L	1.158	0.25
355_Y	361_S	1.158	0.25
263_A	269_I	1.155	0.25
339_G	342_I	1.150	0.25
413_Q	416_T	1.149	0.25
267_V	270_D	1.147	0.25
259_V	265_M	1.146	0.25
244_Y	250_G	1.140	0.24
279_A	284_V	1.138	0.24
369_D	375_V	1.136	0.24
284_V	288_A	1.134	0.24
265_M	268_Y	1.132	0.24
148_F	154_T	1.130	0.24
364_V	370_L	1.128	0.24
361_S	375_V	1.127	0.24
355_Y	367_V	1.127	0.24
526_G	532_I	1.126	0.24
246_N	251_L	1.121	0.24
355_Y	362_L	1.115	0.24
516_V	527_N	1.106	0.23
262_F	270_D	1.104	0.23
226_F	230_S	1.102	0.23
56_A	60_A	1.100	0.23
527_N	532_I	1.100	0.23
331_N	339_G	1.097	0.23
369_D	373_I	1.096	0.23
293_Y	325_F	1.095	0.23
420_T	425_I	1.090	0.23
257_L	270_D	1.086	0.23
256_L	260_V	1.086	0.23
218_K	227_G	1.081	0.23
80_G	189_W	1.080	0.23
416_T	420_T	1.080	0.23
413_Q	429_T	1.069	0.22
417_V	420_T	1.065	0.22
257_L	265_M	1.064	0.22
362_L	366_R	1.064	0.22
257_L	267_V	1.061	0.22
316_D	341_A	1.060	0.22
296_S	339_G	1.059	0.22
367_V	371_L	1.057	0.22
417_V	431_A	1.056	0.22
283_P	287_A	1.055	0.22
365_E	372_T	1.051	0.22
420_T	426_A	1.049	0.22
355_Y	358_G	1.049	0.22
146_R	153_R	1.048	0.22
456_Y	470_D	1.048	0.22
456_Y	459_L	1.047	0.22
353_V	359_F	1.045	0.22
354_P	357_T	1.043	0.22
252_A	256_L	1.039	0.21
249_T	256_L	1.034	0.21
48_D	99_D	1.023	0.21
412_V	420_T	1.019	0.21
258_S	269_I	1.018	0.21
456_Y	466_Q	1.017	0.21
13_P	99_D	1.017	0.21
516_V	528_L	1.017	0.21
374_T	380_V	1.015	0.21
355_Y	364_V	1.015	0.21
359_F	364_V	1.013	0.21
375_V	382_V	1.013	0.21
78_G	82_A	1.011	0.21
316_D	334_I	1.009	0.21
262_F	266_F	1.005	0.21
251_L	264_L	1.004	0.21
255_S	280_N	1.001	0.20
516_V	532_I	1.000	0.20
418_V	421_V	0.999	0.20
459_L	470_D	0.998	0.20
256_L	267_V	0.998	0.20
210_D	214_K	0.997	0.20
413_Q	432_V	0.997	0.20
367_V	379_G	0.995	0.20
13_P	48_D	0.994	0.20
249_T	264_L	0.993	0.20
165_C	175_F	0.991	0.20
421_V	426_A	0.991	0.20
363_A	368_F	0.991	0.20
354_P	360_A	0.988	0.20
495_D	503_F	0.988	0.20
292_V	297_W	0.985	0.20
147_V	151_A	0.984	0.20
521_F	531_V	0.984	0.20
242_R	247_R	0.984	0.20
14_A	198_Q	0.983	0.20
263_A	276_D	0.982	0.20
296_S	301_G	0.980	0.20
251_L	268_Y	0.980	0.20
366_R	374_T	0.978	0.20
366_R	377_A	0.978	0.20
244_Y	249_T	0.976	0.20
357_T	373_I	0.970	0.20
352_S	361_S	0.968	0.20
317_V	342_I	0.968	0.20
221_L	227_G	0.967	0.20
367_V	377_A	0.966	0.20
316_D	348_K	0.966	0.20
424_A	431_A	0.966	0.20
264_L	268_Y	0.964	0.20
428_S	431_A	0.961	0.19
284_V	287_A	0.960	0.19
415_A	426_A	0.959	0.19
357_T	367_V	0.951	0.19
413_Q	421_V	0.949	0.19
358_G	364_V	0.949	0.19
352_S	359_F	0.947	0.19
352_S	360_A	0.946	0.19
242_R	250_G	0.942	0.19
443_Y	447_V	0.940	0.19
278_V	282_D	0.939	0.19
365_E	371_L	0.939	0.19
144_P	152_V	0.926	0.19
411_A	414_Q	0.926	0.19
13_P	17_E	0.925	0.19
223_R	228_M	0.923	0.18
124_A	207_F	0.922	0.18
234_R	238_E	0.922	0.18
373_I	377_A	0.920	0.18
420_T	431_A	0.919	0.18
254_G	263_A	0.919	0.18
525_V	528_L	0.918	0.18
266_F	270_D	0.916	0.18
257_L	271_V	0.915	0.18
273_A	276_D	0.914	0.18
363_A	369_D	0.913	0.18
242_R	251_L	0.911	0.18
257_L	260_V	0.910	0.18
415_A	427_V	0.905	0.18
455_S	464_V	0.904	0.18
138_P	149_N	0.904	0.18
15_Y	99_D	0.904	0.18
356_T	359_F	0.904	0.18
429_T	432_V	0.903	0.18
143_I	152_V	0.903	0.18
455_S	459_L	0.903	0.18
242_R	245_A	0.902	0.18
219_V	224_D	0.902	0.18
219_V	228_M	0.900	0.18
422_V	426_A	0.900	0.18
242_R	252_A	0.900	0.18
246_N	249_T	0.899	0.18
149_N	154_T	0.898	0.18
152_V	158_S	0.897	0.18
243_P	246_N	0.894	0.18
248_R	276_D	0.894	0.18
366_R	375_V	0.893	0.18
357_T	361_S	0.891	0.18
244_Y	247_R	0.889	0.18
96_V	99_D	0.885	0.18
247_R	255_S	0.882	0.18
17_E	99_D	0.882	0.18
363_A	522_A	0.880	0.17
56_A	503_F	0.880	0.17
293_Y	296_S	0.879	0.17
243_P	250_G	0.878	0.17
255_S	270_D	0.873	0.17
519_G	523_V	0.871	0.17
419_S	426_A	0.871	0.17
262_F	269_I	0.867	0.17
222_V	228_M	0.867	0.17
240_S	244_Y	0.867	0.17
256_L	268_Y	0.865	0.17
361_S	369_D	0.865	0.17
223_R	231_Q	0.861	0.17
256_L	259_V	0.860	0.17
459_L	465_E	0.858	0.17
521_F	529_S	0.857	0.17
127_S	131_P	0.857	0.17
353_V	373_I	0.855	0.17
356_T	367_V	0.853	0.17
250_G	263_A	0.852	0.17
163_H	166_G	0.850	0.17
424_A	427_V	0.849	0.17
364_V	380_V	0.847	0.17
356_T	372_T	0.843	0.17
77_L	81_G	0.838	0.17
264_L	270_D	0.835	0.16
258_S	266_F	0.834	0.16
359_F	372_T	0.834	0.16
364_V	374_T	0.832	0.16
417_V	424_A	0.831	0.16
369_D	372_T	0.831	0.16
256_L	266_F	0.831	0.16
370_L	374_T	0.829	0.16
96_V	113_V	0.829	0.16
247_R	251_L	0.828	0.16
327_S	339_G	0.828	0.16
281_A	285_F	0.826	0.16
224_D	230_S	0.825	0.16
230_S	234_R	0.823	0.16
355_Y	369_D	0.823	0.16
353_V	356_T	0.819	0.16
167_F	192_E	0.819	0.16
413_Q	420_T	0.817	0.16
522_A	526_G	0.814	0.16
143_I	153_R	0.813	0.16
224_D	229_G	0.813	0.16
353_V	364_V	0.811	0.16
362_L	368_F	0.811	0.16
294_A	299_L	0.810	0.16
466_Q	474_V	0.810	0.16
251_L	254_G	0.810	0.16
369_D	377_A	0.810	0.16
252_A	264_L	0.806	0.16
53_D	56_A	0.806	0.16
526_G	529_S	0.803	0.16
253_V	256_L	0.801	0.16
137_R	487_S	0.800	0.16
456_Y	468_V	0.799	0.16
331_N	335_P	0.798	0.16
523_V	526_G	0.797	0.16
354_P	367_V	0.795	0.16
467_F	470_D	0.795	0.16
351_R	370_L	0.795	0.16
373_I	380_V	0.795	0.16
525_V	532_I	0.794	0.16
376_L	424_A	0.793	0.16
351_R	366_R	0.793	0.16
162_D	193_L	0.790	0.15
338_A	522_A	0.787	0.15
259_V	266_F	0.786	0.15
361_S	380_V	0.786	0.15
459_L	462_S	0.785	0.15
414_Q	418_V	0.784	0.15
291_V	295_L	0.784	0.15
267_V	273_A	0.784	0.15
257_L	276_D	0.783	0.15
357_T	371_L	0.782	0.15
369_D	374_T	0.781	0.15
249_T	268_Y	0.781	0.15
251_L	262_F	0.780	0.15
283_P	288_A	0.780	0.15
361_S	374_T	0.779	0.15
360_A	377_A	0.779	0.15
414_Q	420_T	0.778	0.15
353_V	372_T	0.777	0.15
218_K	229_G	0.776	0.15
85_A	88_D	0.775	0.15
218_K	224_D	0.774	0.15
357_T	374_T	0.773	0.15
356_T	364_V	0.772	0.15
254_G	258_S	0.772	0.15
219_V	338_A	0.771	0.15
426_A	432_V	0.770	0.15
367_V	380_V	0.769	0.15
411_A	426_A	0.768	0.15
246_N	264_L	0.767	0.15
245_A	264_L	0.767	0.15
361_S	367_V	0.766	0.15
330_G	334_I	0.763	0.15
210_D	213_P	0.763	0.15
292_V	296_S	0.763	0.15
149_N	155_L	0.762	0.15
360_A	366_R	0.761	0.15
522_A	530_K	0.761	0.15
462_S	468_V	0.760	0.15
86_A	188_F	0.759	0.15
459_L	468_V	0.758	0.15
153_R	158_S	0.757	0.15
25_V	35_F	0.756	0.15
252_A	260_V	0.756	0.15
418_V	426_A	0.753	0.15
259_V	267_V	0.751	0.15
296_S	299_L	0.750	0.15
524_S	530_K	0.750	0.15
260_V	264_L	0.749	0.15
259_V	270_D	0.746	0.15
351_R	360_A	0.746	0.15
245_A	257_L	0.745	0.15
292_V	309_A	0.743	0.14
354_P	365_E	0.743	0.14
421_V	432_V	0.742	0.14
124_A	199_R	0.742	0.14
386_A	389_P	0.742	0.14
327_S	337_R	0.741	0.14
370_L	377_A	0.741	0.14
351_R	372_T	0.741	0.14
331_N	340_D	0.741	0.14
375_V	379_G	0.740	0.14
368_F	372_T	0.740	0.14
417_V	425_I	0.739	0.14
353_V	371_L	0.737	0.14
361_S	373_I	0.733	0.14
125_T	128_R	0.733	0.14
484_I	491_I	0.733	0.14
424_A	429_T	0.731	0.14
116_V	124_A	0.730	0.14
373_I	378_G	0.729	0.14
416_T	432_V	0.728	0.14
413_Q	418_V	0.725	0.14
14_A	30_E	0.720	0.14
270_D	276_D	0.714	0.14
292_V	299_L	0.714	0.14
455_S	462_S	0.713	0.14
331_N	336_A	0.713	0.14
177_A	395_L	0.713	0.14
258_S	262_F	0.712	0.14
143_I	157_G	0.710	0.14
13_P	167_F	0.709	0.14
352_S	367_V	0.709	0.14
415_A	429_T	0.707	0.14
260_V	267_V	0.705	0.14
455_S	475_A	0.705	0.14
443_Y	446_R	0.703	0.14
359_F	366_R	0.701	0.14
489_V	509_D	0.701	0.14
523_V	527_N	0.699	0.14
435_W	443_Y	0.699	0.14
293_Y	297_W	0.699	0.14
455_S	465_E	0.699	0.14
171_S	175_F	0.697	0.14
228_M	233_L	0.696	0.14
262_F	268_Y	0.696	0.14
461_A	465_E	0.695	0.14
116_V	121_A	0.695	0.14
518_V	526_G	0.694	0.14
327_S	331_N	0.693	0.14
245_A	253_V	0.692	0.13
260_V	265_M	0.692	0.13
436_S	442_N	0.692	0.13
255_S	266_F	0.691	0.13
343_R	348_K	0.690	0.13
241_V	254_G	0.690	0.13
427_V	432_V	0.689	0.13
372_T	379_G	0.689	0.13
265_M	273_A	0.689	0.13
218_K	228_M	0.688	0.13
415_A	421_V	0.686	0.13
351_R	355_Y	0.686	0.13
248_R	253_V	0.686	0.13
291_V	299_L	0.685	0.13
502_V	506_F	0.683	0.13
247_R	262_F	0.682	0.13
245_A	258_S	0.681	0.13
327_S	348_K	0.678	0.13
250_G	258_S	0.678	0.13
369_D	379_G	0.677	0.13
23_A	512_A	0.676	0.13
152_V	157_G	0.675	0.13
256_L	265_M	0.675	0.13
242_R	263_A	0.674	0.13
327_S	336_A	0.674	0.13
368_F	371_L	0.674	0.13
261_A	270_D	0.674	0.13
411_A	424_A	0.673	0.13
226_F	229_G	0.673	0.13
260_V	268_Y	0.673	0.13
456_Y	465_E	0.670	0.13
411_A	427_V	0.669	0.13
225_V	229_G	0.667	0.13
371_L	380_V	0.667	0.13
255_S	268_Y	0.666	0.13
352_S	369_D	0.665	0.13
328_Q	331_N	0.664	0.13
249_T	253_V	0.663	0.13
444_A	447_V	0.659	0.13
467_F	474_V	0.659	0.13
218_K	338_A	0.658	0.13
362_L	369_D	0.656	0.13
365_E	369_D	0.656	0.13
328_Q	339_G	0.655	0.13
327_S	334_I	0.655	0.13
98_F	113_V	0.655	0.13
137_R	143_I	0.653	0.13
327_S	335_P	0.653	0.13
456_Y	474_V	0.651	0.13
113_V	169_A	0.650	0.13
248_R	260_V	0.648	0.13
99_D	166_G	0.648	0.13
37_P	201_G	0.647	0.13
224_D	233_L	0.646	0.13
364_V	377_A	0.645	0.13
258_S	271_V	0.644	0.13
413_Q	427_V	0.644	0.13
45_V	99_D	0.642	0.13
259_V	271_V	0.641	0.13
84_N	175_F	0.641	0.13
363_A	370_L	0.641	0.13
428_S	444_A	0.640	0.13
356_T	361_S	0.640	0.13
357_T	377_A	0.638	0.13
253_V	259_V	0.637	0.12
414_Q	426_A	0.636	0.12
410_A	429_T	0.634	0.12
13_P	192_E	0.634	0.12
415_A	425_I	0.631	0.12
226_F	231_Q	0.630	0.12
396_A	399_A	0.629	0.12
278_V	288_A	0.628	0.12
443_Y	449_A	0.627	0.12
367_V	388_A	0.627	0.12
436_S	441_T	0.625	0.12
15_Y	79_R	0.624	0.12
356_T	377_A	0.623	0.12
417_V	432_V	0.623	0.12
247_R	259_V	0.622	0.12
519_G	529_S	0.622	0.12
245_A	276_D	0.621	0.12
126_G	131_P	0.621	0.12
242_R	246_N	0.621	0.12
437_A	443_Y	0.620	0.12
251_L	261_A	0.620	0.12
334_I	348_K	0.618	0.12
365_E	374_T	0.616	0.12
127_S	167_F	0.616	0.12
367_V	376_L	0.616	0.12
367_V	378_G	0.613	0.12
217_S	224_D	0.612	0.12
415_A	418_V	0.611	0.12
353_V	366_R	0.611	0.12
352_S	379_G	0.609	0.12
162_D	168_K	0.607	0.12
238_E	250_G	0.606	0.12
298_P	311_L	0.606	0.12
221_L	226_F	0.605	0.12
305_G	308_L	0.604	0.12
279_A	291_V	0.602	0.12
355_Y	371_L	0.601	0.12
371_L	375_V	0.601	0.12
253_V	265_M	0.600	0.12
277_A	281_A	0.600	0.12
439_T	442_N	0.600	0.12
316_D	336_A	0.599	0.12
223_R	227_G	0.597	0.12
370_L	373_I	0.597	0.12
320_L	336_A	0.596	0.12
244_Y	254_G	0.594	0.12
245_A	266_F	0.593	0.12
351_R	354_P	0.593	0.12
529_S	532_I	0.589	0.12
423_G	525_V	0.589	0.12
278_V	382_V	0.588	0.12
247_R	260_V	0.588	0.12
236_F	241_V	0.582	0.12
318_W	331_N	0.582	0.12
355_Y	370_L	0.580	0.12
255_S	269_I	0.579	0.12
244_Y	273_A	0.578	0.11
252_A	268_Y	0.578	0.11
337_R	344_A	0.577	0.11
356_T	365_E	0.577	0.11
52_D	82_A	0.577	0.11
351_R	361_S	0.576	0.11
79_R	99_D	0.576	0.11
247_R	268_Y	0.576	0.11
410_A	414_Q	0.575	0.11
423_G	428_S	0.574	0.11
9_S	21_I	0.573	0.11
460_V	466_Q	0.573	0.11
359_F	367_V	0.573	0.11
466_Q	470_D	0.572	0.11
317_V	337_R	0.571	0.11
354_P	370_L	0.570	0.11
245_A	260_V	0.569	0.11
295_L	325_F	0.569	0.11
255_S	265_M	0.569	0.11
251_L	276_D	0.568	0.11
426_A	431_A	0.567	0.11
54_T	108_H	0.562	0.11
246_N	270_D	0.562	0.11
253_V	262_F	0.562	0.11
17_E	96_V	0.561	0.11
292_V	314_R	0.561	0.11
420_T	432_V	0.561	0.11
414_Q	417_V	0.560	0.11
296_S	325_F	0.559	0.11
372_T	380_V	0.558	0.11
250_G	256_L	0.555	0.11
94_T	99_D	0.554	0.11
254_G	276_D	0.554	0.11
46_A	86_A	0.553	0.11
421_V	424_A	0.553	0.11
367_V	412_V	0.553	0.11
362_L	373_I	0.552	0.11
259_V	264_L	0.551	0.11
220_D	338_A	0.550	0.11
217_S	228_M	0.548	0.11
246_N	260_V	0.548	0.11
279_A	283_P	0.548	0.11
245_A	270_D	0.547	0.11
360_A	371_L	0.546	0.11
248_R	263_A	0.546	0.11
277_A	280_N	0.544	0.11
17_E	162_D	0.544	0.11
433_I	438_R	0.543	0.11
248_R	256_L	0.542	0.11
360_A	374_T	0.542	0.11
45_V	479_R	0.541	0.11
468_V	472_Q	0.541	0.11
459_L	467_F	0.541	0.11
11_V	141_R	0.539	0.11
105_D	471_I	0.539	0.11
359_F	369_D	0.538	0.11
337_R	342_I	0.538	0.11
359_F	377_A	0.538	0.11
518_V	524_S	0.538	0.11
294_A	344_A	0.537	0.11
353_V	369_D	0.537	0.11
242_R	273_A	0.536	0.11
255_S	267_V	0.535	0.11
317_V	345_Y	0.535	0.11
116_V	207_F	0.534	0.11
251_L	265_M	0.533	0.11
246_N	273_A	0.533	0.11
317_V	327_S	0.533	0.11
412_V	421_V	0.533	0.11
307_I	312_G	0.533	0.11
278_V	287_A	0.532	0.11
407_P	428_S	0.532	0.11
281_A	529_S	0.530	0.11
221_L	224_D	0.530	0.11
518_V	522_A	0.529	0.11
13_P	96_V	0.528	0.11
183_A	196_R	0.526	0.11
414_Q	429_T	0.526	0.11
294_A	297_W	0.526	0.11
306_D	321_T	0.525	0.11
363_A	366_R	0.524	0.11
46_A	72_H	0.524	0.11
8_V	201_G	0.523	0.11
250_G	267_V	0.518	0.11
364_V	375_V	0.517	0.11
456_Y	467_F	0.516	0.11
458_E	461_A	0.516	0.11
424_A	432_V	0.516	0.11
417_V	427_V	0.515	0.10
336_A	342_I	0.515	0.10
290_A	296_S	0.514	0.10
147_V	155_L	0.513	0.10
227_G	234_R	0.512	0.10
140_K	149_N	0.511	0.10
225_V	234_R	0.511	0.10
454_D	458_E	0.510	0.10
293_Y	298_P	0.510	0.10
43_V	92_G	0.510	0.10
249_T	270_D	0.509	0.10
243_P	249_T	0.509	0.10
352_S	357_T	0.507	0.10
46_A	76_R	0.505	0.10
352_S	371_L	0.503	0.10
73_S	207_F	0.503	0.10
118_T	385_S	0.502	0.10
244_Y	248_R	0.502	0.10
524_S	529_S	0.502	0.10
258_S	268_Y	0.501	0.10
417_V	421_V	0.500	0.10
355_Y	379_G	0.500	0.10
282_D	287_A	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4p02A	1	0.8893	100	0.724	Contact Map
2z86A	2	0.4055	100	0.757	Contact Map
3ckjA	2	0.4169	100	0.76	Contact Map
3bcvA	2	0.2932	100	0.763	Contact Map
2bo4A	4	0.513	100	0.765	Contact Map
1qg8A	1	0.3502	100	0.772	Contact Map
3f1yA	2	0.4479	100	0.775	Contact Map
1xhbA	1	0.6042	100	0.792	Contact Map
2d7iA	1	0.6238	100	0.794	Contact Map
2nxvA	4	0.3746	100	0.795	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0133 seconds.