Q9HS59 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HS59 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HS59	Sequences: MRTLVVCVDRAGDISRQTGLRTPIAGWEAVQSLVTDMGVADPEDASVNCLLEALRVTRDLRDGADDAVVAAVSATGDGVTADRSVAQQFDSLVDRHDPDSCVVVVDSAADERVVPIVESRIQVDAVDRVVVRQARDLESTYYLLKQFLADEELRQTVLVPVGIVLLVFPGLMMVTGSLAVAAASITTVIGLFLLYKGLGVDEYVAALPGQARDALYSGRVSIVTYVVAGGLGLVGVFAGALGLTNQAAGLSRLVAAMTFTYYSIPWVTLGALTASGGRLFDEYIRNDDVRTSFVNLPFGVLAVGLVVRGFAVYFMERAGIVAPLTAPSAALGALSVRGFQVSPEQRLAVFVVLGVLVSVAGIRVATYVSGVTIRDVERSAEQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	382 (331)
Sequences:	218 (163)
Seq/√Len:	8.9

HALSA - Q9HS59 Q9HNC9
SULSO - Q97ZG7

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
30_V	71_A	5.346	1.00
38_G	51_L	4.523	0.99
10_R	82_D	4.229	0.99
27_W	58_R	3.974	0.98
52_E	129_V	3.779	0.97
12_G	15_S	3.657	0.97
11_A	46_S	3.432	0.95
22_T	73_S	3.101	0.92
78_G	81_A	2.862	0.88
17_Q	37_M	2.788	0.87
37_M	41_D	2.682	0.84
13_D	74_A	2.656	0.84
6_V	70_A	2.594	0.82
123_V	279_L	2.587	0.82
56_V	104_V	2.474	0.79
72_V	89_F	2.351	0.75
223_V	256_A	2.311	0.74
27_W	31_Q	2.295	0.73
53_A	69_V	2.274	0.73
167_V	196_K	2.209	0.70
43_E	150_D	2.062	0.65
6_V	192_F	2.050	0.64
14_I	73_S	2.031	0.64
75_T	80_T	2.023	0.63
25_A	90_D	1.944	0.60
145_K	149_A	1.897	0.58
50_L	71_A	1.895	0.58
111_E	128_R	1.886	0.58
17_Q	41_D	1.803	0.54
27_W	54_L	1.793	0.54
24_I	224_T	1.773	0.53
104_V	176_G	1.770	0.53
229_G	234_V	1.770	0.53
69_V	127_D	1.757	0.52
157_V	196_K	1.742	0.51
34_V	107_S	1.729	0.51
12_G	17_Q	1.729	0.51
7_C	53_A	1.720	0.50
13_D	17_Q	1.706	0.50
180_V	234_V	1.705	0.50
13_D	46_S	1.697	0.49
199_G	284_I	1.681	0.49
128_R	162_G	1.647	0.47
239_G	263_S	1.637	0.47
263_S	271_A	1.637	0.47
27_W	37_M	1.623	0.46
123_V	177_S	1.617	0.46
82_D	125_A	1.610	0.46
120_R	124_D	1.592	0.45
105_V	121_I	1.567	0.44
8_V	70_A	1.549	0.43
39_V	104_V	1.540	0.43
88_Q	117_V	1.533	0.42
45_A	119_S	1.529	0.42
116_I	129_V	1.517	0.42
52_E	104_V	1.506	0.41
64_A	173_M	1.505	0.41
123_V	189_I	1.505	0.41
174_V	204_V	1.487	0.40
22_T	137_L	1.476	0.40
6_V	196_K	1.469	0.40
58_R	107_S	1.466	0.40
65_D	102_V	1.462	0.39
74_A	106_D	1.453	0.39
102_V	163_I	1.446	0.39
31_Q	187_T	1.441	0.39
5_V	79_V	1.440	0.38
280_F	293_F	1.438	0.38
37_M	107_S	1.435	0.38
34_V	37_M	1.413	0.37
215_L	271_A	1.396	0.37
89_F	202_E	1.394	0.37
204_V	249_G	1.391	0.36
256_A	259_F	1.379	0.36
109_A	164_V	1.376	0.36
46_S	107_S	1.374	0.36
20_L	50_L	1.373	0.36
29_A	231_L	1.369	0.36
33_L	123_V	1.362	0.35
72_V	229_G	1.362	0.35
69_V	148_L	1.360	0.35
31_Q	54_L	1.350	0.35
85_V	152_E	1.347	0.35
18_T	41_D	1.346	0.35
17_Q	74_A	1.343	0.35
27_W	107_S	1.327	0.34
234_V	320_I	1.326	0.34
53_A	137_L	1.322	0.34
8_V	269_L	1.316	0.34
154_R	198_L	1.313	0.33
32_S	36_D	1.304	0.33
128_R	215_L	1.301	0.33
310_F	331_L	1.299	0.33
102_V	115_P	1.299	0.33
108_A	197_G	1.298	0.33
41_D	150_D	1.288	0.32
269_L	276_G	1.287	0.32
83_R	197_G	1.276	0.32
130_V	224_T	1.276	0.32
119_S	131_V	1.274	0.32
128_R	145_K	1.274	0.32
59_D	305_L	1.272	0.32
259_F	309_G	1.269	0.32
69_V	113_V	1.267	0.32
59_D	89_F	1.263	0.32
22_T	79_V	1.252	0.31
281_D	298_F	1.246	0.31
6_V	327_P	1.244	0.31
37_M	108_A	1.243	0.31
218_G	298_F	1.237	0.31
17_Q	33_L	1.237	0.31
4_L	43_E	1.234	0.30
217_S	229_G	1.231	0.30
23_P	110_D	1.224	0.30
158_L	306_V	1.215	0.30
112_R	196_K	1.202	0.29
22_T	93_V	1.194	0.29
5_V	20_L	1.193	0.29
214_A	256_A	1.190	0.29
324_L	331_L	1.187	0.29
129_V	268_T	1.182	0.29
56_V	59_D	1.180	0.28
242_G	294_V	1.173	0.28
9_D	13_D	1.167	0.28
64_A	186_T	1.164	0.28
85_V	220_V	1.157	0.28
195_Y	201_D	1.151	0.27
59_D	64_A	1.149	0.27
5_V	216_Y	1.148	0.27
50_L	66_D	1.148	0.27
100_S	124_D	1.147	0.27
136_D	197_G	1.141	0.27
8_V	123_V	1.140	0.27
90_D	120_R	1.132	0.27
91_S	166_L	1.129	0.27
139_S	266_W	1.128	0.27
233_L	237_F	1.121	0.26
322_A	328_S	1.121	0.26
145_K	156_T	1.111	0.26
41_D	142_Y	1.108	0.26
160_P	304_G	1.108	0.26
45_A	117_V	1.105	0.26
14_I	30_V	1.093	0.26
116_I	189_I	1.092	0.25
13_D	44_D	1.086	0.25
219_R	258_T	1.085	0.25
108_A	150_D	1.079	0.25
44_D	106_D	1.078	0.25
236_V	267_V	1.077	0.25
123_V	183_A	1.076	0.25
322_A	325_T	1.072	0.25
114_V	272_L	1.066	0.25
34_V	51_L	1.053	0.24
53_A	82_D	1.053	0.24
98_P	140_T	1.049	0.24
8_V	78_G	1.047	0.24
4_L	70_A	1.037	0.24
11_A	107_S	1.036	0.24
168_F	192_F	1.035	0.24
137_L	169_P	1.034	0.24
5_V	280_F	1.031	0.24
98_P	185_I	1.029	0.23
160_P	309_G	1.027	0.23
10_R	53_A	1.023	0.23
37_M	192_F	1.017	0.23
253_L	257_M	1.017	0.23
87_Q	102_V	1.015	0.23
117_V	205_A	1.012	0.23
45_A	81_A	1.012	0.23
96_H	126_V	1.011	0.23
108_A	160_P	1.006	0.23
270_G	315_M	1.006	0.23
41_D	108_A	1.006	0.23
11_A	53_A	1.004	0.23
139_S	159_V	1.000	0.23
50_L	214_A	0.987	0.22
160_P	266_W	0.987	0.22
6_V	101_C	0.980	0.22
81_A	134_A	0.980	0.22
12_G	33_L	0.978	0.22
104_V	229_G	0.975	0.22
110_D	115_P	0.973	0.22
72_V	226_V	0.972	0.22
4_L	69_V	0.972	0.22
300_V	303_V	0.971	0.22
34_V	58_R	0.969	0.22
144_L	180_V	0.969	0.22
116_I	285_R	0.968	0.22
237_F	240_A	0.966	0.22
150_D	259_F	0.964	0.22
59_D	233_L	0.956	0.21
24_I	272_L	0.954	0.21
232_G	240_A	0.954	0.21
199_G	298_F	0.945	0.21
17_Q	40_A	0.944	0.21
228_A	277_G	0.941	0.21
204_V	253_L	0.938	0.21
34_V	151_E	0.932	0.21
220_V	260_T	0.927	0.20
146_Q	198_L	0.927	0.20
46_S	74_A	0.925	0.20
52_E	69_V	0.922	0.20
24_I	253_L	0.921	0.20
28_E	252_R	0.918	0.20
293_F	298_F	0.918	0.20
13_D	106_D	0.916	0.20
101_C	150_D	0.912	0.20
73_S	235_G	0.912	0.20
73_S	200_V	0.911	0.20
144_L	187_T	0.907	0.20
56_V	317_R	0.906	0.20
61_R	123_V	0.903	0.20
22_T	78_G	0.901	0.20
58_R	151_E	0.898	0.20
154_R	294_V	0.896	0.20
182_A	316_E	0.893	0.20
87_Q	91_S	0.893	0.20
146_Q	193_L	0.892	0.19
273_T	301_L	0.891	0.19
22_T	88_Q	0.889	0.19
85_V	189_I	0.888	0.19
37_M	58_R	0.888	0.19
12_G	74_A	0.883	0.19
8_V	22_T	0.880	0.19
53_A	267_V	0.872	0.19
11_A	57_T	0.871	0.19
12_G	16_R	0.869	0.19
134_A	154_R	0.868	0.19
105_V	284_I	0.866	0.19
36_D	61_R	0.860	0.19
5_V	226_V	0.860	0.19
116_I	157_V	0.859	0.19
39_V	95_R	0.858	0.19
34_V	47_V	0.856	0.19
325_T	329_A	0.855	0.18
51_L	107_S	0.855	0.18
88_Q	109_A	0.854	0.18
166_L	313_Y	0.853	0.18
12_G	61_R	0.853	0.18
57_T	73_S	0.853	0.18
79_V	125_A	0.851	0.18
110_D	117_V	0.850	0.18
83_R	297_P	0.847	0.18
45_A	131_V	0.845	0.18
3_T	124_D	0.841	0.18
51_L	147_F	0.836	0.18
24_I	326_A	0.835	0.18
104_V	333_A	0.835	0.18
99_D	233_L	0.834	0.18
162_G	197_G	0.832	0.18
45_A	142_Y	0.830	0.18
30_V	72_V	0.826	0.18
155_Q	199_G	0.821	0.18
8_V	300_V	0.818	0.18
182_A	189_I	0.817	0.18
54_L	77_D	0.817	0.18
115_P	125_A	0.816	0.17
39_V	196_K	0.815	0.17
5_V	204_V	0.814	0.17
24_I	116_I	0.814	0.17
159_V	198_L	0.814	0.17
56_V	305_L	0.813	0.17
114_V	253_L	0.813	0.17
15_S	46_S	0.813	0.17
8_V	255_A	0.812	0.17
151_E	292_S	0.809	0.17
169_P	281_D	0.800	0.17
129_V	162_G	0.800	0.17
46_S	80_T	0.798	0.17
67_A	204_V	0.796	0.17
136_D	159_V	0.793	0.17
14_I	27_W	0.790	0.17
225_Y	281_D	0.788	0.17
121_I	243_L	0.785	0.17
67_A	113_V	0.785	0.17
38_G	47_V	0.781	0.17
326_A	329_A	0.779	0.17
203_Y	284_I	0.777	0.17
54_L	203_Y	0.775	0.16
145_K	195_Y	0.774	0.16
28_E	73_S	0.771	0.16
126_V	154_R	0.769	0.16
159_V	195_Y	0.766	0.16
12_G	173_M	0.764	0.16
25_A	245_N	0.763	0.16
307_V	310_F	0.756	0.16
156_T	270_G	0.755	0.16
282_E	293_F	0.753	0.16
235_G	275_S	0.750	0.16
86_A	266_W	0.749	0.16
117_V	169_P	0.749	0.16
148_L	332_G	0.748	0.16
186_T	200_V	0.747	0.16
14_I	233_L	0.747	0.16
33_L	46_S	0.747	0.16
62_D	278_R	0.745	0.16
194_L	224_T	0.744	0.16
196_K	205_A	0.742	0.16
194_L	277_G	0.742	0.16
276_G	280_F	0.738	0.16
256_A	264_I	0.738	0.16
27_W	262_Y	0.737	0.16
124_D	160_P	0.733	0.16
279_L	321_V	0.730	0.15
115_P	119_S	0.729	0.15
59_D	265_P	0.729	0.15
233_L	254_V	0.724	0.15
136_D	266_W	0.723	0.15
81_A	257_M	0.722	0.15
191_L	206_A	0.721	0.15
46_S	106_D	0.721	0.15
53_A	269_L	0.718	0.15
11_A	33_L	0.715	0.15
14_I	85_V	0.713	0.15
223_V	228_A	0.713	0.15
84_S	294_V	0.713	0.15
261_Y	312_V	0.711	0.15
194_L	229_G	0.710	0.15
10_R	43_E	0.708	0.15
39_V	87_Q	0.707	0.15
128_R	133_Q	0.704	0.15
66_D	260_T	0.703	0.15
228_A	270_G	0.703	0.15
47_V	215_L	0.703	0.15
57_T	66_D	0.702	0.15
125_A	128_R	0.698	0.15
6_V	13_D	0.698	0.15
81_A	88_Q	0.696	0.15
85_V	99_D	0.696	0.15
45_A	74_A	0.695	0.15
5_V	181_A	0.694	0.15
270_G	280_F	0.693	0.15
178_L	320_I	0.693	0.15
39_V	52_E	0.691	0.15
189_I	249_G	0.691	0.15
45_A	168_F	0.690	0.15
171_L	256_A	0.690	0.15
9_D	26_G	0.689	0.15
73_S	197_G	0.687	0.14
73_S	92_L	0.687	0.14
105_V	152_E	0.687	0.14
226_V	269_L	0.681	0.14
6_V	49_C	0.681	0.14
269_L	280_F	0.680	0.14
10_R	125_A	0.680	0.14
53_A	93_V	0.678	0.14
223_V	313_Y	0.677	0.14
83_R	263_S	0.675	0.14
25_A	171_L	0.674	0.14
65_D	105_V	0.672	0.14
232_G	270_G	0.671	0.14
103_V	198_L	0.671	0.14
147_F	272_L	0.669	0.14
284_I	289_V	0.667	0.14
14_I	176_G	0.667	0.14
132_R	159_V	0.666	0.14
325_T	328_S	0.662	0.14
159_V	270_G	0.660	0.14
144_L	192_F	0.659	0.14
88_Q	139_S	0.658	0.14
264_I	293_F	0.657	0.14
36_D	132_R	0.654	0.14
139_S	160_P	0.652	0.14
90_D	331_L	0.649	0.14
258_T	262_Y	0.644	0.14
55_R	58_R	0.644	0.14
109_A	138_E	0.644	0.14
174_V	245_N	0.644	0.14
159_V	266_W	0.642	0.14
67_A	181_A	0.640	0.14
125_A	159_V	0.638	0.13
116_I	150_D	0.638	0.13
84_S	87_Q	0.638	0.13
46_S	57_T	0.637	0.13
13_D	138_E	0.636	0.13
2_R	151_E	0.635	0.13
30_V	37_M	0.634	0.13
22_T	96_H	0.632	0.13
35_T	50_L	0.632	0.13
219_R	298_F	0.632	0.13
43_E	160_P	0.632	0.13
75_T	123_V	0.631	0.13
93_V	121_I	0.627	0.13
51_L	292_S	0.626	0.13
67_A	144_L	0.626	0.13
70_A	113_V	0.625	0.13
88_Q	262_Y	0.623	0.13
224_T	231_L	0.622	0.13
189_I	333_A	0.621	0.13
13_D	37_M	0.620	0.13
266_W	315_M	0.620	0.13
184_S	209_G	0.618	0.13
8_V	13_D	0.616	0.13
19_G	121_I	0.615	0.13
207_L	313_Y	0.615	0.13
101_C	113_V	0.613	0.13
139_S	150_D	0.612	0.13
15_S	33_L	0.609	0.13
237_F	303_V	0.609	0.13
33_L	71_A	0.608	0.13
65_D	235_G	0.608	0.13
102_V	174_V	0.608	0.13
272_L	307_V	0.607	0.13
117_V	229_G	0.607	0.13
188_V	192_F	0.607	0.13
20_L	61_R	0.600	0.13
24_I	77_D	0.596	0.13
192_F	196_K	0.596	0.13
161_V	288_D	0.595	0.13
144_L	314_F	0.594	0.13
14_I	25_A	0.593	0.13
159_V	216_Y	0.591	0.13
122_Q	222_I	0.591	0.13
30_V	81_A	0.590	0.13
3_T	67_A	0.588	0.12
156_T	160_P	0.586	0.12
66_D	262_Y	0.586	0.12
135_R	290_R	0.584	0.12
28_E	93_V	0.583	0.12
53_A	182_A	0.582	0.12
14_I	67_A	0.582	0.12
55_R	105_V	0.581	0.12
27_W	111_E	0.579	0.12
165_L	218_G	0.579	0.12
133_Q	143_L	0.578	0.12
55_R	59_D	0.577	0.12
14_I	61_R	0.577	0.12
328_S	332_G	0.576	0.12
126_V	260_T	0.575	0.12
8_V	53_A	0.575	0.12
54_L	332_G	0.575	0.12
15_S	68_V	0.574	0.12
7_C	139_S	0.574	0.12
5_V	301_L	0.573	0.12
95_R	104_V	0.570	0.12
21_R	249_G	0.567	0.12
104_V	319_G	0.565	0.12
141_Y	266_W	0.563	0.12
8_V	287_D	0.561	0.12
129_V	176_G	0.559	0.12
97_D	294_V	0.558	0.12
167_V	232_G	0.557	0.12
114_V	192_F	0.557	0.12
157_V	193_L	0.557	0.12
146_Q	165_L	0.555	0.12
24_I	91_S	0.554	0.12
12_G	333_A	0.553	0.12
81_A	161_V	0.552	0.12
76_G	226_V	0.551	0.12
54_L	98_P	0.550	0.12
6_V	16_R	0.549	0.12
67_A	92_L	0.549	0.12
72_V	117_V	0.548	0.12
17_Q	58_R	0.545	0.12
36_D	315_M	0.544	0.12
117_V	135_R	0.544	0.12
129_V	260_T	0.543	0.12
184_S	202_E	0.542	0.12
53_A	115_P	0.541	0.12
98_P	276_G	0.541	0.12
38_G	143_L	0.539	0.12
243_L	259_F	0.539	0.12
5_V	67_A	0.539	0.12
40_A	58_R	0.537	0.12
29_A	233_L	0.537	0.12
162_G	168_F	0.537	0.12
220_V	296_L	0.533	0.11
39_V	322_A	0.533	0.11
127_D	168_F	0.532	0.11
162_G	188_V	0.530	0.11
67_A	226_V	0.530	0.11
141_Y	194_L	0.526	0.11
320_I	330_A	0.525	0.11
17_Q	192_F	0.524	0.11
86_A	120_R	0.523	0.11
205_A	285_R	0.523	0.11
7_C	277_G	0.522	0.11
42_P	57_T	0.521	0.11
117_V	303_V	0.518	0.11
109_A	153_L	0.518	0.11
123_V	174_V	0.517	0.11
157_V	265_P	0.516	0.11
223_V	309_G	0.514	0.11
227_V	248_A	0.513	0.11
220_V	249_G	0.511	0.11
2_R	118_E	0.510	0.11
64_A	148_L	0.510	0.11
98_P	125_A	0.509	0.11
43_E	108_A	0.508	0.11
28_E	69_V	0.504	0.11
101_C	196_K	0.503	0.11
251_S	279_L	0.502	0.11
327_P	331_L	0.502	0.11
165_L	260_T	0.501	0.11
41_D	277_G	0.501	0.11
223_V	259_F	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4j29A	2	0.1361	51.8	0.971	Contact Map
2aifA	1	0.1283	49.2	0.971	Contact Map
1e2bA	1	0.233	44.3	0.972	Contact Map
3ar4A	1	0.8482	34.4	0.973	Contact Map
4nutA	1	0.1335	29.3	0.974	Contact Map
4bbjA	1	0.4817	28.6	0.975	Contact Map
4ezeA	1	0.3743	23.5	0.976	Contact Map
2l2qA	1	0.233	20.7	0.976	Contact Map
2yxbA	1	0.3141	20.5	0.976	Contact Map
2gmwA	1	0.3063	19.5	0.976	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0101 seconds.