Q9HS54 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HS54 - mRNA 3'-end processing factor homolog

UniProt:	Q9HS54	Sequences: MSTVDRQLEELQDEIVSEIPADISVTDVKYEGPELVVYTRDPKQFAQDGDLVRRLASKLRKRITVRPDPAVLSSPKRARDRVLDVIPEEAGVTNLDFHEDTGEVVIEAEKPGMVIGRHGSTLREITQEAGWTPEVVRTPPIESSTVSNVRNFLKQERDERRDILETVGRQIHREEMQDDEYVRVTTLGCCREVGRASFVLSTPETRILVDCGDKPGSEDEVPYLQVQEALAGGANTIDAVILTHAHLDHSAFIPLLFKYGYDGPIYCTEPTRDLMGLLTLDYLDVAAKEGRAPPYDSEMVREAIKHCIPLEYGDVTDIAPDVKLTFHNAGHILGSAVSHFHIGDGLYNVAFSGDIHYDDTRLFNGAVNDFPRVETLVMESTYGGRNDYQTDQEDSERKLKRVINETYEDGGKVLIPAFAVGRSQEMMLVLEEAMREGEIPEMPIHLDGMIWEATAIHTTYPEYLRDDLRDRIFHSDSNPFLAPQFNHIDGGEEERQAVADDDQCIILSTSGMVSGGPIMSWLEHIAPDPDSTLTFVGYQAQGTLGRRIQSGRDKIPMPDSRSGGRTEHLQLNMGVETVDGFSGHADRQGLEDFVRTMNPRPEKVLCVHGDESSTQDLSSALYHEFNMRTFAPKNLETFRFV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	641 (527)
Sequences:	327 (223)
Seq/√Len:	9.7

HALSA - Q9HS54
SULSO - Q7LYL5 Q980D0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
209_V	340_F	5.464	1.00
182_V	349_V	4.963	1.00
205_T	238_D	4.660	1.00
209_V	243_T	4.052	0.99
222_P	225_Q	3.728	0.98
207_I	322_V	3.256	0.95
418_F	537_G	3.241	0.95
253_I	265_I	3.164	0.94
535_F	567_E	3.032	0.93
240_V	257_F	3.028	0.92
74_S	77_R	2.863	0.90
186_T	190_C	2.838	0.90
539_Q	545_G	2.825	0.90
375_T	605_L	2.761	0.88
116_G	137_R	2.729	0.88
566_T	569_L	2.655	0.86
189_C	251_A	2.650	0.86
355_I	378_M	2.585	0.85
585_A	589_G	2.547	0.84
277_L	456_I	2.543	0.84
339_H	348_N	2.529	0.83
62_R	66_R	2.467	0.82
87_P	90_A	2.406	0.80
591_E	620_A	2.394	0.80
562_S	569_L	2.388	0.79
116_G	119_G	2.375	0.79
506_I	525_I	2.358	0.79
387_D	613_S	2.351	0.78
79_R	83_L	2.348	0.78
125_I	133_P	2.330	0.78
361_R	396_E	2.328	0.78
111_P	131_W	2.297	0.77
505_I	533_L	2.273	0.76
334_G	463_Y	2.272	0.76
112_G	116_G	2.264	0.76
80_D	84_D	2.199	0.73
614_T	631_A	2.178	0.73
189_C	196_A	2.161	0.72
209_V	302_E	2.160	0.72
92_V	112_G	2.116	0.70
542_G	545_G	2.114	0.70
324_L	343_G	2.104	0.70
87_P	103_E	2.093	0.69
539_Q	542_G	2.090	0.69
539_Q	551_G	2.090	0.69
110_K	116_G	2.022	0.67
76_K	80_D	1.998	0.66
257_F	306_H	1.994	0.66
539_Q	549_Q	1.988	0.65
242_L	253_I	1.971	0.65
110_K	115_I	1.960	0.64
356_H	583_G	1.948	0.64
522_L	571_L	1.940	0.63
241_I	590_L	1.918	0.62
192_E	578_V	1.906	0.62
421_G	425_E	1.900	0.62
256_L	456_I	1.892	0.61
470_D	520_S	1.892	0.61
330_G	421_G	1.871	0.60
199_V	256_L	1.865	0.60
350_A	489_D	1.862	0.60
327_H	337_V	1.861	0.60
196_A	414_L	1.847	0.59
539_Q	550_S	1.843	0.59
112_G	131_W	1.834	0.59
267_C	275_M	1.832	0.59
545_G	551_G	1.831	0.59
266_Y	318_I	1.828	0.59
115_I	139_P	1.827	0.58
549_Q	555_I	1.827	0.58
103_E	139_P	1.811	0.58
404_N	433_A	1.811	0.58
422_R	511_G	1.785	0.57
185_T	637_T	1.783	0.57
426_M	506_I	1.783	0.57
239_A	335_S	1.773	0.56
225_Q	228_E	1.771	0.56
348_N	581_F	1.770	0.56
539_Q	552_R	1.765	0.56
241_I	408_E	1.760	0.55
87_P	108_A	1.742	0.55
196_A	251_A	1.717	0.54
205_T	321_D	1.715	0.53
362_L	421_G	1.708	0.53
542_G	549_Q	1.708	0.53
209_V	351_F	1.701	0.53
562_S	566_T	1.682	0.52
341_H	371_P	1.681	0.52
350_A	373_V	1.680	0.52
231_A	260_G	1.674	0.52
315_V	323_K	1.666	0.51
531_S	539_Q	1.665	0.51
562_S	567_E	1.664	0.51
540_A	543_T	1.660	0.51
119_G	125_I	1.658	0.51
324_L	341_H	1.654	0.51
541_Q	550_S	1.636	0.50
590_L	620_A	1.635	0.50
202_T	321_D	1.632	0.50
92_V	117_R	1.631	0.50
407_Y	442_M	1.626	0.49
361_R	525_I	1.616	0.49
207_I	548_I	1.615	0.49
165_E	174_E	1.598	0.48
274_L	419_A	1.582	0.47
520_S	540_A	1.581	0.47
80_D	86_I	1.580	0.47
160_R	164_L	1.579	0.47
217_S	568_H	1.566	0.47
114_V	119_G	1.531	0.45
106_I	133_P	1.531	0.45
422_R	582_S	1.523	0.45
415_I	506_I	1.519	0.45
197_S	267_C	1.511	0.44
541_Q	562_S	1.508	0.44
185_T	229_A	1.495	0.44
312_Y	328_N	1.489	0.43
584_H	608_H	1.478	0.43
352_S	610_D	1.470	0.42
200_L	209_V	1.464	0.42
209_V	363_F	1.459	0.42
90_A	93_T	1.458	0.42
271_T	424_Q	1.445	0.41
196_A	606_C	1.443	0.41
591_E	621_L	1.434	0.41
379_E	607_V	1.429	0.41
190_C	198_F	1.413	0.40
330_G	425_E	1.413	0.40
531_S	542_G	1.410	0.40
431_E	446_L	1.405	0.40
549_Q	554_K	1.396	0.39
95_L	117_R	1.392	0.39
619_S	629_T	1.372	0.38
102_G	106_I	1.369	0.38
542_G	550_S	1.368	0.38
115_I	119_G	1.362	0.38
224_L	255_L	1.358	0.38
427_M	485_F	1.358	0.38
105_V	123_R	1.356	0.38
110_K	122_L	1.356	0.38
89_E	95_L	1.347	0.37
112_G	115_I	1.345	0.37
258_K	589_G	1.342	0.37
276_G	280_L	1.341	0.37
542_G	555_I	1.337	0.37
401_R	405_E	1.318	0.36
126_T	130_G	1.316	0.36
352_S	355_I	1.307	0.35
256_L	263_G	1.305	0.35
539_Q	546_R	1.297	0.35
89_E	119_G	1.296	0.35
278_L	449_M	1.296	0.35
408_E	619_S	1.289	0.35
604_V	617_L	1.285	0.35
72_L	75_P	1.283	0.35
80_D	83_L	1.282	0.34
350_A	640_F	1.281	0.34
595_R	624_E	1.277	0.34
531_S	550_S	1.269	0.34
522_L	526_A	1.264	0.34
467_D	473_F	1.259	0.34
106_I	124_E	1.257	0.33
464_L	535_F	1.255	0.33
444_I	505_I	1.253	0.33
395_S	399_L	1.250	0.33
117_R	133_P	1.248	0.33
345_G	380_S	1.244	0.33
371_P	446_L	1.244	0.33
240_V	253_I	1.241	0.33
400_K	425_E	1.232	0.32
114_V	121_T	1.231	0.32
381_T	608_H	1.230	0.32
350_A	376_L	1.222	0.32
403_I	488_I	1.213	0.32
125_I	129_A	1.209	0.32
366_A	406_T	1.208	0.32
406_T	445_H	1.206	0.31
216_G	588_Q	1.200	0.31
588_Q	591_E	1.200	0.31
129_A	209_V	1.199	0.31
202_T	612_S	1.198	0.31
125_I	138_T	1.193	0.31
511_G	582_S	1.190	0.31
108_A	116_G	1.190	0.31
160_R	168_G	1.189	0.31
84_D	91_G	1.185	0.31
120_S	134_E	1.184	0.31
256_L	531_S	1.184	0.31
543_T	551_G	1.180	0.30
123_R	138_T	1.179	0.30
242_L	282_Y	1.179	0.30
621_L	627_M	1.178	0.30
130_G	135_V	1.167	0.30
108_A	135_V	1.165	0.30
90_A	107_E	1.157	0.30
114_V	139_P	1.152	0.29
467_D	470_D	1.151	0.29
128_E	137_R	1.150	0.29
209_V	423_S	1.133	0.29
602_E	629_T	1.130	0.29
251_A	508_S	1.125	0.28
224_L	592_D	1.124	0.28
584_H	609_G	1.121	0.28
104_V	125_I	1.120	0.28
184_V	377_V	1.118	0.28
594_V	604_V	1.113	0.28
103_E	109_E	1.111	0.28
537_G	548_I	1.111	0.28
258_K	360_T	1.110	0.28
569_L	572_N	1.110	0.28
201_S	255_L	1.107	0.28
192_E	529_P	1.106	0.28
531_S	545_G	1.106	0.28
363_F	421_G	1.105	0.28
97_F	102_G	1.101	0.27
257_F	383_G	1.101	0.27
538_Y	546_R	1.100	0.27
258_K	519_M	1.096	0.27
470_D	473_F	1.095	0.27
352_S	396_E	1.089	0.27
197_S	208_L	1.087	0.27
88_E	92_V	1.086	0.27
267_C	543_T	1.082	0.27
451_W	616_D	1.082	0.27
200_L	619_S	1.073	0.26
144_S	148_N	1.073	0.26
531_S	552_R	1.072	0.26
274_L	453_A	1.071	0.26
339_H	460_Y	1.070	0.26
508_S	586_D	1.069	0.26
542_G	551_G	1.069	0.26
591_E	625_F	1.065	0.26
106_I	131_W	1.064	0.26
221_V	383_G	1.063	0.26
235_N	376_L	1.063	0.26
448_G	511_G	1.060	0.26
273_D	459_T	1.058	0.26
112_G	127_Q	1.054	0.26
241_I	340_F	1.053	0.26
273_D	327_H	1.052	0.26
526_A	569_L	1.052	0.26
376_L	399_L	1.050	0.26
61_K	78_A	1.048	0.26
545_G	549_Q	1.047	0.26
311_E	314_D	1.045	0.26
121_T	133_P	1.045	0.26
520_S	523_E	1.044	0.25
104_V	143_S	1.042	0.25
108_A	112_G	1.040	0.25
549_Q	552_R	1.039	0.25
74_S	78_A	1.037	0.25
413_V	506_I	1.036	0.25
127_Q	130_G	1.035	0.25
191_R	634_N	1.035	0.25
189_C	214_K	1.035	0.25
373_V	597_M	1.031	0.25
166_T	170_Q	1.025	0.25
520_S	585_A	1.025	0.25
192_E	311_E	1.022	0.25
242_L	275_M	1.020	0.25
339_H	351_F	1.018	0.25
541_Q	555_I	1.017	0.25
107_E	125_I	1.016	0.25
86_I	92_V	1.014	0.24
92_V	101_T	1.010	0.24
318_I	485_F	1.008	0.24
118_H	154_K	1.007	0.24
341_H	348_N	1.005	0.24
443_P	449_M	1.001	0.24
144_S	209_V	0.999	0.24
531_S	546_R	0.999	0.24
201_S	558_P	0.999	0.24
547_R	551_G	0.999	0.24
417_A	446_L	0.997	0.24
542_G	548_I	0.996	0.24
104_V	114_V	0.993	0.24
102_G	108_A	0.990	0.24
86_I	89_E	0.989	0.24
102_G	107_E	0.989	0.24
116_G	143_S	0.987	0.24
85_V	119_G	0.987	0.24
189_C	356_H	0.987	0.24
96_D	102_G	0.985	0.24
233_G	426_M	0.982	0.23
97_F	114_V	0.978	0.23
101_T	122_L	0.977	0.23
422_R	448_G	0.974	0.23
209_V	338_S	0.974	0.23
67_P	71_V	0.967	0.23
89_E	126_T	0.962	0.23
309_P	467_D	0.961	0.23
99_E	122_L	0.959	0.23
490_G	605_L	0.959	0.23
141_I	444_I	0.958	0.23
305_K	605_L	0.955	0.23
190_C	607_V	0.953	0.22
85_V	89_E	0.952	0.22
112_G	130_G	0.948	0.22
207_I	634_N	0.946	0.22
192_E	256_L	0.946	0.22
278_L	282_Y	0.945	0.22
74_S	81_R	0.944	0.22
116_G	127_Q	0.943	0.22
258_K	326_F	0.935	0.22
147_S	151_N	0.933	0.22
97_F	117_R	0.930	0.22
97_F	128_E	0.930	0.22
550_S	566_T	0.929	0.22
207_I	432_E	0.928	0.22
211_C	274_L	0.926	0.22
114_V	117_R	0.922	0.22
541_Q	548_I	0.921	0.22
497_A	533_L	0.919	0.21
92_V	95_L	0.915	0.21
315_V	506_I	0.914	0.21
164_L	168_G	0.913	0.21
64_T	67_P	0.913	0.21
418_F	511_G	0.908	0.21
209_V	349_V	0.905	0.21
118_H	144_S	0.901	0.21
119_G	133_P	0.900	0.21
207_I	237_I	0.899	0.21
315_V	413_V	0.898	0.21
251_A	356_H	0.895	0.21
576_E	636_E	0.894	0.21
182_V	509_T	0.894	0.21
213_D	222_P	0.894	0.21
136_V	140_P	0.891	0.21
125_I	139_P	0.890	0.21
73_S	496_Q	0.889	0.21
75_P	110_K	0.888	0.21
537_G	541_Q	0.888	0.21
332_I	426_M	0.887	0.20
274_L	572_N	0.885	0.20
378_M	617_L	0.882	0.20
548_I	571_L	0.882	0.20
107_E	138_T	0.882	0.20
225_Q	640_F	0.882	0.20
82_V	87_P	0.881	0.20
84_D	89_E	0.880	0.20
102_G	128_E	0.878	0.20
272_R	307_C	0.874	0.20
111_P	143_S	0.874	0.20
87_P	131_W	0.871	0.20
192_E	195_R	0.869	0.20
425_E	585_A	0.865	0.20
105_V	133_P	0.863	0.20
362_L	520_S	0.862	0.20
337_V	593_F	0.859	0.20
199_V	342_I	0.857	0.20
61_K	65_V	0.856	0.20
90_A	108_A	0.855	0.20
539_Q	543_T	0.852	0.19
110_K	135_V	0.852	0.19
123_R	130_G	0.849	0.19
126_T	131_W	0.847	0.19
531_S	549_Q	0.846	0.19
84_D	96_D	0.843	0.19
351_F	363_F	0.842	0.19
182_V	344_D	0.842	0.19
284_D	361_R	0.839	0.19
91_G	95_L	0.838	0.19
171_I	323_K	0.833	0.19
112_G	141_I	0.832	0.19
100_D	118_H	0.832	0.19
97_F	237_I	0.831	0.19
422_R	583_G	0.829	0.19
97_F	104_V	0.827	0.19
135_V	167_V	0.823	0.19
273_D	587_R	0.823	0.19
538_Y	545_G	0.819	0.19
121_T	127_Q	0.819	0.19
93_T	155_Q	0.818	0.19
535_F	548_I	0.817	0.19
131_W	143_S	0.817	0.19
308_I	362_L	0.816	0.18
79_R	88_E	0.816	0.18
111_P	114_V	0.814	0.18
459_T	557_M	0.814	0.18
83_L	99_E	0.814	0.18
618_S	629_T	0.813	0.18
312_Y	336_A	0.812	0.18
66_R	70_A	0.812	0.18
94_N	114_V	0.811	0.18
337_V	350_A	0.811	0.18
507_L	546_R	0.810	0.18
465_R	531_S	0.804	0.18
87_P	104_V	0.803	0.18
97_F	130_G	0.802	0.18
545_G	550_S	0.802	0.18
349_V	432_E	0.802	0.18
78_A	82_V	0.799	0.18
80_D	104_V	0.798	0.18
215_P	451_W	0.798	0.18
105_V	155_Q	0.797	0.18
106_I	139_P	0.794	0.18
499_A	528_D	0.794	0.18
260_G	464_L	0.794	0.18
75_P	108_A	0.794	0.18
253_I	271_T	0.791	0.18
273_D	277_L	0.789	0.18
99_E	104_V	0.787	0.18
234_A	261_Y	0.785	0.18
211_C	418_F	0.785	0.18
542_G	558_P	0.783	0.18
90_A	97_F	0.780	0.18
415_I	426_M	0.780	0.18
104_V	124_E	0.779	0.17
127_Q	151_N	0.776	0.17
92_V	116_G	0.776	0.17
548_I	552_R	0.773	0.17
545_G	552_R	0.772	0.17
82_V	90_A	0.771	0.17
77_R	81_R	0.770	0.17
137_R	538_Y	0.770	0.17
224_L	355_I	0.768	0.17
220_E	524_H	0.768	0.17
448_G	583_G	0.768	0.17
113_M	126_T	0.767	0.17
105_V	149_V	0.766	0.17
102_G	129_A	0.764	0.17
358_D	524_H	0.763	0.17
360_T	395_S	0.762	0.17
97_F	317_D	0.762	0.17
107_E	118_H	0.760	0.17
104_V	108_A	0.758	0.17
539_Q	548_I	0.757	0.17
531_S	535_F	0.756	0.17
192_E	363_F	0.756	0.17
538_Y	557_M	0.754	0.17
143_S	149_V	0.753	0.17
278_L	450_I	0.752	0.17
532_T	549_Q	0.752	0.17
550_S	562_S	0.751	0.17
120_S	385_R	0.751	0.17
276_G	309_P	0.751	0.17
111_P	129_A	0.750	0.17
121_T	138_T	0.748	0.17
61_K	82_V	0.748	0.17
385_R	463_Y	0.746	0.17
351_F	417_A	0.745	0.17
282_Y	589_G	0.744	0.17
82_V	131_W	0.743	0.17
108_A	114_V	0.743	0.17
116_G	122_L	0.743	0.17
361_R	369_D	0.742	0.17
334_G	421_G	0.741	0.17
552_R	555_I	0.739	0.16
336_A	529_P	0.736	0.16
112_G	118_H	0.736	0.16
423_S	519_M	0.736	0.16
99_E	124_E	0.730	0.16
313_G	419_A	0.727	0.16
200_L	431_E	0.727	0.16
426_M	631_A	0.727	0.16
213_D	224_L	0.727	0.16
133_P	140_P	0.726	0.16
96_D	230_L	0.724	0.16
215_P	251_A	0.724	0.16
103_E	136_V	0.723	0.16
234_A	323_K	0.723	0.16
335_S	414_L	0.721	0.16
86_I	113_M	0.720	0.16
409_D	574_G	0.716	0.16
126_T	132_T	0.715	0.16
246_H	381_T	0.714	0.16
248_D	381_T	0.714	0.16
166_T	253_I	0.713	0.16
61_K	66_R	0.711	0.16
368_N	597_M	0.711	0.16
81_R	88_E	0.710	0.16
101_T	133_P	0.710	0.16
76_K	79_R	0.710	0.16
200_L	351_F	0.709	0.16
110_K	113_M	0.709	0.16
510_S	580_G	0.709	0.16
585_A	607_V	0.707	0.16
61_K	110_K	0.706	0.16
202_T	206_R	0.706	0.16
427_M	459_T	0.706	0.16
517_P	539_Q	0.706	0.16
569_L	638_F	0.705	0.16
99_E	135_V	0.705	0.16
107_E	111_P	0.705	0.16
101_T	159_E	0.705	0.16
120_S	597_M	0.704	0.16
86_I	124_E	0.704	0.16
115_I	122_L	0.701	0.16
97_F	126_T	0.701	0.16
115_I	124_E	0.700	0.16
248_D	584_H	0.698	0.15
246_H	584_H	0.698	0.15
176_M	605_L	0.698	0.15
131_W	308_I	0.697	0.15
396_E	522_L	0.697	0.15
87_P	203_P	0.697	0.15
63_I	66_R	0.697	0.15
340_F	415_I	0.697	0.15
221_V	426_M	0.696	0.15
131_W	137_R	0.695	0.15
387_D	625_F	0.693	0.15
181_Y	549_Q	0.693	0.15
547_R	555_I	0.692	0.15
325_T	421_G	0.692	0.15
92_V	99_E	0.691	0.15
358_D	361_R	0.688	0.15
617_L	620_A	0.688	0.15
200_L	340_F	0.687	0.15
61_K	525_I	0.686	0.15
355_I	360_T	0.684	0.15
100_D	104_V	0.683	0.15
105_V	134_E	0.682	0.15
320_P	335_S	0.681	0.15
194_G	248_D	0.679	0.15
349_V	640_F	0.679	0.15
194_G	246_H	0.679	0.15
130_G	137_R	0.678	0.15
539_Q	555_I	0.678	0.15
242_L	509_T	0.677	0.15
264_P	448_G	0.677	0.15
330_G	416_P	0.676	0.15
143_S	146_V	0.675	0.15
543_T	549_Q	0.675	0.15
92_V	96_D	0.674	0.15
507_L	607_V	0.674	0.15
240_V	413_V	0.673	0.15
199_V	567_E	0.670	0.15
123_R	135_V	0.669	0.15
234_A	280_L	0.669	0.15
82_V	86_I	0.668	0.15
232_G	256_L	0.668	0.15
107_E	120_S	0.667	0.15
461_P	526_A	0.666	0.15
213_D	359_D	0.665	0.15
332_I	509_T	0.663	0.15
77_R	82_V	0.661	0.15
356_H	360_T	0.660	0.15
384_G	387_D	0.659	0.15
102_G	127_Q	0.659	0.15
70_A	73_S	0.657	0.15
119_G	161_R	0.656	0.15
318_I	330_G	0.655	0.14
618_S	640_F	0.654	0.14
345_G	583_G	0.654	0.14
66_R	69_P	0.653	0.14
111_P	130_G	0.653	0.14
215_P	380_S	0.652	0.14
325_T	425_E	0.652	0.14
193_V	281_D	0.652	0.14
393_E	592_D	0.650	0.14
129_A	135_V	0.650	0.14
512_M	585_A	0.650	0.14
189_C	198_F	0.649	0.14
104_V	131_W	0.649	0.14
302_E	528_D	0.648	0.14
89_E	92_V	0.648	0.14
250_S	606_C	0.648	0.14
184_V	360_T	0.647	0.14
89_E	121_T	0.647	0.14
499_A	564_G	0.646	0.14
428_L	628_R	0.646	0.14
274_L	607_V	0.646	0.14
202_T	240_V	0.645	0.14
197_S	460_Y	0.645	0.14
117_R	134_E	0.645	0.14
140_P	146_V	0.644	0.14
354_D	516_G	0.643	0.14
331_H	354_D	0.643	0.14
331_H	516_G	0.643	0.14
212_G	331_H	0.643	0.14
244_H	331_H	0.643	0.14
244_H	516_G	0.643	0.14
184_V	406_T	0.643	0.14
212_G	516_G	0.643	0.14
212_G	354_D	0.643	0.14
212_G	249_H	0.643	0.14
244_H	354_D	0.643	0.14
249_H	331_H	0.643	0.14
212_G	244_H	0.643	0.14
244_H	249_H	0.643	0.14
249_H	516_G	0.643	0.14
249_H	354_D	0.643	0.14
119_G	127_Q	0.642	0.14
83_L	87_P	0.642	0.14
210_D	244_H	0.641	0.14
210_D	516_G	0.641	0.14
210_D	331_H	0.641	0.14
230_L	472_I	0.641	0.14
210_D	354_D	0.641	0.14
210_D	249_H	0.641	0.14
192_E	590_L	0.640	0.14
378_M	590_L	0.639	0.14
366_A	455_A	0.638	0.14
203_P	209_V	0.638	0.14
98_H	103_E	0.637	0.14
112_G	119_G	0.637	0.14
265_I	569_L	0.636	0.14
284_D	338_S	0.636	0.14
106_I	114_V	0.635	0.14
189_C	463_Y	0.635	0.14
149_V	180_E	0.634	0.14
104_V	132_T	0.634	0.14
194_G	448_G	0.632	0.14
75_P	79_R	0.632	0.14
368_N	533_L	0.632	0.14
135_V	148_N	0.631	0.14
123_R	140_P	0.630	0.14
240_V	546_R	0.629	0.14
274_L	593_F	0.629	0.14
96_D	154_K	0.629	0.14
130_G	142_E	0.627	0.14
100_D	113_M	0.627	0.14
207_I	340_F	0.626	0.14
541_Q	549_Q	0.626	0.14
582_S	601_P	0.625	0.14
103_E	117_R	0.625	0.14
186_T	189_C	0.623	0.14
114_V	124_E	0.622	0.14
534_T	542_G	0.622	0.14
411_G	586_D	0.620	0.14
82_V	88_E	0.620	0.14
551_G	555_I	0.620	0.14
102_G	308_I	0.619	0.14
98_H	133_P	0.617	0.14
164_L	167_V	0.615	0.14
349_V	619_S	0.614	0.14
103_E	129_A	0.612	0.14
103_E	110_K	0.611	0.14
414_L	526_A	0.610	0.14
87_P	129_A	0.609	0.13
537_G	549_Q	0.609	0.13
376_L	593_F	0.608	0.13
111_P	121_T	0.608	0.13
327_H	376_L	0.608	0.13
239_A	586_D	0.607	0.13
136_V	139_P	0.606	0.13
225_Q	396_E	0.606	0.13
97_F	101_T	0.605	0.13
87_P	94_N	0.605	0.13
240_V	256_L	0.605	0.13
345_G	356_H	0.605	0.13
535_F	541_Q	0.603	0.13
168_G	171_I	0.603	0.13
531_S	541_Q	0.602	0.13
534_T	551_G	0.601	0.13
172_H	284_D	0.600	0.13
531_S	551_G	0.600	0.13
420_V	616_D	0.598	0.13
534_T	539_Q	0.598	0.13
83_L	86_I	0.598	0.13
102_G	126_T	0.598	0.13
529_P	571_L	0.597	0.13
125_I	134_E	0.596	0.13
313_G	350_A	0.596	0.13
351_F	423_S	0.595	0.13
85_V	133_P	0.595	0.13
619_S	622_Y	0.594	0.13
122_L	127_Q	0.593	0.13
119_G	137_R	0.592	0.13
594_V	617_L	0.592	0.13
376_L	607_V	0.590	0.13
110_K	126_T	0.589	0.13
545_G	604_V	0.588	0.13
343_G	424_Q	0.587	0.13
195_R	205_T	0.587	0.13
256_L	638_F	0.585	0.13
92_V	106_I	0.585	0.13
378_M	604_V	0.585	0.13
339_H	425_E	0.584	0.13
79_R	82_V	0.584	0.13
81_R	84_D	0.582	0.13
256_L	277_L	0.582	0.13
618_S	622_Y	0.581	0.13
103_E	116_G	0.580	0.13
101_T	121_T	0.580	0.13
97_F	131_W	0.579	0.13
565_R	571_L	0.577	0.13
107_E	132_T	0.577	0.13
370_F	452_E	0.576	0.13
528_D	533_L	0.575	0.13
116_G	129_A	0.573	0.13
414_L	522_L	0.573	0.13
582_S	610_D	0.572	0.13
77_R	94_N	0.572	0.13
135_V	140_P	0.572	0.13
450_I	621_L	0.571	0.13
258_K	509_T	0.570	0.13
120_S	237_I	0.569	0.13
455_A	459_T	0.569	0.13
135_V	160_R	0.568	0.13
139_P	150_R	0.568	0.13
61_K	70_A	0.568	0.13
122_L	307_C	0.568	0.13
108_A	160_R	0.567	0.13
374_E	537_G	0.567	0.13
88_E	120_S	0.563	0.13
103_E	137_R	0.563	0.13
195_R	312_Y	0.561	0.13
102_G	153_L	0.559	0.12
423_S	518_I	0.559	0.12
195_R	333_L	0.558	0.12
78_A	87_P	0.556	0.12
536_V	544_L	0.555	0.12
70_A	487_H	0.554	0.12
279_T	485_F	0.554	0.12
127_Q	138_T	0.554	0.12
245_A	427_M	0.552	0.12
90_A	145_T	0.552	0.12
395_S	509_T	0.552	0.12
119_G	135_V	0.551	0.12
444_I	541_Q	0.550	0.12
252_F	635_L	0.550	0.12
95_L	121_T	0.549	0.12
104_V	112_G	0.548	0.12
535_F	542_G	0.547	0.12
329_A	575_V	0.546	0.12
306_H	507_L	0.546	0.12
188_G	254_P	0.545	0.12
352_S	606_C	0.545	0.12
97_F	106_I	0.544	0.12
65_V	78_A	0.543	0.12
82_V	103_E	0.542	0.12
517_P	580_G	0.541	0.12
329_A	337_V	0.539	0.12
606_C	614_T	0.539	0.12
90_A	112_G	0.539	0.12
243_T	364_N	0.537	0.12
327_H	459_T	0.537	0.12
102_G	317_D	0.534	0.12
81_R	90_A	0.534	0.12
213_D	407_Y	0.534	0.12
502_D	536_V	0.534	0.12
576_E	612_S	0.534	0.12
94_N	97_F	0.533	0.12
93_T	101_T	0.533	0.12
531_S	555_I	0.533	0.12
231_A	261_Y	0.533	0.12
397_R	638_F	0.532	0.12
165_E	176_M	0.532	0.12
548_I	582_S	0.531	0.12
383_G	590_L	0.530	0.12
83_L	92_V	0.529	0.12
108_A	117_R	0.528	0.12
404_N	415_I	0.528	0.12
182_V	203_P	0.528	0.12
393_E	588_Q	0.526	0.12
316_T	452_E	0.525	0.12
77_R	84_D	0.525	0.12
605_L	632_P	0.525	0.12
241_I	503_Q	0.524	0.12
113_M	350_A	0.523	0.12
541_Q	552_R	0.523	0.12
89_E	97_F	0.521	0.12
97_F	120_S	0.521	0.12
562_S	568_H	0.521	0.12
192_E	336_A	0.520	0.12
118_H	123_R	0.520	0.12
92_V	102_G	0.519	0.12
75_P	80_D	0.519	0.12
144_S	501_D	0.519	0.12
472_I	574_G	0.517	0.12
410_G	548_I	0.517	0.12
97_F	103_E	0.516	0.12
332_I	510_S	0.516	0.12
198_F	216_G	0.514	0.12
214_K	251_A	0.514	0.12
115_I	137_R	0.514	0.12
112_G	122_L	0.514	0.12
108_A	121_T	0.514	0.12
211_C	594_V	0.512	0.12
77_R	83_L	0.512	0.12
321_D	333_L	0.512	0.12
208_L	283_L	0.509	0.12
443_P	522_L	0.509	0.12
606_C	629_T	0.508	0.12
257_F	467_D	0.507	0.11
165_E	242_L	0.507	0.11
61_K	501_D	0.507	0.11
176_M	638_F	0.505	0.11
242_L	441_E	0.505	0.11
364_N	418_F	0.505	0.11
120_S	123_R	0.505	0.11
542_G	564_G	0.505	0.11
273_D	420_V	0.504	0.11
70_A	74_S	0.503	0.11
94_N	102_G	0.502	0.11
186_T	611_E	0.502	0.11
101_T	104_V	0.502	0.11
522_L	566_T	0.501	0.11
83_L	128_E	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2ycbA	2	0.9906	100	0.372	Contact Map
2xr1A	2	0.9719	100	0.375	Contact Map
3af5A	1	0.986	100	0.381	Contact Map
2i7tA	1	0.6147	100	0.584	Contact Map
3iekA	3	0.6708	100	0.591	Contact Map
3bk2A	2	0.6334	100	0.617	Contact Map
3zq4A	3	0.6303	100	0.618	Contact Map
2i7xA	1	0.6677	100	0.65	Contact Map
2az4A	1	0.6053	100	0.694	Contact Map
4b87A	1	0.5101	100	0.75	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0136 seconds.