Q9HS00 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HS00 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HS00	Sequences: MPTPRSRIREAVPDAEAAVELARVDLVRGYRKLRGQDFWLLYGALSAVGFALITVYAYSLGHDTGVALAAGETPWFAAGGAATAWSVAWLFTVAMLVVEAVGSNGDLDNDGHYLTLRPTADITAGKLASAAVKLAGFMLFPALGLALGLSLGLGTPVPVLGVVAAATVTVTSAAATGYPVGFLLKGVVRRSNVLTQLKPVLGVGIGLGYFAVMLTGEFTTAIDALRPVLRAPPLCWLGDLSLATTPGVTPGATGVAGALALGVVVAGAGVLLAVPAARYAWRADGMASTESDGEPTTAPDHAVDRLLGVLTRAPATHGVASTALLQIYRSPLRLVFVAFPLVGAIPVGEQVLAGGTVPRYAPWLAVWYGAWAGGAALPLNPLGNQGKSLPSLLTARAGGRHVVRGYVAATGVVAVPVSGAVAGLLAGAAGYSLGGVLGVVVAAGSAVLAASVLAAGVGSVFPRFEGVDLAGSRRAVPPSKVAYGVFSATLTAAVVAATVVRSEVLHDAVTVLVSRTLPFGWRVSAGTVETGAFVALAAVAVALPVAYRVAVARLGGYRLA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	560 (532)
Sequences:	110 (93)
Seq/√Len:	4.0

HALSA - Q9HS00 Q9HNY2 Q9HHM1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
319_V	405_G	4.531	0.90
65_G	409_A	4.139	0.86
404_R	547_Y	3.941	0.83
89_W	463_R	3.385	0.71
380_N	462_P	3.171	0.66
307_L	311_T	3.046	0.62
145_L	457_V	3.024	0.62
303_V	307_L	3.021	0.62
256_A	268_A	2.930	0.59
410_T	546_A	2.830	0.56
181_G	384_N	2.669	0.52
43_G	408_A	2.641	0.51
379_L	478_P	2.576	0.49
380_N	478_P	2.575	0.49
167_T	211_A	2.482	0.46
424_L	427_G	2.449	0.45
216_G	325_L	2.413	0.44
171_T	256_A	2.389	0.44
140_F	208_G	2.376	0.43
114_L	281_W	2.368	0.43
371_W	386_G	2.361	0.43
206_G	450_A	2.328	0.42
251_G	255_V	2.267	0.40
156_P	537_A	2.216	0.39
208_G	408_A	2.184	0.38
53_I	551_V	2.182	0.38
114_L	416_P	2.174	0.38
417_V	523_V	2.159	0.37
309_V	531_G	2.150	0.37
269_G	339_F	2.145	0.37
399_G	463_R	2.132	0.36
184_L	342_V	2.126	0.36
325_L	328_Y	2.125	0.36
257_G	351_V	2.117	0.36
101_V	487_S	2.115	0.36
36_Q	294_E	2.112	0.36
113_Y	294_E	2.097	0.36
268_A	492_A	2.076	0.35
99_E	130_A	2.038	0.34
60_L	145_L	2.036	0.34
181_G	326_Q	2.029	0.34
326_Q	380_N	2.014	0.33
167_T	522_R	2.009	0.33
130_A	384_N	2.001	0.33
65_G	152_G	1.996	0.33
326_Q	478_P	1.970	0.32
205_I	450_A	1.953	0.32
82_A	385_Q	1.945	0.32
117_R	402_V	1.938	0.31
68_L	165_A	1.932	0.31
35_G	157_V	1.928	0.31
462_P	478_P	1.906	0.31
21_L	25_D	1.901	0.31
135_A	505_L	1.875	0.30
42_Y	263_V	1.851	0.29
117_R	378_P	1.837	0.29
180_V	211_A	1.831	0.29
340_P	371_W	1.827	0.29
415_V	419_G	1.823	0.29
181_G	380_N	1.818	0.29
241_S	257_G	1.818	0.29
326_Q	462_P	1.815	0.28
379_L	462_P	1.799	0.28
89_W	371_W	1.793	0.28
99_E	244_T	1.773	0.27
21_L	117_R	1.773	0.27
463_R	467_V	1.772	0.27
393_L	546_A	1.767	0.27
135_A	250_P	1.742	0.27
39_W	179_P	1.721	0.26
346_P	408_A	1.708	0.26
79_G	553_R	1.674	0.25
365_A	370_A	1.662	0.25
23_R	428_A	1.660	0.25
115_T	353_A	1.658	0.25
402_V	529_E	1.658	0.25
39_W	133_K	1.655	0.25
165_A	203_V	1.630	0.24
400_R	524_S	1.626	0.24
317_H	433_L	1.619	0.24
305_R	320_A	1.614	0.24
311_T	361_A	1.607	0.24
63_D	214_L	1.595	0.24
133_K	156_P	1.593	0.23
90_L	403_V	1.586	0.23
107_L	548_R	1.573	0.23
105_G	327_I	1.570	0.23
268_A	469_L	1.563	0.23
123_T	551_V	1.560	0.23
172_S	536_L	1.555	0.23
207_L	252_A	1.544	0.22
243_A	509_V	1.541	0.22
271_L	444_G	1.536	0.22
128_A	207_L	1.526	0.22
116_L	385_Q	1.517	0.22
35_G	459_S	1.515	0.22
383_G	478_P	1.512	0.22
161_G	352_L	1.511	0.22
250_P	255_V	1.510	0.22
306_L	540_A	1.501	0.22
386_G	478_P	1.497	0.22
254_G	392_L	1.494	0.21
195_T	340_P	1.493	0.21
181_G	462_P	1.492	0.21
65_G	242_L	1.472	0.21
263_V	373_G	1.468	0.21
379_L	382_L	1.466	0.21
326_Q	379_L	1.462	0.21
239_D	385_Q	1.458	0.21
54_T	201_L	1.458	0.21
499_V	504_V	1.445	0.21
21_L	126_K	1.443	0.20
161_G	244_T	1.440	0.20
482_A	488_A	1.438	0.20
242_L	259_L	1.435	0.20
191_S	392_L	1.434	0.20
386_G	468_D	1.432	0.20
39_W	193_V	1.423	0.20
97_V	201_L	1.417	0.20
313_A	524_S	1.415	0.20
256_A	427_G	1.408	0.20
256_A	260_A	1.402	0.20
371_W	463_R	1.399	0.20
28_R	463_R	1.396	0.20
470_A	483_Y	1.393	0.20
236_W	257_G	1.392	0.20
342_V	549_V	1.381	0.19
238_G	325_L	1.379	0.19
320_A	405_G	1.378	0.19
108_D	483_Y	1.378	0.19
160_L	249_T	1.377	0.19
146_A	150_S	1.373	0.19
142_A	417_V	1.361	0.19
164_A	289_T	1.354	0.19
325_L	378_P	1.344	0.19
106_D	442_A	1.343	0.19
237_L	264_V	1.341	0.19
263_V	457_V	1.338	0.19
146_A	477_P	1.332	0.18
371_W	380_N	1.327	0.18
256_A	492_A	1.311	0.18
31_R	374_G	1.309	0.18
236_W	557_Y	1.305	0.18
239_D	402_V	1.302	0.18
24_V	27_V	1.297	0.18
250_P	448_L	1.296	0.18
118_P	488_A	1.295	0.18
21_L	85_W	1.287	0.18
77_A	242_L	1.286	0.18
209_Y	483_Y	1.280	0.18
421_V	437_L	1.275	0.17
478_P	482_A	1.274	0.17
457_V	509_V	1.271	0.17
160_L	310_L	1.265	0.17
88_A	307_L	1.263	0.17
204_G	425_L	1.258	0.17
48_V	549_V	1.257	0.17
340_P	461_F	1.255	0.17
115_T	369_G	1.254	0.17
169_T	188_V	1.253	0.17
152_G	409_A	1.252	0.17
285_G	377_L	1.251	0.17
304_D	531_G	1.251	0.17
207_L	364_L	1.244	0.17
56_Y	408_A	1.243	0.17
208_G	256_A	1.241	0.17
30_Y	268_A	1.241	0.17
211_A	317_H	1.241	0.17
337_V	375_A	1.240	0.17
200_V	440_V	1.236	0.17
127_L	257_G	1.235	0.17
476_V	486_F	1.235	0.17
56_Y	407_V	1.229	0.17
315_A	490_L	1.228	0.17
308_G	531_G	1.226	0.17
90_L	194_L	1.225	0.17
239_D	392_L	1.221	0.17
282_R	348_G	1.220	0.17
282_R	347_V	1.216	0.17
340_P	380_N	1.214	0.16
522_R	528_V	1.212	0.16
265_V	416_P	1.207	0.16
153_L	268_A	1.204	0.16
85_W	328_Y	1.200	0.16
90_L	156_P	1.200	0.16
111_G	226_R	1.200	0.16
496_A	500_V	1.199	0.16
197_L	238_G	1.187	0.16
22_A	545_V	1.184	0.16
60_L	81_A	1.182	0.16
100_A	414_A	1.182	0.16
495_V	530_T	1.180	0.16
528_V	538_A	1.177	0.16
81_A	260_A	1.176	0.16
169_T	509_V	1.176	0.16
399_G	429_A	1.175	0.16
319_V	416_P	1.174	0.16
243_A	255_V	1.173	0.16
239_D	361_A	1.170	0.16
432_S	440_V	1.166	0.16
262_G	267_G	1.162	0.16
114_L	277_A	1.160	0.16
73_T	266_A	1.157	0.16
428_A	541_V	1.156	0.16
126_K	343_G	1.155	0.16
307_L	312_R	1.153	0.16
144_G	511_V	1.148	0.15
207_L	398_G	1.146	0.15
383_G	458_G	1.145	0.15
238_G	480_K	1.145	0.15
103_S	179_P	1.143	0.15
68_L	115_T	1.141	0.15
94_A	165_A	1.138	0.15
169_T	414_A	1.138	0.15
246_P	379_L	1.137	0.15
18_A	449_A	1.136	0.15
187_V	402_V	1.135	0.15
54_T	241_S	1.134	0.15
326_Q	383_G	1.132	0.15
324_L	477_P	1.126	0.15
419_G	486_F	1.125	0.15
269_G	528_V	1.124	0.15
129_S	154_G	1.120	0.15
393_L	419_G	1.119	0.15
259_L	488_A	1.117	0.15
232_P	456_G	1.112	0.15
112_H	206_G	1.111	0.15
127_L	208_G	1.110	0.15
28_R	31_R	1.108	0.15
99_E	235_C	1.104	0.15
238_G	395_A	1.103	0.15
189_R	422_A	1.101	0.15
128_A	131_A	1.099	0.15
379_L	479_S	1.097	0.15
130_A	181_G	1.095	0.15
378_P	423_G	1.094	0.15
337_V	380_N	1.092	0.15
448_L	538_A	1.091	0.15
113_Y	198_K	1.090	0.15
45_L	151_L	1.087	0.15
175_A	269_G	1.082	0.14
40_L	170_V	1.077	0.14
166_A	279_Y	1.077	0.14
237_L	412_V	1.076	0.14
68_L	552_A	1.076	0.14
252_A	523_V	1.076	0.14
101_V	181_G	1.075	0.14
456_G	460_V	1.075	0.14
200_V	498_T	1.074	0.14
107_L	487_S	1.073	0.14
306_L	541_V	1.071	0.14
380_N	386_G	1.069	0.14
163_V	438_G	1.068	0.14
111_G	500_V	1.067	0.14
307_L	541_V	1.065	0.14
125_G	177_G	1.060	0.14
83_T	235_C	1.060	0.14
328_Y	405_G	1.059	0.14
170_V	231_A	1.056	0.14
352_L	551_V	1.055	0.14
376_A	430_G	1.053	0.14
155_T	385_Q	1.052	0.14
373_G	420_A	1.051	0.14
207_L	504_V	1.047	0.14
191_S	451_S	1.046	0.14
366_V	385_Q	1.046	0.14
266_A	489_T	1.044	0.14
112_H	406_Y	1.044	0.14
238_G	443_A	1.044	0.14
46_S	201_L	1.044	0.14
181_G	381_P	1.041	0.14
119_T	124_A	1.040	0.14
196_Q	235_C	1.036	0.14
185_K	357_V	1.036	0.14
183_L	256_A	1.035	0.14
425_L	465_E	1.033	0.14
236_W	239_D	1.033	0.14
255_V	427_G	1.032	0.14
146_A	364_L	1.031	0.14
181_G	478_P	1.031	0.14
61_G	385_Q	1.028	0.14
498_T	502_S	1.027	0.14
504_V	523_V	1.025	0.14
261_L	433_L	1.019	0.14
375_A	510_T	1.018	0.14
302_A	535_A	1.012	0.13
145_L	382_L	1.012	0.13
21_L	74_P	1.011	0.13
291_S	425_L	1.008	0.13
465_E	539_V	1.006	0.13
336_F	483_Y	1.006	0.13
234_L	392_L	1.006	0.13
267_G	293_G	1.004	0.13
209_Y	475_A	1.001	0.13
116_L	391_S	1.000	0.13
62_H	477_P	0.999	0.13
176_T	240_L	0.994	0.13
341_L	532_A	0.989	0.13
19_V	135_A	0.989	0.13
62_H	324_L	0.983	0.13
113_Y	450_A	0.980	0.13
324_L	500_V	0.980	0.13
392_L	471_G	0.979	0.13
396_R	487_S	0.979	0.13
127_L	327_I	0.978	0.13
28_R	281_W	0.974	0.13
65_G	283_A	0.973	0.13
481_V	499_V	0.968	0.13
393_L	404_R	0.967	0.13
65_G	456_G	0.964	0.13
118_P	472_S	0.964	0.13
494_V	497_A	0.964	0.13
263_V	441_V	0.963	0.13
359_R	369_G	0.962	0.13
82_A	472_S	0.961	0.13
298_A	310_L	0.958	0.13
441_V	530_T	0.958	0.13
260_A	266_A	0.957	0.13
453_L	489_T	0.954	0.13
34_R	370_A	0.953	0.13
481_V	524_S	0.952	0.13
151_L	160_L	0.952	0.13
381_P	548_R	0.950	0.13
114_L	399_G	0.946	0.13
164_A	364_L	0.944	0.13
242_L	245_T	0.941	0.13
127_L	245_T	0.941	0.13
386_G	472_S	0.939	0.13
236_W	467_V	0.935	0.12
327_I	386_G	0.934	0.12
381_P	455_A	0.934	0.12
198_K	205_I	0.932	0.12
202_G	395_A	0.931	0.12
33_L	527_T	0.931	0.12
28_R	99_E	0.929	0.12
448_L	537_A	0.924	0.12
367_W	486_F	0.923	0.12
65_G	475_A	0.923	0.12
151_L	167_T	0.921	0.12
230_R	546_A	0.921	0.12
437_L	542_A	0.920	0.12
210_F	504_V	0.918	0.12
97_V	318_G	0.915	0.12
161_G	262_G	0.914	0.12
47_A	353_A	0.912	0.12
82_A	315_A	0.911	0.12
527_T	531_G	0.910	0.12
401_H	481_V	0.909	0.12
324_L	385_Q	0.908	0.12
115_T	459_S	0.908	0.12
328_Y	334_L	0.904	0.12
233_P	478_P	0.904	0.12
117_R	153_L	0.902	0.12
147_L	455_A	0.898	0.12
431_Y	477_P	0.896	0.12
301_H	427_G	0.896	0.12
426_A	430_G	0.896	0.12
124_A	551_V	0.896	0.12
344_A	421_V	0.895	0.12
275_P	541_V	0.894	0.12
417_V	477_P	0.892	0.12
482_A	490_L	0.891	0.12
22_A	358_P	0.890	0.12
140_F	287_A	0.890	0.12
52_L	58_Y	0.887	0.12
93_V	164_A	0.887	0.12
275_P	532_A	0.887	0.12
379_L	386_G	0.886	0.12
492_A	534_V	0.882	0.12
181_G	379_L	0.882	0.12
118_P	149_L	0.881	0.12
366_V	495_V	0.881	0.12
425_L	450_A	0.879	0.12
343_G	443_A	0.879	0.12
80_G	352_L	0.876	0.12
65_G	185_K	0.872	0.12
393_L	526_G	0.872	0.12
386_G	482_A	0.870	0.12
130_A	380_N	0.868	0.12
254_G	373_G	0.868	0.12
107_L	168_V	0.868	0.12
89_W	317_H	0.865	0.12
203_V	262_G	0.864	0.12
274_V	409_A	0.864	0.12
121_D	494_V	0.861	0.12
348_G	555_G	0.861	0.12
189_R	366_V	0.857	0.12
40_L	335_V	0.856	0.12
58_Y	148_G	0.855	0.11
34_R	100_A	0.854	0.11
18_A	242_L	0.854	0.11
180_V	485_V	0.851	0.11
129_S	133_K	0.850	0.11
308_G	440_V	0.849	0.11
284_D	441_V	0.849	0.11
133_K	179_P	0.849	0.11
28_R	439_V	0.845	0.11
228_V	264_V	0.844	0.11
172_S	317_H	0.842	0.11
386_G	391_S	0.842	0.11
89_W	172_S	0.842	0.11
186_G	209_Y	0.840	0.11
112_H	282_R	0.839	0.11
229_L	481_V	0.838	0.11
240_L	542_A	0.834	0.11
229_L	393_L	0.833	0.11
88_A	411_G	0.833	0.11
407_V	447_V	0.832	0.11
441_V	523_V	0.831	0.11
260_A	434_G	0.830	0.11
201_L	240_L	0.830	0.11
100_A	546_A	0.829	0.11
61_G	533_F	0.828	0.11
187_V	190_R	0.827	0.11
195_T	384_N	0.825	0.11
345_I	418_S	0.824	0.11
362_P	370_A	0.822	0.11
160_L	285_G	0.820	0.11
326_Q	386_G	0.819	0.11
69_A	258_A	0.819	0.11
261_L	272_L	0.818	0.11
143_L	508_A	0.818	0.11
132_V	441_V	0.817	0.11
208_G	338_A	0.816	0.11
188_V	536_L	0.816	0.11
418_S	479_S	0.814	0.11
103_S	165_A	0.814	0.11
54_T	176_T	0.813	0.11
337_V	410_T	0.812	0.11
156_P	352_L	0.809	0.11
147_L	169_T	0.807	0.11
282_R	540_A	0.807	0.11
82_A	128_A	0.806	0.11
41_L	73_T	0.806	0.11
252_A	435_G	0.805	0.11
160_L	415_V	0.803	0.11
90_L	258_A	0.803	0.11
123_T	129_S	0.803	0.11
44_A	290_E	0.802	0.11
62_H	465_E	0.801	0.11
281_W	469_L	0.799	0.11
381_P	414_A	0.796	0.11
51_A	272_L	0.796	0.11
139_L	343_G	0.796	0.11
316_T	472_S	0.795	0.11
164_A	481_V	0.793	0.11
288_S	427_G	0.792	0.11
317_H	412_V	0.789	0.11
140_F	182_F	0.789	0.11
162_V	234_L	0.787	0.11
89_W	340_P	0.786	0.11
399_G	461_F	0.786	0.11
132_V	410_T	0.783	0.11
271_L	304_D	0.783	0.11
40_L	475_A	0.783	0.11
246_P	380_N	0.782	0.11
394_T	546_A	0.781	0.11
122_I	418_S	0.781	0.11
259_L	427_G	0.780	0.11
124_A	146_A	0.780	0.11
57_A	148_G	0.778	0.11
382_L	534_V	0.778	0.11
190_R	369_G	0.777	0.11
395_A	445_S	0.776	0.11
236_W	389_L	0.775	0.11
283_A	358_P	0.775	0.11
490_L	530_T	0.775	0.11
264_V	548_R	0.773	0.11
421_V	507_D	0.773	0.11
204_G	435_G	0.772	0.11
205_I	552_A	0.772	0.11
225_L	234_L	0.772	0.11
261_L	450_A	0.770	0.11
239_D	482_A	0.769	0.11
340_P	355_G	0.764	0.10
196_Q	355_G	0.763	0.10
116_L	402_V	0.763	0.10
388_S	392_L	0.762	0.10
224_A	272_L	0.762	0.10
229_L	529_E	0.762	0.10
198_K	426_A	0.761	0.10
235_C	283_A	0.761	0.10
167_T	258_A	0.761	0.10
440_V	508_A	0.759	0.10
403_V	466_G	0.758	0.10
38_F	497_A	0.758	0.10
368_Y	497_A	0.756	0.10
79_G	146_A	0.756	0.10
244_T	259_L	0.755	0.10
346_P	372_A	0.755	0.10
209_Y	487_S	0.754	0.10
82_A	422_A	0.753	0.10
490_L	547_Y	0.753	0.10
289_T	319_V	0.753	0.10
378_P	403_V	0.753	0.10
444_G	550_A	0.753	0.10
135_A	415_V	0.753	0.10
256_A	408_A	0.753	0.10
229_L	405_G	0.752	0.10
30_Y	294_E	0.752	0.10
155_T	366_V	0.752	0.10
82_A	189_R	0.751	0.10
94_A	406_Y	0.751	0.10
306_L	446_A	0.751	0.10
48_V	268_A	0.751	0.10
87_V	468_D	0.750	0.10
456_G	459_S	0.750	0.10
133_K	493_A	0.750	0.10
44_A	210_F	0.750	0.10
115_T	239_D	0.750	0.10
184_L	510_T	0.749	0.10
93_V	143_L	0.745	0.10
149_L	162_V	0.745	0.10
408_A	534_V	0.744	0.10
342_V	367_W	0.744	0.10
87_V	218_F	0.742	0.10
41_L	534_V	0.742	0.10
427_G	526_G	0.740	0.10
175_A	339_F	0.740	0.10
184_L	296_T	0.738	0.10
215_T	288_S	0.734	0.10
89_W	467_V	0.734	0.10
94_A	346_P	0.734	0.10
393_L	425_L	0.732	0.10
82_A	392_L	0.731	0.10
220_T	259_L	0.730	0.10
296_T	364_L	0.727	0.10
395_A	554_L	0.725	0.10
258_A	388_S	0.725	0.10
400_R	405_G	0.725	0.10
19_V	160_L	0.722	0.10
426_A	437_L	0.721	0.10
326_Q	486_F	0.721	0.10
54_T	60_L	0.718	0.10
149_L	153_L	0.716	0.10
171_T	254_G	0.716	0.10
52_L	299_P	0.714	0.10
332_L	474_R	0.713	0.10
162_V	437_L	0.713	0.10
443_A	554_L	0.712	0.10
402_V	459_S	0.709	0.10
68_L	127_L	0.708	0.10
454_A	474_R	0.708	0.10
380_N	383_G	0.708	0.10
263_V	492_A	0.708	0.10
346_P	472_S	0.705	0.10
263_V	319_V	0.705	0.10
144_G	457_V	0.702	0.10
371_W	464_F	0.699	0.10
380_N	479_S	0.699	0.10
180_V	407_V	0.698	0.10
173_A	497_A	0.698	0.10
177_G	281_W	0.697	0.10
156_P	393_L	0.695	0.10
312_R	414_A	0.695	0.10
123_T	406_Y	0.694	0.10
135_A	504_V	0.694	0.10
466_G	472_S	0.693	0.10
136_G	252_A	0.691	0.10
395_A	475_A	0.691	0.10
160_L	556_G	0.690	0.10
123_T	222_I	0.690	0.10
236_W	386_G	0.690	0.10
133_K	317_H	0.689	0.10
343_G	395_A	0.689	0.10
462_P	479_S	0.688	0.10
380_N	384_N	0.687	0.10
90_L	425_L	0.686	0.10
382_L	542_A	0.686	0.10
181_G	386_G	0.685	0.10
216_G	219_T	0.677	0.10
100_A	289_T	0.676	0.10
41_L	260_A	0.676	0.10
440_V	484_G	0.676	0.10
107_L	425_L	0.675	0.10
78_A	414_A	0.675	0.10
93_V	445_S	0.674	0.10
19_V	46_S	0.674	0.10
268_A	414_A	0.674	0.10
160_L	442_A	0.673	0.10
108_D	126_K	0.672	0.09
126_K	222_I	0.672	0.09
208_G	414_A	0.671	0.09
114_L	340_P	0.668	0.09
164_A	553_R	0.667	0.09
403_V	553_R	0.667	0.09
68_L	387_K	0.667	0.09
268_A	417_V	0.667	0.09
167_T	352_L	0.666	0.09
251_G	435_G	0.666	0.09
55_V	115_T	0.664	0.09
55_V	497_A	0.664	0.09
25_D	410_T	0.664	0.09
33_L	392_L	0.663	0.09
90_L	268_A	0.662	0.09
266_A	523_V	0.659	0.09
144_G	182_F	0.659	0.09
205_I	441_V	0.657	0.09
51_A	250_P	0.657	0.09
295_P	425_L	0.656	0.09
52_L	451_S	0.656	0.09
233_P	458_G	0.655	0.09
48_V	55_V	0.654	0.09
411_G	457_V	0.654	0.09
116_L	529_E	0.653	0.09
89_W	386_G	0.652	0.09
139_L	395_A	0.652	0.09
81_A	359_R	0.651	0.09
347_V	532_A	0.650	0.09
67_A	207_L	0.648	0.09
22_A	320_A	0.646	0.09
108_D	486_F	0.646	0.09
191_S	436_V	0.646	0.09
326_Q	458_G	0.646	0.09
211_A	341_L	0.646	0.09
57_A	443_A	0.646	0.09
55_V	395_A	0.645	0.09
243_A	537_A	0.645	0.09
376_A	412_V	0.642	0.09
39_W	320_A	0.641	0.09
82_A	158_P	0.640	0.09
180_V	224_A	0.639	0.09
258_A	545_V	0.637	0.09
185_K	475_A	0.636	0.09
86_S	450_A	0.636	0.09
160_L	441_V	0.635	0.09
147_L	548_R	0.633	0.09
431_Y	438_G	0.632	0.09
191_S	524_S	0.630	0.09
305_R	441_V	0.629	0.09
337_V	368_Y	0.629	0.09
141_P	557_Y	0.628	0.09
242_L	409_A	0.628	0.09
108_D	197_L	0.628	0.09
408_A	414_A	0.628	0.09
440_V	534_V	0.626	0.09
193_V	347_V	0.626	0.09
169_T	345_I	0.625	0.09
174_A	460_V	0.625	0.09
23_R	352_L	0.624	0.09
229_L	355_G	0.623	0.09
277_A	403_V	0.622	0.09
123_T	158_P	0.622	0.09
173_A	542_A	0.622	0.09
377_L	410_T	0.621	0.09
122_I	372_A	0.620	0.09
148_G	370_A	0.619	0.09
273_A	276_A	0.617	0.09
83_T	174_A	0.614	0.09
143_L	440_V	0.614	0.09
441_V	505_L	0.614	0.09
71_G	152_G	0.614	0.09
85_W	420_A	0.614	0.09
56_Y	507_D	0.613	0.09
241_S	325_L	0.613	0.09
182_F	228_V	0.612	0.09
90_L	100_A	0.612	0.09
122_I	144_G	0.610	0.09
362_P	487_S	0.610	0.09
458_G	478_P	0.609	0.09
105_G	489_T	0.606	0.09
33_L	450_A	0.606	0.09
93_V	327_I	0.604	0.09
25_D	126_K	0.603	0.09
202_G	273_A	0.603	0.09
64_T	403_V	0.602	0.09
355_G	527_T	0.602	0.09
303_V	311_T	0.601	0.09
51_A	454_A	0.601	0.09
209_Y	357_V	0.600	0.09
256_A	294_E	0.600	0.09
319_V	401_H	0.600	0.09
64_T	410_T	0.599	0.09
77_A	417_V	0.599	0.09
386_G	461_F	0.599	0.09
379_L	458_G	0.598	0.09
227_P	553_R	0.598	0.09
90_L	263_V	0.595	0.09
440_V	450_A	0.595	0.09
85_W	266_A	0.594	0.09
171_T	201_L	0.594	0.09
117_R	397_A	0.593	0.09
321_S	386_G	0.593	0.09
116_L	554_L	0.592	0.09
202_G	393_L	0.592	0.09
207_L	415_V	0.591	0.09
377_L	429_A	0.590	0.09
54_T	173_A	0.588	0.09
356_T	437_L	0.588	0.09
209_Y	330_S	0.586	0.09
115_T	143_L	0.584	0.09
238_G	426_A	0.584	0.09
278_R	509_V	0.583	0.09
290_E	551_V	0.583	0.09
233_P	383_G	0.583	0.09
407_V	487_S	0.582	0.09
456_G	475_A	0.581	0.09
188_V	323_A	0.580	0.09
334_L	355_G	0.580	0.09
33_L	191_S	0.579	0.09
118_P	141_P	0.579	0.09
408_A	537_A	0.578	0.09
238_G	287_A	0.576	0.09
42_Y	465_E	0.575	0.09
263_V	409_A	0.572	0.09
83_T	195_T	0.571	0.09
268_A	424_L	0.570	0.09
129_S	340_P	0.569	0.09
55_V	147_L	0.568	0.09
143_L	260_A	0.568	0.09
126_K	281_W	0.568	0.09
243_A	249_T	0.567	0.08
192_N	486_F	0.566	0.08
281_W	557_Y	0.566	0.08
21_L	31_R	0.565	0.08
183_L	454_A	0.565	0.08
345_I	375_A	0.562	0.08
64_T	408_A	0.561	0.08
393_L	528_V	0.560	0.08
99_E	384_N	0.560	0.08
227_P	254_G	0.559	0.08
255_V	270_V	0.559	0.08
162_V	256_A	0.558	0.08
248_V	257_G	0.556	0.08
197_L	244_T	0.556	0.08
213_M	315_A	0.554	0.08
54_T	459_S	0.551	0.08
504_V	510_T	0.551	0.08
289_T	526_G	0.550	0.08
210_F	308_G	0.549	0.08
323_A	397_A	0.548	0.08
187_V	203_V	0.547	0.08
118_P	236_W	0.547	0.08
162_V	554_L	0.546	0.08
49_G	153_L	0.546	0.08
128_A	433_L	0.545	0.08
455_A	548_R	0.544	0.08
333_R	386_G	0.544	0.08
157_V	426_A	0.544	0.08
154_G	284_D	0.543	0.08
233_P	329_R	0.542	0.08
219_T	232_P	0.542	0.08
113_Y	367_W	0.540	0.08
384_N	462_P	0.540	0.08
20_E	210_F	0.540	0.08
124_A	311_T	0.539	0.08
359_R	412_V	0.538	0.08
358_P	497_A	0.537	0.08
101_V	364_L	0.537	0.08
41_L	417_V	0.537	0.08
256_A	357_V	0.537	0.08
81_A	540_A	0.536	0.08
130_A	326_Q	0.535	0.08
331_P	379_L	0.531	0.08
329_R	458_G	0.531	0.08
497_A	533_F	0.529	0.08
497_A	506_H	0.526	0.08
45_L	317_H	0.526	0.08
337_V	545_V	0.526	0.08
284_D	394_T	0.525	0.08
368_Y	473_R	0.524	0.08
35_G	218_F	0.524	0.08
122_I	181_G	0.523	0.08
305_R	465_E	0.523	0.08
192_N	533_F	0.522	0.08
208_G	359_R	0.519	0.08
322_T	394_T	0.519	0.08
258_A	274_V	0.519	0.08
128_A	306_L	0.519	0.08
208_G	257_G	0.519	0.08
56_Y	444_G	0.518	0.08
164_A	222_I	0.517	0.08
138_M	167_T	0.516	0.08
124_A	274_V	0.516	0.08
522_R	536_L	0.515	0.08
535_A	545_V	0.515	0.08
165_A	403_V	0.515	0.08
120_A	277_A	0.514	0.08
342_V	401_H	0.513	0.08
196_Q	268_A	0.512	0.08
429_A	446_A	0.509	0.08
345_I	407_V	0.508	0.08
483_Y	486_F	0.507	0.08
45_L	316_T	0.506	0.08
148_G	544_P	0.506	0.08
387_K	436_V	0.506	0.08
490_L	556_G	0.505	0.08
225_L	409_A	0.505	0.08
224_A	551_V	0.505	0.08
276_A	410_T	0.504	0.08
25_D	48_V	0.504	0.08
130_A	478_P	0.504	0.08
66_V	277_A	0.503	0.08
60_L	440_V	0.503	0.08
19_V	526_G	0.502	0.08
23_R	65_G	0.502	0.08
107_L	122_I	0.500	0.08
277_A	281_W	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4b03D	5	0.1143	2.5	0.987	Contact Map
2m8rA	1	0.1125	2.5	0.987	Contact Map
3fymA	1	0.0268	2	0.988	Contact Map
2kogA	1	0.1089	1.8	0.988	Contact Map
3bbnJ	1	0.1054	1.7	0.988	Contact Map
3aa1C	1	0.0375	1.6	0.988	Contact Map
2l0eA	1	0.0554	1.4	0.989	Contact Map
2lcnA	1	0.0339	1.4	0.989	Contact Map
4heiA	1	0.0661	1.3	0.989	Contact Map
2wh6B	1	0.0393	1.3	0.989	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0136 seconds.