Q9HRX2 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HRX2 - GTP-binding protein homolog

UniProt:	Q9HRX2	Sequences: MLSIALAGKPNAGKSTFYTAATRSEVDVANYPFTTIDANRGVTHVRTACPCLTREERCGHEHCHDGKRYVPVELLDVAGLVPGAHEGRGLGNQFLDELSNADVIVNVVDASGATNEEGEPVEIGDHDPVEDIDFVEEEMDLWLAGIVEDNWESVERASRSPGFDIETAITEMMTGFGASEYQVAAVLREFDYPDDPIQWSGEDREALARGVRERTKPIVVVANKVDVAPEENVQRLLDLDKPVIPATAQGELAVRRGADAGFLDYDPGDEDFDITGDVGDDQREALEALRETMQEYGGTGMQRALDYAVYDLLEMVTAFPVQDQSKWTDATGTVLPDAVLLDAGSTPVDLAYAVHSDIGDGYLHAVNAKTNREIGEDDELGEGDVVKIVSTAN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	393 (384)
Sequences:	373 (253)
Seq/√Len:	12.9

ECOLI - YCHF
BACSU - YCHF
HALSA - Q9HRX2 Q9HP92
SULSO - Q7LXL0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
105_V	221_V	5.662	1.00
352_Y	359_G	5.603	1.00
345_S	349_D	5.352	1.00
83_G	86_E	4.517	1.00
317_T	338_A	4.322	1.00
17_F	21_A	3.927	0.99
307_Y	311_D	3.588	0.99
36_I	78_A	3.426	0.99
221_V	246_A	3.358	0.98
96_D	99_S	3.267	0.98
293_M	298_G	3.215	0.98
115_N	119_E	3.167	0.98
106_N	131_D	3.156	0.97
257_G	282_Q	3.101	0.97
329_D	333_T	2.927	0.96
271_D	290_R	2.926	0.96
341_L	345_S	2.745	0.94
352_Y	360_D	2.645	0.93
314_E	343_A	2.555	0.92
10_P	31_Y	2.554	0.92
5_A	16_T	2.519	0.91
200_S	203_D	2.503	0.91
105_V	246_A	2.447	0.90
10_P	15_S	2.444	0.90
45_V	305_L	2.380	0.88
272_F	286_L	2.371	0.88
148_E	201_G	2.371	0.88
19_T	256_R	2.329	0.87
364_H	373_E	2.310	0.87
8_G	14_K	2.283	0.86
8_G	13_G	2.283	0.86
26_V	39_N	2.282	0.86
350_L	380_L	2.222	0.85
31_Y	34_T	2.192	0.84
126_H	131_D	2.186	0.84
77_V	98_L	2.144	0.82
140_D	212_R	2.071	0.80
5_A	347_P	2.069	0.80
287_E	290_R	1.977	0.77
229_P	232_N	1.956	0.76
20_A	41_G	1.917	0.74
358_I	390_S	1.915	0.74
207_L	360_D	1.867	0.72
316_V	380_L	1.862	0.72
367_N	378_D	1.848	0.71
88_R	311_D	1.835	0.71
52_L	385_V	1.828	0.71
140_D	209_R	1.818	0.70
97_E	104_I	1.816	0.70
5_A	18_Y	1.812	0.70
169_I	183_V	1.789	0.69
107_V	246_A	1.782	0.69
8_G	15_S	1.766	0.68
63_C	68_R	1.754	0.67
4_I	103_V	1.754	0.67
103_V	308_A	1.747	0.67
49_C	63_C	1.744	0.67
7_A	12_A	1.728	0.66
347_P	362_Y	1.683	0.64
108_V	147_V	1.681	0.64
363_L	373_E	1.678	0.64
361_G	390_S	1.668	0.63
189_E	214_R	1.648	0.62
362_Y	365_A	1.646	0.62
265_Y	268_G	1.646	0.62
110_A	368_A	1.641	0.62
7_A	104_I	1.640	0.62
263_L	293_M	1.627	0.61
21_A	74_L	1.620	0.61
55_E	58_C	1.594	0.60
201_G	357_D	1.593	0.60
107_V	221_V	1.580	0.59
80_L	92_N	1.531	0.56
54_R	368_A	1.522	0.56
108_V	372_R	1.503	0.55
378_D	384_D	1.502	0.55
262_F	285_A	1.502	0.55
230_E	295_E	1.501	0.55
367_N	370_T	1.498	0.55
70_V	385_V	1.494	0.54
256_R	315_M	1.488	0.54
356_S	359_G	1.484	0.54
316_V	344_G	1.478	0.54
372_R	381_G	1.453	0.52
341_L	349_D	1.432	0.51
67_K	305_L	1.405	0.50
5_A	385_V	1.405	0.50
10_P	51_C	1.393	0.49
150_N	172_M	1.365	0.48
282_Q	286_L	1.364	0.48
132_I	221_V	1.362	0.48
225_V	233_V	1.347	0.47
10_P	14_K	1.331	0.46
10_P	13_G	1.331	0.46
332_G	335_L	1.330	0.46
202_E	311_D	1.329	0.46
279_G	282_Q	1.324	0.46
378_D	386_V	1.322	0.46
26_V	107_V	1.305	0.45
78_A	82_P	1.298	0.44
34_T	66_G	1.292	0.44
307_Y	312_L	1.288	0.44
37_D	284_E	1.285	0.44
116_E	304_A	1.281	0.43
329_D	336_P	1.271	0.43
317_T	382_E	1.261	0.42
203_D	231_E	1.261	0.42
78_A	97_E	1.260	0.42
306_D	319_F	1.259	0.42
19_T	104_I	1.250	0.42
82_P	135_V	1.248	0.42
37_D	145_G	1.247	0.42
104_I	192_Y	1.240	0.41
264_D	273_D	1.240	0.41
46_R	269_D	1.235	0.41
12_A	174_T	1.231	0.41
54_R	327_W	1.223	0.41
271_D	287_E	1.222	0.40
305_L	364_H	1.219	0.40
16_T	20_A	1.215	0.40
53_T	378_D	1.205	0.40
135_V	172_M	1.202	0.39
341_L	353_A	1.201	0.39
170_T	183_V	1.200	0.39
10_P	34_T	1.195	0.39
347_P	376_E	1.189	0.39
8_G	11_N	1.188	0.39
11_N	14_K	1.188	0.39
369_K	389_V	1.184	0.39
265_Y	272_F	1.174	0.38
82_P	134_F	1.168	0.38
69_Y	266_D	1.165	0.38
36_I	77_V	1.162	0.37
196_P	212_R	1.151	0.37
74_L	85_H	1.147	0.37
132_I	345_S	1.142	0.37
257_G	324_Q	1.120	0.35
306_D	373_E	1.119	0.35
107_V	289_L	1.118	0.35
221_V	304_A	1.118	0.35
249_Q	257_G	1.110	0.35
51_C	154_V	1.103	0.35
178_A	216_K	1.101	0.35
329_D	335_L	1.083	0.34
263_L	334_V	1.072	0.33
165_I	191_D	1.069	0.33
17_F	304_A	1.069	0.33
201_G	366_V	1.060	0.33
43_T	390_S	1.058	0.33
44_H	180_E	1.052	0.32
61_E	232_N	1.048	0.32
261_G	265_Y	1.045	0.32
7_A	135_V	1.042	0.32
19_T	25_E	1.041	0.32
47_T	382_E	1.041	0.32
93_Q	177_G	1.037	0.32
48_A	52_L	1.035	0.32
175_G	300_G	1.034	0.31
173_M	329_D	1.033	0.31
91_G	94_F	1.028	0.31
21_A	45_V	1.028	0.31
13_G	35_T	1.026	0.31
14_K	35_T	1.026	0.31
8_G	35_T	1.026	0.31
19_T	28_V	1.016	0.31
7_A	19_T	1.016	0.31
88_R	117_E	1.012	0.30
7_A	10_P	1.011	0.30
271_D	276_G	1.008	0.30
78_A	98_L	1.008	0.30
61_E	68_R	1.001	0.30
173_M	183_V	0.995	0.30
332_G	365_A	0.995	0.30
92_N	138_E	0.993	0.30
90_L	106_N	0.993	0.30
8_G	16_T	0.993	0.30
13_G	16_T	0.993	0.30
109_D	226_D	0.992	0.30
89_G	138_E	0.991	0.30
30_N	120_P	0.987	0.29
232_N	235_R	0.985	0.29
380_L	389_V	0.980	0.29
93_Q	97_E	0.974	0.29
58_C	102_D	0.971	0.29
169_I	186_V	0.966	0.28
338_A	387_K	0.966	0.28
212_R	375_G	0.962	0.28
165_I	279_G	0.962	0.28
40_R	73_E	0.962	0.28
53_T	122_E	0.959	0.28
347_P	359_G	0.956	0.28
176_F	215_T	0.955	0.28
343_A	381_G	0.951	0.28
34_T	224_K	0.949	0.28
5_A	13_G	0.947	0.28
5_A	8_G	0.947	0.28
5_A	14_K	0.947	0.28
58_C	63_C	0.946	0.28
378_D	381_G	0.944	0.28
268_G	272_F	0.940	0.27
189_E	210_G	0.938	0.27
212_R	385_V	0.933	0.27
148_E	204_R	0.933	0.27
141_L	205_E	0.933	0.27
254_V	265_Y	0.932	0.27
121_V	125_D	0.926	0.27
313_L	337_D	0.924	0.27
143_L	212_R	0.922	0.27
270_E	280_D	0.921	0.27
125_D	210_G	0.918	0.27
108_V	347_P	0.912	0.26
20_A	26_V	0.912	0.26
33_F	38_A	0.907	0.26
203_D	319_F	0.906	0.26
246_A	293_M	0.904	0.26
272_F	275_T	0.902	0.26
17_F	103_V	0.902	0.26
144_A	327_W	0.901	0.26
61_E	285_A	0.901	0.26
247_T	250_G	0.900	0.26
49_C	58_C	0.899	0.26
103_V	219_V	0.892	0.25
280_D	283_R	0.892	0.25
6_L	16_T	0.890	0.25
72_V	202_E	0.890	0.25
19_T	229_P	0.889	0.25
380_L	384_D	0.881	0.25
10_P	135_V	0.879	0.25
133_D	291_E	0.876	0.25
58_C	93_Q	0.875	0.25
146_I	324_Q	0.874	0.25
10_P	29_A	0.874	0.25
6_L	390_S	0.873	0.25
27_D	43_T	0.870	0.25
23_R	29_A	0.868	0.25
6_L	17_F	0.867	0.24
10_P	81_V	0.860	0.24
179_S	185_A	0.859	0.24
365_A	386_V	0.852	0.24
106_N	115_N	0.852	0.24
70_V	319_F	0.850	0.24
348_V	386_V	0.848	0.24
279_G	374_I	0.848	0.24
155_E	197_I	0.845	0.24
7_A	229_P	0.842	0.24
159_R	172_M	0.841	0.23
106_N	135_V	0.839	0.23
37_D	155_E	0.838	0.23
148_E	284_E	0.838	0.23
234_Q	343_A	0.837	0.23
87_G	138_E	0.837	0.23
105_V	304_A	0.835	0.23
351_A	365_A	0.832	0.23
78_A	81_V	0.832	0.23
6_L	43_T	0.832	0.23
48_A	67_K	0.831	0.23
191_D	314_E	0.830	0.23
81_V	154_V	0.829	0.23
216_K	345_S	0.826	0.23
347_P	352_Y	0.824	0.23
93_Q	174_T	0.824	0.23
271_D	275_T	0.823	0.23
84_A	89_G	0.821	0.23
7_A	228_A	0.819	0.23
257_G	367_N	0.819	0.23
81_V	145_G	0.817	0.23
45_V	246_A	0.815	0.23
5_A	28_V	0.814	0.22
135_V	295_E	0.812	0.22
321_V	350_L	0.810	0.22
56_E	61_E	0.808	0.22
234_Q	237_L	0.807	0.22
341_L	363_L	0.806	0.22
81_V	228_A	0.806	0.22
341_L	348_V	0.806	0.22
37_D	73_E	0.805	0.22
60_H	104_I	0.804	0.22
19_T	65_D	0.804	0.22
81_V	156_R	0.804	0.22
118_G	142_W	0.801	0.22
29_A	113_A	0.801	0.22
6_L	110_A	0.799	0.22
249_Q	288_A	0.798	0.22
86_E	357_D	0.798	0.22
29_A	288_A	0.798	0.22
180_E	212_R	0.797	0.22
374_I	380_L	0.797	0.22
96_D	156_R	0.790	0.22
34_T	50_P	0.789	0.22
34_T	51_C	0.783	0.21
19_T	24_S	0.783	0.21
231_E	234_Q	0.782	0.21
108_V	244_I	0.781	0.21
98_L	134_F	0.780	0.21
80_L	84_A	0.780	0.21
287_E	339_V	0.779	0.21
80_L	89_G	0.778	0.21
165_I	289_L	0.777	0.21
102_D	361_G	0.777	0.21
141_L	154_V	0.775	0.21
233_V	252_L	0.775	0.21
367_N	383_G	0.775	0.21
74_L	90_L	0.774	0.21
344_G	379_E	0.773	0.21
67_K	266_D	0.772	0.21
84_A	138_E	0.770	0.21
332_G	336_P	0.765	0.21
221_V	238_D	0.762	0.21
102_D	139_M	0.761	0.21
375_G	378_D	0.760	0.21
12_A	97_E	0.759	0.21
19_T	135_V	0.759	0.21
50_P	53_T	0.759	0.21
359_G	365_A	0.758	0.21
262_F	383_G	0.757	0.20
183_V	293_M	0.754	0.20
34_T	49_C	0.753	0.20
28_V	375_G	0.753	0.20
81_V	107_V	0.753	0.20
93_Q	104_I	0.751	0.20
43_T	361_G	0.750	0.20
270_E	273_D	0.749	0.20
113_A	354_V	0.749	0.20
18_Y	40_R	0.739	0.20
97_E	131_D	0.739	0.20
49_C	68_R	0.737	0.20
327_W	385_V	0.736	0.20
152_E	385_V	0.736	0.20
106_N	126_H	0.734	0.20
36_I	98_L	0.731	0.20
219_V	258_A	0.731	0.20
279_G	283_R	0.728	0.20
36_I	97_E	0.727	0.19
359_G	362_Y	0.723	0.19
132_I	243_V	0.721	0.19
144_A	204_R	0.721	0.19
82_P	117_E	0.716	0.19
38_A	50_P	0.716	0.19
131_D	141_L	0.715	0.19
255_R	265_Y	0.713	0.19
230_E	287_E	0.711	0.19
26_V	148_E	0.708	0.19
175_G	299_T	0.706	0.19
142_W	226_D	0.705	0.19
102_D	177_G	0.705	0.19
38_A	160_S	0.705	0.19
28_V	328_T	0.705	0.19
33_F	91_G	0.704	0.19
250_G	342_D	0.704	0.19
129_V	235_R	0.704	0.19
195_D	386_V	0.704	0.19
289_L	356_S	0.704	0.19
380_L	386_V	0.703	0.19
112_G	118_G	0.699	0.19
146_I	176_F	0.697	0.19
80_L	138_E	0.697	0.19
112_G	128_P	0.697	0.19
210_G	214_R	0.697	0.19
105_V	133_D	0.696	0.19
178_A	192_Y	0.696	0.19
10_P	98_L	0.695	0.18
101_A	199_W	0.691	0.18
9_K	299_T	0.689	0.18
118_G	175_G	0.688	0.18
212_R	221_V	0.686	0.18
12_A	104_I	0.685	0.18
43_T	47_T	0.684	0.18
216_K	222_A	0.684	0.18
116_E	325_S	0.684	0.18
49_C	66_G	0.684	0.18
61_E	64_H	0.683	0.18
50_P	199_W	0.680	0.18
29_A	292_T	0.678	0.18
200_S	318_A	0.678	0.18
364_H	389_V	0.676	0.18
167_T	303_R	0.675	0.18
323_D	326_K	0.672	0.18
118_G	299_T	0.672	0.18
205_E	305_L	0.672	0.18
179_S	353_A	0.671	0.18
65_D	280_D	0.670	0.18
127_D	348_V	0.670	0.18
88_R	325_S	0.669	0.18
16_T	22_T	0.669	0.18
78_A	134_F	0.666	0.18
109_D	224_K	0.664	0.18
355_H	365_A	0.661	0.17
263_L	275_T	0.661	0.17
225_V	240_D	0.660	0.17
76_D	79_G	0.657	0.17
96_D	151_W	0.656	0.17
74_L	250_G	0.653	0.17
77_V	80_L	0.652	0.17
117_E	135_V	0.651	0.17
303_R	307_Y	0.649	0.17
64_H	157_A	0.649	0.17
90_L	96_D	0.645	0.17
167_T	180_E	0.644	0.17
47_T	185_A	0.643	0.17
39_N	77_V	0.643	0.17
62_H	104_I	0.642	0.17
70_V	277_D	0.641	0.17
206_A	209_R	0.640	0.17
151_W	156_R	0.640	0.17
84_A	87_G	0.638	0.17
41_G	215_T	0.638	0.17
7_A	24_S	0.638	0.17
348_V	376_E	0.635	0.17
327_W	368_A	0.631	0.17
201_G	262_F	0.629	0.16
126_H	232_N	0.628	0.16
114_T	118_G	0.627	0.16
265_Y	308_A	0.625	0.16
43_T	286_L	0.625	0.16
45_V	90_L	0.625	0.16
43_T	147_V	0.623	0.16
6_L	273_D	0.623	0.16
178_A	270_E	0.622	0.16
189_E	385_V	0.621	0.16
45_V	302_Q	0.621	0.16
87_G	142_W	0.621	0.16
7_A	376_E	0.619	0.16
29_A	108_V	0.618	0.16
36_I	39_N	0.616	0.16
75_L	126_H	0.614	0.16
120_P	383_G	0.613	0.16
206_A	269_D	0.612	0.16
42_V	47_T	0.612	0.16
62_H	69_Y	0.612	0.16
206_A	210_G	0.611	0.16
29_A	34_T	0.610	0.16
33_F	39_N	0.610	0.16
196_P	222_A	0.609	0.16
15_S	35_T	0.609	0.16
335_L	365_A	0.609	0.16
199_W	375_G	0.607	0.16
195_D	198_Q	0.607	0.16
72_V	186_V	0.606	0.16
358_I	364_H	0.606	0.16
81_V	289_L	0.605	0.16
186_V	358_I	0.604	0.16
306_D	364_H	0.601	0.16
80_L	87_G	0.601	0.16
213_E	307_Y	0.598	0.16
89_G	92_N	0.598	0.16
51_C	358_I	0.598	0.16
19_T	26_V	0.597	0.16
4_I	298_G	0.595	0.16
11_N	15_S	0.595	0.16
213_E	311_D	0.594	0.16
16_T	385_V	0.594	0.16
179_S	314_E	0.593	0.15
4_I	244_I	0.591	0.15
269_D	272_F	0.590	0.15
139_M	273_D	0.590	0.15
63_C	66_G	0.589	0.15
341_L	370_T	0.588	0.15
230_E	233_V	0.587	0.15
68_R	226_D	0.587	0.15
326_K	387_K	0.587	0.15
218_I	231_E	0.587	0.15
129_V	278_V	0.586	0.15
70_V	327_W	0.586	0.15
45_V	105_V	0.585	0.15
75_L	158_S	0.585	0.15
189_E	283_R	0.582	0.15
374_I	378_D	0.582	0.15
336_P	354_V	0.580	0.15
149_D	385_V	0.580	0.15
178_A	215_T	0.580	0.15
376_E	387_K	0.579	0.15
138_E	142_W	0.578	0.15
182_Q	215_T	0.578	0.15
265_Y	299_T	0.578	0.15
134_F	253_A	0.576	0.15
89_G	142_W	0.575	0.15
17_F	116_E	0.574	0.15
122_E	238_D	0.573	0.15
128_P	131_D	0.573	0.15
66_G	194_D	0.572	0.15
90_L	309_V	0.569	0.15
93_Q	155_E	0.568	0.15
210_G	213_E	0.568	0.15
41_G	325_S	0.568	0.15
11_N	338_A	0.567	0.15
4_I	20_A	0.566	0.15
370_T	375_G	0.566	0.15
51_C	81_V	0.564	0.15
212_R	245_P	0.563	0.15
15_S	36_I	0.562	0.15
137_E	244_I	0.562	0.15
31_Y	150_N	0.559	0.15
207_L	211_V	0.558	0.15
279_G	286_L	0.558	0.15
68_R	142_W	0.557	0.15
61_E	247_T	0.557	0.15
249_Q	262_F	0.557	0.15
52_L	57_R	0.557	0.15
113_A	121_V	0.556	0.14
33_F	36_I	0.556	0.14
221_V	375_G	0.556	0.14
146_I	208_A	0.555	0.14
354_V	357_D	0.554	0.14
91_G	95_L	0.554	0.14
5_A	150_N	0.553	0.14
182_Q	193_P	0.552	0.14
5_A	22_T	0.550	0.14
251_E	265_Y	0.549	0.14
370_T	374_I	0.549	0.14
103_V	119_E	0.548	0.14
159_R	195_D	0.545	0.14
84_A	91_G	0.544	0.14
151_W	321_V	0.544	0.14
288_A	386_V	0.543	0.14
151_W	199_W	0.543	0.14
325_S	371_N	0.542	0.14
251_E	300_G	0.539	0.14
333_T	336_P	0.538	0.14
136_E	304_A	0.538	0.14
174_T	190_F	0.538	0.14
257_G	279_G	0.537	0.14
54_R	60_H	0.537	0.14
68_R	109_D	0.537	0.14
10_P	172_M	0.536	0.14
68_R	337_D	0.534	0.14
39_N	309_V	0.533	0.14
155_E	353_A	0.532	0.14
238_D	383_G	0.532	0.14
118_G	226_D	0.531	0.14
77_V	82_P	0.531	0.14
253_A	257_G	0.531	0.14
109_D	118_G	0.531	0.14
35_T	76_D	0.531	0.14
66_G	177_G	0.531	0.14
201_G	290_R	0.530	0.14
186_V	190_F	0.529	0.14
50_P	56_E	0.527	0.14
330_A	362_Y	0.527	0.14
83_G	176_F	0.526	0.14
143_L	208_A	0.525	0.14
355_H	360_D	0.525	0.14
164_D	261_G	0.525	0.14
58_C	174_T	0.525	0.14
167_T	276_G	0.520	0.14
8_G	76_D	0.520	0.14
14_K	76_D	0.520	0.14
13_G	76_D	0.520	0.14
82_P	151_W	0.517	0.14
70_V	183_V	0.516	0.13
243_V	326_K	0.515	0.13
10_P	50_P	0.514	0.13
30_N	85_H	0.514	0.13
13_G	19_T	0.513	0.13
14_K	19_T	0.513	0.13
8_G	19_T	0.513	0.13
281_D	339_V	0.513	0.13
4_I	8_G	0.512	0.13
4_I	14_K	0.512	0.13
4_I	13_G	0.512	0.13
32_P	94_F	0.512	0.13
47_T	61_E	0.512	0.13
257_G	323_D	0.510	0.13
330_A	374_I	0.508	0.13
72_V	340_L	0.507	0.13
282_Q	285_A	0.506	0.13
77_V	199_W	0.505	0.13
94_F	138_E	0.505	0.13
32_P	91_G	0.504	0.13
350_L	386_V	0.504	0.13
37_D	117_E	0.504	0.13
34_T	226_D	0.504	0.13
11_N	19_T	0.502	0.13
304_A	309_V	0.502	0.13
23_R	298_G	0.502	0.13
305_L	348_V	0.501	0.13
86_E	260_A	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1wxqA	1	0.8575	100	0.391	Contact Map
1jalA	1	0.8193	100	0.561	Contact Map
2dbyA	1	0.8321	100	0.564	Contact Map
1ni3A	1	0.8601	100	0.587	Contact Map
2ohfA	1	0.7379	100	0.651	Contact Map
4a9aA	1	0.7379	100	0.678	Contact Map
1lnzA	1	0.4606	100	0.789	Contact Map
4csu9	1	0.4351	100	0.8	Contact Map
3ievA	1	0.7125	100	0.802	Contact Map
1egaA	2	0.6972	100	0.812	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0116 seconds.