Q9HRN5 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HRN5 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HRN5	Sequences: MNKWQRRTAAYSLGLLGLMAAFAVGYYYGMRLFEGDPKTFVHSFRVVVETFTTTGYGSDAPWATPEMNVFVAVMDLTGVALIFMALPAFVFPLMEDAFATTVPQTVVDDYSDHVVVCTYTSRAGALVADLESRDVAYVIVEPDREQAIELYEDGVDVVHADPESVSGLRGAGLASARALVADVSDRVDASIVLAAREANEDVPIVSVVEDPDRIPYHRLAGADDVLSPRPLLGRSLASKVTMSVSMDAADAVEIRDGFEMAEFPVHPGSELQGTTLARSGIRERTGVNVVGAWFNGEFETPPDPETRLTDGTVLLVTGRKDQLEALMEITQSEFRRFERGETLVIGYGHVGKSIADELDTAGVPHTVVDASADVDGVDVVGNAVEPETLRAAGIEDARSVILALPDDTLTEFATLVIRELSPATEVIARVEESGSIQKMYRAGADYVLSLAAVTGRMIASTVIDGEDVLALDRQIEVVRTAAPGLVGTRIGDALVRTRTGCTVVAINRDGALTTEVGPNSRVRDGDKLVVAGTTEGIRAFTDAFV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	545 (520)
Sequences:	170 (149)
Seq/√Len:	6.5

HALSA - Q9HRN5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
179_L	195_A	6.214	1.00
50_T	56_Y	4.417	0.97
23_A	27_Y	4.354	0.97
45_R	49_E	4.044	0.95
160_A	167_G	3.603	0.91
22_F	30_M	3.588	0.91
508_R	526_D	3.550	0.91
23_A	30_M	3.547	0.91
140_V	289_V	3.397	0.88
272_Q	354_I	3.334	0.87
23_A	26_Y	3.183	0.85
158_V	171_A	3.177	0.85
27_Y	30_M	3.129	0.84
15_L	26_Y	3.059	0.82
30_M	34_E	2.818	0.76
181_A	195_A	2.752	0.75
19_M	23_A	2.731	0.74
504_V	510_G	2.710	0.73
15_L	22_F	2.693	0.73
368_V	506_I	2.665	0.72
45_R	58_S	2.649	0.72
276_L	289_V	2.638	0.71
354_I	401_I	2.519	0.68
29_G	67_M	2.503	0.67
418_R	445_D	2.422	0.64
24_V	64_T	2.410	0.64
152_E	208_V	2.400	0.64
160_A	439_M	2.362	0.62
129_D	401_I	2.330	0.61
49_E	58_S	2.255	0.59
119_Y	385_E	2.234	0.58
22_F	27_Y	2.231	0.58
275_T	278_R	2.081	0.52
169_R	492_D	2.052	0.51
494_L	497_T	2.051	0.51
45_R	56_Y	2.037	0.51
240_V	424_T	2.024	0.50
22_F	26_Y	2.017	0.50
26_Y	30_M	1.996	0.49
54_T	59_D	1.994	0.49
140_V	368_V	1.992	0.49
43_S	52_T	1.979	0.48
285_T	322_Q	1.966	0.48
395_E	506_I	1.957	0.48
11_Y	28_Y	1.939	0.47
27_Y	31_R	1.921	0.46
54_T	75_D	1.920	0.46
135_V	177_R	1.904	0.46
344_V	522_V	1.901	0.46
430_V	439_M	1.900	0.46
46_V	59_D	1.893	0.45
112_D	205_V	1.848	0.44
160_A	406_D	1.844	0.43
58_S	75_D	1.843	0.43
45_R	75_D	1.837	0.43
15_L	30_M	1.832	0.43
283_E	378_D	1.809	0.42
411_E	439_M	1.796	0.42
196_R	389_L	1.795	0.42
42_H	46_V	1.761	0.40
277_A	486_V	1.751	0.40
288_N	504_V	1.742	0.40
87_P	350_V	1.735	0.40
185_D	505_A	1.728	0.39
286_G	291_G	1.727	0.39
220_A	415_L	1.709	0.39
228_P	446_Y	1.707	0.39
274_T	387_E	1.706	0.39
164_S	423_A	1.705	0.38
160_A	342_T	1.704	0.38
206_S	522_V	1.698	0.38
15_L	23_A	1.697	0.38
19_M	27_Y	1.694	0.38
181_A	188_D	1.692	0.38
400_V	417_I	1.685	0.38
45_R	68_N	1.683	0.38
19_M	26_Y	1.681	0.38
16_L	25_G	1.668	0.37
43_S	59_D	1.662	0.37
204_I	278_R	1.653	0.37
179_L	260_M	1.649	0.37
59_D	67_M	1.644	0.36
355_A	426_V	1.642	0.36
43_S	67_M	1.641	0.36
53_T	78_G	1.637	0.36
219_L	439_M	1.614	0.35
139_I	155_V	1.602	0.35
43_S	60_A	1.602	0.35
151_Y	240_V	1.595	0.35
168_L	384_V	1.587	0.34
50_T	54_T	1.587	0.34
127_V	426_V	1.585	0.34
91_F	354_I	1.583	0.34
202_V	451_A	1.579	0.34
467_D	477_V	1.577	0.34
96_D	365_H	1.571	0.34
503_V	540_F	1.567	0.34
228_P	345_I	1.542	0.33
343_L	506_I	1.539	0.33
385_E	488_T	1.537	0.33
191_I	504_V	1.531	0.33
70_F	77_T	1.520	0.32
187_V	343_L	1.510	0.32
388_T	521_R	1.508	0.32
79_V	226_L	1.498	0.32
48_V	56_Y	1.496	0.31
85_A	228_P	1.495	0.31
89_F	93_L	1.494	0.31
240_V	368_V	1.491	0.31
258_F	262_E	1.491	0.31
158_V	306_T	1.476	0.31
54_T	60_A	1.473	0.31
75_D	412_F	1.458	0.30
137_Y	167_G	1.457	0.30
26_Y	29_G	1.456	0.30
11_Y	30_M	1.452	0.30
308_L	372_A	1.429	0.29
293_W	503_V	1.426	0.29
506_I	536_G	1.423	0.29
13_L	21_A	1.415	0.29
24_V	27_Y	1.413	0.29
506_I	520_S	1.408	0.29
342_T	411_E	1.398	0.28
11_Y	23_A	1.396	0.28
19_M	22_F	1.391	0.28
86_L	313_V	1.391	0.28
70_F	300_T	1.383	0.28
315_L	489_R	1.382	0.28
93_L	343_L	1.382	0.28
45_R	71_V	1.380	0.28
219_L	313_V	1.375	0.28
124_G	510_G	1.374	0.28
265_V	426_V	1.372	0.28
61_P	68_N	1.370	0.28
79_V	200_E	1.370	0.28
401_I	484_G	1.370	0.28
188_D	458_I	1.360	0.27
450_L	455_G	1.351	0.27
83_F	93_L	1.344	0.27
38_K	59_D	1.342	0.27
196_R	204_I	1.342	0.27
302_P	479_R	1.337	0.27
225_V	379_V	1.333	0.27
495_V	528_L	1.332	0.26
11_Y	15_L	1.326	0.26
56_Y	368_V	1.324	0.26
101_T	163_E	1.322	0.26
468_V	518_P	1.321	0.26
192_V	451_A	1.320	0.26
39_T	42_H	1.316	0.26
22_F	116_V	1.316	0.26
276_L	287_V	1.310	0.26
188_D	462_V	1.309	0.26
423_A	525_G	1.308	0.26
356_D	421_S	1.306	0.26
489_R	492_D	1.305	0.26
226_L	477_V	1.302	0.26
77_T	84_M	1.299	0.26
138_V	173_L	1.294	0.25
86_L	279_S	1.290	0.25
368_V	419_E	1.289	0.25
19_M	33_F	1.287	0.25
193_L	530_V	1.279	0.25
18_L	424_T	1.278	0.25
87_P	126_L	1.264	0.25
182_D	193_L	1.263	0.25
386_P	415_L	1.262	0.25
342_T	388_T	1.262	0.25
161_D	320_K	1.262	0.25
12_S	24_V	1.261	0.24
417_I	537_I	1.260	0.24
141_E	191_I	1.257	0.24
136_A	204_I	1.256	0.24
27_Y	43_S	1.248	0.24
382_N	436_I	1.244	0.24
140_V	503_V	1.239	0.24
358_L	523_R	1.235	0.24
319_R	522_V	1.235	0.24
56_Y	75_D	1.229	0.24
276_L	298_F	1.229	0.24
199_N	396_D	1.225	0.24
11_Y	26_Y	1.220	0.23
129_D	459_A	1.220	0.23
70_F	74_M	1.217	0.23
15_L	95_E	1.215	0.23
140_V	396_D	1.199	0.23
11_Y	22_F	1.183	0.22
161_D	201_D	1.182	0.22
46_V	74_M	1.182	0.22
11_Y	27_Y	1.169	0.22
467_D	517_G	1.169	0.22
406_D	427_I	1.166	0.22
162_P	382_N	1.163	0.22
23_A	34_E	1.161	0.22
44_F	309_T	1.159	0.22
272_Q	435_S	1.150	0.22
158_V	522_V	1.147	0.21
360_T	469_L	1.145	0.21
15_L	445_D	1.143	0.21
45_R	67_M	1.143	0.21
157_V	283_E	1.143	0.21
233_G	447_V	1.141	0.21
166_S	525_G	1.137	0.21
196_R	282_R	1.133	0.21
140_V	387_E	1.131	0.21
298_F	439_M	1.130	0.21
112_D	206_S	1.124	0.21
13_L	76_L	1.120	0.21
94_M	368_V	1.118	0.21
232_L	528_L	1.118	0.21
72_A	312_T	1.117	0.21
49_E	54_T	1.117	0.21
202_V	226_L	1.112	0.21
13_L	169_R	1.111	0.21
127_V	316_V	1.110	0.21
147_A	157_V	1.110	0.21
280_G	283_E	1.102	0.20
359_D	494_L	1.102	0.20
68_N	71_V	1.098	0.20
233_G	314_L	1.097	0.20
27_Y	38_K	1.096	0.20
49_E	75_D	1.094	0.20
68_N	288_N	1.090	0.20
20_A	26_Y	1.084	0.20
63_A	136_A	1.084	0.20
46_V	58_S	1.080	0.20
456_R	514_T	1.072	0.20
205_V	533_T	1.070	0.20
205_V	275_T	1.070	0.20
92_P	95_E	1.069	0.20
186_R	465_G	1.069	0.20
50_T	65_P	1.068	0.20
48_V	54_T	1.068	0.20
397_A	445_D	1.066	0.20
59_D	71_V	1.063	0.19
49_E	56_Y	1.061	0.19
454_T	508_R	1.060	0.19
27_Y	34_E	1.052	0.19
194_A	353_S	1.051	0.19
133_R	140_V	1.048	0.19
184_S	187_V	1.045	0.19
36_D	140_V	1.044	0.19
308_L	326_L	1.039	0.19
410_T	428_A	1.039	0.19
89_F	99_A	1.038	0.19
152_E	317_T	1.036	0.19
205_V	312_T	1.035	0.19
94_M	97_A	1.034	0.19
16_L	328_E	1.033	0.19
430_V	452_A	1.032	0.19
276_L	400_V	1.031	0.19
134_D	387_E	1.030	0.19
492_D	523_R	1.026	0.19
425_E	446_Y	1.025	0.19
195_A	308_L	1.024	0.19
413_A	460_S	1.021	0.19
30_M	60_A	1.020	0.18
46_V	51_F	1.020	0.18
49_E	79_V	1.017	0.18
105_T	219_L	1.016	0.18
388_T	506_I	1.014	0.18
114_V	195_A	1.012	0.18
382_N	534_T	1.007	0.18
140_V	158_V	1.004	0.18
477_V	490_I	1.003	0.18
54_T	61_P	1.002	0.18
41_V	288_N	0.998	0.18
83_F	404_L	0.994	0.18
42_H	58_S	0.993	0.18
343_L	394_I	0.993	0.18
182_D	454_T	0.990	0.18
445_D	451_A	0.989	0.18
58_S	71_V	0.984	0.18
354_I	493_A	0.984	0.18
15_L	27_Y	0.981	0.18
138_V	406_D	0.980	0.18
223_D	315_L	0.979	0.18
350_V	448_L	0.976	0.18
184_S	256_D	0.976	0.18
155_V	406_D	0.975	0.18
368_V	388_T	0.974	0.17
114_V	312_T	0.971	0.17
160_A	411_E	0.971	0.17
19_M	30_M	0.971	0.17
21_A	506_I	0.970	0.17
353_S	393_G	0.970	0.17
89_F	496_R	0.970	0.17
358_L	427_I	0.968	0.17
50_T	75_D	0.968	0.17
94_M	240_V	0.965	0.17
105_T	110_Y	0.963	0.17
140_V	250_D	0.960	0.17
156_D	204_I	0.959	0.17
136_A	533_T	0.959	0.17
25_G	368_V	0.950	0.17
180_V	275_T	0.948	0.17
14_G	19_M	0.948	0.17
390_R	395_E	0.946	0.17
203_P	506_I	0.943	0.17
194_A	434_G	0.942	0.17
13_L	388_T	0.940	0.17
382_N	509_D	0.938	0.17
209_E	517_G	0.936	0.17
18_L	477_V	0.935	0.17
343_L	535_E	0.931	0.17
372_A	377_V	0.930	0.17
149_E	358_L	0.930	0.17
362_G	536_G	0.926	0.16
45_R	59_D	0.925	0.16
110_Y	275_T	0.923	0.16
112_D	509_D	0.922	0.16
257_G	333_E	0.922	0.16
292_A	453_V	0.919	0.16
69_V	524_D	0.914	0.16
365_H	475_I	0.912	0.16
140_V	171_A	0.912	0.16
184_S	426_V	0.911	0.16
109_D	256_D	0.911	0.16
180_V	299_E	0.910	0.16
29_G	115_V	0.908	0.16
323_L	330_T	0.907	0.16
394_I	488_T	0.907	0.16
395_E	536_G	0.906	0.16
235_S	298_F	0.906	0.16
299_E	353_S	0.905	0.16
193_L	369_D	0.905	0.16
40_F	69_V	0.903	0.16
143_D	357_E	0.902	0.16
79_V	354_I	0.901	0.16
343_L	487_G	0.898	0.16
463_I	472_D	0.896	0.16
51_F	449_S	0.895	0.16
391_A	525_G	0.894	0.16
344_V	486_V	0.893	0.16
258_F	261_A	0.891	0.16
13_L	539_A	0.889	0.16
58_S	67_M	0.886	0.16
188_D	192_V	0.885	0.16
368_V	394_I	0.884	0.16
308_L	323_L	0.881	0.16
236_L	293_W	0.881	0.16
495_V	505_A	0.877	0.16
205_V	490_I	0.876	0.15
383_A	418_R	0.875	0.15
43_S	71_V	0.875	0.15
281_I	323_L	0.872	0.15
49_E	421_S	0.872	0.15
158_V	495_V	0.872	0.15
81_L	117_C	0.868	0.15
235_S	439_M	0.867	0.15
70_F	82_I	0.866	0.15
70_F	449_S	0.866	0.15
79_V	302_P	0.865	0.15
23_A	56_Y	0.864	0.15
158_V	368_V	0.864	0.15
64_T	174_A	0.863	0.15
60_A	67_M	0.863	0.15
455_G	472_D	0.863	0.15
15_L	29_G	0.862	0.15
162_P	234_R	0.859	0.15
69_V	77_T	0.859	0.15
136_A	214_I	0.859	0.15
452_A	516_V	0.858	0.15
46_V	68_N	0.858	0.15
99_A	265_V	0.857	0.15
278_R	360_T	0.856	0.15
114_V	154_G	0.855	0.15
181_A	308_L	0.852	0.15
39_T	283_E	0.852	0.15
192_V	462_V	0.848	0.15
49_E	60_A	0.843	0.15
157_V	261_A	0.842	0.15
290_V	431_E	0.841	0.15
155_V	354_I	0.841	0.15
326_L	514_T	0.833	0.15
18_L	37_P	0.831	0.15
344_V	367_V	0.829	0.15
143_D	514_T	0.829	0.15
228_P	526_D	0.828	0.15
219_L	431_E	0.827	0.15
397_A	424_T	0.825	0.15
119_Y	364_P	0.823	0.14
161_D	408_T	0.819	0.14
193_L	207_V	0.817	0.14
261_A	485_L	0.817	0.14
324_E	331_Q	0.817	0.14
173_L	345_I	0.815	0.14
446_Y	459_A	0.814	0.14
225_V	350_V	0.812	0.14
400_V	451_A	0.812	0.14
499_T	505_A	0.812	0.14
116_V	276_L	0.811	0.14
46_V	61_P	0.810	0.14
248_A	308_L	0.810	0.14
14_G	281_I	0.810	0.14
256_D	512_L	0.807	0.14
54_T	412_F	0.807	0.14
21_A	25_G	0.806	0.14
281_I	388_T	0.804	0.14
384_V	448_L	0.803	0.14
76_L	166_S	0.802	0.14
23_A	44_F	0.801	0.14
259_E	509_D	0.800	0.14
70_F	391_A	0.799	0.14
512_L	518_P	0.799	0.14
248_A	323_L	0.798	0.14
58_S	61_P	0.797	0.14
108_D	311_G	0.796	0.14
140_V	402_L	0.795	0.14
411_E	485_L	0.794	0.14
296_G	397_A	0.793	0.14
344_V	528_L	0.792	0.14
264_P	285_T	0.790	0.14
433_S	446_Y	0.789	0.14
38_K	421_S	0.789	0.14
413_A	416_V	0.788	0.14
182_D	223_D	0.786	0.14
117_C	438_K	0.786	0.14
50_T	140_V	0.785	0.14
116_V	529_V	0.785	0.14
117_C	193_L	0.785	0.14
382_N	510_G	0.784	0.14
136_A	174_A	0.783	0.14
189_A	383_A	0.782	0.14
49_E	67_M	0.779	0.14
38_K	43_S	0.778	0.14
160_A	431_E	0.776	0.14
185_D	188_D	0.775	0.14
328_E	379_V	0.774	0.14
311_G	342_T	0.774	0.14
456_R	534_T	0.772	0.14
181_A	477_V	0.772	0.14
280_G	399_S	0.769	0.14
148_I	477_V	0.769	0.14
283_E	533_T	0.768	0.14
100_T	140_V	0.768	0.14
44_F	503_V	0.767	0.13
290_V	525_G	0.766	0.13
433_S	476_E	0.764	0.13
23_A	28_Y	0.760	0.13
394_I	535_E	0.760	0.13
281_I	297_E	0.759	0.13
60_A	65_P	0.756	0.13
216_Y	298_F	0.756	0.13
157_V	412_F	0.755	0.13
43_S	497_T	0.754	0.13
130_L	271_L	0.754	0.13
205_V	280_G	0.753	0.13
349_H	449_S	0.753	0.13
398_R	495_V	0.750	0.13
157_V	533_T	0.748	0.13
356_D	510_G	0.747	0.13
287_V	298_F	0.747	0.13
42_H	59_D	0.745	0.13
64_T	363_V	0.745	0.13
121_S	298_F	0.745	0.13
321_D	354_I	0.743	0.13
139_I	310_D	0.741	0.13
181_A	437_Q	0.740	0.13
177_R	485_L	0.737	0.13
350_V	389_L	0.736	0.13
216_Y	455_G	0.736	0.13
467_D	472_D	0.735	0.13
263_F	410_T	0.734	0.13
288_N	329_I	0.734	0.13
181_A	342_T	0.733	0.13
161_D	468_V	0.732	0.13
137_Y	504_V	0.732	0.13
81_L	401_I	0.732	0.13
471_L	479_R	0.731	0.13
456_R	537_I	0.730	0.13
362_G	539_A	0.728	0.13
324_E	468_V	0.728	0.13
115_V	189_A	0.727	0.13
69_V	146_Q	0.726	0.13
194_A	202_V	0.726	0.13
18_L	368_V	0.726	0.13
81_L	316_V	0.725	0.13
325_A	343_L	0.723	0.13
88_A	197_E	0.723	0.13
56_Y	111_S	0.716	0.13
37_P	115_V	0.716	0.13
113_H	447_V	0.715	0.13
122_R	438_K	0.714	0.13
382_N	391_A	0.713	0.13
24_V	28_Y	0.712	0.13
208_V	477_V	0.710	0.13
188_D	195_A	0.710	0.13
312_T	387_E	0.709	0.13
167_G	342_T	0.708	0.13
43_S	50_T	0.705	0.12
298_F	496_R	0.705	0.12
234_R	460_S	0.705	0.12
12_S	27_Y	0.705	0.12
166_S	169_R	0.704	0.12
206_S	503_V	0.702	0.12
308_L	475_I	0.702	0.12
29_G	60_A	0.701	0.12
506_I	519_N	0.700	0.12
42_H	64_T	0.697	0.12
193_L	229_R	0.697	0.12
12_S	30_M	0.697	0.12
198_A	524_D	0.696	0.12
365_H	427_I	0.695	0.12
344_V	451_A	0.694	0.12
73_V	383_A	0.692	0.12
44_F	139_I	0.692	0.12
91_F	411_E	0.691	0.12
290_V	439_M	0.690	0.12
269_S	304_P	0.690	0.12
158_V	409_L	0.689	0.12
265_V	308_L	0.689	0.12
31_R	60_A	0.688	0.12
269_S	502_T	0.688	0.12
186_R	387_E	0.686	0.12
271_L	469_L	0.685	0.12
255_R	379_V	0.685	0.12
139_I	497_T	0.684	0.12
124_G	300_T	0.684	0.12
503_V	530_V	0.683	0.12
127_V	362_G	0.682	0.12
205_V	400_V	0.681	0.12
112_D	159_H	0.679	0.12
286_G	499_T	0.679	0.12
226_L	313_V	0.677	0.12
45_R	54_T	0.677	0.12
496_R	501_C	0.676	0.12
170_G	310_D	0.676	0.12
80_A	191_I	0.674	0.12
318_G	358_L	0.673	0.12
23_A	528_L	0.673	0.12
415_L	440_Y	0.672	0.12
89_F	115_V	0.671	0.12
47_V	83_F	0.670	0.12
270_E	329_I	0.669	0.12
204_I	286_G	0.669	0.12
180_V	376_G	0.668	0.12
25_G	204_I	0.666	0.12
240_V	338_E	0.666	0.12
256_D	509_D	0.665	0.12
215_P	400_V	0.664	0.12
360_T	394_I	0.664	0.12
255_R	530_V	0.664	0.12
366_T	379_V	0.663	0.12
79_V	83_F	0.663	0.12
19_M	34_E	0.655	0.12
26_Y	59_D	0.652	0.12
74_M	276_L	0.651	0.12
140_V	320_K	0.650	0.12
128_A	260_M	0.650	0.12
468_V	497_T	0.650	0.12
56_Y	138_V	0.648	0.12
514_T	531_A	0.648	0.12
17_G	307_R	0.648	0.12
199_N	542_D	0.648	0.12
73_V	322_Q	0.647	0.12
134_D	200_E	0.647	0.12
123_A	309_T	0.644	0.12
239_K	425_E	0.644	0.12
184_S	257_G	0.643	0.11
169_R	173_L	0.642	0.11
446_Y	468_V	0.641	0.11
12_S	390_R	0.641	0.11
222_A	452_A	0.640	0.11
21_A	343_L	0.638	0.11
127_V	477_V	0.637	0.11
43_S	58_S	0.637	0.11
159_H	208_V	0.636	0.11
185_D	429_R	0.633	0.11
154_G	260_M	0.633	0.11
81_L	198_A	0.633	0.11
28_Y	39_T	0.632	0.11
81_L	89_F	0.632	0.11
306_T	368_V	0.631	0.11
501_C	505_A	0.631	0.11
119_Y	127_V	0.631	0.11
61_P	67_M	0.629	0.11
411_E	431_E	0.629	0.11
47_V	97_A	0.628	0.11
239_K	402_L	0.628	0.11
267_P	312_T	0.628	0.11
298_F	431_E	0.627	0.11
344_V	400_V	0.625	0.11
256_D	426_V	0.625	0.11
15_L	68_N	0.625	0.11
277_A	340_G	0.624	0.11
67_M	71_V	0.623	0.11
209_E	468_V	0.623	0.11
54_T	227_S	0.622	0.11
245_S	522_V	0.622	0.11
42_H	50_T	0.620	0.11
54_T	67_M	0.620	0.11
420_L	426_V	0.619	0.11
30_M	59_D	0.619	0.11
226_L	421_S	0.618	0.11
49_E	463_I	0.617	0.11
87_P	219_L	0.616	0.11
281_I	516_V	0.616	0.11
79_V	522_V	0.614	0.11
285_T	504_V	0.613	0.11
18_L	89_F	0.612	0.11
115_V	190_S	0.612	0.11
155_V	317_T	0.611	0.11
427_I	436_I	0.610	0.11
127_V	354_I	0.608	0.11
308_L	329_I	0.608	0.11
345_I	383_A	0.608	0.11
86_L	194_A	0.607	0.11
436_I	477_V	0.607	0.11
88_A	347_Y	0.607	0.11
47_V	77_T	0.606	0.11
344_V	355_A	0.606	0.11
396_D	524_D	0.605	0.11
219_L	419_E	0.603	0.11
97_A	290_V	0.603	0.11
17_G	513_T	0.603	0.11
48_V	70_F	0.602	0.11
73_V	400_V	0.600	0.11
278_R	328_E	0.600	0.11
124_G	388_T	0.600	0.11
200_E	354_I	0.599	0.11
432_E	461_T	0.599	0.11
52_T	369_D	0.598	0.11
255_R	282_R	0.596	0.11
142_P	477_V	0.596	0.11
246_M	250_D	0.596	0.11
12_S	522_V	0.594	0.11
401_I	459_A	0.591	0.11
349_H	470_A	0.591	0.11
141_E	397_A	0.589	0.11
404_L	410_T	0.588	0.11
13_L	36_D	0.588	0.11
129_D	255_R	0.586	0.11
274_T	388_T	0.586	0.11
168_L	189_A	0.585	0.11
510_G	542_D	0.584	0.11
135_V	448_L	0.583	0.11
184_S	358_L	0.583	0.11
417_I	451_A	0.582	0.11
15_L	492_D	0.581	0.11
93_L	402_L	0.581	0.11
246_M	370_A	0.579	0.11
119_Y	155_V	0.579	0.11
11_Y	24_V	0.577	0.11
319_R	373_D	0.577	0.11
219_L	386_P	0.577	0.11
141_E	179_L	0.576	0.11
225_V	532_G	0.575	0.11
325_A	484_G	0.574	0.10
70_F	101_T	0.574	0.10
112_D	539_A	0.574	0.10
351_G	443_G	0.572	0.10
381_G	443_G	0.572	0.10
351_G	381_G	0.572	0.10
221_G	346_G	0.572	0.10
346_G	351_G	0.572	0.10
346_G	381_G	0.572	0.10
221_G	381_G	0.572	0.10
69_V	112_D	0.572	0.10
221_G	443_G	0.572	0.10
221_G	351_G	0.572	0.10
346_G	443_G	0.572	0.10
22_F	31_R	0.571	0.10
46_V	67_M	0.570	0.10
182_D	229_R	0.569	0.10
507_N	527_K	0.569	0.10
28_Y	170_G	0.567	0.10
171_A	226_L	0.567	0.10
17_G	22_F	0.563	0.10
385_E	390_R	0.563	0.10
117_C	137_Y	0.562	0.10
390_R	504_V	0.561	0.10
160_A	429_R	0.561	0.10
34_E	43_S	0.560	0.10
59_D	65_P	0.560	0.10
225_V	510_G	0.559	0.10
109_D	209_E	0.557	0.10
286_G	404_L	0.557	0.10
315_L	377_V	0.556	0.10
42_H	68_N	0.556	0.10
152_E	412_F	0.556	0.10
131_E	288_N	0.553	0.10
144_R	173_L	0.552	0.10
44_F	508_R	0.550	0.10
446_Y	534_T	0.550	0.10
84_M	468_V	0.550	0.10
76_L	170_G	0.549	0.10
276_L	520_S	0.549	0.10
413_A	505_A	0.549	0.10
12_S	28_Y	0.548	0.10
53_T	57_G	0.546	0.10
323_L	437_Q	0.546	0.10
12_S	360_T	0.545	0.10
256_D	530_V	0.544	0.10
58_S	91_F	0.544	0.10
414_T	440_Y	0.544	0.10
432_E	474_Q	0.543	0.10
307_R	423_A	0.543	0.10
324_E	435_S	0.542	0.10
42_H	49_E	0.541	0.10
23_A	31_R	0.540	0.10
59_D	68_N	0.540	0.10
75_D	90_V	0.540	0.10
320_K	491_G	0.538	0.10
182_D	315_L	0.538	0.10
427_I	435_S	0.537	0.10
54_T	58_S	0.537	0.10
164_S	486_V	0.536	0.10
343_L	361_A	0.536	0.10
52_T	417_I	0.536	0.10
366_T	531_A	0.535	0.10
164_S	265_V	0.535	0.10
70_F	161_D	0.535	0.10
431_E	455_G	0.535	0.10
196_R	469_L	0.535	0.10
239_K	319_R	0.535	0.10
12_S	16_L	0.534	0.10
229_R	472_D	0.533	0.10
390_R	398_R	0.533	0.10
462_V	505_A	0.532	0.10
44_F	299_E	0.532	0.10
290_V	505_A	0.531	0.10
412_F	417_I	0.531	0.10
79_V	84_M	0.530	0.10
24_V	204_I	0.530	0.10
89_F	505_A	0.529	0.10
134_D	490_I	0.529	0.10
90_V	97_A	0.529	0.10
228_P	459_A	0.529	0.10
17_G	200_E	0.529	0.10
402_L	514_T	0.528	0.10
36_D	39_T	0.528	0.10
141_E	146_Q	0.528	0.10
264_P	471_L	0.527	0.10
344_V	537_I	0.527	0.10
369_D	450_L	0.527	0.10
289_V	359_D	0.526	0.10
12_S	20_A	0.526	0.10
161_D	276_L	0.526	0.10
132_S	192_V	0.525	0.10
11_Y	538_R	0.524	0.10
332_S	344_V	0.524	0.10
197_E	536_G	0.524	0.10
288_N	315_L	0.522	0.10
60_A	235_S	0.522	0.10
299_E	449_S	0.522	0.10
58_S	74_M	0.521	0.10
180_V	289_V	0.520	0.10
20_A	72_A	0.520	0.10
376_G	495_V	0.520	0.10
198_A	202_V	0.518	0.10
100_T	415_L	0.518	0.10
489_R	493_A	0.517	0.10
99_A	102_V	0.516	0.10
112_D	290_V	0.516	0.10
412_F	428_A	0.515	0.10
273_G	510_G	0.515	0.10
256_D	516_V	0.515	0.10
50_T	471_L	0.514	0.10
65_P	475_I	0.513	0.10
93_L	195_A	0.513	0.10
180_V	380_V	0.512	0.10
130_L	236_L	0.512	0.10
298_F	427_I	0.511	0.10
209_E	476_E	0.510	0.10
193_L	456_R	0.508	0.10
13_L	25_G	0.508	0.10
226_L	383_A	0.507	0.10
64_T	166_S	0.507	0.10
439_M	454_T	0.507	0.10
115_V	512_L	0.507	0.10
39_T	542_D	0.506	0.10
118_T	415_L	0.506	0.10
43_S	531_A	0.505	0.10
71_V	74_M	0.505	0.10
467_D	490_I	0.504	0.10
342_T	355_A	0.503	0.10
21_A	437_Q	0.501	0.10
11_Y	31_R	0.500	0.10
43_S	56_Y	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4gx0A	3	0.9761	100	0.551	Contact Map
3nafA	3	0.7982	100	0.671	Contact Map
4g65A	2	0.7798	100	0.687	Contact Map
3mt5A	5	0.7578	100	0.695	Contact Map
4hpfA	3	0.7505	100	0.697	Contact Map
1lnqA	6	0.5413	100	0.75	Contact Map
2aefA	2	0.4055	100	0.83	Contact Map
3l4bC	2	0.3927	100	0.861	Contact Map
4j91A	3	0.3908	100	0.868	Contact Map
2r9rB	3	0.1835	99.9	0.89	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0143 seconds.