Q9HRD4 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HRD4 - Protein kinase

UniProt:	Q9HRD4	Sequences: MTETLDRLSEQYAESVPADLRDTQSFQWYLDTLYDDPTVARNAHQRLADMFDYYGKTTDDDGVVEYRLASEDPLGEGANTFFGREVHESIHEFVNKVKSGARGLGPEKRIILLLGPVGSGKSDVDRQVRRYFEDYTAQREGRLYTFRWTDLCSVIDDQDPNDDTITSPMHQDPLVLLPEAQRQQVIDDLNEDLDAPYSLRNSQSLDPESEFYMDELLAHYDDDLQAVLESHVEVVRLVASENRRDCIETFEPKDKKNQDETELTGDVNYSKLAVYGESDPRAFDYAGAFCNANRGIFSGEELLKLQREFLYDFLHATQEQTIKPKNNPRIDIDQVIVGRTNMPEYQDKRADEKMEAFNDRTKRVDFPYVLEYDREAKIYEKLLGNADVPDIHVEPHTLTMAGLFGVLTRIREPDTDAIGLLEKAKAYNGELDDIDDVDPEKLREEAEVTGDREGMDGVSPRFVGDEIAAAIMESMDRDRGFLSPLTVFNRVEDNLPQHGSIPEDHVADYQRVLEQVREEYKERAIEDVRHALAYDLDEIQRQGEKYMDHVMAYIDDDTVADELTGREQEPDETFLRAVEEQLGVPGDRKDDFRQEVSNWVSRRAREGEPFDPQDNDRLRRALERKLWEDKKHNINFSALVSNADVDEEQDNEWVAALVDRGYSEDGAREVLEFAGAEVAKAELES	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	685 (614)
Sequences:	493 (160)
Seq/√Len:	6.5

ECOLI - YEAG
BACSU - PRKA
HALSA - Q9HRD4 Q9HRD5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
663_S	666_G	10.309	1.00
481_F	666_G	9.956	1.00
481_F	663_S	8.568	1.00
373_D	428_N	7.920	1.00
32_T	39_V	7.568	1.00
206_D	209_S	6.156	1.00
167_S	209_S	5.792	1.00
359_D	459_S	5.603	0.99
41_R	49_D	5.099	0.99
167_S	206_D	4.919	0.99
47_L	97_V	4.911	0.99
124_V	408_T	4.176	0.96
427_Y	453_E	4.175	0.96
23_T	147_R	3.884	0.94
371_E	374_R	3.815	0.93
322_I	459_S	3.295	0.87
143_L	239_A	3.288	0.86
392_H	663_S	2.747	0.74
204_S	467_I	2.578	0.69
554_I	575_L	2.560	0.69
206_D	481_F	2.549	0.68
178_P	182_R	2.503	0.67
146_F	232_V	2.436	0.65
322_I	359_D	2.422	0.64
206_D	666_G	2.418	0.64
204_S	296_I	2.411	0.64
364_V	641_S	2.400	0.63
168_P	310_L	2.380	0.63
145_T	148_W	2.377	0.63
134_D	608_E	2.369	0.62
28_W	402_G	2.342	0.61
561_D	565_G	2.333	0.61
118_G	459_S	2.312	0.60
550_V	667_A	2.256	0.58
51_F	94_V	2.245	0.58
118_G	397_T	2.243	0.58
206_D	663_S	2.139	0.54
300_E	359_D	2.129	0.54
408_T	672_E	2.124	0.53
38_T	406_V	2.115	0.53
315_H	459_S	2.045	0.51
438_D	657_L	2.021	0.50
421_L	424_A	2.004	0.49
28_W	296_I	1.970	0.48
419_G	482_L	1.967	0.48
134_D	411_R	1.965	0.48
301_E	356_A	1.935	0.46
372_Y	428_N	1.931	0.46
265_G	301_E	1.927	0.46
180_A	655_A	1.919	0.46
423_K	453_E	1.918	0.46
243_R	506_V	1.917	0.46
180_A	218_A	1.902	0.45
170_H	323_K	1.892	0.45
199_L	209_S	1.871	0.44
406_V	512_V	1.866	0.44
102_R	387_D	1.854	0.44
300_E	459_S	1.848	0.43
145_T	235_V	1.827	0.43
368_Y	375_E	1.808	0.42
367_P	379_Y	1.806	0.42
28_W	608_E	1.800	0.42
103_G	200_R	1.796	0.41
548_D	552_A	1.788	0.41
205_L	333_D	1.784	0.41
167_S	175_V	1.758	0.40
613_Q	646_D	1.745	0.40
118_G	359_D	1.722	0.39
335_V	405_G	1.717	0.39
424_A	608_E	1.716	0.39
168_P	592_F	1.695	0.38
645_V	648_E	1.695	0.38
467_I	487_V	1.693	0.38
435_D	442_L	1.690	0.38
216_L	231_H	1.689	0.38
310_L	592_F	1.662	0.37
359_D	397_T	1.662	0.37
364_V	459_S	1.644	0.36
254_D	319_E	1.642	0.36
31_D	218_A	1.637	0.36
403_L	424_A	1.626	0.36
509_Y	590_D	1.625	0.35
103_G	527_D	1.616	0.35
263_L	531_A	1.614	0.35
246_C	570_P	1.609	0.35
105_G	329_R	1.605	0.35
282_A	313_F	1.596	0.35
93_F	296_I	1.594	0.34
609_P	655_A	1.570	0.34
400_M	484_P	1.569	0.34
128_V	210_E	1.565	0.33
644_D	647_E	1.565	0.33
326_N	363_R	1.561	0.33
406_V	661_G	1.561	0.33
252_P	379_Y	1.559	0.33
569_E	652_E	1.556	0.33
411_R	452_R	1.554	0.33
31_D	35_D	1.552	0.33
31_D	380_E	1.544	0.33
133_E	240_S	1.538	0.33
483_S	555_D	1.537	0.33
406_V	488_F	1.529	0.32
336_I	430_E	1.522	0.32
31_D	416_D	1.503	0.31
112_L	303_L	1.502	0.31
542_Q	671_L	1.501	0.31
252_P	367_P	1.498	0.31
67_R	406_V	1.490	0.31
288_A	513_L	1.487	0.31
280_P	356_A	1.485	0.31
141_G	323_K	1.482	0.31
411_R	456_D	1.478	0.31
320_Q	405_G	1.471	0.30
176_L	232_V	1.471	0.30
427_Y	595_E	1.471	0.30
25_S	547_M	1.465	0.30
103_G	511_R	1.454	0.30
376_A	380_E	1.450	0.30
298_S	342_M	1.431	0.29
336_I	421_L	1.429	0.29
30_L	338_G	1.421	0.29
134_D	655_A	1.415	0.29
561_D	566_R	1.407	0.29
419_G	478_D	1.398	0.28
528_V	674_A	1.396	0.28
212_Y	219_H	1.396	0.28
462_F	494_N	1.394	0.28
322_I	405_G	1.380	0.28
186_I	619_R	1.378	0.28
132_F	247_I	1.376	0.28
402_G	407_L	1.368	0.27
291_N	335_V	1.361	0.27
263_L	319_E	1.356	0.27
184_Q	648_E	1.352	0.27
111_I	216_L	1.351	0.27
410_I	592_F	1.345	0.27
338_G	536_L	1.344	0.27
80_T	145_T	1.344	0.27
171_Q	175_V	1.339	0.27
302_L	372_Y	1.337	0.26
269_Y	359_D	1.332	0.26
402_G	646_D	1.328	0.26
296_I	398_L	1.324	0.26
15_S	35_D	1.324	0.26
559_V	657_L	1.323	0.26
292_A	407_L	1.318	0.26
335_V	338_G	1.318	0.26
323_K	327_N	1.312	0.26
385_N	620_R	1.311	0.26
419_G	515_Q	1.305	0.26
182_R	246_C	1.304	0.26
482_L	509_Y	1.301	0.25
397_T	459_S	1.300	0.25
315_H	359_D	1.299	0.25
527_D	574_F	1.296	0.25
180_A	408_T	1.295	0.25
331_D	484_P	1.292	0.25
302_L	529_R	1.289	0.25
434_I	439_P	1.282	0.25
299_G	342_M	1.277	0.25
375_E	409_R	1.273	0.25
373_D	513_L	1.272	0.25
402_G	573_T	1.267	0.24
293_N	333_D	1.263	0.24
320_Q	608_E	1.254	0.24
32_T	493_D	1.252	0.24
511_R	651_N	1.244	0.24
187_D	408_T	1.241	0.24
44_H	539_I	1.236	0.24
574_F	635_N	1.234	0.24
209_S	481_F	1.226	0.23
458_V	552_A	1.221	0.23
81_F	99_S	1.216	0.23
552_A	625_K	1.212	0.23
179_E	389_P	1.209	0.23
338_G	383_L	1.200	0.23
576_R	600_V	1.188	0.22
118_G	315_H	1.187	0.22
23_T	28_W	1.176	0.22
223_D	231_H	1.175	0.22
220_Y	421_L	1.172	0.22
364_V	603_R	1.170	0.22
72_D	387_D	1.166	0.22
115_G	173_P	1.165	0.22
115_G	579_E	1.165	0.22
115_G	593_R	1.165	0.22
134_D	380_E	1.165	0.22
379_Y	623_E	1.165	0.22
408_T	552_A	1.159	0.22
173_P	579_E	1.157	0.22
173_P	593_R	1.157	0.22
493_D	531_A	1.157	0.22
579_E	593_R	1.157	0.22
49_D	399_T	1.153	0.22
388_V	467_I	1.145	0.21
303_L	460_P	1.143	0.21
310_L	356_A	1.140	0.21
24_Q	202_S	1.135	0.21
349_R	379_Y	1.135	0.21
118_G	429_G	1.134	0.21
290_C	530_H	1.132	0.21
440_E	444_E	1.132	0.21
648_E	655_A	1.129	0.21
129_R	339_R	1.127	0.21
248_E	280_P	1.124	0.21
408_T	509_Y	1.123	0.21
73_P	651_N	1.112	0.21
280_P	661_G	1.111	0.20
27_Q	664_E	1.110	0.20
219_H	232_V	1.110	0.20
133_E	378_I	1.108	0.20
320_Q	595_E	1.107	0.20
44_H	277_E	1.106	0.20
646_D	655_A	1.101	0.20
14_E	18_A	1.101	0.20
397_T	484_P	1.095	0.20
168_P	263_L	1.094	0.20
61_D	366_F	1.094	0.20
408_T	466_E	1.094	0.20
51_F	657_L	1.093	0.20
300_E	315_H	1.093	0.20
28_W	218_A	1.087	0.20
19_D	31_D	1.086	0.20
482_L	527_D	1.085	0.20
645_V	654_V	1.084	0.20
42_N	45_Q	1.083	0.20
92_E	512_V	1.081	0.20
417_A	466_E	1.080	0.20
254_D	310_L	1.079	0.20
532_L	636_F	1.076	0.20
397_T	511_R	1.076	0.20
246_C	375_E	1.076	0.20
525_I	674_A	1.075	0.20
19_D	611_D	1.072	0.20
171_Q	209_S	1.071	0.20
561_D	568_Q	1.070	0.20
117_V	257_N	1.067	0.19
214_D	419_G	1.067	0.19
293_N	368_Y	1.065	0.19
116_P	423_K	1.061	0.19
121_K	454_G	1.059	0.19
341_N	454_G	1.059	0.19
360_R	454_G	1.059	0.19
395_P	454_G	1.059	0.19
454_G	546_Y	1.059	0.19
122_S	375_E	1.058	0.19
350_A	560_A	1.057	0.19
184_Q	218_A	1.054	0.19
408_T	659_D	1.053	0.19
561_D	564_T	1.053	0.19
186_I	523_R	1.053	0.19
658_V	664_E	1.045	0.19
396_H	399_T	1.043	0.19
413_P	598_N	1.039	0.19
397_T	556_D	1.036	0.19
408_T	416_D	1.035	0.19
265_G	356_A	1.034	0.19
412_E	440_E	1.031	0.19
442_L	445_E	1.028	0.19
300_E	405_G	1.028	0.19
121_K	341_N	1.028	0.19
121_K	360_R	1.028	0.19
121_K	395_P	1.028	0.19
121_K	546_Y	1.028	0.19
252_P	461_R	1.028	0.19
341_N	360_R	1.028	0.19
341_N	395_P	1.028	0.19
341_N	546_Y	1.028	0.19
360_R	395_P	1.028	0.19
360_R	546_Y	1.028	0.19
395_P	546_Y	1.028	0.19
251_E	357_F	1.027	0.19
34_Y	185_V	1.025	0.19
270_S	506_V	1.025	0.19
331_D	459_S	1.024	0.18
249_T	460_P	1.024	0.18
64_V	187_D	1.024	0.18
28_W	609_P	1.022	0.18
223_D	440_E	1.016	0.18
25_S	609_P	1.016	0.18
425_K	430_E	1.016	0.18
15_S	18_A	1.014	0.18
55_G	205_L	1.014	0.18
133_E	459_S	1.012	0.18
512_V	620_R	1.005	0.18
67_R	467_I	1.003	0.18
388_V	522_E	1.003	0.18
133_E	252_P	1.000	0.18
261_T	484_P	0.998	0.18
221_D	613_Q	0.996	0.18
583_G	663_S	0.996	0.18
134_D	180_A	0.996	0.18
88_E	380_E	0.995	0.18
406_V	609_P	0.991	0.18
387_D	566_R	0.990	0.18
296_I	646_D	0.982	0.18
134_D	187_D	0.981	0.18
237_L	506_V	0.980	0.18
289_F	583_G	0.979	0.18
209_S	666_G	0.978	0.17
363_R	679_A	0.976	0.17
254_D	263_L	0.968	0.17
245_D	657_L	0.967	0.17
147_R	380_E	0.966	0.17
27_Q	655_A	0.964	0.17
41_R	311_Y	0.963	0.17
15_S	679_A	0.962	0.17
394_E	484_P	0.961	0.17
32_T	456_D	0.958	0.17
324_P	338_G	0.954	0.17
247_I	254_D	0.954	0.17
222_D	342_M	0.952	0.17
103_G	586_G	0.951	0.17
115_G	409_R	0.951	0.17
600_V	618_L	0.950	0.17
110_I	336_I	0.950	0.17
123_D	167_S	0.949	0.17
303_L	340_T	0.948	0.17
73_P	76_E	0.946	0.17
14_E	180_A	0.946	0.17
269_Y	459_S	0.945	0.17
58_T	61_D	0.944	0.17
252_P	378_I	0.943	0.17
429_G	442_L	0.942	0.17
88_E	402_G	0.941	0.17
27_Q	406_V	0.941	0.17
177_L	648_E	0.938	0.17
442_L	646_D	0.936	0.17
410_I	510_Q	0.935	0.17
245_D	292_A	0.935	0.17
339_R	627_W	0.935	0.17
559_V	590_D	0.935	0.17
171_Q	252_P	0.934	0.17
483_S	665_D	0.933	0.17
92_E	335_V	0.933	0.17
319_E	595_E	0.933	0.17
322_I	331_D	0.932	0.17
209_S	663_S	0.930	0.16
207_P	552_A	0.928	0.16
97_V	124_V	0.927	0.16
102_R	406_V	0.927	0.16
49_D	408_T	0.927	0.16
122_S	368_Y	0.925	0.16
533_A	673_F	0.925	0.16
548_D	644_D	0.925	0.16
471_I	575_L	0.923	0.16
656_A	659_D	0.920	0.16
25_S	184_Q	0.919	0.16
665_D	669_E	0.919	0.16
31_D	648_E	0.916	0.16
408_T	606_E	0.914	0.16
539_I	622_L	0.910	0.16
171_Q	666_G	0.910	0.16
302_L	308_E	0.907	0.16
168_P	356_A	0.905	0.16
117_V	258_Q	0.902	0.16
282_A	301_E	0.902	0.16
212_Y	232_V	0.901	0.16
130_R	380_E	0.898	0.16
118_G	211_F	0.896	0.16
396_H	530_H	0.895	0.16
534_Y	567_E	0.894	0.16
72_D	293_N	0.893	0.16
272_L	285_Y	0.893	0.16
349_R	405_G	0.892	0.16
45_Q	487_V	0.892	0.16
331_D	359_D	0.891	0.16
97_V	651_N	0.891	0.16
113_L	379_Y	0.890	0.16
172_D	666_G	0.890	0.16
541_R	550_V	0.889	0.16
116_P	457_G	0.889	0.16
12_Y	15_S	0.888	0.16
331_D	467_I	0.888	0.16
222_D	348_K	0.888	0.16
609_P	645_V	0.888	0.16
408_T	482_L	0.885	0.16
182_R	205_L	0.885	0.16
93_F	384_G	0.883	0.16
397_T	400_M	0.883	0.16
288_A	460_P	0.882	0.16
141_G	182_R	0.880	0.15
131_Y	210_E	0.879	0.15
298_S	339_R	0.878	0.15
67_R	394_E	0.878	0.15
364_V	651_N	0.878	0.15
236_R	327_N	0.877	0.15
338_G	622_L	0.877	0.15
38_T	49_D	0.876	0.15
398_L	648_E	0.874	0.15
42_N	296_I	0.873	0.15
462_F	594_Q	0.870	0.15
61_D	180_A	0.869	0.15
276_G	301_E	0.869	0.15
133_E	279_D	0.867	0.15
28_W	180_A	0.865	0.15
133_E	368_Y	0.865	0.15
326_N	483_S	0.864	0.15
326_N	660_R	0.864	0.15
596_V	663_S	0.864	0.15
288_A	404_F	0.864	0.15
278_S	288_A	0.859	0.15
466_E	630_K	0.858	0.15
258_Q	356_A	0.856	0.15
380_E	389_P	0.855	0.15
214_D	550_V	0.855	0.15
453_E	595_E	0.852	0.15
573_T	651_N	0.852	0.15
109_R	377_K	0.851	0.15
296_I	537_D	0.851	0.15
133_E	370_L	0.849	0.15
43_A	336_I	0.849	0.15
434_I	526_E	0.846	0.15
392_H	481_F	0.845	0.15
170_H	376_A	0.845	0.15
459_S	484_P	0.844	0.15
283_F	424_A	0.844	0.15
79_N	411_R	0.841	0.15
15_S	372_Y	0.841	0.15
468_A	627_W	0.840	0.15
82_F	572_E	0.836	0.15
315_H	366_F	0.836	0.15
483_S	527_D	0.836	0.15
303_L	309_F	0.832	0.15
92_E	506_V	0.830	0.15
98_K	308_E	0.826	0.14
300_E	322_I	0.825	0.14
350_A	550_V	0.821	0.14
56_K	399_T	0.821	0.14
313_F	375_E	0.820	0.14
117_V	345_Y	0.817	0.14
278_S	323_K	0.817	0.14
483_S	598_N	0.817	0.14
301_E	318_Q	0.813	0.14
290_C	542_Q	0.813	0.14
172_D	199_L	0.812	0.14
118_G	262_E	0.812	0.14
113_L	367_P	0.811	0.14
250_F	524_A	0.811	0.14
116_P	378_I	0.810	0.14
118_G	403_L	0.809	0.14
645_V	655_A	0.806	0.14
257_N	316_A	0.805	0.14
110_I	289_F	0.805	0.14
295_G	409_R	0.804	0.14
35_D	507_A	0.803	0.14
491_V	656_A	0.802	0.14
49_D	59_D	0.801	0.14
587_D	633_N	0.801	0.14
53_Y	514_E	0.800	0.14
543_G	633_N	0.800	0.14
114_L	561_D	0.800	0.14
368_Y	409_R	0.798	0.14
43_A	187_D	0.798	0.14
269_Y	338_G	0.797	0.14
521_K	679_A	0.795	0.14
36_D	591_D	0.795	0.14
123_D	366_F	0.795	0.14
335_V	383_L	0.794	0.14
513_L	527_D	0.794	0.14
222_D	560_A	0.794	0.14
25_S	180_A	0.792	0.14
383_L	631_K	0.792	0.14
289_F	308_E	0.792	0.14
89_S	560_A	0.791	0.14
236_R	309_F	0.790	0.14
50_M	626_L	0.789	0.14
185_V	385_N	0.789	0.14
309_F	323_K	0.788	0.14
313_F	402_G	0.786	0.14
347_D	649_Q	0.786	0.14
101_A	488_F	0.785	0.14
184_Q	513_L	0.785	0.14
272_L	615_N	0.783	0.14
340_T	468_A	0.782	0.14
141_G	303_L	0.781	0.14
120_G	404_F	0.780	0.14
39_V	559_V	0.779	0.14
148_W	213_M	0.777	0.14
428_N	619_R	0.776	0.14
14_E	214_D	0.776	0.14
58_T	366_F	0.776	0.14
376_A	390_D	0.776	0.14
39_V	93_F	0.773	0.14
178_P	375_E	0.773	0.14
241_E	292_A	0.773	0.14
597_S	600_V	0.773	0.14
362_K	372_Y	0.773	0.14
59_D	65_E	0.772	0.14
58_T	185_V	0.771	0.14
256_K	345_Y	0.771	0.14
141_G	313_F	0.771	0.14
109_R	340_T	0.769	0.13
179_E	225_Q	0.769	0.13
173_P	409_R	0.768	0.13
409_R	579_E	0.768	0.13
409_R	593_R	0.768	0.13
373_D	398_L	0.766	0.13
483_S	566_R	0.765	0.13
15_S	458_V	0.764	0.13
182_R	375_E	0.764	0.13
280_P	301_E	0.763	0.13
122_S	379_Y	0.763	0.13
110_I	556_D	0.761	0.13
480_G	665_D	0.758	0.13
35_D	390_D	0.757	0.13
313_F	357_F	0.757	0.13
15_S	39_V	0.754	0.13
93_F	144_Y	0.753	0.13
167_S	666_G	0.750	0.13
312_D	359_D	0.746	0.13
402_G	641_S	0.745	0.13
493_D	565_G	0.745	0.13
141_G	528_V	0.744	0.13
285_Y	399_T	0.744	0.13
263_L	355_E	0.742	0.13
174_L	365_D	0.742	0.13
174_L	607_G	0.741	0.13
93_F	527_D	0.740	0.13
132_F	570_P	0.740	0.13
49_D	670_V	0.739	0.13
24_Q	51_F	0.738	0.13
257_N	271_K	0.737	0.13
333_D	517_R	0.736	0.13
175_V	206_D	0.736	0.13
118_G	300_E	0.735	0.13
58_T	68_L	0.734	0.13
312_D	459_S	0.733	0.13
68_L	383_L	0.733	0.13
513_L	646_D	0.728	0.13
266_D	583_G	0.728	0.13
272_L	500_S	0.727	0.13
172_D	663_S	0.723	0.13
46_R	258_Q	0.721	0.13
174_L	280_P	0.720	0.13
109_R	256_K	0.719	0.13
276_G	323_K	0.719	0.13
124_V	446_A	0.718	0.13
133_E	379_Y	0.718	0.13
349_R	357_F	0.717	0.13
408_T	654_V	0.716	0.13
246_C	410_I	0.715	0.13
622_L	670_V	0.712	0.13
671_L	675_G	0.711	0.13
300_E	484_P	0.711	0.13
216_L	539_I	0.710	0.12
57_T	502_P	0.709	0.12
83_G	174_L	0.709	0.12
19_D	28_W	0.708	0.12
36_D	39_V	0.705	0.12
418_I	482_L	0.705	0.12
566_R	673_F	0.705	0.12
168_P	254_D	0.704	0.12
405_G	459_S	0.704	0.12
108_K	300_E	0.702	0.12
31_D	408_T	0.700	0.12
258_Q	355_E	0.699	0.12
379_Y	459_S	0.698	0.12
482_L	569_E	0.698	0.12
262_E	516_V	0.697	0.12
128_V	131_Y	0.697	0.12
67_R	70_S	0.697	0.12
233_E	547_M	0.697	0.12
392_H	666_G	0.696	0.12
384_G	530_H	0.696	0.12
444_E	664_E	0.692	0.12
120_G	566_R	0.691	0.12
22_D	309_F	0.691	0.12
437_V	563_L	0.690	0.12
35_D	184_Q	0.690	0.12
66_Y	70_S	0.689	0.12
145_T	283_F	0.688	0.12
270_S	591_D	0.688	0.12
39_V	49_D	0.688	0.12
105_G	331_D	0.687	0.12
367_P	644_D	0.684	0.12
254_D	318_Q	0.682	0.12
29_Y	33_L	0.682	0.12
50_M	460_P	0.681	0.12
243_R	416_D	0.681	0.12
298_S	379_Y	0.679	0.12
93_F	390_D	0.678	0.12
320_Q	459_S	0.678	0.12
653_W	670_V	0.678	0.12
180_A	547_M	0.678	0.12
48_A	467_I	0.677	0.12
272_L	498_H	0.677	0.12
130_R	408_T	0.677	0.12
109_R	141_G	0.677	0.12
388_V	559_V	0.675	0.12
340_T	543_G	0.673	0.12
558_T	582_L	0.673	0.12
324_P	363_R	0.672	0.12
399_T	508_D	0.672	0.12
276_G	282_A	0.670	0.12
55_G	178_P	0.669	0.12
408_T	570_P	0.669	0.12
563_L	660_R	0.667	0.12
300_E	331_D	0.667	0.12
310_L	319_E	0.666	0.12
552_A	647_E	0.666	0.12
42_N	467_I	0.664	0.12
336_I	428_N	0.663	0.12
42_N	61_D	0.662	0.12
147_R	235_V	0.661	0.12
237_L	641_S	0.661	0.12
42_N	646_D	0.661	0.12
141_G	178_P	0.660	0.12
14_E	497_Q	0.659	0.12
41_R	45_Q	0.658	0.12
22_D	188_D	0.658	0.12
259_D	356_A	0.657	0.12
340_T	637_S	0.656	0.12
441_K	445_E	0.656	0.12
413_P	440_E	0.656	0.12
454_G	457_G	0.655	0.12
470_A	548_D	0.654	0.12
112_L	340_T	0.652	0.12
103_G	114_L	0.651	0.12
72_D	309_F	0.651	0.12
276_G	356_A	0.648	0.12
146_F	220_Y	0.646	0.11
130_R	406_V	0.646	0.11
221_D	619_R	0.646	0.11
496_P	664_E	0.646	0.11
318_Q	344_E	0.644	0.11
175_V	209_S	0.642	0.11
100_G	301_E	0.641	0.11
406_V	426_A	0.641	0.11
34_Y	113_L	0.641	0.11
622_L	636_F	0.641	0.11
574_F	673_F	0.640	0.11
104_L	108_K	0.638	0.11
171_Q	174_L	0.638	0.11
259_D	381_K	0.638	0.11
220_Y	231_H	0.637	0.11
88_E	544_E	0.637	0.11
128_V	313_F	0.637	0.11
378_I	459_S	0.636	0.11
29_Y	89_S	0.635	0.11
483_S	578_V	0.635	0.11
346_Q	373_D	0.634	0.11
483_S	625_K	0.633	0.11
18_A	59_D	0.632	0.11
292_A	297_F	0.632	0.11
483_S	644_D	0.632	0.11
44_H	605_R	0.631	0.11
619_R	672_E	0.630	0.11
177_L	549_H	0.629	0.11
70_S	538_E	0.629	0.11
72_D	566_R	0.628	0.11
466_E	489_N	0.628	0.11
38_T	238_V	0.627	0.11
541_R	642_N	0.626	0.11
121_K	457_G	0.625	0.11
341_N	457_G	0.625	0.11
360_R	457_G	0.625	0.11
395_P	457_G	0.625	0.11
457_G	546_Y	0.625	0.11
103_G	453_E	0.625	0.11
607_G	623_E	0.625	0.11
187_D	568_Q	0.623	0.11
533_A	539_I	0.623	0.11
469_A	513_L	0.622	0.11
180_A	456_D	0.621	0.11
241_E	327_N	0.621	0.11
64_V	508_D	0.621	0.11
518_E	534_Y	0.620	0.11
317_T	504_D	0.620	0.11
68_L	516_V	0.620	0.11
167_S	663_S	0.617	0.11
92_E	320_Q	0.617	0.11
236_R	249_T	0.616	0.11
259_D	301_E	0.615	0.11
27_Q	661_G	0.615	0.11
177_L	421_L	0.614	0.11
42_N	331_D	0.613	0.11
52_D	94_V	0.613	0.11
458_V	568_Q	0.613	0.11
131_Y	426_A	0.612	0.11
256_K	340_T	0.610	0.11
107_E	292_A	0.610	0.11
14_E	361_T	0.609	0.11
264_T	631_K	0.608	0.11
186_I	197_Y	0.607	0.11
592_F	625_K	0.606	0.11
112_L	460_P	0.606	0.11
246_C	368_Y	0.605	0.11
599_W	603_R	0.605	0.11
110_I	645_V	0.605	0.11
282_A	356_A	0.604	0.11
200_R	605_R	0.603	0.11
37_P	141_G	0.602	0.11
61_D	387_D	0.601	0.11
26_F	411_R	0.601	0.11
337_V	660_R	0.601	0.11
100_G	344_E	0.600	0.11
43_A	456_D	0.599	0.11
263_L	595_E	0.599	0.11
396_H	548_D	0.599	0.11
82_F	424_A	0.599	0.11
183_Q	199_L	0.599	0.11
326_N	644_D	0.598	0.11
122_S	356_A	0.598	0.11
425_K	645_V	0.596	0.11
45_Q	49_D	0.596	0.11
122_S	313_F	0.594	0.11
382_L	464_G	0.594	0.11
241_E	629_D	0.592	0.11
305_L	312_D	0.592	0.11
463_V	491_V	0.592	0.11
336_I	356_A	0.592	0.11
171_Q	206_D	0.591	0.11
547_M	657_L	0.591	0.11
173_P	454_G	0.590	0.11
292_A	548_D	0.590	0.11
454_G	579_E	0.590	0.11
454_G	593_R	0.590	0.11
252_P	429_G	0.589	0.11
100_G	304_K	0.588	0.11
115_G	375_E	0.588	0.11
21_R	408_T	0.587	0.11
643_A	652_E	0.587	0.11
182_R	570_P	0.587	0.11
129_R	298_S	0.587	0.11
170_H	291_N	0.587	0.11
324_P	335_V	0.586	0.11
39_V	89_S	0.586	0.11
513_L	651_N	0.586	0.11
36_D	179_E	0.583	0.11
322_I	329_R	0.582	0.11
172_D	209_S	0.581	0.11
647_E	665_D	0.581	0.11
60_D	377_K	0.581	0.11
263_L	339_R	0.580	0.11
351_D	596_V	0.580	0.11
496_P	560_A	0.579	0.11
527_D	637_S	0.579	0.11
329_R	359_D	0.579	0.11
401_A	516_V	0.579	0.11
276_G	528_V	0.579	0.11
180_A	482_L	0.578	0.11
141_G	236_R	0.578	0.11
17_P	419_G	0.578	0.11
184_Q	613_Q	0.578	0.11
31_D	412_E	0.577	0.10
108_K	356_A	0.577	0.10
124_V	296_I	0.577	0.10
249_T	303_L	0.576	0.10
629_D	665_D	0.576	0.10
178_P	205_L	0.574	0.10
28_W	204_S	0.573	0.10
247_I	319_E	0.573	0.10
616_D	619_R	0.572	0.10
247_I	310_L	0.572	0.10
65_E	657_L	0.570	0.10
319_E	467_I	0.569	0.10
44_H	466_E	0.568	0.10
269_Y	329_R	0.566	0.10
35_D	380_E	0.566	0.10
638_A	678_V	0.565	0.10
171_Q	344_E	0.565	0.10
336_I	374_R	0.565	0.10
547_M	605_R	0.564	0.10
74_L	119_S	0.563	0.10
386_A	622_L	0.563	0.10
185_V	350_A	0.562	0.10
205_L	570_P	0.561	0.10
517_R	535_D	0.561	0.10
338_G	535_D	0.561	0.10
503_E	566_R	0.561	0.10
496_P	506_V	0.560	0.10
238_V	420_L	0.559	0.10
367_P	564_T	0.559	0.10
121_K	173_P	0.559	0.10
121_K	579_E	0.559	0.10
121_K	593_R	0.559	0.10
173_P	341_N	0.559	0.10
173_P	360_R	0.559	0.10
173_P	395_P	0.559	0.10
173_P	546_Y	0.559	0.10
341_N	579_E	0.559	0.10
341_N	593_R	0.559	0.10
360_R	579_E	0.559	0.10
360_R	593_R	0.559	0.10
395_P	579_E	0.559	0.10
395_P	593_R	0.559	0.10
546_Y	579_E	0.559	0.10
546_Y	593_R	0.559	0.10
101_A	469_A	0.558	0.10
378_I	461_R	0.558	0.10
336_I	584_V	0.558	0.10
652_E	661_G	0.557	0.10
115_G	454_G	0.557	0.10
513_L	663_S	0.557	0.10
132_F	246_C	0.557	0.10
35_D	218_A	0.556	0.10
145_T	167_S	0.556	0.10
15_S	655_A	0.556	0.10
368_Y	459_S	0.556	0.10
294_R	333_D	0.555	0.10
180_A	406_V	0.555	0.10
209_S	376_A	0.555	0.10
231_H	369_V	0.555	0.10
367_P	378_I	0.555	0.10
167_S	212_Y	0.554	0.10
129_R	355_E	0.553	0.10
289_F	428_N	0.553	0.10
96_K	111_I	0.550	0.10
305_L	535_D	0.549	0.10
141_G	276_G	0.549	0.10
259_D	355_E	0.548	0.10
216_L	369_V	0.548	0.10
497_Q	609_P	0.548	0.10
364_V	618_L	0.546	0.10
486_T	580_E	0.546	0.10
59_D	657_L	0.544	0.10
461_R	564_T	0.544	0.10
559_V	565_G	0.544	0.10
111_I	427_Y	0.543	0.10
178_P	246_C	0.543	0.10
380_E	646_D	0.542	0.10
118_G	322_I	0.542	0.10
308_E	586_G	0.541	0.10
169_M	309_F	0.540	0.10
331_D	465_D	0.540	0.10
308_E	583_G	0.539	0.10
379_Y	461_R	0.539	0.10
183_Q	511_R	0.539	0.10
284_D	340_T	0.539	0.10
249_T	426_A	0.537	0.10
298_S	348_K	0.537	0.10
74_L	611_D	0.536	0.10
517_R	576_R	0.536	0.10
171_Q	663_S	0.536	0.10
503_E	559_V	0.535	0.10
353_K	524_A	0.535	0.10
485_L	517_R	0.534	0.10
338_G	590_D	0.533	0.10
240_S	491_V	0.532	0.10
644_D	665_D	0.532	0.10
21_R	467_I	0.532	0.10
397_T	417_A	0.531	0.10
141_G	550_V	0.531	0.10
95_N	134_D	0.531	0.10
106_P	112_L	0.531	0.10
498_H	501_I	0.530	0.10
326_N	365_D	0.530	0.10
401_A	570_P	0.529	0.10
323_K	401_A	0.529	0.10
182_R	206_D	0.529	0.10
120_G	361_T	0.528	0.10
269_Y	300_E	0.528	0.10
544_E	559_V	0.528	0.10
34_Y	373_D	0.528	0.10
411_R	440_E	0.527	0.10
184_Q	199_L	0.527	0.10
58_T	642_N	0.527	0.10
115_G	121_K	0.527	0.10
115_G	341_N	0.527	0.10
115_G	360_R	0.527	0.10
115_G	395_P	0.527	0.10
115_G	546_Y	0.527	0.10
211_F	397_T	0.527	0.10
44_H	381_K	0.526	0.10
404_F	607_G	0.525	0.10
566_R	641_S	0.524	0.10
50_M	241_E	0.524	0.10
306_Q	342_M	0.523	0.10
236_R	303_L	0.522	0.10
533_A	619_R	0.522	0.10
59_D	185_V	0.522	0.10
263_L	301_E	0.521	0.10
317_T	335_V	0.521	0.10
412_E	496_P	0.519	0.10
105_G	335_V	0.519	0.10
556_D	646_D	0.519	0.10
61_D	563_L	0.518	0.10
467_I	631_K	0.518	0.10
92_E	405_G	0.517	0.10
127_Q	241_E	0.517	0.10
32_T	644_D	0.516	0.10
571_D	580_E	0.516	0.10
602_R	663_S	0.516	0.10
130_R	664_E	0.515	0.10
248_E	275_Y	0.515	0.10
323_K	674_A	0.514	0.10
232_V	613_Q	0.513	0.10
36_D	350_A	0.513	0.10
129_R	334_Q	0.513	0.10
134_D	179_E	0.513	0.10
81_F	428_N	0.512	0.10
412_E	416_D	0.512	0.10
253_K	325_K	0.512	0.10
308_E	317_T	0.512	0.10
105_G	359_D	0.512	0.10
555_D	598_N	0.511	0.10
199_L	504_D	0.511	0.10
283_F	297_F	0.511	0.10
188_D	372_Y	0.511	0.10
148_W	326_N	0.510	0.10
182_R	669_E	0.510	0.10
577_A	621_A	0.510	0.10
91_H	347_D	0.510	0.10
180_A	225_Q	0.510	0.10
36_D	607_G	0.508	0.10
167_S	481_F	0.507	0.10
105_G	146_F	0.507	0.10
272_L	277_E	0.505	0.10
47_L	238_V	0.504	0.10
122_S	319_E	0.504	0.10
18_A	646_D	0.504	0.10
258_Q	289_F	0.503	0.10
552_A	560_A	0.502	0.10
44_H	50_M	0.502	0.10
28_W	547_M	0.502	0.10
214_D	654_V	0.502	0.10
132_F	357_F	0.501	0.09
514_E	518_E	0.501	0.09
72_D	148_W	0.501	0.09
501_I	573_T	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1g8pA	1	0.4628	99.5	0.933	Contact Map
2r44A	1	0.4423	99.4	0.938	Contact Map
4ww4B	2	0.5591	99.3	0.941	Contact Map
2c9oA	3	0.4496	99.2	0.944	Contact Map
1in4A	1	0.4292	99.1	0.945	Contact Map
1hqcA	1	0.4423	99.1	0.945	Contact Map
3pxiA	3	0.4263	99.1	0.945	Contact Map
3k1jA	4	0.654	99.1	0.946	Contact Map
1g41A	3	0.4234	99.1	0.946	Contact Map
4r7yA	3	0.4891	99.1	0.947	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0155 seconds.