Q9HRC1 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HRC1 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HRC1	Sequences: MRTVGVVVNPIAGMGGRVGLKGTDGNVAEARKRGADQRAPQRARTALDALRDAAGDVSVVTYDEPMGGGVAAAAGFTPTVVGHPTTPASTAADTRAAVEAFIDHGVDVILFVGGDGTATDVATAVTAHDASVPVLGVPAGVKVYSAVFAVQPAAAGRVAATFEDTTTREVSDIDEGAYRDGEVQTTLRGVVATPVTEGADALQPAKQAYAGTTGALAAGVADSVRDGVTYVLGPGGTLAEIADALGVSGSPLGVDVYRDGALVVRDGSASEITAALGTDNVVYVSPIGGQGFVFGRGNDQISPAIIDRSEVRVVASPQKLDQTGVLRVDTGSEDTDASLRGWQRVRTGRFEKRLVNVV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	358 (351)
Sequences:	337 (257)
Seq/√Len:	13.7

HALSA - Q9HRC1
SULSO - Q97ZM3

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
29_E	33_R	5.444	1.00
200_D	203_Q	4.079	1.00
203_Q	206_K	4.020	1.00
256_V	267_G	4.001	1.00
14_M	23_T	3.972	1.00
59_V	71_A	3.711	0.99
241_I	314_V	3.576	0.99
149_A	155_A	3.540	0.99
264_V	267_G	3.459	0.99
294_F	330_T	3.241	0.98
284_V	294_F	3.232	0.98
95_R	120_D	3.101	0.98
294_F	306_I	2.893	0.96
256_V	275_A	2.892	0.96
68_G	72_A	2.872	0.96
71_A	76_F	2.844	0.96
46_A	156_G	2.838	0.96
242_A	249_G	2.782	0.95
307_D	335_T	2.727	0.95
45_T	153_A	2.718	0.95
313_V	343_Q	2.678	0.94
58_S	79_T	2.660	0.94
7_V	98_V	2.591	0.93
11_I	23_T	2.573	0.93
134_V	191_V	2.493	0.92
6_V	43_A	2.492	0.92
232_L	238_L	2.436	0.91
328_V	357_V	2.395	0.90
62_Y	82_G	2.387	0.90
18_V	35_A	2.376	0.90
273_T	304_A	2.346	0.89
169_E	187_L	2.328	0.89
269_A	302_S	2.310	0.88
231_V	272_I	2.303	0.88
44_R	73_A	2.283	0.88
3_T	58_S	2.247	0.87
269_A	305_I	2.229	0.87
112_V	137_V	2.190	0.85
62_Y	97_A	2.190	0.85
232_L	242_A	2.189	0.85
106_V	109_I	2.178	0.85
18_V	33_R	2.146	0.84
227_G	259_D	2.094	0.83
294_F	311_V	2.090	0.83
151_Q	327_R	2.085	0.82
122_A	189_G	2.069	0.82
335_T	338_S	2.053	0.81
256_V	272_I	1.943	0.78
229_T	256_V	1.926	0.77
68_G	80_V	1.881	0.75
331_G	336_D	1.842	0.74
231_V	267_G	1.813	0.72
11_I	14_M	1.807	0.72
171_S	187_L	1.794	0.72
71_A	78_P	1.780	0.71
169_E	209_Y	1.740	0.69
11_I	27_V	1.729	0.69
143_V	148_F	1.715	0.68
108_V	159_A	1.710	0.68
268_S	271_E	1.709	0.68
7_V	121_V	1.703	0.67
231_V	256_V	1.701	0.67
307_D	332_S	1.699	0.67
306_I	339_L	1.676	0.66
74_A	78_P	1.672	0.66
64_E	108_V	1.668	0.66
269_A	304_A	1.655	0.65
98_V	121_V	1.643	0.65
30_A	34_G	1.642	0.65
102_I	124_A	1.641	0.64
256_V	264_V	1.626	0.64
317_P	351_E	1.613	0.63
143_V	156_G	1.608	0.63
8_V	70_V	1.598	0.62
14_M	27_V	1.572	0.61
8_V	76_F	1.568	0.61
171_S	354_L	1.562	0.60
62_Y	66_M	1.554	0.60
124_A	191_V	1.515	0.58
44_R	74_A	1.508	0.58
98_V	126_T	1.505	0.58
18_V	23_T	1.489	0.57
29_E	32_K	1.481	0.56
229_T	267_G	1.470	0.56
19_G	268_S	1.464	0.55
219_G	346_R	1.440	0.54
200_D	206_K	1.430	0.54
342_W	356_N	1.411	0.53
196_T	285_S	1.408	0.52
219_G	350_F	1.380	0.51
171_S	185_T	1.378	0.51
92_A	96_A	1.359	0.50
231_V	301_I	1.356	0.50
181_G	329_D	1.343	0.49
63_D	82_G	1.336	0.49
50_L	137_V	1.336	0.49
109_I	132_V	1.334	0.48
110_L	159_A	1.330	0.48
276_L	305_I	1.321	0.48
151_Q	220_V	1.309	0.47
158_V	193_T	1.279	0.45
14_M	18_V	1.277	0.45
63_D	84_P	1.273	0.45
43_A	137_V	1.252	0.44
303_P	332_S	1.250	0.44
294_F	339_L	1.235	0.43
178_Y	292_F	1.225	0.43
303_P	336_D	1.220	0.42
111_F	118_A	1.219	0.42
89_S	102_I	1.218	0.42
70_V	74_A	1.215	0.42
14_M	17_R	1.212	0.42
20_L	25_G	1.209	0.42
18_V	37_Q	1.201	0.41
101_F	109_I	1.200	0.41
281_V	310_E	1.191	0.41
25_G	34_G	1.183	0.40
112_V	146_A	1.182	0.40
112_V	286_P	1.181	0.40
19_G	301_I	1.176	0.40
100_A	103_D	1.173	0.40
57_V	76_F	1.169	0.40
224_V	257_Y	1.155	0.39
307_D	338_S	1.153	0.39
229_T	258_R	1.151	0.39
148_F	292_F	1.143	0.38
59_V	306_I	1.139	0.38
188_R	257_Y	1.137	0.38
283_Y	314_V	1.132	0.38
17_R	42_R	1.129	0.38
98_V	125_V	1.128	0.38
167_T	320_L	1.120	0.37
6_V	137_V	1.119	0.37
151_Q	238_L	1.118	0.37
103_D	313_V	1.114	0.37
119_T	188_R	1.109	0.37
20_L	35_A	1.108	0.37
18_V	34_G	1.106	0.37
29_E	120_D	1.105	0.36
272_I	276_L	1.094	0.36
98_V	101_F	1.083	0.35
191_V	327_R	1.078	0.35
96_A	103_D	1.077	0.35
178_Y	234_P	1.071	0.35
18_V	30_A	1.064	0.34
25_G	302_S	1.055	0.34
44_R	70_V	1.039	0.33
217_A	245_L	1.037	0.33
342_W	354_L	1.031	0.33
266_D	300_Q	1.029	0.33
220_V	283_Y	1.016	0.32
232_L	283_Y	1.011	0.32
121_V	134_V	1.010	0.32
178_Y	285_S	1.010	0.32
327_R	355_V	1.006	0.32
154_A	205_A	1.005	0.32
23_T	27_V	1.003	0.32
248_S	265_R	1.001	0.31
8_V	74_A	1.000	0.31
276_L	293_V	0.987	0.31
89_S	316_S	0.985	0.31
3_T	308_R	0.983	0.31
59_V	339_L	0.981	0.31
19_G	112_V	0.979	0.30
166_T	195_V	0.978	0.30
69_G	100_A	0.977	0.30
134_V	170_V	0.962	0.30
20_L	34_G	0.960	0.30
176_G	180_D	0.954	0.29
156_G	196_T	0.948	0.29
311_V	354_L	0.944	0.29
325_V	355_V	0.944	0.29
23_T	162_F	0.939	0.29
3_T	195_V	0.938	0.29
125_V	189_G	0.938	0.29
234_P	301_I	0.936	0.29
306_I	328_V	0.932	0.28
137_V	238_L	0.931	0.28
187_L	190_V	0.931	0.28
72_A	78_P	0.912	0.27
51_R	54_A	0.912	0.27
96_A	100_A	0.912	0.27
228_V	281_V	0.906	0.27
222_D	354_L	0.902	0.27
25_G	30_A	0.901	0.27
272_I	336_D	0.898	0.27
236_G	248_S	0.891	0.27
19_G	234_P	0.889	0.27
141_V	234_P	0.886	0.26
38_R	42_R	0.883	0.26
181_G	348_G	0.882	0.26
282_V	301_I	0.878	0.26
332_S	336_D	0.878	0.26
43_A	112_V	0.877	0.26
51_R	74_A	0.876	0.26
52_D	76_F	0.874	0.26
98_V	320_L	0.873	0.26
342_W	357_V	0.873	0.26
66_M	97_A	0.871	0.26
46_A	143_V	0.871	0.26
303_P	335_T	0.870	0.26
207_Q	211_G	0.869	0.26
40_P	70_V	0.868	0.26
4_V	59_V	0.867	0.26
293_V	313_V	0.867	0.26
186_T	337_A	0.865	0.26
304_A	308_R	0.860	0.25
91_A	95_R	0.858	0.25
305_I	330_T	0.857	0.25
165_T	284_V	0.857	0.25
224_V	230_Y	0.855	0.25
216_L	221_A	0.853	0.25
82_G	149_A	0.853	0.25
282_V	285_S	0.848	0.25
46_A	110_L	0.844	0.25
291_G	326_L	0.844	0.25
347_T	353_R	0.842	0.25
23_T	35_A	0.836	0.24
135_L	313_V	0.835	0.24
103_D	334_D	0.835	0.24
109_I	259_D	0.831	0.24
28_A	49_A	0.830	0.24
69_G	73_A	0.827	0.24
307_D	315_A	0.822	0.24
249_G	286_P	0.820	0.24
27_V	90_T	0.819	0.24
277_G	308_R	0.818	0.24
344_R	356_N	0.809	0.23
84_P	89_S	0.808	0.23
6_V	208_A	0.805	0.23
100_A	104_H	0.797	0.23
185_T	272_I	0.796	0.23
4_V	58_S	0.795	0.23
109_I	133_P	0.790	0.23
330_T	339_L	0.789	0.23
12_A	15_G	0.781	0.22
225_R	259_D	0.780	0.22
156_G	347_T	0.779	0.22
120_D	293_V	0.776	0.22
231_V	282_V	0.774	0.22
213_T	286_P	0.774	0.22
234_P	268_S	0.773	0.22
121_V	218_A	0.771	0.22
242_A	247_V	0.766	0.22
99_E	131_S	0.765	0.22
287_I	329_D	0.762	0.22
95_R	123_T	0.761	0.22
10_P	15_G	0.758	0.21
10_P	13_G	0.758	0.21
236_G	285_S	0.755	0.21
52_D	57_V	0.753	0.21
306_I	335_T	0.751	0.21
272_I	275_A	0.748	0.21
156_G	185_T	0.748	0.21
8_V	40_P	0.747	0.21
221_A	224_V	0.747	0.21
224_V	316_S	0.745	0.21
80_V	312_R	0.743	0.21
27_V	45_T	0.738	0.21
254_V	339_L	0.737	0.21
178_Y	351_E	0.735	0.21
146_A	213_T	0.735	0.21
232_L	269_A	0.732	0.20
23_T	249_G	0.732	0.20
207_Q	317_P	0.729	0.20
192_A	331_G	0.728	0.20
211_G	215_A	0.726	0.20
170_V	316_S	0.725	0.20
121_V	159_A	0.725	0.20
46_A	139_A	0.724	0.20
130_A	257_Y	0.723	0.20
119_T	299_D	0.722	0.20
14_M	37_Q	0.718	0.20
120_D	282_V	0.716	0.20
207_Q	215_A	0.715	0.20
42_R	120_D	0.711	0.20
177_A	184_Q	0.711	0.20
77_T	186_T	0.710	0.20
234_P	238_L	0.708	0.20
100_A	275_A	0.708	0.20
6_V	101_F	0.705	0.20
109_I	277_G	0.702	0.19
63_D	81_V	0.701	0.19
30_A	35_A	0.701	0.19
14_M	141_V	0.700	0.19
253_G	266_D	0.700	0.19
234_P	249_G	0.696	0.19
112_V	289_G	0.695	0.19
51_R	301_I	0.693	0.19
144_Y	290_Q	0.692	0.19
62_Y	81_V	0.692	0.19
163_E	262_L	0.692	0.19
14_M	35_A	0.691	0.19
259_D	301_I	0.690	0.19
141_V	328_V	0.689	0.19
216_L	224_V	0.689	0.19
94_T	345_V	0.687	0.19
11_I	313_V	0.685	0.19
89_S	274_A	0.685	0.19
219_G	250_S	0.684	0.19
9_N	13_G	0.682	0.19
9_N	15_G	0.682	0.19
157_R	241_I	0.679	0.19
14_M	356_N	0.678	0.19
194_P	266_D	0.677	0.19
206_K	327_R	0.676	0.19
194_P	348_G	0.676	0.19
23_T	195_V	0.676	0.19
188_R	224_V	0.675	0.19
173_I	178_Y	0.675	0.19
6_V	71_A	0.672	0.18
279_D	344_R	0.671	0.18
5_G	9_N	0.668	0.18
79_T	220_V	0.667	0.18
47_L	181_G	0.666	0.18
139_A	143_V	0.666	0.18
77_T	223_S	0.665	0.18
28_A	307_D	0.665	0.18
149_A	267_G	0.664	0.18
270_S	274_A	0.663	0.18
293_V	312_R	0.660	0.18
259_D	345_V	0.659	0.18
65_P	69_G	0.659	0.18
238_L	339_L	0.659	0.18
46_A	159_A	0.654	0.18
257_Y	316_S	0.654	0.18
53_A	169_E	0.654	0.18
3_T	40_P	0.653	0.18
222_D	349_R	0.653	0.18
216_L	222_D	0.653	0.18
281_V	312_R	0.653	0.18
158_V	170_V	0.651	0.18
112_V	185_T	0.646	0.18
341_G	347_T	0.644	0.18
150_V	202_L	0.644	0.18
238_L	283_Y	0.641	0.17
42_R	329_D	0.640	0.17
158_V	322_Q	0.638	0.17
196_T	249_G	0.637	0.17
121_V	125_V	0.637	0.17
9_N	12_A	0.636	0.17
158_V	190_V	0.636	0.17
226_D	334_D	0.635	0.17
66_M	290_Q	0.634	0.17
14_M	34_G	0.634	0.17
6_V	289_G	0.634	0.17
31_R	131_S	0.631	0.17
229_T	278_T	0.631	0.17
90_T	333_E	0.629	0.17
344_R	352_K	0.629	0.17
267_G	273_T	0.629	0.17
38_R	41_Q	0.628	0.17
267_G	305_I	0.626	0.17
32_K	248_S	0.626	0.17
7_V	350_F	0.625	0.17
120_D	267_G	0.625	0.17
175_E	179_R	0.623	0.17
195_V	320_L	0.622	0.17
270_S	335_T	0.621	0.17
264_V	271_E	0.621	0.17
303_P	307_D	0.620	0.17
214_G	269_A	0.619	0.17
285_S	315_A	0.617	0.17
144_Y	335_T	0.617	0.17
227_G	261_A	0.617	0.17
311_V	339_L	0.615	0.17
20_L	302_S	0.614	0.17
343_Q	357_V	0.614	0.17
59_V	269_A	0.614	0.17
200_D	205_A	0.612	0.17
112_V	156_G	0.609	0.17
326_L	348_G	0.608	0.16
285_S	323_T	0.606	0.16
31_R	88_A	0.605	0.16
119_T	171_S	0.604	0.16
3_T	240_E	0.604	0.16
256_V	285_S	0.603	0.16
60_V	81_V	0.602	0.16
53_A	226_D	0.602	0.16
250_S	316_S	0.602	0.16
148_F	191_V	0.602	0.16
281_V	346_R	0.601	0.16
11_I	356_N	0.601	0.16
276_L	308_R	0.600	0.16
162_F	330_T	0.600	0.16
126_T	137_V	0.598	0.16
14_M	88_A	0.598	0.16
301_I	351_E	0.597	0.16
28_A	59_V	0.596	0.16
54_A	109_I	0.596	0.16
173_I	301_I	0.596	0.16
285_S	292_F	0.596	0.16
63_D	121_V	0.595	0.16
247_V	257_Y	0.594	0.16
330_T	336_D	0.592	0.16
59_V	130_A	0.589	0.16
60_V	65_P	0.589	0.16
229_T	279_D	0.589	0.16
131_S	334_D	0.588	0.16
50_L	343_Q	0.587	0.16
197_E	294_F	0.586	0.16
159_A	186_T	0.585	0.16
37_Q	65_P	0.585	0.16
231_V	342_W	0.582	0.16
31_R	134_V	0.580	0.16
256_V	336_D	0.578	0.16
62_Y	313_V	0.577	0.16
151_Q	177_A	0.577	0.16
171_S	311_V	0.576	0.16
229_T	277_G	0.575	0.16
269_A	273_T	0.573	0.15
229_T	264_V	0.573	0.15
18_V	27_V	0.572	0.15
120_D	123_T	0.570	0.15
94_T	141_V	0.570	0.15
7_V	81_V	0.569	0.15
143_V	183_V	0.569	0.15
6_V	213_T	0.568	0.15
156_G	299_D	0.568	0.15
224_V	232_L	0.567	0.15
287_I	293_V	0.567	0.15
144_Y	200_D	0.566	0.15
209_Y	258_R	0.565	0.15
169_E	190_V	0.564	0.15
194_P	253_G	0.563	0.15
60_V	104_H	0.563	0.15
99_E	223_S	0.562	0.15
72_A	131_S	0.561	0.15
32_K	158_V	0.560	0.15
234_P	286_P	0.560	0.15
231_V	309_S	0.560	0.15
13_G	22_G	0.560	0.15
15_G	22_G	0.560	0.15
207_Q	212_T	0.559	0.15
89_S	265_R	0.559	0.15
330_T	341_G	0.559	0.15
105_G	139_A	0.558	0.15
154_A	269_A	0.558	0.15
193_T	271_E	0.556	0.15
192_A	328_V	0.556	0.15
57_V	149_A	0.556	0.15
209_Y	349_R	0.555	0.15
299_D	331_G	0.553	0.15
97_A	105_G	0.553	0.15
264_V	315_A	0.553	0.15
307_D	357_V	0.549	0.15
292_F	351_E	0.548	0.15
125_V	135_L	0.548	0.15
224_V	259_D	0.548	0.15
121_V	271_E	0.547	0.15
105_G	220_V	0.547	0.15
60_V	105_G	0.545	0.15
59_V	78_P	0.545	0.15
210_A	231_V	0.544	0.15
109_I	263_V	0.543	0.15
238_L	327_R	0.542	0.15
201_A	206_K	0.541	0.15
102_I	307_D	0.539	0.15
171_S	197_E	0.539	0.15
148_F	249_G	0.539	0.15
158_V	186_T	0.539	0.15
6_V	62_Y	0.537	0.14
3_T	60_V	0.537	0.14
183_V	289_G	0.537	0.14
232_L	286_P	0.537	0.14
281_V	285_S	0.536	0.14
312_R	346_R	0.536	0.14
109_I	189_G	0.535	0.14
178_Y	323_T	0.534	0.14
103_D	241_I	0.533	0.14
301_I	335_T	0.533	0.14
141_V	198_G	0.532	0.14
119_T	186_T	0.531	0.14
293_V	308_R	0.531	0.14
224_V	262_L	0.531	0.14
280_N	309_S	0.529	0.14
101_F	289_G	0.528	0.14
157_R	355_V	0.528	0.14
170_V	289_G	0.526	0.14
165_T	314_V	0.525	0.14
293_V	330_T	0.525	0.14
323_T	341_G	0.525	0.14
208_A	213_T	0.523	0.14
99_E	226_D	0.523	0.14
268_S	306_I	0.523	0.14
284_V	330_T	0.523	0.14
16_G	19_G	0.523	0.14
8_V	130_A	0.523	0.14
221_A	241_I	0.523	0.14
183_V	355_V	0.522	0.14
221_A	230_Y	0.522	0.14
38_R	292_F	0.521	0.14
97_A	157_R	0.520	0.14
23_T	190_V	0.520	0.14
130_A	191_V	0.519	0.14
80_V	354_L	0.519	0.14
91_A	218_A	0.519	0.14
156_G	183_V	0.517	0.14
157_R	206_K	0.517	0.14
143_V	159_A	0.517	0.14
50_L	220_V	0.517	0.14
12_A	22_G	0.516	0.14
346_R	349_R	0.516	0.14
173_I	242_A	0.515	0.14
253_G	302_S	0.514	0.14
7_V	101_F	0.513	0.14
151_Q	267_G	0.512	0.14
61_T	225_R	0.510	0.14
157_R	169_E	0.510	0.14
144_Y	251_P	0.510	0.14
79_T	103_D	0.509	0.14
27_V	91_A	0.508	0.14
148_F	232_L	0.507	0.14
230_Y	337_A	0.507	0.14
51_R	72_A	0.506	0.14
303_P	338_S	0.506	0.14
8_V	357_V	0.504	0.14
31_R	226_D	0.502	0.14
146_A	190_V	0.502	0.14
148_F	325_V	0.501	0.14
10_P	22_G	0.501	0.14
223_S	230_Y	0.501	0.14
326_L	329_D	0.500	0.14
135_L	292_F	0.500	0.14
23_T	207_Q	0.500	0.14
273_T	305_I	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qv7A	2	0.6788	98.9	0.922	Contact Map
4werA	2	0.6955	98.7	0.927	Contact Map
3s40A	3	0.6955	98.5	0.933	Contact Map
2an1A	4	0.6788	98.5	0.933	Contact Map
1u0tA	4	0.6313	98.3	0.937	Contact Map
1yt5A	4	0.648	98.2	0.937	Contact Map
1z0sA	4	0.6369	98.2	0.938	Contact Map
2bonA	1	0.6508	98	0.941	Contact Map
2i2cA	3	0.6201	97.6	0.947	Contact Map
4v24A	1	0.7626	96.8	0.953	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0099 seconds.