Q9HRB0 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HRB0 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HRB0	Sequences: MTDATVGDEAAAPTVVRLDASCTTQEVEAGEYYHATVNGVVEYGAFVDLSEHVSGLIHESTYSGDPDLAVDDDVIVHLSAVRDNGDLSFEFVDPEEYRTEQRSHAYERTTADAVGSRIGDTVHIEGEVVQIKQTAGPTVFRVRDETSAIPCTAFEDAGVRAHPGVEVGDIVHVSGDADDREGTTQLEVDAFEVLSGGDSADVARRLDAALAEQADPVDVDALVDWPALEQLLPDLRSVARTLRRAVLEGRPIRMRHHADGDGMCASLPVQYALRQFIEDTHQDEDAARHLLKRLPSKAPYYEMEDATRDLNFALEDRARHGQKLPLLLMLDNGSTEEDTPAYKTLDNYDIPIVVVDHHHPDPGAVDPLVDEHVNPYLHGEDYRITTGMLCVELARMIYPGITSDLEHVPAVAGLSDRSKADAMTDYLDLARDAGYDESFLQQMSEALDYEAYMLRYDHGTQVIADILNVDGDAQRHRELVPFLDRLASEAVAEQLDATRSHVEHERVASGANLYRIDVENHAHRFTYPRAGENNRRDPRPQGRGNRGAGDHHRLRPGLRGAPVGRRAPGHPHDGRRTQRRTPWGRRLRRRPPGRRLDPVRSRDA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	604 (566)
Sequences:	144 (104)
Seq/√Len:	4.3

HALSA - Q9HRB0 Q9HPR2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
254_M	291_L	5.469	0.97
584_G	587_L	4.820	0.94
165_V	193_V	4.624	0.93
145_E	443_M	4.023	0.86
238_V	371_E	3.566	0.78
499_R	537_D	3.522	0.77
516_I	537_D	3.205	0.70
124_I	223_V	2.978	0.64
310_L	455_R	2.847	0.60
72_D	246_V	2.832	0.60
246_V	540_P	2.689	0.56
182_G	197_G	2.657	0.55
146_T	492_A	2.629	0.54
263_M	451_A	2.581	0.52
199_S	455_R	2.560	0.52
113_A	427_L	2.533	0.51
128_V	173_V	2.525	0.51
125_E	205_R	2.450	0.48
316_D	519_E	2.439	0.48
265_A	355_V	2.432	0.48
142_V	462_V	2.419	0.47
124_I	197_G	2.401	0.47
145_E	156_D	2.380	0.46
42_E	139_V	2.362	0.46
129_V	291_L	2.346	0.45
165_V	438_S	2.315	0.44
35_A	329_M	2.300	0.44
49_L	316_D	2.269	0.43
308_R	450_E	2.267	0.43
122_V	516_I	2.263	0.43
78_L	86_D	2.247	0.42
316_D	518_V	2.242	0.42
180_R	323_K	2.229	0.42
49_L	519_E	2.206	0.41
498_T	537_D	2.143	0.39
176_D	285_D	2.099	0.38
131_I	139_V	2.068	0.37
78_L	89_F	2.061	0.37
438_S	587_L	2.042	0.36
427_L	503_E	2.028	0.36
39_G	84_N	1.997	0.35
267_L	474_Q	1.997	0.35
555_R	594_R	1.977	0.35
34_H	99_T	1.950	0.34
306_A	343_K	1.946	0.34
180_R	529_R	1.941	0.34
302_E	385_T	1.939	0.34
278_E	287_A	1.910	0.33
48_D	320_H	1.908	0.33
57_I	186_L	1.904	0.33
13_P	31_E	1.895	0.32
241_T	353_V	1.875	0.32
567_A	581_T	1.870	0.32
245_A	516_I	1.869	0.32
538_P	555_R	1.865	0.32
128_V	323_K	1.849	0.31
41_V	86_D	1.825	0.31
424_T	428_D	1.824	0.30
575_R	578_Q	1.823	0.30
228_L	389_L	1.809	0.30
315_E	385_T	1.805	0.30
75_I	460_T	1.797	0.30
358_H	374_N	1.797	0.30
168_G	315_E	1.795	0.30
236_R	587_L	1.783	0.29
213_Q	431_R	1.775	0.29
386_T	393_L	1.773	0.29
86_D	89_F	1.747	0.29
509_S	518_V	1.747	0.29
113_A	142_V	1.715	0.28
111_A	217_V	1.707	0.28
337_E	375_P	1.705	0.28
276_F	291_L	1.705	0.28
238_V	379_G	1.705	0.28
242_L	273_L	1.703	0.27
331_D	385_T	1.702	0.27
156_D	291_L	1.697	0.27
184_T	252_I	1.693	0.27
168_G	400_G	1.692	0.27
20_A	521_H	1.682	0.27
170_I	229_E	1.662	0.27
35_A	87_L	1.657	0.26
348_Y	465_D	1.657	0.26
162_H	516_I	1.643	0.26
180_R	316_D	1.638	0.26
226_P	349_D	1.630	0.26
151_C	462_V	1.623	0.26
135_A	156_D	1.620	0.26
300_Y	500_S	1.618	0.25
319_R	537_D	1.612	0.25
307_T	465_D	1.610	0.25
269_V	509_S	1.600	0.25
139_V	164_G	1.599	0.25
170_I	400_G	1.599	0.25
34_H	73_D	1.597	0.25
367_P	400_G	1.594	0.25
169_D	324_L	1.593	0.25
220_D	474_Q	1.592	0.25
39_G	86_D	1.591	0.25
321_G	466_I	1.590	0.25
298_A	592_P	1.587	0.25
128_V	215_D	1.578	0.25
385_T	393_L	1.576	0.25
186_L	207_D	1.572	0.24
165_V	317_R	1.571	0.24
208_A	492_A	1.568	0.24
264_C	376_Y	1.567	0.24
318_A	498_T	1.562	0.24
173_V	215_D	1.560	0.24
567_A	578_Q	1.559	0.24
250_R	430_A	1.558	0.24
82_R	290_L	1.555	0.24
299_P	555_R	1.548	0.24
186_L	343_K	1.547	0.24
509_S	519_E	1.543	0.24
269_V	328_L	1.543	0.24
350_I	458_H	1.542	0.24
42_E	496_D	1.541	0.24
570_H	575_R	1.541	0.24
27_V	71_D	1.532	0.24
27_V	45_A	1.513	0.23
147_S	213_Q	1.506	0.23
159_V	244_R	1.505	0.23
205_R	209_A	1.495	0.23
80_A	87_L	1.487	0.23
180_R	499_R	1.477	0.22
168_G	503_E	1.475	0.22
425_D	502_V	1.469	0.22
246_V	405_L	1.466	0.22
233_P	240_R	1.466	0.22
157_A	465_D	1.453	0.22
299_P	387_G	1.422	0.21
253_R	412_A	1.408	0.21
564_G	594_R	1.406	0.21
28_E	312_F	1.404	0.21
298_A	387_G	1.400	0.21
318_A	470_D	1.398	0.21
302_E	376_Y	1.397	0.21
81_V	176_D	1.389	0.21
283_D	376_Y	1.383	0.20
127_E	168_G	1.368	0.20
463_I	498_T	1.367	0.20
299_P	302_E	1.366	0.20
574_G	580_R	1.364	0.20
209_A	265_A	1.364	0.20
130_Q	552_H	1.362	0.20
74_V	88_S	1.358	0.20
88_S	245_A	1.355	0.20
302_E	357_H	1.355	0.20
112_D	170_I	1.348	0.20
337_E	374_N	1.345	0.20
182_G	244_R	1.344	0.20
341_A	440_L	1.343	0.20
24_T	27_V	1.340	0.20
252_I	313_A	1.333	0.20
292_K	308_R	1.333	0.20
574_G	578_Q	1.329	0.19
564_G	592_P	1.328	0.19
81_V	93_D	1.327	0.19
570_H	573_D	1.319	0.19
16_V	61_T	1.310	0.19
180_R	238_V	1.309	0.19
35_A	303_M	1.304	0.19
148_A	180_R	1.300	0.19
165_V	477_R	1.297	0.19
427_L	484_D	1.296	0.19
509_S	516_I	1.285	0.19
131_I	355_V	1.284	0.19
316_D	521_H	1.282	0.19
583_W	586_R	1.280	0.19
298_A	591_P	1.280	0.19
74_V	131_I	1.277	0.18
555_R	592_P	1.276	0.18
71_D	289_H	1.270	0.18
128_V	142_V	1.264	0.18
570_H	578_Q	1.264	0.18
151_C	199_S	1.261	0.18
353_V	521_H	1.256	0.18
302_E	358_H	1.255	0.18
43_Y	86_D	1.252	0.18
164_G	196_G	1.252	0.18
253_R	281_H	1.249	0.18
322_Q	533_N	1.248	0.18
165_V	192_E	1.247	0.18
176_D	460_T	1.246	0.18
220_D	370_D	1.245	0.18
334_S	593_G	1.245	0.18
43_Y	542_G	1.243	0.18
379_G	445_E	1.242	0.18
305_D	358_H	1.241	0.18
102_R	124_I	1.241	0.18
299_P	594_R	1.239	0.18
268_P	408_V	1.239	0.18
58_H	85_G	1.231	0.18
374_N	387_G	1.223	0.17
151_C	217_V	1.221	0.17
357_H	594_R	1.221	0.17
257_H	416_D	1.219	0.17
197_G	222_L	1.211	0.17
245_A	347_N	1.210	0.17
143_R	151_C	1.207	0.17
299_P	476_H	1.206	0.17
349_D	364_A	1.204	0.17
276_F	401_I	1.200	0.17
38_N	54_S	1.200	0.17
28_E	31_E	1.200	0.17
74_V	79_S	1.197	0.17
572_H	575_R	1.195	0.17
112_D	124_I	1.193	0.17
119_G	434_G	1.193	0.17
324_L	452_Y	1.191	0.17
387_G	594_R	1.186	0.17
176_D	501_H	1.185	0.17
106_Y	164_G	1.184	0.17
165_V	213_Q	1.184	0.17
176_D	273_L	1.180	0.17
47_V	588_R	1.179	0.17
355_V	393_L	1.173	0.17
245_A	326_L	1.172	0.17
235_L	393_L	1.167	0.17
264_C	455_R	1.166	0.17
269_V	355_V	1.163	0.16
412_A	501_H	1.163	0.16
91_F	94_P	1.160	0.16
215_D	236_R	1.156	0.16
274_R	486_L	1.155	0.16
357_H	387_G	1.155	0.16
122_V	171_V	1.153	0.16
264_C	310_L	1.149	0.16
331_D	555_R	1.148	0.16
30_G	80_A	1.148	0.16
332_N	372_H	1.143	0.16
169_D	172_H	1.140	0.16
139_V	155_E	1.138	0.16
560_G	564_G	1.136	0.16
308_R	357_H	1.135	0.16
354_V	369_V	1.133	0.16
142_V	217_V	1.131	0.16
124_I	450_E	1.131	0.16
463_I	474_Q	1.131	0.16
530_A	591_P	1.129	0.16
430_A	542_G	1.120	0.16
223_V	481_P	1.118	0.16
332_N	357_H	1.115	0.16
124_I	303_M	1.114	0.16
515_R	544_G	1.114	0.16
392_E	594_R	1.113	0.16
111_A	462_V	1.111	0.16
149_I	411_V	1.111	0.16
473_A	477_R	1.105	0.16
156_D	523_H	1.104	0.16
538_P	559_R	1.101	0.15
381_D	559_R	1.098	0.15
43_Y	89_F	1.096	0.15
399_P	447_L	1.094	0.15
355_V	406_E	1.094	0.15
31_E	74_V	1.091	0.15
349_D	429_L	1.090	0.15
129_V	247_L	1.085	0.15
302_E	332_N	1.085	0.15
114_V	159_V	1.083	0.15
106_Y	452_Y	1.080	0.15
550_D	567_A	1.080	0.15
411_V	554_L	1.077	0.15
374_N	525_F	1.076	0.15
23_T	78_L	1.075	0.15
277_I	350_I	1.074	0.15
265_A	524_R	1.071	0.15
519_E	537_D	1.064	0.15
288_R	408_V	1.063	0.15
574_G	581_T	1.060	0.15
149_I	429_L	1.060	0.15
110_T	279_D	1.055	0.15
302_E	518_V	1.054	0.15
518_V	537_D	1.050	0.15
360_P	372_H	1.049	0.15
195_S	247_L	1.047	0.15
464_A	470_D	1.046	0.15
161_A	410_A	1.042	0.15
118_I	411_V	1.040	0.15
321_G	559_R	1.039	0.15
411_V	537_D	1.037	0.14
57_I	77_H	1.036	0.14
71_D	182_G	1.035	0.14
78_L	88_S	1.035	0.14
87_L	277_I	1.034	0.14
412_A	500_S	1.031	0.14
199_S	329_M	1.030	0.14
358_H	392_E	1.029	0.14
559_R	591_P	1.027	0.14
213_Q	300_Y	1.027	0.14
429_L	480_V	1.026	0.14
307_T	409_P	1.024	0.14
358_H	531_G	1.022	0.14
245_A	509_S	1.021	0.14
210_L	452_Y	1.018	0.14
23_T	263_M	1.017	0.14
82_R	87_L	1.016	0.14
316_D	353_V	1.015	0.14
82_R	458_H	1.015	0.14
28_E	164_G	1.006	0.14
229_E	507_V	1.005	0.14
186_L	492_A	1.003	0.14
57_I	91_F	1.001	0.14
61_T	306_A	0.999	0.14
413_G	501_H	0.999	0.14
257_H	331_D	0.998	0.14
111_A	228_L	0.996	0.14
416_D	591_P	0.995	0.14
161_A	251_P	0.994	0.14
199_S	350_I	0.993	0.14
167_V	197_G	0.993	0.14
157_A	307_T	0.993	0.14
45_A	230_Q	0.992	0.14
382_Y	413_G	0.991	0.14
53_V	81_V	0.989	0.14
27_V	400_G	0.989	0.14
360_P	374_N	0.988	0.14
20_A	28_E	0.986	0.14
37_V	58_H	0.984	0.14
26_E	71_D	0.983	0.14
180_R	254_M	0.983	0.14
111_A	142_V	0.982	0.14
50_S	462_V	0.980	0.14
361_D	446_A	0.980	0.14
277_I	443_M	0.969	0.13
105_A	147_S	0.967	0.13
180_R	487_A	0.964	0.13
357_H	372_H	0.964	0.13
123_H	164_G	0.963	0.13
355_V	511_A	0.962	0.13
193_V	328_L	0.956	0.13
518_V	521_H	0.953	0.13
257_H	357_H	0.952	0.13
198_D	278_E	0.952	0.13
535_R	594_R	0.952	0.13
304_E	376_Y	0.948	0.13
173_V	497_A	0.946	0.13
77_H	88_S	0.946	0.13
253_R	351_P	0.945	0.13
354_V	468_N	0.944	0.13
221_A	244_R	0.944	0.13
353_V	371_E	0.944	0.13
204_R	208_A	0.943	0.13
257_H	299_P	0.941	0.13
329_M	555_R	0.940	0.13
49_L	518_V	0.939	0.13
20_A	455_R	0.939	0.13
342_Y	388_M	0.936	0.13
278_E	496_D	0.934	0.13
43_Y	78_L	0.934	0.13
98_R	246_V	0.932	0.13
302_E	495_L	0.931	0.13
192_E	432_D	0.922	0.13
366_D	587_L	0.922	0.13
34_H	75_I	0.922	0.13
39_G	58_H	0.921	0.13
565_R	570_H	0.919	0.13
557_G	567_A	0.917	0.13
324_L	445_E	0.913	0.13
69_A	200_A	0.912	0.13
28_E	350_I	0.908	0.13
448_D	459_G	0.906	0.13
257_H	385_T	0.905	0.13
193_V	406_E	0.904	0.13
80_A	458_H	0.902	0.13
292_K	299_P	0.901	0.13
251_P	465_D	0.901	0.13
145_E	408_V	0.896	0.12
173_V	367_P	0.895	0.12
131_I	589_R	0.895	0.12
257_H	560_G	0.894	0.12
58_H	84_N	0.894	0.12
148_A	168_G	0.886	0.12
74_V	94_P	0.885	0.12
360_P	525_F	0.881	0.12
392_E	530_A	0.881	0.12
90_E	146_T	0.880	0.12
265_A	303_M	0.880	0.12
227_A	534_N	0.879	0.12
249_G	529_R	0.879	0.12
570_H	574_G	0.879	0.12
128_V	365_V	0.879	0.12
100_E	190_A	0.877	0.12
406_E	433_A	0.876	0.12
147_S	589_R	0.875	0.12
151_C	438_S	0.874	0.12
351_P	364_A	0.874	0.12
378_H	386_T	0.873	0.12
197_G	351_P	0.872	0.12
591_P	594_R	0.869	0.12
237_S	452_Y	0.865	0.12
430_A	498_T	0.863	0.12
266_S	590_R	0.862	0.12
36_T	170_I	0.862	0.12
252_I	273_L	0.862	0.12
257_H	360_P	0.861	0.12
146_T	403_S	0.861	0.12
68_L	91_F	0.860	0.12
337_E	566_R	0.859	0.12
35_A	414_L	0.859	0.12
27_V	460_T	0.857	0.12
306_A	344_T	0.857	0.12
119_G	276_F	0.857	0.12
82_R	188_V	0.856	0.12
269_V	429_L	0.854	0.12
259_D	395_R	0.853	0.12
310_L	416_D	0.850	0.12
174_S	269_V	0.849	0.12
205_R	474_Q	0.848	0.12
106_Y	210_L	0.846	0.12
16_V	532_E	0.845	0.12
204_R	217_V	0.845	0.12
151_C	492_A	0.842	0.12
268_P	288_R	0.842	0.12
332_N	360_P	0.842	0.12
562_P	592_P	0.841	0.12
37_V	69_A	0.840	0.12
146_T	168_G	0.839	0.12
177_A	233_P	0.838	0.12
410_A	557_G	0.838	0.12
253_R	386_T	0.833	0.12
509_S	521_H	0.832	0.12
58_H	446_A	0.831	0.12
53_V	93_D	0.831	0.12
188_V	404_D	0.830	0.12
493_E	525_F	0.827	0.12
124_I	464_A	0.826	0.12
259_D	591_P	0.825	0.12
577_T	580_R	0.825	0.12
27_V	189_D	0.823	0.12
374_N	564_G	0.823	0.12
75_I	472_D	0.823	0.12
240_R	328_L	0.820	0.12
569_G	578_Q	0.820	0.12
129_V	233_P	0.818	0.12
230_Q	551_H	0.817	0.11
525_F	555_R	0.815	0.11
535_R	539_R	0.815	0.11
82_R	460_T	0.815	0.11
46_F	55_G	0.814	0.11
33_Y	44_G	0.814	0.11
33_Y	55_G	0.814	0.11
33_Y	46_F	0.814	0.11
44_G	56_L	0.814	0.11
33_Y	56_L	0.814	0.11
44_G	55_G	0.814	0.11
46_F	56_L	0.814	0.11
358_H	372_H	0.813	0.11
241_T	493_E	0.811	0.11
560_G	592_P	0.811	0.11
180_R	346_D	0.811	0.11
228_L	587_L	0.810	0.11
302_E	305_D	0.809	0.11
310_L	327_L	0.807	0.11
86_D	253_R	0.807	0.11
151_C	164_G	0.805	0.11
432_D	543_R	0.802	0.11
194_L	202_V	0.802	0.11
110_T	403_S	0.799	0.11
116_S	204_R	0.799	0.11
75_I	92_V	0.798	0.11
170_I	424_T	0.798	0.11
297_K	533_N	0.797	0.11
204_R	244_R	0.797	0.11
297_K	305_D	0.796	0.11
542_G	568_P	0.796	0.11
372_H	592_P	0.795	0.11
297_K	322_Q	0.792	0.11
299_P	316_D	0.791	0.11
27_V	75_I	0.790	0.11
277_I	431_R	0.789	0.11
62_Y	135_A	0.787	0.11
529_R	536_R	0.787	0.11
173_V	516_I	0.783	0.11
113_A	505_E	0.779	0.11
208_A	404_D	0.777	0.11
120_D	254_M	0.776	0.11
135_A	558_L	0.775	0.11
330_L	565_R	0.775	0.11
225_W	235_L	0.775	0.11
100_E	461_Q	0.774	0.11
567_A	575_R	0.773	0.11
257_H	591_P	0.771	0.11
530_A	564_G	0.771	0.11
389_L	415_S	0.769	0.11
152_T	254_M	0.769	0.11
82_R	267_L	0.769	0.11
299_P	357_H	0.769	0.11
298_A	332_N	0.768	0.11
298_A	531_G	0.767	0.11
195_S	502_V	0.764	0.11
257_H	372_H	0.764	0.11
109_T	128_V	0.763	0.11
372_H	564_G	0.763	0.11
110_T	196_G	0.762	0.11
291_L	445_E	0.761	0.11
184_T	278_E	0.761	0.11
535_R	591_P	0.761	0.11
182_G	442_Q	0.758	0.11
518_V	522_A	0.754	0.11
257_H	374_N	0.752	0.11
180_R	536_R	0.752	0.11
538_P	591_P	0.749	0.11
128_V	366_D	0.747	0.11
530_A	592_P	0.744	0.11
298_A	507_V	0.743	0.11
61_T	585_R	0.743	0.11
357_H	591_P	0.743	0.11
567_A	574_G	0.741	0.11
131_I	321_G	0.740	0.11
127_E	521_H	0.739	0.11
278_E	321_G	0.737	0.11
199_S	229_E	0.736	0.11
210_L	441_Q	0.735	0.11
35_A	263_M	0.735	0.11
162_H	314_L	0.733	0.10
209_A	523_H	0.731	0.10
146_T	479_L	0.730	0.10
217_V	587_L	0.729	0.10
298_A	372_H	0.729	0.10
220_D	584_G	0.727	0.10
100_E	193_V	0.726	0.10
555_R	593_G	0.725	0.10
261_D	369_V	0.725	0.10
54_S	487_A	0.725	0.10
483_L	494_Q	0.724	0.10
164_G	318_A	0.724	0.10
266_S	308_R	0.723	0.10
237_S	321_G	0.722	0.10
559_R	564_G	0.721	0.10
270_Q	527_Y	0.721	0.10
540_P	586_R	0.719	0.10
208_A	481_P	0.719	0.10
221_A	235_L	0.718	0.10
570_H	581_T	0.718	0.10
405_L	525_F	0.716	0.10
434_G	445_E	0.715	0.10
411_V	465_D	0.714	0.10
374_N	560_G	0.714	0.10
178_D	331_D	0.714	0.10
245_A	328_L	0.711	0.10
575_R	580_R	0.711	0.10
539_R	591_P	0.711	0.10
169_D	221_A	0.708	0.10
465_D	486_L	0.705	0.10
233_P	525_F	0.703	0.10
126_G	341_A	0.701	0.10
159_V	430_A	0.701	0.10
156_D	254_M	0.700	0.10
349_D	514_Y	0.699	0.10
27_V	92_V	0.699	0.10
139_V	278_E	0.698	0.10
40_V	70_V	0.697	0.10
358_H	376_Y	0.696	0.10
111_A	519_E	0.696	0.10
68_L	495_L	0.695	0.10
114_V	147_S	0.694	0.10
27_V	285_D	0.694	0.10
387_G	555_R	0.693	0.10
321_G	416_D	0.693	0.10
63_S	149_I	0.693	0.10
470_D	521_H	0.692	0.10
497_A	529_R	0.691	0.10
270_Q	274_R	0.690	0.10
118_I	493_E	0.690	0.10
233_P	282_Q	0.688	0.10
83_D	177_A	0.685	0.10
357_H	525_F	0.682	0.10
281_H	451_A	0.681	0.10
331_D	358_H	0.681	0.10
308_R	413_G	0.681	0.10
298_A	576_R	0.681	0.10
324_L	377_L	0.680	0.10
483_L	592_P	0.680	0.10
27_V	168_G	0.680	0.10
227_A	456_Y	0.680	0.10
253_R	378_H	0.679	0.10
502_V	579_R	0.678	0.10
392_E	531_G	0.677	0.10
64_G	168_G	0.676	0.10
257_H	531_G	0.676	0.10
371_E	502_V	0.675	0.10
217_V	492_A	0.675	0.10
339_T	556_P	0.673	0.10
570_H	580_R	0.673	0.10
358_H	591_P	0.673	0.10
268_P	329_M	0.673	0.10
315_E	440_L	0.672	0.10
245_A	389_L	0.670	0.10
121_T	400_G	0.670	0.10
499_R	518_V	0.667	0.10
167_V	220_D	0.667	0.10
342_Y	593_G	0.666	0.10
178_D	191_F	0.663	0.10
147_S	355_V	0.660	0.10
342_Y	352_I	0.659	0.10
355_V	550_D	0.658	0.10
180_R	485_R	0.656	0.10
357_H	392_E	0.655	0.10
166_E	204_R	0.655	0.10
173_V	523_H	0.654	0.10
223_V	391_V	0.654	0.10
530_A	560_G	0.653	0.10
202_V	245_A	0.653	0.10
290_L	390_C	0.653	0.10
225_W	327_L	0.652	0.10
133_Q	465_D	0.652	0.10
165_V	186_L	0.652	0.10
38_N	48_D	0.651	0.10
278_E	402_T	0.651	0.10
252_I	355_V	0.651	0.10
45_A	149_I	0.651	0.10
268_P	275_Q	0.650	0.10
318_A	502_V	0.650	0.10
562_P	591_P	0.649	0.10
189_D	379_G	0.648	0.10
69_A	210_L	0.648	0.10
474_Q	493_E	0.646	0.10
199_S	393_L	0.645	0.10
357_H	526_T	0.644	0.10
199_S	565_R	0.644	0.10
164_G	427_L	0.643	0.10
379_G	504_H	0.643	0.10
345_L	456_Y	0.643	0.10
157_A	371_E	0.643	0.10
387_G	567_A	0.642	0.10
74_V	306_A	0.642	0.10
59_E	281_H	0.641	0.09
295_P	348_Y	0.641	0.09
181_E	444_S	0.640	0.09
88_S	565_R	0.639	0.09
397_I	535_R	0.638	0.09
515_R	527_Y	0.638	0.09
304_E	455_R	0.637	0.09
27_V	61_T	0.636	0.09
269_V	330_L	0.636	0.09
507_V	591_P	0.635	0.09
34_H	49_L	0.635	0.09
530_A	539_R	0.635	0.09
31_E	88_S	0.635	0.09
250_R	451_A	0.634	0.09
191_F	485_R	0.634	0.09
290_L	515_R	0.634	0.09
112_D	226_P	0.633	0.09
535_R	592_P	0.632	0.09
198_D	404_D	0.631	0.09
159_V	319_R	0.631	0.09
127_E	523_H	0.631	0.09
358_H	564_G	0.630	0.09
146_T	198_D	0.630	0.09
303_M	518_V	0.628	0.09
294_L	345_L	0.627	0.09
233_P	452_Y	0.627	0.09
388_M	571_P	0.627	0.09
331_D	593_G	0.627	0.09
31_E	89_F	0.625	0.09
217_V	277_I	0.625	0.09
48_D	159_V	0.624	0.09
395_R	581_T	0.624	0.09
176_D	523_H	0.624	0.09
331_D	552_H	0.623	0.09
190_A	279_D	0.620	0.09
228_L	245_A	0.620	0.09
80_A	355_V	0.619	0.09
359_H	388_M	0.618	0.09
489_E	542_G	0.618	0.09
78_L	311_N	0.618	0.09
412_A	529_R	0.617	0.09
337_E	381_D	0.617	0.09
185_Q	373_V	0.617	0.09
186_L	406_E	0.616	0.09
374_N	392_E	0.615	0.09
168_G	201_D	0.615	0.09
36_T	240_R	0.615	0.09
350_I	536_R	0.614	0.09
357_H	374_N	0.614	0.09
247_L	477_R	0.613	0.09
278_E	401_I	0.609	0.09
330_L	342_Y	0.609	0.09
54_S	445_E	0.608	0.09
89_F	260_G	0.608	0.09
259_D	480_V	0.607	0.09
180_R	282_Q	0.606	0.09
173_V	184_T	0.605	0.09
575_R	581_T	0.605	0.09
133_Q	295_P	0.602	0.09
132_K	536_R	0.600	0.09
170_I	443_M	0.600	0.09
268_P	274_R	0.599	0.09
13_P	34_H	0.599	0.09
103_S	108_R	0.599	0.09
231_L	519_E	0.598	0.09
298_A	357_H	0.598	0.09
376_Y	412_A	0.597	0.09
297_K	302_E	0.597	0.09
279_D	287_A	0.597	0.09
257_H	358_H	0.597	0.09
560_G	594_R	0.596	0.09
460_T	498_T	0.596	0.09
87_L	402_T	0.595	0.09
231_L	299_P	0.591	0.09
156_D	273_L	0.589	0.09
292_K	555_R	0.588	0.09
302_E	509_S	0.588	0.09
13_P	464_A	0.588	0.09
458_H	461_Q	0.587	0.09
75_I	200_A	0.584	0.09
207_D	406_E	0.584	0.09
355_V	585_R	0.583	0.09
380_E	456_Y	0.582	0.09
525_F	535_R	0.582	0.09
304_E	310_L	0.582	0.09
402_T	540_P	0.582	0.09
210_L	473_A	0.581	0.09
32_Y	473_A	0.580	0.09
242_L	275_Q	0.580	0.09
45_A	201_D	0.579	0.09
510_G	566_R	0.579	0.09
539_R	562_P	0.579	0.09
289_H	456_Y	0.579	0.09
349_D	384_I	0.578	0.09
83_D	279_D	0.576	0.09
463_I	493_E	0.574	0.09
530_A	535_R	0.573	0.09
331_D	564_G	0.572	0.09
530_A	581_T	0.572	0.09
448_D	533_N	0.572	0.09
260_G	555_R	0.571	0.09
51_E	83_D	0.569	0.09
79_S	198_D	0.569	0.09
43_Y	377_L	0.568	0.09
234_D	496_D	0.568	0.09
327_L	555_R	0.568	0.09
525_F	594_R	0.568	0.09
100_E	424_T	0.567	0.09
36_T	217_V	0.567	0.09
539_R	594_R	0.567	0.09
48_D	58_H	0.567	0.09
339_T	518_V	0.566	0.09
322_Q	448_D	0.566	0.09
190_A	323_K	0.565	0.09
125_E	465_D	0.565	0.09
18_L	22_C	0.564	0.09
557_G	566_R	0.563	0.09
230_Q	458_H	0.562	0.09
267_L	562_P	0.562	0.09
168_G	180_R	0.562	0.09
114_V	234_D	0.561	0.09
205_R	446_A	0.561	0.09
369_V	507_V	0.560	0.09
273_L	384_I	0.560	0.09
180_R	210_L	0.559	0.09
358_H	530_A	0.558	0.09
195_S	492_A	0.558	0.09
266_S	536_R	0.558	0.09
302_E	316_D	0.557	0.09
269_V	433_A	0.555	0.09
40_V	440_L	0.554	0.09
41_V	58_H	0.553	0.09
146_T	243_R	0.553	0.09
350_I	554_L	0.552	0.09
374_N	555_R	0.552	0.09
555_R	564_G	0.552	0.09
372_H	531_G	0.551	0.09
305_D	592_P	0.551	0.09
166_E	504_H	0.550	0.09
331_D	416_D	0.549	0.09
489_E	529_R	0.548	0.09
178_D	456_Y	0.546	0.09
275_Q	290_L	0.545	0.09
162_H	165_V	0.545	0.09
298_A	562_P	0.545	0.09
210_L	246_V	0.544	0.09
91_F	95_E	0.544	0.09
28_E	61_T	0.544	0.09
41_V	383_R	0.543	0.09
73_D	516_I	0.543	0.09
24_T	61_T	0.543	0.09
374_N	591_P	0.542	0.09
61_T	67_D	0.540	0.08
292_K	457_D	0.540	0.08
165_V	191_F	0.540	0.08
127_E	388_M	0.538	0.08
283_D	513_L	0.538	0.08
90_E	493_E	0.537	0.08
34_H	81_V	0.536	0.08
446_A	581_T	0.535	0.08
369_V	460_T	0.534	0.08
530_A	594_R	0.534	0.08
504_H	514_Y	0.533	0.08
365_V	510_G	0.533	0.08
126_G	286_A	0.533	0.08
145_E	198_D	0.531	0.08
58_H	410_A	0.531	0.08
166_E	199_S	0.531	0.08
125_E	303_M	0.530	0.08
343_K	502_V	0.530	0.08
202_V	458_H	0.529	0.08
129_V	474_Q	0.528	0.08
145_E	267_L	0.528	0.08
427_L	555_R	0.526	0.08
302_E	555_R	0.526	0.08
287_A	355_V	0.526	0.08
263_M	280_T	0.525	0.08
492_A	510_G	0.525	0.08
130_Q	298_A	0.525	0.08
41_V	382_Y	0.525	0.08
41_V	89_F	0.525	0.08
355_V	387_G	0.524	0.08
525_F	592_P	0.523	0.08
299_P	332_N	0.523	0.08
436_D	582_P	0.523	0.08
182_G	369_V	0.523	0.08
308_R	385_T	0.522	0.08
131_I	476_H	0.522	0.08
238_V	340_P	0.522	0.08
411_V	553_R	0.521	0.08
565_R	588_R	0.520	0.08
197_G	442_Q	0.520	0.08
347_N	354_V	0.520	0.08
569_G	575_R	0.519	0.08
257_H	298_A	0.518	0.08
371_E	470_D	0.517	0.08
388_M	413_G	0.517	0.08
369_V	567_A	0.516	0.08
340_P	487_A	0.514	0.08
132_K	487_A	0.513	0.08
298_A	331_D	0.512	0.08
533_N	542_G	0.512	0.08
357_H	560_G	0.512	0.08
244_R	431_R	0.512	0.08
307_T	463_I	0.511	0.08
531_G	592_P	0.511	0.08
500_S	523_H	0.510	0.08
311_N	454_L	0.509	0.08
180_R	581_T	0.506	0.08
39_G	410_A	0.506	0.08
75_I	576_R	0.505	0.08
326_L	498_T	0.504	0.08
13_P	40_V	0.503	0.08
388_M	453_M	0.503	0.08
310_L	376_Y	0.503	0.08
229_E	337_E	0.502	0.08
498_T	516_I	0.501	0.08
532_E	562_P	0.501	0.08
198_D	389_L	0.501	0.08
40_V	364_A	0.501	0.08
387_G	392_E	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zxrA	1	0.543	99.8	0.931	Contact Map
2a19A	1	0.245	99.6	0.941	Contact Map
4nbqA	3	0.1424	99.3	0.95	Contact Map
1e3pA	3	0.0795	99.3	0.95	Contact Map
3cdiA	3	0	99.3	0.951	Contact Map
4aidA	3	0.005	99.2	0.952	Contact Map
4toiA	2	0.1225	99.2	0.953	Contact Map
2eqsA	1	0.154	99.2	0.953	Contact Map
4py9A	2	0.5	99.1	0.953	Contact Map
2khiA	1	0.1424	99.1	0.953	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0143 seconds.