Q9HR88 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HR88 - Htr18 transducer

UniProt:	Q9HR88	Sequences: MLVLVGVGVFTTQAVSTQVTEQRDTELLTSTEQEAEALEEWIGRQRSATQYLSQDNAIQSAPQADKSEVLSTRISGLTETAAALHYVNLSTDTIRASTDAAVEGDTYTSYSIPWRGEGLSFYGGGDVITSSVFNYRGTPVMAFASKQPGSDNAVFVFHSVETRGEAFSRNIDGSYTQVVDIEGTVQIAADESAISSAYGAGRDAPVIATGLTTNSGIETRDGLLVGHAKVEGTDWVLLKHAPTSNAYALEGDVQRNIVVLIVTAVAGLGALVLVIGRDALTALTDMSDRAEAIAAGDIDTAIEETTRIDEVGDLRRSFRDIQEYLQTVAGQADALAEQDFDADALDKSVPGRLGESLETMHWDLETAIADLEDAQETAEQSRKEAEQSREEAEALAAALESQAQDIRETVEHAADGDLTQRLETDTDHESMAAIATALNSLLEELEGTIHRIQRFSKDVAESSDHITTSAEEVKRASGQVSESVQEMSADARQQNGIVQDVSDEMTDLSATIEEIASSSDEVAAKSNDAVSVGQSGRARSQDAIEEMNAVDEQAKRTIAEMEALDDEMTEIGEIVTLIDDIAEQTSMLALNASIEAARAGEAGEGFAVVADEIKSLSKETTEATQEIESLIADVQDSTTDAVTDMQEMGDRLSEGKSTVTDTVETIDTIVERIEEANGGVQTINTATDEQATTTEEVVTMVDEVGSISDDTTARAEDAAAAAEEQTASLTEVTNRIQDLSDQSTDLYELLSDFTVREDHAVADGGAENTTGAFVRSASTDHSRDATHHDT	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	790 (700)
Sequences:	269 (245)
Seq/√Len:	9.3

BACSU - TLPB MCPC TLPA
HALSA - Q9HR88 Q9HRA1 HTR4 HTR2 COST Q9HP10 Q9HRN6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
307_R	312_G	4.993	1.00
591_N	609_V	4.726	1.00
361_H	372_E	4.329	0.99
379_E	382_R	4.238	0.99
385_A	389_R	4.216	0.99
416_G	439_N	3.781	0.98
361_H	365_E	3.111	0.93
597_A	613_I	3.030	0.92
586_S	591_N	3.009	0.91
515_I	519_S	2.814	0.88
389_R	393_E	2.803	0.88
365_E	371_L	2.793	0.88
586_S	609_V	2.763	0.87
578_I	612_E	2.761	0.87
603_G	607_A	2.760	0.87
397_A	406_I	2.728	0.86
686_A	697_V	2.659	0.85
385_A	392_A	2.631	0.84
582_A	690_Q	2.585	0.83
82_A	157_F	2.560	0.83
378_A	382_R	2.526	0.82
529_A	687_T	2.511	0.81
359_T	363_D	2.508	0.81
603_G	609_V	2.501	0.81
361_H	371_L	2.474	0.80
614_K	725_Q	2.440	0.79
393_E	397_A	2.429	0.79
416_G	421_R	2.429	0.79
554_A	620_T	2.417	0.79
574_I	631_I	2.392	0.78
604_E	698_V	2.365	0.77
377_T	381_S	2.339	0.76
421_R	439_N	2.339	0.76
382_R	385_A	2.305	0.75
129_T	188_A	2.267	0.74
376_E	379_E	2.256	0.73
599_A	603_G	2.226	0.72
515_I	705_G	2.225	0.72
365_E	368_I	2.200	0.72
422_L	435_A	2.183	0.71
523_A	581_I	2.129	0.69
345_L	350_P	2.127	0.69
356_S	365_E	2.110	0.68
356_S	359_T	2.109	0.68
583_E	594_I	2.106	0.68
356_S	361_H	2.105	0.68
533_G	581_I	2.102	0.68
276_G	280_L	2.090	0.67
607_A	655_G	2.079	0.67
512_I	515_I	2.060	0.66
533_G	619_E	2.057	0.66
437_A	441_L	2.054	0.66
48_A	81_A	2.038	0.65
373_D	379_E	2.022	0.65
363_D	369_A	1.995	0.64
312_G	530_V	1.995	0.64
429_E	581_I	1.986	0.63
593_S	715_A	1.984	0.63
602_A	696_E	1.939	0.61
526_S	618_K	1.928	0.61
592_A	609_V	1.917	0.60
574_I	655_G	1.915	0.60
399_L	697_V	1.915	0.60
631_I	655_G	1.912	0.60
363_D	372_E	1.911	0.60
487_M	631_I	1.910	0.60
600_G	623_A	1.897	0.60
494_Q	564_L	1.893	0.59
690_Q	709_D	1.893	0.59
580_D	591_N	1.893	0.59
429_E	533_G	1.890	0.59
582_A	607_A	1.890	0.59
393_E	396_A	1.876	0.59
595_E	605_G	1.873	0.59
501_V	583_E	1.868	0.58
386_E	393_E	1.864	0.58
490_D	529_A	1.863	0.58
376_E	382_R	1.855	0.58
376_E	381_S	1.849	0.57
557_T	666_I	1.842	0.57
379_E	385_A	1.831	0.57
374_A	377_T	1.827	0.57
361_H	367_A	1.825	0.56
568_M	658_T	1.823	0.56
403_A	429_E	1.816	0.56
359_T	372_E	1.815	0.56
156_V	531_S	1.809	0.56
599_A	610_A	1.796	0.55
501_V	715_A	1.789	0.55
321_I	325_L	1.786	0.55
344_A	349_V	1.783	0.55
564_L	594_I	1.777	0.54
382_R	386_E	1.763	0.54
81_A	91_T	1.759	0.54
732_V	739_L	1.749	0.53
504_E	536_G	1.746	0.53
367_A	372_E	1.744	0.53
399_L	491_A	1.740	0.53
508_L	711_T	1.740	0.53
608_V	655_G	1.736	0.53
381_S	385_A	1.735	0.52
346_D	350_P	1.728	0.52
704_V	715_A	1.708	0.51
550_V	715_A	1.703	0.51
386_E	389_R	1.696	0.51
547_M	634_V	1.695	0.51
377_T	385_A	1.694	0.51
550_V	704_V	1.693	0.51
525_K	708_S	1.692	0.51
597_A	607_A	1.670	0.50
519_S	561_M	1.669	0.50
550_V	583_E	1.662	0.49
574_I	594_I	1.653	0.49
301_A	322_Q	1.652	0.49
583_E	598_R	1.649	0.49
399_L	575_V	1.634	0.48
410_V	441_L	1.633	0.48
501_V	550_V	1.632	0.48
600_G	603_G	1.624	0.48
614_K	739_L	1.621	0.47
599_A	623_A	1.618	0.47
235_W	247_Y	1.599	0.47
365_E	372_E	1.588	0.46
505_M	512_I	1.585	0.46
360_M	372_E	1.564	0.45
177_Q	279_A	1.557	0.45
536_G	583_E	1.553	0.44
590_L	614_K	1.553	0.44
515_I	594_I	1.553	0.44
160_V	176_T	1.552	0.44
597_A	608_V	1.547	0.44
438_L	441_L	1.546	0.44
375_Q	382_R	1.546	0.44
375_Q	378_A	1.545	0.44
547_M	561_M	1.545	0.44
596_A	606_F	1.544	0.44
412_H	581_I	1.541	0.44
185_V	325_L	1.534	0.44
396_A	400_E	1.534	0.44
373_D	382_R	1.534	0.44
149_G	275_I	1.529	0.43
578_I	655_G	1.522	0.43
550_V	694_T	1.519	0.43
684_N	725_Q	1.516	0.43
356_S	360_M	1.516	0.43
50_Q	53_S	1.515	0.43
23_R	31_T	1.514	0.43
623_A	655_G	1.511	0.43
346_D	349_V	1.505	0.42
400_E	406_I	1.500	0.42
126_D	147_Q	1.495	0.42
600_G	620_T	1.488	0.42
714_R	725_Q	1.482	0.41
576_T	684_N	1.480	0.41
356_S	371_L	1.475	0.41
375_Q	383_K	1.474	0.41
581_I	591_N	1.474	0.41
611_D	715_A	1.473	0.41
379_E	386_E	1.469	0.41
95_R	153_A	1.461	0.41
373_D	376_E	1.458	0.40
438_L	581_I	1.455	0.40
152_N	246_A	1.447	0.40
31_T	74_I	1.444	0.40
722_A	725_Q	1.440	0.40
504_E	614_K	1.435	0.39
139_P	235_W	1.434	0.39
81_A	157_F	1.433	0.39
583_E	590_L	1.430	0.39
413_A	441_L	1.425	0.39
275_I	399_L	1.422	0.39
573_E	729_L	1.420	0.39
505_M	715_A	1.419	0.39
360_M	365_E	1.418	0.39
342_A	346_D	1.416	0.39
711_T	714_R	1.416	0.39
391_E	575_V	1.414	0.39
578_I	605_G	1.411	0.38
400_E	407_R	1.409	0.38
666_I	680_V	1.408	0.38
578_I	595_E	1.408	0.38
53_S	518_S	1.401	0.38
595_E	623_A	1.398	0.38
97_S	102_V	1.395	0.38
553_Q	649_G	1.390	0.38
590_L	725_Q	1.387	0.37
368_I	371_L	1.386	0.37
560_E	624_T	1.386	0.37
509_S	614_K	1.386	0.37
375_Q	385_A	1.380	0.37
498_V	628_E	1.379	0.37
504_E	715_A	1.370	0.37
590_L	689_E	1.369	0.37
603_G	655_G	1.365	0.37
38_L	248_A	1.361	0.36
413_A	442_L	1.356	0.36
493_Q	716_E	1.349	0.36
606_F	610_A	1.345	0.36
554_A	663_V	1.345	0.36
12_T	84_L	1.343	0.36
564_L	634_V	1.339	0.35
605_G	612_E	1.339	0.35
339_D	342_A	1.336	0.35
586_S	595_E	1.327	0.35
421_R	605_G	1.324	0.35
504_E	658_T	1.317	0.35
41_W	48_A	1.316	0.35
342_A	345_L	1.316	0.35
373_D	378_A	1.311	0.34
418_L	449_I	1.309	0.34
590_L	597_A	1.306	0.34
377_T	382_R	1.304	0.34
550_V	593_S	1.302	0.34
397_A	400_E	1.301	0.34
599_A	607_A	1.297	0.34
568_M	690_Q	1.290	0.34
550_V	663_V	1.287	0.33
344_A	350_P	1.287	0.33
342_A	360_M	1.281	0.33
519_S	564_L	1.280	0.33
697_V	719_A	1.280	0.33
441_L	691_A	1.277	0.33
612_E	623_A	1.275	0.33
515_I	711_T	1.274	0.33
567_E	623_A	1.269	0.33
311_V	524_A	1.265	0.33
607_A	612_E	1.262	0.32
346_D	353_L	1.258	0.32
564_L	694_T	1.258	0.32
497_I	714_R	1.257	0.32
282_A	312_G	1.254	0.32
418_L	442_L	1.245	0.32
375_Q	386_E	1.244	0.32
446_E	449_I	1.243	0.32
442_L	573_E	1.242	0.32
526_S	614_K	1.236	0.31
546_E	593_S	1.234	0.31
287_S	298_I	1.230	0.31
571_I	595_E	1.228	0.31
583_E	715_A	1.228	0.31
583_E	614_K	1.227	0.31
700_M	725_Q	1.224	0.31
605_G	623_A	1.224	0.31
550_V	614_K	1.221	0.31
389_R	392_A	1.211	0.30
344_A	351_G	1.209	0.30
2_L	71_S	1.208	0.30
385_A	391_E	1.207	0.30
494_Q	575_V	1.206	0.30
581_I	609_V	1.205	0.30
585_T	607_A	1.204	0.30
529_A	676_A	1.204	0.30
663_V	708_S	1.201	0.30
605_G	655_G	1.201	0.30
87_V	93_T	1.196	0.30
375_Q	381_S	1.195	0.30
380_Q	388_S	1.180	0.29
604_E	618_K	1.175	0.29
568_M	594_I	1.174	0.29
501_V	564_L	1.174	0.29
410_V	435_A	1.172	0.29
725_Q	738_D	1.172	0.29
512_I	574_I	1.172	0.29
494_Q	711_T	1.171	0.29
429_E	625_Q	1.171	0.29
118_G	152_N	1.169	0.29
564_L	693_T	1.167	0.29
136_R	292_A	1.167	0.29
45_Q	81_A	1.167	0.29
373_D	380_Q	1.165	0.29
693_T	708_S	1.164	0.29
594_I	705_G	1.164	0.29
581_I	619_E	1.163	0.29
174_S	237_L	1.161	0.29
539_R	575_V	1.160	0.29
550_V	725_Q	1.160	0.29
533_G	625_Q	1.159	0.29
434_I	528_D	1.157	0.28
582_A	599_A	1.156	0.28
594_I	694_T	1.153	0.28
595_E	612_E	1.153	0.28
429_E	437_A	1.147	0.28
497_I	694_T	1.147	0.28
504_E	568_M	1.146	0.28
417_D	697_V	1.146	0.28
494_Q	594_I	1.145	0.28
519_S	525_K	1.144	0.28
564_L	583_E	1.144	0.28
417_D	439_N	1.142	0.28
515_I	708_S	1.141	0.28
587_M	597_A	1.141	0.28
581_I	722_A	1.140	0.28
276_G	279_A	1.135	0.28
301_A	319_R	1.133	0.28
419_T	435_A	1.131	0.28
364_L	371_L	1.130	0.28
494_Q	519_S	1.130	0.28
504_E	583_E	1.130	0.28
571_I	605_G	1.128	0.27
434_I	459_V	1.126	0.27
526_S	630_L	1.123	0.27
522_V	547_M	1.120	0.27
369_A	372_E	1.117	0.27
594_I	655_G	1.115	0.27
480_V	694_T	1.114	0.27
38_L	146_K	1.112	0.27
182_E	267_G	1.108	0.27
550_V	625_Q	1.108	0.27
365_E	370_D	1.107	0.27
609_V	619_E	1.104	0.27
86_Y	154_V	1.098	0.26
574_I	721_A	1.096	0.26
180_D	239_K	1.095	0.26
377_T	383_K	1.095	0.26
561_M	631_I	1.095	0.26
705_G	711_T	1.093	0.26
595_E	600_G	1.088	0.26
501_V	663_V	1.085	0.26
594_I	604_E	1.084	0.26
578_I	609_V	1.084	0.26
385_A	395_L	1.078	0.26
290_A	318_F	1.078	0.26
605_G	690_Q	1.074	0.26
438_L	459_V	1.073	0.26
261_I	318_F	1.069	0.25
420_Q	684_N	1.068	0.25
477_S	715_A	1.066	0.25
98_T	104_G	1.063	0.25
631_I	676_A	1.063	0.25
302_I	720_A	1.061	0.25
376_E	386_E	1.054	0.25
418_L	431_M	1.053	0.25
312_G	414_A	1.052	0.25
434_I	719_A	1.051	0.25
574_I	676_A	1.050	0.25
75_S	165_E	1.048	0.25
356_S	372_E	1.047	0.25
666_I	690_Q	1.046	0.25
345_L	349_V	1.045	0.25
23_R	249_L	1.043	0.25
560_E	663_V	1.042	0.25
498_V	704_V	1.041	0.25
45_Q	48_A	1.040	0.24
259_V	320_D	1.039	0.24
537_R	684_N	1.038	0.24
188_A	414_A	1.036	0.24
56_N	72_T	1.034	0.24
700_M	708_S	1.034	0.24
554_A	614_K	1.032	0.24
298_I	326_Q	1.032	0.24
286_M	302_I	1.032	0.24
557_T	679_G	1.031	0.24
278_D	286_M	1.030	0.24
268_L	283_L	1.030	0.24
577_L	624_T	1.029	0.24
341_D	345_L	1.028	0.24
494_Q	508_L	1.028	0.24
614_K	663_V	1.026	0.24
147_Q	680_V	1.023	0.24
519_S	694_T	1.022	0.24
508_L	634_V	1.021	0.24
605_G	609_V	1.015	0.24
604_E	613_I	1.014	0.24
383_K	386_E	1.013	0.24
487_M	511_T	1.013	0.24
675_E	717_D	1.012	0.24
379_E	383_K	1.008	0.23
566_D	574_I	1.008	0.23
376_E	385_A	1.006	0.23
267_G	277_R	1.005	0.23
536_G	553_Q	1.004	0.23
679_G	725_Q	1.004	0.23
509_S	515_I	1.000	0.23
715_A	726_T	0.998	0.23
553_Q	574_I	0.997	0.23
590_L	608_V	0.997	0.23
612_E	655_G	0.995	0.23
85_H	90_S	0.994	0.23
594_I	611_D	0.994	0.23
559_A	565_D	0.991	0.23
583_E	705_G	0.988	0.23
494_Q	624_T	0.987	0.23
97_S	141_M	0.986	0.23
593_S	600_G	0.986	0.23
413_A	579_D	0.983	0.23
114_W	121_F	0.982	0.23
526_S	700_M	0.981	0.23
412_H	722_A	0.981	0.23
609_V	612_E	0.981	0.23
407_R	410_V	0.980	0.23
81_A	229_K	0.979	0.23
605_G	620_T	0.978	0.23
576_T	582_A	0.977	0.22
342_A	385_A	0.977	0.22
529_A	634_V	0.977	0.22
363_D	367_A	0.976	0.22
523_A	722_A	0.971	0.22
359_T	365_E	0.969	0.22
619_E	662_T	0.968	0.22
584_Q	655_G	0.967	0.22
621_T	676_A	0.967	0.22
607_A	613_I	0.967	0.22
437_A	663_V	0.967	0.22
375_Q	380_Q	0.966	0.22
603_G	608_V	0.965	0.22
424_T	718_A	0.965	0.22
703_E	708_S	0.964	0.22
567_E	651_R	0.964	0.22
519_S	594_I	0.963	0.22
512_I	714_R	0.960	0.22
336_A	489_A	0.959	0.22
388_S	393_E	0.958	0.22
504_E	594_I	0.956	0.22
553_Q	565_D	0.953	0.22
581_I	663_V	0.951	0.22
332_A	335_L	0.950	0.22
525_K	621_T	0.948	0.22
396_A	399_L	0.948	0.22
498_V	550_V	0.946	0.22
533_G	623_A	0.943	0.21
603_G	620_T	0.942	0.21
587_M	593_S	0.939	0.21
583_E	604_E	0.938	0.21
180_D	186_Q	0.937	0.21
607_A	658_T	0.936	0.21
588_L	616_L	0.934	0.21
663_V	725_Q	0.933	0.21
414_A	582_A	0.932	0.21
532_V	634_V	0.931	0.21
504_E	604_E	0.931	0.21
403_A	441_L	0.930	0.21
293_I	325_L	0.929	0.21
608_V	623_A	0.926	0.21
452_I	456_S	0.925	0.21
190_D	194_I	0.925	0.21
494_Q	634_V	0.921	0.21
618_K	714_R	0.920	0.21
399_L	662_T	0.920	0.21
606_F	616_L	0.919	0.21
700_M	714_R	0.919	0.21
508_L	547_M	0.918	0.21
449_I	553_Q	0.917	0.21
512_I	594_I	0.915	0.21
550_V	579_D	0.914	0.21
567_E	649_G	0.914	0.21
568_M	604_E	0.912	0.21
526_S	725_Q	0.910	0.20
583_E	618_K	0.910	0.20
592_A	597_A	0.910	0.20
501_V	594_I	0.906	0.20
590_L	700_M	0.906	0.20
578_I	586_S	0.905	0.20
571_I	655_G	0.904	0.20
595_E	655_G	0.902	0.20
580_D	704_V	0.901	0.20
456_S	724_E	0.900	0.20
175_Y	246_A	0.900	0.20
504_E	714_R	0.900	0.20
434_I	441_L	0.898	0.20
583_E	593_S	0.898	0.20
48_A	52_L	0.897	0.20
312_G	315_R	0.897	0.20
438_L	691_A	0.896	0.20
515_I	700_M	0.892	0.20
550_V	564_L	0.891	0.20
346_D	351_G	0.891	0.20
525_K	537_R	0.891	0.20
26_E	31_T	0.891	0.20
438_L	445_L	0.890	0.20
502_S	522_V	0.890	0.20
594_I	618_K	0.887	0.20
496_G	536_G	0.886	0.20
572_G	578_I	0.883	0.20
292_A	311_V	0.882	0.20
130_S	187_I	0.881	0.20
634_V	705_G	0.880	0.20
495_N	526_S	0.878	0.20
423_E	580_D	0.877	0.20
359_T	371_L	0.877	0.20
198_Y	207_I	0.875	0.19
414_A	662_T	0.875	0.19
456_S	539_R	0.873	0.19
590_L	600_G	0.871	0.19
590_L	630_L	0.870	0.19
614_K	700_M	0.867	0.19
120_S	264_A	0.865	0.19
137_G	153_A	0.864	0.19
501_V	614_K	0.864	0.19
164_G	283_L	0.863	0.19
587_M	741_D	0.862	0.19
525_K	701_V	0.859	0.19
571_I	584_Q	0.857	0.19
557_T	560_E	0.857	0.19
430_S	445_L	0.856	0.19
547_M	564_L	0.855	0.19
449_I	474_K	0.853	0.19
585_T	599_A	0.851	0.19
377_T	389_R	0.851	0.19
242_P	326_Q	0.848	0.19
493_Q	703_E	0.847	0.19
544_I	558_I	0.844	0.19
210_G	311_V	0.843	0.19
88_N	92_D	0.843	0.19
544_I	722_A	0.841	0.19
536_G	698_V	0.841	0.19
539_R	705_G	0.841	0.19
600_G	655_G	0.840	0.19
41_W	46_R	0.839	0.19
522_V	705_G	0.836	0.18
561_M	717_D	0.836	0.18
508_L	529_A	0.835	0.18
185_V	303_E	0.832	0.18
594_I	603_G	0.831	0.18
422_L	434_I	0.830	0.18
480_V	722_A	0.829	0.18
429_E	650_D	0.829	0.18
515_I	553_Q	0.828	0.18
512_I	705_G	0.827	0.18
343_D	346_D	0.827	0.18
571_I	690_Q	0.825	0.18
508_L	564_L	0.822	0.18
519_S	714_R	0.821	0.18
515_I	634_V	0.820	0.18
581_I	625_Q	0.820	0.18
525_K	550_V	0.820	0.18
573_E	593_S	0.819	0.18
595_E	690_Q	0.819	0.18
718_A	721_A	0.817	0.18
459_V	553_Q	0.815	0.18
374_A	381_S	0.814	0.18
561_M	601_E	0.814	0.18
579_D	590_L	0.813	0.18
275_I	668_T	0.813	0.18
387_Q	479_Q	0.812	0.18
289_R	302_I	0.811	0.18
81_A	115_R	0.810	0.18
86_Y	94_I	0.808	0.18
521_E	713_A	0.808	0.18
410_V	448_T	0.808	0.18
584_Q	594_I	0.808	0.18
487_M	665_T	0.806	0.18
708_S	711_T	0.806	0.18
277_R	280_L	0.802	0.18
492_R	623_A	0.801	0.18
584_Q	595_E	0.800	0.18
512_I	573_E	0.800	0.18
536_G	564_L	0.797	0.17
490_D	666_I	0.795	0.17
584_Q	590_L	0.794	0.17
500_D	715_A	0.793	0.17
596_A	605_G	0.793	0.17
604_E	611_D	0.792	0.17
476_A	501_V	0.792	0.17
449_I	560_E	0.791	0.17
624_T	694_T	0.791	0.17
585_T	592_A	0.791	0.17
729_L	739_L	0.790	0.17
554_A	600_G	0.790	0.17
143_F	157_F	0.789	0.17
71_S	265_V	0.789	0.17
223_L	227_H	0.788	0.17
714_R	718_A	0.787	0.17
2_L	10_F	0.786	0.17
493_Q	496_G	0.786	0.17
571_I	586_S	0.785	0.17
588_L	606_F	0.785	0.17
39_E	276_G	0.782	0.17
154_V	483_S	0.782	0.17
434_I	705_G	0.781	0.17
226_G	309_D	0.780	0.17
550_V	581_I	0.780	0.17
350_P	354_G	0.780	0.17
583_E	698_V	0.780	0.17
294_A	521_E	0.779	0.17
477_S	700_M	0.779	0.17
581_I	613_I	0.778	0.17
374_A	382_R	0.777	0.17
533_G	550_V	0.774	0.17
561_M	712_T	0.774	0.17
114_W	290_A	0.774	0.17
176_T	290_A	0.774	0.17
46_R	52_L	0.773	0.17
581_I	700_M	0.771	0.17
31_T	198_Y	0.770	0.17
536_G	594_I	0.770	0.17
434_I	438_L	0.769	0.17
159_S	237_L	0.769	0.17
487_M	676_A	0.769	0.17
677_N	691_A	0.768	0.17
557_T	594_I	0.767	0.17
418_L	456_S	0.767	0.17
515_I	627_I	0.767	0.17
666_I	712_T	0.765	0.17
52_L	226_G	0.765	0.17
360_M	363_D	0.764	0.17
550_V	594_I	0.764	0.17
494_Q	498_V	0.763	0.17
613_I	703_E	0.763	0.17
519_S	522_V	0.763	0.17
663_V	700_M	0.763	0.17
580_D	618_K	0.763	0.17
592_A	616_L	0.761	0.17
516_A	659_V	0.758	0.16
438_L	550_V	0.757	0.16
593_S	624_T	0.757	0.16
582_A	610_A	0.757	0.16
680_V	734_N	0.757	0.16
585_T	605_G	0.755	0.16
297_D	499_Q	0.755	0.16
82_A	85_H	0.753	0.16
375_Q	379_E	0.753	0.16
504_E	708_S	0.752	0.16
693_T	700_M	0.751	0.16
603_G	623_A	0.749	0.16
600_G	612_E	0.749	0.16
129_T	182_E	0.747	0.16
560_E	666_I	0.745	0.16
593_S	602_A	0.744	0.16
433_A	561_M	0.744	0.16
491_A	626_E	0.742	0.16
614_K	630_L	0.741	0.16
546_E	583_E	0.740	0.16
73_R	265_V	0.738	0.16
515_I	714_R	0.738	0.16
579_D	625_Q	0.738	0.16
396_A	402_Q	0.738	0.16
441_L	725_Q	0.737	0.16
456_S	694_T	0.736	0.16
229_K	236_V	0.736	0.16
504_E	698_V	0.736	0.16
52_L	97_S	0.735	0.16
430_S	441_L	0.733	0.16
624_T	663_V	0.733	0.16
553_Q	631_I	0.733	0.16
581_I	670_V	0.733	0.16
119_L	730_T	0.731	0.16
438_L	695_E	0.730	0.16
115_R	143_F	0.730	0.16
536_G	547_M	0.729	0.16
722_A	726_T	0.728	0.16
418_L	422_L	0.727	0.16
546_E	604_E	0.727	0.16
31_T	35_A	0.726	0.16
517_S	709_D	0.726	0.16
605_G	613_I	0.725	0.16
620_T	666_I	0.725	0.16
441_L	581_I	0.724	0.16
494_Q	721_A	0.724	0.16
497_I	539_R	0.724	0.16
557_T	656_K	0.723	0.16
501_V	625_Q	0.723	0.16
516_A	530_V	0.722	0.16
521_E	699_T	0.719	0.16
582_A	613_I	0.719	0.16
414_A	667_D	0.718	0.16
531_S	545_E	0.718	0.16
8_G	260_L	0.717	0.15
593_S	670_V	0.716	0.15
11_T	48_A	0.716	0.15
91_T	249_L	0.716	0.15
314_L	399_L	0.716	0.15
519_S	656_K	0.715	0.15
519_S	593_S	0.712	0.15
53_S	112_I	0.709	0.15
508_L	620_T	0.709	0.15
634_V	711_T	0.709	0.15
340_F	346_D	0.709	0.15
505_M	725_Q	0.707	0.15
536_G	634_V	0.707	0.15
580_D	609_V	0.707	0.15
360_M	371_L	0.706	0.15
568_M	739_L	0.704	0.15
498_V	557_T	0.704	0.15
705_G	708_S	0.702	0.15
438_L	520_D	0.701	0.15
55_D	213_T	0.701	0.15
502_S	551_D	0.700	0.15
408_E	531_S	0.699	0.15
441_L	590_L	0.699	0.15
578_I	608_V	0.699	0.15
417_D	554_A	0.697	0.15
413_A	439_N	0.697	0.15
70_L	459_V	0.697	0.15
498_V	577_L	0.697	0.15
564_L	708_S	0.697	0.15
494_Q	577_L	0.696	0.15
599_A	655_G	0.696	0.15
442_L	615_S	0.695	0.15
411_E	523_A	0.694	0.15
729_L	732_V	0.694	0.15
350_P	355_E	0.693	0.15
536_G	579_D	0.693	0.15
525_K	656_K	0.691	0.15
522_V	673_I	0.691	0.15
596_A	610_A	0.690	0.15
709_D	734_N	0.689	0.15
438_L	523_A	0.689	0.15
611_D	705_G	0.689	0.15
494_Q	550_V	0.689	0.15
500_D	714_R	0.689	0.15
508_L	515_I	0.689	0.15
571_I	612_E	0.688	0.15
136_R	143_F	0.688	0.15
177_Q	240_H	0.687	0.15
623_A	666_I	0.686	0.15
388_S	392_A	0.686	0.15
453_Q	618_K	0.686	0.15
501_V	509_S	0.686	0.15
411_E	570_E	0.684	0.15
509_S	594_I	0.684	0.15
356_S	370_D	0.683	0.15
448_T	484_V	0.682	0.15
263_T	684_N	0.681	0.15
536_G	658_T	0.679	0.15
528_D	734_N	0.679	0.15
283_L	712_T	0.679	0.15
347_K	350_P	0.678	0.15
435_A	459_V	0.678	0.15
512_I	618_K	0.676	0.15
53_S	502_S	0.676	0.15
627_I	658_T	0.676	0.15
93_T	96_A	0.673	0.14
513_E	517_S	0.672	0.14
319_R	322_Q	0.671	0.14
600_G	605_G	0.670	0.14
523_A	726_T	0.670	0.14
508_L	594_I	0.670	0.14
579_D	583_E	0.670	0.14
508_L	624_T	0.669	0.14
41_W	45_Q	0.668	0.14
82_A	86_Y	0.668	0.14
581_I	704_V	0.668	0.14
586_S	605_G	0.667	0.14
551_D	663_V	0.667	0.14
424_T	432_A	0.667	0.14
568_M	705_G	0.667	0.14
282_A	680_V	0.666	0.14
406_I	736_I	0.665	0.14
277_R	317_S	0.664	0.14
228_A	235_W	0.663	0.14
554_A	603_G	0.662	0.14
43_G	47_S	0.659	0.14
402_Q	406_I	0.658	0.14
459_V	575_V	0.657	0.14
574_I	718_A	0.657	0.14
487_M	574_I	0.656	0.14
405_D	603_G	0.656	0.14
432_A	436_T	0.655	0.14
584_Q	631_I	0.655	0.14
550_V	700_M	0.654	0.14
19_V	34_E	0.653	0.14
513_E	581_I	0.653	0.14
549_A	698_V	0.653	0.14
515_I	697_V	0.650	0.14
364_L	369_A	0.650	0.14
512_I	523_A	0.650	0.14
504_E	573_E	0.649	0.14
178_V	549_A	0.649	0.14
417_D	494_Q	0.649	0.14
536_G	709_D	0.648	0.14
705_G	736_I	0.648	0.14
523_A	618_K	0.647	0.14
295_A	699_T	0.646	0.14
560_E	718_A	0.646	0.14
97_S	145_S	0.643	0.14
312_G	721_A	0.643	0.14
324_Y	689_E	0.642	0.14
437_A	581_I	0.642	0.14
607_A	630_L	0.641	0.14
559_A	566_D	0.641	0.14
20_T	224_L	0.640	0.14
395_L	402_Q	0.640	0.14
502_S	649_G	0.638	0.14
144_A	242_P	0.637	0.14
48_A	87_V	0.635	0.14
709_D	714_R	0.635	0.14
382_R	389_R	0.634	0.14
560_E	673_I	0.634	0.14
557_T	587_M	0.632	0.14
578_I	603_G	0.632	0.14
666_I	736_I	0.632	0.14
522_V	693_T	0.631	0.14
578_I	623_A	0.630	0.14
568_M	698_V	0.630	0.14
618_K	700_M	0.629	0.14
551_D	561_M	0.629	0.14
302_I	315_R	0.627	0.14
523_A	725_Q	0.627	0.14
536_G	711_T	0.626	0.14
437_A	700_M	0.625	0.13
704_V	718_A	0.625	0.13
208_A	545_E	0.624	0.13
500_D	721_A	0.623	0.13
297_D	731_E	0.623	0.13
634_V	708_S	0.622	0.13
515_I	659_V	0.622	0.13
84_L	602_A	0.621	0.13
8_G	247_Y	0.619	0.13
704_V	714_R	0.619	0.13
442_L	580_D	0.619	0.13
547_M	550_V	0.619	0.13
55_D	59_Q	0.618	0.13
248_A	325_L	0.618	0.13
595_E	613_I	0.618	0.13
573_E	728_S	0.617	0.13
230_V	237_L	0.616	0.13
533_G	546_E	0.616	0.13
242_P	366_T	0.616	0.13
115_R	145_S	0.614	0.13
156_V	165_E	0.614	0.13
450_H	651_R	0.613	0.13
540_S	694_T	0.613	0.13
532_V	711_T	0.613	0.13
583_E	611_D	0.611	0.13
477_S	496_G	0.610	0.13
700_M	722_A	0.610	0.13
314_L	680_V	0.609	0.13
632_A	662_T	0.609	0.13
83_A	155_F	0.609	0.13
378_A	383_K	0.609	0.13
516_A	529_A	0.608	0.13
584_Q	608_V	0.608	0.13
183_G	241_A	0.608	0.13
18_Q	263_T	0.607	0.13
5_V	23_R	0.606	0.13
409_T	675_E	0.606	0.13
66_K	136_R	0.606	0.13
345_L	351_G	0.605	0.13
534_Q	662_T	0.605	0.13
501_V	700_M	0.604	0.13
291_E	377_T	0.603	0.13
492_R	496_G	0.603	0.13
566_D	656_K	0.602	0.13
540_S	634_V	0.602	0.13
434_I	547_M	0.600	0.13
429_E	700_M	0.600	0.13
160_V	178_V	0.597	0.13
588_L	592_A	0.597	0.13
614_K	691_A	0.597	0.13
448_T	719_A	0.596	0.13
522_V	577_L	0.596	0.13
393_E	406_I	0.595	0.13
577_L	594_I	0.595	0.13
129_T	239_K	0.594	0.13
76_G	238_L	0.594	0.13
487_M	701_V	0.593	0.13
55_D	286_M	0.593	0.13
176_T	300_T	0.593	0.13
500_D	504_E	0.592	0.13
693_T	714_R	0.592	0.13
53_S	247_Y	0.591	0.13
515_I	583_E	0.591	0.13
429_E	441_L	0.590	0.13
49_T	225_V	0.590	0.13
310_E	616_L	0.590	0.13
543_A	692_T	0.590	0.13
127_V	283_L	0.589	0.13
363_D	366_T	0.589	0.13
574_I	673_I	0.589	0.13
335_L	342_A	0.588	0.13
391_E	395_L	0.588	0.13
579_D	663_V	0.588	0.13
431_M	435_A	0.588	0.13
605_G	608_V	0.587	0.13
494_Q	547_M	0.586	0.13
92_D	160_V	0.586	0.13
440_S	714_R	0.585	0.13
32_E	207_I	0.583	0.13
33_Q	96_A	0.583	0.13
519_S	565_D	0.583	0.13
525_K	602_A	0.583	0.13
512_I	693_T	0.582	0.13
516_A	525_K	0.582	0.13
546_E	680_V	0.582	0.13
677_N	700_M	0.581	0.13
374_A	379_E	0.581	0.13
435_A	441_L	0.581	0.13
429_E	593_S	0.580	0.13
519_S	652_L	0.580	0.13
615_S	662_T	0.580	0.13
38_L	58_I	0.580	0.13
412_H	441_L	0.580	0.13
212_T	258_V	0.579	0.13
10_F	19_V	0.578	0.13
523_A	715_A	0.577	0.13
525_K	732_V	0.577	0.13
498_V	736_I	0.577	0.13
575_V	624_T	0.577	0.13
172_D	242_P	0.577	0.13
586_S	651_R	0.575	0.12
696_E	699_T	0.575	0.12
494_Q	708_S	0.575	0.12
594_I	607_A	0.574	0.12
533_G	722_A	0.572	0.12
578_I	697_V	0.572	0.12
412_H	726_T	0.571	0.12
255_R	264_A	0.571	0.12
329_A	332_A	0.570	0.12
290_A	328_V	0.570	0.12
292_A	297_D	0.570	0.12
413_A	423_E	0.570	0.12
434_I	594_I	0.570	0.12
501_V	536_G	0.570	0.12
41_W	176_T	0.567	0.12
620_T	740_S	0.567	0.12
413_A	443_E	0.567	0.12
593_S	652_L	0.567	0.12
111_S	491_A	0.567	0.12
286_M	326_Q	0.566	0.12
9_V	167_F	0.565	0.12
441_L	670_V	0.565	0.12
147_Q	479_Q	0.565	0.12
397_A	452_I	0.565	0.12
444_E	702_D	0.565	0.12
683_I	722_A	0.565	0.12
374_A	393_E	0.564	0.12
526_S	697_V	0.564	0.12
263_T	558_I	0.564	0.12
401_S	576_T	0.564	0.12
86_Y	138_T	0.563	0.12
519_S	711_T	0.563	0.12
494_Q	628_E	0.562	0.12
480_V	577_L	0.562	0.12
525_K	704_V	0.562	0.12
434_I	564_L	0.562	0.12
518_S	608_V	0.561	0.12
601_E	663_V	0.560	0.12
708_S	725_Q	0.560	0.12
519_S	736_I	0.560	0.12
494_Q	515_I	0.560	0.12
619_E	732_V	0.558	0.12
484_V	613_I	0.556	0.12
86_Y	264_A	0.556	0.12
419_T	521_E	0.555	0.12
437_A	453_Q	0.555	0.12
429_E	438_L	0.555	0.12
476_A	536_G	0.554	0.12
48_A	287_S	0.551	0.12
182_E	394_A	0.551	0.12
530_V	536_G	0.551	0.12
358_E	368_I	0.551	0.12
34_E	41_W	0.550	0.12
512_I	568_M	0.549	0.12
444_E	544_I	0.549	0.12
204_A	210_G	0.549	0.12
633_D	697_V	0.548	0.12
418_L	715_A	0.547	0.12
539_R	594_I	0.547	0.12
429_E	434_I	0.546	0.12
580_D	702_D	0.546	0.12
112_I	134_N	0.545	0.12
525_K	715_A	0.545	0.12
185_V	709_D	0.545	0.12
660_T	715_A	0.545	0.12
519_S	529_A	0.545	0.12
631_I	665_T	0.545	0.12
445_L	491_A	0.544	0.12
587_M	666_I	0.544	0.12
412_H	437_A	0.543	0.12
610_A	616_L	0.542	0.12
686_A	690_Q	0.542	0.12
568_M	576_T	0.541	0.12
590_L	663_V	0.541	0.12
589_A	616_L	0.539	0.12
424_T	430_S	0.539	0.12
523_A	537_R	0.538	0.12
614_K	710_D	0.537	0.12
597_A	689_E	0.536	0.12
314_L	321_I	0.534	0.12
447_G	681_Q	0.534	0.12
447_G	667_D	0.534	0.12
501_V	604_E	0.533	0.12
498_V	718_A	0.533	0.12
429_E	704_V	0.532	0.12
240_H	279_A	0.532	0.12
536_G	728_S	0.531	0.12
406_I	436_T	0.531	0.12
27_L	312_G	0.531	0.12
580_D	715_A	0.530	0.12
11_T	15_V	0.530	0.12
51_Y	151_D	0.530	0.12
508_L	519_S	0.529	0.12
312_G	631_I	0.528	0.12
502_S	627_I	0.528	0.12
5_V	42_I	0.527	0.12
417_D	526_S	0.527	0.12
627_I	729_L	0.527	0.12
484_V	737_Q	0.526	0.12
504_E	590_L	0.525	0.12
657_S	661_D	0.525	0.12
708_S	714_R	0.524	0.12
590_L	650_D	0.523	0.12
402_Q	441_L	0.522	0.11
438_L	537_R	0.521	0.11
580_D	593_S	0.521	0.11
230_V	699_T	0.520	0.11
519_S	602_A	0.519	0.11
280_L	291_E	0.519	0.11
331_Q	723_E	0.519	0.11
444_E	669_I	0.518	0.11
399_L	402_Q	0.517	0.11
194_I	359_T	0.517	0.11
501_V	533_G	0.517	0.11
400_E	403_A	0.516	0.11
73_R	94_I	0.516	0.11
281_T	513_E	0.516	0.11
406_I	410_V	0.516	0.11
247_Y	325_L	0.515	0.11
506_T	604_E	0.514	0.11
709_D	713_A	0.514	0.11
442_L	484_V	0.513	0.11
88_N	183_G	0.512	0.11
564_L	624_T	0.512	0.11
2_L	111_S	0.511	0.11
591_N	616_L	0.510	0.11
435_A	452_I	0.510	0.11
557_T	574_I	0.510	0.11
582_A	606_F	0.510	0.11
237_L	384_E	0.510	0.11
490_D	680_V	0.510	0.11
550_V	687_T	0.510	0.11
413_A	708_S	0.509	0.11
505_M	523_A	0.509	0.11
12_T	57_A	0.509	0.11
299_D	418_L	0.509	0.11
594_I	704_V	0.508	0.11
553_Q	676_A	0.508	0.11
290_A	312_G	0.507	0.11
170_N	275_I	0.507	0.11
571_I	623_A	0.507	0.11
405_D	410_V	0.507	0.11
494_Q	694_T	0.506	0.11
509_S	517_S	0.506	0.11
523_A	723_E	0.506	0.11
579_D	700_M	0.506	0.11
525_K	630_L	0.505	0.11
533_G	629_S	0.505	0.11
278_D	307_R	0.505	0.11
498_V	519_S	0.505	0.11
689_E	715_A	0.505	0.11
417_D	659_V	0.504	0.11
573_E	735_R	0.504	0.11
87_V	152_N	0.504	0.11
487_M	516_A	0.503	0.11
611_D	704_V	0.502	0.11
437_A	501_V	0.501	0.11
608_V	612_E	0.500	0.11
175_Y	193_A	0.500	0.11
526_S	663_V	0.500	0.11
434_I	583_E	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3zx6A	2	0.3848	100	0.68	Contact Map
1qu7A	2	0.2873	100	0.726	Contact Map
2ch7A	2	0.3911	100	0.741	Contact Map
3g67A	2	0.2646	100	0.792	Contact Map
3lifA	1	0.2911	99.9	0.875	Contact Map
4i3mA	2	0.1899	99.9	0.875	Contact Map
3lidA	2	0.3089	99.9	0.878	Contact Map
3li9A	2	0.2823	99.9	0.879	Contact Map
3libA	3	0.2937	99.9	0.88	Contact Map
3licA	2	0.2848	99.9	0.881	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0174 seconds.