Q9HR80 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HR80 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HR80	Sequences: MERTVAFMYALSRSGMPLAEVLRILARNQPVYGAAAEEMAVAVTDIDNYGADIITALERVGSRTPSDDLAEFTENLGSILQSGSDLPAFLKQEYEYYAEEAEATQSQFLELLATLAEAYVTVLVAGPLFLITILVVIGLTLGGTLGFLRLTAFVLVPGATFGFAVYLDSITDATVGGPGDEQSVGGEQSRFQSIPSPSAALCPDGGADAAVAPLGSSPENRARFAISERLRPVLYRLRNPLTVVLETPTLLFWVSCPIAAVYLGSQWWAPLSTGVFAPAAYDDALVHATVFVVGTFAVAYETARRRRKAIEAEVPDFLDRFASTNEAGMAAVESFGRTVDGDLGALTQELERTWADIQWGARIEHALTRFRDRVNTPAVSRVVALTTNAMAASGNLGPVLRIAANEATASRRLERDRRNELLTYVVVIYVSFFVFIAIIVALDTIFIPNIPTGAATQAGSGASSAVDSGAFSQSAGQLTAAKKAAYSTVFFHTSLVQAVCSGLVAGQMGAGSVKAGAKHATVMLVVAYTTFLLLG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	535 (500)
Sequences:	147 (116)
Seq/√Len:	5.2

HALSA - Q9HR80
SULSO - Q97VE7 Q97W54

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
11_L	16_M	3.803	0.88
80_L	260_A	3.681	0.86
23_R	47_D	3.571	0.84
154_V	298_V	3.409	0.81
388_N	391_A	3.378	0.81
283_D	523_M	3.275	0.79
344_G	436_I	3.272	0.79
159_A	335_F	3.141	0.76
429_Y	519_H	3.038	0.73
86_L	89_F	2.935	0.70
152_A	493_T	2.912	0.70
300_Y	515_A	2.814	0.67
498_A	531_F	2.802	0.66
79_I	120_V	2.781	0.66
505_A	531_F	2.762	0.65
435_F	511_G	2.701	0.63
135_V	501_S	2.659	0.62
10_A	82_S	2.635	0.61
370_F	426_V	2.592	0.60
11_L	415_R	2.584	0.60
416_D	493_T	2.532	0.58
158_G	237_L	2.515	0.57
13_R	428_I	2.437	0.55
310_I	344_G	2.397	0.54
95_E	428_I	2.352	0.52
101_A	417_R	2.276	0.50
293_V	300_Y	2.271	0.50
322_A	454_A	2.260	0.49
248_P	257_P	2.246	0.49
154_V	233_V	2.235	0.48
93_E	368_T	2.182	0.47
503_L	513_V	2.150	0.46
75_N	528_Y	2.145	0.45
310_I	442_L	2.135	0.45
57_L	260_A	2.129	0.45
109_L	121_T	2.088	0.44
71_E	89_F	2.079	0.43
167_L	451_P	2.070	0.43
428_I	503_L	2.068	0.43
283_D	376_T	2.062	0.43
89_F	418_R	2.057	0.43
64_T	69_L	2.044	0.42
156_V	258_I	2.032	0.42
421_L	434_V	1.987	0.40
161_F	237_L	1.966	0.40
39_M	69_L	1.949	0.39
6_A	413_L	1.948	0.39
69_L	406_E	1.899	0.38
128_L	163_F	1.872	0.37
129_F	359_W	1.869	0.37
160_T	446_F	1.863	0.36
350_L	414_E	1.857	0.36
22_L	136_V	1.857	0.36
278_P	529_T	1.843	0.36
366_A	433_F	1.840	0.36
55_T	218_P	1.837	0.36
89_F	440_V	1.830	0.35
156_V	393_S	1.825	0.35
291_F	515_A	1.802	0.35
125_A	402_I	1.787	0.34
315_P	424_Y	1.779	0.34
119_Y	389_A	1.779	0.34
153_F	492_H	1.744	0.33
110_E	490_F	1.729	0.32
362_R	365_H	1.725	0.32
421_L	509_G	1.715	0.32
482_K	490_F	1.715	0.32
171_T	322_A	1.714	0.32
119_Y	428_I	1.708	0.32
106_S	508_M	1.707	0.32
233_V	254_V	1.706	0.32
311_E	519_H	1.695	0.31
248_P	404_A	1.693	0.31
10_A	403_A	1.691	0.31
4_T	35_A	1.670	0.31
330_A	430_V	1.665	0.31
160_T	500_C	1.658	0.30
116_A	407_A	1.650	0.30
492_H	497_Q	1.644	0.30
251_L	255_S	1.643	0.30
7_F	393_S	1.642	0.30
259_A	292_V	1.620	0.29
90_L	169_S	1.616	0.29
496_V	513_V	1.615	0.29
72_F	130_L	1.609	0.29
215_G	292_V	1.593	0.29
347_T	498_A	1.591	0.29
323_S	392_A	1.583	0.28
84_S	427_V	1.582	0.28
9_Y	15_G	1.577	0.28
360_G	389_A	1.557	0.28
431_S	499_V	1.554	0.28
225_A	526_V	1.551	0.28
16_M	57_L	1.518	0.27
109_L	431_S	1.518	0.27
73_T	77_G	1.513	0.27
208_D	225_A	1.504	0.26
23_R	523_M	1.494	0.26
305_R	520_A	1.493	0.26
356_D	369_R	1.492	0.26
381_R	385_L	1.492	0.26
108_F	171_T	1.488	0.26
31_V	168_D	1.474	0.26
58_E	89_F	1.470	0.25
509_G	528_Y	1.468	0.25
252_F	263_L	1.464	0.25
42_A	73_T	1.463	0.25
115_L	495_L	1.462	0.25
128_L	497_Q	1.458	0.25
314_V	359_W	1.457	0.25
11_L	121_T	1.457	0.25
11_L	323_S	1.456	0.25
75_N	486_Y	1.439	0.25
132_T	398_P	1.433	0.25
112_L	305_R	1.425	0.24
69_L	90_L	1.423	0.24
479_T	527_A	1.422	0.24
89_F	508_M	1.418	0.24
282_D	509_G	1.410	0.24
323_S	490_F	1.404	0.24
336_G	444_T	1.396	0.24
7_F	486_Y	1.376	0.23
87_P	363_I	1.368	0.23
5_V	387_T	1.365	0.23
239_N	481_A	1.360	0.23
116_A	121_T	1.356	0.23
92_Q	393_S	1.354	0.23
108_F	123_L	1.354	0.23
69_L	449_N	1.350	0.23
131_I	430_V	1.349	0.23
161_F	235_Y	1.349	0.23
416_D	489_V	1.347	0.22
50_G	426_V	1.344	0.22
289_T	351_E	1.342	0.22
119_Y	360_G	1.342	0.22
14_S	353_T	1.339	0.22
373_R	519_H	1.334	0.22
319_D	352_R	1.329	0.22
135_V	391_A	1.326	0.22
326_E	360_G	1.321	0.22
36_A	306_R	1.319	0.22
57_L	77_G	1.313	0.22
288_A	519_H	1.309	0.22
258_I	499_V	1.309	0.22
254_V	265_S	1.307	0.22
426_V	438_I	1.298	0.21
257_P	492_H	1.298	0.21
376_T	523_M	1.298	0.21
434_V	497_Q	1.293	0.21
6_A	517_A	1.283	0.21
81_Q	371_R	1.281	0.21
18_L	239_N	1.278	0.21
91_K	388_N	1.276	0.21
331_A	334_S	1.266	0.21
296_F	402_I	1.265	0.21
10_A	417_R	1.265	0.21
370_F	386_T	1.261	0.21
22_L	405_N	1.256	0.20
381_R	399_V	1.252	0.20
299_A	391_A	1.251	0.20
14_S	365_H	1.251	0.20
34_A	132_T	1.249	0.20
428_I	482_K	1.245	0.20
498_A	524_L	1.245	0.20
406_E	500_C	1.243	0.20
167_L	499_V	1.239	0.20
344_G	349_E	1.237	0.20
381_R	417_R	1.232	0.20
365_H	442_L	1.228	0.20
26_A	392_A	1.226	0.20
5_V	494_S	1.224	0.20
308_K	428_I	1.224	0.20
79_I	133_I	1.222	0.20
299_A	354_W	1.220	0.20
43_V	513_V	1.215	0.20
382_V	523_M	1.209	0.19
167_L	371_R	1.206	0.19
160_T	286_V	1.202	0.19
304_R	335_F	1.192	0.19
16_M	316_D	1.185	0.19
59_R	265_S	1.184	0.19
139_L	398_P	1.182	0.19
108_F	406_E	1.180	0.19
360_G	429_Y	1.178	0.19
342_D	519_H	1.176	0.19
306_R	316_D	1.175	0.19
350_L	522_V	1.174	0.19
126_G	431_S	1.169	0.19
58_E	341_G	1.167	0.19
14_S	319_D	1.163	0.19
32_Y	492_H	1.163	0.19
139_L	449_N	1.161	0.18
346_L	479_T	1.158	0.18
119_Y	135_V	1.157	0.18
245_L	522_V	1.155	0.18
72_F	413_L	1.148	0.18
82_S	349_E	1.140	0.18
338_T	433_F	1.138	0.18
123_L	430_V	1.136	0.18
4_T	8_M	1.132	0.18
72_F	169_S	1.126	0.18
75_N	511_G	1.122	0.18
238_R	522_V	1.117	0.18
167_L	378_A	1.116	0.18
529_T	532_L	1.114	0.18
280_A	396_L	1.114	0.18
357_I	363_I	1.111	0.18
329_M	458_A	1.110	0.17
370_F	376_T	1.108	0.17
67_D	498_A	1.103	0.17
235_Y	247_T	1.095	0.17
125_A	356_D	1.093	0.17
108_F	359_W	1.093	0.17
9_Y	105_Q	1.092	0.17
402_I	431_S	1.091	0.17
329_M	426_V	1.089	0.17
407_A	509_G	1.083	0.17
252_F	383_V	1.082	0.17
61_G	517_A	1.077	0.17
365_H	370_F	1.077	0.17
69_L	446_F	1.075	0.17
447_I	503_L	1.074	0.17
121_T	381_R	1.069	0.17
245_L	267_W	1.068	0.17
252_F	255_S	1.067	0.17
82_S	415_R	1.066	0.17
165_V	168_D	1.061	0.17
47_D	156_V	1.057	0.17
519_H	522_V	1.055	0.16
109_L	119_Y	1.050	0.16
425_V	496_V	1.049	0.16
127_P	135_V	1.049	0.16
222_A	513_V	1.047	0.16
156_V	347_T	1.047	0.16
75_N	393_S	1.044	0.16
128_L	325_N	1.044	0.16
264_G	292_V	1.043	0.16
32_Y	105_Q	1.042	0.16
12_S	209_A	1.041	0.16
18_L	334_S	1.038	0.16
30_P	261_V	1.036	0.16
40_A	380_S	1.034	0.16
104_T	316_D	1.032	0.16
159_A	162_G	1.030	0.16
251_L	292_V	1.025	0.16
67_D	215_G	1.025	0.16
141_L	398_P	1.025	0.16
152_A	530_T	1.023	0.16
132_T	500_C	1.021	0.16
70_A	357_I	1.020	0.16
147_F	428_I	1.019	0.16
42_A	85_D	1.017	0.16
27_R	487_S	1.015	0.16
120_V	125_A	1.010	0.16
435_F	519_H	1.010	0.16
176_G	437_A	1.010	0.16
339_V	446_F	1.008	0.16
426_V	526_V	1.008	0.16
36_A	105_Q	1.007	0.16
47_D	142_G	1.005	0.16
183_S	186_G	1.004	0.16
293_V	336_G	1.004	0.16
32_Y	417_R	1.000	0.16
437_A	441_A	1.000	0.16
82_S	417_R	0.999	0.15
56_A	413_L	0.995	0.15
85_D	529_T	0.992	0.15
154_V	525_V	0.986	0.15
185_G	219_E	0.985	0.15
7_F	415_R	0.984	0.15
37_E	110_E	0.983	0.15
148_L	413_L	0.978	0.15
328_G	518_K	0.976	0.15
73_T	84_S	0.974	0.15
11_L	81_Q	0.971	0.15
191_F	455_A	0.970	0.15
434_V	495_L	0.968	0.15
43_V	167_L	0.968	0.15
81_Q	329_M	0.967	0.15
55_T	250_L	0.963	0.15
67_D	345_A	0.961	0.15
299_A	399_V	0.960	0.15
360_G	431_S	0.959	0.15
116_A	509_G	0.958	0.15
89_F	427_V	0.957	0.15
334_S	373_R	0.955	0.15
73_T	132_T	0.950	0.15
89_F	100_E	0.948	0.15
15_G	323_S	0.948	0.15
406_E	446_F	0.947	0.15
22_L	354_W	0.945	0.15
233_V	279_A	0.943	0.15
22_L	25_L	0.943	0.15
45_D	433_F	0.943	0.15
128_L	434_V	0.940	0.14
436_I	490_F	0.938	0.14
40_A	490_F	0.938	0.14
39_M	357_I	0.937	0.14
371_R	374_V	0.934	0.14
11_L	82_S	0.933	0.14
60_V	86_L	0.932	0.14
318_L	400_L	0.932	0.14
294_G	298_V	0.931	0.14
29_Q	72_F	0.928	0.14
309_A	388_N	0.928	0.14
8_M	173_A	0.927	0.14
101_A	246_E	0.927	0.14
168_D	493_T	0.926	0.14
107_Q	498_A	0.926	0.14
62_S	234_L	0.923	0.14
148_L	399_V	0.922	0.14
131_I	497_Q	0.922	0.14
21_V	103_A	0.921	0.14
158_G	335_F	0.920	0.14
15_G	128_L	0.916	0.14
247_T	498_A	0.910	0.14
113_A	498_A	0.907	0.14
289_T	380_S	0.905	0.14
105_Q	257_P	0.905	0.14
310_I	326_E	0.904	0.14
342_D	429_Y	0.903	0.14
125_A	430_V	0.902	0.14
85_D	316_D	0.896	0.14
443_D	454_A	0.896	0.14
153_F	257_P	0.895	0.14
258_I	274_G	0.889	0.14
393_S	504_V	0.886	0.14
335_F	515_A	0.885	0.14
445_I	511_G	0.883	0.14
27_R	459_G	0.883	0.14
166_Y	364_E	0.879	0.14
125_A	385_L	0.879	0.14
377_P	386_T	0.879	0.14
150_L	447_I	0.878	0.14
44_T	79_I	0.875	0.13
147_F	167_L	0.873	0.13
51_A	158_G	0.871	0.13
294_G	347_T	0.871	0.13
16_M	252_F	0.871	0.13
125_A	353_T	0.870	0.13
27_R	309_A	0.870	0.13
14_S	295_T	0.869	0.13
374_V	430_V	0.868	0.13
7_F	417_R	0.868	0.13
18_L	372_D	0.867	0.13
207_A	232_P	0.866	0.13
123_L	315_P	0.866	0.13
373_R	424_Y	0.865	0.13
85_D	484_A	0.865	0.13
110_E	158_G	0.864	0.13
394_G	497_Q	0.862	0.13
32_Y	50_G	0.861	0.13
185_G	261_V	0.858	0.13
160_T	510_A	0.858	0.13
118_A	503_L	0.858	0.13
356_D	434_V	0.856	0.13
129_F	434_V	0.855	0.13
72_F	428_I	0.854	0.13
293_V	374_V	0.853	0.13
63_R	355_A	0.850	0.13
85_D	370_F	0.850	0.13
44_T	251_L	0.846	0.13
278_P	482_K	0.846	0.13
71_E	521_T	0.844	0.13
116_A	126_G	0.844	0.13
57_L	522_V	0.843	0.13
26_A	62_S	0.842	0.13
35_A	75_N	0.842	0.13
370_F	432_F	0.841	0.13
403_A	496_V	0.840	0.13
113_A	251_L	0.840	0.13
346_L	415_R	0.840	0.13
151_T	167_L	0.838	0.13
5_V	288_A	0.838	0.13
95_E	416_D	0.838	0.13
129_F	315_P	0.837	0.13
149_R	165_V	0.833	0.13
241_L	523_M	0.832	0.13
410_S	519_H	0.832	0.13
234_L	300_Y	0.831	0.13
337_R	498_A	0.830	0.13
7_F	75_N	0.829	0.13
396_L	493_T	0.827	0.13
335_F	447_I	0.826	0.13
13_R	421_L	0.826	0.13
454_A	527_A	0.824	0.13
393_S	453_G	0.823	0.13
339_V	451_P	0.819	0.13
317_F	429_Y	0.815	0.13
237_L	480_A	0.812	0.13
168_D	405_N	0.810	0.12
55_T	452_T	0.810	0.12
57_L	73_T	0.809	0.12
24_I	414_E	0.805	0.12
250_L	253_W	0.805	0.12
139_L	499_V	0.803	0.12
77_G	235_Y	0.802	0.12
160_T	382_V	0.799	0.12
133_I	300_Y	0.798	0.12
116_A	317_F	0.798	0.12
87_P	425_V	0.797	0.12
381_R	416_D	0.796	0.12
20_E	344_G	0.795	0.12
70_A	334_S	0.795	0.12
45_D	255_S	0.794	0.12
248_P	323_S	0.793	0.12
357_I	379_V	0.791	0.12
414_E	509_G	0.790	0.12
508_M	523_M	0.789	0.12
237_L	484_A	0.788	0.12
311_E	429_Y	0.788	0.12
136_V	439_I	0.787	0.12
300_Y	452_T	0.786	0.12
8_M	35_A	0.785	0.12
44_T	300_Y	0.785	0.12
265_S	278_P	0.784	0.12
16_M	159_A	0.784	0.12
63_R	158_G	0.783	0.12
363_I	423_T	0.782	0.12
447_I	477_Q	0.782	0.12
121_T	126_G	0.781	0.12
82_S	255_S	0.781	0.12
79_I	265_S	0.781	0.12
146_G	487_S	0.777	0.12
391_A	442_L	0.776	0.12
167_L	376_T	0.776	0.12
431_S	507_Q	0.775	0.12
93_E	502_G	0.773	0.12
48_N	331_A	0.773	0.12
325_N	404_A	0.773	0.12
224_F	227_S	0.772	0.12
32_Y	255_S	0.771	0.12
142_G	496_V	0.770	0.12
254_V	285_L	0.770	0.12
287_H	388_N	0.768	0.12
167_L	266_Q	0.766	0.12
115_L	437_A	0.766	0.12
61_G	452_T	0.762	0.12
257_P	497_Q	0.762	0.12
110_E	323_S	0.761	0.12
351_E	496_V	0.761	0.12
113_A	319_D	0.760	0.12
4_T	36_A	0.759	0.12
501_S	505_A	0.759	0.12
83_G	328_G	0.759	0.12
76_L	353_T	0.758	0.12
15_G	325_N	0.758	0.12
8_M	21_V	0.757	0.12
362_R	416_D	0.757	0.12
426_V	445_I	0.757	0.12
309_A	391_A	0.756	0.12
370_F	381_R	0.755	0.12
230_L	459_G	0.754	0.12
335_F	533_L	0.754	0.12
161_F	346_L	0.754	0.12
423_T	441_A	0.752	0.12
15_G	129_F	0.751	0.12
11_L	109_L	0.751	0.12
216_S	498_A	0.747	0.12
139_L	425_V	0.746	0.12
335_F	508_M	0.746	0.12
55_T	512_S	0.743	0.12
12_S	32_Y	0.741	0.12
71_E	427_V	0.740	0.12
81_Q	451_P	0.739	0.12
25_L	503_L	0.738	0.11
258_I	362_R	0.737	0.11
234_L	291_F	0.736	0.11
162_G	436_I	0.734	0.11
49_Y	489_V	0.734	0.11
7_F	437_A	0.733	0.11
315_P	356_D	0.731	0.11
15_G	434_V	0.730	0.11
438_I	528_Y	0.728	0.11
9_Y	42_A	0.727	0.11
85_D	527_A	0.724	0.11
142_G	396_L	0.723	0.11
49_Y	311_E	0.722	0.11
436_I	442_L	0.719	0.11
7_F	322_A	0.717	0.11
289_T	482_K	0.717	0.11
219_E	239_N	0.717	0.11
25_L	322_A	0.715	0.11
165_V	399_V	0.714	0.11
363_I	428_I	0.714	0.11
80_L	354_W	0.714	0.11
178_P	498_A	0.713	0.11
402_I	417_R	0.713	0.11
95_E	494_S	0.713	0.11
327_A	402_I	0.710	0.11
57_L	452_T	0.708	0.11
487_S	531_F	0.708	0.11
40_A	161_F	0.708	0.11
504_V	517_A	0.706	0.11
35_A	399_V	0.706	0.11
111_L	501_S	0.706	0.11
385_L	417_R	0.705	0.11
278_P	285_L	0.705	0.11
334_S	390_M	0.705	0.11
219_E	225_A	0.704	0.11
256_C	267_W	0.703	0.11
7_F	324_T	0.702	0.11
39_M	46_I	0.702	0.11
126_G	402_I	0.702	0.11
271_L	529_T	0.701	0.11
310_I	438_I	0.700	0.11
46_I	338_T	0.700	0.11
434_V	509_G	0.699	0.11
235_Y	479_T	0.699	0.11
356_D	424_Y	0.698	0.11
319_D	326_E	0.697	0.11
158_G	316_D	0.697	0.11
314_V	371_R	0.696	0.11
64_T	533_L	0.692	0.11
350_L	487_S	0.692	0.11
152_A	173_A	0.691	0.11
511_G	528_Y	0.689	0.11
380_S	478_L	0.689	0.11
82_S	497_Q	0.689	0.11
59_R	533_L	0.688	0.11
359_W	395_N	0.687	0.11
136_V	150_L	0.687	0.11
407_A	523_M	0.687	0.11
125_A	511_G	0.687	0.11
14_S	53_I	0.686	0.11
171_T	323_S	0.684	0.11
381_R	497_Q	0.683	0.11
247_T	298_V	0.680	0.11
163_F	490_F	0.678	0.11
104_T	134_L	0.678	0.11
135_V	309_A	0.678	0.11
17_P	69_L	0.677	0.11
93_E	171_T	0.676	0.11
47_D	481_A	0.671	0.11
238_R	309_A	0.671	0.11
237_L	379_V	0.671	0.11
335_F	440_V	0.669	0.11
81_Q	339_V	0.669	0.11
384_A	519_H	0.669	0.11
99_E	225_A	0.668	0.11
241_L	357_I	0.667	0.11
309_A	365_H	0.666	0.11
160_T	437_A	0.663	0.11
154_V	289_T	0.662	0.11
20_E	393_S	0.660	0.10
374_V	378_A	0.660	0.10
296_F	443_D	0.658	0.10
175_V	244_V	0.657	0.10
375_N	504_V	0.656	0.10
84_S	295_T	0.654	0.10
7_F	381_R	0.653	0.10
8_M	36_A	0.652	0.10
169_S	334_S	0.652	0.10
132_T	174_T	0.652	0.10
39_M	130_L	0.650	0.10
114_T	451_P	0.649	0.10
238_R	504_V	0.647	0.10
317_F	435_F	0.647	0.10
139_L	391_A	0.646	0.10
482_K	519_H	0.646	0.10
93_E	441_A	0.645	0.10
212_A	263_L	0.645	0.10
69_L	270_P	0.644	0.10
407_A	511_G	0.641	0.10
163_F	492_H	0.640	0.10
260_A	278_P	0.640	0.10
342_D	435_F	0.640	0.10
8_M	54_I	0.640	0.10
148_L	238_R	0.639	0.10
26_A	163_F	0.639	0.10
100_E	427_V	0.636	0.10
260_A	415_R	0.635	0.10
240_P	385_L	0.635	0.10
499_V	515_A	0.634	0.10
281_Y	447_I	0.633	0.10
292_V	498_A	0.632	0.10
234_L	522_V	0.632	0.10
258_I	530_T	0.631	0.10
8_M	69_L	0.630	0.10
5_V	454_A	0.630	0.10
105_Q	403_A	0.629	0.10
167_L	335_F	0.628	0.10
115_L	151_T	0.628	0.10
258_I	298_V	0.627	0.10
7_F	339_V	0.627	0.10
170_I	303_A	0.626	0.10
366_A	520_A	0.625	0.10
251_L	260_A	0.625	0.10
75_N	354_W	0.624	0.10
320_R	352_R	0.624	0.10
149_R	361_A	0.624	0.10
5_V	498_A	0.622	0.10
58_E	333_E	0.622	0.10
448_P	452_T	0.621	0.10
170_I	442_L	0.620	0.10
79_I	256_C	0.618	0.10
224_F	228_E	0.617	0.10
247_T	250_L	0.617	0.10
401_R	439_I	0.615	0.10
339_V	527_A	0.614	0.10
414_E	431_S	0.612	0.10
90_L	133_I	0.612	0.10
142_G	365_H	0.611	0.10
186_G	298_V	0.610	0.10
256_C	318_L	0.608	0.10
125_A	129_F	0.606	0.10
315_P	359_W	0.605	0.10
42_A	414_E	0.605	0.10
28_N	138_G	0.604	0.10
6_A	352_R	0.604	0.10
86_L	440_V	0.604	0.10
17_P	92_Q	0.604	0.10
75_N	453_G	0.603	0.10
189_S	513_V	0.603	0.10
489_V	492_H	0.600	0.10
36_A	368_T	0.597	0.10
237_L	368_T	0.596	0.10
388_N	398_P	0.596	0.10
306_R	484_A	0.592	0.10
23_R	495_L	0.591	0.10
120_V	403_A	0.591	0.10
160_T	384_A	0.591	0.10
130_L	133_I	0.591	0.10
138_G	361_A	0.588	0.10
418_R	499_V	0.588	0.10
290_V	370_F	0.587	0.10
247_T	260_A	0.587	0.10
349_E	506_G	0.584	0.10
339_V	379_V	0.580	0.10
320_R	361_A	0.579	0.10
154_V	167_L	0.578	0.10
42_A	57_L	0.578	0.10
415_R	437_A	0.578	0.10
437_A	491_F	0.578	0.10
114_T	137_I	0.577	0.10
159_A	418_R	0.577	0.10
55_T	484_A	0.577	0.10
235_Y	250_L	0.577	0.10
380_S	404_A	0.575	0.09
150_L	432_F	0.574	0.09
57_L	304_R	0.574	0.09
505_A	510_A	0.574	0.09
5_V	61_G	0.571	0.09
281_Y	519_H	0.570	0.09
305_R	322_A	0.569	0.09
188_Q	271_L	0.569	0.09
29_Q	241_L	0.568	0.09
90_L	344_G	0.567	0.09
139_L	342_D	0.567	0.09
315_P	434_V	0.567	0.09
116_A	282_D	0.566	0.09
252_F	256_C	0.566	0.09
89_F	303_A	0.566	0.09
46_I	75_N	0.566	0.09
15_G	404_A	0.565	0.09
296_F	533_L	0.564	0.09
382_V	451_P	0.562	0.09
168_D	395_N	0.560	0.09
241_L	499_V	0.559	0.09
75_N	438_I	0.558	0.09
32_Y	257_P	0.556	0.09
154_V	246_E	0.556	0.09
282_D	486_Y	0.555	0.09
142_G	298_V	0.554	0.09
7_F	114_T	0.554	0.09
130_L	151_T	0.553	0.09
364_E	533_L	0.552	0.09
282_D	384_A	0.551	0.09
436_I	482_K	0.551	0.09
352_R	432_F	0.551	0.09
292_V	484_A	0.551	0.09
483_K	533_L	0.550	0.09
398_P	427_V	0.550	0.09
256_C	414_E	0.548	0.09
45_D	57_L	0.548	0.09
398_P	423_T	0.548	0.09
386_T	528_Y	0.548	0.09
252_F	325_N	0.547	0.09
478_L	484_A	0.546	0.09
58_E	104_T	0.544	0.09
340_D	365_H	0.544	0.09
316_D	395_N	0.544	0.09
304_R	454_A	0.543	0.09
176_G	415_R	0.543	0.09
14_S	84_S	0.543	0.09
392_A	490_F	0.543	0.09
167_L	436_I	0.542	0.09
268_W	298_V	0.542	0.09
397_G	428_I	0.542	0.09
57_L	408_T	0.542	0.09
82_S	131_I	0.540	0.09
405_N	498_A	0.538	0.09
38_E	516_G	0.538	0.09
131_I	140_T	0.537	0.09
266_Q	350_L	0.537	0.09
7_F	369_R	0.537	0.09
10_A	381_R	0.537	0.09
286_V	493_T	0.536	0.09
4_T	94_Y	0.535	0.09
50_G	329_M	0.533	0.09
380_S	485_A	0.533	0.09
93_E	330_A	0.532	0.09
64_T	285_L	0.532	0.09
163_F	325_N	0.531	0.09
379_V	408_T	0.531	0.09
293_V	533_L	0.530	0.09
502_G	531_F	0.530	0.09
7_F	101_A	0.529	0.09
14_S	103_A	0.529	0.09
181_E	326_E	0.525	0.09
29_Q	95_E	0.524	0.09
151_T	228_E	0.523	0.09
76_L	347_T	0.523	0.09
296_F	327_A	0.523	0.09
171_T	486_Y	0.522	0.09
104_T	181_E	0.522	0.09
134_L	488_T	0.521	0.09
23_R	476_G	0.521	0.09
78_S	491_F	0.521	0.09
127_P	446_F	0.520	0.09
321_F	338_T	0.520	0.09
386_T	483_K	0.519	0.09
164_A	397_G	0.518	0.09
133_I	519_H	0.517	0.09
316_D	453_G	0.517	0.09
78_S	492_H	0.516	0.09
151_T	341_G	0.516	0.09
256_C	312_A	0.515	0.09
105_Q	370_F	0.515	0.09
386_T	489_V	0.513	0.09
16_M	531_F	0.512	0.09
111_L	438_I	0.511	0.09
436_I	523_M	0.510	0.09
185_G	254_V	0.509	0.09
69_L	442_L	0.509	0.09
407_A	435_F	0.508	0.09
6_A	122_V	0.508	0.09
46_I	306_R	0.507	0.09
452_T	525_V	0.507	0.09
136_V	517_A	0.506	0.09
28_N	227_S	0.505	0.09
23_R	514_K	0.505	0.09
215_G	433_F	0.503	0.09
46_I	144_T	0.503	0.09
352_R	413_L	0.501	0.09
237_L	250_L	0.501	0.09
326_E	528_Y	0.501	0.09
88_A	95_E	0.501	0.09
126_G	434_V	0.500	0.09
223_R	392_A	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3c1qA	2	0.2243	98.8	0.943	Contact Map
4hhxA	1	0.185	98.8	0.944	Contact Map
2whnA	1	0.2037	98.6	0.946	Contact Map
3mc2A	1	0.129	34.8	0.983	Contact Map
4tquN	1	0.2037	26.9	0.984	Contact Map
3rm5A	2	0.2037	26.2	0.984	Contact Map
3v83A	6	0.1252	24.6	0.984	Contact Map
3rlfG	1	0.1701	23.5	0.984	Contact Map
1pw4A	1	0.1944	14.4	0.986	Contact Map
2d3iA	1	0.1346	13.4	0.986	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0132 seconds.