Q9HR00 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HR00 - MAPK-activated protein kinase

UniProt:	Q9HR00	Sequences: MHTRVRSTEPMSPQRHDVDPGAVAHHRGAVDTDDVAELAERLHSADADERSGAAWRLVEAAGTEPTAVRAHLEAIVARADDEDVWVRRGVTWVIAELAERQPDALSMKFSELVALTDADDELVRQNGAVAVAGVTKRYPERATAGLSTLASLTRDADPLLARYAEDAVAEVAAEIAARAEDAGYPMLVRTTAEYAALLPDDLTVVTTDDSEDGPRDPVSVSFGADAPVAVDAADRGDESAPPGHPPAEVPDAPSVGVSQADLTPGLELRETVLTTDFRATITDDTLEHGLVTLRRLNAATANGTDSRVVEAFQRALKRWAAVDEYPHIERVLGTGDTWVATRYDGAETLARRGPPATLSEAQWVVDRVTRAVSYAHARGVVHGGLHPGAVRFVETSVGAWDAPVVADWGFAHAASGHHSPPIPAGFAAPEHHDPASYGRFDQSTDVFGLGALAYFLVTGVSPRGGDGVVPAAQQNPALPERVDSLFERSLATSKQARFETVLDFQAAFDECVADLPGAWPA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	521 (441)
Sequences:	382 (325)
Seq/√Len:	15.5

ECOLI - YEGI
BACSU - PRKC
HALSA - Q9HR00
SULSO - Q97U18 Q97U41 Q97WD5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
371_A	405_V	5.903	1.00
386_H	423_P	4.349	1.00
342_R	404_V	4.163	1.00
384_G	389_A	3.789	1.00
387_P	426_F	3.650	1.00
271_T	407_D	3.540	0.99
454_Y	463_R	3.418	0.99
383_G	440_F	3.390	0.99
279_A	290_L	3.207	0.99
384_G	407_D	3.180	0.99
383_G	423_P	3.142	0.99
446_V	489_S	3.117	0.99
489_S	498_F	3.088	0.98
374_Y	405_V	2.949	0.98
271_T	384_G	2.851	0.97
383_G	422_I	2.816	0.97
271_T	276_D	2.775	0.97
386_H	422_I	2.770	0.97
279_A	288_H	2.658	0.96
485_L	503_D	2.643	0.96
358_L	479_P	2.569	0.95
386_H	389_A	2.551	0.95
390_V	403_P	2.495	0.94
384_G	423_P	2.482	0.94
271_T	274_T	2.463	0.94
315_A	384_G	2.429	0.93
271_T	409_G	2.403	0.93
276_D	389_A	2.388	0.93
387_P	454_Y	2.307	0.91
325_Y	374_Y	2.299	0.91
343_Y	449_L	2.291	0.91
386_H	407_D	2.270	0.91
187_L	190_T	2.170	0.88
269_R	384_G	2.155	0.88
389_A	407_D	2.087	0.86
167_A	170_E	2.083	0.86
440_F	444_T	2.073	0.86
271_T	389_A	2.051	0.85
262_L	463_R	2.012	0.84
471_A	490_L	1.987	0.83
446_V	498_F	1.972	0.83
368_V	390_V	1.957	0.82
350_A	388_G	1.951	0.82
432_H	441_D	1.941	0.82
431_H	440_F	1.935	0.82
389_A	445_D	1.933	0.82
375_A	498_F	1.904	0.81
262_L	333_G	1.897	0.80
454_Y	490_L	1.894	0.80
168_V	176_A	1.861	0.79
484_S	506_A	1.854	0.79
58_V	61_A	1.845	0.78
383_G	421_P	1.825	0.78
315_A	407_D	1.820	0.77
457_V	489_S	1.790	0.76
271_T	386_H	1.788	0.76
327_H	382_H	1.769	0.75
274_T	341_T	1.710	0.73
325_Y	405_V	1.697	0.72
274_T	383_G	1.685	0.72
358_L	462_P	1.656	0.70
348_T	446_V	1.655	0.70
407_D	430_E	1.651	0.70
391_R	406_A	1.649	0.70
479_P	485_L	1.648	0.70
403_P	447_F	1.639	0.69
384_G	422_I	1.632	0.69
365_V	453_A	1.629	0.69
506_A	509_D	1.606	0.68
472_A	475_N	1.579	0.66
228_V	231_D	1.578	0.66
346_A	462_P	1.572	0.66
173_A	176_A	1.572	0.66
407_D	422_I	1.570	0.66
204_V	209_D	1.562	0.66
149_L	153_T	1.551	0.65
385_L	405_V	1.547	0.65
362_Q	508_F	1.545	0.65
493_S	496_A	1.531	0.64
296_L	343_Y	1.525	0.64
382_H	452_L	1.507	0.63
269_R	342_R	1.507	0.63
426_F	471_A	1.505	0.63
235_R	238_E	1.478	0.61
408_W	462_P	1.473	0.61
210_S	214_P	1.469	0.61
388_G	489_S	1.465	0.60
371_A	489_S	1.455	0.60
368_V	385_L	1.453	0.60
276_D	407_D	1.449	0.60
312_F	440_F	1.433	0.59
426_F	463_R	1.433	0.59
387_P	423_P	1.426	0.58
409_G	445_D	1.409	0.57
322_V	498_F	1.392	0.56
389_A	409_G	1.391	0.56
319_W	410_F	1.383	0.56
47_A	50_R	1.375	0.55
269_R	431_H	1.374	0.55
328_I	473_Q	1.371	0.55
410_F	462_P	1.370	0.55
455_F	475_N	1.368	0.55
265_G	333_G	1.365	0.55
204_V	208_D	1.359	0.55
423_P	427_A	1.353	0.54
207_T	210_S	1.350	0.54
486_F	490_L	1.349	0.54
312_F	438_G	1.344	0.54
273_L	374_Y	1.340	0.53
374_Y	411_A	1.339	0.53
274_T	371_A	1.335	0.53
55_W	63_T	1.328	0.53
423_P	426_F	1.326	0.53
53_A	59_E	1.326	0.53
358_L	361_A	1.316	0.52
274_T	420_P	1.316	0.52
271_T	294_R	1.316	0.52
268_L	405_V	1.303	0.51
429_P	447_F	1.300	0.51
339_V	468_V	1.293	0.51
387_P	463_R	1.291	0.51
177_A	183_G	1.291	0.51
499_E	504_F	1.278	0.50
276_D	294_R	1.277	0.50
407_D	429_P	1.276	0.50
198_L	201_D	1.273	0.50
384_G	445_D	1.271	0.50
250_P	253_P	1.263	0.49
273_L	371_A	1.257	0.49
347_E	391_R	1.256	0.49
448_G	489_S	1.255	0.49
333_G	454_Y	1.251	0.48
211_E	215_R	1.250	0.48
117_D	128_A	1.246	0.48
173_A	177_A	1.241	0.48
74_A	77_A	1.241	0.48
375_A	455_F	1.238	0.48
55_W	60_A	1.234	0.47
93_V	127_G	1.232	0.47
342_R	347_E	1.231	0.47
457_V	482_V	1.229	0.47
333_G	489_S	1.222	0.47
465_G	468_V	1.214	0.46
269_R	407_D	1.213	0.46
274_T	409_G	1.212	0.46
294_R	315_A	1.211	0.46
201_D	205_V	1.208	0.46
403_P	408_W	1.202	0.46
428_A	455_F	1.199	0.45
385_L	452_L	1.182	0.45
327_H	499_E	1.180	0.44
426_F	490_L	1.179	0.44
412_H	426_F	1.178	0.44
166_D	176_A	1.173	0.44
112_L	120_D	1.173	0.44
121_E	127_G	1.171	0.44
387_P	425_G	1.169	0.44
289_G	375_A	1.169	0.44
331_V	344_D	1.165	0.44
390_V	416_G	1.164	0.43
294_R	389_A	1.161	0.43
485_L	506_A	1.159	0.43
409_G	450_G	1.158	0.43
427_A	457_V	1.153	0.43
430_E	497_R	1.152	0.43
385_L	411_A	1.145	0.42
166_D	169_A	1.141	0.42
428_A	506_A	1.140	0.42
424_A	449_L	1.140	0.42
320_A	340_A	1.133	0.42
335_G	340_A	1.133	0.42
376_H	386_H	1.133	0.42
463_R	490_L	1.127	0.41
425_G	490_L	1.124	0.41
268_L	308_V	1.124	0.41
53_A	57_L	1.120	0.41
262_L	352_R	1.115	0.41
46_D	57_L	1.114	0.41
206_T	209_D	1.111	0.41
372_V	449_L	1.108	0.40
352_R	494_K	1.107	0.40
380_V	422_I	1.107	0.40
268_L	335_G	1.106	0.40
78_R	81_D	1.099	0.40
166_D	177_A	1.097	0.40
364_V	425_G	1.096	0.40
388_G	463_R	1.096	0.40
210_S	213_G	1.096	0.40
381_V	392_F	1.095	0.40
361_A	451_A	1.091	0.39
453_A	494_K	1.086	0.39
364_V	392_F	1.079	0.39
328_I	331_V	1.077	0.39
343_Y	455_F	1.075	0.39
93_V	149_L	1.073	0.38
152_L	159_L	1.073	0.38
190_T	197_L	1.073	0.38
273_L	325_Y	1.069	0.38
274_T	407_D	1.068	0.38
281_I	333_G	1.067	0.38
315_A	389_A	1.063	0.38
247_A	252_A	1.062	0.38
44_S	47_A	1.061	0.38
236_G	240_A	1.056	0.38
261_D	369_T	1.052	0.37
56_R	59_E	1.036	0.36
315_A	391_R	1.035	0.36
262_L	288_H	1.035	0.36
445_D	450_G	1.032	0.36
428_A	440_F	1.029	0.36
273_L	384_G	1.022	0.36
407_D	445_D	1.022	0.36
274_T	375_A	1.020	0.36
410_F	427_A	1.018	0.36
368_V	411_A	1.017	0.35
369_T	503_D	1.017	0.35
327_H	446_V	1.013	0.35
235_R	240_A	1.013	0.35
243_G	249_V	1.005	0.35
318_R	422_I	1.001	0.35
371_A	391_R	1.000	0.35
276_D	386_H	1.000	0.35
358_L	447_F	0.998	0.35
421_P	440_F	0.997	0.34
422_I	427_A	0.996	0.34
367_R	504_F	0.995	0.34
431_H	444_T	0.992	0.34
75_I	87_R	0.984	0.34
348_T	498_F	0.982	0.34
427_A	503_D	0.975	0.33
421_P	444_T	0.972	0.33
430_E	445_D	0.970	0.33
90_V	108_K	0.964	0.33
272_V	388_G	0.963	0.33
324_E	381_V	0.961	0.33
389_A	423_P	0.959	0.33
431_H	456_L	0.956	0.32
335_G	358_L	0.956	0.32
268_L	495_Q	0.955	0.32
407_D	428_A	0.954	0.32
175_I	184_Y	0.954	0.32
239_S	242_P	0.952	0.32
425_G	447_F	0.949	0.32
236_G	244_H	0.948	0.32
342_R	391_R	0.947	0.32
176_A	181_D	0.946	0.32
55_W	61_A	0.941	0.32
451_A	457_V	0.941	0.32
331_V	391_R	0.939	0.32
91_T	124_R	0.938	0.31
385_L	410_F	0.938	0.31
388_G	426_F	0.938	0.31
353_G	449_L	0.935	0.31
429_P	497_R	0.931	0.31
191_T	198_L	0.930	0.31
471_A	486_F	0.927	0.31
369_T	504_F	0.926	0.31
272_V	421_P	0.922	0.31
320_A	440_F	0.915	0.30
93_V	97_L	0.913	0.30
485_L	509_D	0.910	0.30
482_V	485_L	0.909	0.30
331_V	457_V	0.909	0.30
290_L	368_V	0.909	0.30
231_D	234_D	0.906	0.30
381_V	493_S	0.904	0.30
187_L	200_D	0.903	0.30
407_D	423_P	0.898	0.30
45_A	51_S	0.897	0.30
472_A	479_P	0.896	0.29
120_D	123_V	0.896	0.29
172_A	184_Y	0.892	0.29
210_S	215_R	0.891	0.29
54_A	61_A	0.891	0.29
344_D	434_P	0.889	0.29
387_P	421_P	0.886	0.29
288_H	448_G	0.883	0.29
62_G	66_T	0.882	0.29
295_R	298_A	0.882	0.29
276_D	289_G	0.880	0.29
276_D	384_G	0.878	0.29
432_H	485_L	0.877	0.29
274_T	294_R	0.876	0.29
404_V	424_A	0.875	0.28
409_G	428_A	0.874	0.28
390_V	452_L	0.874	0.28
186_M	190_T	0.872	0.28
325_Y	367_R	0.870	0.28
87_R	92_W	0.868	0.28
334_T	337_T	0.867	0.28
203_T	210_S	0.865	0.28
112_L	168_V	0.863	0.28
408_W	473_Q	0.863	0.28
335_G	425_G	0.863	0.28
387_P	455_F	0.862	0.28
361_A	454_Y	0.861	0.28
337_T	468_V	0.861	0.28
267_E	270_E	0.861	0.28
316_L	452_L	0.861	0.28
446_V	471_A	0.861	0.28
348_T	454_Y	0.857	0.28
65_P	69_R	0.856	0.28
285_T	423_P	0.855	0.28
75_I	78_R	0.855	0.28
388_G	421_P	0.853	0.27
369_T	500_T	0.852	0.27
271_T	383_G	0.851	0.27
47_A	52_G	0.850	0.27
446_V	503_D	0.849	0.27
234_D	238_E	0.848	0.27
72_L	76_V	0.844	0.27
321_A	406_A	0.840	0.27
195_A	198_L	0.836	0.27
190_T	196_A	0.834	0.27
421_P	451_A	0.833	0.27
463_R	472_A	0.833	0.27
333_G	475_N	0.832	0.27
376_H	442_Q	0.826	0.26
316_L	406_A	0.826	0.26
350_A	451_A	0.823	0.26
229_A	232_A	0.823	0.26
192_A	196_A	0.822	0.26
404_V	448_G	0.821	0.26
84_V	87_R	0.821	0.26
332_L	341_T	0.821	0.26
426_F	455_F	0.820	0.26
273_L	389_A	0.817	0.26
445_D	497_R	0.814	0.26
441_D	444_T	0.814	0.26
277_F	371_A	0.811	0.26
262_L	340_A	0.810	0.26
454_Y	489_S	0.809	0.26
231_D	235_R	0.807	0.25
94_I	97_L	0.807	0.25
348_T	489_S	0.807	0.25
341_T	444_T	0.804	0.25
371_A	428_A	0.803	0.25
124_R	146_L	0.800	0.25
149_L	164_A	0.799	0.25
47_A	51_S	0.797	0.25
272_V	461_S	0.797	0.25
262_L	335_G	0.796	0.25
335_G	463_R	0.796	0.25
371_A	456_L	0.795	0.25
447_F	490_L	0.791	0.25
404_V	459_G	0.789	0.25
123_V	328_I	0.784	0.24
333_G	347_E	0.784	0.24
230_V	233_A	0.783	0.24
165_E	183_G	0.783	0.24
156_A	160_L	0.782	0.24
54_A	73_E	0.779	0.24
379_G	406_A	0.778	0.24
272_V	423_P	0.777	0.24
130_A	133_G	0.777	0.24
141_R	155_D	0.775	0.24
388_G	423_P	0.774	0.24
276_D	391_R	0.774	0.24
466_D	489_S	0.774	0.24
290_L	367_R	0.773	0.24
237_D	244_H	0.773	0.24
116_T	131_V	0.772	0.24
201_D	204_V	0.771	0.24
62_G	65_P	0.769	0.24
314_R	410_F	0.769	0.24
269_R	374_Y	0.768	0.24
450_G	497_R	0.765	0.24
288_H	340_A	0.764	0.24
53_A	56_R	0.762	0.24
315_A	383_G	0.761	0.23
168_V	196_A	0.761	0.23
202_L	221_S	0.760	0.23
180_E	186_M	0.760	0.23
279_A	359_S	0.760	0.23
86_V	89_G	0.758	0.23
53_A	58_V	0.758	0.23
269_R	346_A	0.756	0.23
337_T	421_P	0.756	0.23
243_G	246_P	0.754	0.23
409_G	422_I	0.750	0.23
427_A	482_V	0.749	0.23
342_R	447_F	0.749	0.23
104_A	110_S	0.748	0.23
245_P	251_D	0.748	0.23
388_G	424_A	0.748	0.23
375_A	489_S	0.746	0.23
239_S	247_A	0.746	0.23
186_M	201_D	0.746	0.23
137_R	146_L	0.746	0.23
319_W	371_A	0.746	0.23
48_D	51_S	0.743	0.23
48_D	52_G	0.741	0.23
458_T	504_F	0.741	0.23
374_Y	379_G	0.741	0.23
171_V	174_E	0.740	0.23
421_P	426_F	0.739	0.23
428_A	459_G	0.739	0.23
278_R	390_V	0.738	0.23
236_G	239_S	0.738	0.23
122_L	133_G	0.735	0.22
392_F	431_H	0.729	0.22
306_S	319_W	0.729	0.22
335_G	427_A	0.727	0.22
242_P	250_P	0.724	0.22
56_R	79_A	0.722	0.22
375_A	380_V	0.721	0.22
174_E	177_A	0.721	0.22
330_R	408_W	0.720	0.22
328_I	334_T	0.719	0.22
325_Y	383_G	0.716	0.22
463_R	478_L	0.714	0.22
463_R	503_D	0.714	0.22
168_V	182_A	0.711	0.21
375_A	450_G	0.710	0.21
333_G	455_F	0.710	0.21
325_Y	328_I	0.710	0.21
335_G	447_F	0.709	0.21
232_A	235_R	0.708	0.21
48_D	55_W	0.707	0.21
347_E	383_G	0.707	0.21
71_H	130_A	0.706	0.21
116_T	120_D	0.706	0.21
372_V	385_L	0.703	0.21
243_G	251_D	0.702	0.21
242_P	252_A	0.702	0.21
248_E	252_A	0.701	0.21
71_H	77_A	0.696	0.21
307_R	390_V	0.696	0.21
47_A	58_V	0.695	0.21
324_E	330_R	0.693	0.21
164_A	181_D	0.691	0.21
271_T	289_G	0.691	0.21
105_L	131_V	0.688	0.21
196_A	201_D	0.688	0.21
52_G	62_G	0.688	0.21
95_A	98_A	0.687	0.21
410_F	452_L	0.684	0.20
51_S	55_W	0.683	0.20
191_T	194_Y	0.681	0.20
131_V	199_P	0.680	0.20
388_G	425_G	0.679	0.20
268_L	374_Y	0.679	0.20
133_G	142_A	0.678	0.20
171_V	201_D	0.676	0.20
48_D	65_P	0.676	0.20
448_G	475_N	0.676	0.20
59_E	64_E	0.675	0.20
327_H	509_D	0.675	0.20
273_L	405_V	0.674	0.20
47_A	55_W	0.674	0.20
367_R	447_F	0.674	0.20
67_A	71_H	0.673	0.20
278_R	379_G	0.673	0.20
175_I	181_D	0.673	0.20
239_S	243_G	0.672	0.20
209_D	214_P	0.671	0.20
271_T	375_A	0.670	0.20
463_R	466_D	0.670	0.20
276_D	409_G	0.670	0.20
76_V	80_D	0.669	0.20
228_V	233_A	0.669	0.20
384_G	409_G	0.669	0.20
274_T	337_T	0.669	0.20
315_A	422_I	0.667	0.20
63_T	68_V	0.663	0.20
90_V	94_I	0.662	0.20
271_T	315_A	0.660	0.20
388_G	478_L	0.660	0.20
103_D	109_F	0.659	0.20
312_F	316_L	0.658	0.20
171_V	183_G	0.655	0.19
82_E	85_W	0.654	0.19
383_G	424_A	0.654	0.19
401_D	458_T	0.651	0.19
343_Y	503_D	0.651	0.19
343_Y	419_S	0.649	0.19
110_S	131_V	0.648	0.19
386_H	428_A	0.648	0.19
431_H	458_T	0.645	0.19
47_A	54_A	0.644	0.19
312_F	451_A	0.644	0.19
271_T	422_I	0.643	0.19
141_R	145_G	0.643	0.19
50_R	59_E	0.643	0.19
246_P	249_V	0.642	0.19
382_H	445_D	0.642	0.19
207_T	212_D	0.642	0.19
262_L	426_F	0.642	0.19
383_G	427_A	0.641	0.19
54_A	63_T	0.640	0.19
51_S	67_A	0.639	0.19
491_A	496_A	0.638	0.19
308_V	385_L	0.637	0.19
166_D	174_E	0.635	0.19
370_R	499_E	0.635	0.19
335_G	454_Y	0.631	0.19
72_L	80_D	0.631	0.19
400_W	486_F	0.630	0.19
233_A	237_D	0.630	0.19
335_G	361_A	0.629	0.19
404_V	509_D	0.628	0.18
274_T	412_H	0.627	0.18
176_A	182_A	0.626	0.18
172_A	177_A	0.626	0.18
171_V	198_L	0.626	0.18
312_F	479_P	0.624	0.18
275_T	448_G	0.623	0.18
89_G	96_E	0.616	0.18
173_A	185_P	0.616	0.18
208_D	212_D	0.615	0.18
315_A	404_V	0.615	0.18
426_F	454_Y	0.615	0.18
247_A	253_P	0.615	0.18
240_A	243_G	0.614	0.18
372_V	490_L	0.613	0.18
70_A	90_V	0.613	0.18
52_G	61_A	0.613	0.18
58_V	83_D	0.612	0.18
199_P	372_V	0.612	0.18
386_H	434_P	0.610	0.18
165_E	170_E	0.609	0.18
414_A	452_L	0.609	0.18
387_P	451_A	0.608	0.18
459_G	497_R	0.606	0.18
103_D	114_A	0.606	0.18
49_E	63_T	0.606	0.18
411_A	476_P	0.604	0.18
108_K	114_A	0.604	0.18
382_H	421_P	0.604	0.18
274_T	331_V	0.602	0.18
331_V	451_A	0.602	0.18
288_H	463_R	0.601	0.18
247_A	251_D	0.596	0.17
49_E	54_A	0.596	0.17
212_D	216_D	0.595	0.17
405_V	410_F	0.595	0.17
76_V	84_V	0.594	0.17
229_A	238_E	0.594	0.17
194_Y	201_D	0.593	0.17
61_A	64_E	0.593	0.17
386_H	401_D	0.592	0.17
118_A	121_E	0.589	0.17
408_W	455_F	0.589	0.17
177_A	180_E	0.588	0.17
463_R	486_F	0.588	0.17
288_H	356_A	0.588	0.17
185_P	188_V	0.587	0.17
344_D	374_Y	0.586	0.17
343_Y	427_A	0.586	0.17
94_I	486_F	0.585	0.17
45_A	48_D	0.585	0.17
72_L	87_R	0.585	0.17
64_E	67_A	0.584	0.17
56_R	63_T	0.583	0.17
358_L	431_H	0.583	0.17
52_G	64_E	0.582	0.17
272_V	322_V	0.581	0.17
369_T	508_F	0.581	0.17
346_A	374_Y	0.581	0.17
367_R	402_A	0.577	0.17
228_V	240_A	0.577	0.17
181_D	202_L	0.576	0.17
77_A	81_D	0.575	0.17
54_A	57_L	0.575	0.17
446_V	504_F	0.574	0.17
187_L	195_A	0.573	0.17
319_W	331_V	0.572	0.17
45_A	53_A	0.571	0.17
343_Y	398_G	0.570	0.17
336_D	455_F	0.568	0.17
107_M	112_L	0.568	0.17
364_V	456_L	0.567	0.16
170_E	181_D	0.567	0.16
59_E	73_E	0.567	0.16
235_R	243_G	0.567	0.16
258_S	261_D	0.563	0.16
384_G	411_A	0.558	0.16
289_G	389_A	0.558	0.16
83_D	86_V	0.558	0.16
380_V	385_L	0.558	0.16
388_G	475_N	0.556	0.16
52_G	55_W	0.556	0.16
387_P	458_T	0.555	0.16
172_A	193_E	0.555	0.16
319_W	338_W	0.553	0.16
189_R	203_T	0.551	0.16
322_V	453_A	0.550	0.16
197_L	201_D	0.549	0.16
279_A	502_L	0.548	0.16
386_H	490_L	0.547	0.16
53_A	70_A	0.546	0.16
262_L	387_P	0.546	0.16
180_E	195_A	0.545	0.16
427_A	463_R	0.545	0.16
59_E	62_G	0.544	0.16
200_D	217_P	0.544	0.16
155_D	160_L	0.544	0.16
262_L	447_F	0.544	0.16
477_A	481_R	0.543	0.16
279_A	368_V	0.543	0.16
348_T	508_F	0.542	0.16
386_H	426_F	0.541	0.16
171_V	179_A	0.538	0.16
109_F	115_L	0.538	0.16
276_D	428_A	0.538	0.16
458_T	473_Q	0.536	0.16
55_W	58_V	0.536	0.16
163_Y	405_V	0.534	0.15
289_G	386_H	0.534	0.15
68_V	75_I	0.534	0.15
388_G	472_A	0.533	0.15
361_A	457_V	0.533	0.15
277_F	489_S	0.532	0.15
290_L	371_A	0.531	0.15
228_V	232_A	0.531	0.15
260_A	480_E	0.531	0.15
370_R	406_A	0.531	0.15
169_A	172_A	0.530	0.15
383_G	407_D	0.530	0.15
380_V	386_H	0.529	0.15
276_D	430_E	0.529	0.15
325_Y	344_D	0.528	0.15
372_V	426_F	0.527	0.15
319_W	448_G	0.527	0.15
345_G	428_A	0.526	0.15
269_R	440_F	0.526	0.15
333_G	463_R	0.524	0.15
454_Y	457_V	0.523	0.15
51_S	54_A	0.523	0.15
430_E	450_G	0.520	0.15
385_L	409_G	0.520	0.15
171_V	177_A	0.520	0.15
361_A	489_S	0.519	0.15
315_A	341_T	0.519	0.15
206_T	214_P	0.518	0.15
398_G	412_H	0.518	0.15
489_S	499_E	0.518	0.15
74_A	88_R	0.518	0.15
482_V	489_S	0.517	0.15
49_E	56_R	0.517	0.15
257_V	296_L	0.516	0.15
172_A	175_I	0.516	0.15
261_D	479_P	0.516	0.15
265_G	288_H	0.515	0.15
77_A	92_W	0.515	0.15
56_R	61_A	0.514	0.15
206_T	210_S	0.513	0.15
344_D	406_A	0.513	0.15
198_L	206_T	0.512	0.15
48_D	56_R	0.510	0.15
164_A	180_E	0.509	0.15
494_K	497_R	0.509	0.15
483_D	507_A	0.508	0.15
334_T	451_A	0.508	0.15
205_V	215_R	0.508	0.15
229_A	235_R	0.506	0.15
182_A	214_P	0.504	0.15
361_A	421_P	0.504	0.15
192_A	199_P	0.503	0.15
246_P	253_P	0.501	0.15
386_H	424_A	0.501	0.15
275_T	322_V	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4lqsA	1	0.5528	100	0.425	Contact Map
4ic7A	1	0.4875	100	0.43	Contact Map
4fr4A	1	0.4952	100	0.432	Contact Map
4gv1A	1	0.4856	100	0.432	Contact Map
4kikA	2	0.4952	100	0.435	Contact Map
4dc2A	1	0.476	100	0.436	Contact Map
2yabA	2	0.4952	100	0.441	Contact Map
4aw2A	2	0.62	100	0.442	Contact Map
3rp9A	1	0.4491	100	0.443	Contact Map
2bdwA	2	0.4894	100	0.443	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0129 seconds.