Q9HQY4 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HQY4 - Flagella accessory protein J

UniProt:	Q9HQY4	Sequences: MAAEAEGEHVESEGSLSDVDFGEFVESVVESYRTMPMPAFRYVAFALVPAVVFFFVTIVAIVALSLPTYLLIPTPMLGLLALIAAVMYPKIRMDQRRTRMENRFHLFITHMTVLSTTNIDRVEVFRRIGAEEEYGPLSEEARRIVQLIDAWNQSLDDACRMRANKVPSDLIADFLDRLAYTINSGESLESYLMSEQEAIIRNYATTYEGQLENIEVMKDLYLSMVLSVTFALVFATVLPILSGTDPTMTVSAVVVLYTFIQVGFLYTMYTLAPSDPLWYFPEDRTTSVEWRMRVATAAGSVAAVVLVVVVIAVQLSWTPLAPDVLPLPMYAAVPTTPLLIPGLVARAEEGRVKDRDDAFTSFIRALGSSETARQTTTTRVLETLRDKNFGALTELIDDLYKRLNLRLDASQAWRHFTADSHSYLIQKFSEMYLIGRQMGGAPKHLGELISENMSEVLQLRQQRSQSASTLVGVLYGISAAATFAFFIGLGIVDVISGLGLDFSNPAFDVGSIINTEVYDIETIKYLLVLTLLINASLSSLMTRVVDGGHKVNAYIHFVALTWISCVIGSVTLELVKSLLSV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	581 (528)
Sequences:	401 (316)
Seq/√Len:	13.8

HALSA - Q9HQY4 Q9HR80
SULSO - Q97W54 Q97VE7 Q97WB8 Q7LXX7

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
475_Y	556_H	5.069	1.00
111_M	124_V	4.228	1.00
144_I	175_L	3.899	1.00
154_S	157_D	3.796	0.99
259_F	412_A	3.116	0.98
297_A	301_V	3.094	0.98
100_M	166_V	3.067	0.98
408_D	411_Q	3.065	0.98
53_F	77_L	3.037	0.97
126_R	149_D	2.852	0.96
65_S	68_T	2.830	0.96
222_L	545_V	2.779	0.95
294_V	303_A	2.744	0.95
100_M	174_F	2.741	0.95
70_L	74_T	2.718	0.95
169_D	257_Y	2.702	0.95
77_L	80_L	2.625	0.94
36_P	84_A	2.619	0.94
49_P	81_A	2.558	0.93
38_P	43_V	2.476	0.92
73_P	76_M	2.461	0.91
73_P	505_P	2.361	0.90
333_V	394_E	2.357	0.90
539_S	553_A	2.328	0.89
64_L	77_L	2.320	0.89
144_I	159_C	2.314	0.89
298_A	301_V	2.285	0.88
253_V	530_T	2.283	0.88
540_L	550_K	2.272	0.88
356_D	422_S	2.270	0.88
52_V	77_L	2.243	0.87
306_L	311_I	2.233	0.87
300_S	333_V	2.224	0.87
210_Q	229_T	2.219	0.86
110_H	367_G	2.188	0.86
293_R	301_V	2.159	0.85
229_T	481_A	2.116	0.84
304_V	314_Q	2.104	0.83
241_L	536_S	2.082	0.83
174_F	390_G	2.075	0.82
55_F	357_D	2.064	0.82
298_A	302_A	2.035	0.81
42_Y	440_G	2.005	0.80
55_F	300_S	1.981	0.79
56_V	73_P	1.972	0.79
84_A	310_V	1.958	0.78
388_N	556_H	1.952	0.78
107_F	111_M	1.926	0.77
363_I	446_G	1.922	0.77
151_W	356_D	1.895	0.76
329_M	559_A	1.887	0.76
262_V	503_S	1.883	0.75
126_R	260_I	1.869	0.75
84_A	315_L	1.864	0.75
71_L	75_P	1.859	0.75
109_T	182_I	1.855	0.74
65_S	69_Y	1.853	0.74
52_V	67_P	1.852	0.74
53_F	59_V	1.838	0.74
255_V	343_L	1.833	0.73
214_I	548_G	1.832	0.73
482_T	487_I	1.810	0.72
40_F	43_V	1.807	0.72
166_V	219_D	1.795	0.72
296_T	303_A	1.769	0.71
294_V	312_A	1.759	0.70
489_L	492_V	1.757	0.70
46_A	85_A	1.752	0.70
117_T	372_A	1.745	0.70
249_T	309_V	1.732	0.69
223_S	413_W	1.723	0.69
141_A	171_I	1.723	0.69
52_V	306_L	1.718	0.68
177_R	195_E	1.716	0.68
51_V	315_L	1.689	0.67
310_V	315_L	1.683	0.67
300_S	329_M	1.663	0.66
185_G	219_D	1.659	0.66
310_V	563_I	1.657	0.65
51_V	353_K	1.644	0.65
105_H	431_M	1.638	0.64
482_T	560_L	1.638	0.64
211_L	463_R	1.636	0.64
255_V	537_L	1.624	0.64
293_R	296_T	1.613	0.63
300_S	566_V	1.599	0.63
226_L	276_P	1.596	0.62
362_F	388_N	1.594	0.62
304_V	502_F	1.582	0.62
58_I	62_V	1.567	0.61
90_K	93_M	1.553	0.60
134_Y	427_K	1.518	0.58
38_P	80_L	1.515	0.58
300_S	303_A	1.513	0.58
73_P	77_L	1.512	0.58
113_V	184_S	1.509	0.58
316_S	570_V	1.504	0.58
183_N	268_M	1.497	0.57
259_F	264_F	1.495	0.57
115_S	134_Y	1.492	0.57
345_A	552_N	1.490	0.57
293_R	300_S	1.490	0.57
312_A	316_S	1.488	0.57
56_V	76_M	1.478	0.56
51_V	311_I	1.478	0.56
230_F	370_E	1.478	0.56
303_A	350_G	1.471	0.56
252_A	403_L	1.463	0.55
110_H	374_Q	1.463	0.55
178_L	237_V	1.460	0.55
258_T	374_Q	1.459	0.55
311_I	563_I	1.442	0.54
305_V	309_V	1.436	0.54
401_K	461_Q	1.426	0.54
115_S	211_L	1.419	0.53
52_V	315_L	1.419	0.53
144_I	563_I	1.415	0.53
64_L	306_L	1.401	0.52
225_V	229_T	1.398	0.52
217_M	486_F	1.397	0.52
74_T	79_L	1.394	0.52
408_D	462_Q	1.393	0.52
97_R	554_Y	1.393	0.52
134_Y	463_R	1.391	0.52
292_M	510_G	1.390	0.52
163_A	330_Y	1.387	0.51
346_R	350_G	1.387	0.51
301_V	310_V	1.384	0.51
416_F	425_I	1.382	0.51
217_M	237_V	1.381	0.51
69_Y	311_I	1.380	0.51
177_R	191_Y	1.374	0.51
293_R	310_V	1.374	0.51
65_S	72_I	1.370	0.51
71_L	559_A	1.366	0.50
388_N	475_Y	1.354	0.50
60_A	69_Y	1.349	0.49
102_N	367_G	1.344	0.49
231_A	405_L	1.344	0.49
171_I	532_L	1.341	0.49
80_L	563_I	1.339	0.49
167_P	556_H	1.335	0.49
93_M	105_H	1.334	0.49
311_I	504_N	1.332	0.48
221_Y	392_L	1.323	0.48
510_G	566_V	1.323	0.48
84_A	171_I	1.318	0.48
300_S	311_I	1.317	0.48
121_R	227_S	1.315	0.48
38_P	265_L	1.315	0.48
134_Y	416_F	1.309	0.47
290_W	333_V	1.306	0.47
56_V	333_V	1.302	0.47
79_L	290_W	1.301	0.47
58_I	560_L	1.294	0.46
296_T	563_I	1.293	0.46
559_A	566_V	1.291	0.46
255_V	510_G	1.290	0.46
228_V	498_L	1.289	0.46
135_G	412_A	1.288	0.46
138_S	562_W	1.286	0.46
155_L	554_Y	1.284	0.46
51_V	62_V	1.283	0.46
203_Y	459_L	1.282	0.46
255_V	518_Y	1.280	0.46
303_A	314_Q	1.268	0.45
234_F	558_V	1.264	0.45
367_G	419_D	1.264	0.45
160_R	174_F	1.261	0.45
64_L	333_V	1.257	0.44
89_P	483_F	1.255	0.44
238_L	356_D	1.252	0.44
48_V	300_S	1.246	0.44
257_Y	559_A	1.235	0.43
53_F	306_L	1.222	0.43
490_G	498_L	1.220	0.42
273_P	456_V	1.219	0.42
51_V	246_P	1.216	0.42
230_F	428_F	1.216	0.42
59_V	265_L	1.215	0.42
254_V	529_L	1.213	0.42
168_S	219_D	1.207	0.42
230_F	374_Q	1.206	0.42
151_W	367_G	1.205	0.42
311_I	396_I	1.205	0.42
370_E	374_Q	1.203	0.42
302_A	559_A	1.199	0.41
502_F	510_G	1.198	0.41
225_V	378_T	1.197	0.41
76_M	289_E	1.194	0.41
247_T	403_L	1.193	0.41
500_L	503_S	1.193	0.41
311_I	567_I	1.191	0.41
249_T	376_T	1.188	0.41
62_V	501_D	1.188	0.41
295_A	304_V	1.180	0.40
102_N	206_T	1.175	0.40
100_M	140_E	1.173	0.40
559_A	562_W	1.171	0.40
218_K	226_L	1.171	0.40
227_S	463_R	1.170	0.40
190_S	302_A	1.168	0.40
192_L	404_N	1.165	0.40
295_A	299_G	1.162	0.39
473_V	553_A	1.158	0.39
172_A	432_Y	1.155	0.39
63_A	257_Y	1.154	0.39
64_L	310_V	1.152	0.39
420_S	424_L	1.151	0.39
416_F	472_G	1.151	0.39
53_F	92_R	1.149	0.39
117_T	370_E	1.145	0.39
531_L	564_S	1.141	0.38
367_G	460_R	1.139	0.38
314_Q	331_A	1.137	0.38
332_A	425_I	1.135	0.38
448_L	463_R	1.131	0.38
103_R	452_N	1.123	0.37
129_G	222_L	1.123	0.37
362_F	556_H	1.121	0.37
51_V	304_V	1.120	0.37
300_S	308_V	1.120	0.37
227_S	427_K	1.117	0.37
209_G	255_V	1.109	0.37
44_A	212_E	1.104	0.37
260_I	263_G	1.101	0.36
68_T	311_I	1.099	0.36
310_V	497_G	1.094	0.36
110_H	113_V	1.093	0.36
293_R	317_W	1.088	0.36
113_V	525_Y	1.087	0.36
359_F	435_G	1.081	0.35
414_R	566_V	1.079	0.35
112_T	534_N	1.076	0.35
222_L	226_L	1.073	0.35
402_R	415_H	1.071	0.35
270_T	461_Q	1.069	0.35
299_G	316_S	1.062	0.34
161_M	311_I	1.054	0.34
52_V	189_E	1.050	0.34
157_D	489_L	1.050	0.34
256_L	399_L	1.050	0.34
362_F	424_L	1.047	0.34
291_R	294_V	1.046	0.34
293_R	299_G	1.046	0.34
51_V	55_F	1.045	0.34
52_V	305_V	1.044	0.34
37_M	164_N	1.043	0.34
177_R	449_I	1.040	0.33
415_H	531_L	1.034	0.33
54_F	64_L	1.033	0.33
64_L	130_A	1.032	0.33
226_L	464_S	1.032	0.33
396_I	569_S	1.030	0.33
66_L	72_I	1.029	0.33
129_G	464_S	1.028	0.33
223_S	227_S	1.028	0.33
221_Y	406_R	1.028	0.33
57_T	74_T	1.027	0.33
257_Y	359_F	1.026	0.33
48_V	404_N	1.025	0.33
424_L	460_R	1.022	0.33
74_T	461_Q	1.019	0.32
81_A	84_A	1.019	0.32
314_Q	317_W	1.018	0.32
104_F	136_P	1.018	0.32
229_T	480_A	1.015	0.32
101_E	170_L	1.014	0.32
309_V	314_Q	1.008	0.32
308_V	311_I	1.007	0.32
63_A	310_V	1.001	0.32
229_T	258_T	1.001	0.32
351_R	540_L	1.001	0.32
116_T	222_L	1.001	0.32
76_M	329_M	0.996	0.31
64_L	308_V	0.995	0.31
385_R	465_Q	0.995	0.31
363_I	545_V	0.993	0.31
283_D	293_R	0.990	0.31
141_A	474_L	0.990	0.31
308_V	314_Q	0.989	0.31
302_A	306_L	0.988	0.31
72_I	262_V	0.987	0.31
76_M	138_S	0.985	0.31
483_F	537_L	0.985	0.31
359_F	408_D	0.984	0.31
304_V	394_E	0.983	0.31
535_A	539_S	0.983	0.31
212_E	527_L	0.978	0.31
500_L	564_S	0.977	0.30
53_F	73_P	0.976	0.30
183_N	516_E	0.975	0.30
169_D	499_G	0.975	0.30
362_F	475_Y	0.974	0.30
72_I	129_G	0.967	0.30
208_E	462_Q	0.965	0.30
108_I	165_K	0.965	0.30
114_L	119_I	0.964	0.30
227_S	448_L	0.964	0.30
304_V	567_I	0.960	0.30
229_T	380_V	0.958	0.30
160_R	191_Y	0.955	0.29
104_F	527_L	0.955	0.29
343_L	357_D	0.954	0.29
48_V	55_F	0.954	0.29
258_T	446_G	0.954	0.29
236_T	527_L	0.953	0.29
532_L	535_A	0.949	0.29
105_H	374_Q	0.947	0.29
422_S	557_F	0.947	0.29
260_I	382_E	0.944	0.29
253_V	487_I	0.943	0.29
253_V	560_L	0.941	0.29
56_V	394_E	0.939	0.29
374_Q	446_G	0.937	0.29
96_R	294_V	0.937	0.29
234_F	396_I	0.931	0.28
55_F	325_L	0.931	0.28
174_F	185_G	0.927	0.28
77_L	94_D	0.925	0.28
364_R	480_A	0.920	0.28
56_V	566_V	0.920	0.28
52_V	397_D	0.920	0.28
146_Q	345_A	0.919	0.28
69_Y	394_E	0.919	0.28
500_L	566_V	0.918	0.28
55_F	68_T	0.917	0.28
341_P	551_V	0.913	0.28
192_L	270_T	0.911	0.28
273_P	547_G	0.911	0.28
367_G	422_S	0.909	0.27
178_L	474_L	0.907	0.27
290_W	294_V	0.906	0.27
144_I	558_V	0.906	0.27
339_L	382_E	0.905	0.27
480_A	543_R	0.905	0.27
207_Y	360_T	0.903	0.27
306_L	312_A	0.902	0.27
262_V	566_V	0.902	0.27
142_R	312_A	0.901	0.27
225_V	476_G	0.900	0.27
69_Y	75_P	0.900	0.27
105_H	196_Q	0.899	0.27
489_L	571_T	0.897	0.27
173_D	558_V	0.897	0.27
235_A	305_V	0.896	0.27
502_F	552_N	0.892	0.27
313_V	381_L	0.890	0.27
155_L	416_F	0.890	0.27
59_V	84_A	0.887	0.27
72_I	550_K	0.887	0.27
118_N	543_R	0.886	0.26
259_F	343_L	0.884	0.26
259_F	300_S	0.884	0.26
159_C	175_L	0.882	0.26
328_P	420_S	0.881	0.26
374_Q	435_G	0.880	0.26
140_E	555_I	0.879	0.26
535_A	571_T	0.879	0.26
295_A	505_P	0.879	0.26
64_L	569_S	0.877	0.26
235_A	372_A	0.877	0.26
452_N	473_V	0.875	0.26
158_A	211_L	0.874	0.26
316_S	333_V	0.872	0.26
235_A	436_R	0.870	0.26
543_R	553_A	0.869	0.26
435_G	445_L	0.866	0.26
86_V	109_T	0.866	0.26
368_S	371_T	0.866	0.26
349_E	381_L	0.866	0.26
352_V	465_Q	0.865	0.26
333_V	540_L	0.865	0.26
121_R	432_Y	0.865	0.26
34_T	484_A	0.862	0.25
130_A	309_V	0.861	0.25
316_S	566_V	0.859	0.25
210_Q	225_V	0.857	0.25
166_V	174_F	0.856	0.25
74_T	411_Q	0.853	0.25
65_S	76_M	0.852	0.25
353_K	489_L	0.851	0.25
221_Y	475_Y	0.850	0.25
425_I	488_G	0.850	0.25
182_I	306_L	0.850	0.25
177_R	400_Y	0.849	0.25
174_F	367_G	0.848	0.25
60_A	537_L	0.847	0.25
115_S	528_V	0.846	0.25
271_L	526_L	0.846	0.25
60_A	559_A	0.845	0.25
171_I	347_A	0.844	0.25
306_L	354_D	0.843	0.25
356_D	363_I	0.840	0.25
291_R	299_G	0.838	0.25
124_V	445_L	0.838	0.25
51_V	56_V	0.837	0.24
138_S	351_R	0.837	0.24
192_L	356_D	0.837	0.24
390_G	532_L	0.834	0.24
377_T	479_A	0.834	0.24
112_T	445_L	0.833	0.24
396_I	479_A	0.832	0.24
362_F	389_F	0.831	0.24
60_A	79_L	0.831	0.24
368_S	442_P	0.828	0.24
204_A	564_S	0.827	0.24
246_P	304_V	0.826	0.24
386_D	560_L	0.826	0.24
280_F	283_D	0.825	0.24
290_W	299_G	0.823	0.24
158_A	181_T	0.822	0.24
445_L	459_L	0.822	0.24
221_Y	553_A	0.820	0.24
258_T	450_S	0.818	0.24
96_R	167_P	0.817	0.24
135_G	140_E	0.816	0.24
125_F	451_E	0.815	0.24
413_W	429_S	0.814	0.24
532_L	541_M	0.813	0.24
59_V	255_V	0.813	0.24
69_Y	76_M	0.812	0.24
185_G	191_Y	0.811	0.23
184_S	463_R	0.810	0.23
62_V	500_L	0.808	0.23
360_T	417_T	0.807	0.23
177_R	446_G	0.807	0.23
74_T	315_L	0.806	0.23
64_L	69_Y	0.804	0.23
220_L	329_M	0.802	0.23
157_D	355_R	0.802	0.23
163_A	517_V	0.801	0.23
290_W	296_T	0.800	0.23
366_L	384_L	0.799	0.23
73_P	94_D	0.799	0.23
237_V	469_T	0.798	0.23
59_V	325_L	0.796	0.23
311_I	314_Q	0.795	0.23
47_L	188_L	0.794	0.23
62_V	308_V	0.793	0.23
168_S	538_S	0.792	0.23
43_V	85_A	0.791	0.23
154_S	366_L	0.791	0.23
68_T	482_T	0.791	0.23
181_T	482_T	0.786	0.23
61_I	504_N	0.786	0.23
184_S	374_Q	0.786	0.23
381_L	411_Q	0.782	0.22
297_A	306_L	0.782	0.22
352_V	356_D	0.782	0.22
344_V	431_M	0.780	0.22
132_E	271_L	0.777	0.22
222_L	225_V	0.776	0.22
132_E	505_P	0.776	0.22
64_L	307_V	0.776	0.22
167_P	392_L	0.775	0.22
140_E	168_S	0.775	0.22
462_Q	491_I	0.775	0.22
351_R	570_V	0.773	0.22
71_L	74_T	0.772	0.22
311_I	570_V	0.768	0.22
154_S	555_I	0.767	0.22
42_Y	114_L	0.767	0.22
61_I	69_Y	0.766	0.22
185_G	221_Y	0.765	0.22
311_I	315_L	0.764	0.22
422_S	531_L	0.762	0.22
289_E	317_W	0.761	0.22
297_A	322_P	0.760	0.22
325_L	467_A	0.760	0.22
251_S	417_T	0.759	0.22
195_E	365_A	0.758	0.21
62_V	84_A	0.758	0.21
204_A	455_E	0.757	0.21
109_T	387_K	0.756	0.21
50_A	212_E	0.755	0.21
411_Q	564_S	0.753	0.21
204_A	566_V	0.753	0.21
144_I	358_A	0.751	0.21
227_S	480_A	0.750	0.21
177_R	472_G	0.749	0.21
43_V	64_L	0.748	0.21
252_A	387_K	0.747	0.21
412_A	473_V	0.745	0.21
284_R	305_V	0.745	0.21
118_N	534_N	0.745	0.21
364_R	454_S	0.744	0.21
305_V	570_V	0.744	0.21
230_F	233_V	0.744	0.21
52_V	296_T	0.744	0.21
278_W	476_G	0.742	0.21
75_P	536_S	0.742	0.21
125_F	400_Y	0.739	0.21
74_T	351_R	0.738	0.21
195_E	547_G	0.736	0.21
120_D	220_L	0.736	0.21
271_L	313_V	0.736	0.21
177_R	439_G	0.735	0.21
69_Y	307_V	0.734	0.21
134_Y	264_F	0.734	0.21
129_G	307_V	0.733	0.21
249_T	461_Q	0.733	0.21
141_A	403_L	0.733	0.21
542_T	568_G	0.731	0.21
58_I	73_P	0.731	0.21
339_L	371_T	0.730	0.20
258_T	363_I	0.729	0.20
154_S	254_V	0.728	0.20
178_L	272_A	0.728	0.20
171_I	469_T	0.728	0.20
250_V	473_V	0.727	0.20
493_D	497_G	0.724	0.20
177_R	565_C	0.723	0.20
37_M	77_L	0.723	0.20
304_V	315_L	0.722	0.20
72_I	331_A	0.722	0.20
137_L	177_R	0.721	0.20
346_R	555_I	0.721	0.20
310_V	499_G	0.719	0.20
252_A	491_I	0.719	0.20
87_M	315_L	0.718	0.20
230_F	446_G	0.718	0.20
72_I	82_L	0.717	0.20
258_T	409_A	0.714	0.20
53_F	67_P	0.713	0.20
156_D	238_L	0.712	0.20
51_V	313_V	0.711	0.20
255_V	304_V	0.709	0.20
268_M	380_V	0.709	0.20
36_P	138_S	0.709	0.20
308_V	536_S	0.707	0.20
230_F	258_T	0.707	0.20
62_V	73_P	0.705	0.20
113_V	449_I	0.705	0.20
177_R	413_W	0.705	0.20
224_M	537_L	0.705	0.20
185_G	463_R	0.703	0.20
532_L	537_L	0.700	0.19
147_L	366_L	0.700	0.19
130_A	519_D	0.699	0.19
301_V	332_A	0.698	0.19
390_G	482_T	0.697	0.19
125_F	128_I	0.694	0.19
120_D	144_I	0.692	0.19
386_D	521_E	0.692	0.19
495_I	512_I	0.691	0.19
227_S	442_P	0.691	0.19
122_V	473_V	0.690	0.19
110_H	523_I	0.688	0.19
55_F	61_I	0.688	0.19
477_I	544_V	0.687	0.19
185_G	392_L	0.686	0.19
168_S	392_L	0.686	0.19
107_F	137_L	0.686	0.19
51_V	336_T	0.685	0.19
197_E	526_L	0.684	0.19
32_Y	159_C	0.683	0.19
59_V	335_T	0.683	0.19
54_F	252_A	0.681	0.19
204_A	404_N	0.680	0.19
111_M	459_L	0.679	0.19
77_L	88_Y	0.678	0.19
109_T	384_L	0.675	0.19
51_V	302_A	0.674	0.19
74_T	128_I	0.674	0.19
291_R	304_V	0.673	0.19
391_A	504_N	0.671	0.18
296_T	315_L	0.671	0.18
174_F	217_M	0.670	0.18
155_L	224_M	0.670	0.18
178_L	232_L	0.670	0.18
120_D	436_R	0.667	0.18
203_Y	207_Y	0.667	0.18
299_G	504_N	0.664	0.18
151_W	547_G	0.664	0.18
371_T	447_E	0.663	0.18
63_A	70_L	0.659	0.18
43_V	84_A	0.658	0.18
362_F	396_I	0.658	0.18
274_S	358_A	0.657	0.18
219_D	539_S	0.656	0.18
148_I	387_K	0.653	0.18
64_L	84_A	0.652	0.18
133_E	547_G	0.652	0.18
234_F	406_R	0.652	0.18
145_V	255_V	0.651	0.18
306_L	388_N	0.649	0.18
61_I	214_I	0.648	0.18
125_F	379_R	0.648	0.18
73_P	289_E	0.647	0.18
138_S	255_V	0.646	0.18
185_G	195_E	0.644	0.18
344_V	437_Q	0.643	0.18
192_L	451_E	0.641	0.18
43_V	86_V	0.640	0.18
50_A	53_F	0.640	0.18
374_Q	543_R	0.639	0.17
304_V	536_S	0.637	0.17
100_M	219_D	0.637	0.17
210_Q	356_D	0.635	0.17
47_L	541_M	0.635	0.17
98_T	485_F	0.634	0.17
216_V	267_T	0.633	0.17
292_M	295_A	0.632	0.17
54_F	510_G	0.631	0.17
60_A	94_D	0.631	0.17
224_M	231_A	0.627	0.17
69_Y	504_N	0.627	0.17
125_F	537_L	0.626	0.17
51_V	72_I	0.626	0.17
139_E	142_R	0.623	0.17
140_E	538_S	0.621	0.17
53_F	255_V	0.620	0.17
363_I	374_Q	0.620	0.17
402_R	476_G	0.619	0.17
304_V	425_I	0.619	0.17
209_G	272_A	0.618	0.17
356_D	443_K	0.617	0.17
418_A	558_V	0.616	0.17
52_V	68_T	0.616	0.17
442_P	478_S	0.615	0.17
36_P	401_K	0.615	0.17
72_I	144_I	0.614	0.17
221_Y	474_L	0.614	0.17
512_I	570_V	0.613	0.17
155_L	227_S	0.613	0.17
227_S	476_G	0.613	0.17
221_Y	556_H	0.613	0.17
139_E	212_E	0.612	0.17
336_T	386_D	0.611	0.17
139_E	517_V	0.611	0.17
483_F	488_G	0.610	0.17
537_L	557_F	0.609	0.17
342_G	554_Y	0.608	0.17
128_I	188_L	0.608	0.17
77_L	130_A	0.608	0.17
371_T	406_R	0.607	0.17
398_D	462_Q	0.606	0.16
54_F	58_I	0.606	0.16
115_S	203_Y	0.606	0.16
229_T	360_T	0.605	0.16
120_D	410_S	0.605	0.16
62_V	65_S	0.605	0.16
234_F	275_D	0.604	0.16
53_F	56_V	0.604	0.16
233_V	395_L	0.604	0.16
130_A	504_N	0.604	0.16
238_L	277_L	0.602	0.16
473_V	545_V	0.602	0.16
126_R	247_T	0.600	0.16
98_T	527_L	0.600	0.16
165_K	411_Q	0.597	0.16
174_F	388_N	0.596	0.16
70_L	278_W	0.596	0.16
163_A	554_Y	0.596	0.16
99_R	263_G	0.595	0.16
39_A	462_Q	0.595	0.16
174_F	475_Y	0.594	0.16
210_Q	258_T	0.593	0.16
313_V	536_S	0.593	0.16
462_Q	530_T	0.593	0.16
50_A	473_V	0.592	0.16
67_P	305_V	0.591	0.16
205_T	398_D	0.590	0.16
136_P	167_P	0.590	0.16
443_K	474_L	0.589	0.16
168_S	185_G	0.589	0.16
527_L	561_T	0.589	0.16
332_A	388_N	0.589	0.16
361_S	568_G	0.587	0.16
56_V	84_A	0.587	0.16
304_V	343_L	0.587	0.16
306_L	339_L	0.587	0.16
315_L	339_L	0.586	0.16
191_Y	416_F	0.582	0.16
72_I	353_K	0.582	0.16
43_V	51_V	0.581	0.16
309_V	502_F	0.578	0.16
208_E	376_T	0.578	0.16
211_L	538_S	0.576	0.16
166_V	528_V	0.576	0.16
305_V	322_P	0.574	0.16
419_D	470_L	0.574	0.16
216_V	238_L	0.574	0.16
160_R	384_L	0.569	0.15
230_F	465_Q	0.569	0.15
115_S	474_L	0.568	0.15
297_A	315_L	0.568	0.15
307_V	451_E	0.567	0.15
259_F	482_T	0.567	0.15
283_D	564_S	0.567	0.15
333_V	569_S	0.566	0.15
239_P	251_S	0.564	0.15
117_T	340_I	0.563	0.15
505_P	518_Y	0.562	0.15
180_Y	450_S	0.562	0.15
115_S	192_L	0.562	0.15
117_T	185_G	0.560	0.15
370_E	446_G	0.560	0.15
359_F	425_I	0.559	0.15
55_F	315_L	0.558	0.15
219_D	392_L	0.557	0.15
57_T	531_L	0.556	0.15
298_A	304_V	0.556	0.15
86_V	89_P	0.554	0.15
310_V	336_T	0.554	0.15
219_D	538_S	0.553	0.15
248_M	259_F	0.552	0.15
231_A	453_M	0.551	0.15
73_P	322_P	0.551	0.15
332_A	466_S	0.551	0.15
59_V	62_V	0.550	0.15
263_G	458_Q	0.549	0.15
180_Y	372_A	0.549	0.15
37_M	87_M	0.545	0.15
75_P	79_L	0.544	0.15
263_G	394_E	0.543	0.15
101_E	278_W	0.543	0.15
56_V	386_D	0.542	0.15
478_S	571_T	0.542	0.15
328_P	532_L	0.542	0.15
76_M	92_R	0.540	0.15
97_R	414_R	0.539	0.15
434_I	437_Q	0.538	0.15
230_F	349_E	0.538	0.15
49_P	195_E	0.538	0.15
168_S	553_A	0.538	0.15
62_V	70_L	0.537	0.15
147_L	342_G	0.537	0.15
300_S	447_E	0.537	0.15
169_D	544_V	0.536	0.15
47_L	263_G	0.536	0.15
497_G	501_D	0.535	0.14
520_I	525_Y	0.533	0.14
56_V	499_G	0.533	0.14
60_A	75_P	0.533	0.14
121_R	133_E	0.532	0.14
136_P	391_A	0.532	0.14
280_F	541_M	0.532	0.14
154_S	226_L	0.531	0.14
252_A	558_V	0.530	0.14
117_T	173_D	0.530	0.14
282_E	563_I	0.529	0.14
185_G	362_F	0.529	0.14
249_T	428_F	0.529	0.14
136_P	140_E	0.528	0.14
94_D	283_D	0.528	0.14
289_E	420_S	0.527	0.14
413_W	543_R	0.527	0.14
97_R	138_S	0.526	0.14
116_T	446_G	0.526	0.14
35_M	42_Y	0.526	0.14
154_S	405_L	0.526	0.14
119_I	396_I	0.525	0.14
548_G	560_L	0.525	0.14
230_F	480_A	0.525	0.14
118_N	553_A	0.525	0.14
210_Q	272_A	0.525	0.14
39_A	439_G	0.525	0.14
69_Y	497_G	0.524	0.14
129_G	382_E	0.524	0.14
59_V	396_I	0.523	0.14
303_A	311_I	0.523	0.14
59_V	69_Y	0.522	0.14
411_Q	501_D	0.522	0.14
232_L	236_T	0.521	0.14
84_A	339_L	0.520	0.14
100_M	528_V	0.520	0.14
201_R	530_T	0.519	0.14
226_L	268_M	0.519	0.14
72_I	80_L	0.518	0.14
107_F	138_S	0.518	0.14
330_Y	504_N	0.517	0.14
255_V	336_T	0.517	0.14
372_A	548_G	0.516	0.14
174_F	498_L	0.514	0.14
491_I	529_L	0.513	0.14
293_R	298_A	0.511	0.14
57_T	61_I	0.510	0.14
98_T	135_G	0.507	0.14
121_R	480_A	0.506	0.14
492_V	520_I	0.506	0.14
147_L	207_Y	0.506	0.14
260_I	381_L	0.505	0.14
73_P	302_A	0.504	0.14
236_T	453_M	0.504	0.14
356_D	421_H	0.504	0.14
175_L	259_F	0.503	0.14
146_Q	151_W	0.503	0.14
298_A	410_S	0.502	0.14
129_G	559_A	0.501	0.14
255_V	360_T	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3c1qA	2	0.2065	98.2	0.924	Contact Map
2whnA	1	0.1876	98.2	0.925	Contact Map
4hhxA	1	0.1721	98.1	0.927	Contact Map
1a87A	1	0.1738	16.9	0.977	Contact Map
3fx7A	2	0.1377	13.4	0.978	Contact Map
1fc3A	3	0.1842	11.3	0.979	Contact Map
2lv7A	1	0.1618	6.2	0.981	Contact Map
4yvqA	2	0.1308	5.8	0.981	Contact Map
2j69A	1	0.327	5.4	0.981	Contact Map
4wlrB	1	0.1635	5.4	0.981	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0143 seconds.