Q9HQH9 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HQH9 - tRNA(Met) cytidine acetyltransferase TmcA

UniProt:	Q9HQH9	Sequences: MPGGRATAAQPRTKRPLAWSPNRRRMHLSSARALLAEAERANERRMLVLAGDRAAGVRTADTLLDDLPIPLSETTLVATQDALACEHVPTRNADRLLGTTQRAVVIDLHEDCRPNALGRVVGAVDGGGLLVVLAPPLAEWPTRDGAFAAGLAVPPFDAADVTGRFRRRLADTMRAHPGIAIYDVDTDTLSDDGRTRPAPRLPDPDPDPQPTADVPAAAIDACVTPDQAAALASFAALRDPGHAVVADADRGRGKSSVAGLAAACLAAEGHDVLVTAPRRRNTTELFARAGALLADLGALASDGDTVETAAGGRIRFSKPPAAADLPGDPDAVFADEAAAIPVRLLESLLDCQRLAFTTTVHGYEGAGRGFDVRFRDRLADATQTVHETSLTDPIRYAGTDPIEPWAFRALLLGARPAVEPLVADATPDTAAYVALSGADLAADEHLLREAFGLLVSAHYRTEPNDLARLLDAPNLTMRALVADGHVASVALLAREGGLADDRRAAMYDGQRVKGNMIPDVLTSQLRDEAAATTVGYRVLRIATHPAVRSRGLGSRLLGELRAEFNGHADWLGVGYGATPALLSFWAANGYSTVHLSTTRNDTSGEYSAIMLDALSDAGRALHDRHAGWFADRIGGVLSDALRDLDADVARGALRACATTPSLALSERDWRTVAGAAHGPGMYSVDPRPFRRLAVHHLVAGDADLLSPDEQRLLVGALLQARPWDGLADDLGYHSASQAMRALGDALQALVAAHGTAAARAEVARFTED	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	768 (693)
Sequences:	719 (483)
Seq/√Len:	18.4

ECOLI - TMCA
HALSA - Q9HQH9
SULSO - Q97U12 Q980C5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
573_V	610_M	7.726	1.00
561_R	612_D	7.697	1.00
231_L	257_V	7.529	1.00
488_S	543_T	6.244	1.00
480_L	552_L	6.022	1.00
517_I	572_G	5.016	1.00
715_G	726_L	4.783	1.00
557_L	590_Y	4.601	1.00
538_V	557_L	4.560	1.00
112_C	117_L	4.338	1.00
554_S	588_N	4.116	1.00
557_L	588_N	4.040	1.00
256_S	288_R	3.789	1.00
75_T	78_A	3.775	1.00
494_R	536_Y	3.772	1.00
274_V	285_L	3.678	1.00
282_T	285_L	3.342	1.00
535_G	570_W	3.307	1.00
576_G	581_L	3.299	1.00
517_I	609_I	3.179	0.99
164_R	438_A	3.153	0.99
262_A	333_F	3.080	0.99
102_R	125_D	2.978	0.99
561_R	590_Y	2.946	0.99
368_R	576_G	2.936	0.99
289_A	314_I	2.933	0.99
576_G	605_E	2.922	0.99
434_A	476_T	2.890	0.99
593_V	611_L	2.837	0.98
592_T	608_A	2.809	0.98
230_A	246_A	2.741	0.98
334_A	356_F	2.687	0.98
721_R	729_D	2.682	0.98
633_I	652_A	2.657	0.98
277_P	339_A	2.640	0.97
490_A	556_L	2.627	0.97
454_L	489_V	2.622	0.97
260_L	292_L	2.620	0.97
117_L	406_A	2.581	0.97
413_G	448_R	2.556	0.97
516_M	574_G	2.544	0.97
332_V	348_L	2.535	0.97
239_D	242_H	2.530	0.97
450_A	469_L	2.490	0.96
628_W	671_T	2.483	0.96
545_P	548_R	2.474	0.96
44_R	51_G	2.408	0.96
168_R	444_E	2.397	0.96
115_N	464_N	2.315	0.95
433_V	481_V	2.295	0.94
591_S	626_A	2.289	0.94
712_L	730_L	2.288	0.94
44_R	49_L	2.257	0.94
50_A	486_V	2.251	0.94
276_A	316_F	2.233	0.93
450_A	477_M	2.226	0.93
726_L	738_A	2.219	0.93
93_A	119_R	2.157	0.92
450_A	489_V	2.133	0.92
392_D	398_G	2.124	0.92
449_E	485_H	2.116	0.91
450_A	486_V	2.100	0.91
345_L	374_F	2.075	0.91
51_G	56_G	2.010	0.89
527_D	625_H	2.002	0.89
100_T	126_G	1.979	0.88
520_V	609_I	1.970	0.88
356_F	374_F	1.968	0.88
262_A	285_L	1.952	0.88
569_D	615_S	1.952	0.88
245_V	375_R	1.944	0.87
414_A	452_G	1.934	0.87
637_L	649_A	1.925	0.87
112_C	449_E	1.916	0.87
430_A	552_L	1.891	0.86
435_L	479_A	1.887	0.86
246_A	388_T	1.874	0.85
49_L	131_V	1.849	0.84
521_L	593_V	1.840	0.84
243_A	383_Q	1.832	0.84
92_N	281_N	1.832	0.84
475_L	491_L	1.825	0.84
458_H	540_R	1.824	0.84
52_D	184_V	1.809	0.83
489_V	607_S	1.785	0.82
166_R	247_D	1.781	0.82
47_L	131_V	1.771	0.82
222_C	231_L	1.753	0.81
455_V	592_T	1.741	0.81
637_L	721_R	1.739	0.81
113_R	464_N	1.737	0.80
145_G	467_A	1.736	0.80
132_V	358_T	1.735	0.80
340_I	713_L	1.729	0.80
440_L	444_E	1.717	0.80
520_V	594_H	1.699	0.79
480_L	488_S	1.672	0.78
55_A	184_V	1.670	0.78
358_T	370_F	1.666	0.78
34_L	37_E	1.665	0.77
715_G	729_D	1.657	0.77
43_E	49_L	1.653	0.77
231_L	260_L	1.648	0.77
561_R	571_L	1.646	0.77
33_A	393_P	1.643	0.77
234_F	244_V	1.633	0.76
155_P	474_N	1.628	0.76
595_L	684_V	1.620	0.75
74_T	78_A	1.613	0.75
715_G	721_R	1.613	0.75
404_P	742_L	1.605	0.75
231_L	698_V	1.604	0.75
109_H	553_G	1.600	0.75
631_D	668_D	1.589	0.74
583_S	587_A	1.586	0.74
376_D	380_D	1.562	0.73
112_C	472_A	1.558	0.73
168_R	243_A	1.554	0.72
633_I	641_L	1.534	0.71
107_D	460_R	1.533	0.71
256_S	284_E	1.514	0.70
258_A	357_T	1.511	0.70
277_P	340_I	1.508	0.70
368_R	581_L	1.508	0.70
453_L	516_M	1.502	0.70
490_A	560_L	1.493	0.69
35_L	44_R	1.488	0.69
510_Q	596_S	1.479	0.68
682_Y	723_W	1.478	0.68
215_P	234_F	1.478	0.68
397_A	401_P	1.476	0.68
569_D	679_P	1.475	0.68
488_S	556_L	1.471	0.68
244_V	553_G	1.467	0.68
378_L	400_D	1.466	0.68
106_I	126_G	1.465	0.68
237_L	244_V	1.464	0.68
460_R	600_N	1.454	0.67
233_S	386_H	1.448	0.67
276_A	360_V	1.446	0.67
717_L	742_L	1.445	0.67
261_A	331_A	1.445	0.67
234_F	242_H	1.438	0.66
327_G	332_V	1.430	0.66
549_S	580_A	1.425	0.65
368_R	374_F	1.422	0.65
342_V	374_F	1.417	0.65
50_A	59_T	1.415	0.65
453_L	548_R	1.414	0.65
53_R	57_V	1.413	0.65
460_R	535_G	1.413	0.65
332_V	354_L	1.411	0.65
121_V	406_A	1.410	0.65
488_S	694_V	1.405	0.64
435_L	450_A	1.401	0.64
131_V	388_T	1.399	0.64
629_F	633_I	1.387	0.63
274_V	286_F	1.384	0.63
478_R	563_E	1.383	0.63
734_S	743_G	1.382	0.63
554_S	587_A	1.382	0.63
473_P	551_G	1.381	0.63
76_L	79_T	1.371	0.62
118_G	410_L	1.364	0.62
244_V	402_I	1.364	0.62
234_F	246_A	1.362	0.62
131_V	557_L	1.353	0.61
709_E	712_L	1.343	0.61
399_T	538_V	1.331	0.60
48_V	51_G	1.329	0.60
447_L	470_L	1.324	0.60
135_P	140_W	1.323	0.60
713_L	738_A	1.317	0.59
169_L	385_V	1.316	0.59
486_V	655_A	1.316	0.59
581_L	605_E	1.309	0.59
507_Y	570_W	1.306	0.59
535_G	548_R	1.305	0.58
446_L	486_V	1.300	0.58
616_D	619_R	1.299	0.58
364_E	395_R	1.285	0.57
535_G	572_G	1.285	0.57
400_D	447_L	1.282	0.57
50_A	73_E	1.279	0.57
682_Y	716_A	1.279	0.57
244_V	331_A	1.272	0.56
469_L	677_H	1.268	0.56
258_A	272_V	1.267	0.56
282_T	731_G	1.264	0.56
401_P	412_L	1.264	0.56
38_A	43_E	1.261	0.56
575_Y	674_G	1.260	0.56
274_V	544_H	1.260	0.56
333_F	469_L	1.253	0.55
165_F	472_A	1.243	0.55
369_G	374_F	1.241	0.55
402_I	691_R	1.240	0.54
50_A	58_R	1.235	0.54
570_W	710_Q	1.235	0.54
364_E	458_H	1.233	0.54
395_R	458_H	1.233	0.54
168_R	172_T	1.230	0.54
674_G	684_V	1.227	0.54
519_D	596_S	1.223	0.53
121_V	246_A	1.217	0.53
246_A	477_M	1.216	0.53
620_A	695_H	1.215	0.53
364_E	540_R	1.210	0.53
395_R	540_R	1.210	0.53
393_P	626_A	1.209	0.53
488_S	615_S	1.207	0.52
122_G	461_T	1.201	0.52
365_G	395_R	1.191	0.51
331_A	355_A	1.188	0.51
51_G	55_A	1.180	0.51
272_V	738_A	1.174	0.50
379_A	387_E	1.173	0.50
257_V	444_E	1.172	0.50
548_R	553_G	1.170	0.50
716_A	723_W	1.163	0.50
349_L	565_N	1.162	0.50
57_V	486_V	1.161	0.50
50_A	56_G	1.156	0.49
434_A	478_R	1.154	0.49
286_F	469_L	1.153	0.49
183_D	187_D	1.153	0.49
276_A	485_H	1.145	0.49
226_D	391_T	1.144	0.49
664_L	668_D	1.144	0.49
602_T	610_M	1.139	0.48
45_R	48_V	1.138	0.48
594_H	600_N	1.135	0.48
365_G	458_H	1.133	0.48
277_P	524_Q	1.132	0.48
440_L	447_L	1.128	0.48
613_A	622_H	1.128	0.48
101_Q	553_G	1.127	0.47
493_A	539_L	1.125	0.47
134_A	140_W	1.122	0.47
469_L	522_T	1.115	0.47
365_G	540_R	1.113	0.47
565_N	617_A	1.110	0.46
40_R	44_R	1.109	0.46
105_V	199_P	1.108	0.46
358_T	750_V	1.106	0.46
467_A	512_V	1.106	0.46
435_L	440_L	1.105	0.46
141_P	170_A	1.105	0.46
145_G	530_A	1.102	0.46
40_R	43_E	1.101	0.46
109_H	133_L	1.099	0.46
487_A	552_L	1.097	0.46
562_A	567_H	1.093	0.45
600_N	605_E	1.092	0.45
38_A	489_V	1.090	0.45
358_T	728_D	1.089	0.45
134_A	166_R	1.083	0.45
524_Q	598_T	1.083	0.45
133_L	354_L	1.081	0.45
571_L	575_Y	1.080	0.45
648_V	685_D	1.078	0.44
425_A	430_A	1.076	0.44
369_G	603_S	1.071	0.44
140_W	373_R	1.070	0.44
137_L	170_A	1.070	0.44
334_A	547_V	1.069	0.44
501_D	598_T	1.068	0.44
345_L	603_S	1.066	0.44
575_Y	652_A	1.062	0.43
596_S	601_D	1.060	0.43
598_T	726_L	1.057	0.43
499_A	502_R	1.055	0.43
404_P	408_R	1.054	0.43
607_S	727_A	1.054	0.43
460_R	602_T	1.053	0.43
596_S	600_N	1.053	0.43
129_L	379_A	1.053	0.43
524_Q	594_H	1.053	0.43
197_P	202_P	1.051	0.43
122_G	491_L	1.051	0.43
234_F	355_A	1.045	0.42
135_P	369_G	1.045	0.42
316_F	322_A	1.044	0.42
496_G	518_P	1.044	0.42
234_F	239_D	1.043	0.42
318_K	321_A	1.043	0.42
111_D	596_S	1.041	0.42
258_A	262_A	1.040	0.42
671_T	687_R	1.040	0.42
63_L	69_I	1.040	0.42
332_V	512_V	1.038	0.42
102_R	128_G	1.038	0.42
146_A	151_L	1.036	0.42
712_L	741_A	1.033	0.42
411_L	606_Y	1.032	0.42
59_T	63_L	1.032	0.42
60_A	260_L	1.030	0.42
282_T	286_F	1.029	0.41
164_R	437_G	1.029	0.41
465_D	496_G	1.026	0.41
112_C	506_M	1.024	0.41
645_D	664_L	1.024	0.41
38_A	126_G	1.023	0.41
436_S	439_D	1.023	0.41
262_A	356_F	1.021	0.41
646_A	729_D	1.020	0.41
455_V	641_L	1.018	0.41
272_V	554_S	1.018	0.41
472_A	533_T	1.016	0.41
169_L	334_A	1.015	0.41
346_E	685_D	1.013	0.41
96_L	328_D	1.012	0.40
606_Y	641_L	1.012	0.40
664_L	692_L	1.008	0.40
682_Y	686_P	1.004	0.40
346_E	377_R	1.003	0.40
256_S	570_W	1.002	0.40
242_H	353_R	0.997	0.40
238_R	241_G	0.994	0.39
689_F	742_L	0.993	0.39
524_Q	564_F	0.992	0.39
152_A	155_P	0.991	0.39
399_T	404_P	0.991	0.39
547_V	550_R	0.984	0.39
243_A	385_V	0.984	0.39
555_R	559_E	0.983	0.39
317_S	538_V	0.977	0.38
112_C	357_T	0.976	0.38
405_W	409_A	0.975	0.38
461_T	491_L	0.975	0.38
340_I	456_S	0.973	0.38
616_D	620_A	0.973	0.38
112_C	256_S	0.972	0.38
244_V	388_T	0.970	0.38
56_G	60_A	0.970	0.38
394_I	455_V	0.969	0.38
526_R	596_S	0.966	0.38
145_G	521_L	0.963	0.38
414_A	455_V	0.963	0.38
69_I	73_E	0.962	0.37
581_L	629_F	0.961	0.37
290_G	294_A	0.960	0.37
45_R	51_G	0.960	0.37
98_G	364_E	0.958	0.37
98_G	395_R	0.958	0.37
238_R	242_H	0.951	0.37
250_R	363_Y	0.949	0.37
363_Y	459_Y	0.949	0.37
363_Y	537_R	0.949	0.37
440_L	470_L	0.949	0.37
224_T	469_L	0.948	0.37
498_L	610_M	0.946	0.37
412_L	582_L	0.942	0.36
88_V	271_D	0.939	0.36
81_D	84_A	0.938	0.36
582_L	588_N	0.933	0.36
75_T	79_T	0.933	0.36
475_L	602_T	0.932	0.36
345_L	369_G	0.932	0.36
222_C	392_D	0.931	0.36
354_L	435_L	0.930	0.36
412_L	629_F	0.926	0.35
157_D	567_H	0.925	0.35
34_L	649_A	0.924	0.35
177_P	567_H	0.924	0.35
570_W	705_L	0.921	0.35
182_Y	645_D	0.920	0.35
520_V	524_Q	0.920	0.35
38_A	462_E	0.920	0.35
520_V	596_S	0.919	0.35
733_H	740_R	0.917	0.35
262_A	556_L	0.917	0.35
250_R	459_Y	0.915	0.35
250_R	537_R	0.915	0.35
459_Y	537_R	0.915	0.35
131_V	721_R	0.912	0.35
177_P	562_A	0.912	0.35
293_L	310_A	0.912	0.35
275_T	278_R	0.911	0.35
100_T	320_P	0.908	0.34
564_F	567_H	0.908	0.34
672_V	739_M	0.904	0.34
106_I	594_H	0.903	0.34
615_S	618_G	0.903	0.34
510_Q	519_D	0.902	0.34
136_P	633_I	0.901	0.34
511_R	596_S	0.901	0.34
98_G	458_H	0.900	0.34
150_G	166_R	0.897	0.34
257_V	261_A	0.897	0.34
665_S	746_L	0.896	0.34
62_T	73_E	0.895	0.34
468_R	480_L	0.894	0.34
38_A	42_N	0.894	0.34
423_A	550_R	0.893	0.34
427_P	430_A	0.892	0.34
257_V	451_F	0.891	0.33
245_V	262_A	0.890	0.33
39_E	462_E	0.889	0.33
238_R	243_A	0.889	0.33
262_A	374_F	0.889	0.33
393_P	656_C	0.886	0.33
342_V	607_S	0.884	0.33
269_G	595_L	0.884	0.33
518_P	539_L	0.884	0.33
595_L	685_D	0.884	0.33
432_Y	478_R	0.882	0.33
517_I	535_G	0.882	0.33
201_L	204_P	0.880	0.33
161_V	593_V	0.880	0.33
98_G	540_R	0.877	0.33
749_L	754_G	0.877	0.33
458_H	514_G	0.874	0.33
326_P	329_P	0.874	0.33
33_A	185_D	0.872	0.32
343_R	366_A	0.872	0.32
258_A	515_N	0.870	0.32
182_Y	293_L	0.870	0.32
665_S	689_F	0.869	0.32
722_P	731_G	0.868	0.32
224_T	447_L	0.862	0.32
468_R	472_A	0.862	0.32
285_L	634_G	0.861	0.32
356_F	470_L	0.860	0.32
351_C	460_R	0.859	0.32
463_P	604_G	0.858	0.32
166_R	373_R	0.855	0.31
552_L	612_D	0.855	0.31
388_T	559_E	0.854	0.31
392_D	555_R	0.853	0.31
510_Q	549_S	0.853	0.31
332_V	503_R	0.852	0.31
340_I	614_L	0.852	0.31
98_G	365_G	0.851	0.31
329_P	538_V	0.850	0.31
671_T	675_A	0.850	0.31
347_S	500_D	0.849	0.31
160_D	163_G	0.849	0.31
316_F	493_A	0.849	0.31
139_E	143_R	0.848	0.31
243_A	515_N	0.846	0.31
520_V	523_S	0.846	0.31
202_P	595_L	0.846	0.31
514_G	540_R	0.845	0.31
233_S	314_I	0.843	0.31
479_A	486_V	0.840	0.31
383_Q	596_S	0.839	0.31
182_Y	185_D	0.839	0.31
33_A	61_D	0.837	0.31
238_R	407_F	0.836	0.30
552_L	672_V	0.834	0.30
511_R	516_M	0.834	0.30
665_S	712_L	0.834	0.30
122_G	369_G	0.832	0.30
274_V	360_V	0.830	0.30
228_A	390_L	0.830	0.30
38_A	45_R	0.829	0.30
363_Y	395_R	0.829	0.30
283_T	725_G	0.828	0.30
564_F	571_L	0.828	0.30
315_R	578_T	0.827	0.30
476_T	494_R	0.827	0.30
414_A	637_L	0.827	0.30
271_D	315_R	0.827	0.30
297_G	521_L	0.824	0.30
235_A	664_L	0.823	0.30
114_P	452_G	0.823	0.30
454_L	602_T	0.820	0.30
234_F	331_A	0.820	0.30
333_F	503_R	0.819	0.30
354_L	589_G	0.817	0.29
133_L	581_L	0.817	0.29
391_T	558_G	0.816	0.29
451_F	603_S	0.815	0.29
112_C	397_A	0.814	0.29
248_A	571_L	0.813	0.29
548_R	674_G	0.812	0.29
316_F	451_F	0.812	0.29
117_L	354_L	0.811	0.29
159_A	388_T	0.810	0.29
499_A	643_D	0.809	0.29
263_A	333_F	0.807	0.29
607_S	665_S	0.806	0.29
457_A	693_A	0.806	0.29
363_Y	540_R	0.804	0.29
597_T	683_S	0.804	0.29
448_R	478_R	0.804	0.29
286_F	349_L	0.803	0.29
114_P	730_L	0.803	0.29
132_V	194_R	0.802	0.29
536_Y	564_F	0.802	0.29
404_P	660_P	0.799	0.29
250_R	364_E	0.798	0.29
250_R	395_R	0.798	0.29
364_E	459_Y	0.798	0.29
364_E	537_R	0.798	0.29
395_R	459_Y	0.798	0.29
395_R	537_R	0.798	0.29
266_A	497_G	0.797	0.28
401_P	613_A	0.797	0.28
60_A	283_T	0.795	0.28
177_P	614_L	0.795	0.28
652_A	707_P	0.794	0.28
99_T	278_R	0.794	0.28
200_R	501_D	0.794	0.28
492_L	536_Y	0.791	0.28
282_T	578_T	0.791	0.28
91_R	646_A	0.790	0.28
516_M	596_S	0.789	0.28
363_Y	458_H	0.788	0.28
222_C	393_P	0.788	0.28
483_D	541_I	0.786	0.28
472_A	576_G	0.786	0.28
168_R	572_G	0.785	0.28
448_R	648_V	0.784	0.28
105_V	506_M	0.784	0.28
661_S	707_P	0.781	0.28
177_P	616_D	0.781	0.28
46_M	49_L	0.779	0.28
497_G	661_S	0.778	0.28
692_L	753_H	0.777	0.27
388_T	413_G	0.777	0.27
250_R	540_R	0.777	0.27
459_Y	540_R	0.777	0.27
537_R	540_R	0.777	0.27
234_F	674_G	0.777	0.27
129_L	509_G	0.774	0.27
404_P	722_P	0.774	0.27
498_L	531_A	0.773	0.27
486_V	580_A	0.773	0.27
525_L	530_A	0.772	0.27
503_R	528_E	0.772	0.27
333_F	372_V	0.770	0.27
114_P	539_L	0.768	0.27
396_Y	461_T	0.767	0.27
554_S	557_L	0.766	0.27
35_L	39_E	0.766	0.27
282_T	409_A	0.766	0.27
319_P	584_F	0.765	0.27
104_V	237_L	0.764	0.27
37_E	57_V	0.763	0.27
252_R	403_E	0.763	0.27
250_R	458_H	0.763	0.27
458_H	537_R	0.763	0.27
453_L	457_A	0.763	0.27
234_F	237_L	0.763	0.27
446_L	481_V	0.762	0.27
469_L	477_M	0.761	0.27
451_F	460_R	0.759	0.27
413_G	487_A	0.758	0.27
415_R	448_R	0.757	0.26
512_V	523_S	0.757	0.26
316_F	454_L	0.755	0.26
509_G	512_V	0.754	0.26
277_P	360_V	0.753	0.26
332_V	613_A	0.753	0.26
52_D	55_A	0.752	0.26
262_A	316_F	0.752	0.26
396_Y	596_S	0.750	0.26
416_P	662_L	0.750	0.26
544_H	548_R	0.750	0.26
320_P	393_P	0.749	0.26
115_N	412_L	0.749	0.26
50_A	55_A	0.748	0.26
364_E	465_D	0.747	0.26
395_R	465_D	0.747	0.26
60_A	173_M	0.747	0.26
450_A	553_G	0.746	0.26
280_R	387_E	0.746	0.26
469_L	503_R	0.746	0.26
556_L	744_D	0.745	0.26
174_R	215_P	0.744	0.26
73_E	268_E	0.743	0.26
267_A	573_V	0.742	0.26
256_S	388_T	0.741	0.26
366_A	672_V	0.739	0.26
94_D	538_V	0.738	0.26
554_S	667_R	0.738	0.26
332_V	516_M	0.738	0.26
334_A	579_P	0.738	0.26
74_T	77_V	0.737	0.26
368_R	605_E	0.736	0.25
59_T	611_L	0.734	0.25
722_P	738_A	0.734	0.25
490_A	568_A	0.733	0.25
224_T	394_I	0.732	0.25
499_A	557_L	0.731	0.25
35_L	49_L	0.729	0.25
373_R	451_F	0.729	0.25
118_G	574_G	0.728	0.25
219_I	535_G	0.727	0.25
58_R	200_R	0.726	0.25
96_L	587_A	0.724	0.25
265_L	273_L	0.723	0.25
105_V	189_L	0.721	0.25
85_C	90_T	0.721	0.25
224_T	452_G	0.720	0.25
406_A	671_T	0.720	0.25
49_L	224_T	0.718	0.25
535_G	544_H	0.718	0.25
52_D	554_S	0.718	0.25
664_L	691_R	0.718	0.25
204_P	402_I	0.717	0.25
397_A	589_G	0.714	0.24
249_D	361_H	0.713	0.24
294_A	310_A	0.712	0.24
675_A	680_G	0.712	0.24
450_A	548_R	0.712	0.24
590_Y	715_G	0.711	0.24
319_P	545_P	0.710	0.24
63_L	479_A	0.710	0.24
77_V	80_Q	0.710	0.24
59_T	429_T	0.710	0.24
94_D	520_V	0.710	0.24
52_D	538_V	0.709	0.24
595_L	652_A	0.709	0.24
283_T	488_S	0.708	0.24
36_A	40_R	0.706	0.24
114_P	572_G	0.705	0.24
137_L	469_L	0.705	0.24
37_E	58_R	0.704	0.24
355_A	460_R	0.704	0.24
523_S	594_H	0.704	0.24
277_P	530_A	0.704	0.24
53_R	60_A	0.704	0.24
117_L	622_H	0.701	0.24
538_V	579_P	0.701	0.24
172_T	443_D	0.701	0.24
406_A	545_P	0.700	0.24
703_D	749_L	0.700	0.24
531_A	569_D	0.698	0.24
132_V	538_V	0.698	0.24
104_V	358_T	0.698	0.24
250_R	365_G	0.698	0.24
365_G	459_Y	0.698	0.24
365_G	537_R	0.698	0.24
441_A	470_L	0.697	0.24
599_R	651_G	0.696	0.24
745_A	749_L	0.695	0.24
582_L	754_G	0.691	0.23
710_Q	714_V	0.691	0.23
712_L	742_L	0.691	0.23
122_G	130_L	0.690	0.23
153_V	493_A	0.690	0.23
458_H	465_D	0.689	0.23
538_V	588_N	0.688	0.23
265_L	719_Q	0.688	0.23
614_L	627_G	0.687	0.23
447_L	452_G	0.684	0.23
281_N	539_L	0.683	0.23
214_V	314_I	0.683	0.23
117_L	407_F	0.682	0.23
745_A	750_V	0.682	0.23
38_A	129_L	0.680	0.23
263_A	388_T	0.678	0.23
100_T	517_I	0.677	0.23
449_E	653_L	0.676	0.23
500_D	619_R	0.675	0.23
155_P	334_A	0.674	0.23
518_P	535_G	0.673	0.23
396_Y	605_E	0.673	0.23
178_G	401_P	0.672	0.23
264_C	358_T	0.670	0.22
49_L	347_S	0.670	0.22
318_K	393_P	0.669	0.22
132_V	327_G	0.669	0.22
145_G	281_N	0.668	0.22
120_V	123_A	0.668	0.22
428_D	549_S	0.668	0.22
73_E	428_D	0.667	0.22
288_R	349_L	0.667	0.22
93_A	447_L	0.667	0.22
623_D	661_S	0.667	0.22
132_V	505_A	0.666	0.22
396_Y	519_D	0.665	0.22
199_P	749_L	0.665	0.22
340_I	498_L	0.665	0.22
644_L	695_H	0.664	0.22
675_A	743_G	0.664	0.22
465_D	540_R	0.664	0.22
521_L	657_A	0.663	0.22
444_E	572_G	0.663	0.22
553_G	584_F	0.662	0.22
120_V	594_H	0.661	0.22
163_G	507_Y	0.661	0.22
90_T	119_R	0.661	0.22
593_V	618_G	0.660	0.22
215_P	506_M	0.660	0.22
48_V	55_A	0.660	0.22
445_H	617_A	0.658	0.22
343_R	738_A	0.657	0.22
446_L	484_G	0.656	0.22
482_A	486_V	0.656	0.22
114_P	226_D	0.656	0.22
632_R	671_T	0.656	0.22
474_N	493_A	0.655	0.22
235_A	394_I	0.654	0.22
129_L	511_R	0.654	0.22
469_L	739_M	0.653	0.22
74_T	79_T	0.652	0.22
230_A	601_D	0.652	0.22
594_H	675_A	0.652	0.22
165_F	390_L	0.651	0.22
494_R	534_V	0.651	0.22
234_F	290_G	0.649	0.22
51_G	511_R	0.649	0.22
586_A	651_G	0.648	0.22
733_H	737_Q	0.647	0.22
219_I	553_G	0.647	0.22
392_D	626_A	0.647	0.22
571_L	580_A	0.646	0.21
449_E	452_G	0.646	0.21
121_V	126_G	0.645	0.21
456_S	599_R	0.645	0.21
33_A	68_P	0.644	0.21
86_E	175_A	0.644	0.21
173_M	425_A	0.643	0.21
113_R	279_R	0.643	0.21
365_G	465_D	0.642	0.21
226_D	452_G	0.642	0.21
409_A	486_V	0.642	0.21
697_L	705_L	0.641	0.21
257_V	511_R	0.641	0.21
268_E	422_V	0.640	0.21
245_V	276_A	0.640	0.21
63_L	282_T	0.640	0.21
638_S	720_A	0.640	0.21
398_G	715_G	0.639	0.21
318_K	574_G	0.638	0.21
49_L	60_A	0.638	0.21
120_V	124_V	0.638	0.21
117_L	400_D	0.637	0.21
671_T	680_G	0.636	0.21
345_L	515_N	0.636	0.21
529_A	532_T	0.635	0.21
681_M	684_V	0.635	0.21
379_A	385_V	0.635	0.21
59_T	65_D	0.634	0.21
82_A	340_I	0.633	0.21
406_A	409_A	0.631	0.21
108_L	164_R	0.631	0.21
100_T	119_R	0.630	0.21
318_K	322_A	0.630	0.21
523_S	536_Y	0.630	0.21
37_E	557_L	0.629	0.21
431_A	445_H	0.629	0.21
749_L	753_H	0.629	0.21
446_L	479_A	0.628	0.21
94_D	557_L	0.628	0.21
370_F	374_F	0.627	0.21
371_D	440_L	0.627	0.21
531_A	560_L	0.627	0.21
340_I	694_V	0.627	0.21
229_A	643_D	0.627	0.21
138_A	565_N	0.626	0.21
137_L	552_L	0.626	0.21
293_L	728_D	0.626	0.21
282_T	668_D	0.626	0.21
590_Y	613_A	0.624	0.21
471_D	576_G	0.624	0.21
249_D	484_G	0.623	0.21
103_A	573_V	0.623	0.21
182_Y	557_L	0.623	0.21
155_P	158_A	0.623	0.21
117_L	120_V	0.622	0.20
709_E	744_D	0.621	0.20
34_L	69_I	0.620	0.20
249_D	407_F	0.619	0.20
471_D	692_L	0.619	0.20
592_T	629_F	0.619	0.20
472_A	675_A	0.618	0.20
570_W	573_V	0.617	0.20
272_V	447_L	0.617	0.20
332_V	749_L	0.616	0.20
150_G	155_P	0.616	0.20
573_V	614_L	0.616	0.20
579_P	722_P	0.615	0.20
104_V	356_F	0.615	0.20
153_V	573_V	0.615	0.20
272_V	685_D	0.615	0.20
593_V	669_W	0.615	0.20
394_I	544_H	0.612	0.20
716_A	726_L	0.612	0.20
58_R	456_S	0.612	0.20
645_D	722_P	0.611	0.20
343_R	578_T	0.611	0.20
84_A	595_L	0.610	0.20
122_G	470_L	0.610	0.20
349_L	354_L	0.610	0.20
48_V	85_C	0.609	0.20
114_P	405_W	0.609	0.20
458_H	516_M	0.609	0.20
589_G	689_F	0.608	0.20
573_V	603_S	0.608	0.20
461_T	511_R	0.608	0.20
577_A	582_L	0.608	0.20
276_A	550_R	0.608	0.20
173_M	473_P	0.607	0.20
327_G	351_C	0.606	0.20
538_V	747_Q	0.606	0.20
52_D	65_D	0.606	0.20
368_R	392_D	0.605	0.20
218_A	264_C	0.604	0.20
197_P	731_G	0.604	0.20
79_T	142_T	0.604	0.20
201_L	579_P	0.604	0.20
122_G	511_R	0.603	0.20
385_V	413_G	0.603	0.20
333_F	385_V	0.600	0.20
538_V	671_T	0.600	0.20
540_R	604_G	0.600	0.20
502_R	520_V	0.600	0.20
40_R	418_V	0.597	0.19
129_L	749_L	0.596	0.19
131_V	598_T	0.595	0.19
408_R	450_A	0.595	0.19
228_A	571_L	0.594	0.19
560_L	742_L	0.594	0.19
526_R	594_H	0.593	0.19
329_P	739_M	0.592	0.19
99_T	598_T	0.592	0.19
114_P	413_G	0.591	0.19
357_T	360_V	0.591	0.19
390_L	687_R	0.590	0.19
556_L	560_L	0.590	0.19
38_A	682_Y	0.589	0.19
246_A	580_A	0.588	0.19
690_R	719_Q	0.587	0.19
263_A	611_L	0.587	0.19
430_A	480_L	0.586	0.19
270_H	330_D	0.586	0.19
735_A	743_G	0.585	0.19
33_A	37_E	0.583	0.19
401_P	569_D	0.583	0.19
242_H	245_V	0.583	0.19
394_I	534_V	0.582	0.19
93_A	472_A	0.581	0.19
122_G	407_F	0.581	0.19
452_G	455_V	0.579	0.19
405_W	545_P	0.578	0.19
680_G	743_G	0.578	0.19
575_Y	644_L	0.577	0.19
400_D	683_S	0.577	0.19
479_A	485_H	0.577	0.19
61_D	66_D	0.577	0.19
342_V	371_D	0.576	0.19
101_Q	123_A	0.576	0.19
65_D	81_D	0.576	0.19
101_Q	256_S	0.575	0.19
263_A	292_L	0.575	0.19
182_Y	221_A	0.575	0.19
485_H	555_R	0.575	0.19
583_S	687_R	0.575	0.19
452_G	663_A	0.573	0.19
78_A	82_A	0.573	0.19
689_F	753_H	0.573	0.19
93_A	116_A	0.571	0.18
458_H	604_G	0.571	0.18
473_P	629_F	0.569	0.18
391_T	398_G	0.569	0.18
220_D	393_P	0.569	0.18
263_A	547_V	0.568	0.18
729_D	750_V	0.567	0.18
124_V	603_S	0.566	0.18
516_M	540_R	0.565	0.18
101_Q	609_I	0.565	0.18
242_H	414_A	0.565	0.18
116_A	276_A	0.562	0.18
128_G	258_A	0.561	0.18
535_G	625_H	0.561	0.18
164_R	471_D	0.560	0.18
519_D	594_H	0.560	0.18
562_A	623_D	0.560	0.18
42_N	397_A	0.560	0.18
493_A	572_G	0.559	0.18
163_G	486_V	0.559	0.18
446_L	450_A	0.559	0.18
322_A	734_S	0.559	0.18
314_I	683_S	0.558	0.18
262_A	289_A	0.557	0.18
40_R	105_V	0.557	0.18
52_D	67_L	0.556	0.18
467_A	530_A	0.556	0.18
44_R	48_V	0.555	0.18
175_A	376_D	0.555	0.18
76_L	167_R	0.555	0.18
367_G	403_E	0.553	0.18
361_H	455_V	0.553	0.18
426_T	442_A	0.553	0.18
153_V	373_R	0.552	0.18
101_Q	288_R	0.552	0.18
115_N	535_G	0.552	0.18
329_P	628_W	0.551	0.18
96_L	104_V	0.551	0.18
344_L	578_T	0.551	0.18
110_E	146_A	0.550	0.18
429_T	731_G	0.550	0.18
103_A	120_V	0.550	0.18
489_V	682_Y	0.550	0.18
161_V	595_L	0.550	0.18
461_T	530_A	0.549	0.18
658_T	752_A	0.549	0.18
115_N	272_V	0.549	0.18
337_A	365_G	0.548	0.18
340_I	533_T	0.548	0.18
152_A	373_R	0.547	0.18
639_D	682_Y	0.546	0.18
226_D	518_P	0.546	0.18
686_P	742_L	0.546	0.18
361_H	412_L	0.546	0.18
271_D	350_D	0.545	0.18
699_A	746_L	0.545	0.18
539_L	572_G	0.545	0.18
177_P	225_P	0.544	0.18
364_E	496_G	0.543	0.17
395_R	496_G	0.543	0.17
223_V	256_S	0.542	0.17
440_L	641_L	0.542	0.17
355_A	489_V	0.541	0.17
143_R	515_N	0.541	0.17
244_V	450_A	0.539	0.17
66_D	546_A	0.539	0.17
199_P	529_A	0.539	0.17
86_E	101_Q	0.538	0.17
432_Y	480_L	0.537	0.17
150_G	278_R	0.537	0.17
410_L	515_N	0.537	0.17
37_E	82_A	0.536	0.17
215_P	434_A	0.535	0.17
188_T	198_A	0.535	0.17
336_E	359_T	0.534	0.17
715_G	742_L	0.533	0.17
202_P	616_D	0.533	0.17
220_D	722_P	0.533	0.17
251_G	336_E	0.533	0.17
253_G	336_E	0.533	0.17
254_K	336_E	0.533	0.17
366_A	597_T	0.532	0.17
444_E	619_R	0.532	0.17
603_S	681_M	0.531	0.17
428_D	435_L	0.531	0.17
357_T	468_R	0.531	0.17
99_T	112_C	0.531	0.17
506_M	512_V	0.530	0.17
80_Q	356_F	0.530	0.17
380_D	575_Y	0.530	0.17
475_L	535_G	0.529	0.17
456_S	633_I	0.529	0.17
110_E	405_W	0.529	0.17
596_S	690_R	0.529	0.17
213_D	388_T	0.528	0.17
287_A	291_A	0.528	0.17
340_I	350_D	0.525	0.17
665_S	725_G	0.525	0.17
42_N	45_R	0.525	0.17
283_T	382_T	0.525	0.17
480_L	557_L	0.525	0.17
132_V	543_T	0.524	0.17
553_G	718_L	0.524	0.17
114_P	440_L	0.524	0.17
69_I	128_G	0.522	0.17
241_G	266_A	0.522	0.17
273_L	317_S	0.522	0.17
108_L	111_D	0.521	0.17
538_V	659_T	0.521	0.17
62_T	171_D	0.521	0.17
224_T	463_P	0.520	0.17
461_T	603_S	0.520	0.17
113_R	636_V	0.520	0.17
181_I	442_A	0.520	0.17
169_L	551_G	0.519	0.17
417_A	643_D	0.519	0.17
498_L	534_V	0.519	0.17
372_V	581_L	0.518	0.17
115_N	378_L	0.518	0.17
477_M	577_A	0.518	0.17
374_F	473_P	0.518	0.17
65_D	80_Q	0.518	0.17
92_N	525_L	0.518	0.17
63_L	397_A	0.517	0.17
180_A	408_R	0.517	0.17
134_A	410_L	0.517	0.17
89_P	92_N	0.517	0.17
69_I	195_T	0.517	0.17
619_R	731_G	0.516	0.17
286_F	452_G	0.516	0.17
114_P	128_G	0.515	0.16
244_V	577_A	0.515	0.16
299_L	521_L	0.515	0.16
369_G	608_A	0.515	0.16
48_V	106_I	0.514	0.16
414_A	599_R	0.514	0.16
414_A	528_E	0.514	0.16
58_R	73_E	0.513	0.16
444_E	681_M	0.513	0.16
516_M	519_D	0.512	0.16
293_L	382_T	0.512	0.16
460_R	594_H	0.512	0.16
552_L	662_L	0.512	0.16
39_E	565_N	0.512	0.16
406_A	550_R	0.511	0.16
476_T	492_L	0.510	0.16
130_L	461_T	0.510	0.16
251_G	359_T	0.510	0.16
253_G	359_T	0.510	0.16
254_K	359_T	0.510	0.16
518_P	569_D	0.510	0.16
56_G	622_H	0.509	0.16
332_V	451_F	0.509	0.16
467_A	594_H	0.509	0.16
246_A	555_R	0.508	0.16
62_T	712_L	0.508	0.16
419_E	422_V	0.508	0.16
224_T	400_D	0.507	0.16
230_A	683_S	0.507	0.16
116_A	346_E	0.506	0.16
260_L	450_A	0.506	0.16
36_A	105_V	0.505	0.16
115_N	349_L	0.505	0.16
134_A	633_I	0.505	0.16
165_F	511_R	0.505	0.16
517_I	538_V	0.504	0.16
369_G	383_Q	0.504	0.16
608_A	688_P	0.504	0.16
53_R	56_G	0.504	0.16
528_E	626_A	0.503	0.16
273_L	326_P	0.503	0.16
34_L	264_C	0.503	0.16
234_F	238_R	0.502	0.16
239_D	243_A	0.502	0.16
268_E	299_L	0.502	0.16
251_G	254_K	0.502	0.16
98_G	363_Y	0.501	0.16
366_A	739_M	0.501	0.16
224_T	450_A	0.501	0.16
413_G	464_N	0.501	0.16
393_P	523_S	0.501	0.16
714_V	718_L	0.501	0.16
62_T	246_A	0.500	0.16
46_M	90_T	0.500	0.16

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zpaA	1	0.8555	100	0.43	Contact Map
2reeA	1	0.2174	99.5	0.934	Contact Map
3c26A	2	0.3047	99.4	0.94	Contact Map
1z4rA	1	0.2005	99.3	0.942	Contact Map
1kzfA	1	0.2383	99.2	0.945	Contact Map
1m4iA	2	0.2279	99.2	0.946	Contact Map
1n71A	4	0.1927	99.2	0.946	Contact Map
3d8pA	1	0.1914	99.1	0.946	Contact Map
1yghA	1	0.2044	99.1	0.947	Contact Map
4znkA	1	0.2904	99.1	0.947	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0168 seconds.