HUTU - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

HUTU - Probable urocanate hydratase

UniProt:	Q9HQD8	Sequences: MDTPSAAAETSEPSAQWQAYRGAPTGTDIECEGWRQEAALRMLNNNLDPEVAEDPENLVVYGGTGQAARSWDAYDAILDELRTLADAETLLVQSGKPVGVFETHERAPSVLIANSNLVGNWADWEQFHELEAEGKIMYGQMTAGSWAYIGTQGIIQGTFETLAELARDHYPDNDGLRGKIVATAGLGGMGGAQPLAVTMNHGVCIAAEVDEARIDRRIETGYCMERTDDLGEAIERATAAAEAGDPYSVGVHGNAADVLEGMLDRDFVPDVVTDQTSAHDELAGYYPSGYTVADADELRDEDPDAYREASMDTMARHVAAVLAMQDAGAVAFEYGNNIRGQVAAHRGDVTTTAGESHDPFDFPGFVPAYIRPLFCRGKGPFRWVALSGNPADIHRTDRAVTELFPEKDDLHRWIDLAQEHVQFQGLPSRVCWLGYCAADDDLTERARFAVRINELVDNGEIEAPIVVTRDHLDAGSVASPNRETEAMRDGTDAVADWPILNALLNTAAGADIVSVHNGGGVGIGNSLHTNNHVVLDGSDAAAETARRVFTTDPGMGVIRHADAGYADALVEADASGVTVPMRDAEREQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	588 (542)
Sequences:	1205 (343)
Seq/√Len:	14.7

BACSU - HUTU
HALSA - HUTU

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
33_G	36_Q	4.826	1.00
54_D	57_N	4.805	1.00
215_D	219_E	3.962	1.00
197_V	202_G	3.893	1.00
223_C	250_G	3.782	1.00
457_D	542_A	3.738	1.00
225_E	236_R	3.653	0.99
395_R	460_E	3.646	0.99
499_I	515_V	3.394	0.99
395_R	455_L	3.370	0.99
165_L	271_V	3.347	0.99
136_I	494_V	3.280	0.99
305_A	309_A	3.164	0.98
297_E	301_E	3.144	0.98
70_S	73_A	3.138	0.98
221_G	422_Q	3.093	0.98
155_I	421_V	3.092	0.98
80_E	100_V	3.088	0.98
461_I	465_I	3.068	0.98
126_Q	129_E	2.918	0.97
177_R	244_G	2.879	0.97
182_A	259_L	2.839	0.97
257_D	288_S	2.809	0.97
32_E	85_A	2.791	0.96
231_G	265_R	2.775	0.96
240_A	247_Y	2.727	0.96
323_A	327_A	2.721	0.96
211_E	215_D	2.711	0.96
99_G	558_I	2.665	0.95
205_I	237_A	2.598	0.95
261_G	264_D	2.572	0.94
40_L	78_L	2.562	0.94
261_G	265_R	2.525	0.94
44_N	78_L	2.496	0.93
305_A	308_E	2.488	0.93
113_A	116_N	2.482	0.93
232_E	236_R	2.445	0.93
495_A	527_L	2.435	0.92
508_A	551_T	2.433	0.92
260_E	316_R	2.395	0.92
182_A	324_M	2.379	0.91
35_R	511_D	2.370	0.91
227_T	236_R	2.341	0.91
455_L	461_I	2.333	0.91
25_T	50_E	2.332	0.91
239_A	243_A	2.330	0.91
215_D	226_R	2.304	0.90
399_A	451_R	2.298	0.90
457_D	539_D	2.239	0.89
338_I	362_F	2.238	0.89
184_A	255_A	2.197	0.88
151_T	155_I	2.182	0.87
129_E	133_E	2.163	0.87
180_I	267_F	2.159	0.87
407_K	444_E	2.152	0.87
71_W	74_Y	2.103	0.85
106_R	543_E	2.089	0.85
211_E	226_R	2.072	0.84
197_V	204_C	2.072	0.84
36_Q	39_A	2.061	0.84
302_D	305_A	2.036	0.83
169_H	330_V	2.033	0.83
394_H	418_Q	2.016	0.83
358_D	361_D	2.014	0.83
22_G	25_T	2.013	0.83
76_A	79_D	2.010	0.83
19_A	75_D	2.001	0.82
203_V	249_V	1.992	0.82
286_Y	295_A	1.987	0.82
83_T	578_T	1.984	0.82
180_I	237_A	1.981	0.82
272_V	331_A	1.949	0.80
315_A	347_G	1.941	0.80
474_A	557_V	1.936	0.80
21_R	74_Y	1.928	0.80
389_N	462_E	1.921	0.79
126_Q	494_V	1.914	0.79
226_R	252_H	1.887	0.78
448_F	452_I	1.876	0.78
166_A	202_G	1.873	0.78
533_V	545_A	1.871	0.78
43_L	78_L	1.866	0.77
319_A	323_A	1.859	0.77
323_A	326_D	1.858	0.77
151_T	421_V	1.856	0.77
164_E	167_R	1.837	0.76
101_F	554_G	1.827	0.76
455_L	460_E	1.827	0.76
391_A	394_H	1.823	0.76
454_E	458_N	1.793	0.74
535_L	545_A	1.792	0.74
207_A	259_L	1.783	0.74
33_G	39_A	1.775	0.74
40_L	44_N	1.774	0.74
164_E	168_D	1.770	0.73
540_A	544_T	1.767	0.73
260_E	264_D	1.767	0.73
237_A	249_V	1.748	0.73
101_F	504_L	1.739	0.72
251_V	258_V	1.727	0.72
86_D	105_E	1.726	0.72
290_Y	309_A	1.717	0.71
515_V	527_L	1.716	0.71
214_I	252_H	1.713	0.71
263_L	323_A	1.691	0.70
401_T	415_D	1.685	0.70
311_M	341_Q	1.679	0.69
321_V	331_A	1.672	0.69
180_I	205_I	1.671	0.69
203_V	237_A	1.666	0.69
208_E	252_H	1.654	0.68
207_A	253_G	1.652	0.68
30_E	82_R	1.640	0.67
309_A	312_D	1.622	0.67
92_V	146_W	1.617	0.66
450_V	542_A	1.611	0.66
567_D	570_V	1.609	0.66
263_L	327_A	1.606	0.66
390_P	427_P	1.594	0.65
502_A	515_V	1.586	0.65
126_Q	136_I	1.580	0.64
395_R	458_N	1.568	0.64
326_D	358_D	1.555	0.63
207_A	258_V	1.539	0.62
229_D	232_E	1.535	0.62
104_H	107_A	1.534	0.62
186_L	208_E	1.533	0.62
227_T	233_A	1.533	0.62
399_A	455_L	1.529	0.62
211_E	228_D	1.527	0.62
19_A	74_Y	1.525	0.62
64_T	523_I	1.523	0.62
259_L	317_H	1.518	0.61
365_F	472_L	1.515	0.61
123_D	126_Q	1.514	0.61
180_I	241_A	1.509	0.61
401_T	414_I	1.502	0.60
398_R	418_Q	1.496	0.60
531_N	545_A	1.494	0.60
116_N	499_I	1.492	0.60
186_L	223_C	1.484	0.59
322_L	347_G	1.470	0.59
225_E	232_E	1.466	0.58
209_V	286_Y	1.466	0.58
80_E	90_L	1.450	0.58
504_L	555_M	1.440	0.57
521_V	526_S	1.437	0.57
324_M	331_A	1.434	0.57
33_G	86_D	1.429	0.56
198_T	224_M	1.417	0.56
117_L	130_L	1.393	0.54
543_E	546_R	1.392	0.54
53_E	188_G	1.387	0.54
288_S	316_R	1.383	0.54
38_A	534_V	1.380	0.54
116_N	527_L	1.376	0.54
400_V	448_F	1.372	0.53
446_A	550_T	1.365	0.53
181_V	271_V	1.357	0.52
205_I	262_M	1.354	0.52
263_L	324_M	1.354	0.52
194_P	206_A	1.346	0.52
340_G	344_A	1.345	0.52
238_T	241_A	1.344	0.52
177_R	201_H	1.341	0.52
166_A	176_L	1.340	0.52
236_R	247_Y	1.337	0.51
39_A	511_D	1.317	0.50
129_E	132_A	1.312	0.50
398_R	402_E	1.312	0.50
234_I	262_M	1.309	0.50
508_A	533_V	1.306	0.50
105_E	540_A	1.298	0.49
503_L	506_T	1.296	0.49
214_I	226_R	1.292	0.49
237_A	258_V	1.289	0.49
555_M	558_I	1.289	0.49
343_A	357_H	1.276	0.48
106_R	540_A	1.275	0.48
281_E	314_M	1.274	0.48
194_P	248_S	1.263	0.47
186_L	252_H	1.263	0.47
234_I	258_V	1.262	0.47
147_A	468_T	1.246	0.46
23_A	426_L	1.240	0.46
116_N	515_V	1.234	0.46
281_E	341_Q	1.229	0.45
404_F	448_F	1.225	0.45
568_A	572_A	1.220	0.45
210_D	213_R	1.213	0.44
175_G	201_H	1.212	0.44
341_Q	344_A	1.209	0.44
120_N	525_N	1.204	0.44
66_Q	131_E	1.203	0.44
166_A	175_G	1.198	0.44
122_A	517_N	1.197	0.44
247_Y	291_T	1.196	0.44
236_R	245_D	1.192	0.43
64_T	131_E	1.187	0.43
176_L	202_G	1.185	0.43
272_V	324_M	1.184	0.43
539_D	543_E	1.181	0.43
101_F	558_I	1.175	0.42
163_A	200_N	1.158	0.41
68_A	77_I	1.157	0.41
41_R	426_L	1.153	0.41
474_A	555_M	1.151	0.41
207_A	260_E	1.139	0.40
85_A	100_V	1.132	0.40
362_F	368_A	1.130	0.40
79_D	83_T	1.128	0.40
128_H	131_E	1.127	0.40
510_A	513_V	1.125	0.40
540_A	543_E	1.120	0.39
84_L	100_V	1.120	0.39
384_V	428_S	1.114	0.39
21_R	44_N	1.105	0.39
24_P	44_N	1.095	0.38
198_T	204_C	1.092	0.38
131_E	523_I	1.091	0.38
205_I	229_D	1.086	0.38
395_R	461_I	1.085	0.38
291_T	294_D	1.085	0.38
228_D	232_E	1.077	0.37
247_Y	420_H	1.070	0.37
93_Q	500_L	1.059	0.36
216_R	219_E	1.052	0.36
263_L	268_V	1.049	0.36
414_I	452_I	1.037	0.35
73_A	96_K	1.034	0.35
197_V	203_V	1.034	0.35
456_V	461_I	1.032	0.35
571_E	575_S	1.026	0.35
181_V	197_V	1.025	0.35
183_T	206_A	1.022	0.34
539_D	542_A	1.019	0.34
74_Y	465_I	1.017	0.34
321_V	362_F	1.007	0.34
31_C	82_R	1.006	0.34
259_L	272_V	1.004	0.33
181_V	202_G	1.000	0.33
308_E	312_D	0.999	0.33
238_T	242_E	0.996	0.33
455_L	458_N	0.994	0.33
268_V	324_M	0.992	0.33
403_L	451_R	0.992	0.33
44_N	74_Y	0.992	0.33
401_T	411_H	0.989	0.33
117_L	123_D	0.988	0.33
308_E	539_D	0.983	0.32
182_A	262_M	0.983	0.32
214_I	250_G	0.982	0.32
36_Q	86_D	0.978	0.32
138_Y	526_S	0.976	0.32
340_G	525_N	0.976	0.32
452_I	467_V	0.974	0.32
85_A	88_E	0.973	0.32
71_W	78_L	0.973	0.32
207_A	256_A	0.972	0.32
343_A	358_D	0.971	0.32
54_D	59_V	0.971	0.32
231_G	261_G	0.968	0.32
74_Y	78_L	0.968	0.32
391_A	462_E	0.967	0.32
542_A	546_R	0.964	0.32
257_D	289_G	0.963	0.31
205_I	249_V	0.959	0.31
31_C	37_E	0.959	0.31
372_P	375_C	0.959	0.31
295_A	306_Y	0.957	0.31
399_A	452_I	0.955	0.31
207_A	272_V	0.955	0.31
416_L	419_E	0.954	0.31
344_A	525_N	0.952	0.31
87_A	105_E	0.947	0.31
504_L	558_I	0.946	0.31
136_I	523_I	0.946	0.31
225_E	247_Y	0.946	0.31
120_N	123_D	0.945	0.31
218_I	226_R	0.940	0.30
198_T	420_H	0.935	0.30
34_W	37_E	0.932	0.30
454_E	460_E	0.929	0.30
126_Q	133_E	0.925	0.30
64_T	128_H	0.924	0.30
179_K	270_D	0.924	0.30
36_Q	511_D	0.923	0.30
488_R	566_A	0.921	0.30
229_D	236_R	0.915	0.29
231_G	534_V	0.912	0.29
197_V	201_H	0.908	0.29
201_H	246_P	0.908	0.29
166_A	515_V	0.906	0.29
474_A	571_E	0.901	0.29
395_R	462_E	0.897	0.28
499_I	527_L	0.894	0.28
80_E	83_T	0.893	0.28
227_T	232_E	0.889	0.28
116_N	495_A	0.886	0.28
40_L	43_L	0.882	0.28
66_Q	231_G	0.881	0.28
340_G	481_N	0.880	0.28
255_A	338_I	0.879	0.28
166_A	200_N	0.879	0.28
386_L	466_V	0.879	0.28
180_I	203_V	0.873	0.27
182_A	272_V	0.872	0.27
77_I	90_L	0.871	0.27
319_A	347_G	0.869	0.27
139_G	520_G	0.867	0.27
454_E	542_A	0.865	0.27
21_R	71_W	0.863	0.27
211_E	252_H	0.862	0.27
175_G	200_N	0.861	0.27
165_L	170_Y	0.860	0.27
87_A	102_E	0.859	0.27
234_I	261_G	0.858	0.27
286_Y	296_D	0.857	0.27
183_T	204_C	0.857	0.27
144_G	333_E	0.856	0.27
318_V	338_I	0.855	0.27
96_K	562_D	0.854	0.26
115_S	136_I	0.846	0.26
155_I	216_R	0.841	0.26
414_I	527_L	0.840	0.26
257_D	260_E	0.840	0.26
103_T	504_L	0.837	0.26
246_P	420_H	0.837	0.26
194_P	456_V	0.836	0.26
221_G	419_E	0.836	0.26
88_E	100_V	0.833	0.26
259_L	331_A	0.832	0.26
39_A	512_I	0.831	0.26
268_V	329_A	0.830	0.25
182_A	255_A	0.828	0.25
450_V	457_D	0.828	0.25
363_P	368_A	0.828	0.25
166_A	179_K	0.827	0.25
40_L	82_R	0.824	0.25
310_S	315_A	0.823	0.25
262_M	269_P	0.822	0.25
42_M	466_V	0.820	0.25
106_R	544_T	0.819	0.25
102_E	546_R	0.819	0.25
197_V	200_N	0.818	0.25
263_L	320_A	0.818	0.25
63_G	109_S	0.817	0.25
141_M	479_S	0.816	0.25
33_G	511_D	0.816	0.25
399_A	403_L	0.815	0.25
104_H	544_T	0.812	0.25
34_W	41_R	0.811	0.25
26_G	34_W	0.811	0.25
395_R	399_A	0.810	0.25
225_E	239_A	0.808	0.25
257_D	316_R	0.807	0.25
561_A	569_L	0.805	0.24
307_R	311_M	0.804	0.24
257_D	262_M	0.803	0.24
395_R	398_R	0.799	0.24
111_L	502_A	0.795	0.24
294_D	297_E	0.792	0.24
24_P	30_E	0.790	0.24
393_I	423_F	0.787	0.24
499_I	502_A	0.786	0.24
290_Y	297_E	0.786	0.24
194_P	223_C	0.782	0.23
213_R	277_S	0.782	0.23
451_R	454_E	0.781	0.23
171_P	174_D	0.781	0.23
402_E	539_D	0.780	0.23
449_A	549_F	0.777	0.23
78_L	82_R	0.775	0.23
128_H	132_A	0.775	0.23
131_E	494_V	0.773	0.23
561_A	579_V	0.770	0.23
169_H	332_F	0.770	0.23
288_S	320_A	0.768	0.23
384_V	566_A	0.767	0.23
155_I	338_I	0.764	0.23
52_A	62_G	0.763	0.23
458_N	461_I	0.762	0.23
203_V	247_Y	0.762	0.23
297_E	302_D	0.761	0.23
230_L	251_V	0.760	0.23
31_C	36_Q	0.760	0.23
100_V	363_P	0.759	0.23
258_V	261_G	0.758	0.23
399_A	448_F	0.757	0.23
411_H	415_D	0.757	0.23
396_T	452_I	0.755	0.22
337_N	525_N	0.753	0.22
31_C	40_L	0.753	0.22
114_N	144_G	0.752	0.22
211_E	292_V	0.752	0.22
313_T	407_K	0.747	0.22
298_L	465_I	0.746	0.22
479_S	521_V	0.745	0.22
228_D	236_R	0.743	0.22
334_Y	482_R	0.743	0.22
145_S	514_S	0.743	0.22
256_A	260_E	0.742	0.22
113_A	527_L	0.742	0.22
66_Q	128_H	0.742	0.22
230_L	234_I	0.741	0.22
488_R	569_L	0.740	0.22
391_A	395_R	0.740	0.22
50_E	219_E	0.739	0.22
184_A	204_C	0.738	0.22
503_L	515_V	0.737	0.22
286_Y	306_Y	0.737	0.22
236_R	249_V	0.734	0.22
31_C	208_E	0.734	0.22
138_Y	499_I	0.732	0.22
277_S	362_F	0.732	0.22
221_G	420_H	0.731	0.22
558_I	577_V	0.727	0.21
179_K	197_V	0.725	0.21
295_A	299_R	0.725	0.21
151_T	338_I	0.725	0.21
174_D	408_D	0.720	0.21
334_Y	483_E	0.720	0.21
571_E	574_A	0.718	0.21
268_V	327_A	0.718	0.21
567_D	571_E	0.716	0.21
219_E	226_R	0.716	0.21
289_G	312_D	0.715	0.21
495_A	523_I	0.714	0.21
119_G	495_A	0.714	0.21
223_C	252_H	0.713	0.21
312_D	570_V	0.713	0.21
395_R	451_R	0.712	0.21
365_F	432_W	0.710	0.21
219_E	398_R	0.707	0.21
37_E	41_R	0.704	0.21
575_S	578_T	0.703	0.20
208_E	533_V	0.702	0.20
80_E	578_T	0.701	0.20
446_A	450_V	0.699	0.20
302_D	308_E	0.698	0.20
165_L	263_L	0.698	0.20
182_A	370_I	0.696	0.20
162_L	506_T	0.695	0.20
375_C	468_T	0.695	0.20
315_A	319_A	0.694	0.20
414_I	554_G	0.693	0.20
310_S	314_M	0.693	0.20
145_S	512_I	0.693	0.20
177_R	243_A	0.692	0.20
427_P	485_E	0.691	0.20
400_V	407_K	0.690	0.20
106_R	533_V	0.689	0.20
260_E	313_T	0.686	0.20
30_E	40_L	0.686	0.20
538_S	542_A	0.685	0.20
169_H	544_T	0.684	0.20
298_L	305_A	0.684	0.20
56_E	257_D	0.683	0.20
59_V	514_S	0.683	0.20
171_P	574_A	0.682	0.20
209_V	258_V	0.681	0.20
225_E	229_D	0.679	0.20
372_P	376_R	0.679	0.20
290_Y	298_L	0.679	0.20
35_R	534_V	0.678	0.20
113_A	256_A	0.678	0.20
220_T	422_Q	0.676	0.20
237_A	241_A	0.676	0.20
450_V	454_E	0.676	0.20
288_S	313_T	0.676	0.20
378_K	474_A	0.671	0.19
232_E	249_V	0.670	0.19
129_E	357_H	0.669	0.19
332_F	515_V	0.668	0.19
186_L	214_I	0.668	0.19
482_R	522_G	0.667	0.19
105_E	506_T	0.667	0.19
272_V	320_A	0.667	0.19
403_L	448_F	0.667	0.19
403_L	411_H	0.667	0.19
365_F	375_C	0.667	0.19
235_E	309_A	0.665	0.19
99_G	555_M	0.665	0.19
256_A	272_V	0.664	0.19
259_L	324_M	0.663	0.19
505_N	548_V	0.663	0.19
66_Q	75_D	0.662	0.19
404_F	444_E	0.661	0.19
234_I	263_L	0.661	0.19
174_D	304_D	0.661	0.19
62_G	65_G	0.661	0.19
325_Q	329_A	0.660	0.19
230_L	534_V	0.660	0.19
202_G	237_A	0.659	0.19
87_A	566_A	0.659	0.19
165_L	369_Y	0.658	0.19
206_A	214_I	0.657	0.19
318_V	342_V	0.654	0.19
64_T	136_I	0.654	0.19
232_E	402_E	0.654	0.19
73_A	208_E	0.652	0.19
60_V	67_A	0.650	0.19
299_R	306_Y	0.650	0.19
144_G	516_H	0.650	0.19
223_C	452_I	0.648	0.19
533_V	538_S	0.648	0.19
447_R	455_L	0.647	0.19
207_A	251_V	0.647	0.19
511_D	527_L	0.647	0.19
184_A	207_A	0.647	0.19
316_R	319_A	0.646	0.18
462_E	465_I	0.646	0.18
66_Q	70_S	0.646	0.18
297_E	308_E	0.645	0.18
535_L	542_A	0.645	0.18
334_Y	522_G	0.645	0.18
450_V	546_R	0.643	0.18
57_N	188_G	0.643	0.18
243_A	465_I	0.643	0.18
175_G	179_K	0.642	0.18
161_T	483_E	0.642	0.18
119_G	186_L	0.642	0.18
92_V	302_D	0.642	0.18
18_Q	21_R	0.641	0.18
177_R	242_E	0.641	0.18
207_A	320_A	0.641	0.18
207_A	384_V	0.640	0.18
511_D	534_V	0.640	0.18
29_I	40_L	0.640	0.18
234_I	320_A	0.639	0.18
340_G	343_A	0.638	0.18
282_L	307_R	0.636	0.18
234_I	241_A	0.634	0.18
59_V	267_F	0.633	0.18
103_T	508_A	0.633	0.18
400_V	451_R	0.631	0.18
107_A	521_V	0.630	0.18
166_A	197_V	0.628	0.18
479_S	482_R	0.627	0.18
62_G	140_Q	0.627	0.18
250_G	564_G	0.625	0.18
181_V	273_T	0.625	0.18
378_K	508_A	0.624	0.18
169_H	337_N	0.622	0.18
217_R	430_V	0.622	0.18
105_E	544_T	0.622	0.18
113_A	499_I	0.621	0.18
298_L	306_Y	0.619	0.18
70_S	96_K	0.618	0.18
225_E	245_D	0.618	0.18
403_L	406_E	0.617	0.18
378_K	448_F	0.617	0.18
208_E	343_A	0.617	0.18
414_I	448_F	0.617	0.18
161_T	334_Y	0.617	0.18
207_A	244_G	0.617	0.18
33_G	84_L	0.616	0.18
405_P	415_D	0.616	0.18
277_S	333_E	0.615	0.17
277_S	396_T	0.613	0.17
91_L	514_S	0.613	0.17
199_M	259_L	0.612	0.17
304_D	312_D	0.612	0.17
170_Y	330_V	0.612	0.17
214_I	218_I	0.609	0.17
177_R	245_D	0.609	0.17
184_A	538_S	0.608	0.17
182_A	331_A	0.608	0.17
340_G	345_H	0.607	0.17
449_A	531_N	0.606	0.17
504_L	551_T	0.604	0.17
44_N	372_P	0.604	0.17
372_P	563_A	0.604	0.17
99_G	448_F	0.604	0.17
255_A	259_L	0.604	0.17
319_A	570_V	0.604	0.17
165_L	465_I	0.603	0.17
256_A	320_A	0.601	0.17
147_A	372_P	0.601	0.17
314_M	338_I	0.600	0.17
36_Q	40_L	0.599	0.17
23_A	41_R	0.599	0.17
169_H	369_Y	0.597	0.17
124_W	500_L	0.597	0.17
452_I	511_D	0.597	0.17
230_L	262_M	0.597	0.17
305_A	319_A	0.597	0.17
236_R	239_A	0.596	0.17
59_V	296_D	0.596	0.17
98_V	485_E	0.596	0.17
306_Y	337_N	0.595	0.17
35_R	86_D	0.595	0.17
476_S	560_H	0.593	0.17
130_L	493_A	0.593	0.17
332_F	456_V	0.593	0.17
197_V	452_I	0.592	0.17
485_E	500_L	0.592	0.17
121_W	493_A	0.591	0.17
170_Y	271_V	0.591	0.17
147_A	532_H	0.590	0.17
233_A	251_V	0.589	0.17
403_L	452_I	0.589	0.17
432_W	472_L	0.589	0.17
408_D	415_D	0.588	0.17
179_K	202_G	0.587	0.17
197_V	206_A	0.586	0.17
59_V	116_N	0.586	0.17
474_A	504_L	0.585	0.17
44_N	71_W	0.584	0.17
28_D	183_T	0.584	0.17
168_D	368_A	0.584	0.17
250_G	324_M	0.584	0.17
59_V	64_T	0.584	0.17
286_Y	299_R	0.583	0.16
384_V	468_T	0.582	0.16
99_G	277_S	0.582	0.16
141_M	154_I	0.582	0.16
399_A	405_P	0.581	0.16
263_L	312_D	0.581	0.16
405_P	411_H	0.581	0.16
101_F	461_I	0.580	0.16
403_L	447_R	0.580	0.16
182_A	234_I	0.579	0.16
228_D	252_H	0.579	0.16
566_A	570_V	0.579	0.16
141_M	482_R	0.579	0.16
205_I	246_P	0.577	0.16
385_A	393_I	0.577	0.16
180_I	204_C	0.577	0.16
119_G	517_N	0.577	0.16
414_I	495_A	0.576	0.16
87_A	488_R	0.576	0.16
283_A	299_R	0.575	0.16
421_V	444_E	0.575	0.16
331_A	362_F	0.575	0.16
39_A	534_V	0.574	0.16
208_E	226_R	0.574	0.16
209_V	295_A	0.573	0.16
499_I	503_L	0.571	0.16
266_D	418_Q	0.571	0.16
154_I	482_R	0.571	0.16
227_T	251_V	0.570	0.16
232_E	245_D	0.569	0.16
92_V	112_I	0.569	0.16
249_V	405_P	0.569	0.16
188_G	277_S	0.566	0.16
481_N	525_N	0.565	0.16
315_A	461_I	0.565	0.16
260_E	320_A	0.565	0.16
98_V	515_V	0.564	0.16
277_S	284_G	0.564	0.16
101_F	400_V	0.563	0.16
125_E	357_H	0.563	0.16
170_Y	329_A	0.563	0.16
69_R	74_Y	0.562	0.16
223_C	226_R	0.562	0.16
155_I	422_Q	0.561	0.16
467_V	549_F	0.561	0.16
109_S	140_Q	0.560	0.16
140_Q	528_H	0.560	0.16
495_A	554_G	0.559	0.16
183_T	208_E	0.557	0.16
245_D	419_E	0.557	0.16
236_R	243_A	0.556	0.16
230_L	265_R	0.556	0.16
512_I	532_H	0.556	0.16
83_T	100_V	0.556	0.16
207_A	317_H	0.555	0.16
63_G	145_S	0.555	0.16
182_A	237_A	0.555	0.16
468_T	532_H	0.554	0.16
35_R	540_A	0.553	0.16
260_E	263_L	0.553	0.16
23_A	48_D	0.552	0.16
402_E	574_A	0.552	0.16
444_E	448_F	0.551	0.16
22_G	570_V	0.550	0.15
225_E	231_G	0.550	0.15
92_V	107_A	0.550	0.15
64_T	283_A	0.550	0.15
24_P	78_L	0.550	0.15
140_Q	522_G	0.549	0.15
237_A	448_F	0.549	0.15
377_G	483_E	0.548	0.15
364_G	560_H	0.547	0.15
70_S	229_D	0.547	0.15
127_F	332_F	0.547	0.15
131_E	136_I	0.547	0.15
175_G	197_V	0.546	0.15
211_E	229_D	0.546	0.15
447_R	461_I	0.546	0.15
241_A	315_A	0.546	0.15
212_A	538_S	0.545	0.15
184_A	259_L	0.544	0.15
555_M	579_V	0.543	0.15
277_S	430_V	0.542	0.15
495_A	515_V	0.542	0.15
256_A	261_G	0.542	0.15
216_R	515_V	0.542	0.15
305_A	447_R	0.541	0.15
27_T	546_R	0.541	0.15
85_A	208_E	0.541	0.15
396_T	403_L	0.541	0.15
164_E	531_N	0.540	0.15
317_H	321_V	0.540	0.15
147_A	375_C	0.539	0.15
234_I	265_R	0.539	0.15
203_V	415_D	0.538	0.15
308_E	566_A	0.538	0.15
242_E	312_D	0.538	0.15
298_L	357_H	0.536	0.15
225_E	308_E	0.536	0.15
141_M	334_Y	0.536	0.15
205_I	233_A	0.535	0.15
236_R	240_A	0.534	0.15
239_A	298_L	0.534	0.15
367_P	532_H	0.533	0.15
245_D	264_D	0.531	0.15
144_G	532_H	0.531	0.15
466_V	512_I	0.530	0.15
162_L	432_W	0.529	0.15
449_A	467_V	0.528	0.15
33_G	41_R	0.528	0.15
240_A	303_P	0.527	0.15
50_E	123_D	0.527	0.15
327_A	357_H	0.527	0.15
327_A	398_R	0.527	0.15
128_H	494_V	0.526	0.15
471_H	482_R	0.526	0.15
171_P	557_V	0.526	0.15
130_L	222_Y	0.525	0.15
250_G	538_S	0.525	0.15
553_P	560_H	0.525	0.15
182_A	199_M	0.525	0.15
30_E	44_N	0.525	0.15
52_A	63_G	0.525	0.15
137_M	145_S	0.524	0.15
229_D	543_E	0.524	0.15
231_G	234_I	0.524	0.15
136_I	563_A	0.524	0.15
199_M	255_A	0.522	0.15
32_E	283_A	0.522	0.15
151_T	314_M	0.522	0.15
86_D	168_D	0.522	0.15
177_R	235_E	0.521	0.15
176_L	203_V	0.521	0.15
230_L	320_A	0.520	0.15
297_E	458_N	0.520	0.15
38_A	230_L	0.520	0.15
57_N	221_G	0.520	0.15
375_C	472_L	0.519	0.15
141_M	522_G	0.519	0.15
64_T	341_Q	0.519	0.15
305_A	574_A	0.519	0.15
20_Y	50_E	0.518	0.15
243_A	566_A	0.517	0.15
268_V	462_E	0.517	0.15
79_D	539_D	0.517	0.15
46_N	141_M	0.517	0.15
329_A	401_T	0.517	0.15
197_V	237_A	0.516	0.15
239_A	304_D	0.516	0.15
39_A	112_I	0.516	0.15
269_P	299_R	0.516	0.15
181_V	237_A	0.515	0.14
235_E	239_A	0.515	0.14
269_P	337_N	0.515	0.14
235_E	297_E	0.514	0.14
186_L	226_R	0.514	0.14
318_V	362_F	0.514	0.14
167_R	171_P	0.514	0.14
22_G	177_R	0.513	0.14
463_A	466_V	0.513	0.14
457_D	538_S	0.513	0.14
280_D	475_G	0.513	0.14
154_I	396_T	0.512	0.14
52_A	431_C	0.511	0.14
370_I	545_A	0.511	0.14
228_D	231_G	0.511	0.14
237_A	262_M	0.510	0.14
400_V	418_Q	0.510	0.14
84_L	87_A	0.509	0.14
253_G	320_A	0.509	0.14
210_D	271_V	0.508	0.14
504_L	578_T	0.508	0.14
291_T	481_N	0.508	0.14
105_E	391_A	0.508	0.14
35_R	243_A	0.507	0.14
35_R	533_V	0.507	0.14
115_S	568_A	0.506	0.14
235_E	546_R	0.506	0.14
399_A	414_I	0.505	0.14
329_A	495_A	0.505	0.14
145_S	333_E	0.505	0.14
404_F	457_D	0.505	0.14
225_E	228_D	0.504	0.14
482_R	509_G	0.504	0.14
184_A	344_A	0.504	0.14
225_E	243_A	0.504	0.14
545_A	549_F	0.503	0.14
297_E	457_D	0.503	0.14
208_E	214_I	0.503	0.14
129_E	136_I	0.502	0.14
271_V	294_D	0.502	0.14
89_T	254_N	0.502	0.14
200_N	452_I	0.502	0.14
101_F	448_F	0.501	0.14
29_I	82_R	0.501	0.14
54_D	188_G	0.501	0.14
206_A	226_R	0.501	0.14
59_V	212_A	0.501	0.14
239_A	428_S	0.500	0.14
297_E	300_D	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1x87A	2	0.869	100	0.056	Contact Map
1uwkA	2	0.9422	100	0.057	Contact Map
2fknA	2	0.9286	100	0.057	Contact Map
3p2yA	2	0.4983	75.2	0.985	Contact Map
4mhbA	4	0.4269	63.5	0.986	Contact Map
3wbwA	1	0.4082	62.1	0.986	Contact Map
1l7dA	2	0.5221	57.9	0.987	Contact Map
3oj0A	1	0.2296	55.4	0.987	Contact Map
1hw6A	1	0.381	53.3	0.987	Contact Map
3d4oA	4	0.4762	52.5	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0143 seconds.