Q9HQB7 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HQB7 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HQB7	Sequences: MPVDRGAVRDAAKYLRGVRPLDPAALREYVPGQPHEAVVRQVLREQAADLGIIERADGTFVVPPEEPVGPPFNGVSALPERYERVVEAELTAAYGPDWHRGDTGDSLRETIRRFKDDYYRRNPVEYDREVALGYAVYHLAGYYAAVQYVLAGLARDGLLGHDLRVLDLGAGVGGPAVGLFDFLPDEALVEYHAVEPSAAADVLDALLAETPRNVHTTIHRETAESFQPAGEYDLVLACSVLSELDDAASVLRKYADAMAADGTALALAPADKHTSTHLRAVERAVEDDPFTVYGPTPRLWPDRRPTDSGWSFDERPAVEVPAVQSRLADASQDPGEFRHTDVRFSYSLLRRDDRRRHAVELSGDRLLALGDADDRVTDRADLLVAKLSRNLAGADANPVFRVSDGSQTTDCYAVLVRPTSLNGGIEAADYGDLVSIEDALVLWNDDEDAYNLVVDEETVVDAV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	463 (383)
Sequences:	292 (235)
Seq/√Len:	12.0

HALSA - Q9HQB7

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
385_A	390_N	5.319	1.00
266_A	278_L	5.313	1.00
385_A	393_G	5.103	1.00
390_N	393_G	4.198	1.00
275_S	345_S	4.152	1.00
235_V	258_M	4.104	1.00
369_L	372_A	3.717	0.99
384_V	393_G	3.636	0.99
232_Y	235_V	3.236	0.97
296_T	403_S	3.186	0.97
385_A	394_A	3.115	0.97
192_H	195_E	3.014	0.96
189_V	195_E	2.827	0.94
78_L	86_V	2.661	0.92
165_V	179_L	2.609	0.91
189_V	192_H	2.542	0.90
411_C	430_Y	2.514	0.89
266_A	281_V	2.417	0.87
302_D	311_S	2.399	0.87
384_V	390_N	2.366	0.86
192_H	196_P	2.357	0.86
387_L	393_G	2.326	0.85
153_L	348_L	2.326	0.85
71_P	75_V	2.306	0.85
292_V	349_L	2.271	0.84
312_F	343_R	2.258	0.83
177_V	206_L	2.257	0.83
401_R	411_C	2.225	0.82
235_V	260_A	2.139	0.80
385_A	389_R	2.131	0.79
140_A	341_D	2.001	0.75
366_L	369_L	2.000	0.75
390_N	394_A	1.973	0.74
292_V	299_L	1.972	0.74
242_S	268_A	1.970	0.74
178_G	351_R	1.962	0.73
136_V	343_R	1.918	0.71
56_A	60_F	1.902	0.71
340_T	351_R	1.893	0.70
304_R	328_A	1.884	0.70
384_V	388_S	1.870	0.69
320_V	340_T	1.835	0.68
126_Y	243_E	1.794	0.66
235_V	262_G	1.791	0.66
389_R	393_G	1.778	0.65
221_E	228_P	1.771	0.65
233_D	262_G	1.770	0.65
238_C	266_A	1.766	0.65
369_L	373_D	1.760	0.65
149_V	265_L	1.716	0.62
134_Y	343_R	1.713	0.62
384_V	389_R	1.699	0.62
383_L	394_A	1.689	0.61
276_T	279_R	1.676	0.61
401_R	407_Q	1.675	0.61
66_E	69_G	1.664	0.60
107_L	114_F	1.649	0.59
53_I	56_A	1.639	0.59
296_T	303_R	1.628	0.58
126_Y	134_Y	1.617	0.58
384_V	394_A	1.611	0.57
152_G	156_D	1.605	0.57
107_L	113_R	1.602	0.57
383_L	393_G	1.601	0.57
52_I	65_E	1.592	0.56
367_L	370_G	1.565	0.55
235_V	265_L	1.564	0.55
107_L	111_I	1.563	0.55
108_R	115_K	1.557	0.55
214_V	217_T	1.554	0.55
110_T	113_R	1.552	0.55
259_A	350_R	1.548	0.54
390_N	398_P	1.537	0.54
173_G	286_E	1.532	0.54
70_P	79_P	1.528	0.53
303_R	427_A	1.523	0.53
303_R	311_S	1.522	0.53
143_Y	346_Y	1.505	0.52
62_V	67_P	1.502	0.52
405_G	413_A	1.495	0.52
61_V	65_E	1.492	0.52
65_E	69_G	1.487	0.51
238_C	344_F	1.473	0.51
175_P	236_L	1.471	0.50
303_R	403_S	1.464	0.50
294_G	351_R	1.456	0.50
75_V	80_E	1.435	0.49
286_E	303_R	1.423	0.48
101_G	104_G	1.423	0.48
323_V	396_A	1.405	0.47
148_Y	342_V	1.391	0.46
258_M	262_G	1.390	0.46
399_V	413_A	1.386	0.46
274_T	282_E	1.386	0.46
365_R	370_G	1.378	0.46
289_P	354_R	1.369	0.45
61_V	64_P	1.362	0.45
91_T	97_D	1.350	0.44
296_T	311_S	1.346	0.44
166_L	235_V	1.341	0.44
221_E	226_F	1.340	0.44
152_G	294_G	1.337	0.44
186_E	189_V	1.334	0.44
383_L	390_N	1.333	0.44
102_D	106_S	1.325	0.43
388_S	393_G	1.318	0.43
366_L	372_A	1.304	0.42
172_V	203_L	1.275	0.41
134_Y	243_E	1.261	0.40
73_N	77_A	1.261	0.40
72_F	77_A	1.260	0.40
218_I	221_E	1.256	0.40
76_S	79_P	1.251	0.40
64_P	68_V	1.248	0.39
311_S	403_S	1.241	0.39
282_E	302_D	1.236	0.39
403_S	407_Q	1.233	0.39
138_H	142_Y	1.231	0.39
286_E	292_V	1.229	0.38
285_V	349_L	1.221	0.38
303_R	313_D	1.207	0.37
186_E	195_E	1.204	0.37
321_P	424_G	1.199	0.37
279_R	424_G	1.198	0.37
386_K	391_L	1.198	0.37
72_F	135_A	1.195	0.37
216_T	220_R	1.189	0.37
246_D	402_V	1.189	0.37
401_R	430_Y	1.188	0.37
64_P	69_G	1.185	0.36
255_A	315_R	1.182	0.36
52_I	55_R	1.171	0.36
86_V	267_L	1.169	0.36
221_E	224_E	1.167	0.36
398_P	425_I	1.165	0.35
167_D	171_G	1.152	0.35
140_A	352_D	1.146	0.35
263_T	348_L	1.145	0.35
271_D	348_L	1.144	0.35
223_A	254_Y	1.143	0.34
80_E	86_V	1.141	0.34
385_A	388_S	1.136	0.34
221_E	225_S	1.135	0.34
368_A	371_D	1.131	0.34
101_G	105_D	1.129	0.34
366_L	370_G	1.126	0.34
68_V	371_D	1.123	0.34
192_H	197_S	1.114	0.33
145_A	354_R	1.107	0.33
166_L	433_L	1.102	0.33
298_R	328_A	1.099	0.33
384_V	387_L	1.098	0.32
64_P	67_P	1.095	0.32
54_E	60_F	1.091	0.32
165_V	234_L	1.088	0.32
321_P	396_A	1.087	0.32
286_E	315_R	1.085	0.32
383_L	389_R	1.084	0.32
126_Y	269_P	1.082	0.32
382_L	385_A	1.080	0.32
217_T	228_P	1.077	0.32
275_S	279_R	1.074	0.31
111_I	118_Y	1.073	0.31
373_D	376_V	1.069	0.31
264_A	290_F	1.069	0.31
55_R	59_T	1.061	0.31
191_Y	343_R	1.061	0.31
286_E	302_D	1.052	0.30
288_D	358_A	1.052	0.30
232_Y	262_G	1.048	0.30
79_P	82_Y	1.048	0.30
98_W	101_G	1.047	0.30
325_S	338_R	1.045	0.30
302_D	407_Q	1.042	0.30
267_L	374_D	1.038	0.30
415_L	424_G	1.038	0.30
57_D	67_P	1.035	0.30
381_D	385_A	1.034	0.30
417_R	427_A	1.033	0.30
162_D	199_A	1.031	0.30
111_I	115_K	1.030	0.30
380_A	384_V	1.027	0.29
85_V	93_A	1.027	0.29
130_V	136_V	1.026	0.29
170_A	174_G	1.020	0.29
171_G	233_D	1.017	0.29
317_A	430_Y	1.016	0.29
291_T	299_L	1.008	0.29
372_A	428_A	1.006	0.29
356_R	414_V	1.004	0.28
398_P	422_N	1.002	0.28
281_V	426_E	1.001	0.28
425_I	432_D	0.998	0.28
345_S	403_S	0.993	0.28
375_R	384_V	0.991	0.28
381_D	390_N	0.987	0.28
74_G	77_A	0.986	0.28
52_I	57_D	0.984	0.28
417_R	425_I	0.984	0.28
282_E	286_E	0.982	0.28
114_F	119_Y	0.980	0.28
71_P	74_G	0.974	0.27
216_T	221_E	0.973	0.27
282_E	311_S	0.972	0.27
150_L	414_V	0.968	0.27
317_A	341_D	0.966	0.27
141_G	340_T	0.966	0.27
380_A	385_A	0.966	0.27
107_L	118_Y	0.962	0.27
195_E	240_V	0.961	0.27
344_F	371_D	0.959	0.27
345_S	401_R	0.959	0.27
222_T	226_F	0.957	0.27
143_Y	297_P	0.954	0.26
368_A	372_A	0.953	0.26
300_W	318_V	0.950	0.26
282_E	313_D	0.949	0.26
75_V	79_P	0.948	0.26
365_R	369_L	0.945	0.26
258_M	299_L	0.943	0.26
255_A	313_D	0.937	0.26
108_R	111_I	0.937	0.26
82_Y	378_D	0.935	0.26
255_A	430_Y	0.935	0.26
370_G	374_D	0.932	0.26
370_G	373_D	0.928	0.25
54_E	65_E	0.927	0.25
303_R	315_R	0.927	0.25
77_A	80_E	0.922	0.25
302_D	426_E	0.918	0.25
265_L	428_A	0.917	0.25
170_A	232_Y	0.913	0.25
364_D	368_A	0.911	0.25
265_L	372_A	0.911	0.25
158_L	435_S	0.910	0.25
62_V	69_G	0.910	0.25
315_R	397_N	0.910	0.25
283_R	287_D	0.909	0.25
417_R	439_A	0.909	0.25
59_T	64_P	0.908	0.25
387_L	390_N	0.908	0.25
275_S	401_R	0.908	0.25
306_T	323_V	0.907	0.25
243_E	269_P	0.907	0.25
274_T	302_D	0.906	0.25
55_R	60_F	0.903	0.25
350_R	355_R	0.901	0.24
77_A	83_E	0.893	0.24
381_D	388_S	0.888	0.24
383_L	386_K	0.885	0.24
367_L	379_R	0.884	0.24
260_A	351_R	0.876	0.24
252_R	318_V	0.873	0.23
422_N	425_I	0.873	0.23
227_Q	285_V	0.867	0.23
90_L	136_V	0.860	0.23
167_D	264_A	0.859	0.23
274_T	311_S	0.856	0.23
130_V	134_Y	0.856	0.23
156_D	432_D	0.854	0.23
419_T	427_A	0.853	0.23
103_T	106_S	0.853	0.23
114_F	117_D	0.853	0.23
302_D	403_S	0.852	0.23
299_L	412_Y	0.849	0.23
255_A	302_D	0.845	0.22
397_N	432_D	0.844	0.22
397_N	418_P	0.831	0.22
56_A	69_G	0.829	0.22
152_G	268_A	0.827	0.22
100_R	258_M	0.824	0.22
156_D	302_D	0.823	0.22
296_T	302_D	0.820	0.22
108_R	114_F	0.820	0.22
76_S	344_F	0.818	0.22
72_F	75_V	0.815	0.21
149_V	312_F	0.815	0.21
417_R	432_D	0.815	0.21
156_D	255_A	0.814	0.21
251_L	387_L	0.812	0.21
304_R	320_V	0.811	0.21
112_R	408_T	0.809	0.21
249_S	362_S	0.809	0.21
170_A	292_V	0.808	0.21
292_V	315_R	0.808	0.21
282_E	303_R	0.806	0.21
199_A	277_H	0.800	0.21
246_D	252_R	0.799	0.21
255_A	311_S	0.798	0.21
110_T	114_F	0.795	0.21
128_R	161_H	0.794	0.21
367_L	373_D	0.792	0.21
91_T	142_Y	0.791	0.21
408_T	428_A	0.788	0.21
255_A	317_A	0.786	0.20
203_L	270_A	0.786	0.20
69_G	409_T	0.786	0.20
134_Y	148_Y	0.785	0.20
373_D	379_R	0.783	0.20
207_L	210_T	0.783	0.20
166_L	254_Y	0.782	0.20
297_P	313_D	0.777	0.20
62_V	65_E	0.776	0.20
117_D	133_G	0.775	0.20
63_P	66_E	0.775	0.20
61_V	68_V	0.775	0.20
400_F	428_A	0.771	0.20
223_A	226_F	0.768	0.20
255_A	401_R	0.765	0.20
268_A	296_T	0.764	0.20
174_G	199_A	0.763	0.20
391_L	394_A	0.762	0.20
399_V	416_V	0.759	0.20
112_R	116_D	0.756	0.19
282_E	296_T	0.755	0.19
162_D	344_F	0.753	0.19
296_T	313_D	0.752	0.19
155_R	189_V	0.750	0.19
358_A	362_S	0.747	0.19
194_V	197_S	0.746	0.19
131_A	343_R	0.745	0.19
81_R	344_F	0.745	0.19
162_D	298_R	0.743	0.19
367_L	372_A	0.743	0.19
432_D	439_A	0.738	0.19
56_A	67_P	0.734	0.19
74_G	80_E	0.733	0.19
225_S	229_A	0.733	0.19
345_S	407_Q	0.733	0.19
299_L	327_L	0.732	0.19
314_E	411_C	0.731	0.19
267_L	406_S	0.730	0.19
60_F	65_E	0.729	0.19
397_N	427_A	0.728	0.19
135_A	184_P	0.728	0.19
55_R	58_G	0.725	0.19
132_L	279_R	0.723	0.18
384_V	395_D	0.721	0.18
100_R	106_S	0.721	0.18
153_L	289_P	0.720	0.18
197_S	343_R	0.719	0.18
89_E	323_V	0.717	0.18
164_R	219_H	0.708	0.18
69_G	314_E	0.705	0.18
172_V	199_A	0.705	0.18
86_V	358_A	0.705	0.18
136_V	340_T	0.704	0.18
110_T	350_R	0.703	0.18
58_G	61_V	0.701	0.18
216_T	219_H	0.701	0.18
232_Y	330_A	0.700	0.18
303_R	407_Q	0.700	0.18
264_A	426_E	0.699	0.18
166_L	233_D	0.693	0.18
111_I	114_F	0.692	0.18
163_L	233_D	0.691	0.18
115_K	118_Y	0.691	0.18
302_D	315_R	0.688	0.17
149_V	426_E	0.688	0.17
159_L	364_D	0.688	0.17
276_T	320_V	0.685	0.17
162_D	328_A	0.685	0.17
153_L	263_T	0.680	0.17
53_I	59_T	0.680	0.17
214_V	228_P	0.677	0.17
112_R	117_D	0.677	0.17
226_F	229_A	0.676	0.17
255_A	411_C	0.676	0.17
371_D	378_D	0.674	0.17
166_L	261_D	0.674	0.17
241_L	417_R	0.674	0.17
177_V	183_L	0.674	0.17
365_R	372_A	0.673	0.17
250_V	357_H	0.673	0.17
93_A	101_G	0.672	0.17
298_R	303_R	0.670	0.17
182_F	267_L	0.670	0.17
95_G	98_W	0.669	0.17
372_A	378_D	0.668	0.17
317_A	411_C	0.668	0.17
238_C	251_L	0.666	0.17
89_E	93_A	0.666	0.17
144_A	408_T	0.663	0.17
165_V	428_A	0.663	0.17
178_G	426_E	0.663	0.17
184_P	355_R	0.663	0.17
294_G	303_R	0.656	0.17
396_A	438_D	0.656	0.17
108_R	117_D	0.655	0.16
128_R	380_A	0.654	0.16
131_A	144_A	0.653	0.16
96_P	180_F	0.652	0.16
193_A	242_S	0.651	0.16
165_V	409_T	0.649	0.16
134_Y	141_G	0.647	0.16
152_G	433_L	0.647	0.16
102_D	351_R	0.646	0.16
302_D	417_R	0.644	0.16
157_G	263_T	0.643	0.16
161_H	344_F	0.642	0.16
68_V	362_S	0.642	0.16
274_T	303_R	0.640	0.16
267_L	363_G	0.639	0.16
385_A	426_E	0.639	0.16
109_E	113_R	0.639	0.16
157_G	341_D	0.638	0.16
409_T	416_V	0.638	0.16
70_P	80_E	0.637	0.16
154_A	421_L	0.637	0.16
387_L	394_A	0.636	0.16
225_S	360_E	0.636	0.16
398_P	426_E	0.634	0.16
195_E	202_V	0.632	0.16
248_A	340_T	0.631	0.16
382_L	390_N	0.631	0.16
266_A	318_V	0.631	0.16
156_D	303_R	0.630	0.16
397_N	413_A	0.630	0.16
311_S	347_S	0.630	0.16
198_A	252_R	0.629	0.16
136_V	249_S	0.628	0.16
137_Y	271_D	0.627	0.16
320_V	323_V	0.627	0.16
87_E	111_I	0.627	0.16
411_C	416_V	0.627	0.16
128_R	292_V	0.626	0.16
365_R	368_A	0.626	0.16
213_N	344_F	0.625	0.16
169_G	243_E	0.625	0.16
191_Y	195_E	0.624	0.16
90_L	102_D	0.624	0.16
160_G	199_A	0.620	0.16
145_A	206_L	0.619	0.16
346_Y	398_P	0.619	0.16
280_A	356_R	0.617	0.15
270_A	340_T	0.616	0.15
358_A	387_L	0.616	0.15
52_I	56_A	0.615	0.15
424_G	439_A	0.614	0.15
70_P	265_L	0.612	0.15
96_P	104_G	0.612	0.15
168_L	254_Y	0.611	0.15
107_L	112_R	0.610	0.15
83_E	86_V	0.610	0.15
222_T	227_Q	0.609	0.15
141_G	195_E	0.609	0.15
130_V	272_K	0.608	0.15
286_E	311_S	0.608	0.15
362_S	369_L	0.606	0.15
54_E	57_D	0.603	0.15
114_F	147_Q	0.600	0.15
56_A	65_E	0.600	0.15
401_R	426_E	0.600	0.15
344_F	434_V	0.599	0.15
255_A	296_T	0.599	0.15
56_A	68_V	0.596	0.15
165_V	349_L	0.596	0.15
130_V	400_F	0.595	0.15
302_D	425_I	0.594	0.15
128_R	365_R	0.594	0.15
90_L	341_D	0.593	0.15
156_D	162_D	0.593	0.15
54_E	66_E	0.592	0.15
79_P	317_A	0.592	0.15
216_T	229_A	0.590	0.15
417_R	426_E	0.590	0.15
62_V	68_V	0.589	0.15
248_A	251_L	0.588	0.15
182_F	433_L	0.588	0.15
170_A	324_Q	0.587	0.15
300_W	335_G	0.584	0.15
310_W	391_L	0.581	0.15
299_L	354_R	0.580	0.15
162_D	168_L	0.579	0.14
403_S	427_A	0.578	0.14
427_A	432_D	0.578	0.14
79_P	83_E	0.577	0.14
214_V	218_I	0.577	0.14
291_T	416_V	0.576	0.14
62_V	66_E	0.576	0.14
103_T	405_G	0.573	0.14
385_A	395_D	0.573	0.14
132_L	202_V	0.573	0.14
282_E	298_R	0.572	0.14
377_T	382_L	0.572	0.14
196_P	324_Q	0.569	0.14
191_Y	409_T	0.569	0.14
177_V	239_S	0.565	0.14
383_L	387_L	0.565	0.14
166_L	292_V	0.562	0.14
255_A	303_R	0.562	0.14
137_Y	339_H	0.562	0.14
125_E	227_Q	0.561	0.14
133_G	197_S	0.560	0.14
70_P	81_R	0.559	0.14
96_P	101_G	0.559	0.14
149_V	259_A	0.559	0.14
215_H	219_H	0.557	0.14
176_A	347_S	0.556	0.14
276_T	321_P	0.556	0.14
56_A	64_P	0.555	0.14
415_L	418_P	0.555	0.14
82_Y	86_V	0.555	0.14
276_T	412_Y	0.553	0.14
145_A	267_L	0.552	0.14
91_T	95_G	0.551	0.14
346_Y	425_I	0.549	0.14
329_D	435_S	0.547	0.14
72_F	361_L	0.547	0.14
160_G	298_R	0.546	0.14
269_P	281_V	0.546	0.14
294_G	313_D	0.546	0.14
382_L	387_L	0.545	0.14
214_V	221_E	0.543	0.14
184_P	415_L	0.543	0.14
61_V	69_G	0.543	0.14
252_R	424_G	0.542	0.14
303_R	425_I	0.542	0.14
232_Y	258_M	0.541	0.14
424_G	427_A	0.541	0.14
86_V	121_R	0.540	0.14
315_R	430_Y	0.540	0.14
294_G	320_V	0.539	0.14
71_P	77_A	0.539	0.14
247_A	430_Y	0.539	0.14
141_G	183_L	0.539	0.14
56_A	59_T	0.538	0.13
193_A	196_P	0.536	0.13
161_H	185_D	0.536	0.13
73_N	313_D	0.535	0.13
133_G	283_R	0.533	0.13
197_S	201_D	0.532	0.13
303_R	398_P	0.531	0.13
65_E	134_Y	0.529	0.13
77_A	84_R	0.528	0.13
177_V	271_D	0.528	0.13
78_L	154_A	0.527	0.13
396_A	427_A	0.526	0.13
52_I	109_E	0.525	0.13
189_V	197_S	0.525	0.13
115_K	233_D	0.525	0.13
142_Y	406_S	0.524	0.13
210_T	217_T	0.524	0.13
127_D	155_R	0.524	0.13
204_D	325_S	0.522	0.13
415_L	439_A	0.522	0.13
272_K	400_F	0.519	0.13
235_V	264_A	0.519	0.13
166_L	232_Y	0.518	0.13
62_V	337_F	0.516	0.13
304_R	318_V	0.516	0.13
234_L	377_T	0.514	0.13
79_P	90_L	0.513	0.13
282_E	403_S	0.513	0.13
282_E	315_R	0.513	0.13
192_H	397_N	0.512	0.13
91_T	312_F	0.511	0.13
207_L	410_D	0.510	0.13
390_N	426_E	0.510	0.13
313_D	432_D	0.507	0.13
137_Y	312_F	0.507	0.13
188_L	229_A	0.506	0.13
402_V	410_D	0.505	0.13
286_E	427_A	0.505	0.13
265_L	396_A	0.505	0.13
251_L	408_T	0.505	0.13
52_I	62_V	0.504	0.13
351_R	424_G	0.504	0.13
150_L	195_E	0.503	0.13
134_Y	173_G	0.502	0.13
309_G	404_D	0.501	0.13
401_R	440_L	0.501	0.13
192_H	418_P	0.500	0.13
270_A	343_R	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3ssoA	4	0.6933	99.7	0.875	Contact Map
5bp7A	3	0.4816	99.4	0.9	Contact Map
4kdcA	1	0.4341	99.4	0.901	Contact Map
2p7iA	6	0.4276	99.4	0.903	Contact Map
2o57A	2	0.5205	99.3	0.904	Contact Map
2aotA	1	0.5076	99.3	0.904	Contact Map
4krgA	1	0.689	99.3	0.905	Contact Map
2p35A	2	0.4773	99.3	0.905	Contact Map
4gekA	2	0.4795	99.3	0.905	Contact Map
3g5lA	3	0.3801	99.3	0.905	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0111 seconds.