GATE - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

GATE - Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E

UniProt:	Q9HQ32	Sequences: MTEFDYDELGLVAGLEIHQQLDTATKLFCACPTTRREPAEADRTFTRYLHPTRSELGEIDEAALEESRVEREFEYLAYDTTCLVEEDDEPPHRLDEDALAAALEIGHLLGMDAVDRAHVMRKVVIDGSNTGGFQRSTMVAEGGAIDTSEGPVGIEDLMLEEESAQRIEDREDGVLYSLDRLGIPLVEIGTKPDISSPAQAREAAERIGMLLRSTGKVKRGLGTIRQDVNVSIADGARVEMKGVQSLDDIDDLVREEVRRQVELLDIVDELDARDAAVGKPRDVTDVFADTESGVIRGALDDGGEVHAVPLHGFDGLVGRELQADRRLGTEFSDHATRHGAGGIFHTDELPAYGVTAAEVAALRDAVGAGEDDAVAIVADDPETAAQSIQAVAERAETAMAGVPEETRGANDDGTSKYLRPLPGAARMYPETDVPPVDPDPSAVETPELLTEKVERYQADFDLDAGLAEQVAYGRRWQLFEQQVEAGVDATLAAQTLESTVTELRRDDVPVGRLTDAHFRGVLGLVADGDLAQEGVPELLAALAEQPGSDPAVLAEELGLGSAAEDEVREAVVGVVERNSDQVAAEGMGAFSALMGECMGALRGKADGDLVSEVLREEIQQRS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	622 (613)
Sequences:	191 (140)
Seq/√Len:	5.7

HALSA - GATE
SULSO - GATE

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
150_G	199_Q	5.577	0.99
283_V	307_A	5.022	0.98
194_I	200_A	5.009	0.98
147_T	150_G	4.996	0.98
567_V	601_L	4.946	0.98
572_V	617_E	4.151	0.94
346_T	374_V	4.145	0.94
362_L	374_V	4.050	0.93
346_T	362_L	3.876	0.91
111_M	157_L	3.752	0.90
237_R	421_L	3.670	0.89
332_S	336_T	3.559	0.87
334_H	397_T	3.413	0.85
295_I	305_V	3.377	0.84
105_I	109_L	3.320	0.83
356_A	360_A	3.284	0.82
447_E	455_R	3.039	0.77
335_A	340_A	2.940	0.74
19_Q	211_L	2.938	0.74
9_L	221_L	2.898	0.73
5_D	8_E	2.896	0.73
573_G	600_A	2.842	0.71
593_L	614_L	2.840	0.71
550_P	554_A	2.772	0.69
578_N	581_Q	2.675	0.67
617_E	620_Q	2.559	0.63
482_Q	492_A	2.527	0.62
147_T	202_E	2.503	0.61
366_V	374_V	2.441	0.59
562_A	570_A	2.428	0.59
106_G	140_A	2.416	0.58
166_R	176_Y	2.395	0.57
174_V	305_V	2.393	0.57
423_G	429_P	2.377	0.57
147_T	199_Q	2.368	0.57
572_V	575_V	2.301	0.54
524_L	550_P	2.293	0.54
9_L	616_E	2.268	0.53
340_A	379_D	2.233	0.52
267_V	271_D	2.228	0.52
193_D	200_A	2.201	0.51
22_D	218_K	2.197	0.51
391_V	567_V	2.197	0.51
45_F	86_E	2.167	0.50
36_R	79_D	2.157	0.49
155_E	176_Y	2.136	0.49
19_Q	217_V	2.129	0.48
500_V	518_F	2.123	0.48
285_D	288_A	2.116	0.48
325_R	329_T	2.096	0.47
597_C	601_L	2.074	0.46
240_M	415_S	2.067	0.46
147_T	152_V	2.033	0.45
76_L	177_S	2.027	0.45
424_A	469_Q	2.027	0.45
176_Y	200_A	2.026	0.45
106_G	169_D	2.022	0.45
582_V	593_L	1.997	0.44
31_C	82_C	1.981	0.43
51_P	64_L	1.957	0.42
144_A	151_P	1.956	0.42
327_L	614_L	1.954	0.42
575_V	618_I	1.950	0.42
35_R	240_M	1.949	0.42
71_R	542_L	1.940	0.42
301_D	439_D	1.908	0.41
103_L	113_A	1.908	0.41
211_L	217_V	1.883	0.40
69_V	73_F	1.882	0.40
482_Q	519_R	1.872	0.40
368_A	374_V	1.867	0.39
71_R	611_S	1.829	0.38
78_Y	81_T	1.828	0.38
52_T	140_A	1.812	0.38
67_S	88_D	1.808	0.38
590_F	611_S	1.806	0.37
66_E	125_I	1.797	0.37
108_L	445_T	1.792	0.37
336_T	421_L	1.784	0.37
581_Q	592_A	1.776	0.36
61_E	421_L	1.774	0.36
94_L	575_V	1.771	0.36
137_T	612_E	1.753	0.36
311_H	513_L	1.725	0.35
445_T	476_W	1.717	0.35
578_N	597_C	1.714	0.35
418_L	451_E	1.707	0.34
384_A	391_V	1.697	0.34
95_D	137_T	1.682	0.34
51_P	305_V	1.680	0.33
564_E	605_A	1.679	0.33
568_R	617_E	1.679	0.33
97_D	114_V	1.661	0.33
125_I	563_A	1.653	0.33
579_S	583_A	1.647	0.32
29_C	82_C	1.636	0.32
595_G	607_G	1.630	0.32
215_G	333_D	1.623	0.32
131_G	492_A	1.621	0.32
162_E	189_G	1.621	0.32
495_T	535_V	1.612	0.31
146_D	151_P	1.605	0.31
169_D	470_V	1.605	0.31
9_L	261_V	1.600	0.31
490_T	593_L	1.598	0.31
441_S	458_A	1.598	0.31
36_R	78_Y	1.594	0.31
503_L	508_V	1.577	0.30
340_A	591_S	1.577	0.30
248_D	418_L	1.572	0.30
522_L	525_V	1.562	0.30
198_A	376_I	1.553	0.30
147_T	567_V	1.550	0.30
51_P	412_D	1.540	0.29
228_V	449_L	1.534	0.29
262_E	265_D	1.533	0.29
290_T	358_E	1.526	0.29
570_A	601_L	1.508	0.28
37_E	526_A	1.506	0.28
45_F	508_V	1.500	0.28
70_E	500_V	1.499	0.28
110_G	144_A	1.495	0.28
162_E	209_M	1.491	0.28
94_L	137_T	1.487	0.28
321_L	329_T	1.486	0.28
7_D	195_S	1.485	0.28
109_L	383_T	1.485	0.28
331_F	335_A	1.478	0.28
207_I	249_I	1.476	0.28
237_R	327_L	1.468	0.27
346_T	366_V	1.467	0.27
495_T	536_P	1.465	0.27
19_Q	212_R	1.463	0.27
279_K	360_A	1.462	0.27
517_H	546_P	1.460	0.27
325_R	333_D	1.459	0.27
234_D	362_L	1.457	0.27
296_R	300_D	1.457	0.27
236_A	447_E	1.456	0.27
99_L	436_V	1.455	0.27
191_K	196_S	1.449	0.27
509_P	512_R	1.438	0.26
411_D	496_L	1.435	0.26
601_L	605_A	1.430	0.26
85_E	130_T	1.430	0.26
149_E	249_I	1.422	0.26
370_E	379_D	1.415	0.26
520_G	550_P	1.404	0.26
152_V	416_K	1.404	0.26
564_E	609_L	1.403	0.26
570_A	574_V	1.401	0.26
138_M	521_V	1.394	0.25
201_R	250_D	1.391	0.25
573_G	605_A	1.389	0.25
236_A	404_E	1.383	0.25
581_Q	596_E	1.381	0.25
162_E	165_Q	1.373	0.25
102_A	575_V	1.373	0.25
176_Y	558_G	1.372	0.25
154_I	281_R	1.363	0.25
125_I	411_D	1.362	0.24
578_N	596_E	1.354	0.24
109_L	524_L	1.353	0.24
275_A	421_L	1.348	0.24
404_E	417_Y	1.346	0.24
152_V	199_Q	1.332	0.24
200_A	409_A	1.326	0.24
109_L	363_R	1.321	0.23
153_G	191_K	1.321	0.23
209_M	228_V	1.320	0.23
310_L	395_A	1.318	0.23
460_F	604_K	1.317	0.23
130_T	178_L	1.311	0.23
73_F	585_E	1.309	0.23
255_E	414_T	1.302	0.23
369_G	481_Q	1.300	0.23
596_E	599_G	1.288	0.23
261_V	415_S	1.285	0.23
51_P	115_D	1.283	0.23
287_F	305_V	1.283	0.23
587_M	619_Q	1.282	0.23
33_T	218_K	1.280	0.22
151_P	439_D	1.263	0.22
163_S	530_L	1.261	0.22
335_A	379_D	1.259	0.22
31_C	136_S	1.258	0.22
108_L	518_F	1.254	0.22
410_N	590_F	1.253	0.22
32_P	215_G	1.253	0.22
159_L	496_L	1.251	0.22
421_L	448_L	1.250	0.22
538_L	541_A	1.248	0.22
379_D	452_K	1.247	0.22
11_L	54_S	1.243	0.22
369_G	444_E	1.242	0.22
507_D	532_Q	1.240	0.22
81_T	108_L	1.237	0.21
376_I	411_D	1.232	0.21
335_A	391_V	1.231	0.21
582_V	599_G	1.230	0.21
209_M	533_E	1.230	0.21
393_E	487_V	1.220	0.21
274_D	399_M	1.214	0.21
267_V	525_V	1.213	0.21
45_F	494_Q	1.210	0.21
310_L	335_A	1.208	0.21
316_L	377_V	1.206	0.21
314_D	363_R	1.205	0.21
200_A	469_Q	1.203	0.21
105_I	364_D	1.202	0.21
408_G	418_L	1.201	0.21
264_L	323_A	1.198	0.21
141_E	186_V	1.189	0.20
104_E	108_L	1.181	0.20
410_N	591_S	1.176	0.20
106_G	435_P	1.175	0.20
310_L	417_Y	1.173	0.20
101_A	616_E	1.167	0.20
252_L	344_F	1.162	0.20
213_S	471_A	1.157	0.20
113_A	574_V	1.155	0.20
393_E	531_A	1.155	0.20
12_V	69_V	1.154	0.20
297_G	537_E	1.148	0.19
310_L	340_A	1.148	0.19
340_A	391_V	1.147	0.19
37_E	555_E	1.143	0.19
310_L	317_V	1.141	0.19
224_I	589_A	1.138	0.19
165_Q	177_S	1.137	0.19
189_G	421_L	1.135	0.19
335_A	395_A	1.132	0.19
64_L	93_R	1.130	0.19
251_D	254_R	1.129	0.19
6_Y	48_Y	1.129	0.19
73_F	159_L	1.129	0.19
326_R	349_L	1.120	0.19
416_K	530_L	1.116	0.19
381_P	385_A	1.115	0.19
152_V	567_V	1.115	0.19
292_S	350_P	1.113	0.19
521_V	539_L	1.110	0.19
144_A	510_V	1.109	0.19
65_E	217_V	1.108	0.19
272_A	571_V	1.107	0.19
393_E	414_T	1.105	0.19
339_G	607_G	1.105	0.19
145_I	605_A	1.102	0.18
209_M	477_Q	1.101	0.18
361_A	364_D	1.101	0.18
236_A	455_R	1.099	0.18
177_S	449_L	1.098	0.18
327_L	593_L	1.096	0.18
145_I	193_D	1.096	0.18
569_E	573_G	1.095	0.18
404_E	421_L	1.095	0.18
285_D	551_A	1.090	0.18
210_L	470_V	1.087	0.18
275_A	502_E	1.084	0.18
307_A	558_G	1.084	0.18
340_A	395_A	1.083	0.18
99_L	539_L	1.081	0.18
65_E	247_D	1.078	0.18
327_L	334_H	1.077	0.18
388_I	445_T	1.074	0.18
524_L	554_A	1.072	0.18
421_L	502_E	1.072	0.18
65_E	417_Y	1.071	0.18
102_A	579_S	1.070	0.18
253_V	368_A	1.069	0.18
137_T	597_C	1.068	0.18
324_D	408_G	1.067	0.18
287_F	458_A	1.059	0.18
71_R	118_H	1.058	0.18
410_N	414_T	1.057	0.18
574_V	610_V	1.057	0.18
66_E	138_M	1.055	0.18
402_V	521_V	1.052	0.17
37_E	365_A	1.049	0.17
155_E	191_K	1.047	0.17
248_D	566_E	1.044	0.17
554_A	562_A	1.040	0.17
560_G	620_Q	1.039	0.17
167_I	551_A	1.036	0.17
212_R	217_V	1.032	0.17
275_A	336_T	1.030	0.17
123_V	166_R	1.029	0.17
313_F	395_A	1.027	0.17
275_A	332_S	1.025	0.17
248_D	574_V	1.019	0.17
495_T	539_L	1.018	0.17
51_P	414_T	1.018	0.17
389_Q	500_V	1.017	0.17
257_V	564_E	1.015	0.17
283_V	362_L	1.013	0.17
338_H	421_L	1.010	0.17
152_V	619_Q	1.009	0.17
568_R	591_S	1.007	0.17
166_R	450_T	1.002	0.16
5_D	233_A	0.994	0.16
391_V	395_A	0.993	0.16
365_A	438_P	0.990	0.16
104_E	513_L	0.989	0.16
385_A	511_G	0.988	0.16
19_Q	224_I	0.988	0.16
163_S	570_A	0.984	0.16
96_E	385_A	0.983	0.16
538_L	567_V	0.982	0.16
460_F	503_L	0.980	0.16
154_I	190_T	0.979	0.16
522_L	612_E	0.978	0.16
152_V	605_A	0.977	0.16
388_I	498_S	0.976	0.16
165_Q	472_Y	0.972	0.16
37_E	552_V	0.972	0.16
230_V	535_V	0.969	0.16
101_A	217_V	0.969	0.16
344_F	351_A	0.969	0.16
305_V	434_P	0.967	0.16
496_L	500_V	0.964	0.16
100_A	442_A	0.963	0.16
414_T	590_F	0.962	0.16
586_G	595_G	0.961	0.16
220_G	387_S	0.960	0.16
148_S	152_V	0.957	0.16
396_E	458_A	0.956	0.16
116_R	165_Q	0.955	0.16
298_A	460_F	0.955	0.16
147_T	237_R	0.954	0.16
375_A	470_V	0.952	0.16
117_A	438_P	0.952	0.16
410_N	611_S	0.951	0.16
317_V	471_A	0.948	0.15
465_G	588_G	0.946	0.15
74_E	175_L	0.943	0.15
138_M	238_V	0.942	0.15
165_Q	610_V	0.940	0.15
111_M	140_A	0.940	0.15
198_A	250_D	0.938	0.15
409_A	466_L	0.937	0.15
304_E	381_P	0.936	0.15
73_F	237_R	0.936	0.15
585_E	599_G	0.935	0.15
36_R	81_T	0.931	0.15
525_V	532_Q	0.931	0.15
153_G	193_D	0.930	0.15
510_V	616_E	0.930	0.15
99_L	238_V	0.927	0.15
570_A	605_A	0.925	0.15
494_Q	578_N	0.923	0.15
397_T	582_V	0.922	0.15
94_L	164_A	0.922	0.15
69_V	436_V	0.922	0.15
69_V	585_E	0.919	0.15
283_V	503_L	0.919	0.15
48_Y	111_M	0.916	0.15
6_Y	215_G	0.915	0.15
104_E	592_A	0.912	0.15
301_D	381_P	0.911	0.15
78_Y	321_L	0.910	0.15
212_R	224_I	0.909	0.15
286_V	355_T	0.909	0.15
458_A	571_V	0.909	0.15
237_R	502_E	0.908	0.15
189_G	411_D	0.907	0.15
299_L	570_A	0.906	0.15
417_Y	447_E	0.902	0.15
573_G	577_R	0.902	0.15
247_D	282_D	0.901	0.15
230_V	382_E	0.899	0.15
528_G	582_V	0.898	0.15
391_V	411_D	0.891	0.14
103_L	527_D	0.891	0.14
218_K	232_I	0.888	0.14
65_E	108_L	0.884	0.14
364_D	516_A	0.881	0.14
207_I	449_L	0.877	0.14
56_L	456_Y	0.877	0.14
177_S	470_V	0.873	0.14
319_R	506_D	0.873	0.14
213_S	336_T	0.873	0.14
78_Y	502_E	0.872	0.14
346_T	395_A	0.872	0.14
99_L	411_D	0.871	0.14
321_L	325_R	0.871	0.14
454_E	458_A	0.869	0.14
196_S	254_R	0.868	0.14
466_L	493_A	0.868	0.14
65_E	162_E	0.867	0.14
355_T	452_K	0.867	0.14
524_L	551_A	0.866	0.14
164_A	191_K	0.866	0.14
382_E	540_A	0.865	0.14
176_Y	397_T	0.865	0.14
109_L	572_V	0.864	0.14
158_M	307_A	0.861	0.14
323_A	329_T	0.859	0.14
224_I	344_F	0.856	0.14
296_R	410_N	0.856	0.14
585_E	608_D	0.855	0.14
81_T	471_A	0.855	0.14
119_V	409_A	0.854	0.14
44_T	332_S	0.853	0.14
147_T	421_L	0.852	0.14
216_K	501_T	0.851	0.14
101_A	441_S	0.851	0.14
495_T	499_T	0.851	0.14
404_E	448_L	0.851	0.14
268_D	616_E	0.850	0.14
495_T	585_E	0.849	0.14
324_D	418_L	0.849	0.14
299_L	478_L	0.842	0.14
165_Q	346_T	0.841	0.14
113_A	578_N	0.840	0.14
400_A	563_A	0.837	0.14
233_A	605_A	0.836	0.14
80_T	228_V	0.836	0.14
65_E	205_E	0.835	0.14
565_D	569_E	0.835	0.14
31_C	427_M	0.832	0.13
479_F	595_G	0.829	0.13
499_T	564_E	0.828	0.13
81_T	275_A	0.826	0.13
313_F	387_S	0.825	0.13
33_T	374_V	0.824	0.13
70_E	228_V	0.823	0.13
433_V	502_E	0.819	0.13
398_A	403_P	0.819	0.13
111_M	346_T	0.819	0.13
221_L	593_L	0.817	0.13
246_L	282_D	0.817	0.13
28_F	31_C	0.811	0.13
499_T	536_P	0.811	0.13
108_L	213_S	0.811	0.13
124_V	129_N	0.808	0.13
287_F	362_L	0.808	0.13
254_R	386_Q	0.807	0.13
559_L	567_V	0.807	0.13
158_M	186_V	0.805	0.13
167_I	514_T	0.804	0.13
166_R	174_V	0.804	0.13
361_A	552_V	0.804	0.13
388_I	506_D	0.804	0.13
417_Y	456_Y	0.803	0.13
313_F	462_L	0.803	0.13
111_M	277_V	0.802	0.13
195_S	199_Q	0.802	0.13
411_D	528_G	0.801	0.13
327_L	331_F	0.800	0.13
71_R	423_G	0.798	0.13
578_N	582_V	0.798	0.13
50_H	163_S	0.798	0.13
153_G	293_G	0.797	0.13
116_R	450_T	0.796	0.13
235_G	260_Q	0.795	0.13
165_Q	562_A	0.795	0.13
289_D	412_D	0.795	0.13
381_P	439_D	0.794	0.13
581_Q	590_F	0.794	0.13
500_V	513_L	0.794	0.13
270_L	358_E	0.792	0.13
33_T	368_A	0.791	0.13
191_K	297_G	0.791	0.13
499_T	605_A	0.790	0.13
130_T	479_F	0.788	0.13
364_D	371_D	0.787	0.13
321_L	327_L	0.785	0.13
31_C	92_H	0.785	0.13
145_I	303_G	0.784	0.13
95_D	468_E	0.784	0.13
212_R	222_G	0.783	0.13
151_P	478_L	0.783	0.13
592_A	618_I	0.783	0.13
530_L	582_V	0.783	0.13
52_T	105_I	0.782	0.13
81_T	436_V	0.780	0.13
318_G	325_R	0.780	0.13
211_L	247_D	0.779	0.13
176_Y	619_Q	0.777	0.13
176_Y	565_D	0.776	0.13
36_R	433_V	0.776	0.13
212_R	244_Q	0.774	0.13
51_P	67_S	0.774	0.13
559_L	597_C	0.774	0.13
65_E	337_R	0.773	0.13
525_V	562_A	0.770	0.13
277_V	421_L	0.769	0.13
194_I	409_A	0.766	0.12
356_A	612_E	0.765	0.12
483_V	496_L	0.764	0.12
533_E	602_R	0.763	0.12
311_H	444_E	0.763	0.12
209_M	250_D	0.763	0.12
11_L	318_G	0.762	0.12
586_G	620_Q	0.758	0.12
317_V	331_F	0.757	0.12
253_V	283_V	0.757	0.12
140_A	392_A	0.757	0.12
131_G	460_F	0.755	0.12
554_A	563_A	0.752	0.12
113_A	443_V	0.745	0.12
67_S	78_Y	0.744	0.12
174_V	576_E	0.744	0.12
164_A	178_L	0.743	0.12
67_S	614_L	0.743	0.12
81_T	322_Q	0.742	0.12
104_E	597_C	0.742	0.12
196_S	201_R	0.742	0.12
261_V	463_D	0.741	0.12
379_D	384_A	0.741	0.12
76_L	203_A	0.741	0.12
254_R	492_A	0.739	0.12
524_L	618_I	0.738	0.12
45_F	123_V	0.738	0.12
253_V	618_I	0.738	0.12
447_E	456_Y	0.737	0.12
28_F	263_L	0.737	0.12
199_Q	514_T	0.735	0.12
592_A	600_A	0.735	0.12
565_D	568_R	0.735	0.12
250_D	533_E	0.734	0.12
271_D	376_I	0.733	0.12
7_D	527_D	0.733	0.12
138_M	505_R	0.733	0.12
336_T	343_I	0.732	0.12
115_D	559_L	0.730	0.12
355_T	487_V	0.730	0.12
299_L	525_V	0.729	0.12
444_E	532_Q	0.728	0.12
213_S	238_V	0.726	0.12
107_H	443_V	0.726	0.12
529_D	582_V	0.726	0.12
269_E	325_R	0.725	0.12
336_T	448_L	0.725	0.12
103_L	536_P	0.724	0.12
314_D	374_V	0.724	0.12
340_A	384_A	0.723	0.12
82_C	263_L	0.720	0.12
283_V	487_V	0.720	0.12
207_I	495_T	0.719	0.12
531_A	606_D	0.718	0.12
108_L	154_I	0.717	0.12
84_V	89_E	0.716	0.12
408_G	421_L	0.715	0.12
335_A	339_G	0.715	0.12
71_R	567_V	0.715	0.12
240_M	418_L	0.715	0.12
523_G	582_V	0.708	0.12
23_T	414_T	0.707	0.12
24_A	536_P	0.706	0.12
78_Y	237_R	0.705	0.12
167_I	376_I	0.704	0.12
200_A	424_A	0.703	0.12
23_T	125_I	0.703	0.12
97_D	542_L	0.703	0.12
361_A	367_G	0.703	0.12
389_Q	620_Q	0.703	0.12
230_V	424_A	0.702	0.12
68_R	528_G	0.702	0.12
553_L	588_G	0.701	0.12
335_A	502_E	0.701	0.12
291_E	605_A	0.700	0.12
196_S	304_E	0.699	0.11
264_L	267_V	0.699	0.11
17_I	139_V	0.698	0.11
145_I	203_A	0.698	0.11
96_E	551_A	0.698	0.11
11_L	325_R	0.697	0.11
8_E	361_A	0.697	0.11
163_S	248_D	0.697	0.11
392_A	396_E	0.696	0.11
286_V	496_L	0.696	0.11
355_T	358_E	0.695	0.11
529_D	583_A	0.695	0.11
310_L	384_A	0.694	0.11
46_T	101_A	0.694	0.11
211_L	244_Q	0.694	0.11
568_R	590_F	0.694	0.11
179_D	405_E	0.693	0.11
230_V	304_E	0.692	0.11
313_F	375_A	0.692	0.11
381_P	529_D	0.691	0.11
433_V	437_D	0.691	0.11
162_E	346_T	0.691	0.11
166_R	193_D	0.690	0.11
228_V	250_D	0.690	0.11
215_G	539_L	0.689	0.11
418_L	465_G	0.688	0.11
287_F	290_T	0.688	0.11
106_G	537_E	0.688	0.11
538_L	542_L	0.687	0.11
393_E	551_A	0.686	0.11
267_V	552_V	0.686	0.11
483_V	525_V	0.686	0.11
170_R	495_T	0.686	0.11
33_T	341_G	0.684	0.11
49_L	292_S	0.684	0.11
140_A	176_Y	0.683	0.11
466_L	490_T	0.683	0.11
383_T	550_P	0.680	0.11
106_G	164_A	0.679	0.11
562_A	579_S	0.678	0.11
215_G	325_R	0.678	0.11
113_A	528_G	0.678	0.11
64_L	73_F	0.677	0.11
279_K	464_A	0.677	0.11
391_V	538_L	0.676	0.11
285_D	365_A	0.675	0.11
293_G	615_R	0.675	0.11
483_V	486_G	0.673	0.11
469_Q	498_S	0.673	0.11
331_F	391_V	0.673	0.11
439_D	555_E	0.672	0.11
163_S	203_A	0.672	0.11
247_D	344_F	0.671	0.11
96_E	100_A	0.671	0.11
244_Q	607_G	0.671	0.11
7_D	516_A	0.670	0.11
513_L	604_K	0.669	0.11
595_G	614_L	0.669	0.11
337_R	601_L	0.669	0.11
176_Y	202_E	0.669	0.11
105_I	374_V	0.667	0.11
95_D	597_C	0.665	0.11
470_V	497_E	0.665	0.11
85_E	350_P	0.663	0.11
12_V	617_E	0.662	0.11
88_D	108_L	0.661	0.11
29_C	263_L	0.661	0.11
136_S	324_D	0.660	0.11
591_S	595_G	0.658	0.11
85_E	178_L	0.658	0.11
19_Q	595_G	0.658	0.11
93_R	556_E	0.658	0.11
570_A	589_A	0.657	0.11
379_D	558_G	0.655	0.11
583_A	613_V	0.655	0.11
478_L	565_D	0.654	0.11
320_E	325_R	0.654	0.11
395_A	502_E	0.652	0.11
13_A	166_R	0.650	0.11
272_A	511_G	0.649	0.11
296_R	364_D	0.649	0.11
139_V	389_Q	0.648	0.11
486_G	492_A	0.648	0.11
119_V	466_L	0.646	0.11
399_M	504_R	0.645	0.11
139_V	380_D	0.645	0.11
113_A	234_D	0.645	0.11
92_H	155_E	0.645	0.11
71_R	429_P	0.643	0.11
366_V	417_Y	0.642	0.11
78_Y	228_V	0.640	0.11
269_E	272_A	0.640	0.11
170_R	173_G	0.640	0.11
196_S	571_V	0.640	0.11
36_R	80_T	0.638	0.11
142_G	404_E	0.636	0.11
383_T	618_I	0.634	0.11
250_D	610_V	0.633	0.11
176_Y	193_D	0.632	0.11
104_E	245_S	0.632	0.11
117_A	136_S	0.632	0.11
578_N	592_A	0.632	0.11
399_M	601_L	0.632	0.11
14_G	18_H	0.631	0.11
14_G	26_K	0.630	0.11
18_H	26_K	0.630	0.11
16_E	26_K	0.630	0.11
96_E	117_A	0.630	0.11
31_C	263_L	0.630	0.11
342_G	430_E	0.630	0.11
120_M	420_P	0.630	0.11
120_M	430_E	0.630	0.11
420_P	430_E	0.630	0.11
120_M	342_G	0.630	0.11
342_G	420_P	0.630	0.11
48_Y	72_E	0.629	0.11
95_D	453_V	0.629	0.11
62_A	347_D	0.627	0.11
8_E	272_A	0.626	0.11
109_L	188_I	0.625	0.10
269_E	318_G	0.625	0.10
194_I	424_A	0.625	0.10
174_V	295_I	0.625	0.10
367_G	521_V	0.623	0.10
41_A	76_L	0.623	0.10
332_S	341_G	0.622	0.10
183_I	273_R	0.620	0.10
24_A	521_V	0.619	0.10
109_L	503_L	0.618	0.10
207_I	472_Y	0.618	0.10
230_V	491_L	0.618	0.10
190_T	332_S	0.617	0.10
64_L	293_G	0.617	0.10
207_I	415_S	0.617	0.10
37_E	438_P	0.615	0.10
199_Q	605_A	0.614	0.10
593_L	607_G	0.613	0.10
22_D	33_T	0.613	0.10
482_Q	620_Q	0.612	0.10
173_G	252_L	0.610	0.10
390_A	425_A	0.609	0.10
283_V	412_D	0.607	0.10
226_Q	358_E	0.607	0.10
293_G	522_L	0.607	0.10
33_T	287_F	0.606	0.10
553_L	557_L	0.604	0.10
497_E	502_E	0.602	0.10
101_A	552_V	0.602	0.10
148_S	202_E	0.601	0.10
150_G	589_A	0.601	0.10
567_V	613_V	0.600	0.10
444_E	529_D	0.600	0.10
15_L	559_L	0.599	0.10
236_A	417_Y	0.599	0.10
247_D	336_T	0.598	0.10
11_L	320_E	0.598	0.10
113_A	581_Q	0.598	0.10
348_E	353_G	0.597	0.10
425_A	429_P	0.597	0.10
357_A	566_E	0.597	0.10
453_V	590_F	0.597	0.10
117_A	423_G	0.597	0.10
132_G	446_P	0.596	0.10
33_T	478_L	0.595	0.10
549_D	555_E	0.594	0.10
461_D	597_C	0.593	0.10
209_M	213_S	0.593	0.10
458_A	514_T	0.591	0.10
81_T	213_S	0.590	0.10
171_E	493_A	0.590	0.10
463_D	522_L	0.590	0.10
322_Q	325_R	0.590	0.10
221_L	244_Q	0.590	0.10
170_R	470_V	0.589	0.10
594_M	607_G	0.589	0.10
13_A	205_E	0.589	0.10
125_I	163_S	0.587	0.10
299_L	312_G	0.587	0.10
106_G	234_D	0.587	0.10
446_P	594_M	0.586	0.10
13_A	466_L	0.584	0.10
449_L	477_Q	0.584	0.10
162_E	600_A	0.583	0.10
221_L	254_R	0.583	0.10
214_T	305_V	0.583	0.10
34_T	80_T	0.580	0.10
13_A	155_E	0.580	0.10
586_G	614_L	0.580	0.10
199_Q	483_V	0.579	0.10
575_V	601_L	0.579	0.10
146_D	373_A	0.578	0.10
14_G	27_L	0.577	0.10
16_E	27_L	0.577	0.10
18_H	27_L	0.577	0.10
52_T	118_H	0.576	0.10
408_G	591_S	0.575	0.10
312_G	360_A	0.575	0.10
213_S	474_R	0.575	0.10
19_Q	101_A	0.574	0.10
158_M	238_V	0.574	0.10
130_T	350_P	0.573	0.10
22_D	189_G	0.572	0.10
107_H	600_A	0.572	0.10
238_V	343_I	0.571	0.10
35_R	199_Q	0.571	0.10
291_E	556_E	0.571	0.10
216_K	367_G	0.571	0.10
414_T	611_S	0.570	0.10
300_D	568_R	0.570	0.10
162_E	228_V	0.569	0.10
307_A	322_Q	0.569	0.10
383_T	524_L	0.569	0.10
340_A	377_V	0.568	0.10
85_E	226_Q	0.567	0.10
23_T	66_E	0.567	0.10
518_F	522_L	0.567	0.10
233_A	565_D	0.565	0.10
19_Q	222_G	0.565	0.10
103_L	442_A	0.564	0.10
371_D	487_V	0.564	0.10
103_L	495_T	0.564	0.10
111_M	142_G	0.563	0.10
236_A	558_G	0.563	0.10
45_F	362_L	0.563	0.10
100_A	364_D	0.563	0.10
156_D	163_S	0.562	0.10
232_I	264_L	0.562	0.10
538_L	554_A	0.561	0.10
363_R	511_G	0.560	0.10
71_R	497_E	0.559	0.10
317_V	448_L	0.558	0.10
384_A	489_A	0.558	0.10
80_T	511_G	0.558	0.10
151_P	548_S	0.557	0.10
188_I	211_L	0.557	0.10
425_A	558_G	0.556	0.10
418_L	576_E	0.556	0.10
186_V	343_I	0.555	0.10
351_A	585_E	0.552	0.10
323_A	333_D	0.552	0.10
108_L	443_V	0.552	0.10
170_R	175_L	0.551	0.10
364_D	576_E	0.551	0.10
109_L	368_A	0.550	0.10
108_L	614_L	0.549	0.10
362_L	530_L	0.549	0.10
415_S	493_A	0.549	0.10
410_N	416_K	0.548	0.10
425_A	435_P	0.547	0.10
61_E	142_G	0.546	0.10
10_G	232_I	0.544	0.09
106_G	214_T	0.544	0.09
104_E	237_R	0.544	0.09
147_T	391_V	0.543	0.09
67_S	147_T	0.541	0.09
71_R	338_H	0.541	0.09
335_A	417_Y	0.540	0.09
167_I	538_L	0.539	0.09
104_E	338_H	0.539	0.09
297_G	418_L	0.539	0.09
176_Y	587_M	0.538	0.09
343_I	370_E	0.537	0.09
119_V	590_F	0.537	0.09
524_L	597_C	0.537	0.09
230_V	380_D	0.536	0.09
138_M	397_T	0.536	0.09
295_I	299_L	0.535	0.09
533_E	614_L	0.535	0.09
268_D	458_A	0.534	0.09
69_V	343_I	0.534	0.09
56_L	164_A	0.533	0.09
295_I	434_P	0.533	0.09
438_P	585_E	0.533	0.09
373_A	594_M	0.532	0.09
198_A	240_M	0.532	0.09
210_L	476_W	0.532	0.09
65_E	211_L	0.531	0.09
237_R	325_R	0.531	0.09
11_L	377_V	0.530	0.09
147_T	605_A	0.529	0.09
361_A	615_R	0.529	0.09
348_E	420_P	0.529	0.09
348_E	430_E	0.529	0.09
120_M	348_E	0.529	0.09
342_G	348_E	0.529	0.09
155_E	421_L	0.528	0.09
8_E	518_F	0.526	0.09
217_V	222_G	0.526	0.09
341_G	445_T	0.526	0.09
283_V	389_Q	0.525	0.09
94_L	514_T	0.525	0.09
176_Y	423_G	0.525	0.09
361_A	509_P	0.524	0.09
543_A	583_A	0.524	0.09
167_I	240_M	0.523	0.09
329_T	497_E	0.523	0.09
279_K	296_R	0.523	0.09
111_M	395_A	0.522	0.09
95_D	98_A	0.522	0.09
418_L	597_C	0.522	0.09
500_V	549_D	0.521	0.09
109_L	210_L	0.520	0.09
9_L	139_V	0.520	0.09
213_S	445_T	0.520	0.09
36_R	228_V	0.520	0.09
50_H	392_A	0.519	0.09
353_G	420_P	0.519	0.09
353_G	430_E	0.519	0.09
120_M	353_G	0.519	0.09
342_G	353_G	0.519	0.09
51_P	327_L	0.519	0.09
215_G	546_P	0.519	0.09
153_G	615_R	0.519	0.09
168_E	175_L	0.518	0.09
78_Y	165_Q	0.517	0.09
150_G	567_V	0.517	0.09
86_E	95_D	0.517	0.09
297_G	567_V	0.516	0.09
78_Y	213_S	0.516	0.09
361_A	554_A	0.516	0.09
67_S	213_S	0.516	0.09
496_L	525_V	0.515	0.09
281_R	369_G	0.514	0.09
78_Y	275_A	0.514	0.09
93_R	265_D	0.514	0.09
514_T	517_H	0.514	0.09
152_V	451_E	0.514	0.09
389_Q	567_V	0.513	0.09
61_E	275_A	0.513	0.09
141_E	228_V	0.513	0.09
152_V	518_F	0.512	0.09
144_A	439_D	0.511	0.09
61_E	237_R	0.511	0.09
228_V	551_A	0.511	0.09
23_T	139_V	0.510	0.09
584_A	593_L	0.510	0.09
124_V	420_P	0.510	0.09
124_V	430_E	0.510	0.09
124_V	342_G	0.510	0.09
501_T	504_R	0.510	0.09
120_M	124_V	0.510	0.09
518_F	561_S	0.508	0.09
375_A	509_P	0.508	0.09
31_C	101_A	0.508	0.09
165_Q	491_L	0.507	0.09
266_I	451_E	0.507	0.09
581_Q	591_S	0.506	0.09
436_V	553_L	0.505	0.09
46_T	600_A	0.504	0.09
162_E	205_E	0.503	0.09
158_M	293_G	0.503	0.09
13_A	237_R	0.503	0.09
264_L	325_R	0.503	0.09
28_F	82_C	0.502	0.09
541_A	556_E	0.502	0.09
354_V	412_D	0.502	0.09
524_L	564_E	0.502	0.09
496_L	527_D	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1zq1C	1	0.7958	100	0.31	Contact Map
2d6fC	1	0.7685	100	0.317	Contact Map
3al0B	1	0.7122	100	0.625	Contact Map
3h0lB	1	0.6109	100	0.625	Contact Map
3ip4B	1	0.7122	100	0.627	Contact Map
3kfuF	2	0.5884	100	0.661	Contact Map
4wj3B	2	0.5932	100	0.671	Contact Map
4n0hB	1	0.4116	100	0.758	Contact Map
2hz7A	1	0.1961	99.9	0.911	Contact Map
1ng6A	1	0.2299	99.6	0.942	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.015 seconds.