Q9HPZ0 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPZ0 - UDP-sugar hydrolase

UniProt:	Q9HPZ0	Sequences: MRTAMTLLVASLCVLSAAVVPAGAVQASTDAATGTTAPPVATDATTAQANNTTVTILSYNDIQTAAAENDSLPRLATLVAERRAAHDNPTFVFGAGDEVSPHSLSPLTKWQTPVDTLNVIDPDAEAIGNHDLDFGFEAVANFSEASTFPWLMANIVDSETGDPIPGTEPYTVVEKQGVRVGVIGLADQKIKPKTAVDFAEQGYELRDYAAAGSEYATQLRTEEDADVVVVLGHFGVPVAKQLANETENVDAVLVGDDEIKYPPAETNGVVISEGEARANYLGELNLTVSDGAVTDWEGRLIDTQNATHNETVSTLIEDARGEELARVAGRTETTLDARFASNYHDETALGNLVTDAFRAKTGADVAATNAGGIRSNSQYGPGNVTAGNVYNMLPFNNHLVTMRLTGSELTALLESQVETVGDDGAYDPQAKLQVSGVTYEWATHADADSLVRDVSVNGTPVAPNATYNVTVNSYMAGWDSVANATVLNEEYTLYGTVLFDYIDAQGTVSPADTDRIRRVDATADAGTVSLDGAGDAAVSFAMPSTNATVDTQAFYALNAVGERVNATRTTVSDNGTVSVVFPDSSLRTLAADGDGDIDVYGHYSVAGREYGYFNASVVNADVTATMASSNGTATTVDLTAETDTTTTPPADTDAGTGLPVPGFGIGVAVLAVFGAALLASRR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	682 (539)
Sequences:	451 (367)
Seq/√Len:	15.8

ECOLI - CPDB USHA
BACSU - NTPES YUND YHCR
HALSA - Q9HPZ0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
329_G	502_I	5.077	1.00
407_S	411_A	5.054	1.00
405_T	408_E	4.715	1.00
181_G	219_L	4.600	1.00
80_A	309_N	4.542	1.00
313_S	317_E	4.465	1.00
403_R	466_T	4.307	1.00
454_V	461_V	3.836	1.00
185_L	212_G	3.832	1.00
358_R	435_S	3.703	1.00
455_S	460_P	3.674	1.00
190_I	205_L	3.527	0.99
462_A	465_A	3.426	0.99
440_E	453_D	3.281	0.99
251_A	284_L	3.252	0.99
252_V	271_I	3.230	0.99
95_A	253_L	2.996	0.98
355_D	515_R	2.975	0.98
353_V	373_I	2.858	0.98
93_F	253_L	2.720	0.97
404_L	469_V	2.678	0.96
445_A	449_S	2.644	0.96
414_E	448_D	2.643	0.96
93_F	182_V	2.576	0.95
410_T	454_V	2.548	0.95
404_L	409_L	2.546	0.95
415_S	483_N	2.532	0.95
327_V	383_N	2.507	0.95
193_K	256_D	2.482	0.94
310_E	314_T	2.479	0.94
371_G	374_R	2.469	0.94
93_F	231_L	2.453	0.94
243_A	252_V	2.446	0.94
317_E	321_G	2.401	0.93
350_G	373_I	2.391	0.93
212_G	249_V	2.375	0.93
170_Y	181_G	2.375	0.93
216_A	246_T	2.372	0.93
409_L	461_V	2.372	0.93
92_V	120_I	2.360	0.93
59_Y	122_P	2.349	0.92
369_N	372_G	2.335	0.92
331_T	334_T	2.277	0.91
126_A	151_L	2.262	0.91
471_V	476_A	2.255	0.91
158_S	202_G	2.252	0.91
152_M	186_A	2.185	0.89
274_G	280_Y	2.140	0.88
365_V	409_L	2.111	0.88
409_L	437_V	2.102	0.87
185_L	230_V	2.095	0.87
477_G	481_V	2.085	0.87
59_Y	94_G	2.053	0.86
374_R	395_F	2.023	0.85
438_T	455_S	2.006	0.85
565_N	574_N	2.005	0.85
438_T	458_G	1.996	0.84
570_T	573_D	1.994	0.84
170_Y	215_Y	1.974	0.84
124_A	182_V	1.961	0.83
62_I	72_L	1.945	0.83
93_F	124_A	1.892	0.81
407_S	410_T	1.882	0.81
346_E	351_N	1.879	0.80
218_Q	223_E	1.856	0.80
206_R	211_A	1.847	0.79
99_V	142_F	1.840	0.79
82_R	85_A	1.837	0.79
178_V	227_V	1.827	0.78
65_A	277_R	1.825	0.78
417_V	439_Y	1.799	0.77
249_V	252_V	1.791	0.77
460_P	463_P	1.776	0.76
445_A	448_D	1.758	0.76
80_A	310_E	1.756	0.76
94_G	122_P	1.748	0.75
274_G	282_G	1.734	0.75
60_N	274_G	1.734	0.75
410_T	463_P	1.732	0.75
364_D	467_Y	1.732	0.75
405_T	409_L	1.730	0.74
173_V	182_V	1.721	0.74
133_D	515_R	1.720	0.74
76_A	80_A	1.710	0.74
110_W	416_Q	1.686	0.73
555_Y	559_A	1.678	0.72
312_V	315_L	1.663	0.71
214_E	218_Q	1.648	0.71
291_G	322_E	1.611	0.69
576_T	582_P	1.607	0.69
413_L	454_V	1.591	0.68
563_R	566_A	1.583	0.68
346_E	435_S	1.582	0.67
118_N	148_F	1.573	0.67
405_T	464_N	1.553	0.66
583_D	587_R	1.551	0.66
369_N	397_N	1.545	0.66
576_T	584_S	1.539	0.65
212_G	246_T	1.512	0.64
289_S	294_T	1.508	0.64
357_F	471_V	1.505	0.63
552_Q	558_N	1.480	0.62
54_V	180_V	1.479	0.62
576_T	586_L	1.478	0.62
155_I	186_A	1.477	0.62
561_G	564_V	1.475	0.62
368_T	393_L	1.463	0.61
81_E	84_A	1.459	0.61
409_L	463_P	1.456	0.61
343_Y	479_D	1.440	0.60
578_S	586_L	1.435	0.60
446_D	449_S	1.421	0.59
172_V	179_R	1.421	0.59
131_D	478_W	1.420	0.59
538_V	544_S	1.410	0.58
212_G	232_G	1.409	0.58
372_G	396_N	1.396	0.57
43_D	49_A	1.393	0.57
573_D	581_F	1.392	0.57
299_R	312_V	1.389	0.57
442_A	450_L	1.382	0.57
478_W	481_V	1.379	0.57
230_V	249_V	1.377	0.56
575_G	582_P	1.376	0.56
64_T	105_S	1.368	0.56
436_G	472_N	1.360	0.55
551_T	558_N	1.355	0.55
556_A	561_G	1.353	0.55
129_N	395_F	1.352	0.55
275_E	280_Y	1.347	0.55
541_A	544_S	1.332	0.54
534_G	538_V	1.327	0.54
100_S	113_P	1.325	0.53
86_H	90_T	1.316	0.53
539_S	546_N	1.314	0.53
119_V	315_L	1.313	0.53
432_L	475_M	1.311	0.53
345_D	409_L	1.306	0.52
55_T	285_N	1.305	0.52
53_T	287_T	1.298	0.52
445_A	452_R	1.286	0.51
152_M	155_I	1.285	0.51
555_Y	558_N	1.276	0.51
108_T	112_T	1.273	0.50
556_A	563_R	1.271	0.50
180_V	460_P	1.270	0.50
95_A	272_S	1.269	0.50
80_A	408_E	1.268	0.50
56_I	175_K	1.266	0.50
567_T	571_V	1.261	0.50
552_Q	555_Y	1.260	0.50
190_I	354_T	1.259	0.50
564_V	579_V	1.253	0.49
350_G	433_Q	1.250	0.49
477_G	480_S	1.248	0.49
546_N	549_V	1.242	0.49
66_A	278_A	1.240	0.49
141_N	229_V	1.235	0.48
139_V	155_I	1.234	0.48
127_I	151_L	1.232	0.48
186_A	461_V	1.224	0.48
243_A	484_A	1.223	0.48
120_I	278_A	1.217	0.47
257_D	273_E	1.208	0.47
330_R	383_N	1.208	0.47
99_V	110_W	1.206	0.47
57_L	90_T	1.204	0.46
181_G	225_A	1.199	0.46
534_G	537_A	1.197	0.46
577_V	580_V	1.194	0.46
160_T	212_G	1.190	0.46
575_G	584_S	1.190	0.46
387_G	390_Y	1.189	0.46
556_A	559_A	1.188	0.46
194_T	198_F	1.187	0.46
442_A	445_A	1.182	0.45
185_L	232_G	1.182	0.45
577_V	582_P	1.179	0.45
578_S	581_F	1.179	0.45
187_D	478_W	1.168	0.44
371_G	395_F	1.167	0.44
63_Q	101_P	1.164	0.44
100_S	216_A	1.163	0.44
354_T	365_V	1.161	0.44
228_V	250_D	1.161	0.44
535_D	538_V	1.159	0.44
574_N	582_P	1.159	0.44
233_H	256_D	1.156	0.44
381_P	405_T	1.150	0.43
434_V	515_R	1.149	0.43
66_A	131_D	1.149	0.43
557_L	570_T	1.146	0.43
366_A	472_N	1.144	0.43
172_V	221_T	1.141	0.43
576_T	583_D	1.141	0.43
128_G	233_H	1.136	0.43
61_D	258_E	1.127	0.42
215_Y	218_Q	1.125	0.42
580_V	584_S	1.122	0.42
277_R	491_Y	1.121	0.42
157_D	160_T	1.120	0.42
580_V	586_L	1.120	0.42
94_G	98_E	1.119	0.42
549_V	554_F	1.118	0.42
131_D	397_N	1.116	0.41
569_T	586_L	1.116	0.41
431_K	471_V	1.115	0.41
570_T	581_F	1.111	0.41
534_G	550_D	1.109	0.41
60_N	95_A	1.109	0.41
129_N	256_D	1.108	0.41
350_G	369_N	1.107	0.41
61_D	97_D	1.106	0.41
474_Y	478_W	1.104	0.41
275_E	279_N	1.103	0.41
570_T	577_V	1.102	0.41
63_Q	258_E	1.100	0.41
228_V	329_G	1.098	0.40
543_P	554_F	1.097	0.40
357_F	373_I	1.097	0.40
242_L	252_V	1.095	0.40
366_A	436_G	1.095	0.40
357_F	393_L	1.094	0.40
556_A	580_V	1.090	0.40
163_P	211_A	1.089	0.40
405_T	466_T	1.089	0.40
290_D	294_T	1.083	0.40
541_A	546_N	1.080	0.39
546_N	555_Y	1.073	0.39
417_V	441_W	1.068	0.39
335_L	348_A	1.066	0.39
579_V	586_L	1.065	0.39
124_A	457_N	1.062	0.39
174_E	182_V	1.061	0.38
331_T	384_V	1.060	0.38
446_D	543_P	1.058	0.38
562_E	569_T	1.057	0.38
374_R	479_D	1.055	0.38
372_G	376_N	1.049	0.38
530_L	533_A	1.049	0.38
235_G	256_D	1.044	0.38
352_L	356_A	1.044	0.38
567_T	572_S	1.041	0.37
121_D	274_G	1.031	0.37
58_S	254_V	1.029	0.37
409_L	462_A	1.028	0.37
350_G	371_G	1.027	0.37
551_T	555_Y	1.026	0.37
496_T	500_D	1.024	0.36
71_S	450_L	1.024	0.36
571_V	579_V	1.020	0.36
117_L	122_P	1.020	0.36
414_E	450_L	1.019	0.36
575_G	583_D	1.018	0.36
140_A	229_V	1.015	0.36
314_T	317_E	1.015	0.36
225_A	228_V	1.007	0.36
189_K	256_D	1.002	0.35
328_A	408_E	0.997	0.35
78_L	303_T	0.997	0.35
567_T	578_S	0.995	0.35
535_D	540_F	0.988	0.35
97_D	129_N	0.985	0.34
58_S	110_W	0.983	0.34
100_S	131_D	0.982	0.34
412_L	483_N	0.979	0.34
557_L	561_G	0.979	0.34
392_M	475_M	0.975	0.34
94_G	235_G	0.975	0.34
59_Y	102_H	0.975	0.34
200_E	205_L	0.972	0.34
113_P	416_Q	0.968	0.34
369_N	374_R	0.967	0.33
239_A	274_G	0.964	0.33
560_V	566_A	0.964	0.33
187_D	273_E	0.964	0.33
351_N	491_Y	0.962	0.33
194_T	347_T	0.957	0.33
113_P	494_Y	0.957	0.33
568_R	576_T	0.957	0.33
153_A	211_A	0.956	0.33
47_A	328_A	0.955	0.33
60_N	400_V	0.955	0.33
445_A	450_L	0.954	0.33
293_V	514_D	0.954	0.33
531_D	573_D	0.953	0.33
78_L	281_L	0.953	0.33
569_T	579_V	0.945	0.32
121_D	358_R	0.944	0.32
553_A	561_G	0.944	0.32
42_T	47_A	0.943	0.32
328_A	364_D	0.943	0.32
212_G	216_A	0.942	0.32
546_N	569_T	0.938	0.32
328_A	359_A	0.937	0.32
180_V	227_V	0.937	0.32
398_H	500_D	0.936	0.32
131_D	495_G	0.934	0.32
570_T	578_S	0.930	0.32
350_G	366_A	0.930	0.32
109_K	134_F	0.928	0.32
228_V	249_V	0.925	0.31
48_Q	546_N	0.922	0.31
221_T	224_D	0.922	0.31
542_M	548_T	0.920	0.31
527_T	532_G	0.918	0.31
221_T	451_V	0.914	0.31
78_L	182_V	0.912	0.31
556_A	564_V	0.910	0.31
147_T	314_T	0.909	0.31
94_G	101_P	0.909	0.31
558_N	562_E	0.908	0.31
100_S	110_W	0.907	0.30
547_A	552_Q	0.907	0.30
538_V	548_T	0.903	0.30
153_A	159_E	0.903	0.30
110_W	141_N	0.903	0.30
369_N	395_F	0.902	0.30
540_F	554_F	0.897	0.30
60_N	394_P	0.897	0.30
77_T	398_H	0.894	0.30
576_T	587_R	0.893	0.30
549_V	564_V	0.891	0.30
79_V	83_R	0.890	0.30
544_S	582_P	0.886	0.29
183_I	284_L	0.883	0.29
577_V	583_D	0.883	0.29
110_W	113_P	0.881	0.29
153_A	293_V	0.881	0.29
398_H	489_E	0.880	0.29
401_T	488_N	0.880	0.29
420_V	441_W	0.879	0.29
570_T	580_V	0.878	0.29
543_P	556_A	0.878	0.29
397_N	472_N	0.878	0.29
83_R	90_T	0.876	0.29
535_D	543_P	0.874	0.29
393_L	495_G	0.874	0.29
556_A	560_V	0.872	0.29
409_L	456_V	0.869	0.29
234_F	242_L	0.868	0.29
105_S	113_P	0.867	0.29
535_D	542_M	0.864	0.28
407_S	464_N	0.864	0.28
81_E	317_E	0.863	0.28
578_S	583_D	0.861	0.28
554_F	561_G	0.860	0.28
91_F	210_A	0.858	0.28
146_S	150_W	0.858	0.28
346_E	491_Y	0.857	0.28
542_M	549_V	0.857	0.28
539_S	543_P	0.856	0.28
350_G	394_P	0.854	0.28
538_V	543_P	0.850	0.28
191_K	303_T	0.850	0.28
298_G	305_N	0.850	0.28
178_V	181_G	0.849	0.28
546_N	554_F	0.848	0.28
555_Y	563_R	0.844	0.27
342_N	431_K	0.843	0.27
413_L	439_Y	0.840	0.27
562_E	567_T	0.840	0.27
211_A	214_E	0.839	0.27
177_G	277_R	0.838	0.27
94_G	117_L	0.836	0.27
545_T	553_A	0.835	0.27
110_W	394_P	0.834	0.27
193_K	432_L	0.827	0.27
539_S	542_M	0.826	0.27
205_L	208_Y	0.825	0.27
572_S	580_V	0.824	0.27
573_D	577_V	0.824	0.27
411_A	483_N	0.821	0.26
415_S	481_V	0.820	0.26
384_V	499_F	0.820	0.26
178_V	226_D	0.819	0.26
172_V	267_N	0.817	0.26
361_T	401_T	0.817	0.26
537_A	544_S	0.814	0.26
393_L	515_R	0.812	0.26
129_N	374_R	0.810	0.26
371_G	394_P	0.809	0.26
63_Q	131_D	0.809	0.26
355_D	434_V	0.808	0.26
120_I	330_R	0.808	0.26
311_T	552_Q	0.804	0.26
138_A	141_N	0.804	0.26
138_A	142_F	0.798	0.25
374_R	394_P	0.798	0.25
565_N	572_S	0.797	0.25
541_A	579_V	0.796	0.25
536_A	539_S	0.795	0.25
297_E	530_L	0.794	0.25
394_P	467_Y	0.793	0.25
94_G	126_A	0.791	0.25
266_T	464_N	0.791	0.25
232_G	239_A	0.789	0.25
299_R	552_Q	0.789	0.25
217_T	286_L	0.788	0.25
269_V	373_I	0.788	0.25
232_G	316_I	0.786	0.25
54_V	401_T	0.786	0.25
561_G	570_T	0.786	0.25
56_I	253_L	0.783	0.25
229_V	314_T	0.783	0.25
146_S	180_V	0.782	0.25
369_N	394_P	0.782	0.25
568_R	574_N	0.777	0.25
156_V	206_R	0.777	0.25
284_L	571_V	0.777	0.25
50_N	333_T	0.776	0.24
123_D	405_T	0.775	0.24
132_L	139_V	0.775	0.24
102_H	133_D	0.774	0.24
191_K	200_E	0.770	0.24
555_Y	583_D	0.770	0.24
60_N	228_V	0.770	0.24
537_A	548_T	0.767	0.24
415_S	430_A	0.764	0.24
59_Y	63_Q	0.764	0.24
156_V	163_P	0.763	0.24
535_D	547_A	0.763	0.24
541_A	577_V	0.762	0.24
56_I	229_V	0.762	0.24
216_A	249_V	0.761	0.24
92_V	122_P	0.761	0.24
537_A	541_A	0.761	0.24
568_R	579_V	0.760	0.24
43_D	321_G	0.760	0.24
454_V	463_P	0.758	0.24
251_A	468_N	0.757	0.24
100_S	494_Y	0.756	0.24
529_S	533_A	0.756	0.24
117_L	376_N	0.756	0.24
542_M	545_T	0.753	0.24
73_P	366_A	0.753	0.24
246_T	249_V	0.752	0.23
113_P	134_F	0.752	0.23
372_G	397_N	0.752	0.23
346_E	355_D	0.751	0.23
333_T	510_P	0.751	0.23
182_V	393_L	0.751	0.23
572_S	583_D	0.751	0.23
580_V	583_D	0.750	0.23
547_A	556_A	0.749	0.23
284_L	466_T	0.744	0.23
394_P	479_D	0.743	0.23
430_A	475_M	0.743	0.23
147_T	305_N	0.742	0.23
395_F	479_D	0.742	0.23
91_F	532_G	0.742	0.23
149_P	248_N	0.742	0.23
554_F	574_N	0.741	0.23
548_T	573_D	0.740	0.23
56_I	252_V	0.738	0.23
88_N	172_V	0.738	0.23
304_Q	321_G	0.737	0.23
97_D	131_D	0.736	0.23
416_Q	432_L	0.736	0.23
584_S	587_R	0.733	0.23
393_L	494_Y	0.733	0.23
196_V	205_L	0.733	0.23
137_E	504_A	0.733	0.23
141_N	144_E	0.732	0.23
557_L	564_V	0.730	0.23
243_A	271_I	0.728	0.22
76_A	328_A	0.728	0.22
224_D	234_F	0.726	0.22
124_A	151_L	0.726	0.22
555_Y	564_V	0.725	0.22
566_A	578_S	0.723	0.22
582_P	585_S	0.721	0.22
561_G	566_A	0.721	0.22
143_S	459_T	0.720	0.22
403_R	468_N	0.717	0.22
417_V	433_Q	0.717	0.22
536_A	542_M	0.716	0.22
144_E	271_I	0.716	0.22
369_N	433_Q	0.715	0.22
579_V	587_R	0.714	0.22
62_I	122_P	0.714	0.22
555_Y	567_T	0.713	0.22
105_S	133_D	0.712	0.22
44_A	47_A	0.712	0.22
350_G	372_G	0.712	0.22
561_G	573_D	0.710	0.22
558_N	584_S	0.710	0.22
406_G	467_Y	0.709	0.22
575_G	581_F	0.704	0.22
80_A	84_A	0.704	0.22
567_T	570_T	0.704	0.22
59_Y	114_V	0.704	0.22
398_H	472_N	0.703	0.21
576_T	580_V	0.703	0.21
535_D	545_T	0.701	0.21
186_A	194_T	0.701	0.21
564_V	571_V	0.699	0.21
538_V	542_M	0.699	0.21
430_A	474_Y	0.698	0.21
273_E	478_W	0.697	0.21
60_N	273_E	0.697	0.21
133_D	394_P	0.697	0.21
533_A	543_P	0.697	0.21
194_T	370_A	0.695	0.21
421_G	425_A	0.694	0.21
179_R	217_T	0.693	0.21
174_E	218_Q	0.693	0.21
294_T	576_T	0.692	0.21
85_A	90_T	0.691	0.21
315_L	319_A	0.690	0.21
579_V	583_D	0.690	0.21
242_L	246_T	0.689	0.21
469_V	548_T	0.687	0.21
172_V	523_A	0.685	0.21
551_T	554_F	0.685	0.21
145_A	352_L	0.684	0.21
568_R	571_V	0.684	0.21
154_N	184_G	0.684	0.21
390_Y	416_Q	0.684	0.21
358_R	468_N	0.681	0.21
371_G	397_N	0.680	0.21
545_T	548_T	0.680	0.21
537_A	545_T	0.679	0.21
555_Y	570_T	0.678	0.21
576_T	579_V	0.677	0.21
100_S	416_Q	0.677	0.21
536_A	547_A	0.677	0.21
579_V	585_S	0.676	0.20
446_D	450_L	0.676	0.20
203_Y	295_D	0.675	0.20
253_L	277_R	0.673	0.20
581_F	585_S	0.672	0.20
536_A	554_F	0.672	0.20
409_L	562_E	0.671	0.20
369_N	474_Y	0.671	0.20
235_G	274_G	0.670	0.20
94_G	134_F	0.669	0.20
434_V	437_V	0.668	0.20
139_V	460_P	0.668	0.20
328_A	382_G	0.668	0.20
210_A	214_E	0.667	0.20
105_S	183_I	0.666	0.20
94_G	100_S	0.664	0.20
228_V	252_V	0.663	0.20
579_V	582_P	0.662	0.20
112_T	225_A	0.662	0.20
560_V	570_T	0.661	0.20
343_Y	448_D	0.661	0.20
380_G	388_N	0.660	0.20
80_A	179_R	0.659	0.20
574_N	580_V	0.656	0.20
262_P	367_A	0.655	0.20
99_V	416_Q	0.653	0.20
137_E	168_E	0.653	0.20
134_F	494_Y	0.651	0.20
75_L	281_L	0.651	0.20
583_D	586_L	0.650	0.20
124_A	384_V	0.649	0.19
369_N	392_M	0.649	0.19
304_Q	481_V	0.647	0.19
101_P	248_N	0.646	0.19
354_T	366_A	0.644	0.19
366_A	433_Q	0.644	0.19
357_F	368_T	0.644	0.19
569_T	578_S	0.643	0.19
112_T	495_G	0.642	0.19
573_D	585_S	0.641	0.19
351_N	435_S	0.641	0.19
59_Y	101_P	0.640	0.19
464_N	547_A	0.640	0.19
67_A	320_R	0.639	0.19
404_L	580_V	0.638	0.19
357_F	475_M	0.638	0.19
85_A	121_D	0.637	0.19
58_S	93_F	0.637	0.19
180_V	249_V	0.637	0.19
337_A	370_A	0.636	0.19
346_E	395_F	0.636	0.19
547_A	553_A	0.635	0.19
549_V	553_A	0.635	0.19
62_I	113_P	0.634	0.19
149_P	476_A	0.634	0.19
407_S	511_A	0.634	0.19
549_V	560_V	0.633	0.19
560_V	573_D	0.632	0.19
183_I	212_G	0.632	0.19
255_G	500_D	0.631	0.19
433_Q	473_S	0.631	0.19
180_V	531_D	0.629	0.19
73_P	313_S	0.629	0.19
557_L	562_E	0.628	0.19
566_A	569_T	0.628	0.19
310_E	407_S	0.627	0.19
464_N	506_G	0.627	0.19
521_A	526_G	0.627	0.19
311_T	314_T	0.626	0.19
328_A	454_V	0.626	0.19
133_D	393_L	0.625	0.19
311_T	500_D	0.625	0.19
389_V	498_L	0.624	0.19
390_Y	495_G	0.624	0.19
65_A	235_G	0.623	0.19
417_V	491_Y	0.622	0.19
573_D	576_T	0.622	0.19
448_D	452_R	0.622	0.19
543_P	565_N	0.622	0.19
396_N	495_G	0.620	0.18
568_R	572_S	0.619	0.18
388_N	399_L	0.619	0.18
562_E	574_N	0.619	0.18
223_E	226_D	0.618	0.18
208_Y	470_T	0.618	0.18
547_A	558_N	0.617	0.18
82_R	468_N	0.617	0.18
55_T	348_A	0.617	0.18
574_N	581_F	0.615	0.18
544_S	554_F	0.614	0.18
100_S	138_A	0.614	0.18
42_T	384_V	0.614	0.18
550_D	555_Y	0.613	0.18
530_L	536_A	0.612	0.18
440_E	452_R	0.612	0.18
134_F	189_K	0.611	0.18
151_L	366_A	0.611	0.18
307_T	437_V	0.610	0.18
277_R	427_D	0.610	0.18
59_Y	75_L	0.609	0.18
578_S	585_S	0.608	0.18
43_D	578_S	0.608	0.18
557_L	560_V	0.605	0.18
224_D	263_P	0.604	0.18
263_P	266_T	0.604	0.18
393_L	475_M	0.604	0.18
569_T	581_F	0.603	0.18
544_S	547_A	0.602	0.18
181_G	405_T	0.602	0.18
180_V	250_D	0.601	0.18
427_D	430_A	0.599	0.18
326_R	451_V	0.597	0.18
105_S	376_N	0.597	0.18
133_D	435_S	0.597	0.18
581_F	587_R	0.597	0.18
379_Y	382_G	0.596	0.18
343_Y	414_E	0.596	0.18
328_A	510_P	0.594	0.18
102_H	122_P	0.594	0.18
532_G	545_T	0.592	0.17
537_A	568_R	0.591	0.17
58_S	377_S	0.591	0.17
525_A	542_M	0.589	0.17
469_V	570_T	0.589	0.17
87_D	542_M	0.589	0.17
198_F	473_S	0.587	0.17
548_T	558_N	0.586	0.17
187_D	190_I	0.585	0.17
374_R	467_Y	0.584	0.17
566_A	573_D	0.584	0.17
462_A	467_Y	0.584	0.17
45_T	537_A	0.583	0.17
437_V	456_V	0.583	0.17
185_L	249_V	0.582	0.17
179_R	237_P	0.582	0.17
413_L	467_Y	0.582	0.17
529_S	543_P	0.581	0.17
247_E	305_N	0.581	0.17
409_L	469_V	0.580	0.17
460_P	552_Q	0.579	0.17
387_G	396_N	0.579	0.17
73_P	333_T	0.578	0.17
408_E	415_S	0.578	0.17
196_V	337_A	0.578	0.17
100_S	142_F	0.578	0.17
343_Y	346_E	0.577	0.17
553_A	564_V	0.576	0.17
369_N	385_T	0.576	0.17
317_E	576_T	0.575	0.17
134_F	489_E	0.574	0.17
503_D	506_G	0.573	0.17
578_S	582_P	0.572	0.17
343_Y	450_L	0.571	0.17
486_V	489_E	0.571	0.17
185_L	243_A	0.571	0.17
409_L	533_A	0.570	0.17
537_A	572_S	0.570	0.17
122_P	132_L	0.569	0.17
255_G	477_G	0.569	0.17
125_E	150_W	0.568	0.17
60_N	366_A	0.566	0.17
54_V	293_V	0.566	0.17
164_I	481_V	0.565	0.17
196_V	451_V	0.565	0.17
265_E	399_L	0.565	0.17
539_S	545_T	0.565	0.17
44_A	317_E	0.563	0.17
271_I	409_L	0.563	0.17
528_V	533_A	0.562	0.17
553_A	563_R	0.561	0.16
291_G	548_T	0.560	0.16
337_A	344_H	0.560	0.16
182_V	416_Q	0.560	0.16
139_V	142_F	0.559	0.16
353_V	501_Y	0.558	0.16
269_V	345_D	0.554	0.16
536_A	546_N	0.552	0.16
64_T	200_E	0.552	0.16
529_S	541_A	0.551	0.16
110_W	417_V	0.551	0.16
186_A	253_L	0.551	0.16
301_I	314_T	0.551	0.16
257_D	471_V	0.550	0.16
42_T	46_T	0.549	0.16
573_D	580_V	0.549	0.16
46_T	281_L	0.548	0.16
133_D	194_T	0.548	0.16
451_V	504_A	0.547	0.16
514_D	518_R	0.547	0.16
190_I	235_G	0.546	0.16
553_A	577_V	0.546	0.16
193_K	430_A	0.546	0.16
63_Q	256_D	0.546	0.16
257_D	400_V	0.545	0.16
533_A	536_A	0.544	0.16
229_V	251_A	0.544	0.16
404_L	411_A	0.544	0.16
456_V	467_Y	0.543	0.16
278_A	430_A	0.543	0.16
60_N	370_A	0.543	0.16
143_S	404_L	0.541	0.16
543_P	548_T	0.541	0.16
259_I	377_S	0.541	0.16
530_L	555_Y	0.540	0.16
541_A	566_A	0.539	0.16
101_P	381_P	0.539	0.16
417_V	432_L	0.538	0.16
560_V	584_S	0.538	0.16
101_P	415_S	0.537	0.16
84_A	581_F	0.537	0.16
123_D	173_V	0.536	0.16
504_A	543_P	0.536	0.16
531_D	559_A	0.536	0.16
303_T	454_V	0.536	0.16
382_G	448_D	0.535	0.16
124_A	173_V	0.534	0.16
527_T	533_A	0.534	0.16
205_L	349_L	0.532	0.16
372_G	474_Y	0.531	0.16
91_F	232_G	0.531	0.16
45_T	322_E	0.530	0.16
461_V	523_A	0.530	0.16
416_Q	494_Y	0.530	0.16
79_V	92_V	0.528	0.15
415_S	432_L	0.528	0.15
63_Q	94_G	0.528	0.15
119_V	312_V	0.526	0.15
568_R	584_S	0.526	0.15
570_T	576_T	0.525	0.15
114_V	231_L	0.525	0.15
565_N	582_P	0.525	0.15
106_P	471_V	0.523	0.15
196_V	477_G	0.523	0.15
110_W	142_F	0.522	0.15
573_D	583_D	0.521	0.15
578_S	584_S	0.520	0.15
56_I	84_A	0.520	0.15
343_Y	371_G	0.520	0.15
559_A	562_E	0.519	0.15
520_D	577_V	0.519	0.15
397_N	473_S	0.519	0.15
247_E	506_G	0.518	0.15
105_S	194_T	0.516	0.15
58_S	99_V	0.514	0.15
160_T	163_P	0.514	0.15
52_T	227_V	0.513	0.15
56_I	403_R	0.513	0.15
541_A	550_D	0.513	0.15
541_A	560_V	0.513	0.15
565_N	580_V	0.513	0.15
577_V	581_F	0.512	0.15
440_E	517_R	0.511	0.15
328_A	331_T	0.511	0.15
79_V	399_L	0.511	0.15
407_S	524_D	0.511	0.15
215_Y	220_R	0.510	0.15
147_T	242_L	0.510	0.15
437_V	461_V	0.510	0.15
561_G	575_G	0.509	0.15
350_G	355_D	0.509	0.15
84_A	560_V	0.508	0.15
242_L	245_E	0.507	0.15
293_V	296_W	0.507	0.15
254_V	274_G	0.506	0.15
102_H	193_K	0.505	0.15
137_E	140_A	0.505	0.15
220_R	239_A	0.505	0.15
554_F	557_L	0.505	0.15
111_Q	369_N	0.505	0.15
477_G	484_A	0.504	0.15
144_E	182_V	0.504	0.15
537_A	540_F	0.504	0.15
542_M	558_N	0.504	0.15
83_R	538_V	0.503	0.15
83_R	122_P	0.502	0.15
184_G	460_P	0.501	0.15
189_K	394_P	0.501	0.15
311_T	519_V	0.501	0.15
214_E	585_S	0.500	0.15
46_T	381_P	0.500	0.15
361_T	386_A	0.500	0.15

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2z1aA	1	0.6745	100	0.418	Contact Map
3ztvA	2	0.6804	100	0.421	Contact Map
4h2gA	2	0.6686	100	0.422	Contact Map
1hp1A	1	0.6716	100	0.427	Contact Map
3iveA	1	0.6642	100	0.431	Contact Map
4q7fA	1	0.6686	100	0.435	Contact Map
2wdcA	1	0.6862	100	0.451	Contact Map
3c9fA	2	0.6891	100	0.566	Contact Map
3gveA	2	0.4018	100	0.673	Contact Map
3jyfA	2	0.4047	100	0.673	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0151 seconds.