Q9HPY6 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPY6 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HPY6	Sequences: MGPARSLQSNRQRPPAIAFGDTYSIPDAVANATPATGIEVRLPSSLRSVFVTAPLAFYLGATVTVAPDADPVLRAPDHGVVWPLDDPPTAVPAVLSRVFWLDCLVREATTDGPSATETALLDDLDLDPARLAAASPAGRLAAYLETPFERVADRVPDWHLGMHVAPTYEHATTLPYLLDRLALVFPPETASLERQELVSRSLDDFYRGAPGPVASVEMVDPVDRPGRMQGWLADGIPVDAFKSHPASYRNHDEYQRDADRDAISVAVVLNDRDMAGEHDAVADIYESRAGDLPIDVTLHERLTRTELTEVLTTHHEFVHYIGHCAVDGLRCADGHVSVADLPALNVETFFLNACGSFHEGLALVEGGSVAGAVTLRKVLDAQAAKVGTAFARLLLAGFPIALALRLARRRIRMGKDYAVVGDGTQTLAVTDDRETGVAHVDAVDGGDQYRVAWTDHSMANHGGGTPAPLLAGGNRRLGGNQVTFTASATELARTLPRVDAPVVLDGQFYWADEAAAVVRPAQQNCGDFD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	529 (502)
Sequences:	149 (120)
Seq/√Len:	5.4

HALSA - Q9HPY6 Q9HPP7 Q9HMF6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
42_L	52_T	6.258	1.00
79_G	82_W	3.990	0.91
79_G	84_L	3.909	0.90
38_I	136_P	3.494	0.84
40_V	52_T	3.358	0.82
162_M	182_A	3.271	0.80
311_L	399_P	3.238	0.79
302_L	310_V	2.898	0.71
176_Y	249_R	2.856	0.69
337_S	359_E	2.803	0.68
3_P	139_R	2.791	0.68
42_L	139_R	2.720	0.65
51_V	54_P	2.680	0.64
148_F	368_S	2.675	0.64
270_N	274_M	2.610	0.62
42_L	63_V	2.608	0.62
142_A	364_V	2.590	0.61
234_D	244_H	2.570	0.61
69_A	133_A	2.473	0.58
107_E	118_T	2.471	0.58
311_L	464_G	2.448	0.57
48_S	51_V	2.446	0.57
36_T	60_G	2.442	0.57
52_T	73_L	2.411	0.56
247_S	292_L	2.375	0.54
171_A	188_E	2.369	0.54
323_H	354_C	2.317	0.52
420_V	495_L	2.311	0.52
323_H	352_N	2.291	0.52
146_T	508_F	2.288	0.51
242_K	357_F	2.277	0.51
40_V	453_W	2.272	0.51
370_A	400_I	2.261	0.51
10_N	380_D	2.239	0.50
277_E	354_C	2.208	0.49
352_N	356_S	2.206	0.49
184_V	311_L	2.189	0.48
323_H	356_S	2.184	0.48
40_V	370_A	2.176	0.48
285_Y	319_H	2.129	0.46
250_N	293_P	2.115	0.46
165_A	364_V	2.078	0.44
479_G	482_V	2.007	0.42
29_V	40_V	1.999	0.42
286_E	294_I	1.991	0.42
323_H	417_Y	1.977	0.41
349_F	417_Y	1.965	0.41
352_N	383_A	1.956	0.40
354_C	374_T	1.946	0.40
159_H	226_G	1.928	0.40
348_T	373_V	1.876	0.38
323_H	383_A	1.860	0.37
274_M	277_E	1.852	0.37
5_R	11_R	1.842	0.37
122_D	171_A	1.842	0.37
161_G	226_G	1.842	0.37
62_T	364_V	1.826	0.36
277_E	323_H	1.820	0.36
447_D	505_D	1.811	0.36
6_S	58_Y	1.803	0.36
322_G	371_G	1.794	0.35
73_L	307_L	1.768	0.35
277_E	417_Y	1.752	0.34
351_L	363_L	1.745	0.34
13_R	176_Y	1.733	0.33
140_L	505_D	1.727	0.33
270_N	354_C	1.719	0.33
372_A	410_R	1.707	0.33
162_M	339_A	1.703	0.33
270_N	277_E	1.690	0.32
356_S	383_A	1.678	0.32
109_T	132_A	1.676	0.32
277_E	356_S	1.672	0.32
354_C	417_Y	1.671	0.32
59_L	307_L	1.667	0.32
270_N	356_S	1.661	0.31
204_D	509_Y	1.654	0.31
202_L	206_Y	1.645	0.31
270_N	323_H	1.643	0.31
355_G	372_A	1.642	0.31
277_E	352_N	1.637	0.31
16_A	176_Y	1.634	0.31
103_C	352_N	1.634	0.31
352_N	417_Y	1.627	0.30
103_C	356_S	1.625	0.30
3_P	20_G	1.618	0.30
354_C	383_A	1.615	0.30
354_C	387_G	1.602	0.30
6_S	511_A	1.592	0.29
356_S	417_Y	1.591	0.29
75_A	141_A	1.579	0.29
270_N	417_Y	1.553	0.28
352_N	374_T	1.552	0.28
101_L	174_L	1.551	0.28
105_V	139_R	1.535	0.28
148_F	366_G	1.533	0.28
458_M	508_F	1.530	0.28
149_E	305_T	1.530	0.28
311_L	504_L	1.529	0.28
296_V	440_V	1.509	0.27
285_Y	351_L	1.504	0.27
487_S	490_E	1.496	0.27
250_N	292_L	1.484	0.26
11_R	15_P	1.474	0.26
20_G	23_Y	1.455	0.26
103_C	277_E	1.449	0.26
27_D	495_L	1.448	0.26
219_V	237_P	1.440	0.25
349_F	371_G	1.437	0.25
363_L	371_G	1.434	0.25
97_R	388_T	1.429	0.25
274_M	354_C	1.429	0.25
225_P	326_V	1.426	0.25
23_Y	491_L	1.415	0.25
205_F	274_M	1.413	0.25
7_L	51_V	1.413	0.25
4_A	109_T	1.413	0.25
29_V	265_V	1.404	0.24
40_V	67_P	1.403	0.24
97_R	364_V	1.402	0.24
270_N	352_N	1.400	0.24
207_R	398_F	1.399	0.24
210_P	448_Q	1.398	0.24
349_F	354_C	1.395	0.24
17_I	45_S	1.394	0.24
380_D	384_A	1.392	0.24
428_A	432_D	1.390	0.24
18_A	109_T	1.390	0.24
323_H	387_G	1.389	0.24
50_F	353_A	1.387	0.24
42_L	62_T	1.376	0.24
270_N	357_F	1.375	0.24
12_Q	100_W	1.364	0.23
10_N	13_R	1.363	0.23
135_S	200_R	1.351	0.23
270_N	349_F	1.340	0.23
54_P	283_D	1.338	0.23
90_A	139_R	1.333	0.23
236_I	338_V	1.333	0.23
277_E	349_F	1.328	0.23
103_C	323_H	1.328	0.23
285_Y	322_G	1.326	0.23
81_V	140_L	1.322	0.22
85_D	182_A	1.320	0.22
39_E	74_R	1.316	0.22
160_L	357_F	1.313	0.22
285_Y	371_G	1.313	0.22
324_C	379_L	1.307	0.22
368_S	390_F	1.306	0.22
159_H	182_A	1.305	0.22
274_M	323_H	1.305	0.22
346_V	350_F	1.302	0.22
163_H	250_N	1.302	0.22
15_P	58_Y	1.294	0.22
132_A	429_V	1.291	0.22
26_P	393_L	1.289	0.22
56_A	506_G	1.284	0.22
284_I	379_L	1.283	0.22
319_H	387_G	1.267	0.21
59_L	101_L	1.265	0.21
111_D	325_A	1.263	0.21
23_Y	137_A	1.260	0.21
242_K	270_N	1.260	0.21
103_C	354_C	1.258	0.21
161_G	185_F	1.258	0.21
110_T	178_L	1.256	0.21
317_F	365_E	1.245	0.21
81_V	84_L	1.243	0.21
57_F	88_P	1.242	0.21
323_H	349_F	1.241	0.21
129_A	506_G	1.240	0.21
9_S	12_Q	1.239	0.21
136_P	406_L	1.237	0.21
162_M	508_F	1.233	0.20
29_V	186_P	1.230	0.20
313_T	440_V	1.228	0.20
54_P	151_V	1.227	0.20
5_R	15_P	1.226	0.20
124_L	298_L	1.225	0.20
323_H	374_T	1.221	0.20
400_I	406_L	1.220	0.20
356_S	374_T	1.218	0.20
383_A	417_Y	1.214	0.20
13_R	43_P	1.213	0.20
286_E	370_A	1.211	0.20
371_G	417_Y	1.210	0.20
4_A	12_Q	1.209	0.20
352_N	387_G	1.209	0.20
88_P	384_A	1.207	0.20
177_L	245_P	1.202	0.20
352_N	391_A	1.198	0.20
112_G	318_V	1.198	0.20
274_M	352_N	1.198	0.20
287_S	293_P	1.196	0.20
269_L	400_I	1.194	0.20
45_S	48_S	1.193	0.20
9_S	172_T	1.193	0.20
285_Y	317_F	1.190	0.20
144_L	346_V	1.190	0.20
88_P	186_P	1.170	0.19
270_N	374_T	1.163	0.19
374_T	383_A	1.159	0.19
304_R	332_A	1.159	0.19
161_G	164_V	1.157	0.19
329_L	372_A	1.155	0.19
9_S	464_G	1.143	0.19
71_P	145_E	1.141	0.19
176_Y	380_D	1.136	0.18
357_F	500_A	1.133	0.18
380_D	395_L	1.127	0.18
319_H	322_G	1.124	0.18
449_Y	488_A	1.119	0.18
53_A	368_S	1.117	0.18
283_D	326_V	1.115	0.18
250_N	384_A	1.112	0.18
321_I	349_F	1.111	0.18
45_S	135_S	1.110	0.18
25_I	287_S	1.109	0.18
387_G	391_A	1.106	0.18
151_V	178_L	1.105	0.18
440_V	494_T	1.101	0.18
84_L	298_L	1.099	0.18
57_F	267_V	1.098	0.18
7_L	324_C	1.094	0.18
240_A	398_F	1.086	0.17
286_E	337_S	1.085	0.17
124_L	418_A	1.085	0.17
4_A	9_S	1.083	0.17
105_V	128_P	1.082	0.17
300_E	330_R	1.082	0.17
231_W	354_C	1.068	0.17
440_V	487_S	1.066	0.17
291_D	297_T	1.064	0.17
207_R	387_G	1.063	0.17
265_V	384_A	1.060	0.17
72_V	94_V	1.059	0.17
120_L	408_R	1.054	0.17
354_C	357_F	1.054	0.17
262_A	490_E	1.053	0.17
284_I	402_L	1.052	0.17
159_H	427_L	1.048	0.17
317_F	320_Y	1.044	0.17
23_Y	456_H	1.042	0.17
274_M	417_Y	1.040	0.17
163_H	384_A	1.039	0.17
24_S	94_V	1.038	0.17
345_N	348_T	1.037	0.17
75_A	85_D	1.037	0.17
501_P	510_W	1.034	0.16
49_V	86_D	1.032	0.16
259_D	364_V	1.029	0.16
250_N	324_C	1.023	0.16
356_S	391_A	1.021	0.16
277_E	371_G	1.021	0.16
182_A	229_Q	1.019	0.16
103_C	274_M	1.015	0.16
234_D	486_A	1.014	0.16
270_N	371_G	1.012	0.16
248_Y	303_T	1.011	0.16
353_A	363_L	1.009	0.16
263_I	311_L	1.003	0.16
267_V	317_F	0.999	0.16
55_L	58_Y	0.996	0.16
325_A	348_T	0.995	0.16
328_G	363_L	0.994	0.16
138_G	489_T	0.993	0.16
247_S	250_N	0.991	0.16
13_R	380_D	0.991	0.16
80_V	145_E	0.984	0.16
417_Y	510_W	0.984	0.16
145_E	389_A	0.983	0.16
277_E	374_T	0.982	0.16
17_I	428_A	0.981	0.16
130_R	164_V	0.981	0.16
322_G	331_C	0.980	0.15
338_V	345_N	0.978	0.15
14_P	71_P	0.975	0.15
232_L	251_H	0.975	0.15
363_L	368_S	0.971	0.15
407_A	506_G	0.967	0.15
263_I	464_G	0.966	0.15
95_L	397_G	0.964	0.15
5_R	26_P	0.962	0.15
3_P	318_V	0.962	0.15
137_A	501_P	0.961	0.15
442_A	449_Y	0.959	0.15
274_M	356_S	0.958	0.15
441_D	452_A	0.954	0.15
400_I	404_L	0.952	0.15
231_W	352_N	0.951	0.15
72_V	125_D	0.947	0.15
22_T	489_T	0.943	0.15
284_I	411_I	0.942	0.15
11_R	14_P	0.937	0.15
279_D	386_V	0.935	0.15
286_E	395_L	0.933	0.15
436_G	470_L	0.931	0.15
127_D	351_L	0.930	0.15
349_F	363_L	0.927	0.15
29_V	42_L	0.926	0.15
378_V	457_S	0.924	0.15
355_G	370_A	0.923	0.15
205_F	414_G	0.921	0.14
196_E	204_D	0.919	0.14
270_N	383_A	0.919	0.14
121_L	241_F	0.916	0.14
121_L	230_G	0.914	0.14
269_L	286_E	0.914	0.14
57_F	281_V	0.914	0.14
356_S	387_G	0.912	0.14
277_E	383_A	0.911	0.14
392_R	476_R	0.909	0.14
392_R	489_T	0.908	0.14
296_V	403_A	0.904	0.14
289_A	473_G	0.904	0.14
351_L	368_S	0.903	0.14
100_W	151_V	0.901	0.14
88_P	93_A	0.900	0.14
50_F	243_S	0.899	0.14
127_D	363_L	0.897	0.14
276_G	353_A	0.897	0.14
133_A	339_A	0.896	0.14
13_R	302_L	0.895	0.14
164_V	187_P	0.893	0.14
2_G	120_L	0.893	0.14
269_L	274_M	0.893	0.14
93_A	265_V	0.891	0.14
242_K	274_M	0.890	0.14
349_F	352_N	0.889	0.14
80_V	139_R	0.888	0.14
305_T	308_T	0.887	0.14
163_H	254_Y	0.887	0.14
296_V	451_V	0.885	0.14
231_W	323_H	0.882	0.14
21_D	24_S	0.881	0.14
303_T	386_V	0.881	0.14
339_A	451_V	0.879	0.14
442_A	447_D	0.875	0.14
27_D	215_S	0.875	0.14
322_G	417_Y	0.873	0.14
104_L	403_A	0.872	0.14
285_Y	320_Y	0.870	0.14
2_G	68_D	0.868	0.14
276_G	407_A	0.868	0.14
30_A	370_A	0.865	0.14
268_V	352_N	0.862	0.14
274_M	357_F	0.861	0.14
152_A	215_S	0.860	0.13
378_V	390_F	0.860	0.13
40_V	194_R	0.858	0.13
285_Y	387_G	0.856	0.13
72_V	296_V	0.856	0.13
4_A	68_D	0.856	0.13
94_V	308_T	0.854	0.13
8_Q	11_R	0.854	0.13
226_G	241_F	0.853	0.13
43_P	307_L	0.853	0.13
440_V	451_V	0.851	0.13
304_R	490_E	0.850	0.13
328_G	331_C	0.850	0.13
179_D	272_R	0.850	0.13
378_V	383_A	0.849	0.13
128_P	233_A	0.845	0.13
68_D	107_E	0.845	0.13
53_A	307_L	0.841	0.13
277_E	387_G	0.839	0.13
319_H	351_L	0.838	0.13
349_F	356_S	0.838	0.13
166_P	364_V	0.837	0.13
7_L	384_A	0.836	0.13
258_A	355_G	0.832	0.13
221_P	237_P	0.831	0.13
380_D	387_G	0.830	0.13
75_A	513_E	0.828	0.13
121_L	308_T	0.827	0.13
149_E	514_A	0.826	0.13
103_C	417_Y	0.826	0.13
339_A	362_A	0.826	0.13
352_N	371_G	0.825	0.13
157_D	267_V	0.825	0.13
53_A	151_V	0.824	0.13
18_A	23_Y	0.821	0.13
133_A	152_A	0.819	0.13
53_A	309_E	0.819	0.13
153_D	425_Q	0.815	0.13
329_L	369_V	0.815	0.13
13_R	398_F	0.811	0.13
246_A	362_A	0.808	0.13
193_E	280_A	0.806	0.13
43_P	331_C	0.806	0.13
239_D	282_A	0.806	0.13
29_V	84_L	0.804	0.13
285_Y	501_P	0.803	0.13
219_V	342_P	0.802	0.13
157_D	486_A	0.801	0.13
386_V	479_G	0.800	0.13
165_A	365_E	0.799	0.13
114_S	262_A	0.798	0.13
77_D	271_D	0.798	0.13
270_N	321_I	0.797	0.13
260_R	428_A	0.797	0.13
322_G	349_F	0.794	0.12
171_A	297_T	0.792	0.12
78_H	261_D	0.791	0.12
319_H	331_C	0.790	0.12
46_L	50_F	0.790	0.12
320_Y	380_D	0.790	0.12
107_E	370_A	0.788	0.12
139_R	471_A	0.787	0.12
35_A	114_S	0.787	0.12
37_G	79_G	0.786	0.12
151_V	155_V	0.784	0.12
485_T	489_T	0.783	0.12
21_D	276_G	0.778	0.12
180_R	251_H	0.778	0.12
132_A	374_T	0.778	0.12
7_L	23_Y	0.776	0.12
356_S	371_G	0.776	0.12
231_W	356_S	0.775	0.12
132_A	380_D	0.773	0.12
104_L	202_L	0.772	0.12
237_P	242_K	0.771	0.12
129_A	311_L	0.768	0.12
103_C	383_A	0.767	0.12
463_G	507_Q	0.766	0.12
234_D	343_A	0.763	0.12
20_G	248_Y	0.762	0.12
379_L	413_M	0.762	0.12
372_A	468_P	0.760	0.12
399_P	402_L	0.759	0.12
309_E	332_A	0.758	0.12
116_T	178_L	0.758	0.12
274_M	380_D	0.754	0.12
107_E	117_E	0.754	0.12
43_P	336_V	0.752	0.12
188_E	199_S	0.748	0.12
108_A	118_T	0.745	0.12
104_L	117_E	0.745	0.12
96_S	427_L	0.744	0.12
110_T	121_L	0.744	0.12
126_L	240_A	0.743	0.12
277_E	380_D	0.743	0.12
8_Q	38_I	0.742	0.12
13_R	23_Y	0.739	0.12
285_Y	336_V	0.738	0.12
37_G	195_Q	0.734	0.12
35_A	157_D	0.734	0.12
144_L	152_A	0.733	0.12
38_I	245_P	0.733	0.12
67_P	292_L	0.732	0.12
331_C	371_G	0.731	0.12
37_G	373_V	0.726	0.12
323_H	371_G	0.726	0.12
369_V	382_Q	0.725	0.12
62_T	166_P	0.723	0.11
211_G	414_G	0.721	0.11
277_E	357_F	0.721	0.11
230_G	372_A	0.720	0.11
328_G	359_E	0.720	0.11
148_F	265_V	0.720	0.11
6_S	451_V	0.719	0.11
209_A	485_T	0.719	0.11
230_G	401_A	0.718	0.11
42_L	471_A	0.718	0.11
117_E	288_R	0.718	0.11
184_V	224_R	0.716	0.11
35_A	48_S	0.715	0.11
155_V	507_Q	0.714	0.11
54_P	247_S	0.713	0.11
152_A	276_G	0.712	0.11
45_S	504_L	0.708	0.11
182_A	311_L	0.705	0.11
161_G	362_A	0.704	0.11
85_D	126_L	0.702	0.11
307_L	319_H	0.701	0.11
357_F	401_A	0.700	0.11
54_P	303_T	0.700	0.11
354_C	391_A	0.700	0.11
374_T	417_Y	0.698	0.11
54_P	317_F	0.696	0.11
105_V	200_R	0.695	0.11
37_G	61_A	0.693	0.11
396_A	513_E	0.693	0.11
96_S	159_H	0.691	0.11
5_R	14_P	0.690	0.11
86_D	338_V	0.689	0.11
172_T	311_L	0.689	0.11
278_H	385_K	0.688	0.11
41_R	96_S	0.688	0.11
74_R	428_A	0.687	0.11
357_F	508_F	0.686	0.11
73_L	114_S	0.686	0.11
29_V	74_R	0.683	0.11
221_P	320_Y	0.683	0.11
204_D	378_V	0.683	0.11
311_L	458_M	0.683	0.11
270_N	302_L	0.682	0.11
47_R	78_H	0.682	0.11
8_Q	106_R	0.682	0.11
345_N	493_R	0.680	0.11
221_P	242_K	0.679	0.11
352_N	357_F	0.679	0.11
100_W	384_A	0.678	0.11
230_G	344_L	0.677	0.11
466_P	476_R	0.673	0.11
42_L	83_P	0.671	0.11
48_S	120_L	0.669	0.11
26_P	170_H	0.669	0.11
288_R	429_V	0.665	0.11
58_Y	386_V	0.664	0.11
41_R	142_A	0.664	0.11
84_L	124_L	0.663	0.11
41_R	368_S	0.662	0.11
213_V	308_T	0.662	0.11
101_L	149_E	0.661	0.11
53_A	369_V	0.660	0.11
132_A	395_L	0.659	0.11
13_R	274_M	0.659	0.11
378_V	417_Y	0.659	0.11
167_T	449_Y	0.657	0.11
383_A	387_G	0.657	0.11
301_R	325_A	0.656	0.11
160_L	419_V	0.656	0.11
184_V	493_R	0.656	0.11
199_S	203_D	0.655	0.11
120_L	123_D	0.655	0.11
284_I	324_C	0.654	0.11
43_P	54_P	0.654	0.11
289_A	433_R	0.651	0.11
458_M	464_G	0.650	0.11
38_I	406_L	0.650	0.11
14_P	55_L	0.650	0.11
13_R	360_G	0.649	0.11
73_L	140_L	0.649	0.11
33_T	63_V	0.647	0.10
88_P	92_P	0.647	0.10
285_Y	510_W	0.646	0.10
75_A	427_L	0.644	0.10
274_M	321_I	0.643	0.10
7_L	205_F	0.642	0.10
310_V	365_E	0.641	0.10
331_C	356_S	0.640	0.10
285_Y	307_L	0.640	0.10
38_I	512_D	0.639	0.10
281_V	373_V	0.637	0.10
241_F	324_C	0.636	0.10
285_Y	288_R	0.636	0.10
214_A	376_R	0.633	0.10
17_I	327_D	0.633	0.10
193_E	213_V	0.632	0.10
379_L	408_R	0.630	0.10
60_G	399_P	0.629	0.10
242_K	354_C	0.629	0.10
5_R	20_G	0.629	0.10
296_V	490_E	0.628	0.10
117_E	344_L	0.628	0.10
167_T	369_V	0.628	0.10
322_G	352_N	0.628	0.10
78_H	82_W	0.627	0.10
147_P	233_A	0.627	0.10
142_A	484_F	0.627	0.10
16_A	73_L	0.626	0.10
50_F	53_A	0.625	0.10
298_L	514_A	0.621	0.10
17_I	283_D	0.619	0.10
348_T	355_G	0.618	0.10
7_L	428_A	0.617	0.10
319_H	371_G	0.615	0.10
141_A	309_E	0.615	0.10
303_T	375_L	0.614	0.10
384_A	388_T	0.613	0.10
40_V	96_S	0.612	0.10
99_F	139_R	0.611	0.10
119_A	126_L	0.611	0.10
113_P	184_V	0.611	0.10
448_Q	487_S	0.610	0.10
270_N	387_G	0.610	0.10
228_M	401_A	0.609	0.10
69_A	390_F	0.607	0.10
10_N	88_P	0.607	0.10
167_T	346_V	0.606	0.10
326_V	372_A	0.605	0.10
46_L	392_R	0.605	0.10
104_L	124_L	0.605	0.10
13_R	270_N	0.604	0.10
42_L	112_G	0.604	0.10
171_A	452_A	0.604	0.10
430_T	447_D	0.604	0.10
136_P	185_F	0.601	0.10
269_L	294_I	0.601	0.10
242_K	295_D	0.600	0.10
185_F	224_R	0.600	0.10
144_L	451_V	0.599	0.10
86_D	90_A	0.599	0.10
151_V	496_P	0.599	0.10
296_V	399_P	0.599	0.10
171_A	291_D	0.598	0.10
120_L	131_L	0.598	0.10
7_L	151_V	0.596	0.10
354_C	371_G	0.596	0.10
145_E	470_L	0.596	0.10
319_H	391_A	0.595	0.10
34_P	59_L	0.595	0.10
210_P	275_A	0.594	0.10
130_R	508_F	0.594	0.10
163_H	256_R	0.594	0.10
142_A	165_A	0.593	0.10
15_P	60_G	0.593	0.10
161_G	263_I	0.592	0.10
284_I	399_P	0.592	0.10
132_A	277_E	0.591	0.10
246_A	341_L	0.591	0.10
240_A	280_A	0.590	0.10
15_P	71_P	0.590	0.10
341_L	398_F	0.589	0.10
288_R	319_H	0.589	0.10
339_A	485_T	0.589	0.10
327_D	389_A	0.588	0.10
182_A	281_V	0.588	0.10
52_T	67_P	0.587	0.10
57_F	306_E	0.587	0.10
147_P	207_R	0.587	0.10
356_S	380_D	0.586	0.10
186_P	332_A	0.585	0.10
127_D	319_H	0.585	0.10
355_G	390_F	0.585	0.10
16_A	316_E	0.584	0.10
71_P	77_D	0.583	0.10
34_P	477_L	0.583	0.10
17_I	151_V	0.582	0.10
322_G	501_P	0.582	0.10
374_T	387_G	0.580	0.10
294_I	395_L	0.580	0.10
120_L	129_A	0.580	0.10
256_R	399_P	0.579	0.10
93_A	487_S	0.577	0.10
66_A	303_T	0.577	0.10
281_V	511_A	0.577	0.10
285_Y	331_C	0.573	0.10
124_L	180_R	0.573	0.10
142_A	234_D	0.573	0.10
19_F	22_T	0.573	0.10
237_P	240_A	0.571	0.10
395_L	401_A	0.570	0.10
173_T	244_H	0.570	0.10
357_F	417_Y	0.569	0.10
155_V	318_V	0.568	0.10
50_F	140_L	0.568	0.10
139_R	280_A	0.567	0.10
247_S	419_V	0.567	0.10
53_A	168_Y	0.567	0.10
383_A	391_A	0.567	0.10
41_R	265_V	0.565	0.10
103_C	270_N	0.563	0.09
110_T	370_A	0.563	0.09
319_H	323_H	0.562	0.09
40_V	49_V	0.562	0.09
258_A	399_P	0.561	0.09
323_H	357_F	0.561	0.09
6_S	438_A	0.560	0.09
106_R	109_T	0.560	0.09
103_C	374_T	0.559	0.09
495_L	502_V	0.558	0.09
427_L	514_A	0.557	0.09
450_R	482_V	0.557	0.09
212_P	486_A	0.555	0.09
63_V	504_L	0.555	0.09
310_V	376_R	0.555	0.09
323_H	391_A	0.555	0.09
354_C	380_D	0.553	0.09
263_I	318_V	0.551	0.09
309_E	338_V	0.551	0.09
42_L	203_D	0.551	0.09
44_S	486_A	0.550	0.09
89_T	184_V	0.550	0.09
34_P	60_G	0.549	0.09
104_L	239_D	0.549	0.09
99_F	334_G	0.549	0.09
207_R	456_H	0.549	0.09
23_Y	250_N	0.549	0.09
218_M	256_R	0.548	0.09
331_C	336_V	0.547	0.09
117_E	152_A	0.547	0.09
341_L	431_D	0.546	0.09
7_L	10_N	0.545	0.09
63_V	96_S	0.545	0.09
58_Y	373_V	0.544	0.09
274_M	371_G	0.543	0.09
63_V	491_L	0.542	0.09
467_A	494_T	0.542	0.09
10_N	146_T	0.541	0.09
387_G	417_Y	0.541	0.09
319_H	354_C	0.540	0.09
86_D	149_E	0.539	0.09
152_A	312_T	0.539	0.09
119_A	308_T	0.539	0.09
5_R	9_S	0.536	0.09
15_P	26_P	0.536	0.09
7_L	157_D	0.535	0.09
473_G	512_D	0.535	0.09
371_G	510_W	0.534	0.09
151_V	210_P	0.533	0.09
91_V	250_N	0.533	0.09
68_D	109_T	0.532	0.09
319_H	336_V	0.530	0.09
35_A	315_H	0.528	0.09
205_F	270_N	0.528	0.09
59_L	73_L	0.528	0.09
108_A	395_L	0.527	0.09
327_D	335_H	0.526	0.09
13_R	317_F	0.526	0.09
9_S	109_T	0.526	0.09
100_W	135_S	0.525	0.09
274_M	302_L	0.524	0.09
145_E	215_S	0.524	0.09
132_A	207_R	0.524	0.09
30_A	447_D	0.522	0.09
170_H	225_P	0.521	0.09
98_V	130_R	0.521	0.09
242_K	277_E	0.521	0.09
197_L	230_G	0.520	0.09
269_L	370_A	0.520	0.09
10_N	109_T	0.518	0.09
345_N	368_S	0.517	0.09
24_S	211_G	0.517	0.09
37_G	199_S	0.516	0.09
125_D	440_V	0.515	0.09
58_Y	61_A	0.515	0.09
274_M	383_A	0.515	0.09
7_L	17_I	0.513	0.09
184_V	447_D	0.512	0.09
171_A	384_A	0.512	0.09
156_P	248_Y	0.512	0.09
83_P	177_L	0.512	0.09
93_A	105_V	0.510	0.09
219_V	407_A	0.509	0.09
178_L	201_S	0.508	0.09
131_L	142_A	0.507	0.09
34_P	56_A	0.507	0.09
62_T	78_H	0.507	0.09
319_H	352_N	0.506	0.09
234_D	338_V	0.505	0.09
331_C	374_T	0.505	0.09
274_M	374_T	0.505	0.09
466_P	484_F	0.505	0.09
310_V	442_A	0.503	0.09
311_L	437_V	0.502	0.09
233_A	336_V	0.502	0.09
10_N	97_R	0.502	0.09
289_A	453_W	0.501	0.09
127_D	285_Y	0.501	0.09
231_W	270_N	0.500	0.09
139_R	467_A	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2h54A	1	0.2533	96.1	0.967	Contact Map
1pyoA	2	0.2306	95.9	0.967	Contact Map
3sirA	2	0.3384	95.5	0.969	Contact Map
3p45A	3	0.1909	94.7	0.97	Contact Map
2dkoA	2	0.2117	94.3	0.97	Contact Map
4jr2A	2	0.3459	94.2	0.971	Contact Map
1f1jA	3	0.344	93.5	0.972	Contact Map
1m72A	2	0.3762	93	0.972	Contact Map
2j32A	3	0.3554	92.7	0.972	Contact Map
3e4cA	2	0.3856	92.5	0.972	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0133 seconds.