BAT - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

BAT - Bacterioopsin transcriptional activator

UniProt:	Q9HPU8	Sequences: MTSVQNTESETAAGATTIGVLFAGSDPETGPAACDLDEDGRFDVTQIRDFVAARDRVDDPDIDCVVAVHEPDGFDGVAFLEAVRQTHAEFPVVVVPTAVDEDVARRAVDADATGLVPAVSEDATAAIADRIEQSAPAHSEDTETRMPISDLTVESERRLKEQALDEAPIGITISDATDPEEPIIYINDSFEDITGYSPDEVVGANHRFLQGPKTNEDRVAEFWTAITEDHDTQVVLRNYRRDGSLFWNQVDISPIYDEDGTVSHYVGFQMDVSERMAAQQELQGERQSLDRLLDRVNGLMNDVTSALVRAADREEIETRITDRIGTGGEYAGAWFGRYDATEDTITVAEAAGDCEGCDGDVFDLASAGEAVALLQDVVEQREALVSTDADGVSGTADGDACVLVPVTYRSTTYGVLAVSTAEHRIDDREQVLLRSLGRTTGASINDALTRRTIATDTVLNIGVELSDTALFLVELAGATDTTFEQEATIADSQTQGVLMLVTTPHDDPQAVVDTALGYDAVQDAEVIVSTDDESVVQFDLSSSPLVDVLSECGSRVIRMHADRTTLELDVRVGTEGAARRVLSTLRDKYADVELVAYHEDDPEQTPHGFREELRNDLTDRQLTALQKAYVSGYFEWPRRAEGKQLAESMDIVPSTYHQHLQAAKQKLVGAFFEE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	674 (522)
Sequences:	279 (262)
Seq/√Len:	11.5

HALSA - BAT O51970 Q9HQG5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
157_R	161_E	4.211	1.00
478_A	481_T	3.730	0.99
478_A	508_P	3.724	0.99
481_T	508_P	3.657	0.99
592_V	631_S	3.596	0.98
169_I	270_M	3.547	0.98
479_T	511_V	3.514	0.98
598_H	601_D	3.340	0.97
211_G	237_R	3.334	0.97
214_T	237_R	3.237	0.97
212_P	237_R	3.004	0.95
235_V	276_M	2.968	0.95
196_Y	241_R	2.918	0.94
597_Y	601_D	2.802	0.93
516_L	574_T	2.745	0.92
443_S	447_A	2.737	0.92
272_V	276_M	2.699	0.91
612_E	616_D	2.688	0.91
468_T	593_E	2.657	0.91
475_L	515_A	2.531	0.88
468_T	631_S	2.498	0.88
460_N	463_V	2.455	0.87
439_T	442_A	2.426	0.86
507_D	521_V	2.424	0.86
479_T	483_F	2.416	0.86
631_S	638_R	2.408	0.86
457_T	461_I	2.403	0.86
468_T	592_V	2.368	0.85
631_S	645_L	2.356	0.84
200_E	241_R	2.345	0.84
484_E	512_V	2.308	0.83
468_T	472_L	2.294	0.83
313_R	444_I	2.281	0.82
593_E	631_S	2.274	0.82
591_D	631_S	2.261	0.82
469_A	508_P	2.261	0.82
471_F	476_A	2.261	0.82
196_Y	200_E	2.225	0.81
479_T	482_T	2.224	0.81
480_D	631_S	2.218	0.80
615_N	640_A	2.207	0.80
508_P	522_Q	2.206	0.80
472_L	478_A	2.204	0.80
480_D	577_A	2.190	0.80
594_L	597_Y	2.178	0.79
449_T	454_A	2.171	0.79
468_T	508_P	2.165	0.79
652_V	663_A	2.110	0.77
553_G	631_S	2.054	0.75
593_E	613_L	2.006	0.73
473_V	631_S	2.005	0.73
468_T	478_A	1.972	0.72
471_F	480_D	1.964	0.71
476_A	480_D	1.957	0.71
276_M	279_Q	1.952	0.71
476_A	516_L	1.946	0.71
461_I	464_E	1.928	0.70
517_G	577_A	1.920	0.70
464_E	472_L	1.913	0.69
652_V	659_H	1.898	0.69
172_T	267_G	1.874	0.68
468_T	481_T	1.855	0.67
211_G	214_T	1.845	0.66
594_L	659_H	1.828	0.66
461_I	467_D	1.796	0.64
469_A	475_L	1.778	0.63
249_Q	270_M	1.776	0.63
249_Q	275_R	1.756	0.62
597_Y	600_D	1.731	0.61
468_T	613_L	1.727	0.61
272_V	279_Q	1.709	0.60
254_P	264_H	1.709	0.60
190_F	211_G	1.694	0.60
465_L	468_T	1.693	0.59
469_A	520_A	1.688	0.59
311_A	446_D	1.671	0.58
167_A	171_I	1.665	0.58
585_L	610_R	1.654	0.58
468_T	591_D	1.642	0.57
504_P	617_L	1.632	0.57
581_V	655_T	1.617	0.56
592_V	613_L	1.616	0.56
150_D	154_E	1.609	0.55
553_G	593_E	1.606	0.55
646_A	649_M	1.601	0.55
479_T	617_L	1.592	0.55
183_I	203_G	1.581	0.54
464_E	478_A	1.581	0.54
335_F	406_V	1.577	0.54
275_R	279_Q	1.575	0.54
458_V	461_I	1.572	0.54
446_D	449_T	1.568	0.53
504_P	613_L	1.564	0.53
482_T	651_I	1.561	0.53
476_A	591_D	1.550	0.53
187_N	237_R	1.547	0.52
468_T	471_F	1.546	0.52
473_V	593_E	1.539	0.52
581_V	656_Y	1.535	0.52
329_E	425_I	1.533	0.52
474_E	480_D	1.524	0.51
468_T	658_Q	1.511	0.51
332_G	425_I	1.507	0.50
479_T	659_H	1.504	0.50
515_A	520_A	1.502	0.50
475_L	508_P	1.500	0.50
480_D	516_L	1.499	0.50
472_L	475_L	1.495	0.50
388_D	393_S	1.484	0.49
429_E	437_G	1.475	0.49
633_Y	638_R	1.466	0.48
475_L	509_Q	1.459	0.48
638_R	641_E	1.441	0.47
519_D	629_Y	1.439	0.47
311_A	449_T	1.438	0.47
436_L	446_D	1.436	0.47
514_T	651_I	1.435	0.47
480_D	574_T	1.425	0.46
468_T	509_Q	1.423	0.46
591_D	653_P	1.421	0.46
446_D	450_R	1.413	0.46
596_A	613_L	1.412	0.46
577_A	633_Y	1.411	0.46
465_L	476_A	1.407	0.46
638_R	645_L	1.406	0.46
164_L	185_Y	1.406	0.46
578_A	659_H	1.405	0.45
472_L	517_G	1.397	0.45
475_L	522_Q	1.393	0.45
644_Q	649_M	1.392	0.45
470_L	577_A	1.391	0.45
509_Q	520_A	1.391	0.45
483_F	516_L	1.379	0.44
477_G	649_M	1.378	0.44
517_G	631_S	1.376	0.44
480_D	524_A	1.373	0.44
484_E	515_A	1.369	0.44
593_E	596_A	1.365	0.44
127_I	131_I	1.356	0.43
508_P	513_D	1.349	0.43
469_A	474_E	1.346	0.43
415_V	418_V	1.341	0.42
482_T	574_T	1.339	0.42
655_T	659_H	1.334	0.42
508_P	659_H	1.334	0.42
577_A	655_T	1.330	0.42
153_V	262_V	1.320	0.41
475_L	505_H	1.319	0.41
471_F	482_T	1.317	0.41
476_A	482_T	1.310	0.41
475_L	507_D	1.304	0.41
237_R	247_W	1.303	0.41
509_Q	522_Q	1.294	0.40
159_L	267_G	1.288	0.40
468_T	655_T	1.288	0.40
612_E	644_Q	1.288	0.40
533_E	652_V	1.284	0.40
550_S	645_L	1.282	0.40
471_F	591_D	1.281	0.40
425_I	446_D	1.271	0.39
580_R	651_I	1.271	0.39
475_L	520_A	1.268	0.39
471_F	592_V	1.265	0.39
324_I	333_A	1.264	0.39
235_V	272_V	1.261	0.39
474_E	513_D	1.254	0.38
464_E	629_Y	1.252	0.38
508_P	591_D	1.251	0.38
475_L	479_T	1.249	0.38
474_E	631_S	1.248	0.38
308_V	311_A	1.246	0.38
185_Y	247_W	1.244	0.38
533_E	659_H	1.241	0.38
450_R	454_A	1.238	0.38
401_C	418_V	1.234	0.37
471_F	516_L	1.233	0.37
485_Q	507_D	1.231	0.37
511_V	574_T	1.230	0.37
613_L	631_S	1.228	0.37
325_G	425_I	1.227	0.37
475_L	583_S	1.227	0.37
484_E	608_G	1.227	0.37
546_V	577_A	1.223	0.37
472_L	631_S	1.221	0.37
483_F	659_H	1.220	0.37
468_T	633_Y	1.219	0.37
260_G	267_G	1.216	0.37
622_L	625_L	1.211	0.36
471_F	574_T	1.210	0.36
472_L	481_T	1.205	0.36
509_Q	513_D	1.204	0.36
481_T	523_D	1.204	0.36
480_D	591_D	1.203	0.36
163_A	187_N	1.203	0.36
332_G	419_S	1.201	0.36
535_V	578_A	1.201	0.36
592_V	645_L	1.201	0.36
464_E	591_D	1.199	0.36
508_P	523_D	1.193	0.35
480_D	592_V	1.191	0.35
472_L	484_E	1.190	0.35
181_E	193_I	1.188	0.35
591_D	629_Y	1.184	0.35
477_G	646_A	1.183	0.35
476_A	592_V	1.183	0.35
404_V	525_E	1.182	0.35
588_K	646_A	1.180	0.35
419_S	425_I	1.177	0.35
468_T	476_A	1.177	0.35
476_A	514_T	1.176	0.35
524_A	577_A	1.164	0.34
613_L	645_L	1.160	0.34
163_A	173_I	1.158	0.34
374_L	415_V	1.156	0.34
616_D	646_A	1.148	0.33
316_I	446_D	1.144	0.33
614_R	649_M	1.134	0.33
478_A	629_Y	1.131	0.33
553_G	592_V	1.130	0.33
401_C	417_A	1.127	0.33
507_D	583_S	1.127	0.33
126_A	130_R	1.125	0.32
655_T	658_Q	1.124	0.32
316_I	429_E	1.123	0.32
509_Q	523_D	1.118	0.32
596_A	631_S	1.115	0.32
471_F	643_K	1.114	0.32
164_L	197_S	1.113	0.32
577_A	645_L	1.111	0.32
588_K	616_D	1.111	0.32
469_A	509_Q	1.109	0.32
467_D	481_T	1.103	0.32
479_T	507_D	1.100	0.31
612_E	646_A	1.099	0.31
517_G	638_R	1.098	0.31
464_E	592_V	1.095	0.31
546_V	590_A	1.088	0.31
475_L	523_D	1.086	0.31
163_A	264_H	1.085	0.31
465_L	471_F	1.085	0.31
475_L	504_P	1.078	0.30
472_L	550_S	1.073	0.30
480_D	630_V	1.072	0.30
471_F	513_D	1.072	0.30
472_L	508_P	1.068	0.30
469_A	522_Q	1.065	0.30
252_I	265_Y	1.065	0.30
252_I	264_H	1.064	0.30
638_R	655_T	1.060	0.30
631_S	658_Q	1.060	0.30
514_T	574_T	1.058	0.30
588_K	612_E	1.058	0.30
476_A	574_T	1.057	0.30
629_Y	661_Q	1.055	0.30
521_V	651_I	1.054	0.29
471_F	479_T	1.049	0.29
181_E	271_D	1.043	0.29
211_G	245_L	1.042	0.29
458_V	462_G	1.037	0.29
479_T	630_V	1.037	0.29
592_V	629_Y	1.030	0.29
475_L	485_Q	1.028	0.28
461_I	659_H	1.027	0.28
617_L	621_Q	1.022	0.28
474_E	508_P	1.009	0.28
579_R	643_K	1.009	0.28
464_E	580_R	1.007	0.28
480_D	593_E	1.007	0.28
483_F	515_A	1.004	0.27
483_F	579_R	1.001	0.27
481_T	591_D	1.000	0.27
173_I	264_H	0.997	0.27
477_G	482_T	0.996	0.27
485_Q	522_Q	0.996	0.27
588_K	644_Q	0.991	0.27
473_V	553_G	0.990	0.27
531_D	581_V	0.990	0.27
468_T	553_G	0.987	0.27
508_P	583_S	0.986	0.27
240_R	244_S	0.985	0.27
563_R	620_R	0.982	0.27
159_L	162_Q	0.982	0.27
477_G	644_Q	0.980	0.27
465_L	508_P	0.979	0.27
538_F	542_S	0.976	0.26
172_T	186_I	0.975	0.26
474_E	481_T	0.970	0.26
405_P	412_T	0.968	0.26
591_D	638_R	0.967	0.26
126_A	137_A	0.963	0.26
473_V	606_P	0.960	0.26
475_L	631_S	0.958	0.26
505_H	508_P	0.956	0.26
471_F	474_E	0.951	0.25
324_I	436_L	0.951	0.25
478_A	482_T	0.951	0.25
573_G	578_A	0.948	0.25
468_T	475_L	0.946	0.25
170_G	193_I	0.946	0.25
587_D	591_D	0.945	0.25
475_L	658_Q	0.944	0.25
313_R	316_I	0.942	0.25
475_L	597_Y	0.941	0.25
439_T	449_T	0.941	0.25
616_D	644_Q	0.941	0.25
440_T	448_L	0.940	0.25
196_Y	209_L	0.938	0.25
614_R	646_A	0.938	0.25
439_T	446_D	0.937	0.25
618_T	621_Q	0.937	0.25
477_G	588_K	0.936	0.25
469_A	652_V	0.936	0.25
468_T	596_A	0.935	0.25
485_Q	509_Q	0.932	0.25
480_D	484_E	0.930	0.25
170_G	248_N	0.928	0.25
517_G	581_V	0.927	0.25
594_L	601_D	0.925	0.25
471_F	577_A	0.921	0.24
174_S	252_I	0.920	0.24
484_E	507_D	0.920	0.24
235_V	663_A	0.918	0.24
156_E	161_E	0.912	0.24
482_T	577_A	0.907	0.24
469_A	480_D	0.907	0.24
321_T	324_I	0.905	0.24
593_E	597_Y	0.902	0.24
512_V	577_A	0.902	0.24
515_A	606_P	0.898	0.24
612_E	642_G	0.898	0.24
189_S	193_I	0.897	0.23
511_V	524_A	0.894	0.23
526_V	577_A	0.891	0.23
131_I	135_A	0.891	0.23
308_V	446_D	0.889	0.23
472_L	606_P	0.888	0.23
464_E	469_A	0.887	0.23
475_L	650_D	0.886	0.23
479_T	655_T	0.886	0.23
469_A	479_T	0.886	0.23
468_T	484_E	0.882	0.23
169_I	189_S	0.881	0.23
517_G	526_V	0.879	0.23
447_A	450_R	0.879	0.23
475_L	484_E	0.874	0.23
127_I	161_E	0.874	0.23
483_F	597_Y	0.873	0.23
307_L	446_D	0.873	0.23
591_D	661_Q	0.870	0.23
550_S	577_A	0.870	0.23
214_T	267_G	0.868	0.22
511_V	516_L	0.865	0.22
196_Y	254_P	0.862	0.22
582_L	608_G	0.862	0.22
464_E	481_T	0.860	0.22
588_K	614_R	0.858	0.22
478_A	523_D	0.855	0.22
505_H	520_A	0.855	0.22
573_G	659_H	0.854	0.22
464_E	468_T	0.853	0.22
396_A	415_V	0.853	0.22
477_G	584_T	0.851	0.22
478_A	641_E	0.851	0.22
588_K	649_M	0.850	0.22
616_D	649_M	0.850	0.22
303_V	316_I	0.849	0.22
187_N	214_T	0.849	0.22
370_A	379_E	0.846	0.22
465_L	512_V	0.840	0.22
472_L	638_R	0.840	0.22
480_D	653_P	0.837	0.21
172_T	252_I	0.837	0.21
483_F	574_T	0.835	0.21
175_D	180_E	0.834	0.21
468_T	517_G	0.834	0.21
150_D	153_V	0.833	0.21
498_L	502_T	0.832	0.21
307_L	428_R	0.830	0.21
211_G	252_I	0.830	0.21
592_V	640_A	0.829	0.21
580_R	631_S	0.828	0.21
592_V	630_V	0.827	0.21
451_R	454_A	0.820	0.21
420_T	425_I	0.819	0.21
475_L	659_H	0.816	0.21
404_V	445_N	0.816	0.21
587_D	638_R	0.814	0.21
320_I	425_I	0.811	0.21
587_D	631_S	0.811	0.21
612_E	649_M	0.811	0.21
467_D	508_P	0.811	0.21
243_G	278_A	0.808	0.21
157_R	164_L	0.808	0.21
653_P	657_H	0.808	0.21
471_F	617_L	0.807	0.20
584_T	614_R	0.807	0.20
325_G	333_A	0.807	0.20
625_L	630_V	0.805	0.20
476_A	631_S	0.802	0.20
600_D	659_H	0.801	0.20
333_A	423_H	0.801	0.20
308_V	425_I	0.801	0.20
574_T	577_A	0.801	0.20
474_E	522_Q	0.800	0.20
481_T	631_S	0.798	0.20
592_V	638_R	0.797	0.20
331_A	405_P	0.795	0.20
510_A	579_R	0.795	0.20
519_D	651_I	0.794	0.20
473_V	596_A	0.789	0.20
468_T	597_Y	0.787	0.20
468_T	480_D	0.787	0.20
276_M	282_L	0.785	0.20
513_D	523_D	0.782	0.20
517_G	580_R	0.781	0.20
435_S	439_T	0.780	0.20
461_I	507_D	0.779	0.20
633_Y	639_R	0.776	0.19
592_V	653_P	0.774	0.19
517_G	587_D	0.772	0.19
407_T	412_T	0.770	0.19
480_D	513_D	0.770	0.19
415_V	419_S	0.768	0.19
304_T	446_D	0.768	0.19
514_T	577_A	0.768	0.19
317_E	470_L	0.765	0.19
597_Y	659_H	0.764	0.19
457_T	462_G	0.763	0.19
162_Q	174_S	0.762	0.19
598_H	659_H	0.760	0.19
482_T	508_P	0.760	0.19
507_D	631_S	0.760	0.19
508_P	613_L	0.760	0.19
156_E	159_L	0.759	0.19
475_L	615_N	0.759	0.19
401_C	415_V	0.759	0.19
161_E	164_L	0.759	0.19
593_E	658_Q	0.758	0.19
482_T	514_T	0.757	0.19
235_V	252_I	0.756	0.19
153_V	256_Y	0.755	0.19
508_P	621_Q	0.755	0.19
400_A	421_A	0.752	0.19
273_S	314_E	0.750	0.19
601_D	659_H	0.746	0.19
149_S	158_R	0.746	0.19
474_E	523_D	0.746	0.19
461_I	479_T	0.743	0.18
614_R	644_Q	0.743	0.18
577_A	580_R	0.741	0.18
403_L	619_D	0.741	0.18
520_A	652_V	0.740	0.18
465_L	479_T	0.738	0.18
214_T	236_L	0.737	0.18
163_A	174_S	0.735	0.18
234_V	237_R	0.733	0.18
311_A	450_R	0.733	0.18
329_E	403_L	0.733	0.18
520_A	606_P	0.731	0.18
166_E	254_P	0.731	0.18
243_G	275_R	0.729	0.18
481_T	484_E	0.729	0.18
441_G	450_R	0.729	0.18
478_A	631_S	0.728	0.18
375_Q	429_E	0.727	0.18
413_Y	425_I	0.727	0.18
464_E	631_S	0.726	0.18
474_E	509_Q	0.726	0.18
584_T	646_A	0.726	0.18
214_T	252_I	0.725	0.18
271_D	279_Q	0.725	0.18
187_N	243_G	0.724	0.18
324_I	401_C	0.723	0.18
472_L	485_Q	0.722	0.18
586_R	591_D	0.722	0.18
482_T	516_L	0.720	0.18
508_P	643_K	0.719	0.18
469_A	481_T	0.719	0.18
484_E	628_A	0.719	0.18
468_T	650_D	0.718	0.18
130_R	134_S	0.718	0.18
349_E	352_G	0.718	0.18
471_F	653_P	0.717	0.18
513_D	643_K	0.717	0.18
333_A	434_R	0.717	0.18
504_P	608_G	0.717	0.18
626_Q	646_A	0.716	0.18
500_L	503_T	0.715	0.18
468_T	638_R	0.714	0.18
621_Q	630_V	0.712	0.18
477_G	614_R	0.710	0.18
475_L	546_V	0.708	0.17
187_N	211_G	0.707	0.17
378_V	400_A	0.706	0.17
480_D	613_L	0.705	0.17
195_G	200_E	0.703	0.17
509_Q	643_K	0.703	0.17
124_T	137_A	0.702	0.17
307_L	317_E	0.702	0.17
464_E	577_A	0.701	0.17
473_V	517_G	0.701	0.17
160_K	164_L	0.698	0.17
657_H	662_A	0.698	0.17
164_L	440_T	0.698	0.17
330_Y	425_I	0.697	0.17
480_D	658_Q	0.697	0.17
509_Q	515_A	0.697	0.17
172_T	187_N	0.693	0.17
517_G	550_S	0.693	0.17
508_P	520_A	0.692	0.17
166_E	171_I	0.692	0.17
167_A	170_G	0.691	0.17
468_T	473_V	0.691	0.17
312_D	317_E	0.689	0.17
482_T	649_M	0.688	0.17
201_V	444_I	0.687	0.17
521_V	580_R	0.686	0.17
508_P	555_R	0.686	0.17
461_I	613_L	0.685	0.17
468_T	504_P	0.684	0.17
507_D	512_V	0.683	0.17
582_L	663_A	0.682	0.17
310_A	331_A	0.680	0.17
479_T	651_I	0.678	0.17
592_V	596_A	0.677	0.17
464_E	638_R	0.672	0.16
476_A	584_T	0.672	0.16
508_P	630_V	0.671	0.16
471_F	508_P	0.670	0.16
389_A	410_S	0.670	0.16
162_Q	173_I	0.669	0.16
426_D	445_N	0.668	0.16
125_A	130_R	0.667	0.16
186_I	193_I	0.666	0.16
476_A	617_L	0.665	0.16
517_G	591_D	0.664	0.16
517_G	645_L	0.664	0.16
469_A	651_I	0.664	0.16
520_A	625_L	0.663	0.16
531_D	594_L	0.663	0.16
472_L	630_V	0.662	0.16
474_E	520_A	0.661	0.16
465_L	480_D	0.661	0.16
282_L	289_L	0.660	0.16
512_V	643_K	0.658	0.16
483_F	555_R	0.658	0.16
149_S	153_V	0.658	0.16
262_V	275_R	0.658	0.16
502_T	652_V	0.657	0.16
517_G	655_T	0.656	0.16
170_G	269_Q	0.654	0.16
316_I	439_T	0.653	0.16
183_I	206_H	0.652	0.16
480_D	550_S	0.652	0.16
203_G	211_G	0.651	0.16
473_V	645_L	0.650	0.16
505_H	522_Q	0.649	0.16
482_T	593_E	0.647	0.16
475_L	480_D	0.646	0.16
508_P	542_S	0.646	0.16
471_F	512_V	0.646	0.16
629_Y	642_G	0.645	0.16
453_I	458_V	0.643	0.16
484_E	514_T	0.642	0.16
153_V	157_R	0.642	0.16
469_A	514_T	0.641	0.16
508_P	631_S	0.639	0.16
534_S	589_Y	0.638	0.16
616_D	642_G	0.637	0.16
504_P	512_V	0.637	0.16
299_L	437_G	0.636	0.16
585_L	617_L	0.632	0.15
469_A	472_L	0.631	0.15
630_V	659_H	0.630	0.15
484_E	553_G	0.629	0.15
162_Q	172_T	0.627	0.15
539_D	606_P	0.627	0.15
553_G	596_A	0.625	0.15
468_T	514_T	0.624	0.15
504_P	630_V	0.623	0.15
466_S	472_L	0.623	0.15
505_H	592_V	0.622	0.15
469_A	658_Q	0.622	0.15
158_R	161_E	0.622	0.15
581_V	615_N	0.621	0.15
416_L	562_D	0.619	0.15
240_R	246_F	0.618	0.15
577_A	631_S	0.617	0.15
472_L	591_D	0.614	0.15
481_T	652_V	0.614	0.15
468_T	523_D	0.611	0.15
384_L	398_G	0.611	0.15
312_D	400_A	0.610	0.15
471_F	631_S	0.610	0.15
515_A	659_H	0.609	0.15
174_S	183_I	0.608	0.15
471_F	651_I	0.608	0.15
152_T	156_E	0.606	0.15
514_T	592_V	0.605	0.15
210_Q	232_T	0.604	0.15
194_T	323_R	0.604	0.15
246_F	262_V	0.604	0.15
164_L	313_R	0.604	0.15
171_I	194_T	0.602	0.15
473_V	658_Q	0.601	0.15
489_I	538_F	0.600	0.15
254_P	265_Y	0.600	0.15
222_F	498_L	0.600	0.15
485_Q	580_R	0.600	0.15
194_T	238_N	0.598	0.15
469_A	606_P	0.596	0.15
213_K	383_A	0.595	0.15
518_Y	531_D	0.595	0.15
146_M	150_D	0.593	0.14
316_I	419_S	0.593	0.14
468_T	507_D	0.592	0.14
514_T	593_E	0.591	0.14
183_I	252_I	0.590	0.14
465_L	474_E	0.589	0.14
479_T	639_R	0.588	0.14
632_G	635_E	0.588	0.14
480_D	509_Q	0.588	0.14
261_T	314_E	0.588	0.14
334_W	415_V	0.587	0.14
171_I	181_E	0.587	0.14
508_P	615_N	0.586	0.14
175_D	274_E	0.585	0.14
484_E	577_A	0.585	0.14
466_S	526_V	0.584	0.14
480_D	645_L	0.584	0.14
520_A	584_T	0.583	0.14
533_E	582_L	0.582	0.14
485_Q	520_A	0.582	0.14
213_K	279_Q	0.582	0.14
195_G	444_I	0.581	0.14
235_V	260_G	0.581	0.14
227_T	434_R	0.581	0.14
538_F	573_G	0.580	0.14
507_D	515_A	0.580	0.14
460_N	655_T	0.579	0.14
522_Q	621_Q	0.579	0.14
469_A	533_E	0.579	0.14
479_T	592_V	0.579	0.14
476_A	651_I	0.578	0.14
470_L	628_A	0.578	0.14
188_D	192_D	0.578	0.14
127_I	130_R	0.578	0.14
267_G	432_L	0.577	0.14
236_L	252_I	0.575	0.14
471_F	514_T	0.575	0.14
520_A	532_D	0.575	0.14
172_T	237_R	0.574	0.14
480_D	485_Q	0.574	0.14
469_A	643_K	0.573	0.14
521_V	591_D	0.572	0.14
475_L	630_V	0.571	0.14
461_I	472_L	0.570	0.14
347_V	351_A	0.569	0.14
173_I	179_P	0.569	0.14
400_A	417_A	0.568	0.14
251_D	264_H	0.567	0.14
592_V	661_Q	0.566	0.14
447_A	454_A	0.566	0.14
329_E	377_V	0.565	0.14
250_V	269_Q	0.564	0.14
555_R	613_L	0.563	0.14
381_R	405_P	0.563	0.14
587_D	630_V	0.562	0.14
154_E	455_T	0.561	0.14
168_P	266_V	0.561	0.14
172_T	190_F	0.560	0.14
585_L	644_Q	0.558	0.14
542_S	579_R	0.558	0.14
474_E	628_A	0.557	0.14
196_Y	252_I	0.556	0.14
196_Y	240_R	0.556	0.14
479_T	574_T	0.556	0.14
617_L	626_Q	0.556	0.14
130_R	272_V	0.554	0.14
163_A	383_A	0.554	0.14
187_N	247_W	0.554	0.14
632_G	638_R	0.554	0.14
476_A	630_V	0.553	0.14
473_V	478_A	0.552	0.13
280_Q	382_E	0.552	0.13
477_G	480_D	0.552	0.13
516_L	584_T	0.551	0.13
475_L	481_T	0.550	0.13
555_R	596_A	0.550	0.13
172_T	264_H	0.549	0.13
183_I	194_T	0.548	0.13
157_R	160_K	0.547	0.13
163_A	483_F	0.547	0.13
528_V	613_L	0.545	0.13
469_A	583_S	0.542	0.13
580_R	645_L	0.542	0.13
630_V	638_R	0.542	0.13
580_R	584_T	0.542	0.13
437_G	624_A	0.541	0.13
266_V	650_D	0.540	0.13
445_N	448_L	0.540	0.13
215_N	222_F	0.540	0.13
482_T	512_V	0.537	0.13
594_L	598_H	0.537	0.13
504_P	628_A	0.537	0.13
478_A	652_V	0.536	0.13
542_S	590_A	0.535	0.13
329_E	423_H	0.535	0.13
170_G	262_V	0.534	0.13
469_A	592_V	0.534	0.13
584_T	644_Q	0.534	0.13
482_T	580_R	0.533	0.13
362_F	653_P	0.533	0.13
584_T	649_M	0.532	0.13
325_G	332_G	0.531	0.13
439_T	443_S	0.531	0.13
645_L	658_Q	0.531	0.13
309_R	439_T	0.530	0.13
222_F	627_K	0.530	0.13
500_L	613_L	0.530	0.13
175_D	181_E	0.530	0.13
517_G	661_Q	0.530	0.13
473_V	484_E	0.529	0.13
615_N	638_R	0.529	0.13
299_L	324_I	0.528	0.13
481_T	485_Q	0.527	0.13
156_E	162_Q	0.526	0.13
425_I	607_H	0.526	0.13
160_K	185_Y	0.526	0.13
535_V	606_P	0.525	0.13
299_L	618_T	0.524	0.13
389_A	651_I	0.524	0.13
480_D	512_V	0.523	0.13
435_S	446_D	0.522	0.13
483_F	641_E	0.522	0.13
173_I	187_N	0.522	0.13
155_S	160_K	0.522	0.13
319_R	447_A	0.521	0.13
325_G	330_Y	0.521	0.13
400_A	440_T	0.521	0.13
509_Q	592_V	0.520	0.13
480_D	518_Y	0.520	0.13
299_L	304_T	0.519	0.13
626_Q	649_M	0.518	0.13
522_Q	579_R	0.517	0.13
617_L	622_L	0.517	0.13
471_F	657_H	0.517	0.13
161_E	432_L	0.516	0.13
441_G	458_V	0.514	0.13
271_D	612_E	0.514	0.13
591_D	640_A	0.513	0.13
393_S	416_L	0.512	0.13
240_R	418_V	0.511	0.13
414_G	441_G	0.511	0.13
321_T	433_L	0.509	0.13
321_T	447_A	0.509	0.13
383_A	412_T	0.509	0.13
481_T	615_N	0.509	0.13
475_L	655_T	0.509	0.13
321_T	418_V	0.509	0.13
469_A	485_Q	0.509	0.13
482_T	592_V	0.509	0.13
509_Q	613_L	0.508	0.13
406_V	441_G	0.508	0.13
174_S	196_Y	0.507	0.12
485_Q	504_P	0.507	0.12
466_S	627_K	0.507	0.12
518_Y	643_K	0.505	0.12
160_K	528_V	0.505	0.12
610_R	616_D	0.505	0.12
550_S	661_Q	0.505	0.12
536_V	539_D	0.504	0.12
482_T	591_D	0.504	0.12
138_H	141_D	0.504	0.12
461_I	473_V	0.503	0.12
508_P	652_V	0.503	0.12
643_K	654_S	0.502	0.12
333_A	412_T	0.502	0.12
472_L	528_V	0.502	0.12
592_V	658_Q	0.502	0.12
548_V	661_Q	0.501	0.12
316_I	425_I	0.500	0.12
464_E	485_Q	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4gczA	2	0.5059	100	0.683	Contact Map
4i5sA	2	0.5504	100	0.695	Contact Map
3a0rA	2	0.4555	100	0.704	Contact Map
4r3aA	1	0.4362	100	0.743	Contact Map
4mpcA	2	0.4154	100	0.783	Contact Map
3jz3A	2	0.2181	100	0.786	Contact Map
2c2aA	2	0.316	100	0.786	Contact Map
4q20A	2	0.3101	100	0.787	Contact Map
4e01A	3	0.3872	100	0.79	Contact Map
2q8gA	2	0.4228	100	0.793	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0144 seconds.