Q9HPT8 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPT8 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HPT8	Sequences: MFDSQSVSKHASRITVLAVVVLITLSAVPLSVSAADNTVTGKPDISLSSPDGPVGAESAHAFTVTVSNSGTLIQGGQDRYEREVQTAEALKLDIATEKLDANITPKSGTYTISSLPSGQGTDVKFQLEVGDVEPGTYRIPIDIAYEHTRSVSYGRFQEASRTKTEEESTQYVDITIEDKPQFSIVSQGENEIYGGDTGQLSLDVKNTGTETATDASVQLSSQSPTLYFGQMTSPQPKTSVYIPALDPGETANISAKVGAESNADAGDYPINAVVAYTNSNGVTRKSDSLTAGVSVQPERTFELRNVDTEKFRVDESDAEIHGEIVNTGSGSANNVAVRLGSIPGIEPTNGESAVGDLAPGESKPVSFTVAIPGSAEPGSNSFPFNVEYENDNGDVRTISSPLRQPLEIGAEQDPFEVVNVSTSVSPGGSDTVAVSLRYQGDEPVSAANAKLFVSDPLSTSDDGAYLGELQPGETTTATFTASADSAAITKEYDASVEVRYDEPDGDTKYTDGLTVGVPVSPQSGGLPVPLPVIIGLVVVVAGVGYVLYQRR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	551 (479)
Sequences:	287 (261)
Seq/√Len:	11.9

HALSA - Q9HPT8

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
219_L	270_I	4.970	1.00
23_I	28_V	3.813	0.99
322_G	365_V	3.664	0.99
295_V	299_R	3.437	0.98
207_T	359_P	3.412	0.98
208_G	328_G	3.307	0.98
290_T	299_R	3.201	0.97
320_I	432_V	3.067	0.96
305_N	339_L	3.059	0.96
339_L	382_F	3.035	0.96
325_V	362_S	2.973	0.95
326_N	438_Y	2.926	0.95
436_L	455_D	2.896	0.95
270_I	382_F	2.829	0.94
202_L	322_G	2.792	0.93
186_S	219_L	2.751	0.93
451_L	479_F	2.641	0.91
386_V	498_V	2.602	0.91
219_L	382_F	2.531	0.89
339_L	451_L	2.480	0.88
365_V	371_I	2.431	0.87
388_Y	500_Y	2.410	0.87
41_G	84_V	2.371	0.86
198_G	318_A	2.362	0.86
517_V	521_P	2.347	0.85
440_G	467_G	2.341	0.85
24_T	29_P	2.317	0.85
320_I	382_F	2.286	0.84
26_S	31_S	2.285	0.84
323_E	362_S	2.225	0.82
314_D	379_S	2.211	0.82
109_T	248_G	2.198	0.81
43_P	70_G	2.187	0.81
18_A	23_I	2.182	0.81
186_S	270_I	2.137	0.79
32_V	325_V	2.094	0.78
467_G	477_A	2.085	0.77
339_L	342_I	2.068	0.77
290_T	293_V	2.058	0.77
206_N	438_Y	2.036	0.76
295_V	301_F	2.003	0.74
331_S	359_P	1.990	0.74
426_P	459_T	1.969	0.73
186_S	382_F	1.953	0.73
336_A	380_N	1.937	0.72
242_I	245_L	1.937	0.72
268_Y	390_N	1.915	0.71
270_I	320_I	1.910	0.71
259_A	338_R	1.908	0.71
22_L	29_P	1.899	0.70
339_L	417_V	1.891	0.70
508_K	512_G	1.878	0.69
509_Y	512_G	1.864	0.69
118_G	140_P	1.831	0.67
493_D	498_V	1.800	0.66
18_A	22_L	1.788	0.65
200_L	219_L	1.783	0.65
70_G	84_V	1.777	0.65
432_V	481_A	1.761	0.64
326_N	440_G	1.761	0.64
182_F	186_S	1.744	0.63
41_G	45_I	1.733	0.63
390_N	394_D	1.723	0.62
441_D	471_P	1.717	0.62
222_Q	454_S	1.715	0.62
129_V	249_E	1.712	0.62
43_P	87_A	1.712	0.62
205_K	250_T	1.708	0.62
495_S	510_T	1.707	0.62
18_A	31_S	1.706	0.62
177_E	367_F	1.704	0.62
206_N	245_L	1.697	0.61
249_E	361_E	1.694	0.61
26_S	29_P	1.691	0.61
305_N	451_L	1.680	0.60
497_E	509_Y	1.679	0.60
123_V	359_P	1.654	0.59
175_T	474_T	1.650	0.59
350_G	469_L	1.648	0.59
21_V	25_L	1.641	0.59
305_N	417_V	1.639	0.58
94_I	125_F	1.625	0.58
21_V	28_V	1.601	0.57
264_D	384_F	1.576	0.55
512_G	521_P	1.572	0.55
62_F	419_N	1.566	0.55
115_L	255_A	1.560	0.55
57_E	469_L	1.539	0.54
215_A	245_L	1.537	0.53
200_L	320_I	1.537	0.53
215_A	306_V	1.531	0.53
29_P	32_V	1.530	0.53
58_S	61_A	1.524	0.53
342_I	384_F	1.509	0.52
20_V	23_I	1.504	0.52
418_V	435_S	1.504	0.52
424_V	430_D	1.501	0.52
146_E	303_L	1.499	0.52
18_A	21_V	1.497	0.51
174_I	293_V	1.494	0.51
311_F	513_L	1.489	0.51
219_L	272_A	1.478	0.50
245_L	251_A	1.476	0.50
212_A	472_G	1.445	0.49
289_L	403_R	1.436	0.48
248_G	361_E	1.433	0.48
55_G	58_S	1.432	0.48
184_I	247_P	1.420	0.48
353_A	357_L	1.419	0.48
357_L	361_E	1.416	0.47
101_A	107_S	1.414	0.47
89_A	118_G	1.414	0.47
60_H	179_K	1.411	0.47
351_E	367_F	1.408	0.47
447_A	497_E	1.405	0.47
277_T	288_S	1.389	0.46
18_A	24_T	1.389	0.46
200_L	215_A	1.386	0.46
22_L	28_V	1.384	0.46
470_Q	473_E	1.382	0.46
45_I	115_L	1.380	0.46
502_E	512_G	1.378	0.45
221_S	237_K	1.372	0.45
479_F	487_A	1.368	0.45
449_A	497_E	1.365	0.45
360_G	438_Y	1.363	0.45
286_S	415_F	1.357	0.44
335_V	355_G	1.357	0.44
62_F	291_A	1.356	0.44
466_L	469_L	1.353	0.44
498_V	516_G	1.347	0.44
24_T	33_S	1.331	0.43
274_V	292_G	1.328	0.43
348_T	474_T	1.327	0.43
301_F	311_F	1.324	0.43
171_Y	291_A	1.322	0.43
245_L	474_T	1.320	0.43
45_I	90_L	1.318	0.43
19_V	22_L	1.316	0.42
449_A	510_T	1.316	0.42
127_L	375_A	1.314	0.42
421_S	424_V	1.312	0.42
43_P	68_N	1.308	0.42
30_L	36_D	1.294	0.41
192_I	494_A	1.293	0.41
199_Q	244_A	1.286	0.41
322_G	364_P	1.275	0.40
311_F	322_G	1.268	0.40
164_T	170_Q	1.246	0.39
140_P	377_P	1.245	0.39
312_R	457_L	1.244	0.39
208_G	326_N	1.243	0.39
139_I	483_A	1.240	0.39
268_Y	423_S	1.231	0.38
214_D	288_S	1.228	0.38
444_V	483_A	1.226	0.38
123_V	292_G	1.218	0.38
24_T	31_S	1.217	0.38
321_H	384_F	1.213	0.37
174_I	340_G	1.213	0.37
208_G	212_A	1.210	0.37
165_E	244_A	1.208	0.37
424_V	449_A	1.207	0.37
343_P	397_T	1.207	0.37
223_S	271_N	1.202	0.37
268_Y	380_N	1.197	0.37
41_G	70_G	1.191	0.36
403_R	415_F	1.188	0.36
214_D	400_S	1.188	0.36
376_E	387_E	1.187	0.36
268_Y	388_Y	1.186	0.36
113_S	182_F	1.178	0.36
266_G	389_E	1.178	0.36
500_Y	505_G	1.174	0.36
442_E	497_E	1.173	0.36
237_K	253_I	1.168	0.35
181_Q	201_S	1.167	0.35
311_F	380_N	1.165	0.35
89_A	122_D	1.162	0.35
130_G	318_A	1.159	0.35
469_L	473_E	1.157	0.35
513_L	516_G	1.157	0.35
224_P	332_A	1.156	0.35
516_G	521_P	1.155	0.35
303_L	356_D	1.153	0.35
40_T	45_I	1.152	0.35
54_V	176_I	1.152	0.35
36_D	42_K	1.150	0.35
376_E	444_V	1.149	0.35
22_L	38_T	1.149	0.35
115_L	125_F	1.145	0.34
196_D	381_S	1.144	0.34
440_G	447_A	1.142	0.34
311_F	365_V	1.139	0.34
173_D	243_P	1.134	0.34
200_L	270_I	1.134	0.34
20_V	58_S	1.133	0.34
319_E	366_S	1.132	0.34
27_A	32_V	1.131	0.34
25_L	31_S	1.127	0.34
305_N	382_F	1.126	0.34
286_S	357_L	1.118	0.33
167_E	491_E	1.116	0.33
268_Y	500_Y	1.108	0.33
321_H	441_D	1.108	0.33
31_S	41_G	1.107	0.33
328_G	357_L	1.100	0.32
487_A	502_E	1.099	0.32
227_Y	428_G	1.099	0.32
345_I	380_N	1.092	0.32
336_A	498_V	1.081	0.32
197_T	365_V	1.076	0.31
89_A	120_G	1.073	0.31
102_N	190_N	1.072	0.31
64_V	69_S	1.072	0.31
332_A	444_V	1.069	0.31
192_I	414_P	1.066	0.31
344_G	367_F	1.062	0.31
24_T	28_V	1.061	0.31
335_V	492_Y	1.061	0.31
322_G	406_L	1.060	0.31
134_P	137_Y	1.057	0.30
511_D	514_T	1.054	0.30
67_S	90_L	1.054	0.30
530_L	533_I	1.050	0.30
333_N	339_L	1.050	0.30
311_F	318_A	1.049	0.30
184_I	530_L	1.048	0.30
127_L	183_S	1.045	0.30
22_L	25_L	1.044	0.30
276_Y	388_Y	1.044	0.30
204_V	359_P	1.043	0.30
64_V	107_S	1.043	0.30
372_P	466_L	1.042	0.30
143_I	319_E	1.038	0.30
270_I	432_V	1.037	0.30
360_G	519_V	1.033	0.29
99_L	118_G	1.032	0.29
447_A	498_V	1.030	0.29
122_D	127_L	1.029	0.29
57_E	68_N	1.027	0.29
23_I	27_A	1.026	0.29
314_D	511_D	1.022	0.29
243_P	371_I	1.021	0.29
434_V	444_V	1.021	0.29
380_N	467_G	1.019	0.29
200_L	268_Y	1.016	0.29
315_E	354_V	1.008	0.28
23_I	26_S	1.007	0.28
55_G	64_V	1.002	0.28
351_E	468_E	1.001	0.28
145_Y	281_G	0.997	0.28
24_T	209_T	0.996	0.28
362_S	374_S	0.995	0.28
436_L	467_G	0.989	0.28
456_P	492_Y	0.988	0.28
409_G	515_V	0.988	0.28
25_L	214_D	0.987	0.28
24_T	174_I	0.986	0.28
114_S	164_T	0.985	0.28
337_V	512_G	0.983	0.27
241_Y	292_G	0.983	0.27
82_R	143_I	0.981	0.27
206_N	378_G	0.981	0.27
20_V	218_Q	0.981	0.27
89_A	220_S	0.980	0.27
137_Y	438_Y	0.977	0.27
18_A	288_S	0.976	0.27
84_V	88_E	0.976	0.27
137_Y	212_A	0.973	0.27
109_T	200_L	0.973	0.27
48_S	248_G	0.967	0.27
457_L	475_T	0.967	0.27
355_G	483_A	0.964	0.27
324_I	517_V	0.964	0.27
135_G	360_G	0.961	0.27
488_I	500_Y	0.961	0.27
417_V	451_L	0.960	0.27
365_V	493_D	0.960	0.27
498_V	510_T	0.957	0.26
507_T	516_G	0.955	0.26
266_G	390_N	0.952	0.26
357_L	363_K	0.952	0.26
479_F	511_D	0.949	0.26
204_V	334_N	0.948	0.26
250_T	295_V	0.946	0.26
345_I	498_V	0.945	0.26
21_V	32_V	0.944	0.26
20_V	28_V	0.944	0.26
59_A	465_Y	0.942	0.26
494_A	499_R	0.938	0.26
29_P	176_I	0.935	0.26
40_T	71_T	0.934	0.26
224_P	346_E	0.934	0.26
69_S	91_K	0.933	0.26
45_I	52_G	0.932	0.25
380_N	465_Y	0.931	0.25
393_G	418_V	0.931	0.25
130_G	440_G	0.926	0.25
131_D	191_E	0.921	0.25
446_A	501_D	0.919	0.25
449_A	462_D	0.919	0.25
131_D	432_V	0.918	0.25
483_A	492_Y	0.915	0.25
127_L	138_R	0.914	0.25
181_Q	322_G	0.912	0.25
20_V	24_T	0.910	0.25
207_T	520_S	0.908	0.25
204_V	245_L	0.901	0.24
246_D	435_S	0.901	0.24
29_P	40_T	0.899	0.24
517_V	520_S	0.896	0.24
57_E	438_Y	0.895	0.24
494_A	520_S	0.891	0.24
325_V	384_F	0.890	0.24
184_I	288_S	0.889	0.24
208_G	440_G	0.889	0.24
230_Q	303_L	0.889	0.24
101_A	132_V	0.887	0.24
328_G	438_Y	0.887	0.24
93_D	366_S	0.886	0.24
237_K	447_A	0.885	0.24
178_D	182_F	0.884	0.24
323_E	329_S	0.882	0.24
350_G	384_F	0.881	0.24
169_T	229_G	0.879	0.24
70_G	80_Y	0.872	0.23
268_Y	292_G	0.872	0.23
116_P	203_D	0.872	0.23
419_N	432_V	0.871	0.23
489_T	522_Q	0.870	0.23
328_G	393_G	0.870	0.23
357_L	492_Y	0.869	0.23
68_N	253_I	0.869	0.23
188_G	252_N	0.869	0.23
315_E	334_N	0.868	0.23
248_G	382_F	0.865	0.23
205_K	435_S	0.861	0.23
269_P	454_S	0.861	0.23
434_V	453_V	0.859	0.23
88_E	148_T	0.858	0.23
94_I	197_T	0.855	0.23
239_S	243_P	0.855	0.23
141_I	180_P	0.855	0.23
186_S	221_S	0.853	0.23
255_A	344_G	0.851	0.23
332_A	386_V	0.849	0.22
372_P	411_E	0.849	0.22
197_T	246_D	0.848	0.22
224_P	227_Y	0.848	0.22
354_V	446_A	0.847	0.22
247_P	456_P	0.843	0.22
66_V	482_S	0.842	0.22
205_K	489_T	0.842	0.22
23_I	303_L	0.842	0.22
212_A	274_V	0.842	0.22
104_T	386_V	0.841	0.22
326_N	393_G	0.841	0.22
205_K	211_T	0.840	0.22
200_L	213_T	0.837	0.22
132_V	140_P	0.837	0.22
351_E	465_Y	0.836	0.22
279_S	401_P	0.836	0.22
247_P	360_G	0.834	0.22
332_A	394_D	0.833	0.22
19_V	432_V	0.833	0.22
23_I	359_P	0.820	0.21
276_Y	500_Y	0.818	0.21
428_G	458_S	0.817	0.21
461_D	490_K	0.817	0.21
25_L	29_P	0.815	0.21
410_A	479_F	0.812	0.21
345_I	475_T	0.812	0.21
184_I	202_L	0.812	0.21
275_A	295_V	0.810	0.21
43_P	47_L	0.808	0.21
248_G	363_K	0.807	0.21
64_V	473_E	0.803	0.21
272_A	324_I	0.802	0.21
112_I	384_F	0.800	0.21
303_L	331_S	0.798	0.21
355_G	473_E	0.795	0.21
373_G	440_G	0.795	0.21
202_L	349_N	0.793	0.21
26_S	175_T	0.791	0.20
163_K	494_A	0.790	0.20
20_V	30_L	0.789	0.20
490_K	497_E	0.789	0.20
498_V	509_Y	0.786	0.20
143_I	404_Q	0.784	0.20
182_F	274_V	0.784	0.20
135_G	312_R	0.782	0.20
68_N	145_Y	0.782	0.20
489_T	512_G	0.777	0.20
194_G	245_L	0.776	0.20
497_E	510_T	0.776	0.20
89_A	146_E	0.772	0.20
122_D	288_S	0.770	0.20
350_G	454_S	0.768	0.20
51_D	61_A	0.767	0.20
273_V	515_V	0.766	0.20
57_E	66_V	0.765	0.20
223_S	484_D	0.764	0.20
288_S	436_L	0.764	0.20
131_D	260_E	0.763	0.20
173_D	406_L	0.759	0.19
343_P	441_D	0.757	0.19
390_N	396_R	0.757	0.19
386_V	500_Y	0.755	0.19
423_S	430_D	0.755	0.19
53_P	119_Q	0.751	0.19
418_V	423_S	0.751	0.19
80_Y	118_G	0.751	0.19
272_A	515_V	0.750	0.19
51_D	115_L	0.746	0.19
208_G	281_G	0.745	0.19
226_L	359_P	0.744	0.19
204_V	337_V	0.744	0.19
263_A	319_E	0.742	0.19
313_V	386_V	0.741	0.19
200_L	240_V	0.741	0.19
341_S	382_F	0.741	0.19
107_S	466_L	0.739	0.19
38_T	46_S	0.738	0.19
200_L	388_Y	0.736	0.19
277_T	362_S	0.736	0.19
28_V	32_V	0.734	0.19
462_D	465_Y	0.732	0.19
84_V	103_I	0.732	0.19
239_S	332_A	0.731	0.19
469_L	472_G	0.729	0.19
200_L	274_V	0.727	0.18
437_R	443_P	0.726	0.18
41_G	88_E	0.725	0.18
208_G	438_Y	0.725	0.18
207_T	313_V	0.724	0.18
66_V	115_L	0.724	0.18
62_F	118_G	0.723	0.18
28_V	42_K	0.723	0.18
32_V	165_E	0.722	0.18
180_P	252_N	0.722	0.18
516_G	530_L	0.721	0.18
84_V	148_T	0.720	0.18
197_T	229_G	0.718	0.18
171_Y	184_I	0.718	0.18
486_A	515_V	0.716	0.18
482_S	501_D	0.715	0.18
427_G	488_I	0.714	0.18
231_M	255_A	0.713	0.18
206_N	375_A	0.712	0.18
372_P	384_F	0.711	0.18
496_V	513_L	0.711	0.18
208_G	245_L	0.710	0.18
21_V	27_A	0.709	0.18
359_P	471_P	0.708	0.18
211_T	224_P	0.707	0.18
220_S	265_A	0.705	0.18
50_P	69_S	0.705	0.18
432_V	503_P	0.703	0.18
168_S	184_I	0.703	0.18
413_D	439_Q	0.702	0.18
115_L	121_T	0.702	0.18
477_A	483_A	0.700	0.18
134_P	187_Q	0.700	0.18
48_S	146_E	0.699	0.18
189_E	436_L	0.698	0.18
325_V	393_G	0.698	0.18
437_R	467_G	0.697	0.18
174_I	182_F	0.695	0.18
57_E	145_Y	0.694	0.18
483_A	495_S	0.693	0.17
202_L	446_A	0.693	0.17
409_G	479_F	0.692	0.17
140_P	224_P	0.690	0.17
216_S	291_A	0.687	0.17
39_V	84_V	0.687	0.17
57_E	91_K	0.684	0.17
314_D	326_N	0.681	0.17
298_E	301_F	0.681	0.17
444_V	472_G	0.680	0.17
362_S	448_N	0.679	0.17
51_D	69_S	0.677	0.17
371_I	380_N	0.675	0.17
322_G	371_I	0.673	0.17
354_V	451_L	0.673	0.17
166_E	171_Y	0.673	0.17
243_P	378_G	0.673	0.17
121_T	217_V	0.670	0.17
24_T	42_K	0.668	0.17
498_V	515_V	0.667	0.17
250_T	481_A	0.667	0.17
449_A	465_Y	0.667	0.17
349_N	380_N	0.666	0.17
268_Y	492_Y	0.666	0.17
341_S	354_V	0.666	0.17
327_T	389_E	0.662	0.17
41_G	47_L	0.661	0.17
208_G	375_A	0.661	0.17
24_T	32_V	0.661	0.17
25_L	33_S	0.659	0.17
501_D	505_G	0.659	0.17
198_G	215_A	0.655	0.16
326_N	362_S	0.655	0.16
218_Q	422_T	0.655	0.16
409_G	496_V	0.654	0.16
58_S	180_P	0.654	0.16
228_F	231_M	0.653	0.16
325_V	468_E	0.652	0.16
260_E	371_I	0.652	0.16
410_A	454_S	0.651	0.16
33_S	382_F	0.651	0.16
276_Y	310_K	0.650	0.16
68_N	243_P	0.649	0.16
337_V	430_D	0.649	0.16
201_S	300_T	0.648	0.16
311_F	497_E	0.646	0.16
384_F	446_A	0.644	0.16
54_V	180_P	0.643	0.16
23_I	66_V	0.641	0.16
206_N	326_N	0.640	0.16
365_V	438_Y	0.638	0.16
254_S	459_T	0.637	0.16
137_Y	357_L	0.637	0.16
23_I	79_R	0.636	0.16
219_L	432_V	0.635	0.16
146_E	176_I	0.635	0.16
45_I	66_V	0.633	0.16
456_P	490_K	0.632	0.16
180_P	299_R	0.632	0.16
205_K	408_I	0.631	0.16
182_F	281_G	0.630	0.16
313_V	336_A	0.629	0.16
367_F	401_P	0.628	0.16
270_I	388_Y	0.628	0.16
453_V	459_T	0.628	0.16
412_Q	423_S	0.628	0.16
137_Y	471_P	0.626	0.16
430_D	433_A	0.625	0.16
128_E	314_D	0.625	0.16
402_L	425_S	0.625	0.16
351_E	471_P	0.625	0.16
367_F	387_E	0.624	0.16
20_V	169_T	0.624	0.16
55_G	202_L	0.624	0.16
303_L	372_P	0.623	0.16
21_V	26_S	0.623	0.16
245_L	364_P	0.622	0.16
359_P	458_S	0.620	0.15
124_K	262_N	0.620	0.15
373_G	445_S	0.620	0.15
39_V	118_G	0.620	0.15
254_S	364_P	0.620	0.15
120_G	397_T	0.618	0.15
303_L	401_P	0.617	0.15
95_A	98_K	0.616	0.15
184_I	272_A	0.615	0.15
43_P	59_A	0.615	0.15
270_I	318_A	0.615	0.15
60_H	204_V	0.615	0.15
228_F	274_V	0.614	0.15
350_G	426_P	0.614	0.15
138_R	171_Y	0.610	0.15
139_I	324_I	0.609	0.15
196_D	315_E	0.609	0.15
513_L	518_P	0.606	0.15
55_G	205_K	0.605	0.15
201_S	273_V	0.604	0.15
436_L	492_Y	0.603	0.15
177_E	262_N	0.601	0.15
517_V	522_Q	0.601	0.15
371_I	387_E	0.601	0.15
70_G	113_S	0.601	0.15
84_V	87_A	0.601	0.15
246_D	294_S	0.600	0.15
102_N	281_G	0.598	0.15
26_S	94_I	0.596	0.15
270_I	352_S	0.595	0.15
80_Y	83_E	0.595	0.15
301_F	329_S	0.595	0.15
102_N	137_Y	0.594	0.15
293_V	342_I	0.594	0.15
508_K	514_T	0.594	0.15
20_V	27_A	0.594	0.15
29_P	309_E	0.593	0.15
188_G	423_S	0.593	0.15
53_P	67_S	0.593	0.15
215_A	268_Y	0.590	0.15
322_G	380_N	0.588	0.15
193_Y	406_L	0.584	0.15
329_S	332_A	0.583	0.15
513_L	519_V	0.583	0.15
382_F	500_Y	0.582	0.14
47_L	141_I	0.582	0.14
115_L	448_N	0.580	0.14
276_Y	345_I	0.579	0.14
89_A	434_V	0.579	0.14
217_V	490_K	0.578	0.14
339_L	380_N	0.578	0.14
168_S	332_A	0.577	0.14
279_S	300_T	0.577	0.14
510_T	516_G	0.574	0.14
314_D	328_G	0.573	0.14
317_D	520_S	0.573	0.14
22_L	31_S	0.572	0.14
417_V	472_G	0.571	0.14
32_V	44_D	0.571	0.14
510_T	517_V	0.568	0.14
204_V	270_I	0.568	0.14
297_P	403_R	0.567	0.14
178_D	459_T	0.566	0.14
509_Y	518_P	0.565	0.14
298_E	303_L	0.565	0.14
45_I	87_A	0.563	0.14
432_V	521_P	0.563	0.14
165_E	177_E	0.563	0.14
496_V	505_G	0.563	0.14
39_V	45_I	0.562	0.14
452_F	462_D	0.562	0.14
41_G	68_N	0.561	0.14
360_G	426_P	0.560	0.14
129_V	147_H	0.560	0.14
58_S	83_E	0.559	0.14
166_E	169_T	0.559	0.14
107_S	135_G	0.559	0.14
382_F	391_D	0.558	0.14
290_T	327_T	0.557	0.14
57_E	60_H	0.556	0.14
22_L	515_V	0.556	0.14
93_D	385_N	0.555	0.14
377_P	469_L	0.554	0.14
71_T	246_D	0.554	0.14
245_L	395_V	0.553	0.14
273_V	296_Q	0.552	0.14
435_S	476_T	0.551	0.14
273_V	429_S	0.551	0.14
139_I	142_D	0.550	0.14
352_S	381_S	0.550	0.14
355_G	375_A	0.550	0.14
513_L	517_V	0.549	0.14
328_G	372_P	0.549	0.14
455_D	483_A	0.549	0.14
440_G	512_G	0.549	0.14
270_I	494_A	0.548	0.14
397_T	420_V	0.547	0.14
41_G	86_T	0.547	0.14
429_S	480_T	0.547	0.14
36_D	90_L	0.546	0.14
85_Q	93_D	0.545	0.14
460_S	490_K	0.544	0.14
33_S	38_T	0.544	0.14
109_T	213_T	0.544	0.14
382_F	451_L	0.543	0.14
373_G	376_E	0.543	0.14
493_D	499_R	0.543	0.14
323_E	334_N	0.542	0.14
295_V	335_V	0.541	0.14
499_R	502_E	0.541	0.14
436_L	466_L	0.541	0.14
95_A	496_V	0.540	0.13
281_G	360_G	0.539	0.13
380_N	475_T	0.539	0.13
84_V	151_V	0.537	0.13
123_V	126_Q	0.535	0.13
259_A	262_N	0.534	0.13
222_Q	419_N	0.533	0.13
452_F	509_Y	0.533	0.13
22_L	27_A	0.531	0.13
92_L	143_I	0.530	0.13
221_S	397_T	0.529	0.13
21_V	166_E	0.529	0.13
208_G	247_P	0.528	0.13
176_I	281_G	0.528	0.13
359_P	369_V	0.527	0.13
55_G	131_D	0.527	0.13
221_S	424_V	0.526	0.13
362_S	430_D	0.526	0.13
458_S	509_Y	0.526	0.13
322_G	381_S	0.526	0.13
419_N	447_A	0.525	0.13
127_L	390_N	0.525	0.13
353_A	452_F	0.525	0.13
203_D	252_N	0.524	0.13
506_D	519_V	0.524	0.13
188_G	255_A	0.524	0.13
84_V	147_H	0.523	0.13
371_I	438_Y	0.523	0.13
465_Y	501_D	0.522	0.13
30_L	72_L	0.521	0.13
421_S	521_P	0.519	0.13
354_V	479_F	0.519	0.13
334_N	447_A	0.518	0.13
283_T	400_S	0.517	0.13
430_D	496_V	0.515	0.13
293_V	378_G	0.515	0.13
433_A	466_L	0.514	0.13
489_T	501_D	0.513	0.13
131_D	257_V	0.512	0.13
509_Y	514_T	0.512	0.13
436_L	441_D	0.510	0.13
209_T	320_I	0.510	0.13
355_G	386_V	0.510	0.13
20_V	229_G	0.510	0.13
293_V	482_S	0.510	0.13
381_S	385_N	0.509	0.13
493_D	497_E	0.509	0.13
69_S	92_L	0.509	0.13
93_D	129_V	0.509	0.13
380_N	457_L	0.508	0.13
365_V	413_D	0.508	0.13
202_L	343_P	0.508	0.13
28_V	38_T	0.508	0.13
129_V	268_Y	0.508	0.13
281_G	320_I	0.507	0.13
331_S	377_P	0.505	0.13
226_L	260_E	0.502	0.13
384_F	451_L	0.502	0.13
123_V	182_F	0.500	0.13
497_E	516_G	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qsvA	1	0.3684	98.2	0.896	Contact Map
3iduA	1	0.216	98.1	0.898	Contact Map
4tshB	1	0.637	98.1	0.899	Contact Map
2l0dA	1	0.2069	98.1	0.899	Contact Map
2kutA	1	0.2087	97.7	0.908	Contact Map
2pn5A	1	0.7604	97.4	0.913	Contact Map
4e9lA	1	0.412	97.3	0.914	Contact Map
2b39A	1	0.7695	97.1	0.917	Contact Map
3prxB	1	0.7659	96.9	0.92	Contact Map
5a2fA	1	0.2831	96.4	0.924	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0133 seconds.