Q9HPR4 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPR4 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HPR4	Sequences: MNQKREVTSVDLVALTAELNEYAGAKVDKAYLYGDDLLRLKMRDFDRGRVELLVEVGETKRAHVADPTHVPDAPGRPPNFAKMLRNRLSGADFHAVRQHGFDRILEFEFRREDADTTIVAELFGDGNIAVLDPQREVVDSLDTVRLQSRTVAPGRDYGFPDARVNPLDLSYEAFAEQMRDSDTDLVRTLATQLNFGGLYAEELCSRAGVEKTTPVADAPESTLEALFDASETLLGNISAGDLDPQVYYEPTDDEDEQGARVDVTPIALDERADLPSDAFESFNDALDDYFTNLDTSEDEDSGETVDRPDFENEIEKQQRIIEQQEQAIEDFEAQAEAEREKAESLYGHYDLVDGLLSAVRQAREAGHGWQQIADTFDDAAGDVPGAEAFVGVNESAGMIRARIDDHTVTLDPSAGVEKNADRLYTEAKRIEEKKAGARAAIENTRADLDAVKQRRDEWEAEPESEHEDDADDEVAWLSRSSIPIRHQEQWYERFRWFRTSEGFLVIGGRDAGQNEELVKKYMDRYDRFFHSQAHGGPITVLKTSAPSEPSNDIEVPERDARQAARFAVACSSVWKDGRGAGDAYMVSPDQVSKTPESGEYLEKGGFAVRGDRTYFRDLSTEWAVGITCEPNTRVLGGPTDAIREQVETRIEIEPGRYAQGDAAKRIYREFRERFTDESFVRKVASPGEIQKYMPPGGSRIVEE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	703 (653)
Sequences:	469 (332)
Seq/√Len:	13.0

HALSA - Q9HPR4
SULSO - Q980T2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
499_T	559_D	8.622	1.00
93_F	107_F	6.933	1.00
263_V	290_F	6.009	1.00
106_E	117_T	5.715	1.00
119_V	131_L	5.496	1.00
528_F	538_I	5.355	1.00
27_V	40_L	4.155	1.00
226_L	230_S	3.991	1.00
379_A	383_V	3.726	0.99
501_E	556_P	3.502	0.99
118_I	130_V	3.499	0.99
4_K	11_D	3.472	0.99
506_I	517_L	3.438	0.99
541_L	559_D	3.302	0.98
227_F	230_S	3.219	0.98
517_L	540_V	3.135	0.97
499_T	541_L	3.099	0.97
514_N	600_Y	3.035	0.97
601_L	607_A	2.995	0.97
27_V	109_F	2.890	0.96
66_D	284_D	2.879	0.96
527_R	560_A	2.859	0.95
353_D	357_S	2.825	0.95
55_E	63_H	2.743	0.94
185_L	209_V	2.741	0.94
508_G	514_N	2.676	0.93
600_Y	609_R	2.667	0.93
55_E	61_R	2.666	0.93
596_E	607_A	2.662	0.93
514_N	609_R	2.658	0.93
346_Y	448_L	2.630	0.93
585_M	613_T	2.586	0.92
590_Q	610_G	2.572	0.92
42_M	93_F	2.562	0.92
586_V	608_V	2.556	0.92
224_E	230_S	2.523	0.91
30_A	541_L	2.482	0.90
523_D	542_K	2.462	0.90
137_V	155_R	2.370	0.88
5_R	10_V	2.367	0.88
123_F	611_D	2.354	0.88
27_V	136_E	2.348	0.88
568_V	583_A	2.348	0.88
418_K	421_D	2.308	0.87
93_F	109_F	2.277	0.86
514_N	611_D	2.257	0.86
510_D	531_S	2.227	0.85
527_R	541_L	2.211	0.84
514_N	596_E	2.189	0.84
363_R	432_E	2.188	0.84
439_A	442_E	2.133	0.82
96_V	107_F	2.122	0.82
594_T	609_R	2.120	0.82
224_E	229_A	2.107	0.81
49_R	496_W	2.078	0.80
599_E	611_D	2.054	0.80
514_N	595_P	2.048	0.79
393_N	433_K	2.047	0.79
514_N	605_G	2.039	0.79
243_D	278_A	2.009	0.78
30_A	40_L	1.996	0.78
339_R	343_E	1.985	0.77
595_P	605_G	1.985	0.77
501_E	558_R	1.963	0.76
323_Q	327_A	1.962	0.76
586_V	590_Q	1.960	0.76
269_D	272_A	1.915	0.74
136_E	156_D	1.904	0.74
534_H	569_A	1.885	0.73
390_V	402_R	1.868	0.73
540_V	592_S	1.861	0.72
40_L	54_V	1.852	0.72
108_E	541_L	1.846	0.72
595_P	607_A	1.845	0.72
514_N	599_E	1.838	0.71
40_L	118_I	1.837	0.71
527_R	585_M	1.827	0.71
83_M	87_R	1.815	0.70
490_W	535_G	1.809	0.70
372_I	434_K	1.805	0.70
676_D	680_V	1.791	0.69
595_P	599_E	1.785	0.69
638_P	642_I	1.780	0.69
487_Q	514_N	1.773	0.68
596_E	600_Y	1.773	0.68
61_R	500_S	1.771	0.68
318_Q	322_E	1.750	0.67
634_V	638_P	1.749	0.67
27_V	42_M	1.749	0.67
379_A	562_Q	1.746	0.67
42_M	52_L	1.732	0.67
97_R	106_E	1.729	0.66
16_T	105_L	1.726	0.66
283_N	359_V	1.720	0.66
119_V	135_R	1.714	0.66
117_T	135_R	1.701	0.65
107_F	200_A	1.692	0.65
564_A	615_F	1.686	0.64
172_E	407_T	1.683	0.64
118_I	576_D	1.672	0.64
57_G	61_R	1.672	0.64
595_P	600_Y	1.651	0.63
217_D	446_A	1.647	0.62
353_D	356_L	1.642	0.62
12_L	105_L	1.641	0.62
514_N	538_I	1.641	0.62
150_T	155_R	1.636	0.62
595_P	611_D	1.629	0.62
87_R	130_V	1.626	0.61
6_E	11_D	1.607	0.60
595_P	609_R	1.589	0.60
507_G	567_A	1.587	0.59
530_H	590_Q	1.581	0.59
511_A	514_N	1.580	0.59
118_I	198_L	1.574	0.59
529_F	564_A	1.564	0.58
534_H	609_R	1.562	0.58
662_A	666_I	1.560	0.58
543_T	555_V	1.552	0.58
560_A	585_M	1.533	0.57
603_K	609_R	1.531	0.57
415_G	419_N	1.526	0.56
327_A	461_E	1.514	0.56
605_G	609_R	1.504	0.55
41_K	69_H	1.496	0.55
143_T	151_V	1.495	0.55
401_A	434_K	1.494	0.55
80_F	369_W	1.493	0.55
325_E	532_Q	1.492	0.55
87_R	138_V	1.486	0.54
501_E	622_W	1.481	0.54
456_D	459_E	1.477	0.54
229_A	232_T	1.477	0.54
289_Y	528_F	1.474	0.54
494_F	600_Y	1.464	0.53
29_K	569_A	1.464	0.53
270_E	529_F	1.463	0.53
317_Q	466_H	1.460	0.53
600_Y	605_G	1.455	0.53
30_A	235_G	1.453	0.53
96_V	183_T	1.443	0.52
343_E	346_Y	1.442	0.52
226_L	229_A	1.441	0.52
356_L	434_K	1.435	0.52
671_R	676_D	1.434	0.52
217_D	540_V	1.429	0.51
522_M	525_Y	1.426	0.51
514_N	530_H	1.419	0.51
106_E	135_R	1.419	0.51
22_Y	42_M	1.416	0.51
325_E	329_E	1.412	0.50
490_W	530_H	1.406	0.50
8_T	15_L	1.401	0.50
519_K	607_A	1.396	0.50
202_E	270_E	1.394	0.49
128_I	464_S	1.391	0.49
57_G	63_H	1.383	0.49
530_H	610_G	1.377	0.49
491_Y	498_R	1.376	0.49
590_Q	600_Y	1.373	0.48
337_A	341_K	1.353	0.47
514_N	607_A	1.344	0.47
399_I	426_E	1.342	0.47
359_V	439_A	1.332	0.46
62_A	105_L	1.332	0.46
568_V	580_A	1.331	0.46
535_G	610_G	1.323	0.46
82_K	362_A	1.322	0.46
129_A	385_G	1.317	0.45
381_G	509_R	1.304	0.45
322_E	325_E	1.300	0.45
54_V	120_A	1.296	0.44
538_I	609_R	1.296	0.44
53_L	138_V	1.293	0.44
572_S	625_G	1.291	0.44
522_M	588_P	1.287	0.44
18_E	116_T	1.284	0.44
253_D	677_E	1.281	0.44
393_N	396_A	1.277	0.43
142_D	460_A	1.276	0.43
594_T	602_E	1.273	0.43
124_G	379_A	1.273	0.43
355_L	399_I	1.270	0.43
490_W	610_G	1.270	0.43
342_A	580_A	1.267	0.43
86_N	130_V	1.265	0.43
363_R	372_I	1.264	0.43
493_R	516_E	1.264	0.43
367_H	379_A	1.263	0.43
225_A	589_D	1.263	0.43
129_A	151_V	1.260	0.43
154_G	157_Y	1.255	0.42
94_H	118_I	1.254	0.42
599_E	609_R	1.254	0.42
540_V	586_V	1.248	0.42
18_E	157_Y	1.246	0.42
541_L	597_S	1.244	0.42
420_A	612_R	1.243	0.42
189_L	382_D	1.242	0.42
470_A	473_E	1.242	0.42
331_F	461_E	1.235	0.41
346_Y	569_A	1.231	0.41
502_G	642_I	1.229	0.41
140_S	204_C	1.229	0.41
538_I	595_P	1.224	0.41
40_L	226_L	1.220	0.41
119_V	129_A	1.219	0.40
514_N	590_Q	1.216	0.40
514_N	535_G	1.214	0.40
101_F	552_D	1.208	0.40
106_E	119_V	1.203	0.40
519_K	595_P	1.200	0.40
612_R	641_A	1.200	0.40
564_A	616_R	1.197	0.39
123_F	542_K	1.197	0.39
502_G	641_A	1.196	0.39
372_I	507_G	1.191	0.39
558_R	562_Q	1.183	0.39
595_P	601_L	1.181	0.39
377_D	401_A	1.181	0.39
12_L	345_L	1.180	0.39
27_V	360_R	1.178	0.38
508_G	600_Y	1.170	0.38
403_I	560_A	1.164	0.38
22_Y	64_V	1.156	0.37
129_A	321_I	1.155	0.37
5_R	144_V	1.152	0.37
530_H	535_G	1.152	0.37
53_L	222_T	1.151	0.37
534_H	538_I	1.148	0.37
590_Q	594_T	1.148	0.37
652_I	666_I	1.148	0.37
100_G	352_V	1.145	0.37
239_A	614_Y	1.144	0.37
91_A	109_F	1.143	0.37
288_D	291_T	1.139	0.37
41_K	383_V	1.138	0.36
664_K	676_D	1.136	0.36
62_A	266_I	1.136	0.36
444_T	448_L	1.134	0.36
531_S	534_H	1.133	0.36
339_R	567_A	1.131	0.36
50_V	64_V	1.126	0.36
153_P	290_F	1.122	0.36
105_L	440_A	1.122	0.36
590_Q	598_G	1.121	0.36
27_V	438_R	1.119	0.36
534_H	600_Y	1.114	0.35
326_Q	433_K	1.113	0.35
76_R	325_E	1.110	0.35
316_K	451_V	1.109	0.35
118_I	395_S	1.102	0.35
52_L	64_V	1.100	0.35
661_D	675_T	1.100	0.35
78_P	597_S	1.098	0.35
230_S	507_G	1.097	0.35
505_V	517_L	1.096	0.34
435_A	457_E	1.095	0.34
106_E	159_F	1.089	0.34
107_F	135_R	1.087	0.34
465_E	474_V	1.085	0.34
142_D	486_H	1.084	0.34
172_E	673_R	1.079	0.34
53_L	267_A	1.068	0.33
72_D	303_E	1.066	0.33
524_R	567_A	1.066	0.33
12_L	611_D	1.061	0.33
526_D	542_K	1.060	0.33
123_F	184_D	1.060	0.33
538_I	600_Y	1.059	0.33
590_Q	608_V	1.057	0.33
57_G	132_D	1.057	0.33
75_G	342_A	1.056	0.33
124_G	358_A	1.050	0.32
335_A	458_W	1.048	0.32
8_T	266_I	1.046	0.32
228_D	231_E	1.044	0.32
25_A	50_V	1.044	0.32
596_E	609_R	1.044	0.32
621_E	648_T	1.043	0.32
434_K	532_Q	1.038	0.32
29_K	90_G	1.034	0.32
290_F	328_I	1.032	0.32
122_L	470_A	1.028	0.31
83_M	139_D	1.028	0.31
345_L	395_S	1.027	0.31
503_F	642_I	1.017	0.31
458_W	626_I	1.016	0.31
497_F	500_S	1.014	0.31
448_L	452_K	1.013	0.31
193_L	541_L	1.009	0.30
341_K	447_D	1.006	0.30
419_N	428_K	1.006	0.30
541_L	556_P	1.001	0.30
182_D	191_T	0.999	0.30
593_K	606_F	0.999	0.30
124_G	383_V	0.998	0.30
327_A	331_F	0.991	0.30
140_S	368_G	0.990	0.30
627_T	647_E	0.987	0.30
346_Y	349_Y	0.984	0.29
539_T	567_A	0.983	0.29
285_A	599_E	0.982	0.29
356_L	399_I	0.980	0.29
15_L	360_R	0.978	0.29
124_G	366_G	0.977	0.29
106_E	131_L	0.976	0.29
399_I	510_D	0.975	0.29
208_G	228_D	0.974	0.29
537_P	584_Y	0.974	0.29
352_V	401_A	0.973	0.29
339_R	376_F	0.971	0.29
187_R	323_Q	0.969	0.29
182_D	231_E	0.968	0.29
76_R	358_A	0.967	0.29
134_Q	138_V	0.967	0.29
92_D	294_D	0.967	0.29
586_V	610_G	0.962	0.28
346_Y	445_R	0.960	0.28
416_V	420_A	0.960	0.28
40_L	52_L	0.959	0.28
585_M	615_F	0.958	0.28
670_F	673_R	0.956	0.28
515_E	586_V	0.954	0.28
535_G	600_Y	0.953	0.28
125_D	562_Q	0.952	0.28
85_R	103_R	0.952	0.28
139_D	626_I	0.950	0.28
41_K	377_D	0.948	0.28
131_L	135_R	0.948	0.28
351_L	567_A	0.946	0.28
590_Q	595_P	0.943	0.28
514_N	534_H	0.942	0.28
109_F	578_R	0.941	0.28
249_E	345_L	0.941	0.28
98_Q	123_F	0.940	0.28
599_E	605_G	0.940	0.28
519_K	590_Q	0.940	0.28
9_S	52_L	0.939	0.27
490_W	590_Q	0.939	0.27
661_D	665_R	0.938	0.27
416_V	419_N	0.937	0.27
567_A	625_G	0.936	0.27
99_H	201_E	0.935	0.27
189_L	223_L	0.934	0.27
318_Q	569_A	0.933	0.27
525_Y	554_E	0.932	0.27
280_E	511_A	0.931	0.27
26_K	57_G	0.928	0.27
105_L	270_E	0.928	0.27
125_D	379_A	0.927	0.27
291_T	499_T	0.927	0.27
65_A	291_T	0.925	0.27
128_I	618_L	0.924	0.27
225_A	273_D	0.922	0.27
54_V	338_E	0.922	0.27
414_A	418_K	0.921	0.27
29_K	91_A	0.921	0.27
91_A	331_F	0.920	0.27
280_E	387_E	0.918	0.27
439_A	443_N	0.918	0.27
27_V	463_E	0.917	0.27
213_T	555_V	0.917	0.27
494_F	515_E	0.916	0.27
10_V	199_Y	0.915	0.26
363_R	523_D	0.915	0.26
100_G	342_A	0.914	0.26
522_M	589_D	0.913	0.26
12_L	568_V	0.912	0.26
580_A	614_Y	0.911	0.26
582_D	617_D	0.911	0.26
283_N	521_Y	0.910	0.26
487_Q	536_G	0.908	0.26
134_Q	352_V	0.905	0.26
674_F	679_F	0.903	0.26
27_V	316_K	0.903	0.26
563_A	615_F	0.903	0.26
654_P	662_A	0.899	0.26
586_V	599_E	0.899	0.26
280_E	284_D	0.899	0.26
207_A	625_G	0.898	0.26
331_F	394_E	0.895	0.26
470_A	502_G	0.893	0.26
397_G	435_A	0.892	0.26
120_A	375_T	0.890	0.25
529_F	541_L	0.889	0.25
63_H	494_F	0.885	0.25
472_D	642_I	0.885	0.25
118_I	481_S	0.885	0.25
289_Y	616_R	0.883	0.25
637_G	642_I	0.883	0.25
592_S	599_E	0.881	0.25
666_I	672_E	0.879	0.25
121_E	265_P	0.878	0.25
273_D	677_E	0.876	0.25
315_E	319_R	0.875	0.25
600_Y	607_A	0.874	0.25
53_L	141_L	0.873	0.25
528_F	531_S	0.872	0.25
582_D	614_Y	0.871	0.25
451_V	457_E	0.870	0.25
138_V	620_T	0.868	0.25
439_A	447_D	0.867	0.25
137_V	536_G	0.867	0.25
91_A	110_R	0.863	0.24
669_E	680_V	0.861	0.24
410_L	625_G	0.861	0.24
45_F	452_K	0.860	0.24
209_V	384_P	0.859	0.24
342_A	448_L	0.859	0.24
667_Y	674_F	0.859	0.24
353_D	399_I	0.857	0.24
353_D	440_A	0.857	0.24
27_V	82_K	0.857	0.24
315_E	318_Q	0.856	0.24
486_H	492_E	0.855	0.24
518_V	522_M	0.855	0.24
525_Y	588_P	0.852	0.24
486_H	493_R	0.850	0.24
49_R	73_A	0.850	0.24
42_M	171_Y	0.850	0.24
590_Q	609_R	0.848	0.24
488_E	528_F	0.847	0.24
28_D	90_G	0.847	0.24
532_Q	614_Y	0.846	0.24
15_L	286_L	0.844	0.24
5_R	354_G	0.842	0.24
402_R	520_K	0.840	0.24
389_F	592_S	0.839	0.24
212_T	506_I	0.838	0.23
399_I	589_D	0.837	0.23
123_F	127_N	0.836	0.23
277_D	288_D	0.833	0.23
570_C	622_W	0.833	0.23
358_A	367_H	0.832	0.23
464_S	569_A	0.832	0.23
185_L	510_D	0.831	0.23
128_I	214_P	0.830	0.23
18_E	74_P	0.830	0.23
107_F	405_D	0.828	0.23
279_F	288_D	0.827	0.23
88_L	380_A	0.827	0.23
208_G	600_Y	0.826	0.23
634_V	637_G	0.825	0.23
36_D	614_Y	0.824	0.23
400_R	556_P	0.824	0.23
57_G	80_F	0.822	0.23
370_Q	589_D	0.822	0.23
503_F	543_T	0.822	0.23
56_V	270_E	0.821	0.23
3_Q	18_E	0.821	0.23
535_G	590_Q	0.820	0.23
660_G	673_R	0.820	0.23
172_E	452_K	0.819	0.23
461_E	586_V	0.818	0.23
472_D	496_W	0.818	0.23
88_L	317_Q	0.817	0.23
339_R	451_V	0.816	0.23
226_L	588_P	0.815	0.23
31_Y	563_A	0.812	0.23
187_R	567_A	0.812	0.23
144_V	154_G	0.811	0.22
150_T	569_A	0.811	0.22
27_V	93_F	0.810	0.22
318_Q	336_E	0.810	0.22
590_Q	606_F	0.810	0.22
319_R	324_Q	0.809	0.22
661_D	668_R	0.809	0.22
399_I	541_L	0.808	0.22
222_T	677_E	0.806	0.22
5_R	38_L	0.806	0.22
354_G	399_I	0.806	0.22
161_D	464_S	0.804	0.22
341_K	625_G	0.803	0.22
124_G	144_V	0.803	0.22
296_S	638_P	0.802	0.22
508_G	599_E	0.802	0.22
528_F	599_E	0.801	0.22
367_H	562_Q	0.801	0.22
519_K	596_E	0.800	0.22
136_E	382_D	0.798	0.22
380_A	402_R	0.792	0.22
657_Y	665_R	0.791	0.22
410_L	663_A	0.791	0.22
104_I	537_P	0.791	0.22
142_D	493_R	0.789	0.22
467_E	471_D	0.789	0.22
25_A	38_L	0.788	0.22
81_A	123_F	0.787	0.22
3_Q	7_V	0.786	0.22
508_G	535_G	0.785	0.22
510_D	532_Q	0.783	0.21
237_I	541_L	0.781	0.21
40_L	279_F	0.781	0.21
386_A	573_V	0.781	0.21
538_I	599_E	0.781	0.21
661_D	664_K	0.778	0.21
270_E	624_V	0.777	0.21
349_Y	624_V	0.777	0.21
46_D	625_G	0.777	0.21
195_F	364_E	0.776	0.21
227_F	269_D	0.776	0.21
62_A	381_G	0.775	0.21
571_S	574_W	0.773	0.21
53_L	646_V	0.773	0.21
507_G	537_P	0.771	0.21
39_R	45_F	0.771	0.21
331_F	623_A	0.770	0.21
117_T	344_S	0.769	0.21
109_F	141_L	0.769	0.21
666_I	676_D	0.768	0.21
514_N	567_A	0.767	0.21
500_S	562_Q	0.766	0.21
653_E	666_I	0.766	0.21
137_V	150_T	0.766	0.21
359_V	592_S	0.766	0.21
171_Y	224_E	0.765	0.21
514_N	598_G	0.765	0.21
502_G	640_D	0.764	0.21
3_Q	11_D	0.763	0.21
630_P	634_V	0.762	0.21
366_G	525_Y	0.760	0.21
355_L	401_A	0.760	0.21
98_Q	126_G	0.760	0.21
492_E	516_E	0.760	0.21
491_Y	528_F	0.759	0.21
423_L	432_E	0.756	0.21
20_N	330_D	0.756	0.21
263_V	462_P	0.755	0.21
556_P	563_A	0.753	0.20
383_V	562_Q	0.753	0.20
79_N	87_R	0.752	0.20
635_L	646_V	0.751	0.20
375_T	379_A	0.751	0.20
438_R	460_A	0.751	0.20
33_Y	484_I	0.751	0.20
46_D	665_R	0.751	0.20
67_P	615_F	0.748	0.20
27_V	154_G	0.748	0.20
253_D	678_S	0.747	0.20
494_F	513_Q	0.746	0.20
482_I	506_I	0.745	0.20
491_Y	499_T	0.743	0.20
595_P	602_E	0.743	0.20
670_F	680_V	0.742	0.20
417_E	420_A	0.741	0.20
675_T	680_V	0.741	0.20
79_N	83_M	0.740	0.20
656_R	678_S	0.740	0.20
171_Y	289_Y	0.739	0.20
110_R	122_L	0.738	0.20
103_R	121_E	0.737	0.20
382_D	387_E	0.737	0.20
115_D	509_R	0.737	0.20
125_D	466_H	0.737	0.20
221_S	239_A	0.735	0.20
239_A	376_F	0.735	0.20
23_A	95_A	0.734	0.20
490_W	522_M	0.733	0.20
530_H	598_G	0.732	0.20
15_L	18_E	0.732	0.20
247_Y	271_R	0.731	0.20
25_A	51_E	0.731	0.20
181_S	249_E	0.731	0.20
514_N	610_G	0.730	0.20
562_Q	570_C	0.730	0.20
104_I	108_E	0.729	0.20
596_E	611_D	0.729	0.20
212_T	608_V	0.727	0.20
312_N	562_Q	0.727	0.20
595_P	614_Y	0.725	0.19
97_R	286_L	0.725	0.19
56_V	141_L	0.724	0.19
4_K	121_E	0.723	0.19
120_A	144_V	0.722	0.19
413_S	587_S	0.721	0.19
287_D	291_T	0.721	0.19
3_Q	6_E	0.720	0.19
382_D	442_E	0.719	0.19
404_D	672_E	0.719	0.19
415_G	517_L	0.718	0.19
513_Q	531_S	0.717	0.19
596_E	603_K	0.717	0.19
6_E	10_V	0.716	0.19
88_L	455_R	0.716	0.19
499_T	527_R	0.714	0.19
116_T	573_V	0.714	0.19
187_R	480_S	0.714	0.19
132_D	521_Y	0.713	0.19
443_N	457_E	0.713	0.19
519_K	600_Y	0.713	0.19
341_K	456_D	0.711	0.19
535_G	598_G	0.710	0.19
228_D	677_E	0.710	0.19
29_K	368_G	0.709	0.19
408_V	412_P	0.709	0.19
114_A	338_E	0.709	0.19
501_E	621_E	0.708	0.19
674_F	678_S	0.708	0.19
538_I	596_E	0.707	0.19
148_S	152_A	0.707	0.19
660_G	671_R	0.704	0.19
200_A	520_K	0.704	0.19
380_A	401_A	0.703	0.19
106_E	540_V	0.703	0.19
56_V	83_M	0.703	0.19
528_F	660_G	0.702	0.19
654_P	664_K	0.702	0.19
229_A	280_E	0.702	0.19
456_D	517_L	0.701	0.19
508_G	592_S	0.701	0.19
91_A	154_G	0.701	0.19
533_A	573_V	0.699	0.19
170_S	253_D	0.698	0.19
218_A	520_K	0.698	0.19
278_A	560_A	0.698	0.19
200_A	401_A	0.696	0.19
117_T	131_L	0.693	0.18
99_H	581_G	0.692	0.18
150_T	174_F	0.692	0.18
34_G	37_L	0.691	0.18
128_I	468_D	0.691	0.18
40_L	451_V	0.690	0.18
12_L	163_R	0.690	0.18
21_E	95_A	0.690	0.18
519_K	522_M	0.690	0.18
528_F	600_Y	0.689	0.18
267_A	629_E	0.688	0.18
293_L	402_R	0.687	0.18
8_T	11_D	0.686	0.18
294_D	563_A	0.685	0.18
261_V	368_G	0.684	0.18
93_F	204_C	0.682	0.18
266_I	372_I	0.681	0.18
241_D	411_D	0.681	0.18
40_L	192_Q	0.680	0.18
412_P	415_G	0.680	0.18
593_K	604_G	0.679	0.18
107_F	357_S	0.679	0.18
437_A	460_A	0.678	0.18
86_N	249_E	0.677	0.18
530_H	595_P	0.677	0.18
300_D	309_D	0.676	0.18
400_R	624_V	0.676	0.18
128_I	232_T	0.676	0.18
516_E	669_E	0.675	0.18
62_A	120_A	0.675	0.18
514_N	594_T	0.675	0.18
50_V	123_F	0.672	0.18
53_L	119_V	0.672	0.18
659_Q	673_R	0.671	0.18
666_I	679_F	0.671	0.18
42_M	289_Y	0.671	0.18
141_L	514_N	0.670	0.18
443_N	562_Q	0.670	0.18
510_D	513_Q	0.667	0.18
318_Q	561_R	0.666	0.18
507_G	570_C	0.665	0.18
457_E	563_A	0.664	0.18
226_L	390_V	0.662	0.18
20_N	626_I	0.662	0.18
66_D	534_H	0.662	0.18
288_D	536_G	0.661	0.17
69_H	125_D	0.660	0.17
64_V	284_D	0.660	0.17
226_L	666_I	0.660	0.17
230_S	393_N	0.659	0.17
122_L	144_V	0.659	0.17
324_Q	603_K	0.659	0.17
269_D	452_K	0.658	0.17
7_V	12_L	0.657	0.17
33_Y	178_M	0.657	0.17
169_L	177_Q	0.657	0.17
237_I	342_A	0.656	0.17
421_D	426_E	0.656	0.17
152_A	203_L	0.655	0.17
199_Y	283_N	0.655	0.17
239_A	428_K	0.655	0.17
129_A	134_Q	0.654	0.17
672_E	679_F	0.654	0.17
41_K	379_A	0.652	0.17
118_I	620_T	0.650	0.17
448_L	584_Y	0.650	0.17
403_I	509_R	0.649	0.17
519_K	530_H	0.647	0.17
18_E	89_S	0.647	0.17
411_D	421_D	0.647	0.17
411_D	416_V	0.645	0.17
482_I	518_V	0.644	0.17
134_Q	267_A	0.644	0.17
316_K	675_T	0.644	0.17
421_D	671_R	0.644	0.17
670_F	674_F	0.643	0.17
508_G	586_V	0.642	0.17
457_E	460_A	0.642	0.17
56_V	105_L	0.641	0.17
500_S	525_Y	0.641	0.17
253_D	258_G	0.641	0.17
655_G	679_F	0.640	0.17
345_L	391_G	0.638	0.17
285_A	518_V	0.638	0.17
176_E	235_G	0.638	0.17
12_L	324_Q	0.638	0.17
91_A	495_R	0.637	0.17
184_D	187_R	0.636	0.17
30_A	78_P	0.635	0.17
400_R	431_E	0.635	0.17
247_Y	533_A	0.635	0.17
325_E	517_L	0.635	0.17
212_T	399_I	0.635	0.17
314_I	396_A	0.633	0.17
345_L	352_V	0.632	0.17
118_I	507_G	0.632	0.17
235_G	651_E	0.631	0.17
190_A	511_A	0.631	0.17
27_V	374_D	0.631	0.17
394_E	443_N	0.631	0.17
592_S	609_R	0.631	0.17
650_I	654_P	0.630	0.17
221_S	409_T	0.630	0.17
413_S	495_R	0.630	0.17
239_A	662_A	0.629	0.17
359_V	373_A	0.629	0.17
40_L	50_V	0.628	0.17
107_F	336_E	0.627	0.16
23_A	113_D	0.627	0.16
261_V	352_V	0.627	0.16
328_I	569_A	0.626	0.16
535_G	606_F	0.625	0.16
139_D	372_I	0.625	0.16
99_H	170_S	0.624	0.16
344_S	625_G	0.624	0.16
527_R	559_D	0.623	0.16
577_G	638_P	0.623	0.16
246_V	661_D	0.622	0.16
344_S	430_I	0.622	0.16
433_K	447_D	0.622	0.16
336_E	608_V	0.621	0.16
258_G	280_E	0.621	0.16
420_A	584_Y	0.621	0.16
14_A	282_F	0.620	0.16
187_R	453_Q	0.620	0.16
514_N	537_P	0.619	0.16
573_V	620_T	0.619	0.16
13_V	540_V	0.618	0.16
3_Q	451_V	0.617	0.16
263_V	331_F	0.616	0.16
30_A	46_D	0.616	0.16
279_F	409_T	0.614	0.16
248_Y	562_Q	0.614	0.16
40_L	104_I	0.612	0.16
290_F	676_D	0.612	0.16
86_N	369_W	0.612	0.16
42_M	260_R	0.611	0.16
118_I	233_L	0.611	0.16
659_Q	676_D	0.611	0.16
361_Q	622_W	0.611	0.16
531_S	573_V	0.610	0.16
235_G	273_D	0.609	0.16
670_F	679_F	0.609	0.16
289_Y	378_D	0.608	0.16
544_S	626_I	0.608	0.16
96_V	289_Y	0.607	0.16
211_K	618_L	0.606	0.16
96_V	353_D	0.604	0.16
327_A	628_C	0.604	0.16
269_D	597_S	0.604	0.16
214_P	569_A	0.604	0.16
415_G	418_K	0.604	0.16
665_R	677_E	0.602	0.16
405_D	672_E	0.602	0.16
511_A	620_T	0.601	0.16
376_F	388_A	0.600	0.16
495_R	625_G	0.600	0.16
36_D	623_A	0.600	0.16
469_D	474_V	0.600	0.16
436_G	444_T	0.599	0.16
356_L	605_G	0.598	0.16
535_G	609_R	0.598	0.16
138_V	560_A	0.596	0.16
3_Q	137_V	0.595	0.16
568_V	588_P	0.593	0.16
534_H	587_S	0.593	0.16
490_W	510_D	0.591	0.15
415_G	646_V	0.589	0.15
267_A	278_A	0.589	0.15
605_G	611_D	0.587	0.15
607_A	613_T	0.587	0.15
12_L	32_L	0.587	0.15
264_T	335_A	0.586	0.15
520_K	600_Y	0.585	0.15
228_D	273_D	0.584	0.15
132_D	403_I	0.582	0.15
92_D	397_G	0.582	0.15
449_D	499_T	0.581	0.15
176_E	675_T	0.581	0.15
598_G	610_G	0.580	0.15
466_H	470_A	0.579	0.15
582_D	618_L	0.579	0.15
534_H	596_E	0.578	0.15
208_G	435_A	0.577	0.15
174_F	509_R	0.577	0.15
375_T	505_V	0.577	0.15
248_Y	277_D	0.575	0.15
673_R	676_D	0.574	0.15
301_S	465_E	0.573	0.15
188_T	385_G	0.573	0.15
328_I	341_K	0.573	0.15
197_G	346_Y	0.573	0.15
196_G	201_E	0.573	0.15
241_D	671_R	0.572	0.15
351_L	357_S	0.572	0.15
123_F	322_E	0.572	0.15
397_G	438_R	0.572	0.15
355_L	386_A	0.571	0.15
508_G	607_A	0.570	0.15
533_A	581_G	0.570	0.15
524_R	568_V	0.570	0.15
123_F	374_D	0.570	0.15
493_R	617_D	0.569	0.15
635_L	644_E	0.569	0.15
151_V	353_D	0.569	0.15
186_V	197_G	0.568	0.15
289_Y	629_E	0.568	0.15
77_P	80_F	0.568	0.15
183_T	624_V	0.567	0.15
222_T	643_R	0.566	0.15
389_F	421_D	0.566	0.15
499_T	615_F	0.564	0.15
666_I	671_R	0.564	0.15
625_G	647_E	0.564	0.15
355_L	385_G	0.564	0.15
136_E	360_R	0.563	0.15
12_L	23_A	0.563	0.15
221_S	671_R	0.563	0.15
657_Y	672_E	0.563	0.15
224_E	228_D	0.562	0.15
310_F	316_K	0.562	0.15
79_N	499_T	0.562	0.15
41_K	309_D	0.562	0.15
14_A	178_M	0.561	0.15
410_L	588_P	0.561	0.15
538_I	577_G	0.560	0.15
671_R	674_F	0.560	0.15
495_R	576_D	0.560	0.15
380_A	481_S	0.559	0.15
36_D	73_A	0.558	0.15
358_A	379_A	0.558	0.15
168_D	522_M	0.558	0.15
320_I	324_Q	0.556	0.15
331_F	615_F	0.556	0.15
332_E	458_W	0.555	0.15
196_G	440_A	0.555	0.15
187_R	264_T	0.554	0.14
345_L	434_K	0.554	0.14
34_G	53_L	0.553	0.14
473_E	476_W	0.553	0.14
569_A	611_D	0.552	0.14
114_A	518_V	0.551	0.14
49_R	629_E	0.551	0.14
26_K	92_D	0.551	0.14
324_Q	464_S	0.550	0.14
416_V	421_D	0.549	0.14
487_Q	611_D	0.546	0.14
28_D	43_R	0.546	0.14
379_A	509_R	0.546	0.14
544_S	555_V	0.546	0.14
195_F	602_E	0.545	0.14
119_V	611_D	0.543	0.14
103_R	126_G	0.542	0.14
150_T	351_L	0.541	0.14
535_G	595_P	0.541	0.14
43_R	536_G	0.541	0.14
30_A	52_L	0.541	0.14
85_R	121_E	0.541	0.14
468_D	471_D	0.540	0.14
235_G	675_T	0.540	0.14
127_N	497_F	0.540	0.14
140_S	293_L	0.538	0.14
415_G	664_K	0.538	0.14
49_R	198_L	0.538	0.14
187_R	614_Y	0.538	0.14
401_A	642_I	0.537	0.14
23_A	105_L	0.536	0.14
50_V	53_L	0.536	0.14
385_G	436_G	0.535	0.14
343_E	569_A	0.535	0.14
123_F	149_R	0.534	0.14
518_V	538_I	0.533	0.14
193_L	200_A	0.533	0.14
514_N	597_S	0.533	0.14
280_E	678_S	0.533	0.14
110_R	113_D	0.533	0.14
466_H	536_G	0.532	0.14
80_F	102_D	0.532	0.14
107_F	387_E	0.530	0.14
325_E	386_A	0.530	0.14
646_V	651_E	0.530	0.14
343_E	472_D	0.529	0.14
297_E	527_R	0.528	0.14
527_R	660_G	0.526	0.14
81_A	558_R	0.526	0.14
55_E	196_G	0.526	0.14
55_E	614_Y	0.526	0.14
61_R	583_A	0.525	0.14
401_A	631_N	0.525	0.14
496_W	570_C	0.524	0.14
94_H	391_G	0.524	0.14
65_A	492_E	0.524	0.14
451_V	466_H	0.523	0.14
25_A	42_M	0.523	0.14
15_L	62_A	0.523	0.14
69_H	379_A	0.523	0.14
99_H	403_I	0.522	0.14
206_R	229_A	0.520	0.14
49_R	420_A	0.520	0.14
92_D	317_Q	0.520	0.14
20_N	95_A	0.519	0.14
128_I	276_S	0.519	0.14
301_S	474_V	0.519	0.14
323_Q	443_N	0.519	0.14
163_R	532_Q	0.518	0.14
371_Q	616_R	0.518	0.14
376_F	614_Y	0.518	0.14
40_L	430_I	0.517	0.14
63_H	497_F	0.517	0.14
577_G	634_V	0.517	0.14
343_E	464_S	0.517	0.14
360_R	364_E	0.517	0.14
69_H	72_D	0.517	0.14
451_V	624_V	0.516	0.14
197_G	638_P	0.516	0.14
659_Q	679_F	0.516	0.14
322_E	326_Q	0.516	0.14
65_A	486_H	0.516	0.14
33_Y	73_A	0.516	0.14
237_I	452_K	0.516	0.14
652_I	656_R	0.516	0.14
170_S	228_D	0.516	0.14
283_N	483_P	0.515	0.14
258_G	675_T	0.515	0.14
513_Q	612_R	0.515	0.14
236_N	541_L	0.514	0.13
511_A	540_V	0.514	0.13
203_L	431_E	0.514	0.13
179_R	560_A	0.514	0.13
345_L	475_A	0.514	0.13
53_L	403_I	0.513	0.13
153_P	157_Y	0.513	0.13
528_F	613_T	0.513	0.13
323_Q	584_Y	0.513	0.13
333_A	496_W	0.512	0.13
660_G	670_F	0.512	0.13
170_S	219_P	0.512	0.13
660_G	680_V	0.511	0.13
271_R	468_D	0.509	0.13
324_Q	468_D	0.509	0.13
173_A	370_Q	0.509	0.13
69_H	124_G	0.509	0.13
221_S	225_A	0.508	0.13
253_D	411_D	0.508	0.13
74_P	379_A	0.507	0.13
146_L	587_S	0.507	0.13
8_T	154_G	0.507	0.13
514_N	589_D	0.507	0.13
312_N	382_D	0.506	0.13
40_L	147_Q	0.505	0.13
38_L	195_F	0.505	0.13
200_A	637_G	0.505	0.13
286_L	517_L	0.504	0.13
176_E	212_T	0.504	0.13
227_F	392_V	0.503	0.13
190_A	197_G	0.503	0.13
15_L	144_V	0.502	0.13
434_K	452_K	0.502	0.13
74_P	631_N	0.501	0.13
137_V	247_Y	0.501	0.13
185_L	352_V	0.501	0.13
390_V	431_E	0.501	0.13
672_E	677_E	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3doaA	1	0.3599	100	0.765	Contact Map
1ee8A	2	0.3272	98.8	0.953	Contact Map
1k82A	1	0.3172	95.8	0.973	Contact Map
3twlA	1	0.2916	95.3	0.974	Contact Map
3u6pA	1	0.2987	95.1	0.974	Contact Map
4mb7A	2	0.3201	93.5	0.976	Contact Map
4pd2A	1	0.3314	92.2	0.977	Contact Map
3vk8A	1	0.34	92.1	0.977	Contact Map
3w0fA	1	0.3243	91.1	0.978	Contact Map
1k3xA	1	0.3115	90.3	0.978	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0142 seconds.