Q9HPR3 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPR3 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HPR3	Sequences: MSSNADDGAFQAACEELVSRILAGDVGKDDIEDAKLDVCGEYAASKVPKHSDLLDVAPDGRRDELEDVLQRKPVRTASGVTPVAIMTSPHTCPHGKCLYCPGGPASEFTSSQSYTGHEPAAARGVQNDYDPYGQVTLRLHQLRQIGHPVDKVELILMGGTMTARSHDYQEWFVKRALQALNDFDPDQEPAPNQTESFAQDPAEYDFRYLEDVIADNEHGALRNIGTTFETKPDWCDPEQVDRMLDLGATKVEVGVQTTFERVNREMHRGHGVQASVDANRRLRDAAFKVGFHMMPGQPGMSKEMVLEDFRRLFDDERWKPDYLKIYPTLVVRDTITYDMWRNGDFEPLHNEEAADLVAEIKDMIPRYTRLQRVQRDIPADFIDAGVWKSNLRQLARQRMAEHGYTCDCIRCREAGMNDDDPENVSLDVETYAAGGGTEQFISIEDFQQDLLVGFARLRFPNEPAREELTDAALLRELHVYGSEVSVGDDTGDDQHQHQGYGRQLMERAEHLAADSGFEKLSVISGIGARQYYKQQLGYHQDGPYVSKRL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	549 (510)
Sequences:	386 (227)
Seq/√Len:	10.0

HALSA - Q9HPR3
SULSO - Q97ZU7

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
408_C	411_C	6.103	1.00
541_D	546_S	5.782	1.00
361_K	408_C	5.305	1.00
311_R	315_D	5.244	1.00
505_M	536_L	4.651	1.00
507_R	510_H	4.617	1.00
406_C	411_C	4.419	0.99
271_G	274_A	4.295	0.99
468_L	521_S	4.245	0.99
361_K	411_C	4.022	0.99
349_H	352_E	3.663	0.98
441_I	455_A	3.655	0.98
279_N	291_F	3.653	0.98
286_A	473_L	3.365	0.96
267_H	335_I	3.245	0.95
149_V	221_L	2.959	0.92
428_V	441_I	2.854	0.91
178_Q	212_V	2.853	0.91
177_L	526_I	2.840	0.91
428_V	507_R	2.819	0.90
85_I	176_A	2.809	0.90
257_T	262_V	2.799	0.90
208_Y	211_D	2.737	0.89
471_A	521_S	2.718	0.88
283_R	434_G	2.713	0.88
366_R	429_E	2.691	0.88
154_L	176_A	2.669	0.88
505_M	522_V	2.637	0.87
428_V	439_Q	2.630	0.87
316_E	432_A	2.587	0.86
361_K	406_C	2.546	0.85
241_D	465_R	2.526	0.84
296_G	353_A	2.476	0.83
83_V	152_V	2.438	0.82
398_R	401_E	2.425	0.82
467_E	542_G	2.412	0.81
474_L	505_M	2.389	0.81
178_Q	185_P	2.389	0.81
139_L	505_M	2.376	0.80
16_E	41_E	2.366	0.80
250_K	283_R	2.333	0.79
153_E	478_H	2.319	0.79
424_V	500_Y	2.316	0.79
115_T	235_C	2.290	0.78
76_T	81_T	2.277	0.77
88_S	164_R	2.265	0.77
123_R	138_R	2.261	0.77
430_T	439_Q	2.259	0.77
178_Q	182_D	2.233	0.76
432_A	437_T	2.232	0.76
293_M	312_L	2.204	0.75
439_Q	515_S	2.186	0.74
153_E	480_Y	2.169	0.74
122_A	125_V	2.163	0.73
217_E	533_K	2.145	0.73
472_A	512_A	2.087	0.71
123_R	376_D	2.054	0.69
240_V	281_R	2.053	0.69
468_L	471_A	2.038	0.69
276_V	317_R	2.035	0.69
174_K	178_Q	2.009	0.68
75_R	376_D	1.986	0.67
138_R	376_D	1.969	0.66
453_G	479_V	1.945	0.65
399_M	406_C	1.919	0.64
181_N	216_N	1.916	0.64
540_Q	545_V	1.914	0.64
525_G	528_A	1.878	0.62
509_E	547_K	1.854	0.61
427_D	442_S	1.845	0.61
120_A	134_Q	1.837	0.60
228_F	248_A	1.791	0.58
102_G	112_Q	1.772	0.57
430_T	437_T	1.757	0.57
353_A	386_V	1.749	0.56
465_R	542_G	1.747	0.56
314_D	319_K	1.712	0.55
103_G	112_Q	1.683	0.53
171_W	175_R	1.678	0.53
54_L	57_A	1.661	0.52
75_R	123_R	1.658	0.52
175_R	178_Q	1.645	0.52
103_G	116_G	1.644	0.52
260_E	273_Q	1.635	0.51
235_C	243_M	1.632	0.51
521_S	546_S	1.622	0.51
169_Q	242_R	1.609	0.50
84_A	157_M	1.606	0.50
134_Q	172_F	1.599	0.50
285_A	367_Y	1.587	0.49
509_E	538_Y	1.583	0.49
262_V	348_L	1.582	0.49
75_R	138_R	1.581	0.49
157_M	252_E	1.580	0.49
261_R	304_M	1.567	0.48
145_I	386_V	1.557	0.48
153_E	390_N	1.557	0.48
176_A	408_C	1.555	0.48
300_M	308_D	1.549	0.47
99_Y	250_K	1.544	0.47
329_L	374_Q	1.538	0.47
258_T	312_L	1.530	0.46
85_I	134_Q	1.524	0.46
316_E	319_K	1.511	0.46
348_L	353_A	1.503	0.45
98_L	336_T	1.490	0.45
283_R	367_Y	1.488	0.45
154_L	177_L	1.488	0.45
131_P	171_W	1.477	0.44
182_D	212_V	1.467	0.44
231_K	297_Q	1.463	0.43
332_R	337_Y	1.459	0.43
84_A	252_E	1.452	0.43
153_E	308_D	1.448	0.43
240_V	287_F	1.443	0.42
132_Y	182_D	1.443	0.42
80_V	409_I	1.434	0.42
343_G	522_V	1.428	0.42
142_L	391_L	1.420	0.41
278_A	461_N	1.417	0.41
315_D	498_Q	1.410	0.41
302_K	356_L	1.397	0.40
95_G	320_P	1.394	0.40
153_E	243_M	1.388	0.40
105_A	129_Y	1.370	0.39
74_V	441_I	1.364	0.39
427_D	444_E	1.364	0.39
231_K	376_D	1.355	0.39
378_P	525_G	1.351	0.38
287_F	523_I	1.349	0.38
430_T	441_I	1.347	0.38
273_Q	277_D	1.345	0.38
219_G	262_V	1.334	0.38
459_F	517_F	1.333	0.38
477_L	532_Y	1.313	0.37
150_D	224_I	1.307	0.37
83_V	253_V	1.306	0.36
367_Y	429_E	1.298	0.36
83_V	357_V	1.279	0.35
80_V	130_D	1.279	0.35
439_Q	507_R	1.276	0.35
20_R	43_A	1.267	0.35
85_I	231_K	1.262	0.35
286_A	510_H	1.255	0.34
357_V	399_M	1.253	0.34
426_L	443_I	1.238	0.34
250_K	266_M	1.235	0.34
156_L	404_Y	1.229	0.33
465_R	543_P	1.227	0.33
390_N	393_Q	1.224	0.33
164_R	371_Q	1.213	0.33
156_L	173_V	1.202	0.32
180_L	223_N	1.202	0.32
183_F	364_I	1.196	0.32
102_G	116_G	1.183	0.31
263_N	266_M	1.182	0.31
312_L	320_P	1.181	0.31
272_V	318_W	1.179	0.31
241_D	467_E	1.167	0.31
122_A	356_L	1.167	0.31
84_A	115_T	1.164	0.31
341_R	344_D	1.161	0.31
19_S	23_A	1.161	0.31
476_E	480_Y	1.160	0.31
102_G	329_L	1.157	0.30
429_E	444_E	1.156	0.30
48_P	103_G	1.154	0.30
289_V	473_L	1.152	0.30
533_K	539_H	1.147	0.30
248_A	287_F	1.147	0.30
77_A	416_M	1.146	0.30
257_T	334_T	1.143	0.30
429_E	442_S	1.141	0.30
157_M	164_R	1.140	0.30
178_Q	208_Y	1.137	0.30
366_R	426_L	1.136	0.30
519_K	535_Q	1.133	0.29
30_D	474_L	1.126	0.29
306_L	356_L	1.125	0.29
451_L	478_H	1.118	0.29
122_A	253_V	1.112	0.29
293_M	360_I	1.112	0.29
306_L	359_E	1.102	0.28
102_G	374_Q	1.102	0.28
519_K	541_D	1.099	0.28
407_D	449_D	1.096	0.28
74_V	122_A	1.095	0.28
123_R	231_K	1.093	0.28
121_A	162_T	1.092	0.28
181_N	454_F	1.090	0.28
72_K	453_G	1.090	0.28
355_D	398_R	1.080	0.27
414_A	450_L	1.077	0.27
116_G	374_Q	1.076	0.27
530_Q	533_K	1.072	0.27
502_R	505_M	1.067	0.27
171_W	182_D	1.067	0.27
86_M	329_L	1.065	0.27
258_T	275_S	1.064	0.27
99_Y	263_N	1.056	0.27
103_G	329_L	1.052	0.26
359_E	486_V	1.051	0.26
21_I	54_L	1.048	0.26
347_P	384_A	1.048	0.26
134_Q	287_F	1.047	0.26
428_V	515_S	1.042	0.26
352_E	435_G	1.040	0.26
85_I	512_A	1.037	0.26
124_G	297_Q	1.034	0.26
141_Q	329_L	1.031	0.26
510_H	514_D	1.030	0.26
290_G	371_Q	1.029	0.26
115_T	381_F	1.028	0.26
44_A	48_P	1.025	0.26
279_N	434_G	1.022	0.25
259_F	262_V	1.021	0.25
221_L	228_F	1.020	0.25
290_G	322_Y	1.016	0.25
235_C	244_L	1.015	0.25
323_L	328_T	1.015	0.25
318_W	328_T	1.013	0.25
86_M	116_G	1.010	0.25
127_N	137_L	1.008	0.25
297_Q	305_V	1.008	0.25
312_L	528_A	1.006	0.25
138_R	231_K	1.005	0.25
149_V	370_L	1.003	0.25
428_V	437_T	1.002	0.25
306_L	310_R	1.000	0.25
366_R	407_D	0.992	0.24
156_L	466_E	0.991	0.24
210_E	245_D	0.990	0.24
213_I	246_L	0.984	0.24
142_L	426_L	0.981	0.24
109_T	278_A	0.980	0.24
322_Y	371_Q	0.979	0.24
141_Q	465_R	0.975	0.24
153_E	512_A	0.974	0.24
275_S	370_L	0.971	0.24
124_G	351_E	0.968	0.24
361_K	396_R	0.967	0.24
165_S	432_A	0.965	0.23
163_A	540_Q	0.961	0.23
48_P	112_Q	0.960	0.23
258_T	370_L	0.958	0.23
501_G	527_G	0.956	0.23
180_L	221_L	0.955	0.23
250_K	364_I	0.954	0.23
246_L	526_I	0.953	0.23
357_V	502_R	0.951	0.23
320_P	365_P	0.950	0.23
337_Y	383_D	0.948	0.23
531_Y	544_Y	0.946	0.23
455_A	474_L	0.943	0.23
86_M	244_L	0.942	0.23
273_Q	520_L	0.942	0.23
111_S	408_C	0.935	0.22
279_N	283_R	0.935	0.22
472_A	517_F	0.934	0.22
356_L	484_V	0.932	0.22
348_L	377_I	0.931	0.22
127_N	530_Q	0.931	0.22
112_Q	164_R	0.930	0.22
243_M	478_H	0.930	0.22
177_L	414_A	0.928	0.22
451_L	480_Y	0.928	0.22
135_V	154_L	0.926	0.22
103_G	374_Q	0.925	0.22
264_R	335_I	0.923	0.22
286_A	544_Y	0.922	0.22
276_V	315_D	0.919	0.22
103_G	244_L	0.919	0.22
255_V	325_I	0.915	0.22
87_T	219_G	0.913	0.22
303_E	314_D	0.912	0.22
282_L	478_H	0.908	0.22
112_Q	115_T	0.905	0.22
222_R	530_Q	0.903	0.21
433_A	522_V	0.903	0.21
525_G	538_Y	0.899	0.21
112_Q	374_Q	0.898	0.21
259_F	304_M	0.895	0.21
398_R	402_H	0.891	0.21
48_P	102_G	0.886	0.21
154_L	383_D	0.885	0.21
87_T	156_L	0.883	0.21
112_Q	116_G	0.883	0.21
442_S	477_L	0.880	0.21
226_T	471_A	0.877	0.21
116_G	329_L	0.876	0.21
390_N	480_Y	0.876	0.21
260_E	505_M	0.875	0.21
182_D	185_P	0.875	0.21
494_Q	520_L	0.873	0.21
451_L	538_Y	0.872	0.21
470_D	539_H	0.871	0.21
234_W	250_K	0.871	0.21
257_T	336_T	0.869	0.20
390_N	478_H	0.866	0.20
263_N	275_S	0.865	0.20
505_M	540_Q	0.865	0.20
244_L	374_Q	0.864	0.20
124_G	316_E	0.862	0.20
87_T	278_A	0.861	0.20
135_V	320_P	0.859	0.20
40_G	466_E	0.857	0.20
332_R	336_T	0.856	0.20
72_K	373_V	0.854	0.20
451_L	525_G	0.854	0.20
329_L	367_Y	0.851	0.20
216_N	219_G	0.850	0.20
164_R	374_Q	0.849	0.20
52_D	167_D	0.848	0.20
424_V	452_V	0.846	0.20
531_Y	538_Y	0.844	0.20
50_H	57_A	0.842	0.20
396_R	411_C	0.840	0.20
121_A	350_N	0.840	0.20
519_K	546_S	0.839	0.20
24_G	29_D	0.839	0.20
169_Q	382_I	0.838	0.20
154_L	180_L	0.837	0.20
103_G	395_A	0.837	0.20
86_M	161_M	0.836	0.19
172_F	512_A	0.835	0.19
75_R	87_T	0.834	0.19
106_S	257_T	0.833	0.19
39_C	44_A	0.831	0.19
33_D	39_C	0.831	0.19
85_I	156_L	0.831	0.19
95_G	99_Y	0.828	0.19
250_K	322_Y	0.828	0.19
88_S	371_Q	0.827	0.19
115_T	374_Q	0.827	0.19
131_P	175_R	0.826	0.19
506_E	546_S	0.825	0.19
538_Y	545_V	0.824	0.19
30_D	42_Y	0.822	0.19
181_N	219_G	0.822	0.19
231_K	545_V	0.821	0.19
502_R	536_L	0.820	0.19
209_L	213_I	0.820	0.19
143_R	285_A	0.817	0.19
174_K	209_L	0.816	0.19
225_G	243_M	0.815	0.19
112_Q	373_V	0.813	0.19
52_D	98_L	0.813	0.19
353_A	389_S	0.809	0.19
221_L	226_T	0.809	0.19
425_S	510_H	0.807	0.19
84_A	141_Q	0.806	0.19
163_A	383_D	0.804	0.19
174_K	240_V	0.803	0.19
186_D	486_V	0.802	0.19
241_D	244_L	0.800	0.18
61_R	260_E	0.799	0.18
124_G	353_A	0.799	0.18
396_R	408_C	0.799	0.18
260_E	264_R	0.797	0.18
468_L	473_L	0.796	0.18
139_L	364_I	0.796	0.18
102_G	328_T	0.792	0.18
51_S	286_A	0.791	0.18
116_G	244_L	0.788	0.18
142_L	225_G	0.787	0.18
94_H	112_Q	0.787	0.18
260_E	328_T	0.786	0.18
83_V	316_E	0.786	0.18
141_Q	386_V	0.785	0.18
84_A	353_A	0.783	0.18
177_L	226_T	0.781	0.18
251_V	285_A	0.780	0.18
117_H	122_A	0.776	0.18
180_L	483_E	0.776	0.18
231_K	304_M	0.774	0.18
50_H	54_L	0.773	0.18
383_D	444_E	0.773	0.18
244_L	415_G	0.773	0.18
103_G	106_S	0.772	0.18
367_Y	414_A	0.772	0.18
15_E	61_R	0.768	0.18
85_I	345_F	0.768	0.18
262_V	304_M	0.768	0.18
278_A	408_C	0.765	0.18
87_T	181_N	0.763	0.17
238_E	502_R	0.759	0.17
35_K	502_R	0.757	0.17
359_E	402_H	0.756	0.17
246_L	278_A	0.755	0.17
130_D	357_V	0.754	0.17
227_T	525_G	0.753	0.17
499_G	523_I	0.752	0.17
39_C	238_E	0.750	0.17
245_D	446_F	0.748	0.17
313_F	365_P	0.747	0.17
43_A	57_A	0.747	0.17
370_L	392_R	0.745	0.17
250_K	517_F	0.743	0.17
231_K	261_R	0.743	0.17
451_L	473_L	0.742	0.17
541_D	548_R	0.742	0.17
348_L	354_A	0.742	0.17
386_V	389_S	0.740	0.17
127_N	251_V	0.740	0.17
81_T	483_E	0.739	0.17
397_Q	401_E	0.739	0.17
16_E	21_I	0.737	0.17
296_G	322_Y	0.736	0.17
76_T	152_V	0.735	0.17
332_R	388_K	0.735	0.17
250_K	290_G	0.734	0.17
111_S	305_V	0.731	0.17
163_A	386_V	0.730	0.17
297_Q	532_Y	0.729	0.17
221_L	500_Y	0.726	0.17
399_M	402_H	0.724	0.16
453_G	477_L	0.724	0.16
520_L	536_L	0.723	0.16
91_T	231_K	0.722	0.16
278_A	411_C	0.722	0.16
298_P	392_R	0.722	0.16
75_R	231_K	0.721	0.16
32_E	257_T	0.719	0.16
283_R	516_G	0.719	0.16
431_Y	440_F	0.719	0.16
183_F	285_A	0.719	0.16
35_K	351_E	0.718	0.16
279_N	515_S	0.716	0.16
17_L	69_L	0.715	0.16
76_T	142_L	0.714	0.16
440_F	479_V	0.713	0.16
84_A	164_R	0.711	0.16
33_D	37_D	0.709	0.16
155_I	318_W	0.709	0.16
178_Q	323_L	0.708	0.16
330_V	415_G	0.708	0.16
80_V	521_S	0.705	0.16
356_L	378_P	0.704	0.16
127_N	451_L	0.702	0.16
115_T	212_V	0.702	0.16
73_P	224_I	0.702	0.16
40_G	136_T	0.701	0.16
132_Y	414_A	0.701	0.16
17_L	21_I	0.697	0.16
334_T	337_Y	0.697	0.16
349_H	526_I	0.697	0.16
102_G	164_R	0.696	0.16
124_G	164_R	0.695	0.16
18_V	57_A	0.690	0.16
142_L	295_P	0.690	0.16
415_G	435_G	0.686	0.16
357_V	492_D	0.685	0.15
258_T	304_M	0.685	0.15
285_A	500_Y	0.683	0.15
439_Q	459_F	0.680	0.15
364_I	406_C	0.679	0.15
244_L	465_R	0.679	0.15
17_L	42_Y	0.678	0.15
94_H	374_Q	0.677	0.15
252_E	374_Q	0.675	0.15
221_L	370_L	0.674	0.15
82_P	367_Y	0.674	0.15
102_G	252_E	0.674	0.15
282_L	472_A	0.673	0.15
117_H	381_F	0.673	0.15
86_M	157_M	0.671	0.15
459_F	473_L	0.670	0.15
379_A	382_I	0.669	0.15
86_M	141_Q	0.669	0.15
182_D	211_D	0.668	0.15
455_A	505_M	0.667	0.15
250_K	459_F	0.666	0.15
366_R	427_D	0.665	0.15
267_H	290_G	0.662	0.15
80_V	209_L	0.662	0.15
226_T	248_A	0.661	0.15
483_E	528_A	0.661	0.15
209_L	219_G	0.661	0.15
279_N	290_G	0.660	0.15
115_T	543_P	0.659	0.15
491_G	506_E	0.658	0.15
227_T	458_R	0.657	0.15
307_E	470_D	0.655	0.15
73_P	103_G	0.653	0.15
87_T	263_N	0.653	0.15
226_T	428_V	0.652	0.15
366_R	373_V	0.652	0.15
269_G	330_V	0.652	0.15
27_G	30_D	0.651	0.15
122_A	126_Q	0.650	0.15
497_H	501_G	0.650	0.15
496_Q	501_G	0.650	0.15
468_L	486_V	0.649	0.15
239_Q	243_M	0.649	0.15
520_L	524_S	0.647	0.15
295_P	361_K	0.646	0.15
17_L	421_P	0.645	0.15
461_N	468_L	0.644	0.15
251_V	278_A	0.644	0.15
217_E	222_R	0.643	0.15
226_T	231_K	0.643	0.15
284_D	325_I	0.642	0.14
42_Y	49_K	0.642	0.14
390_N	532_Y	0.642	0.14
339_M	344_D	0.641	0.14
356_L	402_H	0.640	0.14
182_D	364_I	0.638	0.14
87_T	376_D	0.637	0.14
298_P	339_M	0.637	0.14
306_L	511_L	0.637	0.14
538_Y	547_K	0.637	0.14
98_L	339_M	0.636	0.14
265_E	299_G	0.635	0.14
269_G	415_G	0.635	0.14
81_T	142_L	0.634	0.14
123_R	378_P	0.631	0.14
331_V	337_Y	0.631	0.14
98_L	178_Q	0.630	0.14
115_T	252_E	0.629	0.14
276_V	307_E	0.629	0.14
224_I	525_G	0.629	0.14
174_K	248_A	0.629	0.14
34_A	224_I	0.629	0.14
333_D	486_V	0.629	0.14
35_K	318_W	0.628	0.14
57_A	218_H	0.628	0.14
225_G	426_L	0.628	0.14
118_E	454_F	0.628	0.14
143_R	150_D	0.627	0.14
397_Q	400_A	0.627	0.14
112_Q	329_L	0.626	0.14
116_G	141_Q	0.626	0.14
473_L	486_V	0.625	0.14
153_E	235_C	0.625	0.14
142_L	145_I	0.625	0.14
441_I	459_F	0.625	0.14
110_S	129_Y	0.625	0.14
28_K	165_S	0.625	0.14
141_Q	467_E	0.624	0.14
115_T	244_L	0.624	0.14
228_F	354_A	0.624	0.14
497_H	508_A	0.624	0.14
496_Q	508_A	0.624	0.14
358_A	402_H	0.623	0.14
335_I	342_N	0.623	0.14
231_K	335_I	0.623	0.14
155_I	365_P	0.623	0.14
88_S	145_I	0.622	0.14
291_F	370_L	0.622	0.14
34_A	37_D	0.621	0.14
426_L	441_I	0.620	0.14
154_L	516_G	0.620	0.14
143_R	149_V	0.620	0.14
313_F	406_C	0.619	0.14
110_S	121_A	0.619	0.14
111_S	361_K	0.618	0.14
497_H	504_L	0.618	0.14
496_Q	504_L	0.618	0.14
86_M	89_P	0.618	0.14
165_S	300_M	0.618	0.14
112_Q	381_F	0.618	0.14
139_L	320_P	0.617	0.14
82_P	262_V	0.616	0.14
225_G	499_G	0.616	0.14
102_G	141_Q	0.615	0.14
266_M	298_P	0.614	0.14
103_G	141_Q	0.614	0.14
98_L	266_M	0.613	0.14
76_T	93_P	0.613	0.14
242_R	451_L	0.612	0.14
307_E	310_R	0.612	0.14
73_P	239_Q	0.610	0.14
88_S	441_I	0.609	0.14
458_R	538_Y	0.609	0.14
278_A	282_L	0.608	0.14
136_T	140_H	0.607	0.14
452_V	500_Y	0.606	0.14
138_R	378_P	0.605	0.14
282_L	312_L	0.605	0.14
70_Q	237_P	0.604	0.14
26_V	31_I	0.603	0.14
110_S	328_T	0.603	0.14
494_Q	505_M	0.603	0.14
278_A	422_E	0.602	0.14
46_K	54_L	0.601	0.14
176_A	411_C	0.600	0.14
51_S	57_A	0.600	0.14
308_D	373_V	0.599	0.14
56_V	129_Y	0.598	0.14
293_M	323_L	0.598	0.14
141_Q	157_M	0.597	0.13
175_R	373_V	0.596	0.13
30_D	45_S	0.595	0.13
157_M	374_Q	0.595	0.13
314_D	398_R	0.594	0.13
115_T	329_L	0.593	0.13
31_I	224_I	0.593	0.13
120_A	150_D	0.592	0.13
287_F	396_R	0.591	0.13
325_I	419_D	0.591	0.13
134_Q	150_D	0.590	0.13
527_G	531_Y	0.590	0.13
119_P	376_D	0.590	0.13
319_K	540_Q	0.589	0.13
67_D	152_V	0.586	0.13
493_D	506_E	0.586	0.13
244_L	252_E	0.584	0.13
135_V	139_L	0.584	0.13
168_Y	172_F	0.583	0.13
338_D	511_L	0.583	0.13
441_I	507_R	0.582	0.13
284_D	461_N	0.581	0.13
338_D	354_A	0.581	0.13
46_K	59_D	0.581	0.13
250_K	391_L	0.580	0.13
35_K	45_S	0.578	0.13
84_A	386_V	0.577	0.13
139_L	301_S	0.576	0.13
82_P	98_L	0.572	0.13
443_I	549_L	0.572	0.13
464_A	468_L	0.572	0.13
179_A	478_H	0.570	0.13
37_D	47_V	0.569	0.13
112_Q	117_H	0.566	0.13
17_L	25_D	0.566	0.13
511_L	515_S	0.565	0.13
112_Q	157_M	0.565	0.13
222_R	246_L	0.565	0.13
527_G	537_G	0.564	0.13
414_A	535_Q	0.564	0.13
403_G	417_N	0.564	0.13
396_R	441_I	0.564	0.13
111_S	216_N	0.563	0.13
16_E	549_L	0.562	0.13
318_W	365_P	0.562	0.13
124_G	175_R	0.562	0.13
240_V	269_G	0.561	0.13
36_L	40_G	0.561	0.13
169_Q	487_G	0.558	0.13
355_D	443_I	0.558	0.13
237_P	520_L	0.558	0.13
322_Y	454_F	0.557	0.13
379_A	523_I	0.557	0.13
297_Q	390_N	0.557	0.13
110_S	329_L	0.556	0.13
87_T	382_I	0.556	0.13
120_A	416_M	0.556	0.13
489_D	522_V	0.556	0.13
236_D	274_A	0.556	0.13
403_G	502_R	0.555	0.13
102_G	106_S	0.554	0.13
523_I	529_R	0.554	0.13
510_H	519_K	0.551	0.13
367_Y	479_V	0.551	0.13
290_G	370_L	0.550	0.13
358_A	397_Q	0.550	0.13
540_Q	546_S	0.549	0.12
346_E	384_A	0.547	0.12
76_T	406_C	0.547	0.12
28_K	354_A	0.545	0.12
500_Y	526_I	0.545	0.12
262_V	359_E	0.545	0.12
328_T	451_L	0.544	0.12
73_P	365_P	0.544	0.12
84_A	161_M	0.544	0.12
53_L	367_Y	0.543	0.12
176_A	361_K	0.541	0.12
74_V	389_S	0.541	0.12
516_G	521_S	0.540	0.12
275_S	313_F	0.540	0.12
349_H	461_N	0.539	0.12
183_F	325_I	0.539	0.12
103_G	298_P	0.538	0.12
284_D	473_L	0.537	0.12
305_V	336_T	0.537	0.12
234_W	533_K	0.536	0.12
273_Q	447_Q	0.536	0.12
88_S	454_F	0.536	0.12
360_I	451_L	0.536	0.12
417_N	470_D	0.535	0.12
95_G	169_Q	0.535	0.12
181_N	263_N	0.533	0.12
234_W	262_V	0.532	0.12
487_G	549_L	0.532	0.12
331_V	383_D	0.532	0.12
15_E	21_I	0.531	0.12
301_S	304_M	0.531	0.12
343_G	403_G	0.531	0.12
104_P	477_L	0.530	0.12
463_P	474_L	0.530	0.12
173_V	338_D	0.529	0.12
28_K	32_E	0.529	0.12
26_V	34_A	0.529	0.12
27_G	432_A	0.529	0.12
183_F	443_I	0.529	0.12
364_I	367_Y	0.529	0.12
102_G	110_S	0.529	0.12
16_E	22_L	0.528	0.12
217_E	351_E	0.527	0.12
451_L	528_A	0.527	0.12
82_P	142_L	0.527	0.12
283_R	312_L	0.527	0.12
466_E	492_D	0.526	0.12
338_D	344_D	0.524	0.12
237_P	485_S	0.524	0.12
58_P	62_R	0.524	0.12
261_R	346_E	0.524	0.12
446_F	526_I	0.523	0.12
161_M	164_R	0.523	0.12
84_A	374_Q	0.522	0.12
119_P	168_Y	0.520	0.12
50_H	61_R	0.520	0.12
258_T	308_D	0.519	0.12
412_R	442_S	0.519	0.12
103_G	164_R	0.519	0.12
80_V	251_V	0.518	0.12
213_I	526_I	0.518	0.12
155_I	524_S	0.518	0.12
177_L	180_L	0.518	0.12
20_R	28_K	0.517	0.12
231_K	267_H	0.516	0.12
429_E	520_L	0.516	0.12
458_R	509_E	0.515	0.12
486_V	494_Q	0.514	0.12
28_K	447_Q	0.514	0.12
86_M	415_G	0.514	0.12
398_R	474_L	0.513	0.12
48_P	116_G	0.513	0.12
501_G	508_A	0.512	0.12
87_T	138_R	0.512	0.12
331_V	455_A	0.511	0.12
46_K	50_H	0.511	0.12
399_M	505_M	0.511	0.12
129_Y	532_Y	0.511	0.12
428_V	510_H	0.510	0.12
164_R	389_S	0.510	0.12
452_V	495_H	0.509	0.12
90_H	165_S	0.508	0.12
446_F	512_A	0.508	0.12
180_L	365_P	0.508	0.12
351_E	464_A	0.507	0.12
83_V	223_N	0.507	0.12
49_K	55_D	0.507	0.12
392_R	396_R	0.506	0.12
129_Y	323_L	0.506	0.12
248_A	348_L	0.506	0.12
52_D	258_T	0.506	0.12
500_Y	543_P	0.506	0.12
501_G	504_L	0.505	0.12
145_I	285_A	0.505	0.12
86_M	333_D	0.505	0.12
169_Q	408_C	0.504	0.12
263_N	345_F	0.504	0.12
38_V	42_Y	0.503	0.12
426_L	511_L	0.502	0.12
285_A	467_E	0.502	0.12
31_I	225_G	0.502	0.12
65_L	350_N	0.502	0.12
31_I	483_E	0.501	0.12
257_T	478_H	0.501	0.12
250_K	434_G	0.501	0.12
310_R	363_M	0.501	0.12
179_A	210_E	0.501	0.12
219_G	515_S	0.500	0.12
143_R	183_F	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4fhdA	1	0.5519	99.9	0.907	Contact Map
1oltA	1	0.7086	99.8	0.915	Contact Map
4wcxA	1	0.7359	99.8	0.917	Contact Map
4rtbA	2	0.6521	99.8	0.918	Contact Map
4jc0A	1	0.6667	99.7	0.928	Contact Map
2qgqA	1	0.4845	99.7	0.929	Contact Map
3iixA	1	0.5938	99.7	0.93	Contact Map
1r30A	2	0.5446	99.6	0.931	Contact Map
3t7vA	1	0.5592	99.6	0.933	Contact Map
4r33A	2	0.6211	99.6	0.935	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0137 seconds.