Q9HPP7 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPP7 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HPP7	Sequences: MNPAFTPTTSPTGLRVHDRIENAQFELYTESRVAPTPIATGSGHGLSRQPDAEAWHTSSDAGFALPVDSAVAFDTTRITLPALVDVFVWQPDRTLVGKTTNQESATYPEQGAYALDVDIGSMKLQLAVTDPFEIHRTDDSTVISFDATATVRLGARSLHTAPEATITITDDVRDGMRAVSLFGSALKTTTPERSFPTLRGHPPLVERGDAFDAPATLDAPDTGIAIEIPPDWGDLYRVSTLAYYLGATVQPGAQRALVLDGVRYPFPSASGFGDAVQALLEHVFLLDCVVRTEGLYSVSMHERTAIEPTLGIDLSAAYDAPPAERLAAYLGVPFAVTEPHGPQWPVTADIAPDPGRIAALPFVVDGLANIRVHDAQPDTASDAGHGAEAVSSFLRSRSQPDRDQPRVAADADDVVVPPDTESIEHVWLADGVPVGANKATAADYQARLACDAPASDPIRVVVVCNDPSMDAEDCVSAVYGMRDFFEFDISVRHELSTSELATVLESTVDFLHYIGHTDATGFQCVDGRLDARDLDTTGVRAFLLNSCQSHAQGRALVDRGSQGGIVTVSDIDNDAAVRVGHAIARLLNDGFSLLAGLSVARNVTAFGNQYVTVGDGSAQVVQSRSGMPLLIELAATDADYELSLVGYPTANTPLGSLITPYVPGNDTPYLNAGHIDTFSVATEDVRSFFDQGVFPVLYDGTLTWSDKLTIEETG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	714 (640)
Sequences:	136 (110)
Seq/√Len:	4.4

HALSA - Q9HPP7 Q9HMF6 Q9HPY6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
228_I	238_V	5.920	0.98
169_T	174_D	4.632	0.93
348_A	368_A	3.722	0.81
334_F	561_S	3.416	0.75
129_T	133_E	3.370	0.74
226_I	238_V	3.287	0.72
170_D	207_R	3.200	0.70
495_L	503_V	2.943	0.63
430_D	440_T	2.908	0.62
224_I	322_P	2.887	0.61
362_F	445_Q	2.880	0.61
175_G	232_W	2.850	0.60
191_P	325_R	2.800	0.59
167_T	208_G	2.781	0.58
504_L	592_S	2.757	0.58
228_I	325_R	2.721	0.57
166_I	181_L	2.718	0.57
237_R	240_T	2.703	0.56
465_N	472_E	2.663	0.55
81_P	705_S	2.662	0.55
115_L	135_H	2.656	0.55
171_D	174_D	2.622	0.54
238_V	257_L	2.489	0.50
228_I	272_F	2.476	0.49
469_M	472_E	2.461	0.49
332_V	702_L	2.391	0.47
234_D	237_R	2.361	0.46
530_D	552_Q	2.296	0.44
326_L	699_D	2.284	0.43
415_V	433_P	2.270	0.43
204_L	362_F	2.255	0.43
278_A	460_V	2.220	0.42
547_C	580_G	2.191	0.41
66_P	200_G	2.190	0.41
563_G	593_L	2.188	0.41
351_A	557_V	2.143	0.39
392_S	703_T	2.140	0.39
613_V	689_F	2.118	0.39
516_H	580_G	2.094	0.38
357_I	374_D	2.094	0.38
516_H	547_C	2.090	0.38
169_T	289_V	2.086	0.38
516_H	610_Y	2.083	0.38
151_V	261_G	2.081	0.38
253_A	319_D	2.048	0.37
649_T	702_L	2.024	0.36
516_H	545_N	2.022	0.36
123_K	156_R	2.017	0.36
248_T	557_V	2.006	0.35
240_T	261_G	1.995	0.35
166_I	331_G	1.987	0.35
123_K	197_T	1.987	0.35
328_A	557_V	1.982	0.35
544_L	556_L	1.981	0.35
198_L	573_N	1.963	0.34
169_T	310_L	1.939	0.34
171_D	192_E	1.937	0.34
545_N	549_S	1.931	0.33
438_K	550_H	1.921	0.33
516_H	549_S	1.918	0.33
545_N	576_A	1.917	0.33
479_Y	515_G	1.915	0.33
108_P	194_S	1.907	0.33
66_P	162_P	1.896	0.32
472_E	547_C	1.894	0.32
545_N	580_G	1.875	0.32
124_L	252_G	1.868	0.32
465_N	469_M	1.862	0.32
134_I	665_N	1.854	0.31
292_T	303_R	1.852	0.31
547_C	567_T	1.840	0.31
63_F	236_Y	1.821	0.31
201_H	362_F	1.818	0.30
465_N	547_C	1.811	0.30
226_I	563_G	1.802	0.30
183_G	364_V	1.802	0.30
465_N	516_H	1.802	0.30
516_H	576_A	1.798	0.30
275_A	325_R	1.798	0.30
345_P	422_S	1.789	0.30
465_N	580_G	1.783	0.30
242_A	700_G	1.776	0.29
294_G	318_Y	1.762	0.29
479_Y	512_H	1.759	0.29
146_D	332_V	1.753	0.29
478_V	572_D	1.753	0.29
147_A	236_Y	1.748	0.29
561_S	583_I	1.736	0.28
318_Y	622_Q	1.732	0.28
415_V	535_D	1.723	0.28
125_Q	573_N	1.709	0.28
127_A	518_D	1.702	0.28
549_S	580_G	1.689	0.27
479_Y	564_G	1.677	0.27
549_S	610_Y	1.671	0.27
547_C	576_A	1.668	0.27
228_I	249_V	1.667	0.27
164_A	191_P	1.666	0.27
159_H	200_G	1.662	0.27
175_G	182_F	1.653	0.26
217_L	372_V	1.652	0.26
266_F	310_L	1.650	0.26
222_T	246_G	1.649	0.26
363_V	441_A	1.643	0.26
549_S	576_A	1.643	0.26
544_L	561_S	1.631	0.26
278_A	307_E	1.630	0.26
547_C	610_Y	1.627	0.26
176_M	251_P	1.624	0.26
180_S	509_D	1.622	0.26
290_V	325_R	1.611	0.25
565_I	603_V	1.607	0.25
465_N	549_S	1.603	0.25
545_N	610_Y	1.600	0.25
83_L	120_G	1.593	0.25
512_H	515_G	1.582	0.25
63_F	220_P	1.579	0.25
438_K	488_D	1.578	0.25
179_V	239_S	1.572	0.25
78_I	519_A	1.565	0.24
189_T	439_A	1.548	0.24
120_G	430_D	1.542	0.24
191_P	208_G	1.537	0.24
228_I	257_L	1.535	0.24
335_A	498_S	1.535	0.24
159_H	163_E	1.532	0.24
491_V	708_L	1.522	0.23
115_L	326_L	1.521	0.23
271_G	324_E	1.514	0.23
465_N	545_N	1.508	0.23
204_L	257_L	1.505	0.23
194_S	705_S	1.494	0.23
94_T	221_D	1.490	0.23
194_S	244_Y	1.488	0.23
180_S	189_T	1.487	0.23
580_G	610_Y	1.481	0.23
113_Y	243_Y	1.481	0.23
393_F	469_M	1.475	0.22
576_A	580_G	1.473	0.22
328_A	678_F	1.473	0.22
322_P	599_V	1.472	0.22
68_D	153_L	1.459	0.22
436_A	591_F	1.458	0.22
600_A	700_G	1.455	0.22
288_C	545_N	1.449	0.22
182_F	228_I	1.447	0.22
288_C	549_S	1.446	0.22
472_E	545_N	1.446	0.22
349_D	446_A	1.437	0.22
306_I	596_G	1.430	0.21
166_I	339_P	1.426	0.21
127_A	255_R	1.423	0.21
515_G	564_G	1.422	0.21
205_V	231_D	1.417	0.21
472_E	549_S	1.406	0.21
148_T	323_A	1.406	0.21
546_S	556_L	1.405	0.21
245_L	500_L	1.404	0.21
164_A	338_E	1.398	0.21
542_F	545_N	1.394	0.21
512_H	564_G	1.393	0.21
576_A	610_Y	1.392	0.21
259_L	327_A	1.391	0.21
642_L	688_F	1.390	0.21
159_H	187_K	1.385	0.21
140_S	166_I	1.379	0.20
176_M	363_V	1.374	0.20
462_V	510_F	1.373	0.20
115_L	690_D	1.353	0.20
542_F	547_C	1.351	0.20
465_N	610_Y	1.348	0.20
350_I	373_H	1.348	0.20
130_D	557_V	1.344	0.20
472_E	516_H	1.335	0.20
634_A	643_S	1.335	0.20
175_G	228_I	1.333	0.20
310_L	491_V	1.330	0.19
548_Q	565_I	1.310	0.19
538_G	541_A	1.309	0.19
479_Y	524_C	1.304	0.19
472_E	580_G	1.303	0.19
231_D	234_D	1.301	0.19
370_I	504_L	1.298	0.19
504_L	698_Y	1.297	0.19
516_H	542_F	1.293	0.19
545_N	584_A	1.290	0.19
545_N	567_T	1.288	0.19
417_P	433_P	1.287	0.19
272_F	511_L	1.285	0.19
469_M	516_H	1.281	0.19
195_F	237_R	1.279	0.19
498_S	501_A	1.278	0.19
111_G	613_V	1.277	0.19
282_H	557_V	1.275	0.18
159_H	198_L	1.275	0.18
201_H	573_N	1.273	0.18
315_S	700_G	1.269	0.18
182_F	259_L	1.265	0.18
66_P	156_R	1.265	0.18
149_A	253_A	1.264	0.18
105_A	185_A	1.256	0.18
182_F	295_L	1.252	0.18
221_D	299_S	1.248	0.18
201_H	647_Y	1.243	0.18
480_G	487_F	1.238	0.18
182_F	205_V	1.235	0.18
243_Y	462_V	1.226	0.18
504_L	630_L	1.225	0.18
65_L	121_S	1.224	0.18
156_R	197_T	1.218	0.17
549_S	584_A	1.218	0.17
129_T	707_K	1.217	0.17
228_I	248_T	1.215	0.17
107_Y	236_Y	1.214	0.17
480_G	563_G	1.212	0.17
197_T	358_A	1.205	0.17
226_I	644_L	1.203	0.17
63_F	435_G	1.203	0.17
315_S	504_L	1.203	0.17
201_H	591_F	1.200	0.17
291_R	553_G	1.196	0.17
547_C	550_H	1.192	0.17
350_I	448_L	1.186	0.17
542_F	584_A	1.186	0.17
465_N	550_H	1.182	0.17
143_I	319_D	1.181	0.17
489_I	596_G	1.179	0.17
288_C	469_M	1.178	0.17
393_F	465_N	1.174	0.17
334_F	559_R	1.171	0.17
337_T	341_G	1.170	0.17
182_F	457_P	1.168	0.17
263_R	377_P	1.167	0.17
71_V	456_D	1.166	0.17
288_C	516_H	1.163	0.17
358_A	504_L	1.162	0.16
166_I	170_D	1.159	0.16
229_P	529_L	1.158	0.16
512_H	580_G	1.157	0.16
167_T	311_G	1.152	0.16
311_G	462_V	1.150	0.16
229_P	524_C	1.149	0.16
256_A	279_L	1.149	0.16
444_Y	496_S	1.148	0.16
168_I	227_E	1.145	0.16
146_D	166_I	1.141	0.16
131_P	263_R	1.140	0.16
282_H	638_A	1.140	0.16
70_A	88_V	1.139	0.16
471_A	600_A	1.139	0.16
469_M	545_N	1.138	0.16
282_H	581_H	1.136	0.16
472_E	542_F	1.127	0.16
352_P	557_V	1.126	0.16
122_M	601_R	1.126	0.16
489_I	592_S	1.126	0.16
556_L	561_S	1.125	0.16
217_L	226_I	1.122	0.16
512_H	524_C	1.121	0.16
549_S	573_N	1.118	0.16
148_T	599_V	1.117	0.16
542_F	549_S	1.117	0.16
515_G	524_C	1.115	0.16
348_A	532_R	1.114	0.16
143_I	338_E	1.113	0.16
166_I	520_T	1.113	0.16
497_T	525_V	1.112	0.16
469_M	547_C	1.110	0.16
217_L	228_I	1.109	0.16
123_K	338_E	1.108	0.16
78_I	92_D	1.105	0.16
150_T	391_S	1.104	0.16
347_T	350_I	1.102	0.16
550_H	702_L	1.102	0.16
157_S	180_S	1.101	0.16
469_M	573_N	1.101	0.16
562_Q	575_A	1.096	0.15
149_A	685_V	1.094	0.15
430_D	577_V	1.091	0.15
288_C	547_C	1.090	0.15
446_A	577_V	1.088	0.15
345_P	368_A	1.088	0.15
215_A	689_F	1.084	0.15
174_D	182_F	1.084	0.15
347_T	422_S	1.082	0.15
133_E	504_L	1.080	0.15
201_H	495_L	1.079	0.15
446_A	485_F	1.077	0.15
81_P	475_V	1.077	0.15
195_F	517_T	1.075	0.15
483_D	665_N	1.074	0.15
370_I	597_L	1.073	0.15
356_R	634_A	1.073	0.15
516_H	567_T	1.072	0.15
455_S	621_V	1.072	0.15
257_L	299_S	1.069	0.15
263_R	326_L	1.068	0.15
443_D	485_F	1.066	0.15
239_S	500_L	1.064	0.15
475_V	566_V	1.064	0.15
75_T	582_A	1.063	0.15
290_V	314_L	1.061	0.15
288_C	472_E	1.060	0.15
472_E	610_Y	1.060	0.15
469_M	576_A	1.057	0.15
68_D	370_I	1.056	0.15
209_D	582_A	1.054	0.15
231_D	321_P	1.054	0.15
261_G	457_P	1.050	0.15
157_S	182_F	1.050	0.15
483_D	514_I	1.047	0.15
168_I	561_S	1.040	0.15
262_V	325_R	1.037	0.15
133_E	175_G	1.036	0.14
521_G	556_L	1.036	0.14
66_P	300_M	1.035	0.14
417_P	444_Y	1.035	0.14
123_K	194_S	1.031	0.14
182_F	418_P	1.031	0.14
70_A	132_F	1.031	0.14
186_L	487_F	1.026	0.14
469_M	580_G	1.026	0.14
149_A	219_A	1.026	0.14
208_G	257_L	1.025	0.14
584_A	610_Y	1.025	0.14
175_G	489_I	1.025	0.14
353_D	539_V	1.025	0.14
164_A	332_V	1.024	0.14
129_T	224_I	1.023	0.14
297_S	511_L	1.021	0.14
549_S	567_T	1.018	0.14
498_S	606_F	1.018	0.14
89_W	116_D	1.016	0.14
221_D	234_D	1.016	0.14
274_D	370_I	1.015	0.14
68_D	166_I	1.014	0.14
681_A	684_D	1.010	0.14
97_G	504_L	1.008	0.14
665_N	707_K	1.007	0.14
471_A	546_S	1.006	0.14
465_N	576_A	1.006	0.14
280_L	590_G	1.004	0.14
240_T	443_D	1.003	0.14
75_T	248_T	1.001	0.14
346_V	550_H	0.998	0.14
564_G	610_Y	0.998	0.14
66_P	294_G	0.998	0.14
323_A	695_P	0.994	0.14
120_G	557_V	0.994	0.14
621_V	625_S	0.992	0.14
296_Y	518_D	0.992	0.14
524_C	544_L	0.991	0.14
179_V	505_E	0.988	0.14
462_V	475_V	0.988	0.14
592_S	625_S	0.987	0.14
469_M	549_S	0.987	0.14
438_K	472_E	0.987	0.14
77_R	107_Y	0.986	0.14
573_N	580_G	0.981	0.14
347_T	371_R	0.981	0.14
188_T	200_G	0.980	0.14
288_C	576_A	0.980	0.14
220_P	246_G	0.980	0.14
442_A	555_A	0.978	0.14
421_E	436_A	0.976	0.14
278_A	703_T	0.974	0.14
585_R	683_E	0.973	0.14
545_N	564_G	0.970	0.14
417_P	438_K	0.970	0.14
144_S	166_I	0.968	0.14
267_P	368_A	0.965	0.13
542_F	610_Y	0.964	0.13
490_S	663_P	0.963	0.13
542_F	564_G	0.960	0.13
345_P	620_V	0.958	0.13
89_W	161_A	0.958	0.13
259_L	707_K	0.958	0.13
286_L	360_L	0.957	0.13
172_V	443_D	0.956	0.13
438_K	465_N	0.955	0.13
240_T	306_I	0.953	0.13
177_R	211_F	0.953	0.13
426_V	537_T	0.950	0.13
427_W	547_C	0.950	0.13
393_F	472_E	0.949	0.13
210_A	683_E	0.948	0.13
167_T	170_D	0.947	0.13
94_T	679_S	0.946	0.13
180_S	184_S	0.942	0.13
100_T	446_A	0.942	0.13
469_M	610_Y	0.941	0.13
149_A	665_N	0.941	0.13
514_I	542_F	0.941	0.13
156_R	292_T	0.940	0.13
660_P	696_V	0.940	0.13
438_K	469_M	0.939	0.13
127_A	325_R	0.938	0.13
381_S	534_L	0.937	0.13
116_D	461_V	0.937	0.13
446_A	486_E	0.937	0.13
125_Q	458_I	0.934	0.13
418_P	620_V	0.933	0.13
362_F	573_N	0.931	0.13
480_G	588_N	0.929	0.13
144_S	644_L	0.927	0.13
222_T	488_D	0.926	0.13
200_G	285_L	0.925	0.13
273_G	372_V	0.924	0.13
244_Y	566_V	0.921	0.13
175_G	499_E	0.920	0.13
395_R	465_N	0.919	0.13
266_F	628_P	0.917	0.13
208_G	444_Y	0.916	0.13
547_C	584_A	0.915	0.13
288_C	580_G	0.914	0.13
524_C	564_G	0.913	0.13
70_A	244_Y	0.912	0.13
549_S	564_G	0.909	0.13
211_F	323_A	0.909	0.13
305_A	340_H	0.909	0.13
649_T	656_S	0.907	0.13
472_E	576_A	0.906	0.13
472_E	550_H	0.905	0.13
234_D	240_T	0.903	0.13
68_D	75_T	0.903	0.13
236_Y	598_S	0.902	0.13
125_Q	197_T	0.902	0.13
110_Q	170_D	0.902	0.13
120_G	274_D	0.901	0.13
201_H	469_M	0.901	0.13
187_K	587_L	0.900	0.13
205_V	520_T	0.899	0.13
573_N	577_V	0.897	0.13
515_G	545_N	0.895	0.13
516_H	564_G	0.894	0.12
173_R	635_A	0.893	0.12
165_T	294_G	0.892	0.12
435_G	476_S	0.891	0.12
580_G	584_A	0.890	0.12
145_F	245_L	0.890	0.12
267_P	279_L	0.887	0.12
472_E	573_N	0.887	0.12
164_A	445_Q	0.886	0.12
422_S	437_N	0.882	0.12
368_A	504_L	0.880	0.12
264_Y	413_D	0.878	0.12
483_D	644_L	0.878	0.12
221_D	255_R	0.876	0.12
521_G	544_L	0.875	0.12
567_T	610_Y	0.874	0.12
78_I	107_Y	0.872	0.12
118_D	459_R	0.872	0.12
496_S	568_V	0.870	0.12
77_R	192_E	0.869	0.12
145_F	696_V	0.869	0.12
318_Y	567_T	0.868	0.12
93_R	303_R	0.866	0.12
115_L	190_T	0.865	0.12
559_R	669_Y	0.865	0.12
78_I	494_E	0.865	0.12
134_I	335_A	0.865	0.12
463_V	564_G	0.864	0.12
249_V	685_V	0.863	0.12
517_T	581_H	0.859	0.12
571_I	576_A	0.859	0.12
185_A	489_I	0.855	0.12
179_V	256_A	0.855	0.12
145_F	708_L	0.853	0.12
303_R	307_E	0.852	0.12
272_F	376_Q	0.852	0.12
334_F	460_V	0.852	0.12
427_W	545_N	0.848	0.12
488_D	548_Q	0.848	0.12
640_Y	662_V	0.847	0.12
288_C	610_Y	0.847	0.12
260_D	620_V	0.846	0.12
201_H	229_P	0.846	0.12
114_A	359_A	0.845	0.12
166_I	310_L	0.844	0.12
517_T	572_D	0.844	0.12
220_P	236_Y	0.843	0.12
464_C	472_E	0.842	0.12
125_Q	200_G	0.840	0.12
238_V	251_P	0.838	0.12
90_Q	620_V	0.837	0.12
194_S	631_I	0.834	0.12
349_D	577_V	0.832	0.12
128_V	368_A	0.831	0.12
512_H	545_N	0.830	0.12
113_Y	705_S	0.827	0.12
156_R	201_H	0.825	0.12
212_D	279_L	0.825	0.12
320_A	617_S	0.824	0.12
589_D	707_K	0.823	0.12
224_I	599_V	0.822	0.12
545_N	550_H	0.819	0.12
122_M	306_I	0.818	0.12
131_P	189_T	0.816	0.11
155_A	222_T	0.816	0.11
512_H	516_H	0.815	0.11
512_H	547_C	0.814	0.11
541_A	548_Q	0.813	0.11
480_G	530_D	0.811	0.11
347_T	555_A	0.811	0.11
66_P	159_H	0.810	0.11
366_G	495_L	0.808	0.11
500_L	524_C	0.808	0.11
214_P	586_L	0.807	0.11
549_S	553_G	0.807	0.11
521_G	546_S	0.806	0.11
206_E	294_G	0.806	0.11
195_F	621_V	0.804	0.11
205_V	504_L	0.803	0.11
567_T	580_G	0.802	0.11
229_P	465_N	0.801	0.11
244_Y	579_V	0.794	0.11
524_C	529_L	0.794	0.11
398_S	430_D	0.792	0.11
331_G	411_A	0.791	0.11
613_V	655_G	0.791	0.11
446_A	517_T	0.791	0.11
610_Y	704_W	0.790	0.11
313_D	544_L	0.787	0.11
169_T	270_S	0.785	0.11
346_V	545_N	0.785	0.11
465_N	524_C	0.785	0.11
527_G	542_F	0.782	0.11
205_V	621_V	0.782	0.11
479_Y	516_H	0.782	0.11
592_S	595_A	0.781	0.11
489_I	684_D	0.780	0.11
251_P	597_L	0.779	0.11
73_F	266_F	0.778	0.11
211_F	647_Y	0.778	0.11
531_A	541_A	0.778	0.11
316_A	702_L	0.775	0.11
132_F	613_V	0.774	0.11
131_P	323_A	0.773	0.11
548_Q	563_G	0.771	0.11
78_I	248_T	0.771	0.11
236_Y	546_S	0.771	0.11
335_A	708_L	0.771	0.11
315_S	519_A	0.771	0.11
66_P	197_T	0.769	0.11
521_G	552_Q	0.768	0.11
465_N	567_T	0.768	0.11
128_V	132_F	0.764	0.11
224_I	366_G	0.764	0.11
168_I	588_N	0.763	0.11
180_S	188_T	0.760	0.11
129_T	582_A	0.759	0.11
460_V	681_A	0.758	0.11
571_I	671_N	0.757	0.11
266_F	357_I	0.756	0.11
227_E	328_A	0.754	0.11
564_G	704_W	0.754	0.11
182_F	236_Y	0.753	0.11
235_L	310_L	0.753	0.11
100_T	339_P	0.752	0.11
510_F	513_Y	0.751	0.11
125_Q	156_R	0.749	0.11
224_I	641_E	0.749	0.11
200_G	448_L	0.748	0.11
229_P	544_L	0.747	0.11
333_P	429_A	0.746	0.11
96_V	348_A	0.746	0.11
166_I	205_V	0.743	0.11
120_G	612_T	0.743	0.11
156_R	198_L	0.743	0.11
155_A	450_C	0.742	0.11
213_A	337_T	0.742	0.11
595_A	608_N	0.742	0.11
267_P	271_G	0.741	0.11
427_W	622_Q	0.740	0.11
141_T	554_R	0.739	0.11
285_L	577_V	0.736	0.11
312_I	436_A	0.736	0.11
427_W	516_H	0.735	0.11
223_G	418_P	0.735	0.11
257_L	521_G	0.735	0.11
184_S	293_E	0.734	0.11
192_E	487_F	0.734	0.11
133_E	582_A	0.733	0.11
192_E	294_G	0.733	0.11
542_F	580_G	0.733	0.11
463_V	545_N	0.732	0.10
547_C	564_G	0.732	0.10
209_D	212_D	0.730	0.10
181_L	364_V	0.729	0.10
108_P	543_L	0.729	0.10
479_Y	545_N	0.728	0.10
305_A	483_D	0.727	0.10
227_E	355_G	0.727	0.10
185_A	424_E	0.726	0.10
179_V	233_G	0.725	0.10
440_T	555_A	0.724	0.10
427_W	465_N	0.724	0.10
191_P	249_V	0.723	0.10
229_P	479_Y	0.723	0.10
211_F	446_A	0.723	0.10
276_V	521_G	0.722	0.10
279_L	501_A	0.722	0.10
395_R	472_E	0.721	0.10
141_T	233_G	0.721	0.10
324_E	683_E	0.720	0.10
72_A	456_D	0.719	0.10
182_F	522_F	0.719	0.10
516_H	584_A	0.719	0.10
539_V	607_G	0.719	0.10
464_C	480_G	0.718	0.10
145_F	694_F	0.717	0.10
478_V	604_T	0.717	0.10
280_L	628_P	0.716	0.10
417_P	513_Y	0.716	0.10
159_H	184_S	0.716	0.10
513_Y	703_T	0.713	0.10
516_H	550_H	0.713	0.10
226_I	266_F	0.711	0.10
108_P	490_S	0.711	0.10
229_P	500_L	0.710	0.10
325_R	399_Q	0.709	0.10
166_I	211_F	0.709	0.10
542_F	567_T	0.708	0.10
185_A	303_R	0.708	0.10
189_T	226_I	0.708	0.10
395_R	438_K	0.706	0.10
477_A	519_A	0.706	0.10
132_F	531_A	0.704	0.10
453_P	548_Q	0.704	0.10
130_D	175_G	0.703	0.10
337_T	690_D	0.703	0.10
265_P	452_A	0.702	0.10
437_N	561_S	0.701	0.10
257_L	500_L	0.700	0.10
553_G	567_T	0.700	0.10
166_I	364_V	0.700	0.10
153_L	693_V	0.698	0.10
353_D	562_Q	0.698	0.10
421_E	501_A	0.697	0.10
75_T	620_V	0.696	0.10
186_L	464_C	0.696	0.10
173_R	357_I	0.696	0.10
285_L	337_T	0.695	0.10
479_Y	580_G	0.695	0.10
510_F	558_D	0.694	0.10
201_H	465_N	0.693	0.10
215_A	411_A	0.693	0.10
421_E	519_A	0.692	0.10
174_D	444_Y	0.690	0.10
249_V	281_E	0.690	0.10
289_V	435_G	0.690	0.10
337_T	364_V	0.687	0.10
431_G	471_A	0.685	0.10
465_N	542_F	0.685	0.10
133_E	257_L	0.685	0.10
343_Q	680_V	0.685	0.10
562_Q	612_T	0.683	0.10
515_G	580_G	0.682	0.10
124_L	550_H	0.682	0.10
205_V	337_T	0.682	0.10
105_A	621_V	0.680	0.10
170_D	669_Y	0.680	0.10
151_V	471_A	0.679	0.10
189_T	669_Y	0.679	0.10
478_V	592_S	0.678	0.10
126_L	131_P	0.677	0.10
469_M	514_I	0.676	0.10
153_L	216_T	0.676	0.10
153_L	175_G	0.676	0.10
224_I	706_D	0.675	0.10
396_S	456_D	0.675	0.10
271_G	446_A	0.675	0.10
427_W	567_T	0.674	0.10
74_D	678_F	0.674	0.10
204_L	445_Q	0.674	0.10
125_Q	300_M	0.673	0.10
486_E	510_F	0.673	0.10
211_F	685_V	0.672	0.10
472_E	567_T	0.672	0.10
251_P	258_V	0.671	0.10
515_G	542_F	0.671	0.10
567_T	576_A	0.671	0.10
437_N	517_T	0.671	0.10
255_R	331_G	0.670	0.10
66_P	198_L	0.670	0.10
217_L	452_A	0.669	0.10
68_D	111_G	0.668	0.10
378_D	541_A	0.668	0.10
224_I	631_I	0.667	0.10
441_A	459_R	0.666	0.10
61_A	502_T	0.666	0.10
391_S	597_L	0.665	0.10
252_G	255_R	0.665	0.10
402_R	679_S	0.665	0.10
430_D	535_D	0.664	0.10
130_D	373_H	0.664	0.10
443_D	612_T	0.664	0.10
163_E	293_E	0.663	0.10
190_T	238_V	0.663	0.10
228_I	363_V	0.662	0.10
78_I	603_V	0.661	0.10
368_A	630_L	0.660	0.10
516_H	573_N	0.657	0.10
120_G	256_A	0.656	0.10
547_C	553_G	0.656	0.10
246_G	621_V	0.656	0.10
107_Y	341_G	0.655	0.10
163_E	647_Y	0.654	0.10
187_K	211_F	0.653	0.10
547_C	573_N	0.653	0.10
229_P	515_G	0.652	0.10
556_L	564_G	0.652	0.10
521_G	524_C	0.651	0.10
465_N	573_N	0.651	0.10
186_L	303_R	0.650	0.10
300_M	488_D	0.650	0.10
68_D	355_G	0.650	0.10
168_I	259_L	0.650	0.10
295_L	364_V	0.649	0.10
195_F	337_T	0.648	0.10
179_V	261_G	0.644	0.10
179_V	364_V	0.644	0.10
177_R	363_V	0.641	0.10
577_V	581_H	0.641	0.10
81_P	139_D	0.639	0.09
163_E	358_A	0.639	0.09
430_D	680_V	0.639	0.09
582_A	707_K	0.639	0.09
288_C	465_N	0.638	0.09
227_E	281_E	0.638	0.09
239_S	561_S	0.638	0.09
231_D	319_D	0.637	0.09
173_R	558_D	0.636	0.09
640_Y	682_T	0.633	0.09
493_H	523_Q	0.632	0.09
313_D	445_Q	0.632	0.09
442_A	620_V	0.630	0.09
184_S	504_L	0.629	0.09
210_A	249_V	0.629	0.09
188_T	513_Y	0.629	0.09
553_G	576_A	0.628	0.09
588_N	594_L	0.628	0.09
146_D	557_V	0.627	0.09
300_M	318_Y	0.627	0.09
553_G	591_F	0.627	0.09
225_A	258_V	0.626	0.09
306_I	601_R	0.626	0.09
101_N	179_V	0.625	0.09
156_R	162_P	0.625	0.09
92_D	485_F	0.624	0.09
243_Y	518_D	0.622	0.09
159_H	448_L	0.622	0.09
465_N	495_L	0.622	0.09
86_V	292_T	0.621	0.09
301_H	364_V	0.620	0.09
179_V	237_R	0.620	0.09
438_K	547_C	0.618	0.09
205_V	358_A	0.618	0.09
102_Q	370_I	0.617	0.09
192_E	504_L	0.616	0.09
545_N	553_G	0.614	0.09
608_N	613_V	0.614	0.09
367_L	695_P	0.614	0.09
319_D	490_S	0.613	0.09
208_G	319_D	0.613	0.09
324_E	686_R	0.612	0.09
426_V	482_R	0.611	0.09
542_F	576_A	0.609	0.09
156_R	302_E	0.609	0.09
514_I	546_S	0.609	0.09
103_E	143_I	0.609	0.09
240_T	486_E	0.609	0.09
237_R	261_G	0.607	0.09
564_G	580_G	0.604	0.09
332_V	627_M	0.603	0.09
331_G	582_A	0.603	0.09
293_E	303_R	0.602	0.09
506_S	569_S	0.601	0.09
146_D	295_L	0.601	0.09
283_V	688_F	0.600	0.09
217_L	460_V	0.599	0.09
78_I	153_L	0.599	0.09
284_F	527_G	0.599	0.09
194_S	623_S	0.598	0.09
224_I	441_A	0.598	0.09
168_I	240_T	0.598	0.09
239_S	502_T	0.596	0.09
465_N	512_H	0.596	0.09
228_I	365_D	0.596	0.09
501_A	533_D	0.595	0.09
470_D	599_V	0.593	0.09
236_Y	477_A	0.592	0.09
273_G	460_V	0.591	0.09
165_T	180_S	0.591	0.09
151_V	209_D	0.591	0.09
195_F	205_V	0.590	0.09
263_R	338_E	0.590	0.09
481_M	486_E	0.590	0.09
515_G	544_L	0.590	0.09
430_D	536_T	0.590	0.09
209_D	471_A	0.589	0.09
586_L	590_G	0.588	0.09
368_A	425_H	0.587	0.09
337_T	452_A	0.587	0.09
479_Y	542_F	0.586	0.09
229_P	512_H	0.585	0.09
166_I	182_F	0.585	0.09
542_F	556_L	0.584	0.09
90_Q	168_I	0.584	0.09
176_M	437_N	0.583	0.09
230_P	680_V	0.583	0.09
246_G	592_S	0.583	0.09
532_R	642_L	0.583	0.09
131_P	211_F	0.582	0.09
448_L	534_L	0.581	0.09
257_L	685_V	0.580	0.09
479_Y	549_S	0.579	0.09
433_P	438_K	0.579	0.09
524_C	580_G	0.579	0.09
218_D	226_I	0.578	0.09
427_W	580_G	0.578	0.09
185_A	259_L	0.578	0.09
159_H	563_G	0.577	0.09
122_M	648_P	0.575	0.09
236_Y	439_A	0.575	0.09
254_Q	528_R	0.575	0.09
334_F	685_V	0.574	0.09
395_R	591_F	0.574	0.09
117_V	267_P	0.573	0.09
107_Y	485_F	0.573	0.09
400_P	460_V	0.573	0.09
179_V	504_L	0.572	0.09
195_F	577_V	0.570	0.09
97_G	592_S	0.570	0.09
348_A	702_L	0.570	0.09
541_A	601_R	0.570	0.09
593_L	599_V	0.570	0.09
71_V	297_S	0.569	0.09
151_V	520_T	0.569	0.09
168_I	487_F	0.567	0.09
266_F	361_P	0.566	0.09
426_V	507_T	0.566	0.09
689_F	696_V	0.565	0.09
176_M	422_S	0.564	0.09
123_K	198_L	0.564	0.09
112_A	501_A	0.563	0.09
207_R	332_V	0.562	0.09
80_L	628_P	0.562	0.09
107_Y	245_L	0.561	0.09
195_F	446_A	0.560	0.09
660_P	688_F	0.559	0.09
63_F	371_R	0.558	0.09
310_L	474_C	0.557	0.09
194_S	239_S	0.556	0.09
445_Q	656_S	0.555	0.09
395_R	647_Y	0.555	0.09
205_V	677_T	0.554	0.09
167_T	257_L	0.554	0.09
75_T	176_M	0.552	0.09
633_L	642_L	0.552	0.09
243_Y	475_V	0.552	0.09
180_S	638_A	0.551	0.09
155_A	306_I	0.550	0.09
392_S	571_I	0.550	0.09
243_Y	499_E	0.549	0.09
483_D	688_F	0.549	0.09
531_A	538_G	0.547	0.09
100_T	215_A	0.546	0.09
245_L	286_L	0.546	0.09
234_D	335_A	0.546	0.09
427_W	564_G	0.546	0.09
85_D	482_R	0.545	0.09
64_A	325_R	0.545	0.09
149_A	220_P	0.544	0.09
479_Y	510_F	0.544	0.09
135_H	442_A	0.544	0.09
171_D	654_L	0.543	0.09
539_V	543_L	0.542	0.09
159_H	358_A	0.541	0.09
562_Q	599_V	0.541	0.09
110_Q	661_Y	0.540	0.09
134_I	316_A	0.539	0.08
265_P	642_L	0.539	0.08
161_A	325_R	0.538	0.08
437_N	450_C	0.538	0.08
613_V	618_A	0.537	0.08
197_T	294_G	0.537	0.08
179_V	235_L	0.536	0.08
256_A	312_I	0.534	0.08
310_L	601_R	0.533	0.08
271_G	483_D	0.532	0.08
479_Y	544_L	0.532	0.08
320_A	392_S	0.532	0.08
114_A	430_D	0.530	0.08
366_G	447_R	0.530	0.08
187_K	510_F	0.527	0.08
204_L	509_D	0.526	0.08
429_A	548_Q	0.526	0.08
272_F	675_I	0.525	0.08
341_G	536_T	0.525	0.08
166_I	279_L	0.525	0.08
191_P	312_I	0.525	0.08
162_P	294_G	0.524	0.08
60_D	128_V	0.524	0.08
479_Y	547_C	0.523	0.08
144_S	319_D	0.522	0.08
187_K	647_Y	0.522	0.08
278_A	290_V	0.522	0.08
329_Y	544_L	0.521	0.08
469_M	550_H	0.521	0.08
134_I	271_G	0.521	0.08
150_T	502_T	0.521	0.08
166_I	623_S	0.520	0.08
123_K	187_K	0.520	0.08
224_I	266_F	0.520	0.08
427_W	549_S	0.519	0.08
349_D	425_H	0.519	0.08
74_D	131_P	0.519	0.08
350_I	372_V	0.518	0.08
464_C	487_F	0.518	0.08
70_A	502_T	0.518	0.08
170_D	467_P	0.517	0.08
497_T	684_D	0.516	0.08
328_A	351_A	0.516	0.08
229_P	564_G	0.516	0.08
614_G	655_G	0.516	0.08
94_T	117_V	0.515	0.08
633_L	688_F	0.515	0.08
236_Y	471_A	0.514	0.08
550_H	610_Y	0.513	0.08
271_G	539_V	0.513	0.08
171_D	394_L	0.512	0.08
400_P	446_A	0.512	0.08
196_P	291_R	0.510	0.08
155_A	453_P	0.510	0.08
342_P	616_G	0.510	0.08
475_V	510_F	0.509	0.08
151_V	312_I	0.509	0.08
166_I	219_A	0.508	0.08
201_H	472_E	0.508	0.08
620_V	708_L	0.508	0.08
479_Y	513_Y	0.508	0.08
273_G	304_T	0.507	0.08
174_D	177_R	0.507	0.08
637_D	666_D	0.506	0.08
427_W	610_Y	0.506	0.08
486_E	596_G	0.505	0.08
337_T	370_I	0.505	0.08
150_T	277_Q	0.505	0.08
318_Y	547_C	0.505	0.08
330_L	539_V	0.505	0.08
465_N	564_G	0.505	0.08
265_P	275_A	0.504	0.08
415_V	438_K	0.502	0.08
357_I	490_S	0.502	0.08
89_W	260_D	0.501	0.08
165_T	395_R	0.501	0.08
328_A	430_D	0.501	0.08
318_Y	610_Y	0.500	0.08
293_E	588_N	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1pyoA	2	0.1737	96.9	0.973	Contact Map
2h54A	1	0.1905	96.8	0.973	Contact Map
3sirA	2	0.2535	96.4	0.974	Contact Map
4jr2A	2	0.2591	96.4	0.974	Contact Map
3p45A	3	0.1443	96.2	0.975	Contact Map
2dkoA	2	0.1597	96	0.975	Contact Map
1f1jA	3	0.2577	96	0.975	Contact Map
4jb8A	2	0.1555	96	0.975	Contact Map
1m72A	2	0.2787	95.7	0.976	Contact Map
3e4cA	2	0.2829	95	0.977	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0164 seconds.