Q9HPM3 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPM3 - Protoporphyrin IX magnesium chelatase

UniProt:	Q9HPM3	Sequences: MVDLGRSKKLSPDRRAGAPFPAVVGQDDLKTGLLAVAANASLDGLLVTGEKGTAKSTTARALADLLPDQRAVADCPYGCPPEDPTRQCADCRDRTDPPVESRPVPFVTLPLGASRDRVVGSLSVTDALAGDAEFSPGLLAAANRGILYVDEVNLLDDHLVDVLLDAAASGVNRVERDGVSVTHPAEFTLVGTMNPEEGDLRPQFRDRFALRVAVAGSEEIADRVEIMDRALAGFDGDYAADTAAVRDRLVTARDLLPDVDLPESLAREIAELCRDAGVDGHRADVATARAARTLAALDGRPTVTEADIERAAGFALPHRLQSRPFEDAPDPEDVVDDHFDDDGDQSDEEGDAETSDEAGGDDPEPTDNAEADAEPDGDTGGAEAPTGGPDDSQSEGSQAPADSEAGDDPTDGERGDDEDTEDAAPLVPGQPRGDTVEPGTGVAPDADAPDAERATGDSGRASATPSPDARGARVRTERATPADDVDAAASVRAAAARGSDAVESRDLRQSINAGSASALVVFAVDASASMRGPMRAAKGVALDLLRDAYQHRDEIAVVAFAGDDADVLVPPTDSVALAARHLKDLPTGDRTPLPAGLRAADDVLARADPDASVVVVVTDGQANATDTPTAATRTAASALAERGAHVVVVDAGDNARGLTSDIVDAADGERVPLDALSADRVEHAVGQARK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	690 (640)
Sequences:	353 (280)
Seq/√Len:	11.1

HALSA - Q9HPM3

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
471_G	474_V	6.163	1.00
442_V	445_D	5.453	1.00
442_V	447_D	5.160	1.00
475_R	479_A	4.548	1.00
471_G	475_R	4.337	1.00
75_C	79_C	4.086	0.99
443_A	447_D	3.980	0.99
474_V	478_R	3.943	0.99
555_I	578_A	3.919	0.99
23_V	58_T	3.919	0.99
88_C	91_C	3.905	0.99
217_S	281_H	3.815	0.99
471_G	476_T	3.722	0.99
521_V	556_A	3.715	0.99
637_S	665_A	3.675	0.98
445_D	450_D	3.563	0.98
474_V	479_A	3.549	0.98
241_D	244_A	3.432	0.98
347_D	351_D	3.268	0.97
86_R	89_A	3.229	0.96
639_L	681_V	3.221	0.96
19_P	22_A	3.185	0.96
475_R	478_R	3.146	0.96
441_G	447_D	3.117	0.96
86_R	90_D	3.100	0.95
85_T	88_C	3.099	0.95
472_A	475_R	3.042	0.95
87_Q	90_D	3.025	0.95
438_P	441_G	2.939	0.94
294_L	310_R	2.761	0.92
79_C	88_C	2.738	0.91
441_G	445_D	2.719	0.91
42_L	61_A	2.672	0.90
75_C	88_C	2.659	0.90
556_A	604_L	2.627	0.89
476_T	479_A	2.619	0.89
442_V	446_A	2.606	0.89
668_G	671_V	2.552	0.88
83_D	86_R	2.497	0.87
601_D	642_R	2.473	0.86
536_A	539_G	2.448	0.86
338_H	342_D	2.429	0.85
86_R	91_C	2.425	0.85
300_R	538_K	2.387	0.84
118_V	238_Y	2.385	0.84
436_V	445_D	2.361	0.83
463_A	513_A	2.331	0.83
483_D	509_Q	2.313	0.82
438_P	445_D	2.307	0.82
447_D	450_D	2.284	0.81
85_T	89_A	2.256	0.80
446_A	450_D	2.225	0.79
374_E	379_T	2.222	0.79
221_A	267_R	2.184	0.78
409_P	417_D	2.178	0.78
283_A	548_A	2.131	0.76
438_P	442_V	2.099	0.75
436_V	443_A	2.065	0.74
134_F	292_R	2.059	0.74
442_V	450_D	2.058	0.74
265_L	268_E	1.993	0.71
639_L	644_A	1.989	0.71
509_Q	578_A	1.988	0.71
602_D	605_A	1.983	0.71
275_D	338_H	1.969	0.70
85_T	90_D	1.958	0.70
83_D	90_D	1.954	0.70
271_E	668_G	1.949	0.69
538_K	586_P	1.948	0.69
118_V	556_A	1.938	0.69
443_A	446_A	1.915	0.68
30_K	281_H	1.906	0.68
441_G	444_P	1.876	0.66
444_P	447_D	1.871	0.66
470_R	474_V	1.870	0.66
557_V	617_V	1.865	0.66
441_G	450_D	1.856	0.65
526_A	534_M	1.824	0.64
601_D	681_V	1.810	0.63
521_V	604_L	1.806	0.63
29_L	38_A	1.801	0.63
393_Q	427_V	1.782	0.62
174_V	558_V	1.780	0.62
262_P	265_L	1.772	0.62
523_A	600_A	1.766	0.61
436_V	440_T	1.740	0.60
298_D	586_P	1.714	0.59
429_G	445_D	1.713	0.59
220_I	546_R	1.709	0.59
439_G	445_D	1.708	0.59
83_D	88_C	1.708	0.59
526_A	569_V	1.692	0.58
423_A	426_L	1.667	0.57
656_R	659_T	1.661	0.56
87_Q	91_C	1.660	0.56
134_F	610_D	1.644	0.56
72_V	79_C	1.637	0.55
438_P	443_A	1.625	0.55
534_M	538_K	1.620	0.54
443_A	450_D	1.614	0.54
49_G	55_K	1.610	0.54
616_V	662_I	1.610	0.54
285_V	517_S	1.602	0.54
611_A	651_A	1.573	0.52
534_M	586_P	1.554	0.51
26_Q	30_K	1.539	0.51
533_P	540_V	1.529	0.50
436_V	441_G	1.528	0.50
287_T	315_A	1.516	0.49
327_D	546_R	1.514	0.49
300_R	586_P	1.513	0.49
433_G	442_V	1.510	0.49
384_A	403_S	1.497	0.49
352_A	414_R	1.494	0.48
438_P	447_D	1.493	0.48
634_T	641_E	1.493	0.48
157_D	278_V	1.490	0.48
372_D	377_G	1.488	0.48
380_G	405_A	1.487	0.48
360_G	405_A	1.481	0.48
390_D	407_D	1.477	0.48
407_D	416_D	1.477	0.48
239_A	243_A	1.475	0.47
114_S	118_V	1.474	0.47
49_G	52_G	1.459	0.47
52_G	55_K	1.459	0.47
672_P	675_A	1.453	0.46
545_L	574_S	1.448	0.46
72_V	75_C	1.444	0.46
534_M	542_L	1.442	0.46
375_P	408_D	1.442	0.46
579_A	586_P	1.438	0.46
104_V	123_S	1.434	0.46
265_L	308_I	1.422	0.45
472_A	476_T	1.420	0.45
151_E	194_N	1.415	0.45
83_D	89_A	1.411	0.44
162_V	661_D	1.409	0.44
132_A	135_S	1.409	0.44
347_D	352_A	1.406	0.44
47_V	548_A	1.404	0.44
400_P	419_D	1.398	0.44
349_E	353_E	1.380	0.43
513_A	517_S	1.374	0.43
118_V	577_L	1.374	0.43
357_E	415_G	1.367	0.42
418_E	425_P	1.356	0.42
156_D	513_A	1.356	0.42
161_D	165_D	1.356	0.42
36_V	177_D	1.353	0.42
446_A	449_P	1.351	0.42
281_H	492_R	1.347	0.41
631_A	635_A	1.346	0.41
594_P	632_T	1.345	0.41
437_E	504_S	1.339	0.41
341_D	446_A	1.337	0.41
135_S	538_K	1.332	0.41
440_T	447_D	1.331	0.41
165_D	273_C	1.331	0.41
433_G	443_A	1.318	0.40
85_T	91_C	1.316	0.40
389_P	408_D	1.307	0.40
135_S	509_Q	1.303	0.39
632_T	639_L	1.303	0.39
438_P	450_D	1.301	0.39
224_V	491_V	1.300	0.39
451_A	455_T	1.299	0.39
345_Q	349_E	1.297	0.39
473_R	477_E	1.294	0.39
557_V	578_A	1.292	0.39
70_R	254_D	1.288	0.39
156_D	162_V	1.285	0.39
105_P	108_T	1.284	0.38
114_S	177_D	1.284	0.38
668_G	681_V	1.282	0.38
247_D	616_V	1.280	0.38
471_G	479_A	1.279	0.38
439_G	442_V	1.273	0.38
469_A	483_D	1.273	0.38
294_L	595_A	1.271	0.38
354_T	375_P	1.264	0.38
287_T	546_R	1.259	0.37
655_A	659_T	1.245	0.37
438_P	444_P	1.242	0.37
334_V	338_H	1.238	0.36
272_L	532_G	1.234	0.36
157_D	201_R	1.232	0.36
205_R	533_P	1.229	0.36
118_V	584_D	1.223	0.36
455_T	535_R	1.214	0.35
300_R	307_D	1.207	0.35
171_V	610_D	1.207	0.35
127_A	617_V	1.205	0.35
58_T	298_D	1.205	0.35
513_A	554_E	1.204	0.35
452_E	456_G	1.201	0.35
221_A	523_A	1.198	0.35
221_A	224_V	1.190	0.34
433_G	436_V	1.190	0.34
595_A	676_L	1.189	0.34
373_A	377_G	1.188	0.34
434_D	442_V	1.187	0.34
271_E	285_V	1.186	0.34
540_V	543_D	1.185	0.34
21_P	255_L	1.183	0.34
395_E	414_R	1.180	0.34
492_R	538_K	1.179	0.34
56_S	169_S	1.179	0.34
349_E	387_G	1.176	0.34
474_V	505_R	1.176	0.34
458_S	481_P	1.174	0.34
333_D	420_T	1.170	0.33
536_A	676_L	1.169	0.33
452_E	455_T	1.163	0.33
149_V	472_A	1.154	0.33
462_S	518_A	1.150	0.33
83_D	375_P	1.150	0.33
63_A	653_D	1.142	0.32
439_G	447_D	1.140	0.32
104_V	141_A	1.137	0.32
335_V	339_F	1.134	0.32
387_G	418_E	1.128	0.32
40_A	43_D	1.121	0.31
403_S	408_D	1.116	0.31
422_D	428_P	1.115	0.31
149_V	281_H	1.115	0.31
360_G	378_D	1.113	0.31
390_D	402_D	1.110	0.31
549_Y	552_R	1.108	0.31
305_E	308_I	1.108	0.31
386_T	393_Q	1.107	0.31
382_A	394_S	1.106	0.31
439_G	443_A	1.104	0.31
306_A	634_T	1.101	0.31
659_T	662_I	1.100	0.30
219_E	332_E	1.099	0.30
214_V	649_V	1.096	0.30
648_V	652_G	1.094	0.30
346_S	617_V	1.094	0.30
118_V	277_G	1.091	0.30
355_S	359_G	1.087	0.30
75_C	81_P	1.084	0.30
159_L	284_D	1.083	0.30
69_Q	78_G	1.081	0.30
584_D	637_S	1.081	0.30
219_E	389_P	1.079	0.30
243_A	247_D	1.079	0.30
403_S	423_A	1.078	0.30
213_A	542_L	1.077	0.30
29_L	58_T	1.076	0.30
278_V	284_D	1.073	0.29
125_T	308_I	1.071	0.29
668_G	676_L	1.071	0.29
545_L	578_A	1.062	0.29
233_G	414_R	1.059	0.29
399_A	408_D	1.058	0.29
255_L	301_P	1.057	0.29
470_R	476_T	1.055	0.29
356_D	359_G	1.055	0.29
161_D	203_Q	1.055	0.29
42_L	242_T	1.054	0.29
437_E	443_A	1.053	0.29
30_K	123_S	1.053	0.29
633_R	639_L	1.053	0.29
265_L	546_R	1.052	0.29
440_T	449_P	1.050	0.28
405_A	428_P	1.048	0.28
157_D	161_D	1.048	0.28
72_V	81_P	1.046	0.28
388_G	392_S	1.043	0.28
129_A	281_H	1.039	0.28
416_D	426_L	1.039	0.28
632_T	636_A	1.037	0.28
399_A	402_D	1.036	0.28
437_E	447_D	1.035	0.28
400_P	406_G	1.033	0.28
534_M	560_F	1.031	0.28
220_I	346_S	1.029	0.28
241_D	246_R	1.027	0.28
141_A	185_A	1.024	0.27
308_I	676_L	1.022	0.27
644_A	670_R	1.020	0.27
356_D	407_D	1.018	0.27
663_V	670_R	1.017	0.27
454_A	460_R	1.009	0.27
399_A	411_D	1.007	0.27
509_Q	538_K	1.007	0.27
283_A	526_A	1.007	0.27
312_A	569_V	1.002	0.27
30_K	172_N	0.999	0.27
664_D	667_D	0.998	0.26
173_R	323_R	0.997	0.26
639_L	645_H	0.997	0.26
35_A	40_A	0.995	0.26
322_S	325_F	0.995	0.26
36_V	238_Y	0.993	0.26
122_L	184_P	0.992	0.26
313_G	485_V	0.992	0.26
272_L	287_T	0.991	0.26
255_L	677_S	0.991	0.26
171_V	290_A	0.989	0.26
310_R	489_A	0.988	0.26
112_G	128_L	0.982	0.26
146_I	458_S	0.982	0.26
399_A	404_E	0.981	0.26
413_E	416_D	0.981	0.26
69_Q	517_S	0.978	0.26
154_L	197_E	0.977	0.26
124_V	171_V	0.974	0.26
262_P	624_A	0.974	0.26
183_H	569_V	0.974	0.26
535_R	671_V	0.972	0.26
165_D	168_A	0.971	0.25
246_R	505_R	0.970	0.25
437_E	446_A	0.970	0.25
631_A	639_L	0.969	0.25
469_A	509_Q	0.967	0.25
454_A	462_S	0.966	0.25
676_L	681_V	0.965	0.25
340_D	426_L	0.965	0.25
160_V	201_R	0.964	0.25
528_A	533_P	0.963	0.25
355_S	360_G	0.959	0.25
473_R	488_A	0.959	0.25
149_V	217_S	0.957	0.25
542_L	579_A	0.955	0.25
246_R	491_V	0.953	0.25
416_D	427_V	0.953	0.25
161_D	201_R	0.952	0.25
634_T	638_A	0.951	0.25
51_K	590_R	0.951	0.25
492_R	500_D	0.949	0.25
410_T	413_E	0.946	0.25
149_V	548_A	0.946	0.25
432_R	450_D	0.945	0.25
632_T	635_A	0.942	0.24
161_D	273_C	0.941	0.24
168_A	203_Q	0.941	0.24
565_A	572_T	0.941	0.24
402_D	406_G	0.939	0.24
401_A	418_E	0.937	0.24
147_L	198_G	0.937	0.24
71_A	144_R	0.935	0.24
393_Q	402_D	0.933	0.24
32_G	45_L	0.932	0.24
409_P	558_V	0.932	0.24
165_D	203_Q	0.930	0.24
659_T	663_V	0.930	0.24
601_D	669_E	0.928	0.24
99_V	473_R	0.927	0.24
423_A	438_P	0.926	0.24
402_D	418_E	0.926	0.24
436_V	442_V	0.924	0.24
65_L	492_R	0.924	0.24
358_A	427_V	0.923	0.24
105_P	375_P	0.922	0.24
313_G	631_A	0.921	0.24
451_A	638_A	0.921	0.24
558_V	566_D	0.920	0.24
47_V	111_L	0.917	0.24
522_F	586_P	0.917	0.24
125_T	129_A	0.910	0.23
543_D	678_A	0.908	0.23
476_T	629_T	0.906	0.23
154_L	198_G	0.906	0.23
241_D	409_P	0.903	0.23
215_A	323_R	0.903	0.23
440_T	443_A	0.903	0.23
466_S	470_R	0.896	0.23
386_T	392_S	0.894	0.23
389_P	414_R	0.891	0.23
525_D	529_S	0.890	0.23
483_D	532_G	0.889	0.23
381_G	405_A	0.889	0.23
177_D	488_A	0.888	0.23
489_A	492_R	0.887	0.23
38_A	308_I	0.887	0.23
491_V	501_A	0.884	0.22
401_A	408_D	0.884	0.22
224_V	270_A	0.883	0.22
211_R	604_L	0.883	0.22
81_P	144_R	0.883	0.22
219_E	348_E	0.882	0.22
258_D	681_V	0.882	0.22
378_D	394_S	0.879	0.22
224_V	672_P	0.879	0.22
277_G	310_R	0.879	0.22
574_S	578_A	0.877	0.22
48_T	518_A	0.876	0.22
348_E	351_D	0.876	0.22
121_S	274_R	0.875	0.22
219_E	409_P	0.875	0.22
357_E	414_R	0.874	0.22
659_T	666_A	0.872	0.22
213_A	602_D	0.872	0.22
408_D	417_D	0.871	0.22
471_G	478_R	0.870	0.22
379_T	391_D	0.869	0.22
114_S	217_S	0.868	0.22
539_G	601_D	0.868	0.22
635_A	681_V	0.868	0.22
512_N	575_V	0.868	0.22
349_E	564_D	0.867	0.22
400_P	405_A	0.866	0.22
119_V	676_L	0.866	0.22
484_D	488_A	0.864	0.22
373_A	379_T	0.864	0.22
34_L	47_V	0.863	0.22
560_F	591_T	0.863	0.22
386_T	390_D	0.861	0.22
42_L	290_A	0.855	0.21
436_V	450_D	0.855	0.21
173_R	268_E	0.853	0.21
473_R	510_S	0.852	0.21
406_G	415_G	0.851	0.21
298_D	310_R	0.850	0.21
567_V	603_V	0.850	0.21
26_Q	134_F	0.850	0.21
386_T	389_P	0.849	0.21
559_A	568_L	0.849	0.21
582_L	621_Q	0.848	0.21
393_Q	405_A	0.846	0.21
509_Q	557_V	0.846	0.21
395_E	411_D	0.845	0.21
392_S	401_A	0.845	0.21
491_V	576_A	0.844	0.21
373_A	392_S	0.842	0.21
224_V	290_A	0.841	0.21
469_A	472_A	0.838	0.21
262_P	304_T	0.838	0.21
158_H	203_Q	0.837	0.21
353_E	381_G	0.837	0.21
528_A	589_D	0.837	0.21
486_D	510_S	0.837	0.21
240_A	432_R	0.836	0.21
135_S	300_R	0.836	0.21
156_D	463_A	0.836	0.21
221_A	340_D	0.835	0.21
432_R	440_T	0.835	0.21
290_A	455_T	0.834	0.21
63_A	106_F	0.833	0.21
99_V	646_V	0.833	0.21
244_A	407_D	0.830	0.21
146_I	222_D	0.830	0.21
349_E	436_V	0.830	0.21
352_A	376_D	0.829	0.21
161_D	269_I	0.828	0.21
30_K	535_R	0.827	0.21
78_G	105_P	0.827	0.21
528_A	540_V	0.826	0.21
145_G	278_V	0.824	0.20
522_F	545_L	0.823	0.20
347_D	350_G	0.823	0.20
119_V	668_G	0.817	0.20
346_S	352_A	0.816	0.20
346_S	350_G	0.816	0.20
396_G	409_P	0.815	0.20
511_I	534_M	0.815	0.20
459_G	462_S	0.814	0.20
400_P	416_D	0.812	0.20
276_A	554_E	0.812	0.20
164_L	180_S	0.811	0.20
599_A	602_D	0.811	0.20
265_L	586_P	0.811	0.20
436_V	483_D	0.811	0.20
333_D	396_G	0.809	0.20
220_I	327_D	0.809	0.20
391_D	422_D	0.809	0.20
240_A	412_G	0.807	0.20
407_D	437_E	0.806	0.20
636_A	639_L	0.806	0.20
470_R	478_R	0.805	0.20
72_V	181_V	0.804	0.20
251_T	387_G	0.803	0.20
240_A	664_D	0.799	0.20
164_L	167_A	0.798	0.20
292_R	576_A	0.797	0.20
344_D	436_V	0.797	0.20
58_T	146_I	0.797	0.20
377_G	382_A	0.797	0.20
423_A	563_D	0.796	0.20
512_N	603_V	0.795	0.20
23_V	239_A	0.795	0.20
520_V	643_G	0.793	0.20
72_V	88_C	0.793	0.20
157_D	203_Q	0.793	0.20
670_R	677_S	0.792	0.19
143_N	183_H	0.791	0.19
149_V	183_H	0.791	0.19
550_Q	587_T	0.791	0.19
123_S	536_A	0.788	0.19
156_D	211_R	0.788	0.19
86_R	399_A	0.787	0.19
229_R	561_A	0.787	0.19
87_Q	97_P	0.784	0.19
153_N	198_G	0.782	0.19
390_D	393_Q	0.779	0.19
633_R	665_A	0.779	0.19
407_D	412_G	0.779	0.19
359_G	417_D	0.777	0.19
348_E	376_D	0.777	0.19
431_P	434_D	0.776	0.19
73_A	101_S	0.775	0.19
383_E	393_Q	0.775	0.19
26_Q	265_L	0.774	0.19
402_D	416_D	0.772	0.19
182_T	294_L	0.772	0.19
435_T	445_D	0.768	0.19
389_P	432_R	0.767	0.19
35_A	43_D	0.766	0.19
433_G	440_T	0.765	0.19
65_L	222_D	0.764	0.19
377_G	402_D	0.764	0.19
286_A	320_L	0.764	0.19
525_D	619_D	0.764	0.19
527_S	619_D	0.764	0.19
529_S	619_D	0.764	0.19
310_R	313_G	0.761	0.19
415_G	428_P	0.761	0.19
158_H	167_A	0.760	0.19
126_D	496_A	0.758	0.18
521_V	560_F	0.757	0.18
38_A	42_L	0.755	0.18
526_A	545_L	0.754	0.18
161_D	202_P	0.751	0.18
47_V	173_R	0.750	0.18
662_I	667_D	0.750	0.18
509_Q	631_A	0.749	0.18
559_A	569_V	0.749	0.18
146_I	305_E	0.748	0.18
506_D	572_T	0.747	0.18
376_D	441_G	0.747	0.18
240_A	411_D	0.746	0.18
238_Y	580_R	0.744	0.18
401_A	425_P	0.744	0.18
519_L	609_P	0.744	0.18
173_R	188_T	0.743	0.18
191_G	197_E	0.742	0.18
351_D	358_A	0.742	0.18
77_Y	556_A	0.740	0.18
545_L	572_T	0.738	0.18
34_L	381_G	0.737	0.18
118_V	188_T	0.737	0.18
352_A	384_A	0.735	0.18
225_E	603_V	0.735	0.18
158_H	201_R	0.735	0.18
265_L	327_D	0.735	0.18
68_D	101_S	0.735	0.18
403_S	416_D	0.734	0.18
43_D	209_A	0.734	0.18
153_N	193_M	0.734	0.18
386_T	634_T	0.733	0.18
558_V	567_V	0.732	0.18
256_L	259_V	0.731	0.18
161_D	167_A	0.730	0.18
421_E	426_L	0.730	0.18
127_A	556_A	0.730	0.18
133_E	271_E	0.728	0.18
287_T	586_P	0.728	0.18
119_V	509_Q	0.728	0.18
265_L	338_H	0.727	0.18
82_E	567_V	0.727	0.18
385_P	391_D	0.725	0.18
674_D	677_S	0.721	0.17
401_A	584_D	0.721	0.17
74_D	427_V	0.721	0.17
124_V	334_V	0.720	0.17
167_A	191_G	0.719	0.17
240_A	388_G	0.719	0.17
108_T	111_L	0.719	0.17
351_D	407_D	0.719	0.17
192_T	197_E	0.718	0.17
433_G	438_P	0.718	0.17
171_V	595_A	0.717	0.17
257_P	479_A	0.717	0.17
279_D	551_H	0.717	0.17
36_V	129_A	0.717	0.17
393_Q	437_E	0.716	0.17
171_V	246_R	0.715	0.17
221_A	387_G	0.715	0.17
455_T	465_P	0.714	0.17
485_V	624_A	0.714	0.17
348_E	436_V	0.712	0.17
484_D	680_R	0.709	0.17
254_D	558_V	0.708	0.17
254_D	417_D	0.706	0.17
114_S	268_E	0.706	0.17
161_D	284_D	0.706	0.17
254_D	358_A	0.706	0.17
323_R	458_S	0.705	0.17
300_R	304_T	0.705	0.17
358_A	422_D	0.705	0.17
23_V	290_A	0.705	0.17
395_E	404_E	0.704	0.17
532_G	646_V	0.703	0.17
121_S	294_L	0.701	0.17
381_G	384_A	0.700	0.17
251_T	255_L	0.698	0.17
566_D	584_D	0.696	0.17
123_S	587_T	0.696	0.17
37_A	62_L	0.694	0.17
134_F	333_D	0.694	0.17
260_D	641_E	0.694	0.17
405_A	415_G	0.693	0.17
661_D	664_D	0.693	0.17
323_R	586_P	0.691	0.17
358_A	400_P	0.690	0.17
389_P	393_Q	0.688	0.17
243_A	361_D	0.687	0.17
133_E	246_R	0.687	0.17
337_D	576_A	0.686	0.16
189_L	203_Q	0.685	0.16
464_T	473_R	0.685	0.16
406_G	423_A	0.685	0.16
43_D	293_T	0.682	0.16
182_T	327_D	0.681	0.16
191_G	203_Q	0.681	0.16
443_A	449_P	0.680	0.16
138_L	284_D	0.679	0.16
473_R	484_D	0.677	0.16
653_D	679_D	0.676	0.16
380_G	406_G	0.674	0.16
401_A	406_G	0.674	0.16
390_D	416_D	0.674	0.16
395_E	427_V	0.673	0.16
472_A	479_A	0.673	0.16
298_D	338_H	0.672	0.16
124_V	294_L	0.672	0.16
360_G	390_D	0.672	0.16
129_A	292_R	0.671	0.16
436_V	444_P	0.670	0.16
510_S	623_N	0.670	0.16
403_S	422_D	0.669	0.16
557_V	681_V	0.669	0.16
144_R	174_V	0.668	0.16
23_V	298_D	0.668	0.16
80_P	84_P	0.667	0.16
406_G	630_A	0.666	0.16
555_I	593_L	0.666	0.16
361_D	381_G	0.666	0.16
276_A	548_A	0.665	0.16
405_A	424_A	0.665	0.16
539_G	676_L	0.665	0.16
111_L	297_L	0.664	0.16
432_R	438_P	0.662	0.16
376_D	445_D	0.661	0.16
432_R	445_D	0.661	0.16
311_A	317_P	0.661	0.16
75_C	489_A	0.658	0.16
32_G	42_L	0.658	0.16
219_E	669_E	0.658	0.16
404_E	411_D	0.657	0.16
275_D	285_V	0.657	0.16
75_C	123_S	0.656	0.16
152_V	203_Q	0.655	0.16
182_T	222_D	0.655	0.16
168_A	202_P	0.654	0.16
380_G	388_G	0.653	0.16
171_V	182_T	0.653	0.16
193_M	591_T	0.653	0.16
384_A	439_G	0.652	0.16
333_D	388_G	0.652	0.16
301_P	634_T	0.652	0.16
132_A	477_E	0.651	0.16
163_L	600_A	0.651	0.16
262_P	502_V	0.650	0.16
356_D	417_D	0.650	0.16
401_A	424_A	0.650	0.16
27_D	30_K	0.649	0.16
489_A	573_D	0.649	0.16
250_V	258_D	0.649	0.16
380_G	409_P	0.648	0.15
523_A	558_V	0.645	0.15
409_P	415_G	0.644	0.15
65_L	178_G	0.644	0.15
327_D	580_R	0.644	0.15
546_R	586_P	0.642	0.15
436_V	447_D	0.641	0.15
567_V	606_R	0.641	0.15
664_D	680_R	0.638	0.15
358_A	361_D	0.637	0.15
260_D	305_E	0.637	0.15
352_A	420_T	0.637	0.15
231_L	681_V	0.636	0.15
260_D	444_P	0.636	0.15
100_E	408_D	0.633	0.15
125_T	606_R	0.632	0.15
159_L	273_C	0.632	0.15
99_V	256_L	0.630	0.15
34_L	225_E	0.630	0.15
121_S	677_S	0.629	0.15
456_G	462_S	0.628	0.15
123_S	589_D	0.627	0.15
392_S	427_V	0.626	0.15
405_A	410_T	0.626	0.15
396_G	410_T	0.626	0.15
269_I	273_C	0.625	0.15
98_P	355_S	0.624	0.15
298_D	538_K	0.623	0.15
81_P	127_A	0.623	0.15
439_G	446_A	0.622	0.15
149_V	156_D	0.622	0.15
51_K	59_A	0.622	0.15
375_P	382_A	0.621	0.15
599_A	669_E	0.619	0.15
635_A	638_A	0.618	0.15
401_A	411_D	0.618	0.15
158_H	202_P	0.618	0.15
478_R	617_V	0.617	0.15
376_D	380_G	0.617	0.15
402_D	430_Q	0.617	0.15
209_A	652_G	0.616	0.15
354_T	360_G	0.616	0.15
408_D	661_D	0.616	0.15
160_V	203_Q	0.616	0.15
542_L	560_F	0.615	0.15
161_D	278_V	0.615	0.15
281_H	489_A	0.614	0.15
466_S	501_A	0.614	0.15
119_V	132_A	0.614	0.15
272_L	644_A	0.613	0.15
115_R	589_D	0.613	0.15
21_P	242_T	0.612	0.15
457_D	465_P	0.612	0.15
112_G	289_R	0.612	0.15
595_A	631_A	0.612	0.15
535_R	578_A	0.611	0.15
351_D	394_S	0.610	0.15
298_D	323_R	0.610	0.15
146_I	523_A	0.610	0.15
348_E	415_G	0.609	0.15
217_S	489_A	0.609	0.15
427_V	432_R	0.608	0.15
27_D	544_L	0.608	0.15
83_D	91_C	0.608	0.15
438_P	449_P	0.608	0.15
59_A	106_F	0.608	0.15
106_F	124_V	0.608	0.15
305_E	662_I	0.607	0.14
414_R	428_P	0.606	0.14
210_L	547_D	0.606	0.14
134_F	507_L	0.605	0.14
432_R	436_V	0.604	0.14
61_A	616_V	0.603	0.14
243_A	353_E	0.603	0.14
113_A	273_C	0.602	0.14
473_R	491_V	0.602	0.14
126_D	614_V	0.602	0.14
165_D	284_D	0.602	0.14
442_V	449_P	0.601	0.14
35_A	294_L	0.601	0.14
294_L	482_A	0.600	0.14
552_R	574_S	0.600	0.14
419_D	431_P	0.598	0.14
521_V	534_M	0.598	0.14
148_Y	175_E	0.598	0.14
70_R	260_D	0.597	0.14
114_S	134_F	0.597	0.14
36_V	573_D	0.597	0.14
121_S	205_R	0.595	0.14
383_E	429_G	0.594	0.14
148_Y	176_R	0.592	0.14
601_D	639_L	0.592	0.14
121_S	171_V	0.592	0.14
287_T	670_R	0.591	0.14
621_Q	656_R	0.591	0.14
190_V	231_L	0.591	0.14
287_T	677_S	0.591	0.14
356_D	584_D	0.591	0.14
664_D	669_E	0.590	0.14
327_D	579_A	0.590	0.14
488_A	491_V	0.589	0.14
300_R	585_L	0.589	0.14
30_K	132_A	0.587	0.14
162_V	562_G	0.587	0.14
34_L	65_L	0.586	0.14
111_L	172_N	0.586	0.14
30_K	645_H	0.586	0.14
409_P	416_D	0.585	0.14
453_R	482_A	0.585	0.14
140_A	571_P	0.585	0.14
411_D	430_Q	0.584	0.14
398_Q	423_A	0.583	0.14
553_D	572_T	0.583	0.14
119_V	241_D	0.582	0.14
372_D	440_T	0.581	0.14
37_A	119_V	0.581	0.14
509_Q	595_A	0.581	0.14
361_D	410_T	0.580	0.14
354_T	407_D	0.579	0.14
209_A	234_F	0.578	0.14
422_D	440_T	0.578	0.14
460_R	464_T	0.578	0.14
381_G	406_G	0.578	0.14
208_F	318_H	0.578	0.14
167_A	203_Q	0.577	0.14
502_V	668_G	0.576	0.14
235_D	421_E	0.575	0.14
146_I	233_G	0.575	0.14
451_A	457_D	0.575	0.14
137_G	591_T	0.574	0.14
153_N	197_E	0.574	0.14
373_A	378_D	0.574	0.14
138_L	145_G	0.574	0.14
233_G	469_A	0.571	0.14
30_K	342_D	0.571	0.14
177_D	677_S	0.570	0.14
650_D	657_G	0.570	0.14
140_A	183_H	0.570	0.14
67_P	585_L	0.569	0.14
113_A	159_L	0.568	0.14
422_D	425_P	0.567	0.14
350_G	476_T	0.567	0.14
110_P	164_L	0.566	0.14
241_D	352_A	0.566	0.14
377_G	381_G	0.566	0.14
412_G	447_D	0.566	0.14
161_D	168_A	0.565	0.14
273_C	284_D	0.565	0.14
661_D	669_E	0.565	0.14
432_R	435_T	0.565	0.14
240_A	344_D	0.564	0.13
171_V	294_L	0.564	0.13
427_V	445_D	0.564	0.13
233_G	422_D	0.563	0.13
247_D	348_E	0.563	0.13
445_D	449_P	0.562	0.13
267_R	334_V	0.562	0.13
158_H	214_V	0.562	0.13
613_V	616_V	0.561	0.13
350_G	485_V	0.560	0.13
254_D	434_D	0.560	0.13
418_E	664_D	0.560	0.13
388_G	401_A	0.559	0.13
395_E	418_E	0.559	0.13
386_T	394_S	0.559	0.13
294_L	298_D	0.558	0.13
268_E	338_H	0.558	0.13
472_A	477_E	0.557	0.13
267_R	557_V	0.557	0.13
426_L	558_V	0.557	0.13
38_A	61_A	0.556	0.13
388_G	417_D	0.556	0.13
437_E	441_G	0.556	0.13
173_R	338_H	0.555	0.13
426_L	432_R	0.555	0.13
158_H	161_D	0.554	0.13
393_Q	412_G	0.554	0.13
590_R	597_L	0.553	0.13
402_D	414_R	0.551	0.13
415_G	434_D	0.551	0.13
118_V	482_A	0.551	0.13
243_A	352_A	0.551	0.13
420_T	443_A	0.551	0.13
123_S	561_A	0.550	0.13
481_P	484_D	0.550	0.13
415_G	418_E	0.550	0.13
132_A	509_Q	0.550	0.13
31_T	294_L	0.550	0.13
102_R	106_F	0.548	0.13
73_A	244_A	0.548	0.13
433_G	447_D	0.547	0.13
672_P	676_L	0.545	0.13
146_I	249_L	0.545	0.13
440_T	445_D	0.544	0.13
506_D	565_A	0.544	0.13
349_E	402_D	0.543	0.13
336_D	444_P	0.543	0.13
388_G	406_G	0.543	0.13
157_D	284_D	0.541	0.13
379_T	445_D	0.541	0.13
411_D	418_E	0.541	0.13
357_E	378_D	0.541	0.13
348_E	427_V	0.540	0.13
269_I	278_V	0.539	0.13
473_R	602_D	0.539	0.13
134_F	172_N	0.539	0.13
415_G	422_D	0.538	0.13
526_A	560_F	0.538	0.13
75_C	144_R	0.537	0.13
151_E	192_T	0.537	0.13
247_D	384_A	0.537	0.13
356_D	377_G	0.537	0.13
389_P	395_E	0.536	0.13
156_D	276_A	0.535	0.13
57_T	168_A	0.535	0.13
24_V	615_V	0.535	0.13
241_D	446_A	0.534	0.13
249_L	576_A	0.534	0.13
132_A	173_R	0.534	0.13
314_F	519_L	0.534	0.13
344_D	413_E	0.533	0.13
470_R	488_A	0.533	0.13
50_E	214_V	0.533	0.13
294_L	492_R	0.533	0.13
669_E	680_R	0.532	0.13
416_D	421_E	0.532	0.13
432_R	447_D	0.530	0.13
544_L	574_S	0.530	0.13
145_G	161_D	0.529	0.13
380_G	396_G	0.529	0.13
134_F	222_D	0.529	0.13
184_P	339_F	0.528	0.13
29_L	222_D	0.526	0.13
378_D	424_A	0.525	0.13
51_K	57_T	0.525	0.13
222_D	407_D	0.525	0.13
359_G	409_P	0.524	0.13
556_A	560_F	0.523	0.13
98_P	422_D	0.522	0.13
521_V	557_V	0.522	0.13
241_D	675_A	0.521	0.13
97_P	101_S	0.520	0.13
50_E	210_L	0.520	0.13
478_R	482_A	0.520	0.13
401_A	428_P	0.519	0.13
30_K	217_S	0.519	0.13
526_A	574_S	0.519	0.13
295_A	319_R	0.519	0.13
152_V	167_A	0.518	0.12
123_S	533_P	0.517	0.12
248_R	270_A	0.516	0.12
51_K	214_V	0.516	0.12
112_G	514_G	0.516	0.12
82_E	91_C	0.515	0.12
148_Y	153_N	0.515	0.12
225_E	228_D	0.514	0.12
374_E	415_G	0.514	0.12
241_D	584_D	0.514	0.12
439_G	451_A	0.514	0.12
153_N	195_P	0.514	0.12
386_T	416_D	0.513	0.12
357_E	429_G	0.512	0.12
110_P	180_S	0.511	0.12
486_D	623_N	0.511	0.12
290_A	558_V	0.511	0.12
412_G	418_E	0.509	0.12
354_T	361_D	0.509	0.12
549_Y	574_S	0.509	0.12
424_A	431_P	0.508	0.12
79_C	172_N	0.508	0.12
545_L	549_Y	0.507	0.12
145_G	157_D	0.507	0.12
78_G	583_K	0.506	0.12
148_Y	203_Q	0.506	0.12
429_G	640_A	0.506	0.12
500_D	681_V	0.505	0.12
47_V	162_V	0.505	0.12
407_D	419_D	0.505	0.12
32_G	483_D	0.504	0.12
403_S	418_E	0.504	0.12
26_Q	29_L	0.504	0.12
58_T	171_V	0.504	0.12
355_S	390_D	0.503	0.12
274_R	322_S	0.503	0.12
228_D	263_E	0.502	0.12
61_A	394_S	0.502	0.12
29_L	42_L	0.502	0.12
390_D	396_G	0.501	0.12
51_K	155_L	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1g8pA	1	0.4551	100	0.808	Contact Map
4ww4B	2	0.4377	100	0.837	Contact Map
4r7yA	3	0.4116	100	0.843	Contact Map
3ja83	1	0.4029	100	0.848	Contact Map
3ja82	1	0.4333	100	0.851	Contact Map
3f8tA	1	0.3667	100	0.855	Contact Map
2r44A	1	0.4377	100	0.857	Contact Map
3ja87	1	0.4116	100	0.858	Contact Map
3ja84	1	0.4145	100	0.866	Contact Map
3ja86	1	0.4029	100	0.868	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0157 seconds.