Q9HPJ0 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPJ0 - 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A synthase

UniProt:	Q9HPJ0	Sequences: MTSVGIDAIEIHTGKLKLDLAETFAPEMGDDPEKYTKGLGLHASSFPDAYEDIVTMGANAAHRLLERKGLEPADVGRIDVATESAFDNSKPVSTYIAGCLEQVYDGDFHHANKGERKFACIAGTQSLDDAVNWILAGRNRGRGALVIATDTALYARDSSGEATQGAGAVAMWITEDPDIVELSTEQGYGSADETDFLKPNQQFPSVDGKRSMQVYLARMRESLQDFERATGASHPDDYAFIPFHTPFPGMVRKAAVLGYRHMIRGTDIEEELAADIGRQPRRERFDSDDAFEDAISEYVDGLTDTDAYREWYDAAIQPTLSISSQVGNWYTGSVHLARFSALKHAAENGIDLAGKRLLVASYGSGAQAEIHSETVQDGFTEAVAASTIDEQIEQRYDISFAEYEQVHDRHNHEKSVELEPFTQPDAEFVFDGWGPMNERKYTYVE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	445 (423)
Sequences:	487 (269)
Seq/√Len:	13.1

HALSA - Q9HPJ0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
65_L	72_P	6.439	1.00
334_V	359_V	5.747	1.00
130_A	144_A	5.039	1.00
131_V	181_E	4.784	1.00
110_H	229_A	4.325	1.00
431_D	442_T	4.288	1.00
335_H	371_H	4.217	1.00
66_E	443_Y	4.004	1.00
53_I	149_T	3.989	1.00
17_K	397_D	3.745	0.99
434_G	438_E	3.534	0.99
419_E	432_G	3.442	0.99
111_A	145_L	3.368	0.98
42_H	324_S	3.330	0.98
339_F	386_S	3.180	0.98
77_R	129_D	3.081	0.97
128_D	369_E	3.076	0.97
63_R	67_R	2.866	0.96
98_G	192_D	2.865	0.96
387_T	390_E	2.784	0.95
356_R	372_S	2.542	0.92
342_L	383_V	2.498	0.91
60_A	168_A	2.452	0.90
182_L	374_T	2.432	0.90
62_H	66_E	2.408	0.89
3_S	176_D	2.404	0.89
123_G	361_S	2.402	0.89
191_A	217_A	2.392	0.89
179_I	373_E	2.386	0.89
7_D	403_Y	2.341	0.88
226_F	238_Y	2.303	0.87
127_L	173_I	2.286	0.87
290_A	293_D	2.272	0.86
8_A	172_W	2.268	0.86
404_E	407_H	2.144	0.83
28_M	157_D	2.136	0.82
43_A	325_Q	2.110	0.82
334_V	371_H	2.097	0.81
241_I	358_L	2.088	0.81
349_G	353_A	2.079	0.81
65_L	111_A	2.064	0.80
401_A	405_Q	2.062	0.80
132_N	138_R	2.060	0.80
227_E	264_R	2.052	0.80
130_A	148_A	2.015	0.78
148_A	368_A	2.009	0.78
306_D	309_R	1.960	0.76
81_A	122_A	1.936	0.76
21_A	32_P	1.923	0.75
134_I	173_I	1.919	0.75
54_V	92_V	1.914	0.75
19_D	43_A	1.863	0.73
103_V	108_F	1.853	0.72
163_T	395_R	1.848	0.72
222_S	370_I	1.837	0.71
56_M	78_I	1.822	0.71
42_H	325_Q	1.814	0.70
198_K	204_P	1.796	0.70
226_F	372_S	1.795	0.70
9_I	179_I	1.793	0.70
240_F	341_A	1.785	0.69
124_T	335_H	1.785	0.69
399_S	404_E	1.784	0.69
337_A	340_S	1.777	0.69
254_A	360_A	1.748	0.68
56_M	166_A	1.687	0.65
238_Y	358_L	1.680	0.64
16_L	48_D	1.651	0.63
71_E	74_D	1.646	0.63
354_G	384_A	1.629	0.62
26_P	32_P	1.626	0.62
127_L	335_H	1.622	0.62
7_D	143_G	1.622	0.62
381_E	385_A	1.618	0.61
70_L	337_A	1.613	0.61
18_L	41_L	1.591	0.60
3_S	376_Q	1.587	0.60
128_D	335_H	1.577	0.59
210_R	362_Y	1.571	0.59
299_V	303_T	1.568	0.59
153_L	407_H	1.557	0.58
432_G	440_K	1.540	0.57
408_D	412_H	1.526	0.57
167_G	215_Y	1.517	0.56
116_R	254_A	1.517	0.56
18_L	400_F	1.514	0.56
248_P	320_L	1.491	0.55
207_D	210_R	1.486	0.55
123_G	147_I	1.484	0.54
352_L	356_R	1.473	0.54
313_D	317_Q	1.467	0.54
358_L	370_I	1.463	0.53
72_P	111_A	1.462	0.53
225_D	228_R	1.440	0.52
68_K	385_A	1.435	0.52
399_S	402_E	1.423	0.51
163_T	211_S	1.409	0.51
291_F	295_I	1.408	0.50
188_Y	357_L	1.379	0.49
193_E	362_Y	1.363	0.48
25_A	33_E	1.362	0.48
115_E	190_S	1.349	0.47
310_E	314_A	1.338	0.47
68_K	307_A	1.334	0.47
217_A	292_E	1.332	0.47
375_V	378_G	1.314	0.46
144_A	167_G	1.310	0.45
82_T	92_V	1.308	0.45
325_Q	388_I	1.308	0.45
121_I	369_E	1.294	0.45
128_D	371_H	1.286	0.44
230_T	235_P	1.283	0.44
147_I	163_T	1.282	0.44
11_I	339_F	1.278	0.44
121_I	125_Q	1.278	0.44
156_R	404_E	1.270	0.43
67_R	391_Q	1.268	0.43
117_K	254_A	1.268	0.43
54_V	95_Y	1.254	0.42
9_I	355_K	1.245	0.42
357_L	375_V	1.238	0.42
103_V	107_D	1.236	0.42
311_W	436_M	1.234	0.41
316_I	341_A	1.227	0.41
205_S	436_M	1.220	0.41
3_S	145_L	1.219	0.41
47_P	406_V	1.218	0.41
28_M	35_Y	1.212	0.40
323_S	370_I	1.211	0.40
323_S	337_A	1.209	0.40
110_H	436_M	1.203	0.40
248_P	358_L	1.185	0.39
97_A	111_A	1.184	0.39
240_F	316_I	1.183	0.39
239_A	355_K	1.176	0.39
125_Q	162_A	1.172	0.38
356_R	374_T	1.159	0.38
156_R	415_S	1.155	0.38
415_S	431_D	1.154	0.37
332_G	368_A	1.152	0.37
5_G	14_G	1.151	0.37
189_G	221_E	1.145	0.37
70_L	368_A	1.139	0.37
223_L	226_F	1.138	0.37
242_P	334_V	1.136	0.37
94_T	369_E	1.126	0.36
81_A	129_D	1.121	0.36
77_R	249_G	1.119	0.36
65_L	412_H	1.118	0.36
242_P	319_T	1.117	0.36
53_I	92_V	1.115	0.36
182_L	185_E	1.114	0.36
147_I	169_V	1.114	0.36
189_G	358_L	1.113	0.35
250_M	254_A	1.109	0.35
79_D	129_D	1.105	0.35
61_A	100_L	1.104	0.35
93_S	113_K	1.095	0.35
247_F	252_R	1.077	0.34
146_V	169_V	1.074	0.34
221_E	225_D	1.071	0.33
166_A	190_S	1.069	0.33
267_D	297_E	1.066	0.33
58_A	95_Y	1.061	0.33
398_I	406_V	1.061	0.33
33_E	36_T	1.060	0.33
367_Q	375_V	1.052	0.33
259_Y	263_I	1.047	0.32
179_I	319_T	1.046	0.32
38_G	52_D	1.046	0.32
31_D	70_L	1.045	0.32
179_I	375_V	1.043	0.32
309_R	313_D	1.042	0.32
168_A	332_G	1.038	0.32
179_I	351_D	1.030	0.32
57_G	96_I	1.028	0.32
343_K	391_Q	1.026	0.31
323_S	336_L	1.026	0.31
60_A	317_Q	1.024	0.31
380_T	384_A	1.021	0.31
75_V	418_L	1.019	0.31
421_F	432_G	1.015	0.31
408_D	413_E	1.015	0.31
92_V	414_K	1.014	0.31
189_G	225_D	1.014	0.31
145_L	322_I	1.013	0.31
315_A	326_V	1.009	0.31
74_D	143_G	1.007	0.31
29_G	433_W	0.996	0.30
221_E	224_Q	0.995	0.30
72_P	403_Y	0.994	0.30
13_T	433_W	0.993	0.30
125_Q	371_H	0.993	0.30
60_A	332_G	0.989	0.30
213_Q	307_A	0.983	0.30
196_F	208_G	0.980	0.29
341_A	369_E	0.978	0.29
117_K	334_V	0.978	0.29
264_R	342_L	0.973	0.29
301_G	329_W	0.969	0.29
358_L	368_A	0.967	0.29
190_S	194_T	0.964	0.29
169_V	361_S	0.962	0.29
274_A	277_G	0.959	0.28
196_F	199_P	0.955	0.28
191_A	326_V	0.954	0.28
216_L	337_A	0.953	0.28
361_S	395_R	0.953	0.28
326_V	391_Q	0.952	0.28
275_D	393_E	0.951	0.28
416_V	428_F	0.948	0.28
84_S	149_T	0.943	0.28
403_Y	416_V	0.942	0.28
256_V	261_H	0.939	0.28
212_M	247_F	0.938	0.28
231_G	264_R	0.938	0.28
294_A	309_R	0.938	0.28
123_G	366_A	0.936	0.27
211_S	362_Y	0.933	0.27
148_A	331_T	0.933	0.27
39_L	52_D	0.931	0.27
247_F	250_M	0.927	0.27
24_F	41_L	0.924	0.27
132_N	335_H	0.922	0.27
11_I	404_E	0.920	0.27
156_R	408_D	0.917	0.27
216_L	312_Y	0.913	0.27
43_A	191_A	0.904	0.26
61_A	111_A	0.904	0.26
337_A	368_A	0.901	0.26
357_L	378_G	0.898	0.26
373_E	381_E	0.897	0.26
220_R	256_V	0.892	0.26
74_D	173_I	0.891	0.26
10_E	13_T	0.891	0.26
125_Q	369_E	0.888	0.26
161_E	164_Q	0.885	0.25
26_P	176_D	0.882	0.25
22_E	192_D	0.878	0.25
214_V	325_Q	0.878	0.25
25_A	38_G	0.877	0.25
123_G	169_V	0.877	0.25
266_T	273_A	0.875	0.25
275_D	279_Q	0.874	0.25
136_A	140_R	0.874	0.25
27_E	41_L	0.873	0.25
11_I	21_A	0.873	0.25
362_Y	365_G	0.872	0.25
326_V	388_I	0.872	0.25
183_S	229_A	0.868	0.25
63_R	69_G	0.863	0.25
209_K	415_S	0.861	0.24
147_I	361_S	0.860	0.24
312_Y	316_I	0.860	0.24
13_T	47_P	0.859	0.24
135_L	140_R	0.858	0.24
63_R	314_A	0.856	0.24
291_F	294_A	0.852	0.24
49_A	91_P	0.852	0.24
188_Y	369_E	0.851	0.24
114_G	134_I	0.851	0.24
417_E	433_W	0.850	0.24
24_F	28_M	0.844	0.24
13_T	67_R	0.843	0.24
188_Y	368_A	0.842	0.24
84_S	111_A	0.841	0.24
245_T	337_A	0.841	0.24
332_G	376_Q	0.840	0.24
273_A	276_I	0.836	0.24
115_E	329_W	0.836	0.24
238_Y	304_D	0.835	0.23
214_V	254_A	0.833	0.23
132_N	187_G	0.830	0.23
149_T	173_I	0.829	0.23
116_R	200_N	0.828	0.23
276_I	431_D	0.827	0.23
423_Q	435_P	0.822	0.23
92_V	95_Y	0.822	0.23
413_E	418_L	0.821	0.23
45_S	317_Q	0.819	0.23
144_A	151_T	0.819	0.23
76_G	133_W	0.818	0.23
86_F	307_A	0.817	0.23
112_N	128_D	0.813	0.23
190_S	367_Q	0.813	0.23
359_V	405_Q	0.812	0.23
19_D	47_P	0.811	0.23
358_L	376_Q	0.810	0.23
53_I	414_K	0.808	0.22
54_V	252_R	0.805	0.22
148_A	191_A	0.805	0.22
357_L	401_A	0.804	0.22
173_I	387_T	0.802	0.22
210_R	403_Y	0.801	0.22
216_L	407_H	0.801	0.22
98_G	116_R	0.799	0.22
418_L	425_D	0.798	0.22
168_A	199_P	0.798	0.22
127_L	205_S	0.798	0.22
48_D	316_I	0.797	0.22
155_A	339_F	0.795	0.22
171_M	224_Q	0.794	0.22
100_L	111_A	0.792	0.22
51_E	243_F	0.792	0.22
359_V	373_E	0.791	0.22
64_L	198_K	0.791	0.22
17_K	395_R	0.789	0.22
186_Q	395_R	0.786	0.22
125_Q	128_D	0.782	0.22
110_H	310_E	0.782	0.22
9_I	45_S	0.781	0.22
212_M	216_L	0.779	0.21
48_D	422_T	0.778	0.21
80_V	144_A	0.777	0.21
9_I	300_D	0.776	0.21
276_I	280_P	0.773	0.21
163_T	322_I	0.769	0.21
174_T	178_D	0.769	0.21
125_Q	168_A	0.769	0.21
218_R	366_A	0.768	0.21
210_R	252_R	0.767	0.21
236_D	436_M	0.765	0.21
370_I	416_V	0.765	0.21
216_L	225_D	0.762	0.21
116_R	125_Q	0.757	0.21
224_Q	368_A	0.755	0.21
264_R	383_V	0.755	0.21
222_S	254_A	0.753	0.21
320_L	362_Y	0.753	0.21
42_H	78_I	0.750	0.20
183_S	403_Y	0.750	0.20
195_D	199_P	0.748	0.20
65_L	74_D	0.747	0.20
21_A	351_D	0.746	0.20
145_L	291_F	0.745	0.20
342_L	408_D	0.745	0.20
277_G	280_P	0.744	0.20
312_Y	326_V	0.744	0.20
206_V	239_A	0.743	0.20
50_Y	91_P	0.742	0.20
243_F	371_H	0.739	0.20
61_A	145_L	0.737	0.20
74_D	326_V	0.733	0.20
379_F	382_A	0.731	0.20
21_A	237_D	0.731	0.20
169_V	265_G	0.730	0.20
94_T	358_L	0.729	0.20
38_G	44_S	0.728	0.20
415_S	440_K	0.728	0.20
24_F	38_G	0.728	0.20
378_G	422_T	0.727	0.20
65_L	405_Q	0.724	0.20
187_G	225_D	0.722	0.19
210_R	216_L	0.722	0.19
36_T	39_L	0.717	0.19
54_V	210_R	0.716	0.19
22_E	350_I	0.715	0.19
54_V	413_E	0.713	0.19
190_S	229_A	0.712	0.19
172_W	401_A	0.711	0.19
93_S	97_A	0.711	0.19
278_R	357_L	0.711	0.19
4_V	78_I	0.710	0.19
390_E	393_E	0.710	0.19
57_G	183_S	0.709	0.19
310_E	313_D	0.708	0.19
53_I	57_G	0.708	0.19
125_Q	443_Y	0.707	0.19
194_T	211_S	0.707	0.19
70_L	355_K	0.705	0.19
143_G	174_T	0.705	0.19
112_N	157_D	0.704	0.19
69_G	380_T	0.704	0.19
16_L	248_P	0.704	0.19
162_A	214_V	0.703	0.19
73_A	176_D	0.703	0.19
187_G	370_I	0.701	0.19
64_L	145_L	0.701	0.19
80_V	253_K	0.701	0.19
125_Q	247_F	0.701	0.19
292_E	435_P	0.696	0.19
222_S	360_A	0.696	0.19
114_G	360_A	0.696	0.19
199_P	364_S	0.695	0.19
259_Y	318_P	0.693	0.19
236_D	311_W	0.691	0.18
242_P	303_T	0.691	0.18
10_E	63_R	0.688	0.18
271_E	310_E	0.688	0.18
70_L	74_D	0.688	0.18
72_P	108_F	0.687	0.18
19_D	183_S	0.687	0.18
248_P	324_S	0.687	0.18
89_S	270_E	0.686	0.18
171_M	230_T	0.685	0.18
9_I	228_R	0.685	0.18
169_V	366_A	0.683	0.18
152_A	244_H	0.682	0.18
357_L	373_E	0.682	0.18
276_I	303_T	0.681	0.18
232_A	287_S	0.680	0.18
47_P	312_Y	0.680	0.18
75_V	239_A	0.678	0.18
61_A	148_A	0.676	0.18
49_A	96_I	0.675	0.18
304_D	358_L	0.673	0.18
32_P	306_D	0.671	0.18
310_E	387_T	0.669	0.18
287_S	336_L	0.668	0.18
53_I	82_T	0.668	0.18
179_I	416_V	0.667	0.18
4_V	230_T	0.666	0.18
209_K	325_Q	0.666	0.18
265_G	270_E	0.663	0.18
237_D	436_M	0.660	0.18
85_A	117_K	0.660	0.18
15_K	424_P	0.659	0.18
56_M	205_S	0.659	0.18
48_D	403_Y	0.658	0.17
127_L	432_G	0.658	0.17
272_L	337_A	0.658	0.17
56_M	404_E	0.657	0.17
303_T	443_Y	0.657	0.17
169_V	431_D	0.657	0.17
64_L	170_A	0.656	0.17
173_I	411_N	0.656	0.17
342_L	351_D	0.656	0.17
299_V	443_Y	0.655	0.17
110_H	125_Q	0.654	0.17
52_D	90_K	0.654	0.17
212_M	323_S	0.653	0.17
161_E	177_P	0.652	0.17
155_A	436_M	0.652	0.17
106_G	296_S	0.651	0.17
267_D	415_S	0.650	0.17
252_R	326_V	0.650	0.17
73_A	233_S	0.648	0.17
59_N	127_L	0.647	0.17
110_H	402_E	0.647	0.17
78_I	186_Q	0.646	0.17
63_R	387_T	0.645	0.17
277_G	407_H	0.644	0.17
421_F	437_N	0.644	0.17
36_T	41_L	0.644	0.17
117_K	322_I	0.643	0.17
61_A	374_T	0.642	0.17
163_T	186_Q	0.641	0.17
80_V	113_K	0.641	0.17
33_E	223_L	0.641	0.17
48_D	337_A	0.639	0.17
26_P	416_V	0.638	0.17
55_T	96_I	0.636	0.17
4_V	61_A	0.636	0.17
111_A	193_E	0.635	0.17
323_S	326_V	0.634	0.17
65_L	236_D	0.633	0.17
260_R	294_A	0.632	0.17
187_G	339_F	0.632	0.17
209_K	413_E	0.630	0.17
252_R	295_I	0.629	0.17
222_S	250_M	0.629	0.17
63_R	385_A	0.629	0.17
163_T	404_E	0.629	0.17
272_L	300_D	0.626	0.17
124_T	361_S	0.625	0.16
127_L	371_H	0.621	0.16
12_H	263_I	0.620	0.16
300_D	304_D	0.618	0.16
68_K	382_A	0.618	0.16
206_V	253_K	0.618	0.16
267_D	432_G	0.617	0.16
180_V	376_Q	0.616	0.16
329_W	332_G	0.616	0.16
79_D	222_S	0.616	0.16
309_R	323_S	0.615	0.16
216_L	250_M	0.614	0.16
232_A	288_D	0.612	0.16
148_A	322_I	0.611	0.16
425_D	437_N	0.610	0.16
143_G	172_W	0.610	0.16
4_V	65_L	0.610	0.16
27_E	404_E	0.609	0.16
15_K	332_G	0.609	0.16
334_V	367_Q	0.609	0.16
353_A	377_D	0.608	0.16
250_M	323_S	0.608	0.16
25_A	39_L	0.608	0.16
56_M	316_I	0.607	0.16
4_V	54_V	0.606	0.16
56_M	248_P	0.605	0.16
56_M	114_G	0.604	0.16
169_V	345_A	0.602	0.16
224_Q	275_D	0.601	0.16
127_L	419_E	0.601	0.16
134_I	433_W	0.599	0.16
131_V	271_E	0.599	0.16
45_S	332_G	0.598	0.16
394_Q	442_T	0.597	0.16
179_I	334_V	0.594	0.16
257_L	261_H	0.594	0.16
361_S	366_A	0.592	0.16
222_S	362_Y	0.592	0.16
395_R	400_F	0.592	0.16
94_T	336_L	0.591	0.16
69_G	404_E	0.589	0.15
408_D	433_W	0.588	0.15
171_M	335_H	0.586	0.15
314_A	388_I	0.585	0.15
67_R	331_T	0.584	0.15
424_P	431_D	0.583	0.15
131_V	432_G	0.583	0.15
94_T	125_Q	0.581	0.15
132_N	197_L	0.580	0.15
108_F	353_A	0.579	0.15
121_I	174_T	0.577	0.15
301_G	306_D	0.577	0.15
195_D	364_S	0.576	0.15
323_S	388_I	0.575	0.15
233_S	399_S	0.574	0.15
8_A	171_M	0.572	0.15
182_L	375_V	0.572	0.15
243_F	319_T	0.572	0.15
388_I	391_Q	0.570	0.15
68_K	316_I	0.570	0.15
164_Q	177_P	0.570	0.15
191_A	265_G	0.566	0.15
243_F	254_A	0.564	0.15
342_L	370_I	0.564	0.15
361_S	372_S	0.563	0.15
92_V	320_L	0.562	0.15
29_G	50_Y	0.562	0.15
375_V	433_W	0.560	0.15
194_T	197_L	0.560	0.15
240_F	387_T	0.559	0.15
199_P	215_Y	0.559	0.15
131_V	373_E	0.559	0.15
398_I	402_E	0.558	0.15
61_A	72_P	0.558	0.15
230_T	331_T	0.557	0.15
50_Y	429_V	0.555	0.15
293_D	401_A	0.555	0.15
211_S	215_Y	0.555	0.15
376_Q	387_T	0.555	0.15
35_Y	38_G	0.554	0.15
421_F	427_E	0.553	0.15
211_S	360_A	0.553	0.15
67_R	416_V	0.553	0.15
27_E	373_E	0.552	0.14
49_A	126_S	0.549	0.14
11_I	264_R	0.549	0.14
343_K	440_K	0.547	0.14
171_M	200_N	0.547	0.14
49_A	409_R	0.546	0.14
3_S	67_R	0.546	0.14
417_E	432_G	0.545	0.14
135_L	139_N	0.545	0.14
10_E	45_S	0.544	0.14
70_L	405_Q	0.544	0.14
309_R	314_A	0.544	0.14
92_V	410_H	0.543	0.14
4_V	72_P	0.541	0.14
166_A	342_L	0.541	0.14
412_H	419_E	0.541	0.14
119_A	246_P	0.540	0.14
83_E	246_P	0.540	0.14
83_E	119_A	0.540	0.14
20_L	395_R	0.538	0.14
240_F	417_E	0.538	0.14
214_V	362_Y	0.538	0.14
96_I	429_V	0.536	0.14
157_D	161_E	0.536	0.14
86_F	117_K	0.535	0.14
222_S	312_Y	0.532	0.14
8_A	46_F	0.532	0.14
22_E	386_S	0.531	0.14
414_K	420_P	0.531	0.14
209_K	247_F	0.530	0.14
359_V	381_E	0.530	0.14
431_D	440_K	0.529	0.14
349_G	379_F	0.528	0.14
16_L	19_D	0.525	0.14
190_S	262_M	0.523	0.14
412_H	436_M	0.523	0.14
383_V	391_Q	0.523	0.14
289_D	378_G	0.523	0.14
401_A	425_D	0.522	0.14
176_D	398_I	0.521	0.14
311_W	404_E	0.519	0.14
69_G	228_R	0.519	0.14
179_I	336_L	0.519	0.14
91_P	239_A	0.517	0.14
211_S	323_S	0.516	0.14
86_F	408_D	0.516	0.14
173_I	353_A	0.515	0.14
264_R	399_S	0.515	0.14
92_V	157_D	0.515	0.14
308_Y	351_D	0.515	0.14
59_N	332_G	0.514	0.14
298_Y	301_G	0.514	0.14
117_K	443_Y	0.514	0.14
74_D	383_V	0.513	0.14
85_A	413_E	0.512	0.13
274_A	387_T	0.511	0.13
243_F	362_Y	0.510	0.13
88_N	251_V	0.510	0.13
155_A	252_R	0.509	0.13
312_Y	336_L	0.509	0.13
43_A	437_N	0.509	0.13
202_Q	410_H	0.508	0.13
176_D	188_Y	0.508	0.13
240_F	296_S	0.508	0.13
148_A	267_D	0.508	0.13
63_R	391_Q	0.508	0.13
391_Q	402_E	0.508	0.13
26_P	61_A	0.507	0.13
382_A	394_Q	0.506	0.13
153_L	245_T	0.506	0.13
296_S	417_E	0.504	0.13
27_E	401_A	0.504	0.13
195_D	198_K	0.504	0.13
75_V	389_D	0.503	0.13
155_A	388_I	0.503	0.13
332_G	381_E	0.502	0.13
309_R	403_Y	0.502	0.13
426_A	443_Y	0.502	0.13
245_T	323_S	0.502	0.13
229_A	399_S	0.502	0.13
89_S	207_D	0.502	0.13
410_H	420_P	0.502	0.13
18_L	160_G	0.501	0.13
128_D	334_V	0.500	0.13
415_S	437_N	0.500	0.13
48_D	132_N	0.500	0.13
110_H	233_S	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2p8uA	2	0.9618	100	0.523	Contact Map
2wyaA	2	0.9618	100	0.524	Contact Map
2f82A	2	0.9596	100	0.53	Contact Map
1xpmA	2	0.8607	100	0.61	Contact Map
3sqzA	2	0.8629	100	0.616	Contact Map
3v4nA	2	0.8584	100	0.619	Contact Map
3il3A	2	0.6764	100	0.84	Contact Map
1u0mA	2	0.6809	100	0.843	Contact Map
3s21A	2	0.6652	100	0.843	Contact Map
4rybA	2	0.6787	100	0.845	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.012 seconds.