Q9HPI2 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HPI2 - Malate dehydrogenase

UniProt:	Q9HPI2	Sequences: MGLDDDALDYHASDPPGKVEISTTKPTNTQRDLSLAYSPGVAAPCRAIADDPTEAFTHTTKGNMVGVVSNGSAVLGLGDIGAQAAKPVMEGKGVLFKRFADIDVFDIELDQATADELVATVSAMEPTFGGINLEDIKAPECFEVERRLGDAMDVPVFHDDQHGTAIISGAALLNAAEIAGKDLSDLDVVFSGAGASAIATAKFYVSLGVDREHITMCDSSGVITEDRDVNEFKAAFAQPADSGGDLADAMAGADVFVGLSVGGIVNQAMVRSMADDPIVFAMANPDPEIDYESAKAAREDTVIMATGRSDYPNQVNNVLGFPFIFRGALDVRATDINEEMKVAAATALADLAKQDVPDEVVKAYGDQPLQFGSEYIIPKPLDPRVLFEVAPAVADAAMETGVARTELDLVDYREELEARLGKSREMMRIVINKAKSEQQRIALGEGGDEKMIRAAHQMHEAGIADPVLLGDRDTIQGTVDALSLDFDPDVVDPDEGDHSAYADTLYDLRKRKGITRNEAESLVARDPNYLGSTMVEAGDADAFLTGLTHHYPSALKPPLQVVGTAPDTDYVAGVYMLTFQNRVVFCADATVNQDPDADVLAEVAQHTADLARRFNVDPRVAVLSYSNFGSVDNEGTRKPRRAAQQLREDDDIDFPVDGEMQADTAVVEDILQGSYEFSDLDTAANVLIFPNLEAGNIGYKLLQRLGGADAIGPMLVGMNKPVHVLQRGDEVKDIVNLAAVAAADAQQRED	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	750 (738)
Sequences:	1161 (465)
Seq/√Len:	17.1

ECOLI - MAO2
HALSA - Q9HPI2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
79_D	112_A	7.470	1.00
441_I	542_A	6.827	1.00
188_V	209_V	6.629	1.00
225_E	239_P	5.445	1.00
117_L	121_V	4.652	1.00
47_A	50_D	4.463	1.00
182_D	185_D	4.403	1.00
523_V	533_T	4.305	1.00
292_E	311_Y	4.082	1.00
177_E	353_K	3.923	1.00
501_Y	534_M	3.701	1.00
395_D	399_E	3.646	1.00
501_Y	539_D	3.610	1.00
51_D	54_E	3.593	1.00
250_M	265_V	3.513	1.00
201_A	216_M	3.344	0.99
109_L	124_M	3.303	0.99
5_D	9_D	3.274	0.99
276_D	373_S	3.260	0.99
443_L	738_A	3.259	0.99
646_L	656_V	3.205	0.99
587_A	688_I	3.139	0.99
12_A	57_T	3.124	0.99
122_S	151_A	3.102	0.99
395_D	409_L	3.086	0.99
224_T	229_V	3.076	0.99
54_E	57_T	3.020	0.99
542_A	741_A	2.965	0.99
596_D	599_V	2.939	0.98
175_A	278_I	2.889	0.98
467_V	540_A	2.882	0.98
120_T	123_A	2.858	0.98
604_A	622_V	2.843	0.98
169_G	203_F	2.820	0.98
147_R	150_D	2.801	0.98
215_T	238_Q	2.789	0.98
294_A	297_A	2.784	0.98
116_E	119_A	2.774	0.98
262_G	286_D	2.704	0.97
641_R	644_Q	2.687	0.97
54_E	58_H	2.683	0.97
535_V	540_A	2.645	0.97
438_Q	742_A	2.626	0.97
202_K	235_A	2.597	0.97
472_R	492_D	2.591	0.96
667_V	704_R	2.522	0.96
267_Q	296_A	2.493	0.96
114_A	118_V	2.489	0.96
176_A	183_L	2.481	0.95
242_S	248_D	2.453	0.95
247_A	272_S	2.417	0.95
173_L	346_T	2.400	0.95
294_A	299_E	2.389	0.94
475_I	490_V	2.379	0.94
114_A	147_R	2.372	0.94
111_Q	116_E	2.365	0.94
647_R	656_V	2.356	0.94
115_D	118_V	2.355	0.94
268_A	271_R	2.345	0.94
442_A	535_V	2.335	0.94
398_M	406_E	2.333	0.94
202_K	236_F	2.327	0.94
531_G	543_F	2.315	0.93
117_L	144_V	2.267	0.93
21_I	93_G	2.237	0.92
19_V	93_G	2.233	0.92
458_M	738_A	2.217	0.92
698_G	701_L	2.213	0.92
657_D	679_D	2.213	0.92
125_E	153_D	2.209	0.92
137_K	140_E	2.208	0.92
111_Q	123_A	2.203	0.92
45_C	74_V	2.198	0.91
250_M	272_S	2.195	0.91
293_S	296_A	2.191	0.91
598_D	641_R	2.184	0.91
586_C	689_F	2.148	0.90
53_T	404_R	2.142	0.90
338_E	341_K	2.134	0.90
265_V	272_S	2.134	0.90
172_L	255_V	2.123	0.90
169_G	207_L	2.109	0.90
251_A	272_S	2.101	0.89
55_A	82_A	2.090	0.89
647_R	679_D	2.063	0.89
220_S	233_K	2.059	0.88
224_T	244_G	2.039	0.88
508_L	536_E	2.029	0.88
594_D	634_E	2.029	0.88
271_R	297_A	2.022	0.87
294_A	302_V	2.014	0.87
226_D	229_V	2.010	0.87
248_D	251_A	2.007	0.87
55_A	83_Q	2.007	0.87
222_V	240_A	2.003	0.87
443_L	458_M	2.001	0.87
219_S	261_V	1.995	0.87
558_P	722_V	1.990	0.87
600_L	642_A	1.980	0.86
109_L	123_A	1.979	0.86
146_R	150_D	1.966	0.86
220_S	228_D	1.944	0.85
594_D	638_K	1.941	0.85
431_I	739_A	1.940	0.85
184_S	210_D	1.938	0.85
186_L	209_V	1.909	0.84
623_L	697_I	1.898	0.84
286_D	290_D	1.893	0.84
354_Q	388_E	1.885	0.83
186_L	255_V	1.885	0.83
107_I	124_M	1.880	0.83
46_R	49_A	1.879	0.83
56_F	61_K	1.877	0.83
224_T	228_D	1.856	0.82
534_M	539_D	1.844	0.82
197_A	259_L	1.837	0.82
465_D	489_D	1.816	0.81
386_L	389_V	1.816	0.81
657_D	675_Y	1.813	0.81
118_V	147_R	1.804	0.81
331_V	398_M	1.803	0.81
600_L	639_P	1.800	0.80
469_L	531_G	1.790	0.80
215_T	249_A	1.780	0.80
442_A	540_A	1.780	0.80
93_G	104_V	1.761	0.79
124_M	152_M	1.760	0.79
121_V	144_V	1.758	0.79
267_Q	271_R	1.727	0.77
504_T	536_E	1.717	0.77
545_T	554_A	1.714	0.77
114_A	143_E	1.707	0.77
56_F	62_G	1.699	0.76
125_E	152_M	1.694	0.76
219_S	223_I	1.680	0.75
350_D	354_Q	1.674	0.75
52_P	83_Q	1.671	0.75
479_V	484_L	1.670	0.75
256_F	265_V	1.665	0.75
115_D	147_R	1.665	0.75
443_L	544_L	1.658	0.74
105_F	127_T	1.656	0.74
219_S	233_K	1.653	0.74
591_V	715_L	1.646	0.74
576_M	711_I	1.644	0.74
270_V	297_A	1.635	0.73
226_D	244_G	1.631	0.73
601_A	645_Q	1.631	0.73
116_E	120_T	1.630	0.73
206_S	338_E	1.618	0.73
109_L	117_L	1.600	0.72
339_E	399_E	1.597	0.72
337_N	400_T	1.594	0.71
198_I	219_S	1.586	0.71
574_V	716_V	1.583	0.71
460_E	485_D	1.577	0.71
147_R	151_A	1.576	0.71
270_V	279_V	1.575	0.71
198_I	230_N	1.574	0.70
8_L	47_A	1.571	0.70
295_K	304_M	1.557	0.70
441_I	738_A	1.554	0.69
168_S	204_Y	1.545	0.69
4_D	43_A	1.544	0.69
217_C	249_A	1.543	0.69
458_M	464_A	1.534	0.68
47_A	58_H	1.534	0.68
111_Q	117_L	1.533	0.68
113_T	116_E	1.532	0.68
604_A	686_V	1.528	0.68
205_V	236_F	1.525	0.68
267_Q	293_S	1.519	0.68
439_Q	742_A	1.514	0.67
286_D	293_S	1.509	0.67
44_P	58_H	1.497	0.66
442_A	534_M	1.497	0.66
225_E	234_A	1.494	0.66
344_A	389_V	1.485	0.66
729_D	733_D	1.481	0.66
209_V	214_I	1.468	0.65
293_S	297_A	1.462	0.65
104_V	127_T	1.461	0.65
223_I	233_K	1.455	0.64
585_F	611_A	1.446	0.64
190_F	201_A	1.442	0.63
350_D	353_K	1.426	0.63
586_C	702_L	1.425	0.63
172_L	278_I	1.422	0.62
172_L	280_F	1.420	0.62
207_L	342_V	1.417	0.62
602_E	649_D	1.413	0.62
290_D	293_S	1.406	0.61
111_Q	120_T	1.402	0.61
563_G	719_N	1.401	0.61
189_V	250_M	1.398	0.61
598_D	645_Q	1.390	0.61
725_L	734_I	1.374	0.60
245_D	248_D	1.362	0.59
399_E	409_L	1.348	0.58
655_P	681_D	1.345	0.58
457_Q	735_V	1.344	0.58
510_K	677_F	1.344	0.58
267_Q	270_V	1.340	0.58
240_A	244_G	1.339	0.58
464_A	738_A	1.338	0.58
178_I	376_I	1.333	0.57
270_V	293_S	1.333	0.57
190_F	216_M	1.325	0.57
646_L	654_F	1.300	0.55
562_V	719_N	1.297	0.55
211_R	238_Q	1.296	0.55
426_M	576_M	1.285	0.54
723_H	741_A	1.282	0.54
217_C	222_V	1.278	0.54
523_V	529_Y	1.276	0.54
443_L	464_A	1.274	0.54
622_V	646_L	1.273	0.54
219_S	262_G	1.272	0.54
187_D	410_V	1.268	0.53
252_G	275_D	1.267	0.53
230_N	233_K	1.263	0.53
612_R	617_D	1.261	0.53
573_G	590_T	1.254	0.53
199_A	205_V	1.252	0.52
9_D	13_S	1.251	0.52
215_T	222_V	1.247	0.52
111_Q	119_A	1.245	0.52
143_E	147_R	1.241	0.52
615_N	695_G	1.234	0.51
644_Q	648_E	1.231	0.51
504_T	537_A	1.230	0.51
222_V	245_D	1.228	0.51
175_A	280_F	1.222	0.51
531_G	722_V	1.221	0.51
111_Q	114_A	1.217	0.50
68_V	109_L	1.212	0.50
172_L	204_Y	1.212	0.50
231_E	234_A	1.209	0.50
197_A	216_M	1.200	0.49
153_D	334_T	1.196	0.49
668_E	672_Q	1.194	0.49
692_L	696_N	1.192	0.49
217_C	233_K	1.186	0.48
180_G	271_R	1.185	0.48
536_E	720_K	1.184	0.48
119_A	151_A	1.184	0.48
622_V	656_V	1.182	0.48
122_S	148_L	1.180	0.48
207_L	346_T	1.176	0.48
470_G	475_I	1.171	0.48
149_G	335_D	1.167	0.47
252_G	694_A	1.165	0.47
279_V	302_V	1.165	0.47
339_E	400_T	1.161	0.47
205_V	214_I	1.160	0.47
44_P	49_A	1.150	0.46
496_G	530_L	1.150	0.46
262_G	266_N	1.149	0.46
266_N	272_S	1.148	0.46
168_S	219_S	1.145	0.46
570_Y	599_V	1.145	0.46
619_R	655_P	1.142	0.46
492_D	495_E	1.139	0.46
492_D	530_L	1.138	0.46
44_P	54_E	1.132	0.45
265_V	294_A	1.131	0.45
130_G	193_A	1.129	0.45
198_I	223_I	1.126	0.45
620_V	686_V	1.123	0.45
197_A	692_L	1.122	0.45
332_R	405_T	1.122	0.45
559_L	571_V	1.122	0.45
643_A	647_R	1.115	0.44
714_M	737_L	1.113	0.44
203_F	345_A	1.111	0.44
295_K	373_S	1.110	0.44
600_L	622_V	1.109	0.44
188_V	214_I	1.108	0.44
535_V	705_L	1.107	0.44
645_Q	649_D	1.104	0.44
109_L	120_T	1.103	0.44
582_R	707_G	1.102	0.43
217_C	223_I	1.100	0.43
72_S	112_A	1.100	0.43
198_I	220_S	1.095	0.43
632_D	637_R	1.093	0.43
461_A	742_A	1.093	0.43
64_M	104_V	1.092	0.43
205_V	211_R	1.090	0.43
143_E	146_R	1.080	0.42
69_S	85_A	1.077	0.42
584_V	705_L	1.076	0.42
101_D	646_L	1.073	0.42
565_A	609_D	1.071	0.42
290_D	311_Y	1.068	0.41
597_A	601_A	1.067	0.41
476_Q	480_D	1.066	0.41
177_E	371_F	1.066	0.41
504_T	533_T	1.063	0.41
209_V	255_V	1.063	0.41
590_T	699_Y	1.062	0.41
479_V	486_F	1.061	0.41
442_A	467_V	1.057	0.41
671_L	682_T	1.057	0.41
662_A	697_I	1.054	0.41
265_V	410_V	1.054	0.41
453_R	730_E	1.047	0.40
216_M	230_N	1.045	0.40
631_V	636_T	1.045	0.40
669_D	673_G	1.042	0.40
507_D	510_K	1.036	0.40
176_A	186_L	1.034	0.39
201_A	214_I	1.032	0.39
14_D	107_I	1.030	0.39
270_V	294_A	1.026	0.39
169_G	209_V	1.025	0.39
438_Q	535_V	1.023	0.39
238_Q	249_A	1.018	0.39
303_I	376_I	1.017	0.39
291_Y	297_A	1.016	0.38
388_E	413_R	1.011	0.38
94_V	128_F	1.008	0.38
449_E	481_A	1.005	0.38
187_D	242_S	1.004	0.38
144_V	677_F	1.004	0.38
116_E	123_A	1.001	0.38
171_A	315_V	1.001	0.38
267_Q	297_A	0.997	0.37
528_N	545_T	0.992	0.37
571_V	718_M	0.991	0.37
574_V	610_L	0.989	0.37
572_A	592_N	0.985	0.37
168_S	282_M	0.985	0.37
472_R	476_Q	0.983	0.37
102_I	264_I	0.982	0.37
573_G	715_L	0.982	0.37
389_V	737_L	0.977	0.36
690_P	697_I	0.973	0.36
611_A	686_V	0.972	0.36
58_H	85_A	0.972	0.36
193_A	197_A	0.968	0.36
471_D	474_T	0.967	0.36
398_M	409_L	0.964	0.36
449_E	453_R	0.963	0.35
452_I	456_H	0.963	0.35
191_S	247_A	0.963	0.35
645_Q	648_E	0.962	0.35
655_P	680_L	0.961	0.35
215_T	240_A	0.961	0.35
492_D	499_S	0.958	0.35
601_A	646_L	0.956	0.35
220_S	223_I	0.956	0.35
510_K	675_Y	0.952	0.35
574_V	611_A	0.947	0.35
219_S	266_N	0.946	0.35
56_F	85_A	0.943	0.34
627_N	696_N	0.941	0.34
198_I	261_V	0.941	0.34
58_H	69_S	0.939	0.34
229_V	232_F	0.938	0.34
696_N	699_Y	0.937	0.34
247_A	250_M	0.937	0.34
68_V	117_L	0.936	0.34
263_G	293_S	0.936	0.34
55_A	342_V	0.933	0.34
226_D	240_A	0.929	0.34
295_K	299_E	0.927	0.34
664_T	670_I	0.927	0.34
222_V	249_A	0.924	0.33
9_D	731_V	0.921	0.33
614_F	736_N	0.919	0.33
66_G	69_S	0.916	0.33
219_S	269_M	0.914	0.33
592_N	603_V	0.914	0.33
460_E	493_P	0.914	0.33
543_F	555_L	0.911	0.33
282_M	305_A	0.909	0.33
188_V	257_V	0.909	0.33
267_Q	294_A	0.909	0.33
610_L	716_V	0.907	0.32
153_D	535_V	0.906	0.32
280_F	356_V	0.906	0.32
577_L	710_A	0.905	0.32
229_V	244_G	0.904	0.32
210_D	271_R	0.902	0.32
27_T	98_R	0.899	0.32
661_Q	728_G	0.898	0.32
119_A	122_S	0.896	0.32
280_F	305_A	0.893	0.32
647_R	654_F	0.891	0.32
320_G	324_I	0.890	0.32
481_A	530_L	0.889	0.32
410_V	413_R	0.888	0.31
198_I	216_M	0.883	0.31
222_V	244_G	0.883	0.31
642_A	646_L	0.882	0.31
496_G	499_S	0.882	0.31
617_D	655_P	0.880	0.31
165_A	318_V	0.880	0.31
178_I	303_I	0.879	0.31
551_Y	573_G	0.879	0.31
249_A	600_L	0.877	0.31
20_E	140_E	0.871	0.31
335_D	402_V	0.870	0.31
332_R	404_R	0.869	0.31
498_H	502_A	0.868	0.30
373_S	694_A	0.867	0.30
506_Y	510_K	0.864	0.30
217_C	264_I	0.862	0.30
99_F	381_L	0.861	0.30
386_L	688_I	0.861	0.30
625_Y	693_E	0.861	0.30
587_A	607_T	0.861	0.30
27_T	45_C	0.861	0.30
619_R	682_T	0.859	0.30
503_D	507_D	0.858	0.30
74_V	80_I	0.858	0.30
171_A	280_F	0.858	0.30
605_Q	646_L	0.857	0.30
197_A	377_I	0.856	0.30
45_C	80_I	0.856	0.30
529_Y	557_P	0.855	0.30
572_A	603_V	0.852	0.30
266_N	269_M	0.851	0.30
444_G	531_G	0.850	0.30
619_R	684_A	0.850	0.30
492_D	559_L	0.848	0.29
279_V	291_Y	0.848	0.29
442_A	473_D	0.846	0.29
597_A	641_R	0.844	0.29
206_S	342_V	0.844	0.29
467_V	489_D	0.844	0.29
191_S	264_I	0.841	0.29
278_I	305_A	0.840	0.29
450_K	695_G	0.840	0.29
47_A	109_L	0.838	0.29
140_E	702_L	0.837	0.29
202_K	205_V	0.836	0.29
344_A	359_E	0.835	0.29
257_V	282_M	0.834	0.29
167_I	323_F	0.831	0.29
225_E	229_V	0.831	0.29
501_Y	535_V	0.831	0.29
49_A	54_E	0.828	0.28
573_G	695_G	0.827	0.28
12_A	58_H	0.827	0.28
604_A	620_V	0.827	0.28
292_E	304_M	0.824	0.28
101_D	419_R	0.823	0.28
102_I	223_I	0.820	0.28
263_G	311_Y	0.819	0.28
337_N	707_G	0.818	0.28
140_E	323_F	0.817	0.28
625_Y	633_N	0.816	0.28
570_Y	592_N	0.813	0.28
605_Q	651_D	0.811	0.28
652_I	656_V	0.808	0.28
114_A	120_T	0.807	0.27
441_I	544_L	0.805	0.27
224_T	240_A	0.804	0.27
4_D	46_R	0.804	0.27
177_E	350_D	0.804	0.27
259_L	266_N	0.804	0.27
575_Y	590_T	0.804	0.27
512_K	632_D	0.803	0.27
623_L	696_N	0.802	0.27
248_D	437_E	0.802	0.27
15_P	20_E	0.799	0.27
34_S	101_D	0.798	0.27
255_V	689_F	0.798	0.27
663_D	703_Q	0.794	0.27
373_S	376_I	0.793	0.27
502_A	520_E	0.791	0.27
657_D	678_S	0.791	0.27
232_F	236_F	0.790	0.27
20_E	128_F	0.790	0.27
189_V	233_K	0.788	0.27
543_F	558_P	0.788	0.27
204_Y	291_Y	0.787	0.27
107_I	127_T	0.786	0.26
599_V	708_A	0.786	0.26
355_D	485_D	0.786	0.26
173_L	207_L	0.785	0.26
534_M	540_A	0.785	0.26
591_V	662_A	0.784	0.26
57_T	62_G	0.783	0.26
623_L	662_A	0.783	0.26
444_G	597_A	0.782	0.26
263_G	297_A	0.778	0.26
386_L	666_V	0.777	0.26
265_V	270_V	0.776	0.26
475_I	585_F	0.774	0.26
598_D	644_Q	0.773	0.26
93_G	196_S	0.772	0.26
263_G	286_D	0.770	0.26
34_S	678_S	0.769	0.26
93_G	105_F	0.769	0.26
572_A	716_V	0.767	0.26
278_I	667_V	0.767	0.26
215_T	242_S	0.766	0.26
342_V	346_T	0.766	0.26
432_N	435_K	0.765	0.25
118_V	144_V	0.764	0.25
60_T	617_D	0.764	0.25
214_I	374_E	0.763	0.25
381_L	536_E	0.763	0.25
622_V	639_P	0.763	0.25
459_H	486_F	0.762	0.25
51_D	334_T	0.761	0.25
114_A	137_K	0.760	0.25
613_R	711_I	0.759	0.25
117_L	151_A	0.759	0.25
510_K	657_D	0.758	0.25
581_N	584_V	0.758	0.25
570_Y	603_V	0.758	0.25
64_M	105_F	0.757	0.25
331_V	743_A	0.755	0.25
269_M	272_S	0.753	0.25
601_A	651_D	0.752	0.25
478_T	481_A	0.752	0.25
564_T	711_I	0.752	0.25
391_P	563_G	0.751	0.25
111_Q	147_R	0.751	0.25
64_M	127_T	0.749	0.25
53_T	734_I	0.749	0.25
637_R	641_R	0.748	0.25
31_R	640_R	0.746	0.25
47_A	54_E	0.746	0.25
140_E	469_L	0.745	0.25
643_A	646_L	0.745	0.25
46_R	50_D	0.745	0.25
66_G	112_A	0.744	0.25
535_V	600_L	0.743	0.25
699_Y	710_A	0.742	0.24
574_V	607_T	0.741	0.24
220_S	740_V	0.741	0.24
635_G	691_N	0.740	0.24
295_K	374_E	0.739	0.24
318_V	360_V	0.739	0.24
69_S	458_M	0.739	0.24
149_G	223_I	0.737	0.24
586_C	687_L	0.737	0.24
115_D	119_A	0.737	0.24
601_A	608_A	0.737	0.24
252_G	441_I	0.737	0.24
348_L	389_V	0.734	0.24
46_R	55_A	0.734	0.24
167_I	377_I	0.734	0.24
179_A	376_I	0.734	0.24
600_L	603_V	0.733	0.24
500_A	537_A	0.732	0.24
350_D	388_E	0.731	0.24
598_D	601_A	0.731	0.24
191_S	217_C	0.730	0.24
522_L	525_R	0.730	0.24
623_L	690_P	0.729	0.24
426_M	714_M	0.729	0.24
484_L	574_V	0.728	0.24
55_A	61_K	0.728	0.24
175_A	266_N	0.728	0.24
29_T	56_F	0.727	0.24
458_M	463_I	0.727	0.24
558_P	718_M	0.726	0.24
223_I	229_V	0.724	0.24
23_T	592_N	0.724	0.24
344_A	576_M	0.723	0.24
564_T	571_V	0.723	0.24
491_V	534_M	0.721	0.24
204_Y	209_V	0.721	0.24
404_R	452_I	0.720	0.23
529_Y	722_V	0.719	0.23
94_V	168_S	0.719	0.23
469_L	622_V	0.718	0.23
171_A	733_D	0.718	0.23
448_D	517_N	0.718	0.23
490_V	497_D	0.717	0.23
66_G	374_E	0.715	0.23
344_A	415_E	0.713	0.23
111_Q	121_V	0.713	0.23
44_P	57_T	0.709	0.23
323_F	379_K	0.708	0.23
60_T	702_L	0.706	0.23
428_R	724_V	0.705	0.23
23_T	669_D	0.705	0.23
420_L	640_R	0.705	0.23
324_I	439_Q	0.704	0.23
334_T	404_R	0.703	0.23
268_A	272_S	0.703	0.23
50_D	109_L	0.700	0.23
191_S	266_N	0.700	0.23
21_I	143_E	0.698	0.23
278_I	303_I	0.698	0.23
361_V	688_I	0.698	0.23
175_A	179_A	0.698	0.23
578_T	619_R	0.697	0.23
270_V	290_D	0.695	0.22
400_T	688_I	0.694	0.22
210_D	414_E	0.694	0.22
263_G	290_D	0.693	0.22
110_D	128_F	0.693	0.22
445_E	600_L	0.693	0.22
600_L	646_L	0.691	0.22
27_T	94_V	0.690	0.22
113_T	117_L	0.690	0.22
5_D	577_L	0.690	0.22
197_A	266_N	0.690	0.22
34_S	282_M	0.690	0.22
181_K	598_D	0.690	0.22
608_A	654_F	0.688	0.22
542_A	745_A	0.688	0.22
494_D	530_L	0.688	0.22
625_Y	661_Q	0.687	0.22
195_A	233_K	0.686	0.22
115_D	567_D	0.686	0.22
519_A	714_M	0.685	0.22
176_A	181_K	0.685	0.22
27_T	74_V	0.685	0.22
294_A	304_M	0.685	0.22
529_Y	561_V	0.685	0.22
82_A	111_Q	0.684	0.22
569_D	688_I	0.683	0.22
189_V	379_K	0.683	0.22
228_D	711_I	0.683	0.22
187_D	211_R	0.682	0.22
188_V	199_A	0.681	0.22
168_S	266_N	0.681	0.22
282_M	357_P	0.680	0.22
661_Q	696_N	0.679	0.22
263_G	292_E	0.679	0.22
501_Y	540_A	0.678	0.22
241_D	275_D	0.678	0.22
114_A	117_L	0.678	0.22
619_R	668_E	0.677	0.22
82_A	183_L	0.677	0.22
45_C	49_A	0.677	0.22
183_L	209_V	0.676	0.22
105_F	207_L	0.675	0.22
60_T	262_G	0.675	0.22
121_V	708_A	0.674	0.22
625_Y	692_L	0.674	0.22
55_A	441_I	0.673	0.22
626_S	629_G	0.672	0.21
248_D	367_Q	0.671	0.21
44_P	130_G	0.671	0.21
114_A	344_A	0.671	0.21
562_V	718_M	0.670	0.21
69_S	207_L	0.670	0.21
167_I	439_Q	0.669	0.21
168_S	223_I	0.668	0.21
85_A	634_E	0.667	0.21
175_A	639_P	0.666	0.21
229_V	233_K	0.666	0.21
176_A	257_V	0.666	0.21
347_A	654_F	0.665	0.21
503_D	510_K	0.664	0.21
196_S	219_S	0.664	0.21
506_Y	677_F	0.664	0.21
664_T	700_K	0.663	0.21
105_F	694_A	0.663	0.21
545_T	737_L	0.661	0.21
474_T	478_T	0.660	0.21
116_E	122_S	0.659	0.21
296_A	544_L	0.658	0.21
481_A	492_D	0.657	0.21
371_F	434_A	0.656	0.21
473_D	494_D	0.655	0.21
69_S	82_A	0.655	0.21
596_D	724_V	0.654	0.21
547_L	734_I	0.654	0.21
168_S	198_I	0.654	0.21
197_A	230_N	0.653	0.21
19_V	64_M	0.652	0.21
585_F	616_V	0.652	0.21
46_R	58_H	0.651	0.21
187_D	222_V	0.651	0.21
172_L	186_L	0.651	0.21
369_L	575_Y	0.651	0.21
477_G	543_F	0.651	0.21
198_I	217_C	0.650	0.21
441_I	741_A	0.650	0.21
536_E	711_I	0.650	0.21
47_A	255_V	0.649	0.21
16_P	259_L	0.649	0.21
93_G	302_V	0.648	0.21
94_V	98_R	0.647	0.20
348_L	512_K	0.647	0.20
444_G	455_A	0.646	0.20
463_I	483_S	0.646	0.20
189_V	203_F	0.646	0.20
255_V	353_K	0.646	0.20
505_L	514_I	0.646	0.20
93_G	551_Y	0.646	0.20
79_D	220_S	0.645	0.20
146_R	231_E	0.643	0.20
259_L	721_P	0.643	0.20
500_A	539_D	0.643	0.20
187_D	250_M	0.642	0.20
332_R	554_A	0.642	0.20
433_K	499_S	0.641	0.20
223_I	602_E	0.641	0.20
296_A	413_R	0.641	0.20
191_S	197_A	0.641	0.20
180_G	695_G	0.641	0.20
27_T	435_K	0.641	0.20
278_I	356_V	0.640	0.20
225_E	296_A	0.639	0.20
657_D	680_L	0.638	0.20
410_V	462_G	0.638	0.20
256_F	407_L	0.637	0.20
21_I	104_V	0.636	0.20
19_V	729_D	0.635	0.20
540_A	724_V	0.634	0.20
127_T	345_A	0.634	0.20
353_K	694_A	0.634	0.20
182_D	210_D	0.633	0.20
207_L	262_G	0.633	0.20
390_A	705_L	0.632	0.20
631_V	693_E	0.631	0.20
315_V	697_I	0.631	0.20
502_A	530_L	0.630	0.20
348_L	373_S	0.630	0.20
224_T	234_A	0.629	0.20
355_D	544_L	0.629	0.20
501_Y	537_A	0.629	0.20
434_A	452_I	0.628	0.20
274_A	300_D	0.628	0.20
118_V	535_V	0.628	0.20
452_I	478_T	0.628	0.20
15_P	415_E	0.627	0.20
548_T	573_G	0.626	0.20
387_F	391_P	0.626	0.20
435_K	446_G	0.626	0.20
573_G	589_A	0.625	0.20
270_V	299_E	0.625	0.20
481_A	496_G	0.625	0.20
606_H	610_L	0.625	0.20
202_K	232_F	0.624	0.20
334_T	599_V	0.624	0.20
564_T	576_M	0.623	0.20
46_R	526_D	0.623	0.20
534_M	731_V	0.623	0.20
544_L	724_V	0.621	0.19
271_R	279_V	0.621	0.19
149_G	199_A	0.620	0.19
181_K	186_L	0.620	0.19
323_F	501_Y	0.620	0.19
593_Q	634_E	0.619	0.19
276_D	302_V	0.619	0.19
199_A	223_I	0.619	0.19
509_R	699_Y	0.619	0.19
197_A	203_F	0.619	0.19
435_K	688_I	0.619	0.19
34_S	324_I	0.619	0.19
118_V	599_V	0.619	0.19
187_D	264_I	0.619	0.19
248_D	259_L	0.618	0.19
414_E	480_D	0.618	0.19
190_F	193_A	0.617	0.19
236_F	600_L	0.616	0.19
635_G	693_E	0.616	0.19
146_R	232_F	0.616	0.19
715_L	724_V	0.615	0.19
557_P	560_Q	0.615	0.19
241_D	248_D	0.615	0.19
485_D	661_Q	0.614	0.19
455_A	458_M	0.614	0.19
93_G	143_E	0.613	0.19
320_G	332_R	0.613	0.19
451_M	615_N	0.613	0.19
107_I	395_D	0.612	0.19
168_S	220_S	0.611	0.19
627_N	664_T	0.611	0.19
119_A	147_R	0.609	0.19
238_Q	242_S	0.609	0.19
217_C	250_M	0.609	0.19
559_L	590_T	0.608	0.19
472_R	498_H	0.608	0.19
55_A	581_N	0.606	0.19
604_A	646_L	0.606	0.19
79_D	110_D	0.606	0.19
504_T	507_D	0.605	0.19
503_D	516_R	0.605	0.19
101_D	420_L	0.604	0.19
122_S	147_R	0.604	0.19
509_R	557_P	0.603	0.19
21_I	675_Y	0.603	0.19
178_I	199_A	0.603	0.19
4_D	47_A	0.602	0.19
183_L	323_F	0.602	0.19
85_A	184_S	0.602	0.19
544_L	737_L	0.602	0.19
619_R	671_L	0.601	0.19
109_L	121_V	0.601	0.19
574_V	606_H	0.601	0.19
178_I	232_F	0.601	0.19
16_P	203_F	0.600	0.19
176_A	255_V	0.600	0.19
725_L	737_L	0.599	0.19
118_V	373_S	0.598	0.19
149_G	338_E	0.598	0.19
459_H	466_P	0.597	0.19
109_L	604_A	0.596	0.19
130_G	167_I	0.595	0.19
459_H	734_I	0.595	0.19
455_A	605_Q	0.595	0.19
292_E	295_K	0.594	0.19
389_V	715_L	0.594	0.19
691_N	699_Y	0.594	0.19
173_L	432_N	0.594	0.19
526_D	675_Y	0.593	0.18
391_P	562_V	0.593	0.18
259_L	744_D	0.593	0.18
265_V	731_V	0.592	0.18
370_Q	544_L	0.592	0.18
29_T	249_A	0.592	0.18
146_R	248_D	0.591	0.18
542_A	692_L	0.591	0.18
515_T	630_S	0.590	0.18
450_K	547_L	0.589	0.18
451_M	547_L	0.588	0.18
21_I	544_L	0.588	0.18
8_L	189_V	0.588	0.18
565_A	606_H	0.588	0.18
105_F	345_A	0.587	0.18
319_L	348_L	0.587	0.18
460_E	730_E	0.586	0.18
296_A	371_F	0.586	0.18
320_G	348_L	0.586	0.18
443_L	463_I	0.586	0.18
473_D	495_E	0.585	0.18
223_I	667_V	0.584	0.18
603_V	606_H	0.583	0.18
443_L	707_G	0.583	0.18
430_V	667_V	0.582	0.18
43_A	46_R	0.582	0.18
62_G	66_G	0.582	0.18
447_G	492_D	0.581	0.18
389_V	440_R	0.581	0.18
386_L	553_S	0.580	0.18
447_G	684_A	0.580	0.18
54_E	85_A	0.580	0.18
217_C	220_S	0.579	0.18
725_L	742_A	0.579	0.18
187_D	215_T	0.578	0.18
66_G	304_M	0.577	0.18
219_S	264_I	0.577	0.18
104_V	345_A	0.577	0.18
358_D	706_G	0.576	0.18
410_V	739_A	0.576	0.18
72_S	79_D	0.575	0.18
250_M	551_Y	0.575	0.18
585_F	614_F	0.575	0.18
512_K	640_R	0.574	0.18
532_S	558_P	0.574	0.18
467_V	616_V	0.573	0.18
297_A	634_E	0.573	0.18
435_K	564_T	0.572	0.18
324_I	390_A	0.572	0.18
483_S	663_D	0.572	0.18
463_I	509_R	0.571	0.18
250_M	256_F	0.571	0.18
20_E	336_I	0.571	0.18
398_M	565_A	0.571	0.18
93_G	178_I	0.570	0.18
124_M	153_D	0.570	0.18
291_Y	295_K	0.570	0.18
44_P	557_P	0.569	0.18
20_E	580_Q	0.569	0.18
111_Q	151_A	0.569	0.18
118_V	276_D	0.569	0.18
441_I	724_V	0.569	0.18
169_G	239_P	0.568	0.18
172_L	209_V	0.568	0.18
191_S	701_L	0.568	0.18
197_A	324_I	0.567	0.18
204_Y	257_V	0.567	0.18
594_D	696_N	0.566	0.18
121_V	646_L	0.566	0.18
150_D	430_V	0.566	0.18
38_S	527_P	0.566	0.18
128_F	259_L	0.565	0.17
223_I	238_Q	0.563	0.17
5_D	245_D	0.563	0.17
199_A	395_D	0.563	0.17
472_R	481_A	0.562	0.17
418_A	510_K	0.562	0.17
678_S	681_D	0.562	0.17
515_T	561_V	0.562	0.17
635_G	639_P	0.561	0.17
421_G	709_D	0.561	0.17
608_A	612_R	0.561	0.17
146_R	202_K	0.561	0.17
220_S	681_D	0.561	0.17
224_T	238_Q	0.560	0.17
390_A	414_E	0.560	0.17
110_D	386_L	0.559	0.17
191_S	389_V	0.559	0.17
85_A	315_V	0.559	0.17
344_A	360_V	0.559	0.17
156_V	282_M	0.559	0.17
188_V	204_Y	0.559	0.17
60_T	500_A	0.558	0.17
590_T	686_V	0.558	0.17
391_P	737_L	0.558	0.17
286_D	302_V	0.558	0.17
248_D	603_V	0.557	0.17
280_F	376_I	0.556	0.17
66_G	339_E	0.556	0.17
592_N	702_L	0.556	0.17
386_L	415_E	0.556	0.17
200_T	456_H	0.556	0.17
294_A	354_Q	0.556	0.17
538_G	720_K	0.555	0.17
178_I	181_K	0.555	0.17
279_V	297_A	0.554	0.17
331_V	399_E	0.554	0.17
69_S	173_L	0.554	0.17
94_V	125_E	0.553	0.17
4_D	526_D	0.553	0.17
502_A	516_R	0.553	0.17
82_A	426_M	0.553	0.17
312_P	319_L	0.553	0.17
188_V	255_V	0.552	0.17
49_A	82_A	0.552	0.17
291_Y	302_V	0.551	0.17
279_V	684_A	0.551	0.17
38_S	323_F	0.551	0.17
450_K	673_G	0.551	0.17
68_V	102_I	0.551	0.17
695_G	729_D	0.551	0.17
398_M	407_L	0.550	0.17
19_V	409_L	0.550	0.17
344_A	734_I	0.550	0.17
266_N	271_R	0.549	0.17
109_L	367_Q	0.548	0.17
110_D	405_T	0.548	0.17
348_L	583_V	0.547	0.17
335_D	612_R	0.547	0.17
261_V	265_V	0.547	0.17
190_F	574_V	0.547	0.17
555_L	591_V	0.546	0.17
236_F	667_V	0.546	0.17
167_I	354_Q	0.546	0.17
536_E	561_V	0.545	0.17
222_V	270_V	0.544	0.17
214_I	230_N	0.544	0.17
202_K	264_I	0.544	0.17
276_D	296_A	0.544	0.17
94_V	151_A	0.543	0.17
702_L	707_G	0.543	0.17
26_P	501_Y	0.543	0.17
21_I	105_F	0.543	0.17
220_S	261_V	0.543	0.17
315_V	623_L	0.543	0.17
44_P	56_F	0.543	0.17
171_A	510_K	0.542	0.17
82_A	146_R	0.542	0.17
143_E	220_S	0.542	0.17
723_H	743_A	0.541	0.17
320_G	419_R	0.541	0.17
579_F	582_R	0.541	0.17
57_T	443_L	0.541	0.17
157_F	279_V	0.541	0.17
217_C	561_V	0.540	0.17
50_D	542_A	0.539	0.17
591_V	614_F	0.539	0.17
600_L	738_A	0.539	0.17
214_I	236_F	0.539	0.17
12_A	339_E	0.539	0.17
261_V	266_N	0.538	0.17
250_M	270_V	0.538	0.17
184_S	487_D	0.538	0.17
364_Y	379_K	0.538	0.17
520_E	530_L	0.538	0.17
497_D	502_A	0.536	0.16
608_A	645_Q	0.536	0.16
434_A	743_A	0.535	0.16
425_E	428_R	0.535	0.16
363_A	384_R	0.535	0.16
245_D	295_K	0.534	0.16
72_S	140_E	0.533	0.16
369_L	379_K	0.532	0.16
385_V	727_R	0.532	0.16
262_G	443_L	0.532	0.16
79_D	656_V	0.531	0.16
53_T	332_R	0.531	0.16
183_L	353_K	0.531	0.16
212_E	238_Q	0.530	0.16
335_D	339_E	0.530	0.16
199_A	202_K	0.530	0.16
186_L	280_F	0.529	0.16
125_E	434_A	0.529	0.16
610_L	700_K	0.529	0.16
216_M	219_S	0.529	0.16
604_A	656_V	0.529	0.16
266_N	491_V	0.528	0.16
38_S	666_V	0.528	0.16
721_P	744_D	0.528	0.16
361_V	453_R	0.527	0.16
601_A	617_D	0.527	0.16
586_C	647_R	0.527	0.16
27_T	124_M	0.527	0.16
27_T	386_L	0.526	0.16
674_S	706_G	0.526	0.16
491_V	740_V	0.526	0.16
197_A	562_V	0.525	0.16
627_N	728_G	0.525	0.16
280_F	357_P	0.525	0.16
149_G	492_D	0.525	0.16
278_I	411_D	0.525	0.16
202_K	297_A	0.524	0.16
115_D	620_V	0.524	0.16
668_E	684_A	0.524	0.16
540_A	543_F	0.524	0.16
359_E	383_P	0.524	0.16
499_S	520_E	0.523	0.16
116_E	252_G	0.523	0.16
118_V	250_M	0.523	0.16
443_L	587_A	0.522	0.16
171_A	568_T	0.522	0.16
694_A	697_I	0.522	0.16
99_F	319_L	0.522	0.16
19_V	701_L	0.522	0.16
38_S	614_F	0.522	0.16
346_T	714_M	0.520	0.16
109_L	115_D	0.520	0.16
492_D	536_E	0.520	0.16
473_D	492_D	0.519	0.16
509_R	661_Q	0.518	0.16
446_G	452_I	0.518	0.16
443_L	693_E	0.518	0.16
168_S	297_A	0.517	0.16
180_G	252_G	0.517	0.16
94_V	99_F	0.516	0.16
395_D	651_D	0.516	0.16
473_D	477_G	0.516	0.16
514_I	519_A	0.516	0.16
584_V	611_A	0.515	0.16
564_T	724_V	0.515	0.16
369_L	586_C	0.515	0.16
311_Y	374_E	0.515	0.16
489_D	567_D	0.514	0.16
567_D	599_V	0.514	0.16
187_D	214_I	0.514	0.16
687_L	701_L	0.513	0.16
51_D	120_T	0.513	0.16
586_C	652_I	0.513	0.16
34_S	315_V	0.513	0.16
556_K	735_V	0.513	0.16
610_L	686_V	0.513	0.16
356_V	521_S	0.512	0.16
575_Y	699_Y	0.512	0.16
555_L	724_V	0.512	0.16
120_T	152_M	0.512	0.16
252_G	299_E	0.512	0.16
118_V	503_D	0.511	0.16
672_Q	681_D	0.511	0.16
445_E	547_L	0.511	0.16
128_F	168_S	0.511	0.16
13_S	57_T	0.511	0.16
173_L	262_G	0.510	0.16
55_A	453_R	0.510	0.16
381_L	615_N	0.510	0.16
323_F	633_N	0.510	0.16
557_P	699_Y	0.510	0.16
558_P	575_Y	0.510	0.16
533_T	537_A	0.510	0.16
98_R	376_I	0.510	0.16
338_E	438_Q	0.510	0.16
296_A	339_E	0.510	0.16
110_D	117_L	0.509	0.16
55_A	450_K	0.509	0.16
614_F	723_H	0.509	0.16
376_I	503_D	0.508	0.16
457_Q	730_E	0.508	0.16
385_V	666_V	0.507	0.16
467_V	599_V	0.507	0.16
188_V	460_E	0.507	0.16
261_V	297_A	0.506	0.16
315_V	423_S	0.506	0.16
270_V	345_A	0.506	0.16
232_F	323_F	0.506	0.16
157_F	355_D	0.506	0.16
282_M	516_R	0.505	0.15
547_L	729_D	0.504	0.15
415_E	543_F	0.504	0.15
49_A	573_G	0.503	0.15
279_V	292_E	0.503	0.15
57_T	405_T	0.503	0.15
673_G	711_I	0.503	0.15
233_K	740_V	0.503	0.15
46_R	74_V	0.503	0.15
175_A	439_Q	0.502	0.15
251_A	376_I	0.502	0.15
115_D	505_L	0.502	0.15
261_V	348_L	0.502	0.15
43_A	656_V	0.501	0.15
295_K	302_V	0.501	0.15
249_A	293_S	0.501	0.15
348_L	390_A	0.501	0.15
409_L	551_Y	0.501	0.15
29_T	357_P	0.500	0.15
173_L	617_D	0.500	0.15
178_I	239_P	0.500	0.15
29_T	445_E	0.500	0.15
635_G	728_G	0.500	0.15
509_R	726_Q	0.500	0.15

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3nv9A	2	0.5827	100	0.599	Contact Map
1vl6A	4	0.4933	100	0.654	Contact Map
1pj3A	4	0.536	100	0.665	Contact Map
1gq2A	6	0.5453	100	0.666	Contact Map
1o0sA	4	0.5613	100	0.666	Contact Map
2dvmA	2	0.5653	100	0.69	Contact Map
2a9fA	2	0.5013	100	0.691	Contact Map
4e4rA	2	0.432	100	0.826	Contact Map
1td9A	3	0.428	100	0.833	Contact Map
1r5jA	4	0.428	100	0.836	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0175 seconds.