CDCH - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

CDCH - Protein CdcH

UniProt:	Q9HPF0	Sequences: MNEVQLEVAKAYPNDSGRGIARLDPDTLLHLKLSPGDIIEIEGAETTAAKVWRADRQDWNTDTIRIDGFTRQNAEVGIGERVKIRKADAEKADTLVLAPPEEASVQFGSDAAGMVKRQILKRPVVARDIVPVMSSTNHPFMRSPGQAIPLIAVETEPEGVCLVTEDTDVELREEPISGFERTGGGITYEDIGGLENEIQRVREMVELPMKHPQIFQKLGIEPPQGVLLHGPPGTGKTLLAKAVANETSASFFSIAGPEIISKYYGESEQQLREIFEDAKDDSPSIIFIDELDSIAPKREDVTGEVERRVVAQLLTMMDGLEGRGQVIVIAATNRVDAVDPALRRPGRFDREIEIGVPDEIGREEILKIHTRGMPLSDDVNLSTLADDTHGFVGADIESLSKEAAMRALRRYLPEIDLDEEDIPPSLIDRMIVKREDFKGALSEVEPSAMREVLVELPKITWDDVGGLTEAKNNVKESVEWPLNQPEKFTRMGVEPPAGVLLYGPPGTGKTLMAKAVANETNANFISVRGPQLLSKWVGESEKAIRQTFRKARQVAPTVIFFDELDSLAPGRGQTGGNNVSERVVNQLLTELDGLEEMEEVMVIAATNRPDIIDPALIRSGRFDRLVQVGQPGIEGREQILKIHTQDTPLAADVSLRELAERADGYVGSDLANIAREAAIEALRDDEDADDVGMAHFRAAMENVRPTITDDLMEYYDQVEDQFKGSQGPNVNSRQGSEHIGFQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	742 (606)
Sequences:	112 (70)
Seq/√Len:	2.9

HALSA - CDCH Q9HHW2 Q9HPU1 Q9HPV0
SULSO - Q980U9 Q97ZZ9

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
326_V	329_I	3.961	0.69
285_I	658_L	3.494	0.59
558_V	626_V	3.484	0.59
215_F	218_L	3.397	0.57
485_P	507_T	3.028	0.48
336_D	663_D	2.984	0.46
507_T	534_S	2.921	0.45
226_V	254_I	2.878	0.44
452_V	521_N	2.852	0.43
535_K	585_N	2.839	0.43
142_R	148_I	2.820	0.42
636_R	662_A	2.804	0.42
253_S	658_L	2.772	0.41
185_G	188_Y	2.691	0.39
245_N	650_A	2.600	0.37
526_S	529_G	2.599	0.37
529_G	582_R	2.582	0.37
513_A	524_F	2.566	0.37
530_P	586_Q	2.443	0.34
529_G	584_V	2.437	0.34
604_A	636_R	2.348	0.32
241_K	729_N	2.330	0.31
521_N	603_I	2.323	0.31
471_K	565_D	2.318	0.31
143_S	147_A	2.318	0.31
152_A	158_E	2.312	0.31
303_G	507_T	2.304	0.31
186_I	189_E	2.284	0.30
631_P	636_R	2.257	0.30
643_H	695_H	2.227	0.29
465_G	523_N	2.200	0.29
591_L	664_G	2.199	0.29
607_N	628_V	2.162	0.28
120_L	125_V	2.157	0.28
626_V	707_I	2.150	0.28
492_G	607_N	2.136	0.27
588_L	616_L	2.107	0.27
143_S	146_Q	2.105	0.27
184_G	189_E	2.099	0.27
185_G	189_E	2.079	0.26
487_K	591_L	2.037	0.26
116_K	119_I	2.025	0.25
467_L	669_D	2.024	0.25
537_V	611_I	2.006	0.25
487_K	671_A	1.960	0.24
626_V	682_L	1.957	0.24
564_L	607_N	1.937	0.24
122_R	135_S	1.937	0.24
528_R	531_Q	1.936	0.24
325_Q	333_N	1.930	0.24
551_A	560_F	1.919	0.23
551_A	562_D	1.919	0.23
551_A	563_E	1.919	0.23
560_F	563_E	1.919	0.23
235_G	623_D	1.913	0.23
436_D	626_V	1.891	0.23
547_T	570_G	1.887	0.23
608_R	639_I	1.866	0.22
470_A	487_K	1.861	0.22
268_E	286_I	1.860	0.22
278_A	653_V	1.857	0.22
529_G	669_D	1.848	0.22
485_P	504_P	1.841	0.22
666_V	715_Y	1.838	0.22
526_S	572_G	1.837	0.22
161_C	692_G	1.830	0.22
588_L	623_D	1.827	0.22
616_L	623_D	1.827	0.22
664_G	715_Y	1.823	0.22
651_A	692_G	1.817	0.22
324_G	331_A	1.817	0.22
463_D	565_D	1.816	0.22
507_T	625_L	1.790	0.21
259_I	487_K	1.789	0.21
699_A	705_P	1.785	0.21
609_P	669_D	1.779	0.21
328_V	331_A	1.776	0.21
120_L	129_I	1.774	0.21
143_S	152_A	1.767	0.21
487_K	570_G	1.766	0.21
526_S	582_R	1.753	0.21
535_K	631_P	1.750	0.21
591_L	715_Y	1.749	0.21
585_N	631_P	1.741	0.20
528_R	584_V	1.735	0.20
572_G	582_R	1.720	0.20
235_G	588_L	1.717	0.20
235_G	616_L	1.717	0.20
122_R	130_V	1.716	0.20
511_L	526_S	1.714	0.20
477_S	496_P	1.710	0.20
125_V	135_S	1.709	0.20
182_T	188_Y	1.688	0.20
481_P	706_T	1.688	0.20
499_V	527_V	1.686	0.20
271_L	286_I	1.680	0.19
522_A	576_G	1.677	0.19
483_N	612_I	1.676	0.19
561_F	584_V	1.676	0.19
125_V	128_D	1.670	0.19
514_K	628_V	1.666	0.19
567_L	662_A	1.664	0.19
119_I	125_V	1.663	0.19
529_G	572_G	1.662	0.19
537_V	581_E	1.660	0.19
508_G	548_F	1.659	0.19
155_T	170_E	1.656	0.19
485_P	591_L	1.638	0.19
662_A	670_L	1.636	0.19
467_L	481_P	1.635	0.19
348_F	403_A	1.633	0.19
184_G	188_Y	1.606	0.18
209_M	558_V	1.595	0.18
116_K	120_L	1.587	0.18
293_S	527_V	1.565	0.18
391_F	493_V	1.564	0.18
565_D	664_G	1.559	0.18
494_E	572_G	1.554	0.18
531_Q	584_V	1.554	0.18
564_L	628_V	1.544	0.17
182_T	185_G	1.542	0.17
636_R	659_A	1.537	0.17
542_K	678_A	1.536	0.17
542_K	691_V	1.527	0.17
499_V	714_Y	1.523	0.17
142_R	146_Q	1.517	0.17
525_I	535_K	1.516	0.17
530_P	584_V	1.515	0.17
158_E	168_D	1.512	0.17
518_N	612_I	1.510	0.17
514_K	607_N	1.499	0.17
639_I	667_G	1.492	0.17
531_Q	582_R	1.487	0.17
718_V	726_Q	1.487	0.17
615_A	631_P	1.483	0.17
122_R	132_V	1.482	0.17
545_R	581_E	1.480	0.17
532_L	567_L	1.474	0.16
464_V	662_A	1.471	0.16
470_A	591_L	1.459	0.16
537_V	628_V	1.449	0.16
165_E	170_E	1.442	0.16
159_G	173_E	1.441	0.16
550_K	554_V	1.415	0.16
168_D	171_L	1.412	0.16
591_L	666_V	1.412	0.16
494_E	580_S	1.404	0.16
122_R	127_R	1.404	0.16
607_N	719_E	1.404	0.16
290_E	519_E	1.401	0.16
589_T	604_A	1.392	0.15
433_K	655_L	1.386	0.15
291_L	604_A	1.383	0.15
339_D	432_V	1.381	0.15
143_S	148_I	1.377	0.15
569_P	579_V	1.370	0.15
530_P	545_R	1.364	0.15
165_E	168_D	1.363	0.15
580_S	585_N	1.362	0.15
116_K	125_V	1.357	0.15
461_W	497_A	1.353	0.15
483_N	567_L	1.351	0.15
675_R	679_I	1.351	0.15
449_M	452_V	1.347	0.15
517_A	605_A	1.346	0.15
487_K	507_T	1.337	0.15
176_I	558_V	1.334	0.15
466_G	588_L	1.326	0.15
466_G	616_L	1.326	0.15
156_E	176_I	1.325	0.15
531_Q	581_E	1.324	0.15
427_I	692_G	1.323	0.15
307_R	657_E	1.320	0.15
118_Q	123_P	1.319	0.14
655_L	663_D	1.317	0.14
443_E	559_I	1.313	0.14
676_E	679_I	1.311	0.14
347_R	527_V	1.309	0.14
542_K	558_V	1.309	0.14
468_T	471_K	1.304	0.14
559_I	607_N	1.298	0.14
130_V	136_T	1.295	0.14
111_A	118_Q	1.283	0.14
481_P	669_D	1.281	0.14
565_D	642_I	1.276	0.14
395_D	595_E	1.274	0.14
523_N	610_D	1.273	0.14
452_V	603_I	1.271	0.14
152_A	170_E	1.271	0.14
467_L	582_R	1.270	0.14
545_R	588_L	1.270	0.14
545_R	616_L	1.270	0.14
561_F	586_Q	1.263	0.14
117_R	122_R	1.258	0.14
530_P	561_F	1.257	0.14
494_E	526_S	1.253	0.14
240_A	290_E	1.252	0.14
478_V	520_T	1.252	0.14
644_T	722_F	1.250	0.14
325_Q	331_A	1.249	0.14
467_L	566_S	1.249	0.14
566_S	582_R	1.245	0.14
486_E	534_S	1.244	0.14
214_I	218_L	1.243	0.14
603_I	715_Y	1.237	0.14
120_L	123_P	1.231	0.13
109_S	116_K	1.230	0.13
183_G	245_N	1.229	0.13
119_I	129_I	1.228	0.13
719_E	722_F	1.227	0.13
150_L	153_V	1.223	0.13
474_V	525_I	1.223	0.13
574_T	628_V	1.220	0.13
314_L	682_L	1.219	0.13
467_L	523_N	1.217	0.13
331_A	532_L	1.214	0.13
464_V	604_A	1.214	0.13
245_N	366_L	1.214	0.13
539_E	590_E	1.213	0.13
236_K	623_D	1.207	0.13
166_D	181_R	1.200	0.13
119_I	122_R	1.199	0.13
552_R	590_E	1.196	0.13
569_P	586_Q	1.196	0.13
234_T	601_M	1.189	0.13
536_W	588_L	1.186	0.13
536_W	616_L	1.186	0.13
530_P	569_P	1.185	0.13
545_R	586_Q	1.180	0.13
328_V	332_T	1.179	0.13
547_T	629_G	1.179	0.13
285_I	565_D	1.178	0.13
399_L	450_R	1.175	0.13
535_K	636_R	1.173	0.13
514_K	559_I	1.169	0.13
585_N	636_R	1.161	0.13
467_L	608_R	1.157	0.13
484_Q	599_E	1.157	0.13
559_I	628_V	1.155	0.13
533_L	617_I	1.153	0.13
152_A	159_G	1.149	0.13
285_I	614_P	1.145	0.13
591_L	594_L	1.145	0.13
581_E	588_L	1.144	0.12
581_E	616_L	1.144	0.12
666_V	727_G	1.141	0.12
530_P	611_I	1.140	0.12
123_P	133_M	1.140	0.12
467_L	609_P	1.136	0.12
116_K	126_A	1.135	0.12
539_E	607_N	1.135	0.12
586_Q	611_I	1.131	0.12
599_E	607_N	1.127	0.12
501_L	631_P	1.127	0.12
163_V	170_E	1.125	0.12
329_I	344_R	1.124	0.12
507_T	532_L	1.117	0.12
312_Q	648_P	1.116	0.12
569_P	611_I	1.116	0.12
447_S	632_G	1.115	0.12
450_R	612_I	1.114	0.12
551_A	556_P	1.113	0.12
556_P	560_F	1.113	0.12
556_P	562_D	1.113	0.12
556_P	563_E	1.113	0.12
244_A	542_K	1.102	0.12
164_T	356_V	1.100	0.12
467_L	706_T	1.098	0.12
405_M	573_Q	1.097	0.12
468_T	565_D	1.097	0.12
261_S	507_T	1.095	0.12
269_Q	272_R	1.091	0.12
578_N	611_I	1.091	0.12
516_V	663_D	1.078	0.12
546_Q	678_A	1.076	0.12
488_F	526_S	1.075	0.12
482_L	507_T	1.074	0.12
538_G	541_E	1.068	0.12
331_A	340_P	1.066	0.12
324_G	329_I	1.063	0.12
403_A	534_S	1.063	0.12
448_A	587_L	1.063	0.12
131_P	134_S	1.061	0.12
581_E	611_I	1.059	0.12
253_S	507_T	1.056	0.12
569_P	584_V	1.055	0.12
414_E	692_G	1.054	0.12
564_L	599_E	1.052	0.12
723_K	726_Q	1.046	0.11
228_L	348_F	1.046	0.11
339_D	682_L	1.045	0.11
466_G	623_D	1.042	0.11
531_Q	586_Q	1.042	0.11
558_V	691_V	1.041	0.11
389_H	580_S	1.035	0.11
526_S	584_V	1.035	0.11
671_A	728_P	1.031	0.11
474_V	535_K	1.026	0.11
147_A	151_I	1.025	0.11
159_G	164_T	1.025	0.11
312_Q	649_L	1.025	0.11
474_V	585_N	1.025	0.11
474_V	631_P	1.017	0.11
539_E	580_S	1.017	0.11
494_E	547_T	1.015	0.11
270_Q	327_I	1.014	0.11
151_I	157_P	1.012	0.11
129_I	136_T	1.007	0.11
537_V	578_N	1.007	0.11
540_S	579_V	1.006	0.11
603_I	625_L	1.006	0.11
532_L	591_L	1.005	0.11
462_D	699_A	1.004	0.11
114_M	134_S	1.003	0.11
532_L	572_G	1.002	0.11
432_V	437_F	1.001	0.11
232_P	361_G	0.996	0.11
485_P	699_A	0.992	0.11
504_P	664_G	0.991	0.11
149_P	169_V	0.988	0.11
212_P	217_K	0.986	0.11
271_L	334_R	0.986	0.11
504_P	507_T	0.982	0.11
236_K	588_L	0.978	0.11
236_K	616_L	0.978	0.11
500_L	503_G	0.978	0.11
500_L	506_G	0.978	0.11
500_L	509_K	0.978	0.11
500_L	510_T	0.978	0.11
500_L	571_R	0.978	0.11
500_L	593_G	0.978	0.11
500_L	613_D	0.978	0.11
500_L	621_R	0.978	0.11
503_G	506_G	0.978	0.11
503_G	509_K	0.978	0.11
503_G	510_T	0.978	0.11
503_G	571_R	0.978	0.11
503_G	593_G	0.978	0.11
503_G	613_D	0.978	0.11
503_G	621_R	0.978	0.11
506_G	509_K	0.978	0.11
506_G	510_T	0.978	0.11
506_G	571_R	0.978	0.11
506_G	593_G	0.978	0.11
506_G	613_D	0.978	0.11
506_G	621_R	0.978	0.11
509_K	571_R	0.978	0.11
509_K	593_G	0.978	0.11
509_K	613_D	0.978	0.11
509_K	621_R	0.978	0.11
510_T	571_R	0.978	0.11
510_T	593_G	0.978	0.11
510_T	613_D	0.978	0.11
510_T	621_R	0.978	0.11
571_R	593_G	0.978	0.11
571_R	613_D	0.978	0.11
571_R	621_R	0.978	0.11
593_G	613_D	0.978	0.11
593_G	621_R	0.978	0.11
613_D	621_R	0.978	0.11
313_L	710_D	0.977	0.11
545_R	623_D	0.974	0.11
502_Y	545_R	0.974	0.11
582_R	669_D	0.973	0.11
271_L	285_I	0.972	0.11
184_G	187_T	0.971	0.11
474_V	603_I	0.971	0.11
124_V	128_D	0.971	0.11
255_A	656_R	0.968	0.11
357_P	511_L	0.968	0.11
504_P	591_L	0.964	0.11
466_G	569_P	0.961	0.11
492_G	564_L	0.961	0.11
119_I	128_D	0.960	0.11
570_G	671_A	0.958	0.11
159_G	170_E	0.957	0.11
530_P	568_A	0.956	0.11
515_A	664_G	0.955	0.11
528_R	582_R	0.954	0.11
568_A	586_Q	0.953	0.11
279_K	342_L	0.952	0.11
476_E	493_V	0.950	0.11
537_V	564_L	0.950	0.11
434_R	489_T	0.949	0.11
452_V	464_V	0.949	0.11
168_D	173_E	0.947	0.11
158_E	169_V	0.947	0.11
528_R	586_Q	0.946	0.11
611_I	628_V	0.946	0.11
551_A	636_R	0.945	0.11
560_F	636_R	0.945	0.11
562_D	636_R	0.945	0.11
563_E	636_R	0.945	0.11
230_G	236_K	0.945	0.11
117_R	124_V	0.943	0.10
278_A	695_H	0.939	0.10
124_V	133_M	0.938	0.10
160_V	174_E	0.938	0.10
601_M	612_I	0.938	0.10
318_D	490_R	0.937	0.10
582_R	586_Q	0.937	0.10
146_Q	153_V	0.937	0.10
114_M	118_Q	0.937	0.10
480_W	514_K	0.935	0.10
166_D	173_E	0.934	0.10
567_L	612_I	0.931	0.10
339_D	714_Y	0.930	0.10
243_V	329_I	0.930	0.10
484_Q	564_L	0.930	0.10
465_G	608_R	0.930	0.10
650_A	653_V	0.929	0.10
244_A	696_F	0.929	0.10
307_R	661_R	0.929	0.10
665_Y	674_A	0.928	0.10
354_I	453_L	0.920	0.10
440_A	511_L	0.920	0.10
209_M	570_G	0.920	0.10
235_G	466_G	0.917	0.10
462_D	656_R	0.917	0.10
531_Q	611_I	0.913	0.10
114_M	126_A	0.913	0.10
325_Q	328_V	0.912	0.10
118_Q	125_V	0.912	0.10
223_P	376_S	0.910	0.10
535_K	669_D	0.910	0.10
265_G	268_E	0.910	0.10
569_P	578_N	0.907	0.10
357_P	499_V	0.905	0.10
126_A	129_I	0.904	0.10
486_E	507_T	0.903	0.10
391_F	514_K	0.902	0.10
160_V	170_E	0.900	0.10
502_Y	536_W	0.898	0.10
522_A	578_N	0.895	0.10
166_D	172_R	0.895	0.10
715_Y	725_S	0.895	0.10
153_V	158_E	0.895	0.10
554_V	557_T	0.892	0.10
564_L	577_N	0.891	0.10
536_W	623_D	0.891	0.10
402_E	554_V	0.889	0.10
482_L	607_N	0.888	0.10
551_A	565_D	0.887	0.10
560_F	565_D	0.887	0.10
562_D	565_D	0.887	0.10
467_L	667_G	0.887	0.10
502_Y	588_L	0.882	0.10
502_Y	616_L	0.882	0.10
352_I	378_D	0.876	0.10
444_V	448_A	0.876	0.10
495_P	534_S	0.875	0.10
239_L	527_V	0.874	0.10
636_R	670_L	0.874	0.10
537_V	569_P	0.872	0.10
561_F	722_F	0.871	0.10
440_A	572_G	0.871	0.10
171_L	174_E	0.869	0.10
487_K	514_K	0.869	0.10
464_V	521_N	0.868	0.10
566_S	572_G	0.867	0.10
547_T	682_L	0.862	0.10
118_Q	122_R	0.860	0.10
541_E	585_N	0.859	0.10
183_G	194_L	0.856	0.10
538_G	556_P	0.856	0.10
540_S	545_R	0.855	0.10
360_I	645_Q	0.854	0.10
235_G	545_R	0.851	0.10
531_Q	537_V	0.851	0.10
270_Q	276_E	0.850	0.10
644_T	674_A	0.850	0.10
289_D	539_E	0.848	0.10
499_V	673_I	0.848	0.10
446_P	612_I	0.847	0.10
167_T	174_E	0.845	0.10
114_M	117_R	0.844	0.10
581_E	623_D	0.839	0.10
508_G	524_F	0.838	0.10
524_F	548_F	0.838	0.10
569_P	588_L	0.834	0.10
569_P	616_L	0.834	0.10
233_G	677_A	0.825	0.09
139_P	658_L	0.823	0.09
127_R	133_M	0.823	0.09
403_A	507_T	0.819	0.09
329_I	333_N	0.817	0.09
355_G	547_T	0.816	0.09
154_E	159_G	0.814	0.09
536_W	581_E	0.814	0.09
227_L	436_D	0.811	0.09
533_L	544_I	0.811	0.09
255_A	710_D	0.810	0.09
624_R	679_I	0.810	0.09
389_H	607_N	0.810	0.09
528_R	581_E	0.808	0.09
534_S	671_A	0.806	0.09
646_D	711_L	0.805	0.09
391_F	487_K	0.804	0.09
133_M	136_T	0.802	0.09
564_L	719_E	0.802	0.09
607_N	703_V	0.802	0.09
667_G	706_T	0.801	0.09
523_N	669_D	0.800	0.09
156_E	172_R	0.799	0.09
481_P	609_P	0.799	0.09
367_K	612_I	0.797	0.09
514_K	539_E	0.797	0.09
111_A	115_V	0.796	0.09
514_K	625_L	0.796	0.09
156_E	174_E	0.795	0.09
324_G	334_R	0.795	0.09
549_R	587_L	0.793	0.09
599_E	617_I	0.793	0.09
561_F	569_P	0.791	0.09
205_V	210_K	0.790	0.09
540_S	588_L	0.790	0.09
540_S	616_L	0.790	0.09
502_Y	530_P	0.786	0.09
570_G	682_L	0.786	0.09
573_Q	628_V	0.786	0.09
471_K	499_V	0.786	0.09
502_Y	586_Q	0.785	0.09
532_L	643_H	0.782	0.09
583_V	620_G	0.782	0.09
553_Q	665_Y	0.780	0.09
488_F	669_D	0.780	0.09
317_M	434_R	0.774	0.09
362_R	569_P	0.771	0.09
117_R	130_V	0.770	0.09
626_V	642_I	0.768	0.09
184_G	190_D	0.768	0.09
235_G	536_W	0.767	0.09
478_V	487_K	0.767	0.09
359_E	665_Y	0.766	0.09
484_Q	601_M	0.760	0.09
559_I	564_L	0.760	0.09
727_G	731_N	0.760	0.09
326_V	336_D	0.757	0.09
269_Q	275_F	0.757	0.09
233_G	239_L	0.756	0.09
404_A	532_L	0.756	0.09
478_V	672_N	0.755	0.09
528_R	557_T	0.755	0.09
545_R	611_I	0.754	0.09
164_T	171_L	0.754	0.09
278_A	729_N	0.753	0.09
540_S	584_V	0.753	0.09
480_W	632_G	0.750	0.09
335_V	532_L	0.750	0.09
487_K	504_P	0.749	0.09
581_E	586_Q	0.748	0.09
461_W	569_P	0.747	0.09
127_R	132_V	0.746	0.09
239_L	701_E	0.743	0.09
466_G	583_V	0.743	0.09
594_L	703_V	0.743	0.09
595_E	628_V	0.742	0.09
530_P	581_E	0.742	0.09
604_A	631_P	0.741	0.09
615_A	636_R	0.741	0.09
608_R	669_D	0.739	0.09
159_G	168_D	0.738	0.09
525_I	631_P	0.735	0.09
389_H	628_V	0.734	0.09
440_A	526_S	0.733	0.09
283_P	526_S	0.732	0.09
130_V	143_S	0.731	0.09
528_R	611_I	0.730	0.09
528_R	537_V	0.728	0.09
573_Q	580_S	0.727	0.09
496_P	601_M	0.726	0.09
454_V	518_N	0.724	0.09
537_V	584_V	0.724	0.09
355_G	570_G	0.723	0.09
149_P	162_L	0.721	0.09
125_V	129_I	0.721	0.09
242_A	534_S	0.719	0.09
183_G	685_D	0.719	0.09
132_V	135_S	0.718	0.09
243_V	285_I	0.718	0.09
497_A	619_S	0.717	0.09
671_A	678_A	0.716	0.09
485_P	532_L	0.715	0.09
437_F	448_A	0.715	0.09
532_L	715_Y	0.714	0.09
226_V	707_I	0.713	0.09
544_I	617_I	0.713	0.09
464_V	603_I	0.711	0.09
288_I	651_A	0.709	0.09
436_D	516_V	0.706	0.09
235_G	581_E	0.705	0.08
182_T	658_L	0.705	0.08
234_T	275_F	0.704	0.08
515_A	524_F	0.699	0.08
625_L	715_Y	0.699	0.08
480_W	627_Q	0.698	0.08
170_E	173_E	0.695	0.08
223_P	660_E	0.695	0.08
434_R	697_R	0.695	0.08
115_V	122_R	0.693	0.08
285_I	429_R	0.693	0.08
167_T	173_E	0.693	0.08
154_E	157_P	0.692	0.08
126_A	692_G	0.691	0.08
449_M	464_V	0.691	0.08
172_R	175_P	0.687	0.08
151_I	154_E	0.685	0.08
504_P	627_Q	0.685	0.08
345_P	504_P	0.684	0.08
504_P	594_L	0.682	0.08
261_S	534_S	0.681	0.08
508_G	609_P	0.681	0.08
548_F	609_P	0.681	0.08
570_G	642_I	0.679	0.08
536_W	540_S	0.679	0.08
529_G	566_S	0.678	0.08
241_K	313_L	0.678	0.08
325_Q	342_L	0.677	0.08
367_K	370_T	0.677	0.08
578_N	583_V	0.676	0.08
129_I	133_M	0.676	0.08
307_R	645_Q	0.675	0.08
493_V	547_T	0.675	0.08
534_S	625_L	0.675	0.08
173_E	626_V	0.673	0.08
133_M	312_Q	0.672	0.08
553_Q	630_Q	0.670	0.08
373_M	696_F	0.667	0.08
546_Q	672_N	0.667	0.08
348_F	532_L	0.666	0.08
542_K	683_R	0.665	0.08
586_Q	610_D	0.665	0.08
286_I	701_E	0.665	0.08
125_V	134_S	0.664	0.08
530_P	610_D	0.664	0.08
109_S	117_R	0.663	0.08
566_S	669_D	0.662	0.08
584_V	611_I	0.662	0.08
578_N	581_E	0.657	0.08
532_L	638_Q	0.656	0.08
116_K	131_P	0.654	0.08
283_P	523_N	0.652	0.08
618_R	631_P	0.652	0.08
347_R	645_Q	0.651	0.08
581_E	584_V	0.649	0.08
239_L	354_I	0.647	0.08
327_I	336_D	0.646	0.08
148_I	427_I	0.645	0.08
327_I	670_L	0.644	0.08
468_T	672_N	0.644	0.08
168_D	174_E	0.643	0.08
557_T	561_F	0.643	0.08
123_P	135_S	0.642	0.08
561_F	564_L	0.641	0.08
476_E	480_W	0.640	0.08
223_P	312_Q	0.639	0.08
535_K	662_A	0.638	0.08
585_N	662_A	0.637	0.08
500_L	551_A	0.636	0.08
500_L	560_F	0.636	0.08
500_L	562_D	0.636	0.08
500_L	563_E	0.636	0.08
503_G	551_A	0.636	0.08
503_G	560_F	0.636	0.08
503_G	562_D	0.636	0.08
503_G	563_E	0.636	0.08
506_G	551_A	0.636	0.08
506_G	560_F	0.636	0.08
506_G	562_D	0.636	0.08
506_G	563_E	0.636	0.08
509_K	551_A	0.636	0.08
509_K	560_F	0.636	0.08
509_K	562_D	0.636	0.08
509_K	563_E	0.636	0.08
510_T	551_A	0.636	0.08
510_T	560_F	0.636	0.08
510_T	562_D	0.636	0.08
510_T	563_E	0.636	0.08
551_A	571_R	0.636	0.08
551_A	593_G	0.636	0.08
551_A	613_D	0.636	0.08
551_A	621_R	0.636	0.08
560_F	571_R	0.636	0.08
560_F	593_G	0.636	0.08
560_F	613_D	0.636	0.08
560_F	621_R	0.636	0.08
562_D	571_R	0.636	0.08
562_D	593_G	0.636	0.08
562_D	613_D	0.636	0.08
562_D	621_R	0.636	0.08
563_E	571_R	0.636	0.08
563_E	593_G	0.636	0.08
563_E	613_D	0.636	0.08
563_E	621_R	0.636	0.08
184_G	192_G	0.635	0.08
151_I	158_E	0.635	0.08
400_S	403_A	0.634	0.08
487_K	534_S	0.634	0.08
426_L	443_E	0.633	0.08
448_A	696_F	0.631	0.08
144_P	149_P	0.630	0.08
464_V	670_L	0.629	0.08
186_I	196_N	0.629	0.08
505_P	659_A	0.629	0.08
507_T	598_E	0.628	0.08
228_L	527_V	0.628	0.08
261_S	479_E	0.627	0.08
328_V	403_A	0.624	0.08
530_P	537_V	0.624	0.08
608_R	667_G	0.624	0.08
254_I	441_L	0.622	0.08
537_V	586_Q	0.622	0.08
142_R	157_P	0.621	0.08
599_E	628_V	0.621	0.08
112_A	119_I	0.620	0.08
362_R	365_I	0.619	0.08
523_N	609_P	0.618	0.08
589_T	612_I	0.616	0.08
467_L	529_G	0.616	0.08
331_A	335_V	0.615	0.08
183_G	186_I	0.615	0.08
158_E	161_C	0.614	0.08
576_G	586_Q	0.614	0.08
457_P	504_P	0.614	0.08
287_F	369_H	0.611	0.08
482_L	539_E	0.611	0.08
491_M	726_Q	0.611	0.08
588_L	620_G	0.610	0.08
616_L	620_G	0.610	0.08
530_P	576_G	0.609	0.08
428_D	692_G	0.606	0.08
143_S	149_P	0.605	0.08
336_D	433_K	0.604	0.08
351_E	464_V	0.604	0.08
292_D	614_P	0.603	0.08
467_L	639_I	0.603	0.08
552_R	665_Y	0.602	0.08
711_L	718_V	0.601	0.08
214_I	217_K	0.601	0.08
144_P	160_V	0.601	0.08
559_I	595_E	0.601	0.08
148_I	154_E	0.600	0.08
568_A	574_T	0.599	0.08
483_N	675_R	0.598	0.08
564_L	611_I	0.597	0.08
430_M	438_K	0.597	0.08
555_A	628_V	0.597	0.08
540_S	586_Q	0.596	0.08
487_K	532_L	0.595	0.08
609_P	639_I	0.595	0.08
109_S	113_G	0.593	0.08
124_V	127_R	0.593	0.08
534_S	598_E	0.592	0.08
109_S	112_A	0.591	0.08
117_R	123_P	0.591	0.08
237_T	478_V	0.590	0.08
519_E	678_A	0.588	0.08
234_T	387_D	0.587	0.08
155_T	159_G	0.586	0.08
493_V	715_Y	0.586	0.08
155_T	692_G	0.586	0.08
390_G	395_D	0.585	0.08
554_V	578_N	0.583	0.08
612_I	675_R	0.583	0.08
123_P	134_S	0.582	0.08
226_V	324_G	0.582	0.08
502_Y	623_D	0.581	0.08
316_M	428_D	0.580	0.08
115_V	118_Q	0.580	0.08
498_G	503_G	0.580	0.08
498_G	506_G	0.580	0.08
498_G	509_K	0.580	0.08
498_G	510_T	0.580	0.08
498_G	571_R	0.580	0.08
498_G	593_G	0.580	0.08
498_G	613_D	0.580	0.08
498_G	621_R	0.580	0.08
230_G	395_D	0.579	0.08
362_R	561_F	0.578	0.08
624_R	668_S	0.578	0.08
396_I	478_V	0.576	0.08
150_L	175_P	0.575	0.08
171_L	307_R	0.574	0.08
243_V	489_T	0.573	0.08
144_P	158_E	0.572	0.08
496_P	679_I	0.570	0.08
478_V	504_P	0.569	0.08
545_R	584_V	0.568	0.08
427_I	634_E	0.565	0.07
521_N	535_K	0.565	0.07
545_R	568_A	0.565	0.07
561_F	582_R	0.564	0.07
276_E	320_L	0.563	0.07
530_P	582_R	0.563	0.07
467_L	541_E	0.562	0.07
577_N	580_S	0.562	0.07
684_D	695_H	0.561	0.07
450_R	602_V	0.560	0.07
565_D	661_R	0.560	0.07
282_S	534_S	0.559	0.07
507_T	672_N	0.559	0.07
540_S	623_D	0.559	0.07
632_G	635_G	0.559	0.07
467_L	584_V	0.558	0.07
482_L	494_E	0.557	0.07
601_M	675_R	0.557	0.07
313_L	430_M	0.556	0.07
226_V	516_V	0.555	0.07
504_P	514_K	0.554	0.07
536_W	611_I	0.553	0.07
566_S	667_G	0.553	0.07
537_V	607_N	0.552	0.07
237_T	502_Y	0.552	0.07
277_D	385_A	0.552	0.07
111_A	136_T	0.551	0.07
387_D	558_V	0.550	0.07
526_S	669_D	0.550	0.07
376_S	414_E	0.549	0.07
674_A	695_H	0.549	0.07
480_W	522_A	0.546	0.07
511_L	572_G	0.545	0.07
292_D	705_P	0.545	0.07
519_E	542_K	0.545	0.07
170_E	285_I	0.543	0.07
329_I	335_V	0.543	0.07
298_R	699_A	0.542	0.07
130_V	135_S	0.541	0.07
455_E	699_A	0.540	0.07
577_N	628_V	0.540	0.07
185_G	190_D	0.539	0.07
492_G	601_M	0.538	0.07
457_P	492_G	0.536	0.07
622_F	706_T	0.536	0.07
695_H	715_Y	0.536	0.07
181_R	190_D	0.535	0.07
577_N	607_N	0.535	0.07
495_P	726_Q	0.535	0.07
362_R	540_S	0.534	0.07
268_E	271_L	0.534	0.07
134_S	365_I	0.533	0.07
157_P	170_E	0.532	0.07
432_V	436_D	0.532	0.07
212_P	215_F	0.529	0.07
115_V	125_V	0.528	0.07
529_G	609_P	0.527	0.07
154_E	172_R	0.526	0.07
369_H	707_I	0.526	0.07
654_S	658_L	0.526	0.07
502_Y	599_E	0.525	0.07
465_G	667_G	0.524	0.07
461_W	496_P	0.524	0.07
561_F	588_L	0.523	0.07
561_F	616_L	0.523	0.07
477_S	578_N	0.522	0.07
574_T	597_M	0.522	0.07
465_G	524_F	0.522	0.07
111_A	117_R	0.521	0.07
405_M	483_N	0.520	0.07
326_V	330_A	0.518	0.07
569_P	623_D	0.517	0.07
444_V	449_M	0.517	0.07
712_M	727_G	0.516	0.07
396_I	576_G	0.515	0.07
124_V	139_P	0.514	0.07
234_T	464_V	0.514	0.07
168_D	172_R	0.514	0.07
140_F	143_S	0.514	0.07
455_E	473_N	0.514	0.07
126_A	130_V	0.513	0.07
226_V	694_A	0.512	0.07
238_L	315_T	0.511	0.07
265_G	649_L	0.511	0.07
612_I	624_R	0.511	0.07
466_G	579_V	0.510	0.07
500_L	592_D	0.509	0.07
503_G	592_D	0.509	0.07
506_G	592_D	0.509	0.07
509_K	592_D	0.509	0.07
510_T	592_D	0.509	0.07
571_R	592_D	0.509	0.07
592_D	613_D	0.509	0.07
592_D	621_R	0.509	0.07
358_D	445_E	0.508	0.07
551_A	639_I	0.506	0.07
560_F	639_I	0.506	0.07
562_D	639_I	0.506	0.07
563_E	639_I	0.506	0.07
111_A	125_V	0.506	0.07
154_E	162_L	0.506	0.07
153_V	166_D	0.506	0.07
157_P	160_V	0.506	0.07
488_F	535_K	0.506	0.07
529_G	561_F	0.505	0.07
540_S	589_T	0.503	0.07
573_Q	590_E	0.503	0.07
500_L	618_R	0.503	0.07
503_G	618_R	0.503	0.07
506_G	618_R	0.503	0.07
509_K	618_R	0.503	0.07
510_T	618_R	0.503	0.07
571_R	618_R	0.503	0.07
593_G	618_R	0.503	0.07
613_D	618_R	0.503	0.07
618_R	621_R	0.503	0.07
464_V	636_R	0.501	0.07
578_N	588_L	0.501	0.07
578_N	616_L	0.501	0.07
545_R	561_F	0.501	0.07
540_S	561_F	0.500	0.07

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3cf2A	3	0.8801	100	0.592	Contact Map
3cmuA	1	0.8032	100	0.711	Contact Map
4cr2J	1	0.4757	100	0.744	Contact Map
2x8aA	1	0.3127	100	0.756	Contact Map
4ko8A	3	0.5701	100	0.768	Contact Map
1xwiA	1	0.3666	100	0.77	Contact Map
4cr2L	1	0.4663	100	0.771	Contact Map
3cf0A	3	0.372	100	0.772	Contact Map
4cr2M	1	0.4528	100	0.775	Contact Map
2ce7A	3	0.3801	100	0.776	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0156 seconds.