Q9HP92 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HP92 - GTP-binding protein homolog

UniProt:	Q9HP92	Sequences: MSYRVGLVGKPSVGKSTFFNAATNNDVPEGAYPFTTIDPAVGEAYVRVECAAPEFGEECTPATGFCEDGTRFVPTKLVDVAGLIPGAHEGAGLGNQFLTDLNEADVLIHVVDFSGTTDIEGEATEGHDPREDIDFLETELDQWYLDVLEKGIERYEGQHMADATLEVELAEQMSAFRTSPEEVKQVLLALDLAFDPDTWDDADRLELAREMRTRTKPMVVAANKMDTPEAQANWAAITDDDEYDHLEFVPVSAHAEQALTQADQGGVVDYRAGDDAFTIVGEPSDDQRAGLESIREFVTEYGGTGVQSAIEAALFDALGVKPVFPGSANGLGTADGRVLPDVFLLEPDATAEDFAYAVHSDVGDGFLHAVDCRANRQIAADQDLDSRAVIEIISTN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	396 (382)
Sequences:	389 (271)
Seq/√Len:	13.9

ECOLI - YCHF
BACSU - YCHF
HALSA - Q9HP92 Q9HRX2
SULSO - Q7LXL0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
356_Y	363_G	5.432	1.00
349_A	353_D	5.334	1.00
108_I	221_A	5.241	1.00
86_G	89_E	4.248	1.00
322_P	342_V	4.214	1.00
333_T	336_G	4.105	1.00
312_A	316_D	3.942	1.00
18_F	22_A	3.838	1.00
276_A	295_R	3.533	0.99
221_A	251_V	3.365	0.99
37_I	81_A	3.347	0.99
99_T	102_N	3.217	0.98
109_H	132_D	3.121	0.98
319_G	347_P	3.067	0.98
118_D	122_E	2.929	0.97
331_L	336_G	2.738	0.95
356_Y	364_D	2.661	0.94
345_L	349_A	2.605	0.94
330_G	333_T	2.500	0.92
330_G	336_G	2.462	0.92
6_G	17_T	2.378	0.90
149_E	201_D	2.362	0.90
292_E	295_R	2.357	0.90
169_L	183_V	2.354	0.90
106_V	313_A	2.351	0.90
262_A	287_Q	2.332	0.89
9_G	15_K	2.328	0.89
9_G	14_G	2.328	0.89
27_V	40_A	2.315	0.89
200_D	203_D	2.309	0.89
108_I	251_V	2.279	0.88
32_Y	35_T	2.236	0.87
80_V	101_L	2.233	0.87
368_H	377_Q	2.229	0.87
11_P	16_S	2.210	0.86
333_T	337_R	2.192	0.86
329_N	332_G	2.158	0.85
332_G	336_G	2.153	0.85
328_A	331_L	2.092	0.83
46_V	310_I	2.081	0.83
127_H	132_D	2.070	0.82
11_P	32_Y	2.069	0.82
59_C	66_C	2.066	0.82
20_N	261_Q	2.023	0.81
329_N	333_T	2.022	0.81
50_C	66_C	2.010	0.80
141_D	212_R	1.995	0.80
331_L	334_A	1.982	0.80
6_G	351_A	1.963	0.79
110_V	251_V	1.924	0.77
189_A	214_R	1.893	0.76
354_F	384_L	1.885	0.76
55_F	331_L	1.870	0.75
9_G	16_S	1.823	0.73
330_G	334_A	1.794	0.72
85_P	136_L	1.767	0.71
366_F	369_A	1.759	0.71
53_P	389_V	1.750	0.70
141_D	209_R	1.731	0.69
22_A	77_L	1.723	0.69
5_V	106_V	1.718	0.69
328_A	333_T	1.709	0.68
6_G	19_F	1.701	0.68
21_A	42_G	1.700	0.68
100_D	107_L	1.664	0.66
279_I	282_E	1.627	0.64
371_D	374_A	1.599	0.63
83_L	95_N	1.595	0.63
8_V	61_P	1.593	0.63
382_Q	388_A	1.590	0.62
360_S	363_G	1.583	0.62
276_A	279_I	1.556	0.61
376_R	385_D	1.556	0.61
328_A	336_G	1.554	0.61
91_A	316_D	1.534	0.60
111_V	148_L	1.531	0.59
11_P	136_L	1.522	0.59
321_K	384_L	1.501	0.58
207_L	364_D	1.483	0.57
66_C	71_R	1.475	0.56
11_P	35_T	1.466	0.56
321_K	348_D	1.458	0.56
277_F	291_L	1.448	0.55
311_E	324_F	1.441	0.55
61_P	107_L	1.421	0.54
119_I	309_A	1.392	0.52
8_V	107_L	1.390	0.52
221_A	239_D	1.383	0.52
110_V	221_A	1.381	0.51
202_A	316_D	1.379	0.51
8_V	13_V	1.379	0.51
73_V	389_V	1.377	0.51
85_P	120_E	1.371	0.51
367_L	377_Q	1.370	0.51
17_T	21_A	1.348	0.50
351_A	366_F	1.341	0.49
20_N	107_L	1.338	0.49
81_A	85_P	1.337	0.49
20_N	26_D	1.323	0.48
298_V	303_G	1.323	0.48
133_I	221_A	1.323	0.48
382_Q	390_I	1.323	0.48
277_F	280_V	1.320	0.48
322_P	386_S	1.319	0.48
371_D	382_Q	1.313	0.48
312_A	317_A	1.308	0.47
96_Q	100_D	1.307	0.47
310_I	368_H	1.297	0.47
267_V	290_G	1.285	0.46
230_A	233_N	1.280	0.46
345_L	357_A	1.267	0.45
81_A	100_D	1.260	0.45
225_M	234_W	1.248	0.44
12_S	15_K	1.247	0.44
9_G	12_S	1.247	0.44
201_D	361_D	1.245	0.44
61_P	64_G	1.233	0.43
34_F	39_P	1.231	0.43
91_A	329_N	1.225	0.43
18_F	309_A	1.219	0.43
270_Y	273_G	1.219	0.43
70_T	310_I	1.207	0.42
151_G	172_Q	1.206	0.42
93_L	109_H	1.206	0.42
221_A	309_A	1.205	0.42
35_T	69_G	1.201	0.42
6_G	9_G	1.199	0.42
6_G	14_G	1.199	0.42
6_G	15_K	1.199	0.42
11_P	52_A	1.194	0.41
55_F	372_C	1.188	0.41
49_E	70_T	1.187	0.41
11_P	14_G	1.181	0.41
11_P	15_K	1.181	0.41
116_T	125_E	1.170	0.40
113_F	372_C	1.167	0.40
37_I	80_V	1.162	0.40
59_C	80_V	1.162	0.40
111_V	376_R	1.160	0.40
72_F	271_R	1.156	0.39
9_G	17_T	1.147	0.39
14_G	17_T	1.147	0.39
48_V	386_S	1.135	0.38
276_A	280_V	1.134	0.38
328_A	332_G	1.130	0.38
329_N	334_A	1.127	0.38
382_Q	385_D	1.127	0.38
107_L	192_L	1.117	0.37
14_G	36_T	1.112	0.37
9_G	36_T	1.112	0.37
15_K	36_T	1.112	0.37
50_C	59_C	1.108	0.37
92_G	139_E	1.102	0.37
351_A	380_A	1.100	0.37
94_G	97_F	1.099	0.37
329_N	336_G	1.095	0.36
259_L	270_Y	1.083	0.36
20_N	29_E	1.080	0.36
261_Q	320_V	1.062	0.35
6_G	389_V	1.057	0.34
81_A	101_L	1.052	0.34
8_V	136_L	1.052	0.34
38_D	289_A	1.050	0.34
20_N	27_V	1.043	0.34
73_V	324_F	1.043	0.34
42_G	215_T	1.037	0.33
170_A	183_V	1.035	0.33
47_R	274_D	1.028	0.33
331_L	372_C	1.026	0.33
133_I	349_A	1.023	0.33
136_L	172_Q	1.022	0.33
112_D	224_K	1.022	0.33
345_L	353_D	1.014	0.32
48_V	64_G	1.009	0.32
18_F	106_V	1.006	0.32
98_L	132_D	1.000	0.32
13_V	174_S	0.996	0.32
308_S	312_A	0.996	0.32
347_P	385_D	0.981	0.31
330_G	339_L	0.979	0.31
111_V	351_A	0.975	0.31
20_N	136_L	0.970	0.30
269_D	278_T	0.959	0.30
11_P	84_I	0.950	0.29
252_S	255_A	0.946	0.29
292_E	299_T	0.946	0.29
115_G	121_G	0.941	0.29
379_A	382_Q	0.940	0.29
384_L	388_A	0.936	0.29
351_A	363_G	0.934	0.29
108_I	309_A	0.931	0.29
203_D	324_F	0.930	0.29
35_T	224_K	0.928	0.28
87_A	92_G	0.925	0.28
41_V	76_K	0.922	0.28
276_A	281_G	0.920	0.28
85_P	135_F	0.918	0.28
268_V	338_V	0.913	0.28
196_P	212_R	0.913	0.28
178_T	216_K	0.913	0.28
38_D	146_D	0.911	0.28
118_D	315_F	0.911	0.28
212_R	389_V	0.910	0.28
216_K	349_A	0.909	0.28
126_G	210_E	0.907	0.28
33_P	36_T	0.903	0.27
94_G	98_L	0.903	0.27
33_P	37_I	0.902	0.27
45_Y	180_P	0.899	0.27
152_I	157_G	0.894	0.27
299_T	303_G	0.893	0.27
46_V	251_V	0.889	0.27
87_A	139_E	0.887	0.27
352_E	390_I	0.886	0.27
207_L	211_M	0.886	0.27
123_A	221_A	0.884	0.27
8_V	228_P	0.882	0.26
101_L	135_F	0.880	0.26
77_L	88_H	0.876	0.26
209_R	294_I	0.875	0.26
351_A	356_Y	0.875	0.26
90_G	139_E	0.874	0.26
134_D	296_E	0.870	0.26
144_Y	212_R	0.869	0.26
342_V	391_E	0.869	0.26
330_G	337_R	0.868	0.26
132_D	142_Q	0.864	0.26
153_E	389_V	0.864	0.26
34_F	37_I	0.863	0.26
8_V	20_N	0.861	0.26
109_H	118_D	0.860	0.26
318_L	388_A	0.860	0.26
37_I	101_L	0.858	0.25
145_L	204_R	0.857	0.25
44_A	291_L	0.850	0.25
19_F	25_N	0.850	0.25
105_D	365_G	0.849	0.25
100_D	132_D	0.849	0.25
233_N	236_A	0.849	0.25
112_D	226_D	0.849	0.25
22_A	46_V	0.847	0.25
8_V	229_E	0.847	0.25
136_L	158_Q	0.846	0.25
231_Q	300_E	0.846	0.25
133_I	248_F	0.845	0.25
27_V	110_V	0.845	0.25
83_L	87_A	0.843	0.25
97_F	139_E	0.842	0.25
168_E	281_G	0.839	0.25
201_D	370_V	0.838	0.25
65_F	72_F	0.836	0.25
49_E	53_P	0.836	0.25
75_T	202_A	0.829	0.24
84_I	91_A	0.828	0.24
384_L	393_I	0.826	0.24
51_A	59_C	0.822	0.24
37_I	100_D	0.822	0.24
359_H	369_A	0.822	0.24
109_H	127_H	0.820	0.24
267_V	387_R	0.818	0.24
179_S	185_Q	0.815	0.24
84_I	146_D	0.815	0.24
285_D	288_R	0.815	0.24
128_D	236_A	0.815	0.24
54_E	60_T	0.814	0.24
355_A	369_A	0.814	0.24
99_T	157_G	0.806	0.23
7_L	17_T	0.805	0.23
36_T	39_P	0.804	0.23
50_C	71_R	0.799	0.23
290_G	293_S	0.797	0.23
52_A	155_Y	0.796	0.23
89_E	249_V	0.795	0.23
218_M	232_A	0.795	0.23
287_Q	291_L	0.794	0.23
345_L	352_E	0.793	0.23
83_L	92_G	0.791	0.23
96_Q	177_R	0.790	0.23
203_D	232_A	0.787	0.23
24_N	30_G	0.785	0.23
311_E	377_Q	0.779	0.22
51_A	199_W	0.778	0.22
51_A	54_E	0.774	0.22
149_E	204_R	0.774	0.22
121_G	305_G	0.768	0.22
11_P	101_L	0.767	0.22
329_N	335_D	0.765	0.22
77_L	93_L	0.764	0.22
276_A	282_E	0.763	0.22
384_L	390_I	0.758	0.22
239_D	295_R	0.757	0.22
19_F	41_V	0.753	0.21
331_L	387_R	0.750	0.21
16_S	37_I	0.747	0.21
378_I	384_L	0.744	0.21
87_A	90_G	0.743	0.21
116_T	358_V	0.743	0.21
90_G	256_E	0.742	0.21
254_H	262_A	0.741	0.21
148_L	163_A	0.740	0.21
219_V	317_A	0.739	0.21
105_D	177_R	0.738	0.21
129_P	304_T	0.737	0.21
175_A	305_G	0.735	0.21
326_G	391_E	0.734	0.21
279_I	292_E	0.730	0.21
91_A	120_E	0.730	0.21
34_F	40_A	0.725	0.20
378_I	382_Q	0.725	0.20
354_F	390_I	0.724	0.20
20_N	25_N	0.724	0.20
254_H	267_V	0.723	0.20
358_V	361_D	0.720	0.20
160_M	172_Q	0.719	0.20
210_E	214_R	0.716	0.20
44_A	48_V	0.714	0.20
244_D	247_E	0.713	0.20
326_G	354_F	0.712	0.20
120_E	219_V	0.711	0.20
142_Q	205_L	0.709	0.20
28_P	44_A	0.709	0.20
34_F	94_G	0.707	0.20
262_A	328_A	0.706	0.20
106_V	219_V	0.705	0.20
254_H	293_S	0.704	0.20
54_E	382_Q	0.703	0.20
189_A	210_E	0.702	0.20
107_L	259_L	0.701	0.20
35_T	52_A	0.700	0.20
118_D	262_A	0.699	0.20
328_A	335_D	0.698	0.19
39_P	51_A	0.696	0.19
269_D	280_V	0.696	0.19
59_C	101_L	0.695	0.19
16_S	36_T	0.695	0.19
31_A	88_H	0.693	0.19
87_A	94_G	0.692	0.19
111_V	249_V	0.692	0.19
119_I	329_N	0.691	0.19
142_Q	155_Y	0.690	0.19
328_A	334_A	0.689	0.19
68_D	316_D	0.689	0.19
220_V	315_F	0.688	0.19
179_S	357_A	0.688	0.19
104_A	117_T	0.687	0.19
235_A	347_P	0.686	0.19
116_T	124_T	0.685	0.19
79_D	82_G	0.684	0.19
81_A	84_I	0.684	0.19
37_I	40_A	0.682	0.19
281_G	284_S	0.680	0.19
119_I	306_V	0.678	0.19
180_P	212_R	0.678	0.19
8_V	380_A	0.677	0.19
83_L	90_G	0.676	0.19
176_F	215_T	0.673	0.19
64_G	233_N	0.672	0.19
55_F	377_Q	0.671	0.19
29_E	379_A	0.671	0.19
175_A	304_T	0.670	0.19
213_T	312_A	0.670	0.19
82_G	223_N	0.669	0.19
310_I	324_F	0.669	0.19
168_E	358_V	0.668	0.18
44_A	148_L	0.667	0.18
219_V	301_Y	0.666	0.18
44_A	365_G	0.666	0.18
94_G	139_E	0.663	0.18
351_A	379_A	0.662	0.18
359_H	364_D	0.661	0.18
262_A	371_D	0.661	0.18
280_V	283_P	0.659	0.18
331_L	335_D	0.659	0.18
12_S	16_S	0.658	0.18
345_L	367_L	0.658	0.18
77_L	255_A	0.657	0.18
17_T	389_V	0.657	0.18
348_D	383_D	0.654	0.18
368_H	393_I	0.653	0.18
143_W	226_D	0.652	0.18
56_G	186_V	0.651	0.18
71_R	143_W	0.649	0.18
20_N	230_A	0.647	0.18
71_R	226_D	0.646	0.18
95_N	109_H	0.646	0.18
120_E	136_L	0.646	0.18
28_P	255_A	0.643	0.18
46_V	108_I	0.642	0.18
11_P	30_G	0.641	0.18
118_D	296_E	0.640	0.18
287_Q	290_G	0.640	0.18
336_G	369_A	0.640	0.18
155_Y	298_V	0.639	0.18
117_T	121_G	0.639	0.18
128_D	352_E	0.635	0.17
104_A	175_A	0.635	0.17
8_V	11_P	0.628	0.17
83_L	139_E	0.627	0.17
23_T	34_F	0.626	0.17
104_A	199_W	0.626	0.17
45_Y	93_L	0.624	0.17
137_E	309_A	0.623	0.17
129_P	305_G	0.623	0.17
363_G	366_F	0.623	0.17
212_R	379_A	0.621	0.17
178_T	192_L	0.620	0.17
101_L	120_E	0.620	0.17
70_T	271_R	0.620	0.17
362_V	368_H	0.620	0.17
18_F	119_I	0.620	0.17
13_V	100_D	0.619	0.17
64_G	71_R	0.616	0.17
279_I	283_P	0.616	0.17
219_V	249_V	0.615	0.17
6_G	29_E	0.614	0.17
147_V	176_F	0.612	0.17
96_Q	107_L	0.610	0.17
127_H	233_N	0.610	0.17
207_L	376_R	0.610	0.17
61_P	124_T	0.609	0.17
17_T	23_T	0.607	0.17
49_E	316_D	0.607	0.17
275_D	285_D	0.605	0.17
185_Q	289_A	0.604	0.16
33_P	40_A	0.603	0.16
78_V	127_H	0.603	0.16
169_L	186_V	0.601	0.16
371_D	387_R	0.600	0.16
93_L	177_R	0.600	0.16
61_P	174_S	0.599	0.16
100_D	199_W	0.598	0.16
92_G	97_F	0.597	0.16
325_P	350_T	0.597	0.16
33_P	39_P	0.597	0.16
6_G	16_S	0.596	0.16
289_A	292_E	0.595	0.16
234_W	302_G	0.595	0.16
61_P	74_P	0.594	0.16
48_V	185_Q	0.594	0.16
35_T	112_D	0.593	0.16
352_E	380_A	0.593	0.16
64_G	244_D	0.593	0.16
182_E	265_G	0.592	0.16
206_E	209_R	0.591	0.16
59_C	64_G	0.591	0.16
207_L	260_T	0.590	0.16
51_A	65_F	0.589	0.16
115_G	129_P	0.586	0.16
148_L	252_S	0.586	0.16
138_T	292_E	0.586	0.16
284_S	310_I	0.585	0.16
255_A	346_E	0.584	0.16
96_Q	111_V	0.583	0.16
58_E	168_E	0.582	0.16
275_D	278_T	0.580	0.16
6_G	23_T	0.580	0.16
369_A	390_I	0.579	0.16
30_G	35_T	0.577	0.16
179_S	319_G	0.577	0.16
56_G	158_Q	0.575	0.16
66_C	224_K	0.574	0.16
13_V	107_L	0.574	0.16
95_N	139_E	0.574	0.16
12_S	20_N	0.574	0.16
66_C	69_G	0.573	0.16
84_I	228_P	0.572	0.16
372_C	377_Q	0.571	0.16
268_V	298_V	0.570	0.16
143_W	224_K	0.569	0.15
15_K	79_D	0.568	0.15
14_G	79_D	0.568	0.15
9_G	79_D	0.568	0.15
136_L	365_G	0.568	0.15
84_I	110_V	0.568	0.15
189_A	389_V	0.567	0.15
213_T	316_D	0.567	0.15
218_M	300_E	0.566	0.15
85_P	152_I	0.566	0.15
132_D	167_V	0.564	0.15
30_G	111_V	0.564	0.15
58_E	232_A	0.564	0.15
87_A	98_L	0.563	0.15
33_P	97_F	0.562	0.15
274_D	277_F	0.561	0.15
380_A	391_E	0.560	0.15
234_W	364_D	0.560	0.15
73_V	372_C	0.559	0.15
189_A	288_R	0.558	0.15
34_F	98_L	0.558	0.15
7_L	113_F	0.556	0.15
39_P	105_D	0.554	0.15
38_D	41_V	0.554	0.15
327_S	354_F	0.554	0.15
96_Q	156_E	0.553	0.15
115_G	226_D	0.553	0.15
178_T	215_T	0.552	0.15
38_D	76_K	0.551	0.15
36_T	79_D	0.549	0.15
211_M	323_V	0.548	0.15
290_G	296_E	0.548	0.15
378_I	392_I	0.547	0.15
109_H	136_L	0.547	0.15
49_E	292_E	0.547	0.15
355_A	359_H	0.545	0.15
112_D	143_W	0.544	0.15
12_S	342_V	0.544	0.15
96_Q	389_V	0.543	0.15
235_A	238_T	0.541	0.15
362_V	365_G	0.540	0.15
293_S	390_I	0.540	0.15
255_A	331_L	0.539	0.15
155_Y	246_L	0.539	0.15
48_V	75_T	0.539	0.15
34_F	97_F	0.539	0.15
92_G	95_N	0.538	0.15
389_V	392_I	0.537	0.15
20_N	68_D	0.537	0.15
5_V	21_A	0.535	0.15
5_V	249_V	0.535	0.15
31_A	37_I	0.534	0.15
81_A	95_N	0.534	0.15
40_A	80_V	0.533	0.14
35_T	226_D	0.533	0.14
49_E	54_E	0.532	0.14
178_T	275_D	0.532	0.14
87_A	97_F	0.531	0.14
234_W	257_Q	0.530	0.14
80_V	83_L	0.529	0.14
34_F	87_A	0.529	0.14
143_W	325_P	0.527	0.14
155_Y	176_F	0.525	0.14
365_G	369_A	0.525	0.14
217_P	313_A	0.525	0.14
6_G	151_G	0.524	0.14
12_S	36_T	0.523	0.14
121_G	175_A	0.523	0.14
115_G	344_L	0.523	0.14
35_T	50_C	0.521	0.14
113_F	248_F	0.521	0.14
118_D	190_L	0.519	0.14
60_T	337_R	0.518	0.14
86_G	92_G	0.518	0.14
327_S	391_E	0.517	0.14
149_E	283_P	0.516	0.14
83_L	94_G	0.516	0.14
148_L	172_Q	0.515	0.14
374_A	378_I	0.513	0.14
186_V	190_L	0.513	0.14
351_A	367_L	0.512	0.14
135_F	147_V	0.512	0.14
384_L	392_I	0.512	0.14
8_V	14_G	0.510	0.14
8_V	15_K	0.510	0.14
277_F	282_E	0.510	0.14
77_L	219_V	0.510	0.14
58_E	192_L	0.510	0.14
144_Y	208_A	0.508	0.14
106_V	122_E	0.508	0.14
7_L	105_D	0.507	0.14
125_E	227_T	0.506	0.14
184_K	261_Q	0.506	0.14
206_E	210_E	0.506	0.14
140_L	214_R	0.505	0.14
148_L	173_M	0.505	0.14
130_R	236_A	0.504	0.14
10_K	175_A	0.504	0.14
98_L	148_L	0.504	0.14
30_G	293_S	0.503	0.14
222_A	248_F	0.502	0.14
53_P	335_D	0.501	0.14
71_R	112_D	0.501	0.14
121_G	143_W	0.500	0.14
134_D	191_D	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1wxqA	1	0.8636	100	0.376	Contact Map
1jalA	1	0.8283	100	0.509	Contact Map
2dbyA	1	0.8384	100	0.517	Contact Map
1ni3A	1	0.8662	100	0.535	Contact Map
2ohfA	1	0.75	100	0.607	Contact Map
4a9aA	1	0.7348	100	0.666	Contact Map
1lnzA	1	0.4697	100	0.786	Contact Map
4csu9	1	0.447	100	0.798	Contact Map
1udxA	1	0.5732	100	0.808	Contact Map
3ievA	1	0.7348	100	0.81	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0114 seconds.