Q9HNX2 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HNX2 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HNX2	Sequences: MPEGCRACLIAFLLPPVPFGGPKPFPGGDAEYCRMSDASDDRTRVEWREWGSDAFADARERGVPLLVSVVATWSESCRAMAQRTYAEPRIAANINDDFVPVRVNAARRPRVRERYNMGGFPSTVFVTPDGEHIAGATFLEPDGFRQVLQRVRETWDDAGADAGSVPRALSGGEPPAAPLSGDIEGLVAGQLADQYDSEHAGWGSSEKFPLPETVSFALKRDRDRALRTLDAIRRHLVGDDGGCFRFAHGRDWSDPQTERTLSVNAGMLAAFAHAYLTTGDDEYRGAATGVLDYLTETLWTGAAFGAGETPDGGVDDAAYADGNALAADALLSLAAYTGDDRATRYAERTLDYIADELLVDDTVRHYAGAAAPVGLLADRARVTGALTTAGQVLDPAYLEPARAVADRAIADLQDDTGAFVDGPETGAGLLDEPLRPIDDTAAMADALVDLSYLTGEARYRDAARDAIAAFAGAAERMGVQVAGYATAAARLSTRPLVIRVADDPGSELHRAALRMADHEKVVAVGVDGDPGTAWLDTADGDTDAVATPSALAALVADTAQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	560 (509)
Sequences:	212 (178)
Seq/√Len:	7.9

BACSU - YYAL
HALSA - Q9HNX2 Q9HQ68
SULSO - Q97WL2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
98_F	125_F	4.463	0.99
74_S	78_R	4.283	0.98
408_A	443_M	4.272	0.98
536_D	541_D	3.909	0.97
136_A	139_L	3.595	0.95
324_A	385_A	3.579	0.95
76_S	79_A	3.551	0.94
57_D	61_R	3.497	0.94
75_E	79_A	3.423	0.93
45_V	91_A	3.374	0.93
87_E	90_I	3.322	0.92
306_A	312_G	3.161	0.90
74_S	256_Q	3.151	0.90
69_V	115_Y	3.113	0.89
265_A	329_A	3.105	0.89
246_F	256_Q	3.092	0.89
125_F	264_N	3.043	0.88
71_A	106_A	3.028	0.88
105_A	112_R	3.011	0.87
243_C	267_M	2.973	0.87
75_E	256_Q	2.872	0.85
81_A	85_Y	2.829	0.84
230_D	283_Y	2.809	0.83
68_S	260_T	2.765	0.82
106_A	317_A	2.762	0.82
66_L	123_T	2.729	0.81
350_L	389_A	2.657	0.80
55_F	65_L	2.653	0.79
71_A	260_T	2.644	0.79
73_W	106_A	2.642	0.79
199_H	250_R	2.562	0.77
125_F	144_F	2.555	0.77
75_E	78_R	2.539	0.76
68_S	71_A	2.509	0.75
62_G	159_G	2.448	0.73
498_I	535_L	2.407	0.72
196_D	207_K	2.395	0.72
74_S	77_C	2.362	0.71
429_L	438_D	2.321	0.69
304_F	307_G	2.310	0.69
51_G	54_A	2.304	0.69
271_F	274_A	2.229	0.66
82_Q	99_V	2.210	0.65
65_L	101_V	2.182	0.64
401_A	450_L	2.128	0.62
309_T	312_G	2.111	0.61
284_R	333_L	2.109	0.61
76_S	256_Q	2.096	0.61
64_P	125_F	2.063	0.60
201_G	207_K	2.047	0.59
66_L	94_I	1.989	0.57
73_W	307_G	1.988	0.57
73_W	85_Y	1.986	0.57
67_V	126_V	1.972	0.56
71_A	85_Y	1.936	0.54
208_F	245_R	1.934	0.54
78_R	256_Q	1.926	0.54
71_A	317_A	1.911	0.53
534_W	544_A	1.892	0.53
76_S	309_T	1.889	0.53
363_V	374_G	1.871	0.52
66_L	85_Y	1.865	0.52
315_D	323_N	1.842	0.51
328_D	388_T	1.835	0.50
293_Y	487_A	1.833	0.50
70_V	122_S	1.804	0.49
71_A	319_Y	1.785	0.48
70_V	102_R	1.781	0.48
118_G	137_T	1.776	0.48
238_G	289_G	1.763	0.47
196_D	201_G	1.759	0.47
107_R	137_T	1.748	0.47
67_V	115_Y	1.732	0.46
324_A	386_L	1.726	0.46
304_F	309_T	1.717	0.46
64_P	133_I	1.716	0.46
74_S	79_A	1.691	0.45
81_A	106_A	1.685	0.44
44_R	70_V	1.670	0.44
334_A	343_T	1.669	0.44
327_A	349_T	1.667	0.44
309_T	541_D	1.657	0.43
99_V	254_D	1.655	0.43
306_A	311_D	1.628	0.42
331_L	389_A	1.614	0.41
308_E	314_V	1.612	0.41
44_R	72_T	1.606	0.41
70_V	112_R	1.601	0.41
73_W	319_Y	1.578	0.40
78_R	105_A	1.566	0.40
75_E	536_D	1.564	0.40
112_R	120_F	1.545	0.39
72_T	76_S	1.522	0.38
70_V	105_A	1.517	0.38
533_A	551_L	1.511	0.37
112_R	245_R	1.507	0.37
68_S	106_A	1.507	0.37
78_R	309_T	1.499	0.37
112_R	208_F	1.499	0.37
276_L	302_A	1.497	0.37
85_Y	106_A	1.489	0.37
75_E	541_D	1.487	0.37
547_T	550_A	1.485	0.36
260_T	317_A	1.482	0.36
383_T	446_A	1.479	0.36
256_Q	260_T	1.468	0.36
44_R	102_R	1.467	0.36
106_A	260_T	1.451	0.35
44_R	317_A	1.439	0.35
259_R	310_P	1.436	0.35
105_A	122_S	1.430	0.34
158_A	161_D	1.428	0.34
307_G	322_G	1.420	0.34
51_G	55_F	1.407	0.34
94_I	100_P	1.407	0.34
132_H	249_G	1.405	0.34
304_F	308_E	1.405	0.34
243_C	264_N	1.403	0.33
106_A	319_Y	1.399	0.33
118_G	245_R	1.398	0.33
294_L	326_A	1.387	0.33
297_T	314_V	1.384	0.33
139_L	144_F	1.376	0.32
245_R	263_V	1.375	0.32
85_Y	123_T	1.365	0.32
347_E	394_D	1.352	0.32
300_T	305_G	1.351	0.32
76_S	260_T	1.346	0.31
295_T	345_Y	1.345	0.31
200_A	248_H	1.340	0.31
510_R	522_V	1.338	0.31
232_I	441_A	1.338	0.31
101_V	453_L	1.335	0.31
80_M	102_R	1.334	0.31
112_R	317_A	1.331	0.31
43_T	81_A	1.330	0.31
306_A	309_T	1.320	0.30
77_C	258_E	1.317	0.30
101_V	546_A	1.316	0.30
44_R	105_A	1.315	0.30
43_T	71_A	1.311	0.30
260_T	322_G	1.311	0.30
230_D	280_D	1.310	0.30
288_T	339_D	1.305	0.30
70_V	75_E	1.304	0.30
70_V	83_R	1.302	0.30
350_L	385_A	1.298	0.30
68_S	83_R	1.294	0.30
351_D	397_Y	1.290	0.29
137_T	245_R	1.287	0.29
71_A	74_S	1.286	0.29
268_L	294_L	1.278	0.29
90_I	144_F	1.260	0.28
85_Y	102_R	1.259	0.28
72_T	317_A	1.252	0.28
99_V	150_R	1.247	0.28
75_E	246_F	1.240	0.28
262_S	322_G	1.239	0.28
77_C	256_Q	1.239	0.28
75_E	309_T	1.239	0.28
76_S	137_T	1.238	0.28
79_A	256_Q	1.230	0.27
102_R	105_A	1.230	0.27
324_A	353_I	1.225	0.27
229_L	271_F	1.225	0.27
166_P	298_L	1.223	0.27
105_A	120_F	1.220	0.27
119_G	196_D	1.217	0.27
140_E	478_G	1.216	0.27
202_W	217_A	1.213	0.27
86_A	404_V	1.205	0.27
249_G	257_T	1.205	0.27
87_E	141_P	1.205	0.27
73_W	260_T	1.202	0.27
79_A	120_F	1.202	0.27
147_V	151_V	1.201	0.27
44_R	71_A	1.200	0.27
71_A	102_R	1.197	0.26
319_Y	325_L	1.195	0.26
74_S	119_G	1.190	0.26
70_V	106_A	1.187	0.26
119_G	256_Q	1.179	0.26
306_A	353_I	1.176	0.26
303_A	324_A	1.175	0.26
79_A	309_T	1.175	0.26
83_R	105_A	1.160	0.25
106_A	262_S	1.156	0.25
267_M	271_F	1.153	0.25
119_G	245_R	1.152	0.25
85_Y	322_G	1.152	0.25
118_G	208_F	1.147	0.25
71_A	105_A	1.145	0.25
107_R	122_S	1.141	0.25
309_T	536_D	1.137	0.25
320_A	363_V	1.131	0.24
343_T	389_A	1.130	0.24
90_I	143_G	1.129	0.24
69_V	317_A	1.123	0.24
71_A	112_R	1.121	0.24
534_W	541_D	1.121	0.24
119_G	208_F	1.119	0.24
75_E	102_R	1.117	0.24
102_R	112_R	1.110	0.24
43_T	260_T	1.103	0.24
136_A	144_F	1.094	0.23
112_R	122_S	1.093	0.23
47_W	121_P	1.088	0.23
44_R	112_R	1.088	0.23
426_G	429_L	1.086	0.23
228_T	232_I	1.084	0.23
69_V	106_A	1.083	0.23
260_T	309_T	1.079	0.23
115_Y	118_G	1.076	0.23
74_S	138_F	1.074	0.23
246_F	252_W	1.071	0.23
91_A	317_A	1.064	0.22
60_E	314_V	1.061	0.22
79_A	102_R	1.059	0.22
86_A	130_G	1.059	0.22
119_G	207_K	1.055	0.22
68_S	85_Y	1.048	0.22
525_G	528_G	1.040	0.22
354_A	386_L	1.039	0.22
223_D	399_E	1.035	0.22
76_S	541_D	1.034	0.22
47_W	58_A	1.032	0.22
153_E	460_R	1.031	0.21
68_S	315_D	1.030	0.21
304_F	310_P	1.026	0.21
245_R	260_T	1.021	0.21
85_Y	137_T	1.021	0.21
83_R	91_A	1.020	0.21
306_A	322_G	1.017	0.21
233_R	271_F	1.017	0.21
107_R	112_R	1.014	0.21
104_N	121_P	1.011	0.21
354_A	393_L	1.007	0.21
115_Y	216_F	1.006	0.21
133_I	139_L	1.006	0.21
226_L	466_A	1.006	0.21
77_C	196_D	1.005	0.21
105_A	133_I	1.003	0.21
333_L	337_T	1.003	0.21
77_C	115_Y	1.003	0.21
44_R	91_A	0.998	0.21
70_V	260_T	0.995	0.21
137_T	260_T	0.991	0.20
43_T	102_R	0.989	0.20
76_S	120_F	0.988	0.20
300_T	314_V	0.986	0.20
76_S	536_D	0.984	0.20
256_Q	541_D	0.983	0.20
48_R	57_D	0.983	0.20
79_A	260_T	0.982	0.20
71_A	123_T	0.982	0.20
71_A	256_Q	0.979	0.20
137_T	208_F	0.978	0.20
56_A	60_E	0.976	0.20
294_L	430_L	0.976	0.20
317_A	322_G	0.972	0.20
296_E	445_D	0.971	0.20
78_R	260_T	0.971	0.20
327_A	453_L	0.969	0.20
75_E	260_T	0.967	0.20
105_A	260_T	0.966	0.20
249_G	259_R	0.963	0.20
284_R	288_T	0.960	0.20
307_G	310_P	0.959	0.20
268_L	272_A	0.956	0.20
256_Q	536_D	0.953	0.19
152_R	438_D	0.952	0.19
251_D	500_V	0.951	0.19
99_V	152_R	0.951	0.19
101_V	397_Y	0.950	0.19
110_R	408_A	0.950	0.19
394_D	398_L	0.947	0.19
347_E	351_D	0.943	0.19
102_R	262_S	0.939	0.19
94_I	144_F	0.931	0.19
112_R	263_V	0.925	0.19
112_R	256_Q	0.919	0.19
331_L	350_L	0.919	0.19
133_I	263_V	0.916	0.19
503_D	529_D	0.915	0.18
71_A	75_E	0.915	0.18
245_R	267_M	0.912	0.18
75_E	138_F	0.911	0.18
66_L	81_A	0.911	0.18
236_L	254_D	0.911	0.18
89_R	518_H	0.909	0.18
380_A	408_A	0.908	0.18
112_R	137_T	0.908	0.18
355_D	456_E	0.908	0.18
240_D	297_T	0.899	0.18
324_A	350_L	0.899	0.18
72_T	106_A	0.898	0.18
474_A	535_L	0.896	0.18
506_S	514_R	0.895	0.18
92_A	96_D	0.894	0.18
71_A	81_A	0.892	0.18
111_V	155_W	0.891	0.18
387_T	450_L	0.889	0.18
151_V	236_L	0.886	0.18
270_A	325_L	0.886	0.18
473_A	508_L	0.886	0.18
467_I	488_A	0.886	0.18
540_G	549_S	0.885	0.18
68_S	80_M	0.883	0.18
113_E	391_Q	0.882	0.18
532_T	546_A	0.879	0.18
541_D	544_A	0.879	0.18
318_A	386_L	0.879	0.18
68_S	322_G	0.878	0.18
90_I	141_P	0.876	0.18
119_G	246_F	0.874	0.17
56_A	228_T	0.872	0.17
268_L	441_A	0.872	0.17
246_F	261_L	0.871	0.17
205_S	302_A	0.870	0.17
68_S	78_R	0.868	0.17
193_D	414_D	0.868	0.17
81_A	102_R	0.867	0.17
137_T	263_V	0.867	0.17
105_A	245_R	0.867	0.17
106_A	112_R	0.866	0.17
68_S	79_A	0.864	0.17
343_T	522_V	0.863	0.17
102_R	106_A	0.859	0.17
65_L	359_V	0.859	0.17
229_L	274_A	0.855	0.17
76_S	310_P	0.852	0.17
138_F	256_Q	0.851	0.17
216_F	220_R	0.851	0.17
71_A	83_R	0.848	0.17
97_D	393_L	0.847	0.17
48_R	100_P	0.847	0.17
354_A	374_G	0.845	0.17
72_T	260_T	0.842	0.17
103_V	245_R	0.841	0.17
70_V	317_A	0.838	0.17
136_A	485_A	0.836	0.17
70_V	73_W	0.833	0.17
324_A	349_T	0.833	0.17
363_V	382_V	0.832	0.17
75_E	257_T	0.832	0.17
65_L	100_P	0.831	0.17
73_W	81_A	0.829	0.16
70_V	79_A	0.828	0.16
74_S	246_F	0.828	0.16
434_L	438_D	0.825	0.16
329_A	345_Y	0.824	0.16
401_A	446_A	0.824	0.16
81_A	480_Q	0.823	0.16
45_V	70_V	0.823	0.16
239_D	259_R	0.822	0.16
52_S	56_A	0.821	0.16
116_N	244_F	0.821	0.16
78_R	120_F	0.819	0.16
351_D	394_D	0.818	0.16
109_P	378_D	0.816	0.16
131_E	167_R	0.816	0.16
85_Y	107_R	0.816	0.16
90_I	192_A	0.815	0.16
215_S	269_A	0.814	0.16
191_L	203_G	0.814	0.16
232_I	267_M	0.813	0.16
104_N	239_D	0.812	0.16
132_H	250_R	0.810	0.16
74_S	112_R	0.805	0.16
44_R	106_A	0.803	0.16
98_F	258_E	0.801	0.16
247_A	342_A	0.800	0.16
56_A	63_V	0.800	0.16
410_A	465_D	0.799	0.16
256_Q	309_T	0.798	0.16
126_V	432_E	0.798	0.16
90_I	153_E	0.797	0.16
354_A	400_P	0.796	0.16
235_H	254_D	0.796	0.16
144_F	186_L	0.794	0.16
71_A	262_S	0.793	0.16
75_E	120_F	0.792	0.16
195_Y	224_R	0.790	0.16
350_L	357_L	0.790	0.16
68_S	317_A	0.789	0.16
268_L	291_L	0.787	0.16
71_A	322_G	0.787	0.16
290_V	383_T	0.786	0.16
306_A	310_P	0.784	0.15
327_A	367_A	0.784	0.15
87_E	547_T	0.779	0.15
151_V	159_G	0.777	0.15
142_D	298_L	0.775	0.15
428_G	436_P	0.775	0.15
173_E	302_A	0.774	0.15
165_V	191_L	0.773	0.15
127_T	243_C	0.773	0.15
135_G	205_S	0.771	0.15
102_R	317_A	0.770	0.15
135_G	319_Y	0.770	0.15
122_S	319_Y	0.770	0.15
118_G	260_T	0.770	0.15
492_S	529_D	0.768	0.15
54_A	99_V	0.765	0.15
43_T	322_G	0.765	0.15
80_M	207_K	0.764	0.15
529_D	550_A	0.762	0.15
68_S	118_G	0.761	0.15
66_L	436_P	0.760	0.15
101_V	520_K	0.760	0.15
121_P	242_G	0.760	0.15
363_V	379_R	0.758	0.15
451_S	454_T	0.756	0.15
79_A	536_D	0.755	0.15
228_T	287_A	0.754	0.15
235_H	249_G	0.753	0.15
67_V	111_V	0.753	0.15
160_A	198_E	0.752	0.15
207_K	246_F	0.752	0.15
209_P	267_M	0.751	0.15
202_W	214_V	0.751	0.15
510_R	515_M	0.750	0.15
247_A	271_F	0.749	0.15
66_L	132_H	0.749	0.15
73_W	317_A	0.746	0.15
384_G	483_G	0.746	0.15
103_V	208_F	0.746	0.15
89_R	290_V	0.745	0.15
363_V	404_V	0.745	0.15
118_G	398_L	0.741	0.15
147_V	192_A	0.736	0.14
237_V	348_R	0.735	0.14
55_F	111_V	0.735	0.14
118_G	259_R	0.735	0.14
283_Y	485_A	0.734	0.14
105_A	317_A	0.732	0.14
259_R	307_G	0.732	0.14
132_H	240_D	0.732	0.14
111_V	168_A	0.731	0.14
106_A	123_T	0.731	0.14
354_A	358_L	0.730	0.14
497_V	539_D	0.729	0.14
66_L	151_V	0.729	0.14
302_A	485_A	0.728	0.14
339_D	397_Y	0.727	0.14
108_R	316_D	0.726	0.14
535_L	551_L	0.724	0.14
288_T	292_D	0.724	0.14
132_H	263_V	0.723	0.14
44_R	84_T	0.722	0.14
65_L	491_L	0.722	0.14
101_V	301_G	0.722	0.14
74_S	258_E	0.720	0.14
99_V	281_D	0.720	0.14
500_V	525_G	0.719	0.14
249_G	379_R	0.717	0.14
264_N	380_A	0.716	0.14
43_T	86_A	0.716	0.14
512_A	516_A	0.715	0.14
94_I	531_G	0.714	0.14
251_D	321_D	0.713	0.14
44_R	85_Y	0.713	0.14
124_V	128_P	0.713	0.14
487_A	495_P	0.712	0.14
79_A	541_D	0.712	0.14
68_S	76_S	0.709	0.14
200_A	227_R	0.708	0.14
118_G	264_N	0.707	0.14
463_A	485_A	0.707	0.14
142_D	432_E	0.705	0.14
85_Y	440_T	0.704	0.14
329_A	391_Q	0.703	0.14
63_V	301_G	0.702	0.14
207_K	256_Q	0.699	0.14
206_E	224_R	0.699	0.14
245_R	256_Q	0.696	0.14
108_R	375_L	0.695	0.14
111_V	398_L	0.695	0.14
218_L	225_A	0.695	0.14
50_W	143_G	0.695	0.14
150_R	324_A	0.694	0.14
68_S	73_W	0.693	0.14
220_R	320_A	0.692	0.14
74_S	104_N	0.692	0.14
74_S	196_D	0.691	0.14
262_S	440_T	0.691	0.14
68_S	102_R	0.690	0.14
70_V	85_Y	0.689	0.14
47_W	104_N	0.689	0.14
98_F	144_F	0.689	0.14
93_N	176_A	0.688	0.14
54_A	101_V	0.686	0.13
68_S	77_C	0.685	0.13
320_A	430_L	0.685	0.13
506_S	549_S	0.684	0.13
166_P	214_V	0.684	0.13
138_F	252_W	0.682	0.13
74_S	260_T	0.682	0.13
333_L	342_A	0.682	0.13
291_L	333_L	0.681	0.13
236_L	428_G	0.680	0.13
133_I	478_G	0.680	0.13
108_R	287_A	0.677	0.13
63_V	259_R	0.674	0.13
84_T	106_A	0.673	0.13
256_Q	310_P	0.672	0.13
124_V	255_P	0.671	0.13
401_A	447_L	0.671	0.13
107_R	120_F	0.670	0.13
259_R	398_L	0.670	0.13
77_C	119_G	0.669	0.13
107_R	133_I	0.668	0.13
391_Q	449_D	0.667	0.13
318_A	327_A	0.664	0.13
50_W	127_T	0.664	0.13
66_L	135_G	0.661	0.13
127_T	131_E	0.661	0.13
338_G	348_R	0.660	0.13
392_V	529_D	0.660	0.13
74_S	245_R	0.658	0.13
45_V	319_Y	0.658	0.13
111_V	209_P	0.658	0.13
73_W	114_R	0.658	0.13
44_R	69_V	0.656	0.13
298_L	331_L	0.656	0.13
101_V	154_T	0.655	0.13
64_P	265_A	0.655	0.13
77_C	207_K	0.654	0.13
264_N	267_M	0.654	0.13
105_A	208_F	0.653	0.13
304_F	312_G	0.653	0.13
124_V	135_G	0.652	0.13
262_S	317_A	0.651	0.13
95_N	377_A	0.650	0.13
122_S	245_R	0.650	0.13
228_T	304_F	0.650	0.13
468_A	494_R	0.648	0.13
262_S	437_I	0.646	0.13
74_S	248_H	0.645	0.13
275_Y	278_T	0.643	0.13
392_V	417_G	0.643	0.13
368_G	551_L	0.643	0.13
147_V	289_G	0.642	0.13
257_T	321_D	0.641	0.13
109_P	121_P	0.641	0.13
235_H	297_T	0.640	0.13
168_A	188_A	0.640	0.13
211_P	374_G	0.639	0.13
161_D	442_A	0.639	0.13
147_V	365_H	0.637	0.13
144_F	154_T	0.637	0.13
105_A	116_N	0.635	0.13
536_D	544_A	0.635	0.13
263_V	293_Y	0.635	0.13
218_L	279_G	0.634	0.13
239_D	242_G	0.631	0.12
272_A	294_L	0.631	0.12
111_V	303_A	0.629	0.12
235_H	322_G	0.628	0.12
119_G	260_T	0.626	0.12
272_A	400_P	0.626	0.12
118_G	310_P	0.625	0.12
405_A	446_A	0.625	0.12
385_A	404_V	0.624	0.12
119_G	201_G	0.622	0.12
55_F	73_W	0.622	0.12
142_D	186_L	0.621	0.12
137_T	309_T	0.621	0.12
75_E	248_H	0.620	0.12
144_F	273_H	0.620	0.12
244_F	298_L	0.620	0.12
265_A	330_L	0.620	0.12
71_A	76_S	0.619	0.12
88_P	467_I	0.619	0.12
521_V	526_V	0.619	0.12
214_V	270_A	0.618	0.12
370_A	380_A	0.618	0.12
50_W	77_C	0.617	0.12
241_G	315_D	0.617	0.12
77_C	245_R	0.616	0.12
128_P	243_C	0.616	0.12
244_F	251_D	0.615	0.12
138_F	207_K	0.615	0.12
76_S	378_D	0.614	0.12
353_I	376_L	0.613	0.12
73_W	84_T	0.609	0.12
75_E	104_N	0.609	0.12
43_T	85_Y	0.608	0.12
115_Y	196_D	0.608	0.12
319_Y	347_E	0.608	0.12
112_R	232_I	0.608	0.12
121_P	239_D	0.607	0.12
128_P	218_L	0.605	0.12
198_E	356_E	0.605	0.12
70_V	107_R	0.604	0.12
84_T	202_W	0.604	0.12
405_A	450_L	0.604	0.12
95_N	243_C	0.602	0.12
257_T	306_A	0.602	0.12
347_E	398_L	0.602	0.12
158_A	184_E	0.600	0.12
47_W	242_G	0.598	0.12
77_C	124_V	0.598	0.12
69_V	105_A	0.597	0.12
436_P	511_A	0.597	0.12
64_P	551_L	0.596	0.12
55_F	351_D	0.595	0.12
287_A	455_G	0.595	0.12
101_V	307_G	0.595	0.12
502_D	531_G	0.595	0.12
81_A	331_L	0.594	0.12
200_A	207_K	0.594	0.12
67_V	344_R	0.593	0.12
257_T	310_P	0.592	0.12
354_A	382_V	0.590	0.12
246_F	378_D	0.589	0.12
539_D	549_S	0.587	0.12
303_A	307_G	0.586	0.12
112_R	217_A	0.585	0.12
129_D	358_L	0.585	0.12
157_D	467_I	0.584	0.12
324_A	388_T	0.584	0.12
450_L	454_T	0.583	0.12
309_T	378_D	0.583	0.12
531_G	534_W	0.583	0.12
147_V	247_A	0.582	0.12
389_A	392_V	0.582	0.12
133_I	137_T	0.580	0.12
78_R	138_F	0.578	0.12
222_R	264_N	0.578	0.12
528_G	549_S	0.577	0.12
66_L	84_T	0.576	0.12
201_G	228_T	0.576	0.12
346_A	401_A	0.576	0.12
207_K	228_T	0.575	0.12
67_V	438_D	0.575	0.12
58_A	62_G	0.574	0.12
72_T	79_A	0.574	0.12
311_D	390_G	0.573	0.11
140_E	202_W	0.573	0.11
296_E	443_M	0.573	0.11
101_V	238_G	0.573	0.11
291_L	326_A	0.572	0.11
54_A	103_V	0.571	0.11
61_R	65_L	0.569	0.11
125_F	133_I	0.569	0.11
60_E	414_D	0.568	0.11
268_L	326_A	0.567	0.11
127_T	155_W	0.566	0.11
83_R	108_R	0.566	0.11
217_A	374_G	0.565	0.11
43_T	262_S	0.563	0.11
68_S	74_S	0.562	0.11
84_T	319_Y	0.560	0.11
99_V	301_G	0.557	0.11
71_A	79_A	0.555	0.11
146_Q	532_T	0.555	0.11
190_Q	222_R	0.555	0.11
287_A	405_A	0.553	0.11
503_D	521_V	0.553	0.11
169_L	264_N	0.552	0.11
43_T	327_A	0.551	0.11
51_G	453_L	0.551	0.11
123_T	476_R	0.550	0.11
518_H	522_V	0.550	0.11
329_A	378_D	0.549	0.11
144_F	485_A	0.549	0.11
65_L	448_V	0.548	0.11
289_G	298_L	0.547	0.11
102_R	122_S	0.547	0.11
177_A	471_A	0.546	0.11
133_I	304_F	0.546	0.11
161_D	301_G	0.545	0.11
76_S	119_G	0.544	0.11
185_G	225_A	0.543	0.11
365_H	543_D	0.543	0.11
193_D	321_D	0.542	0.11
137_T	207_K	0.542	0.11
336_Y	343_T	0.541	0.11
85_Y	262_S	0.541	0.11
374_G	474_A	0.541	0.11
48_R	232_I	0.541	0.11
508_L	522_V	0.540	0.11
75_E	140_E	0.540	0.11
135_G	325_L	0.538	0.11
407_R	411_D	0.538	0.11
93_N	145_R	0.538	0.11
53_D	275_Y	0.538	0.11
255_P	333_L	0.537	0.11
380_A	387_T	0.537	0.11
366_Y	535_L	0.535	0.11
208_F	256_Q	0.535	0.11
225_A	279_G	0.534	0.11
383_T	405_A	0.533	0.11
143_G	365_H	0.533	0.11
78_R	536_D	0.533	0.11
419_F	429_L	0.532	0.11
43_T	68_S	0.532	0.11
365_H	424_E	0.532	0.11
184_E	320_A	0.532	0.11
70_V	133_I	0.531	0.11
144_F	263_V	0.530	0.11
81_A	482_A	0.530	0.11
65_L	370_A	0.529	0.11
374_G	380_A	0.528	0.11
161_D	319_Y	0.528	0.11
238_G	259_R	0.527	0.11
517_D	548_P	0.526	0.11
196_D	246_F	0.526	0.11
93_N	452_Y	0.525	0.11
65_L	126_V	0.525	0.11
185_G	371_A	0.525	0.11
171_G	291_L	0.525	0.11
110_R	202_W	0.524	0.11
192_A	549_S	0.523	0.11
292_D	362_T	0.522	0.11
275_Y	284_R	0.522	0.11
48_R	61_R	0.521	0.11
290_V	467_I	0.521	0.11
232_I	235_H	0.521	0.11
83_R	379_R	0.521	0.11
135_G	151_V	0.520	0.11
83_R	112_R	0.519	0.11
190_Q	339_D	0.518	0.11
115_Y	323_N	0.517	0.11
232_I	536_D	0.517	0.11
229_L	247_A	0.516	0.11
125_F	209_P	0.515	0.11
72_T	112_R	0.514	0.11
209_P	264_N	0.514	0.11
259_R	380_A	0.514	0.11
505_G	512_A	0.514	0.11
131_E	482_A	0.514	0.11
107_R	354_A	0.513	0.11
112_R	260_T	0.513	0.11
320_A	438_D	0.512	0.11
78_R	541_D	0.512	0.11
493_T	531_G	0.512	0.11
529_D	546_A	0.511	0.10
141_P	255_P	0.511	0.10
87_E	301_G	0.511	0.10
95_N	249_G	0.511	0.10
114_R	331_L	0.511	0.10
140_E	309_T	0.510	0.10
235_H	253_S	0.510	0.10
338_G	545_V	0.509	0.10
235_H	487_A	0.509	0.10
206_E	374_G	0.509	0.10
74_S	293_Y	0.509	0.10
236_L	240_D	0.509	0.10
248_H	255_P	0.508	0.10
47_W	50_W	0.508	0.10
55_F	460_R	0.508	0.10
102_R	246_F	0.507	0.10
63_V	390_G	0.507	0.10
71_A	78_R	0.507	0.10
207_K	252_W	0.507	0.10
71_A	84_T	0.506	0.10
122_S	137_T	0.504	0.10
71_A	77_C	0.503	0.10
249_G	254_D	0.503	0.10
298_L	401_A	0.503	0.10
44_R	75_E	0.502	0.10
91_A	112_R	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4c1sA	1	0.5839	100	0.814	Contact Map
3wkgA	1	0.6464	100	0.826	Contact Map
3vw5A	1	0.6107	100	0.833	Contact Map
2gz6A	2	0.5982	100	0.838	Contact Map
5agdA	1	0.5554	100	0.84	Contact Map
2zzrA	1	0.5929	100	0.843	Contact Map
2zblA	5	0.6286	100	0.847	Contact Map
1fp3A	2	0.6375	100	0.849	Contact Map
2ahfA	1	0.5411	100	0.85	Contact Map
3gt5A	1	0.6036	100	0.851	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0137 seconds.