ATGT - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

ATGT - tRNA-guanine(15) transglycosylase

UniProt:	Q9HNT1	Sequences: MRDVFEVGAQDGLARIGELDVPRAGVTVETPTLMPVVNPNLITVEPSRFVDEFGAELLITNSYIINSDDDLRERALDEGLHEMLGFDGAIMTDSGSFQLAEYGEIDTDTEAILRFQHDIGSDIGTPVDIPTPPDADREQAAAELETTQQRLELAETVDVGDMLVNAPVQGATQPDLREQAGAHAYGTALDLFPVGAVVPLMNQYRYDDMTEAVLAAKRGLGRDAPVHLFGAGHPMMFALAAALGCDLFDSAAYAIYARDDRYLTVSGTEHLDDLHYFPCDCPVCAEHSPQAVRGMAAGDRERLLAEHNLHVSFGEIRRVKQAIKSGTLMELVAARAHAHPSTLDGYRALLDHSDQLEASDPASKDAFFYTGAGSARRPEVHRHHQRLDRLDVDGDDVLLTEGDSNHRYDESWNVLPPFGPYPSALATTYPLTAETPARMDRAGYEAAAEGVCRLAEANPDTAFTLAHDDWPESALEAVPQRVSLYNAVRGE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	491 (460)
Sequences:	209 (163)
Seq/√Len:	7.6

HALSA - ATGT
SULSO - ATGT

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
21_V	24_A	6.167	1.00
279_C	284_C	5.098	0.99
277_F	289_P	4.313	0.98
137_R	141_A	3.839	0.96
146_T	149_Q	3.790	0.96
281_C	284_C	3.638	0.94
211_E	348_A	3.586	0.94
8_G	18_E	3.514	0.93
183_H	186_G	3.438	0.93
276_Y	320_K	3.095	0.88
29_E	320_K	3.033	0.87
205_R	208_D	2.997	0.86
260_D	300_R	2.952	0.85
24_A	89_A	2.823	0.82
99_L	130_P	2.720	0.80
96_S	99_L	2.679	0.79
252_A	312_S	2.626	0.77
163_L	190_D	2.621	0.77
274_L	321_Q	2.615	0.77
217_K	226_V	2.553	0.75
213_V	320_K	2.545	0.75
201_M	209_M	2.542	0.75
14_A	241_A	2.491	0.73
241_A	319_V	2.451	0.72
124_G	162_M	2.437	0.72
100_A	196_A	2.382	0.70
40_N	65_I	2.376	0.69
55_A	313_F	2.359	0.69
224_A	319_V	2.358	0.69
18_E	27_T	2.341	0.68
346_Y	350_L	2.325	0.68
130_P	255_I	2.275	0.66
214_L	320_K	2.272	0.66
16_I	320_K	2.269	0.66
204_Y	339_H	2.250	0.65
96_S	130_P	2.196	0.63
9_A	16_I	2.162	0.62
137_R	175_D	2.135	0.61
126_P	151_L	2.104	0.60
91_M	165_N	2.084	0.59
217_K	229_F	2.050	0.57
177_R	199_P	2.048	0.57
74_R	78_E	2.039	0.57
242_A	255_I	2.037	0.57
331_L	335_R	2.010	0.56
149_Q	201_M	2.000	0.56
97_F	193_P	1.997	0.55
34_M	57_L	1.990	0.55
166_A	189_L	1.972	0.54
109_T	153_L	1.928	0.53
71_L	83_M	1.921	0.52
243_L	320_K	1.904	0.52
51_D	87_D	1.887	0.51
133_P	199_P	1.872	0.50
21_V	346_Y	1.869	0.50
100_A	255_I	1.823	0.48
177_R	216_A	1.813	0.48
220_L	331_L	1.794	0.47
237_F	312_S	1.793	0.47
139_Q	143_E	1.789	0.47
281_C	330_E	1.782	0.47
177_R	196_A	1.771	0.46
97_F	125_T	1.762	0.46
62_S	65_I	1.759	0.46
80_L	90_I	1.710	0.44
91_M	121_S	1.688	0.43
320_K	378_P	1.687	0.43
315_E	335_R	1.674	0.43
163_L	191_L	1.665	0.42
262_Y	284_C	1.664	0.42
225_P	378_P	1.655	0.42
228_L	240_A	1.650	0.42
277_F	295_M	1.636	0.41
100_A	130_P	1.626	0.41
262_Y	281_C	1.615	0.40
202_N	329_M	1.595	0.39
226_V	229_F	1.587	0.39
443_G	447_A	1.578	0.39
96_S	196_A	1.577	0.39
125_T	165_N	1.557	0.38
76_L	118_D	1.553	0.38
33_L	194_V	1.551	0.38
262_Y	279_C	1.547	0.38
130_P	196_A	1.515	0.36
34_M	171_A	1.509	0.36
29_E	276_Y	1.507	0.36
79_G	115_F	1.503	0.36
113_L	327_T	1.502	0.36
133_P	198_V	1.494	0.36
18_E	90_I	1.480	0.35
67_S	87_D	1.464	0.35
40_N	68_D	1.461	0.34
316_I	319_V	1.458	0.34
260_D	297_A	1.458	0.34
280_D	314_G	1.456	0.34
318_R	322_A	1.455	0.34
279_C	330_E	1.449	0.34
12_G	125_T	1.445	0.34
168_V	287_H	1.435	0.34
284_C	326_G	1.421	0.33
58_L	90_I	1.419	0.33
193_P	197_V	1.419	0.33
12_G	96_S	1.417	0.33
267_G	331_L	1.400	0.32
24_A	127_V	1.391	0.32
58_L	80_L	1.389	0.32
284_C	330_E	1.378	0.32
110_E	153_L	1.377	0.32
155_E	221_G	1.359	0.31
142_A	156_T	1.359	0.31
299_D	316_I	1.352	0.31
33_L	312_S	1.350	0.31
140_A	328_L	1.345	0.30
201_M	256_Y	1.342	0.30
286_E	325_S	1.341	0.30
34_M	177_R	1.333	0.30
336_A	377_R	1.333	0.30
252_A	335_R	1.329	0.30
21_V	89_A	1.328	0.30
67_S	106_D	1.325	0.30
262_Y	277_F	1.324	0.30
177_R	197_V	1.324	0.30
262_Y	276_Y	1.319	0.30
98_Q	169_Q	1.309	0.29
281_C	326_G	1.290	0.29
252_A	263_L	1.285	0.28
271_L	383_H	1.284	0.28
191_L	247_L	1.282	0.28
227_H	253_Y	1.276	0.28
193_P	196_A	1.275	0.28
133_P	177_R	1.269	0.28
425_L	428_T	1.268	0.28
134_D	205_R	1.267	0.28
128_D	257_A	1.265	0.28
128_D	249_D	1.265	0.28
249_D	257_A	1.265	0.28
29_E	325_S	1.260	0.28
441_R	451_V	1.254	0.27
84_L	154_A	1.254	0.27
265_V	345_G	1.238	0.27
97_F	199_P	1.238	0.27
8_G	27_T	1.237	0.27
126_P	167_P	1.231	0.27
178_E	218_R	1.229	0.27
285_A	288_S	1.224	0.26
165_N	198_V	1.218	0.26
211_E	357_E	1.213	0.26
206_Y	386_R	1.210	0.26
130_P	262_Y	1.208	0.26
58_L	84_L	1.205	0.26
37_V	295_M	1.203	0.26
65_I	71_L	1.196	0.26
153_L	451_V	1.195	0.26
97_F	197_V	1.195	0.26
32_T	85_G	1.192	0.26
181_G	216_A	1.187	0.25
37_V	58_L	1.185	0.25
447_A	451_V	1.182	0.25
167_P	229_F	1.178	0.25
435_T	456_E	1.174	0.25
177_R	198_V	1.174	0.25
47_S	50_V	1.167	0.25
24_A	346_Y	1.163	0.25
407_R	458_N	1.159	0.25
360_D	418_F	1.159	0.25
33_L	349_L	1.156	0.24
442_A	449_E	1.151	0.24
92_T	169_Q	1.147	0.24
151_L	407_R	1.143	0.24
54_G	278_P	1.141	0.24
121_S	165_N	1.137	0.24
314_G	320_K	1.134	0.24
124_G	361_P	1.131	0.24
136_D	269_E	1.130	0.24
299_D	421_Y	1.128	0.24
13_L	416_P	1.127	0.24
396_D	399_L	1.125	0.24
55_A	252_A	1.119	0.23
71_L	171_A	1.118	0.23
258_R	350_L	1.118	0.23
82_E	421_Y	1.109	0.23
349_L	356_L	1.106	0.23
71_L	193_P	1.106	0.23
42_I	338_A	1.104	0.23
97_F	238_A	1.100	0.23
93_D	195_G	1.099	0.23
13_L	426_A	1.095	0.23
14_A	130_P	1.093	0.23
95_G	195_G	1.087	0.22
235_M	333_A	1.087	0.22
255_I	264_T	1.084	0.22
320_K	324_K	1.084	0.22
61_N	169_Q	1.083	0.22
256_Y	429_Y	1.083	0.22
386_R	389_R	1.082	0.22
48_R	185_Y	1.081	0.22
97_F	177_R	1.080	0.22
174_P	213_V	1.079	0.22
241_A	320_K	1.073	0.22
71_L	75_A	1.068	0.22
452_C	462_A	1.067	0.22
287_H	292_V	1.066	0.22
164_V	177_R	1.066	0.22
283_V	303_L	1.065	0.22
36_V	93_D	1.052	0.21
343_L	369_Y	1.050	0.21
169_Q	232_G	1.049	0.21
433_A	447_A	1.043	0.21
62_S	364_K	1.022	0.21
196_A	255_I	1.020	0.21
102_Y	204_Y	1.011	0.20
97_F	198_V	1.010	0.20
45_E	270_H	1.005	0.20
129_I	150_R	1.003	0.20
148_Q	183_H	0.998	0.20
35_P	232_G	0.996	0.20
455_A	465_L	0.994	0.20
302_R	306_E	0.992	0.20
315_E	377_R	0.992	0.20
190_D	306_E	0.985	0.20
74_R	90_I	0.985	0.20
152_E	183_H	0.985	0.20
36_V	95_G	0.984	0.20
37_V	84_L	0.981	0.20
449_E	455_A	0.980	0.20
96_S	193_P	0.979	0.20
171_A	235_M	0.971	0.19
215_A	432_T	0.970	0.19
244_G	308_N	0.964	0.19
29_E	378_P	0.963	0.19
34_M	84_L	0.962	0.19
61_N	92_T	0.959	0.19
37_V	269_E	0.958	0.19
130_P	281_C	0.957	0.19
97_F	100_A	0.955	0.19
162_M	190_D	0.955	0.19
70_D	100_A	0.954	0.19
97_F	206_Y	0.951	0.19
133_P	193_P	0.945	0.19
28_V	236_M	0.941	0.19
209_M	421_Y	0.940	0.19
205_R	240_A	0.940	0.19
40_N	304_L	0.937	0.19
213_V	258_R	0.936	0.19
102_Y	261_R	0.936	0.19
142_A	445_E	0.934	0.18
76_L	168_V	0.932	0.18
166_A	213_V	0.932	0.18
83_M	237_F	0.932	0.18
213_V	243_L	0.932	0.18
97_F	133_P	0.928	0.18
136_D	351_D	0.925	0.18
319_V	387_L	0.925	0.18
148_Q	152_E	0.925	0.18
444_Y	452_C	0.921	0.18
36_V	169_Q	0.920	0.18
15_R	30_T	0.920	0.18
16_I	29_E	0.919	0.18
227_H	250_S	0.917	0.18
23_R	334_A	0.916	0.18
103_G	204_Y	0.915	0.18
14_A	99_L	0.912	0.18
130_P	242_A	0.910	0.18
133_P	197_V	0.907	0.18
191_L	362_A	0.903	0.18
262_Y	304_L	0.899	0.18
198_V	332_V	0.898	0.18
168_V	325_S	0.898	0.18
109_T	127_V	0.896	0.18
84_L	264_T	0.895	0.18
67_S	83_M	0.895	0.18
143_E	196_A	0.894	0.18
49_F	153_L	0.894	0.18
121_S	231_A	0.893	0.18
75_A	115_F	0.892	0.17
192_F	220_L	0.892	0.17
339_H	368_F	0.890	0.17
251_A	255_I	0.890	0.17
279_C	326_G	0.889	0.17
32_T	398_L	0.889	0.17
391_D	453_R	0.889	0.17
383_H	431_L	0.888	0.17
382_R	436_P	0.886	0.17
206_Y	273_D	0.886	0.17
330_E	419_G	0.882	0.17
94_S	257_A	0.882	0.17
94_S	249_D	0.882	0.17
94_S	128_D	0.882	0.17
316_I	385_Q	0.881	0.17
85_G	353_S	0.877	0.17
95_G	230_G	0.874	0.17
435_T	441_R	0.874	0.17
165_N	177_R	0.872	0.17
149_Q	351_D	0.871	0.17
111_A	293_R	0.871	0.17
93_D	116_Q	0.870	0.17
19_L	37_V	0.869	0.17
56_E	215_A	0.869	0.17
64_I	198_V	0.867	0.17
441_R	445_E	0.867	0.17
106_D	291_A	0.866	0.17
47_S	73_E	0.865	0.17
193_P	199_P	0.862	0.17
35_P	93_D	0.860	0.17
16_I	276_Y	0.855	0.17
442_A	457_A	0.855	0.17
15_R	31_P	0.854	0.17
165_N	431_L	0.850	0.17
96_S	100_A	0.849	0.17
189_L	202_N	0.847	0.16
407_R	415_L	0.846	0.16
69_D	109_T	0.846	0.16
260_D	295_M	0.845	0.16
22_P	332_V	0.845	0.16
60_T	102_Y	0.843	0.16
16_I	345_G	0.841	0.16
63_Y	92_T	0.839	0.16
252_A	418_F	0.833	0.16
349_L	408_Y	0.831	0.16
177_R	193_P	0.831	0.16
130_P	279_C	0.830	0.16
33_L	425_L	0.829	0.16
19_L	187_T	0.827	0.16
99_L	113_L	0.826	0.16
61_N	98_Q	0.826	0.16
46_P	334_A	0.824	0.16
20_D	295_M	0.824	0.16
414_V	432_T	0.824	0.16
165_N	197_V	0.823	0.16
83_M	116_Q	0.822	0.16
34_M	196_A	0.821	0.16
78_E	406_H	0.820	0.16
45_E	157_V	0.815	0.16
36_V	98_Q	0.815	0.16
62_S	306_E	0.813	0.16
449_E	453_R	0.811	0.16
244_G	307_H	0.810	0.16
119_I	323_I	0.810	0.16
220_L	267_G	0.810	0.16
38_N	84_L	0.809	0.16
224_A	365_D	0.808	0.16
92_T	232_G	0.808	0.16
196_A	247_L	0.807	0.16
95_G	116_Q	0.805	0.16
9_A	157_V	0.805	0.16
102_Y	251_A	0.804	0.16
44_V	125_T	0.804	0.16
20_D	27_T	0.801	0.15
65_I	75_A	0.801	0.15
333_A	429_Y	0.800	0.15
113_L	358_A	0.800	0.15
179_Q	183_H	0.799	0.15
129_I	143_E	0.798	0.15
68_D	71_L	0.796	0.15
269_E	274_L	0.795	0.15
36_V	232_G	0.792	0.15
93_D	230_G	0.789	0.15
92_T	98_Q	0.789	0.15
60_T	261_R	0.789	0.15
416_P	419_G	0.789	0.15
407_R	421_Y	0.789	0.15
178_E	295_M	0.788	0.15
116_Q	194_V	0.786	0.15
441_R	452_C	0.785	0.15
406_H	410_E	0.785	0.15
126_P	146_T	0.779	0.15
338_A	354_D	0.777	0.15
79_G	332_V	0.774	0.15
6_E	377_R	0.767	0.15
35_P	95_G	0.766	0.15
11_D	377_R	0.765	0.15
50_V	208_D	0.765	0.15
459_P	466_A	0.765	0.15
149_Q	321_Q	0.764	0.15
16_I	338_A	0.763	0.15
109_T	269_E	0.762	0.15
100_A	132_P	0.761	0.15
250_S	253_Y	0.761	0.15
184_A	263_L	0.759	0.15
102_Y	233_H	0.759	0.15
113_L	352_H	0.758	0.15
237_F	316_I	0.758	0.15
336_A	379_E	0.757	0.15
210_T	243_L	0.756	0.15
409_D	426_A	0.755	0.15
132_P	139_Q	0.754	0.15
75_A	193_P	0.754	0.15
152_E	391_D	0.754	0.15
288_S	421_Y	0.753	0.14
82_E	358_A	0.751	0.14
102_Y	169_Q	0.748	0.14
10_Q	42_I	0.748	0.14
193_P	238_A	0.748	0.14
115_F	198_V	0.748	0.14
237_F	252_A	0.747	0.14
9_A	365_D	0.744	0.14
360_D	382_R	0.744	0.14
302_R	338_A	0.742	0.14
266_S	350_L	0.742	0.14
120_G	124_G	0.742	0.14
96_S	255_I	0.741	0.14
281_C	322_A	0.739	0.14
78_E	288_S	0.738	0.14
64_I	151_L	0.736	0.14
171_A	333_A	0.736	0.14
170_G	249_D	0.736	0.14
128_D	170_G	0.736	0.14
170_G	257_A	0.736	0.14
61_N	232_G	0.736	0.14
357_E	382_R	0.735	0.14
221_G	414_V	0.733	0.14
57_L	123_I	0.732	0.14
98_Q	102_Y	0.730	0.14
206_Y	312_S	0.730	0.14
130_P	284_C	0.730	0.14
6_E	11_D	0.729	0.14
276_Y	407_R	0.727	0.14
267_G	335_R	0.724	0.14
36_V	92_T	0.723	0.14
60_T	204_Y	0.721	0.14
115_F	267_G	0.721	0.14
127_V	189_L	0.720	0.14
108_D	343_L	0.720	0.14
314_G	325_S	0.719	0.14
110_E	114_R	0.719	0.14
114_R	194_V	0.718	0.14
79_G	177_R	0.718	0.14
29_E	163_L	0.712	0.14
29_E	314_G	0.709	0.14
52_E	90_I	0.709	0.14
98_Q	195_G	0.708	0.14
14_A	330_E	0.707	0.14
52_E	354_D	0.707	0.14
82_E	425_L	0.706	0.14
256_Y	334_A	0.704	0.14
95_G	169_Q	0.704	0.14
33_L	212_A	0.703	0.14
156_T	182_A	0.703	0.14
140_A	364_K	0.702	0.14
112_I	333_A	0.701	0.13
375_A	433_A	0.700	0.13
107_T	112_I	0.699	0.13
282_P	310_H	0.698	0.13
366_A	431_L	0.698	0.13
50_V	286_E	0.697	0.13
155_E	187_T	0.697	0.13
63_Y	79_G	0.694	0.13
194_V	312_S	0.694	0.13
100_A	336_A	0.692	0.13
167_P	180_A	0.691	0.13
165_N	366_A	0.691	0.13
116_Q	205_R	0.691	0.13
134_D	304_L	0.690	0.13
168_V	178_E	0.688	0.13
315_E	339_H	0.688	0.13
202_N	326_G	0.686	0.13
178_E	182_A	0.686	0.13
90_I	109_T	0.686	0.13
229_F	253_Y	0.685	0.13
78_E	82_E	0.684	0.13
407_R	411_S	0.684	0.13
98_Q	232_G	0.683	0.13
51_D	58_L	0.681	0.13
448_A	455_A	0.680	0.13
180_A	184_A	0.679	0.13
390_L	451_V	0.678	0.13
34_M	365_D	0.678	0.13
70_D	235_M	0.677	0.13
65_I	80_L	0.677	0.13
97_F	116_Q	0.676	0.13
295_M	300_R	0.676	0.13
360_D	379_E	0.674	0.13
185_Y	221_G	0.674	0.13
147_T	169_Q	0.674	0.13
192_F	224_A	0.674	0.13
106_D	458_N	0.672	0.13
455_A	463_F	0.671	0.13
406_H	456_E	0.669	0.13
99_L	144_L	0.669	0.13
377_R	418_F	0.668	0.13
213_V	311_V	0.665	0.13
36_V	195_G	0.663	0.13
173_Q	386_R	0.663	0.13
150_R	153_L	0.662	0.13
155_E	394_G	0.662	0.13
393_D	465_L	0.662	0.13
155_E	457_A	0.660	0.13
384_H	458_N	0.659	0.13
100_A	193_P	0.659	0.13
12_G	242_A	0.659	0.13
71_L	197_V	0.659	0.13
224_A	394_G	0.658	0.13
95_G	98_Q	0.658	0.13
178_E	219_G	0.657	0.13
353_S	387_L	0.656	0.13
93_D	169_Q	0.656	0.13
39_P	233_H	0.655	0.13
116_Q	121_S	0.654	0.13
179_Q	408_Y	0.653	0.13
21_V	209_M	0.652	0.13
95_G	227_H	0.648	0.13
10_Q	427_T	0.648	0.13
91_M	102_Y	0.648	0.13
66_N	280_D	0.648	0.13
34_M	71_L	0.647	0.13
97_F	196_A	0.647	0.13
362_A	399_L	0.646	0.13
130_P	379_E	0.646	0.13
399_L	451_V	0.646	0.13
157_V	187_T	0.646	0.13
125_T	167_P	0.645	0.12
447_A	459_P	0.642	0.12
31_P	246_D	0.642	0.12
290_Q	293_R	0.641	0.12
118_D	393_D	0.640	0.12
8_G	124_G	0.639	0.12
136_D	161_D	0.639	0.12
454_L	459_P	0.639	0.12
142_A	394_G	0.638	0.12
204_Y	251_A	0.636	0.12
33_L	123_I	0.636	0.12
146_T	191_L	0.636	0.12
394_G	463_F	0.635	0.12
149_Q	385_Q	0.634	0.12
164_V	196_A	0.633	0.12
246_D	308_N	0.632	0.12
193_P	198_V	0.632	0.12
329_M	383_H	0.632	0.12
54_G	81_H	0.631	0.12
182_A	388_D	0.630	0.12
130_P	364_K	0.629	0.12
229_F	243_L	0.629	0.12
394_G	407_R	0.628	0.12
135_A	220_L	0.628	0.12
206_Y	278_P	0.627	0.12
126_P	433_A	0.626	0.12
220_L	335_R	0.625	0.12
94_S	308_N	0.623	0.12
94_S	244_G	0.623	0.12
211_E	440_D	0.622	0.12
55_A	317_R	0.622	0.12
354_D	388_D	0.621	0.12
448_A	463_F	0.620	0.12
165_N	199_P	0.620	0.12
438_R	448_A	0.620	0.12
53_F	85_G	0.618	0.12
93_D	227_H	0.618	0.12
86_F	401_E	0.617	0.12
35_P	98_Q	0.617	0.12
186_G	285_A	0.616	0.12
258_R	367_F	0.615	0.12
35_P	230_G	0.615	0.12
48_R	51_D	0.614	0.12
96_S	125_T	0.614	0.12
262_Y	416_P	0.614	0.12
116_Q	199_P	0.613	0.12
72_R	112_I	0.612	0.12
102_Y	147_T	0.612	0.12
99_L	196_A	0.612	0.12
448_A	452_C	0.611	0.12
313_F	317_R	0.611	0.12
372_A	441_R	0.610	0.12
195_G	230_G	0.610	0.12
140_A	241_A	0.609	0.12
96_S	143_E	0.608	0.12
421_Y	458_N	0.608	0.12
337_H	373_G	0.605	0.12
378_P	429_Y	0.602	0.12
114_R	137_R	0.600	0.12
189_L	379_E	0.600	0.12
450_G	458_N	0.599	0.12
138_E	190_D	0.599	0.12
68_D	428_T	0.597	0.12
78_E	260_D	0.596	0.12
35_P	169_Q	0.596	0.12
35_P	92_T	0.594	0.12
213_V	324_K	0.591	0.12
326_G	330_E	0.590	0.12
396_D	463_F	0.589	0.12
201_M	243_L	0.588	0.12
29_E	213_V	0.588	0.12
441_R	453_R	0.586	0.11
7_V	463_F	0.586	0.11
89_A	318_R	0.585	0.11
211_E	280_D	0.584	0.11
64_I	199_P	0.583	0.11
170_G	308_N	0.582	0.11
170_G	244_G	0.582	0.11
383_H	418_F	0.581	0.11
393_D	397_V	0.581	0.11
281_C	285_A	0.580	0.11
93_D	232_G	0.579	0.11
39_P	115_F	0.578	0.11
151_L	447_A	0.577	0.11
109_T	432_T	0.577	0.11
194_V	243_L	0.576	0.11
119_I	169_Q	0.575	0.11
168_V	277_F	0.574	0.11
252_A	367_F	0.573	0.11
173_Q	314_G	0.573	0.11
54_G	147_T	0.573	0.11
147_T	261_R	0.573	0.11
421_Y	455_A	0.572	0.11
75_A	197_V	0.572	0.11
140_A	283_V	0.571	0.11
138_E	142_A	0.570	0.11
410_E	460_D	0.567	0.11
79_G	267_G	0.565	0.11
93_D	229_F	0.564	0.11
93_D	98_Q	0.564	0.11
183_H	426_A	0.564	0.11
101_E	319_V	0.562	0.11
102_Y	250_S	0.561	0.11
318_R	347_R	0.560	0.11
39_P	60_T	0.559	0.11
91_M	167_P	0.559	0.11
277_F	329_M	0.559	0.11
7_V	28_V	0.559	0.11
130_P	264_T	0.558	0.11
50_V	166_A	0.557	0.11
264_T	364_K	0.556	0.11
92_T	102_Y	0.556	0.11
45_E	243_L	0.555	0.11
259_D	346_Y	0.554	0.11
94_S	195_G	0.552	0.11
258_R	412_W	0.552	0.11
230_G	250_S	0.552	0.11
38_N	58_L	0.550	0.11
177_R	247_L	0.550	0.11
415_L	426_A	0.550	0.11
58_L	178_E	0.549	0.11
452_C	464_T	0.546	0.11
459_P	463_F	0.546	0.11
293_R	298_G	0.543	0.11
237_F	327_T	0.543	0.11
89_A	189_L	0.542	0.11
32_T	313_F	0.542	0.11
32_T	353_S	0.541	0.11
260_D	399_L	0.540	0.11
63_Y	267_G	0.538	0.11
168_V	314_G	0.538	0.11
233_H	256_Y	0.538	0.11
236_M	304_L	0.538	0.11
38_N	64_I	0.537	0.11
95_G	257_A	0.537	0.11
95_G	128_D	0.537	0.11
95_G	249_D	0.537	0.11
381_H	388_D	0.536	0.11
51_D	424_A	0.533	0.11
80_L	343_L	0.533	0.11
49_F	347_R	0.531	0.11
290_Q	356_L	0.530	0.11
13_L	65_I	0.530	0.11
179_Q	295_M	0.528	0.11
196_A	206_Y	0.526	0.11
34_M	199_P	0.526	0.11
218_R	355_Q	0.526	0.11
395_D	420_P	0.525	0.11
306_E	334_A	0.524	0.11
60_T	291_A	0.523	0.11
21_V	127_V	0.523	0.11
78_E	442_A	0.523	0.11
124_G	408_Y	0.523	0.11
92_T	121_S	0.522	0.10
115_F	210_T	0.520	0.10
173_Q	431_L	0.519	0.10
167_P	231_A	0.519	0.10
184_A	448_A	0.515	0.10
118_D	162_M	0.514	0.10
18_E	298_G	0.513	0.10
60_T	233_H	0.512	0.10
46_P	145_E	0.511	0.10
211_E	353_S	0.510	0.10
262_Y	364_K	0.509	0.10
283_V	429_Y	0.508	0.10
106_D	320_K	0.508	0.10
125_T	193_P	0.507	0.10
36_V	61_N	0.507	0.10
290_Q	317_R	0.507	0.10
417_P	436_P	0.505	0.10
63_Y	232_G	0.504	0.10
130_P	416_P	0.504	0.10
156_T	272_D	0.503	0.10
29_E	243_L	0.503	0.10
119_I	315_E	0.502	0.10
13_L	215_A	0.502	0.10
29_E	225_P	0.501	0.10
110_E	410_E	0.501	0.10
59_I	102_Y	0.500	0.10
217_K	354_D	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1iq8A	2	0.947	100	0.336	Contact Map
4q8wA	2	0.6843	100	0.472	Contact Map
2ashA	3	0.6721	100	0.483	Contact Map
2q07A	1	0.2057	99.8	0.886	Contact Map
4oqvA	1	0.5377	88.5	0.971	Contact Map
1nvmA	2	0.6415	85.5	0.973	Contact Map
3vkjA	4	0.6191	83.2	0.973	Contact Map
3sgzA	4	0.5234	78.7	0.975	Contact Map
2qiwA	2	0.4297	77.2	0.975	Contact Map
1jubA	2	0.5418	74.3	0.976	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0128 seconds.