GLPB - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

GLPB - Probable anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B

UniProt:	Q9HNS3	Sequences: MAIESEVLVIGGGLAGITSALAAADAGADTRLVSYKQSTLRNASGLVDVLGYTPSGDGPVVDPFDAIPSLPDAHPYRTVGVDTVRDAMAFFDAHAPRYQGHHTDANALVPTHGGTVKPTARYPASAAAGLASDDRDTLLVGFETLPDFNADHAAAHLESAGVPFDVRGVTVPFPGDLRAGAKVTRYAGLLDANPQVSVDGTERPLRLALATRVADAAADADRVGFPAVLGDDDPAGVRDALADHLGAAVFEVPMGPPSLPGLRLSDHLFGALEAAGVRIETGNPVVDADTTAGGVETVYVEKNGARIPNSADEYVLATGGLVGKGIDSDRDAVYEPIFDCRIAHSDDRYAWFDDDAFGDHAFAQFGVRTDDTLRPRDDDGAAAHANLRAAGAVLGGYNFAAEHSGSGVSIATGYAAGTAAAEAIHDE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	427 (405)
Sequences:	314 (238)
Seq/√Len:	11.8

ECOLI - GLPB
HALSA - GLPB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
370_D	374_R	11.015	1.00
9_V	20_A	5.382	1.00
20_A	272_L	4.680	1.00
20_A	32_L	4.508	1.00
224_G	250_F	4.070	0.99
19_S	315_V	3.591	0.99
63_P	106_N	3.552	0.98
66_A	370_D	3.128	0.96
272_L	277_V	3.105	0.96
25_D	271_A	2.918	0.95
288_A	295_V	2.843	0.94
413_G	417_G	2.828	0.94
7_V	28_A	2.700	0.92
23_A	417_G	2.600	0.90
187_A	190_L	2.586	0.90
207_L	211_T	2.580	0.90
215_D	245_L	2.458	0.88
227_A	253_P	2.390	0.86
186_Y	190_L	2.381	0.86
25_D	93_A	2.377	0.86
100_G	360_H	2.337	0.85
126_A	260_P	2.324	0.85
340_C	375_P	2.282	0.83
60_V	70_L	2.253	0.83
139_L	224_G	2.115	0.78
36_K	147_D	2.099	0.78
23_A	420_A	2.099	0.78
48_D	119_T	2.091	0.77
397_Y	408_V	2.047	0.76
84_V	153_A	2.041	0.76
311_A	314_Y	2.032	0.75
140_V	213_V	2.031	0.75
269_F	273_E	2.023	0.75
49_V	190_L	2.007	0.74
73_A	140_V	2.002	0.74
289_D	299_Y	1.996	0.74
71_P	77_R	1.937	0.72
88_M	360_H	1.929	0.71
140_V	169_V	1.908	0.70
66_A	374_R	1.884	0.69
223_V	247_A	1.843	0.68
230_G	263_R	1.834	0.67
20_A	277_V	1.822	0.67
276_G	325_G	1.796	0.66
60_V	323_G	1.780	0.65
251_E	409_S	1.778	0.65
138_L	220_A	1.775	0.65
353_D	358_G	1.773	0.65
38_S	357_F	1.744	0.63
325_G	351_W	1.739	0.63
146_P	360_H	1.737	0.63
369_T	394_L	1.732	0.63
12_G	185_R	1.729	0.62
52_Y	118_P	1.727	0.62
72_D	77_R	1.726	0.62
69_S	315_V	1.721	0.62
292_A	309_N	1.719	0.62
376_R	383_A	1.701	0.61
147_D	386_N	1.675	0.60
245_L	249_V	1.664	0.59
210_A	245_L	1.664	0.59
313_E	420_A	1.637	0.58
39_T	408_V	1.606	0.57
183_V	190_L	1.596	0.56
13_G	16_G	1.594	0.56
11_G	16_G	1.594	0.56
206_R	240_A	1.586	0.56
82_D	119_T	1.580	0.55
51_G	106_N	1.575	0.55
323_G	417_G	1.558	0.54
318_T	325_G	1.555	0.54
21_L	271_A	1.537	0.53
271_A	275_A	1.536	0.53
186_Y	198_V	1.518	0.52
239_D	243_D	1.511	0.52
66_A	291_T	1.506	0.52
223_V	249_V	1.495	0.51
36_K	386_N	1.491	0.51
213_V	243_D	1.490	0.51
338_F	387_L	1.446	0.49
60_V	63_P	1.439	0.48
80_G	83_T	1.437	0.48
282_G	356_A	1.427	0.48
259_L	413_G	1.425	0.48
44_S	408_V	1.422	0.47
188_G	191_D	1.415	0.47
187_A	198_V	1.413	0.47
107_A	122_Y	1.406	0.47
264_L	373_L	1.399	0.46
229_L	342_I	1.396	0.46
180_G	191_D	1.395	0.46
141_G	396_G	1.392	0.46
222_R	280_E	1.383	0.45
392_A	408_V	1.383	0.45
285_V	337_I	1.382	0.45
187_A	191_D	1.370	0.45
169_V	209_L	1.361	0.44
12_G	336_P	1.358	0.44
178_R	188_G	1.358	0.44
227_A	254_M	1.356	0.44
355_D	367_V	1.354	0.44
79_V	372_T	1.351	0.44
206_R	210_A	1.350	0.44
152_H	369_T	1.344	0.44
42_N	254_M	1.335	0.43
63_P	66_A	1.333	0.43
108_L	244_H	1.328	0.43
184_T	228_V	1.326	0.43
36_K	121_R	1.323	0.43
98_Y	123_P	1.321	0.42
47_V	413_G	1.314	0.42
147_D	320_G	1.314	0.42
142_F	228_V	1.308	0.42
362_F	409_S	1.303	0.42
417_G	420_A	1.302	0.42
71_P	79_V	1.301	0.41
191_D	199_D	1.299	0.41
139_L	396_G	1.299	0.41
65_D	93_A	1.298	0.41
33_V	165_D	1.294	0.41
20_A	30_T	1.293	0.41
44_S	325_G	1.290	0.41
156_H	251_E	1.286	0.41
349_Y	370_D	1.279	0.40
46_L	109_V	1.276	0.40
47_V	164_F	1.260	0.40
131_A	333_V	1.258	0.39
212_R	215_D	1.254	0.39
78_T	371_D	1.253	0.39
100_G	389_A	1.251	0.39
34_S	357_F	1.246	0.39
91_F	410_I	1.243	0.39
146_P	251_E	1.233	0.38
357_F	398_N	1.232	0.38
65_D	89_A	1.232	0.38
249_V	410_I	1.231	0.38
357_F	369_T	1.222	0.38
328_S	403_H	1.216	0.37
325_G	398_N	1.215	0.37
368_R	396_G	1.207	0.37
17_I	36_K	1.187	0.36
152_H	387_L	1.187	0.36
276_G	328_S	1.186	0.36
32_L	272_L	1.183	0.36
296_E	314_Y	1.172	0.35
360_H	411_A	1.171	0.35
200_G	205_L	1.170	0.35
333_V	365_F	1.168	0.35
295_V	387_L	1.164	0.35
63_P	70_L	1.157	0.35
78_T	339_D	1.151	0.34
125_S	251_E	1.151	0.34
15_A	209_L	1.150	0.34
140_V	243_D	1.150	0.34
15_A	50_L	1.144	0.34
342_I	365_F	1.142	0.34
251_E	411_A	1.139	0.34
272_L	399_F	1.134	0.34
312_D	334_Y	1.128	0.33
51_G	118_P	1.126	0.33
63_P	118_P	1.124	0.33
23_A	188_G	1.124	0.33
315_V	420_A	1.123	0.33
38_S	185_R	1.120	0.33
84_V	263_R	1.120	0.33
289_D	294_G	1.118	0.33
6_E	29_D	1.117	0.33
82_D	354_D	1.114	0.33
6_E	312_D	1.113	0.33
318_T	337_I	1.112	0.33
90_F	146_P	1.108	0.33
77_R	211_T	1.105	0.32
62_D	105_A	1.102	0.32
342_I	346_D	1.102	0.32
17_I	268_L	1.100	0.32
144_T	325_G	1.100	0.32
126_A	149_N	1.100	0.32
321_L	326_I	1.096	0.32
141_G	373_L	1.096	0.32
22_A	282_G	1.096	0.32
91_F	96_P	1.093	0.32
21_L	275_A	1.092	0.32
229_L	352_F	1.092	0.32
121_R	417_G	1.091	0.32
198_V	326_I	1.079	0.31
288_A	338_F	1.073	0.31
142_F	237_V	1.073	0.31
139_L	416_A	1.072	0.31
139_L	270_G	1.063	0.31
100_G	276_G	1.058	0.30
135_R	294_G	1.058	0.30
185_R	320_G	1.050	0.30
66_A	410_I	1.047	0.30
64_F	360_H	1.046	0.30
220_A	246_G	1.040	0.30
241_L	328_S	1.040	0.30
240_A	244_H	1.026	0.29
20_A	229_L	1.026	0.29
131_A	337_I	1.024	0.29
15_A	339_D	1.017	0.29
91_F	95_A	1.013	0.29
87_A	369_T	1.013	0.29
173_F	274_A	1.012	0.28
18_T	161_G	1.004	0.28
46_L	107_A	1.003	0.28
150_A	184_T	1.003	0.28
112_H	255_G	0.996	0.28
224_G	252_V	0.993	0.28
289_D	297_T	0.987	0.27
24_A	275_A	0.979	0.27
352_F	362_F	0.979	0.27
109_V	300_V	0.979	0.27
223_V	245_L	0.972	0.27
38_S	341_R	0.972	0.27
332_A	342_I	0.971	0.27
91_F	237_V	0.969	0.27
217_A	354_D	0.961	0.26
16_G	405_G	0.960	0.26
100_G	123_P	0.957	0.26
27_G	256_P	0.956	0.26
218_A	242_A	0.956	0.26
59_P	65_D	0.953	0.26
185_R	341_R	0.952	0.26
107_A	241_L	0.949	0.26
217_A	221_D	0.948	0.26
17_I	277_V	0.944	0.26
38_S	303_N	0.943	0.26
361_A	398_N	0.939	0.26
46_L	323_G	0.934	0.25
44_S	351_W	0.932	0.25
348_R	351_W	0.931	0.25
43_A	328_S	0.931	0.25
298_V	353_D	0.923	0.25
50_L	54_P	0.922	0.25
136_D	221_D	0.919	0.25
183_V	186_Y	0.916	0.25
324_K	369_T	0.908	0.24
106_N	406_S	0.908	0.24
28_A	420_A	0.906	0.24
227_A	389_A	0.900	0.24
39_T	322_V	0.897	0.24
205_L	295_V	0.896	0.24
109_V	277_V	0.893	0.24
129_G	374_R	0.893	0.24
185_R	283_N	0.892	0.24
33_V	309_N	0.891	0.24
254_M	348_R	0.890	0.24
160_A	169_V	0.890	0.24
56_G	297_T	0.889	0.24
24_A	87_A	0.883	0.24
51_G	63_P	0.881	0.23
22_A	165_D	0.880	0.23
117_K	404_S	0.879	0.23
322_V	404_S	0.878	0.23
206_R	237_V	0.873	0.23
110_P	396_G	0.871	0.23
207_L	296_E	0.870	0.23
120_A	341_R	0.870	0.23
109_V	122_Y	0.868	0.23
88_M	251_E	0.868	0.23
364_Q	398_N	0.865	0.23
146_P	409_S	0.864	0.23
180_G	183_V	0.863	0.23
231_D	295_V	0.861	0.23
51_G	403_H	0.861	0.23
19_S	30_T	0.858	0.23
38_S	365_F	0.856	0.23
153_A	279_I	0.855	0.23
15_A	214_A	0.850	0.22
333_V	359_D	0.848	0.22
4_E	33_V	0.845	0.22
314_Y	328_S	0.844	0.22
117_K	169_V	0.841	0.22
84_V	252_V	0.838	0.22
146_P	389_A	0.832	0.22
253_P	387_L	0.830	0.22
183_V	198_V	0.830	0.22
13_G	45_G	0.830	0.22
11_G	45_G	0.830	0.22
297_T	314_Y	0.829	0.22
68_P	326_I	0.829	0.22
120_A	283_N	0.825	0.22
158_E	163_P	0.817	0.21
250_F	253_P	0.816	0.21
53_T	404_S	0.815	0.21
50_L	80_G	0.814	0.21
320_G	363_A	0.813	0.21
190_L	198_V	0.812	0.21
113_G	356_A	0.810	0.21
149_N	393_V	0.809	0.21
146_P	341_R	0.802	0.21
56_G	147_D	0.801	0.21
241_L	339_D	0.800	0.21
283_N	320_G	0.799	0.21
292_A	371_D	0.798	0.21
61_V	372_T	0.796	0.21
337_I	384_H	0.795	0.21
39_T	403_H	0.795	0.21
199_D	231_D	0.795	0.21
230_G	413_G	0.794	0.20
88_M	95_A	0.794	0.20
215_D	355_D	0.793	0.20
182_K	413_G	0.792	0.20
206_R	239_D	0.790	0.20
239_D	312_D	0.787	0.20
267_H	315_V	0.786	0.20
79_V	413_G	0.784	0.20
87_A	367_V	0.783	0.20
291_T	296_E	0.783	0.20
5_S	42_N	0.781	0.20
191_D	198_V	0.781	0.20
90_F	94_H	0.781	0.20
91_F	98_Y	0.781	0.20
42_N	120_A	0.781	0.20
77_R	298_V	0.780	0.20
227_A	413_G	0.777	0.20
210_A	214_A	0.777	0.20
55_S	60_V	0.775	0.20
129_G	384_H	0.772	0.20
415_A	419_A	0.771	0.20
224_G	421_A	0.770	0.20
43_A	46_L	0.770	0.20
38_S	369_T	0.766	0.20
218_A	246_G	0.766	0.20
147_D	152_H	0.766	0.20
343_A	412_T	0.765	0.20
78_T	369_T	0.765	0.20
115_T	155_A	0.764	0.20
52_Y	403_H	0.761	0.19
183_V	191_D	0.761	0.19
8_L	309_N	0.758	0.19
15_A	82_D	0.757	0.19
9_V	297_T	0.756	0.19
378_D	390_A	0.755	0.19
213_V	217_A	0.755	0.19
351_W	357_F	0.755	0.19
316_L	393_V	0.748	0.19
79_V	412_T	0.747	0.19
117_K	357_F	0.745	0.19
325_G	408_V	0.745	0.19
254_M	326_I	0.742	0.19
360_H	410_I	0.738	0.19
192_A	200_G	0.735	0.19
321_L	417_G	0.734	0.19
289_D	410_I	0.733	0.19
9_V	16_G	0.733	0.19
273_E	285_V	0.732	0.19
26_A	416_A	0.732	0.19
161_G	178_R	0.732	0.19
165_D	297_T	0.731	0.19
46_L	185_R	0.731	0.19
21_L	277_V	0.729	0.18
316_L	326_I	0.729	0.18
183_V	320_G	0.728	0.18
126_A	253_P	0.728	0.18
6_E	44_S	0.724	0.18
229_L	389_A	0.723	0.18
154_A	246_G	0.720	0.18
280_E	405_G	0.719	0.18
18_T	65_D	0.716	0.18
204_P	315_V	0.716	0.18
374_R	385_A	0.715	0.18
104_D	370_D	0.715	0.18
70_L	77_R	0.714	0.18
292_A	333_V	0.713	0.18
146_P	188_G	0.713	0.18
87_A	421_A	0.712	0.18
54_P	282_G	0.709	0.18
287_D	299_Y	0.709	0.18
39_T	186_Y	0.709	0.18
115_T	414_Y	0.707	0.18
311_A	367_V	0.707	0.18
88_M	242_A	0.704	0.18
73_A	171_V	0.700	0.18
187_A	231_D	0.699	0.18
225_F	275_A	0.699	0.18
100_G	121_R	0.699	0.18
50_L	60_V	0.698	0.18
264_L	398_N	0.697	0.18
392_A	406_S	0.694	0.17
342_I	401_A	0.694	0.17
326_I	380_G	0.693	0.17
90_F	410_I	0.692	0.17
77_R	328_S	0.688	0.17
175_G	228_V	0.688	0.17
60_V	66_A	0.685	0.17
115_T	405_G	0.684	0.17
33_V	170_T	0.684	0.17
99_Q	124_A	0.682	0.17
351_W	398_N	0.682	0.17
67_I	216_A	0.682	0.17
5_S	341_R	0.680	0.17
53_T	60_V	0.679	0.17
389_A	393_V	0.679	0.17
326_I	342_I	0.677	0.17
375_P	389_A	0.677	0.17
220_A	387_L	0.675	0.17
41_R	277_V	0.675	0.17
4_E	337_I	0.673	0.17
14_L	33_V	0.671	0.17
16_G	394_L	0.671	0.17
363_A	397_Y	0.671	0.17
141_G	184_T	0.669	0.17
65_D	294_G	0.668	0.17
126_A	395_G	0.668	0.17
35_Y	406_S	0.667	0.17
6_E	13_G	0.666	0.17
6_E	11_G	0.666	0.17
303_N	307_I	0.666	0.17
66_A	388_R	0.666	0.17
8_L	33_V	0.666	0.17
64_F	412_T	0.665	0.17
238_R	249_V	0.665	0.17
109_V	120_A	0.665	0.17
66_A	210_A	0.664	0.17
138_L	151_D	0.663	0.17
8_L	388_R	0.662	0.17
223_V	242_A	0.661	0.16
342_I	345_S	0.659	0.16
221_D	273_E	0.658	0.16
223_V	418_T	0.658	0.16
249_V	318_T	0.658	0.16
165_D	239_D	0.657	0.16
266_D	314_Y	0.656	0.16
42_N	283_N	0.652	0.16
325_G	328_S	0.651	0.16
321_L	324_K	0.650	0.16
334_Y	365_F	0.647	0.16
218_A	292_A	0.645	0.16
9_V	119_T	0.645	0.16
292_A	385_A	0.642	0.16
171_V	253_P	0.641	0.16
139_L	153_A	0.640	0.16
312_D	347_D	0.640	0.16
280_E	360_H	0.638	0.16
185_R	258_S	0.637	0.16
120_A	300_V	0.637	0.16
118_P	298_V	0.635	0.16
141_G	150_A	0.635	0.16
76_Y	80_G	0.633	0.16
178_R	393_V	0.633	0.16
353_D	412_T	0.632	0.16
115_T	397_Y	0.632	0.16
22_A	171_V	0.631	0.16
60_V	380_G	0.631	0.16
232_D	259_L	0.631	0.16
148_F	282_G	0.630	0.16
83_T	370_D	0.630	0.16
11_G	15_A	0.630	0.16
30_T	406_S	0.629	0.16
374_R	384_H	0.629	0.16
188_G	413_G	0.628	0.16
316_L	325_G	0.628	0.16
351_W	365_F	0.627	0.16
135_R	339_D	0.626	0.16
95_A	161_G	0.625	0.16
210_A	244_H	0.625	0.16
230_G	396_G	0.623	0.15
177_L	395_G	0.623	0.15
79_V	414_Y	0.622	0.15
145_L	182_K	0.622	0.15
217_A	247_A	0.617	0.15
171_V	392_A	0.616	0.15
340_C	349_Y	0.612	0.15
37_Q	277_V	0.612	0.15
4_E	145_L	0.611	0.15
307_I	409_S	0.611	0.15
314_Y	386_N	0.610	0.15
19_S	23_A	0.610	0.15
213_V	292_A	0.610	0.15
25_D	117_K	0.609	0.15
38_S	41_R	0.609	0.15
212_R	281_T	0.608	0.15
217_A	350_A	0.606	0.15
145_L	254_M	0.605	0.15
111_T	355_D	0.602	0.15
94_H	312_D	0.602	0.15
140_V	285_V	0.601	0.15
147_D	268_L	0.601	0.15
173_F	229_L	0.600	0.15
80_G	402_E	0.599	0.15
35_Y	63_P	0.599	0.15
62_D	371_D	0.599	0.15
170_T	327_D	0.598	0.15
37_Q	185_R	0.597	0.15
36_K	268_L	0.596	0.15
325_G	335_E	0.596	0.15
132_S	135_R	0.595	0.15
79_V	422_E	0.595	0.15
79_V	297_T	0.594	0.15
322_V	356_A	0.593	0.15
302_K	395_G	0.593	0.15
12_G	276_G	0.591	0.15
336_P	362_F	0.590	0.15
172_P	227_A	0.589	0.15
139_L	170_T	0.587	0.15
142_F	153_A	0.585	0.15
12_G	362_F	0.584	0.14
90_F	100_G	0.582	0.14
88_M	409_S	0.581	0.14
351_W	408_V	0.581	0.14
42_N	144_T	0.580	0.14
12_G	144_T	0.578	0.14
176_D	371_D	0.577	0.14
61_V	68_P	0.576	0.14
125_S	146_P	0.576	0.14
53_T	56_G	0.575	0.14
122_Y	184_T	0.574	0.14
206_R	209_L	0.573	0.14
210_A	246_G	0.572	0.14
42_N	321_L	0.571	0.14
169_V	212_R	0.571	0.14
275_A	291_T	0.570	0.14
19_S	375_P	0.569	0.14
31_R	412_T	0.568	0.14
59_P	63_P	0.567	0.14
92_D	213_V	0.567	0.14
181_A	191_D	0.567	0.14
198_V	230_G	0.565	0.14
33_V	267_H	0.563	0.14
62_D	104_D	0.563	0.14
214_A	245_L	0.562	0.14
135_R	372_T	0.562	0.14
398_N	401_A	0.562	0.14
248_A	356_A	0.560	0.14
356_A	397_Y	0.559	0.14
188_G	231_D	0.558	0.14
47_V	285_V	0.558	0.14
41_R	325_G	0.558	0.14
90_F	389_A	0.556	0.14
237_V	246_G	0.556	0.14
139_L	223_V	0.555	0.14
252_V	255_G	0.555	0.14
49_V	88_M	0.555	0.14
178_R	282_G	0.554	0.14
134_D	259_L	0.551	0.14
309_N	402_E	0.551	0.14
326_I	333_V	0.551	0.14
200_G	268_L	0.550	0.14
21_L	50_L	0.549	0.14
307_I	397_Y	0.549	0.14
223_V	293_G	0.546	0.14
153_A	345_S	0.546	0.14
360_H	396_G	0.545	0.14
84_V	140_V	0.544	0.14
68_P	333_V	0.543	0.14
310_S	404_S	0.543	0.14
30_T	245_L	0.542	0.13
74_H	391_G	0.540	0.13
114_G	319_G	0.539	0.13
33_V	169_V	0.537	0.13
366_G	391_G	0.537	0.13
7_V	342_I	0.535	0.13
391_G	407_G	0.535	0.13
213_V	225_F	0.534	0.13
318_T	350_A	0.533	0.13
41_R	399_F	0.533	0.13
83_T	385_A	0.532	0.13
79_V	373_L	0.531	0.13
224_G	345_S	0.530	0.13
218_A	287_D	0.529	0.13
313_E	409_S	0.529	0.13
36_K	320_G	0.529	0.13
87_A	192_A	0.529	0.13
190_L	223_V	0.528	0.13
250_F	392_A	0.527	0.13
59_P	85_R	0.527	0.13
316_L	389_A	0.525	0.13
33_V	95_A	0.525	0.13
123_P	251_E	0.524	0.13
200_G	209_L	0.524	0.13
29_D	222_R	0.523	0.13
299_Y	308_P	0.520	0.13
21_L	369_T	0.520	0.13
125_S	360_H	0.519	0.13
116_V	238_R	0.519	0.13
19_S	229_L	0.518	0.13
42_N	341_R	0.517	0.13
371_D	393_V	0.516	0.13
80_G	282_G	0.516	0.13
348_R	406_S	0.516	0.13
373_L	398_N	0.515	0.13
65_D	243_D	0.514	0.13
110_P	373_L	0.513	0.13
7_V	229_L	0.512	0.13
106_N	210_A	0.512	0.13
209_L	339_D	0.511	0.13
59_P	213_V	0.510	0.13
265_S	342_I	0.510	0.13
241_L	351_W	0.510	0.13
323_G	359_D	0.509	0.13
23_A	360_H	0.508	0.13
258_S	276_G	0.508	0.13
79_V	96_P	0.508	0.13
23_A	231_D	0.507	0.13
133_D	222_R	0.506	0.13
333_V	358_G	0.505	0.13
394_L	405_G	0.504	0.13
235_A	247_A	0.504	0.13
105_A	292_A	0.503	0.13
73_A	364_Q	0.503	0.13
107_A	120_A	0.502	0.13
294_G	374_R	0.502	0.13
18_T	239_D	0.502	0.13
144_T	254_M	0.501	0.13
183_V	188_G	0.501	0.13
363_A	403_H	0.501	0.13
337_I	393_V	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4c3xA	4	0.7564	99.9	0.85	Contact Map
4at0A	2	0.7143	99.9	0.859	Contact Map
2h88A	2	0.6909	99.8	0.862	Contact Map
1qo8A	2	0.6862	99.8	0.863	Contact Map
2i0zA	1	0.6089	99.8	0.865	Contact Map
1y0pA	1	0.6768	99.8	0.867	Contact Map
2wdqA	1	0.6979	99.8	0.868	Contact Map
1trbA	2	0.726	99.8	0.873	Contact Map
3itjA	2	0.7213	99.8	0.874	Contact Map
3o0hA	2	0.7377	99.8	0.875	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0121 seconds.