SYK - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

SYK - Lysine--tRNA ligase

UniProt:	Q9HNN7	Sequences: MHPDDDPYADDGSGRLFWADAAADRVLDGDPEEPIVIKGGISPSGVPHLGNMNEIMRGYFVAAVLRERGHEVRQVFTSDDRDPLRGLPRKLADLDGEVVALGDVNAGALGQNLGAPYTEIPDPFGCCDSYGAHFSNLIQSSADRLGVDVEMVSNTETYANGGFEEVTRYLLEHVTAARDVLGEYQDKVDEEYVPFNPICEACGKVTETVTDVDADAGTVEYVCTDMDAGDQTIEGCGHEGTATLREGKLPWRFEWPAQWRTLGVDYEPFGKDHAEGSWPSGTDISRNVLGDEPPTPMVYEWFTLDGEPFSSSAGHVILVQDVLALLELPVVRYFFSKDPRRARDFSIEHLDQLVDEFDRMERVYFGEAADASEDERERAARVYPLLVDDIDADRVRIPFTFAAVLGMTEDSALREEIARREGHIPADADADTVADALTRVERAREWARRTNNEFNYRLARAEIPAHDFDDATAAALDELAAFLDDEDPDGEALQGEIYEAAKRHDIDIGAFFAAGYRLFFDEDQGPKLGPFLAKLDREFVVTRLRREG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	548 (494)
Sequences:	668 (379)
Seq/√Len:	17.0

HALSA - SYK

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
112_N	115_A	6.610	1.00
173_H	176_A	5.422	1.00
199_C	221_Y	5.033	1.00
180_V	288_V	5.025	1.00
128_D	132_A	4.432	1.00
489_D	492_A	4.316	1.00
73_R	150_E	4.095	1.00
338_D	341_R	3.376	0.99
358_D	439_R	3.348	0.99
202_C	236_C	3.222	0.99
484_D	545_R	3.189	0.99
273_H	276_G	3.152	0.99
480_A	545_R	3.101	0.99
201_A	236_C	3.080	0.99
152_V	157_T	3.045	0.99
199_C	202_C	3.045	0.99
499_E	503_R	2.955	0.98
127_C	133_H	2.938	0.98
199_C	238_H	2.869	0.98
119_E	159_A	2.850	0.98
496_E	499_E	2.764	0.98
211_D	220_E	2.750	0.98
269_F	298_V	2.653	0.97
255_W	281_G	2.624	0.97
478_E	504_H	2.567	0.96
213_D	216_A	2.567	0.96
166_V	260_R	2.528	0.96
286_R	292_E	2.515	0.96
480_A	541_V	2.461	0.95
202_C	223_C	2.446	0.95
199_C	236_C	2.441	0.95
517_R	523_D	2.389	0.94
34_P	73_R	2.378	0.94
169_Y	173_H	2.355	0.94
170_L	177_A	2.348	0.94
359_R	363_V	2.320	0.93
220_E	239_E	2.306	0.93
222_V	239_E	2.261	0.92
269_F	296_P	2.255	0.92
199_C	223_C	2.252	0.92
223_C	236_C	2.241	0.92
255_W	276_G	2.215	0.92
199_C	210_T	2.214	0.92
221_Y	238_H	2.137	0.90
324_A	449_R	2.107	0.89
474_A	504_H	2.104	0.89
91_L	109_L	2.079	0.89
502_K	508_I	2.071	0.89
34_P	71_E	2.071	0.89
33_E	71_E	2.063	0.88
111_Q	115_A	2.050	0.88
164_E	244_L	2.048	0.88
108_A	111_Q	2.037	0.88
269_F	278_W	2.020	0.87
256_P	281_G	2.015	0.87
482_F	496_E	2.005	0.87
541_V	545_R	2.002	0.87
126_C	137_L	2.001	0.87
514_A	524_Q	1.979	0.86
321_D	324_A	1.962	0.86
210_T	221_Y	1.957	0.86
127_C	137_L	1.942	0.85
255_W	296_P	1.934	0.85
363_V	366_G	1.933	0.85
282_T	296_P	1.931	0.85
206_T	221_Y	1.916	0.84
118_T	131_G	1.907	0.84
84_L	120_I	1.905	0.84
255_W	273_H	1.903	0.84
75_V	152_V	1.893	0.84
510_A	513_A	1.882	0.83
84_L	273_H	1.875	0.83
210_T	222_V	1.848	0.82
195_F	247_G	1.822	0.81
222_V	237_G	1.800	0.80
170_L	249_L	1.799	0.80
176_A	179_D	1.793	0.80
112_N	121_P	1.778	0.79
154_N	163_F	1.776	0.79
169_Y	172_E	1.769	0.79
286_R	293_P	1.757	0.79
218_T	241_T	1.751	0.78
271_K	300_E	1.748	0.78
114_G	204_K	1.733	0.78
491_E	495_G	1.733	0.78
480_A	484_D	1.728	0.77
221_Y	224_T	1.709	0.77
470_D	473_A	1.705	0.76
120_I	297_M	1.682	0.75
249_L	257_A	1.680	0.75
114_G	255_W	1.673	0.75
502_K	509_G	1.672	0.75
202_C	237_G	1.664	0.75
126_C	133_H	1.655	0.74
186_D	189_D	1.652	0.74
256_P	275_E	1.645	0.74
166_V	169_Y	1.634	0.73
108_A	112_N	1.628	0.73
157_T	162_G	1.623	0.73
493_L	537_R	1.616	0.72
62_A	66_R	1.611	0.72
224_T	236_C	1.599	0.72
260_R	285_S	1.595	0.71
518_L	528_L	1.578	0.70
274_A	296_P	1.571	0.70
171_L	212_V	1.560	0.70
535_L	540_V	1.549	0.69
273_H	281_G	1.541	0.69
470_D	474_A	1.528	0.68
285_S	291_D	1.526	0.68
406_G	448_R	1.522	0.68
20_D	381_R	1.519	0.67
275_E	279_P	1.509	0.67
269_F	297_M	1.488	0.66
473_A	477_D	1.478	0.65
177_A	253_F	1.462	0.64
368_A	374_D	1.459	0.64
254_E	258_Q	1.459	0.64
137_L	140_S	1.446	0.64
185_Q	189_D	1.440	0.63
175_T	179_D	1.439	0.63
221_Y	240_G	1.437	0.63
356_E	406_G	1.422	0.62
368_A	375_E	1.419	0.62
374_D	377_E	1.413	0.62
77_T	163_F	1.409	0.61
107_G	110_G	1.393	0.61
491_E	498_Y	1.391	0.60
199_C	237_G	1.389	0.60
499_E	502_K	1.388	0.60
273_H	278_W	1.385	0.60
474_A	478_E	1.378	0.60
532_L	540_V	1.376	0.60
274_A	298_V	1.376	0.60
301_W	308_P	1.357	0.58
266_Y	273_H	1.351	0.58
223_C	237_G	1.347	0.58
255_W	274_A	1.345	0.58
269_F	274_A	1.337	0.57
361_E	383_Y	1.332	0.57
21_A	24_D	1.320	0.56
80_D	88_P	1.295	0.55
199_C	206_T	1.290	0.55
66_R	69_G	1.287	0.54
361_E	382_V	1.287	0.54
183_E	283_D	1.259	0.53
276_G	281_G	1.234	0.51
322_V	331_V	1.234	0.51
487_D	492_A	1.227	0.51
138_I	309_F	1.214	0.50
84_L	276_G	1.209	0.50
318_L	321_D	1.202	0.49
40_G	54_E	1.201	0.49
276_G	279_P	1.198	0.49
170_L	253_F	1.197	0.49
75_V	157_T	1.193	0.49
134_F	309_F	1.187	0.48
528_L	532_L	1.182	0.48
34_P	69_G	1.181	0.48
263_G	291_D	1.180	0.48
15_R	379_A	1.178	0.48
33_E	69_G	1.176	0.48
269_F	276_G	1.175	0.48
477_D	481_A	1.175	0.48
465_A	471_A	1.174	0.48
363_V	367_E	1.170	0.47
84_L	170_L	1.158	0.47
125_G	133_H	1.157	0.47
204_K	224_T	1.148	0.46
539_F	543_R	1.147	0.46
174_V	178_R	1.145	0.46
311_S	332_R	1.143	0.46
84_L	293_P	1.134	0.45
63_A	66_R	1.134	0.45
202_C	238_H	1.130	0.45
88_P	310_S	1.128	0.45
84_L	255_W	1.126	0.45
210_T	220_E	1.125	0.45
449_R	452_N	1.124	0.45
499_E	508_I	1.123	0.45
470_D	538_E	1.122	0.44
350_L	399_F	1.120	0.44
185_Q	249_L	1.118	0.44
88_P	113_L	1.112	0.44
79_D	85_R	1.105	0.43
496_E	502_K	1.105	0.43
255_W	282_T	1.104	0.43
255_W	269_F	1.100	0.43
476_L	544_L	1.100	0.43
478_E	482_F	1.097	0.43
269_F	281_G	1.096	0.43
321_D	426_A	1.096	0.43
282_T	293_P	1.093	0.43
152_V	162_G	1.084	0.42
78_S	345_F	1.081	0.42
116_P	203_G	1.079	0.42
333_Y	360_M	1.077	0.42
84_L	114_G	1.076	0.42
165_E	510_A	1.076	0.42
122_D	126_C	1.072	0.42
475_A	511_F	1.071	0.41
375_E	379_A	1.071	0.41
14_G	545_R	1.069	0.41
498_Y	512_F	1.068	0.41
87_L	110_G	1.067	0.41
273_H	279_P	1.066	0.41
221_Y	236_C	1.065	0.41
53_N	335_F	1.063	0.41
57_R	278_W	1.062	0.41
478_E	503_R	1.058	0.41
484_D	489_D	1.054	0.41
210_T	237_G	1.051	0.40
273_H	296_P	1.051	0.40
199_C	247_G	1.049	0.40
255_W	280_S	1.045	0.40
115_A	435_D	1.043	0.40
484_D	541_V	1.042	0.40
220_E	237_G	1.040	0.40
211_D	237_G	1.038	0.40
88_P	308_P	1.035	0.39
180_V	204_K	1.028	0.39
273_H	280_S	1.027	0.39
201_A	495_G	1.024	0.39
199_C	240_G	1.022	0.39
275_E	278_W	1.021	0.39
361_E	365_F	1.020	0.39
205_V	262_L	1.019	0.39
200_E	221_Y	1.019	0.39
66_R	73_R	1.014	0.38
25_R	295_T	1.014	0.38
118_T	155_T	1.010	0.38
256_P	273_H	1.006	0.38
333_Y	359_R	1.006	0.38
386_L	391_D	1.005	0.38
156_E	398_P	1.005	0.38
334_F	353_L	1.000	0.37
358_D	395_V	0.994	0.37
499_E	509_G	0.987	0.37
221_Y	247_G	0.986	0.37
34_P	396_R	0.985	0.37
27_L	70_H	0.985	0.37
269_F	273_H	0.981	0.36
253_F	276_G	0.980	0.36
255_W	279_P	0.979	0.36
173_H	253_F	0.979	0.36
207_E	223_C	0.974	0.36
255_W	266_Y	0.971	0.36
63_A	67_E	0.970	0.36
286_R	291_D	0.968	0.36
426_A	539_F	0.962	0.35
163_F	258_Q	0.960	0.35
178_R	253_F	0.960	0.35
484_D	496_E	0.959	0.35
21_A	25_R	0.957	0.35
190_E	219_V	0.957	0.35
201_A	238_H	0.956	0.35
502_K	513_A	0.953	0.35
274_A	278_W	0.953	0.35
237_G	281_G	0.951	0.35
207_E	266_Y	0.947	0.35
368_A	376_R	0.945	0.34
184_Y	283_D	0.942	0.34
494_Q	529_G	0.942	0.34
114_G	279_P	0.941	0.34
165_E	497_I	0.937	0.34
190_E	198_I	0.936	0.34
93_D	108_A	0.936	0.34
66_R	72_V	0.934	0.34
46_V	316_V	0.930	0.34
164_E	245_R	0.929	0.34
417_I	441_E	0.927	0.33
519_F	544_L	0.923	0.33
451_N	459_A	0.921	0.33
172_E	215_D	0.919	0.33
188_V	252_R	0.915	0.33
242_A	246_E	0.914	0.33
28_D	31_P	0.911	0.33
444_R	448_R	0.900	0.32
266_Y	274_A	0.900	0.32
24_D	68_R	0.899	0.32
210_T	239_E	0.897	0.32
168_R	217_G	0.896	0.32
327_E	446_W	0.896	0.32
418_A	449_R	0.896	0.32
201_A	224_T	0.894	0.32
142_A	258_Q	0.887	0.31
130_Y	134_F	0.886	0.31
36_V	293_P	0.883	0.31
88_P	135_S	0.882	0.31
38_K	258_Q	0.880	0.31
536_D	543_R	0.876	0.31
382_V	527_K	0.875	0.31
320_Q	435_D	0.875	0.31
163_F	254_E	0.874	0.31
499_E	541_V	0.874	0.31
209_V	247_G	0.874	0.31
177_A	297_M	0.872	0.31
278_W	298_V	0.870	0.30
365_F	377_E	0.868	0.30
148_D	538_E	0.868	0.30
163_F	257_A	0.868	0.30
41_I	138_I	0.861	0.30
504_H	508_I	0.861	0.30
164_E	243_T	0.860	0.30
120_I	246_E	0.860	0.30
496_E	505_D	0.859	0.30
32_E	128_D	0.851	0.30
276_G	296_P	0.851	0.30
219_V	507_D	0.849	0.29
154_N	254_E	0.845	0.29
509_G	524_Q	0.844	0.29
59_Y	337_K	0.843	0.29
38_K	77_T	0.840	0.29
125_G	128_D	0.838	0.29
54_E	254_E	0.837	0.29
281_G	296_P	0.837	0.29
424_I	444_R	0.836	0.29
120_I	148_D	0.833	0.29
430_A	474_A	0.830	0.28
281_G	298_V	0.830	0.28
237_G	255_W	0.829	0.28
36_V	75_V	0.820	0.28
263_G	458_L	0.817	0.28
410_D	541_V	0.814	0.28
156_E	221_Y	0.814	0.28
316_V	381_R	0.813	0.28
19_A	43_P	0.812	0.28
484_D	538_E	0.812	0.28
194_P	259_W	0.812	0.28
223_C	238_H	0.812	0.28
256_P	296_P	0.811	0.28
178_R	209_V	0.811	0.28
266_Y	298_V	0.810	0.28
77_T	262_L	0.809	0.27
237_G	273_H	0.808	0.27
154_N	258_Q	0.807	0.27
364_Y	390_I	0.806	0.27
43_P	117_Y	0.805	0.27
170_L	273_H	0.804	0.27
269_F	279_P	0.804	0.27
364_Y	514_A	0.802	0.27
406_G	515_G	0.802	0.27
38_K	163_F	0.798	0.27
120_I	296_P	0.794	0.27
324_A	480_A	0.792	0.27
204_K	221_Y	0.790	0.27
252_R	280_S	0.784	0.26
420_R	527_K	0.782	0.26
77_T	258_Q	0.781	0.26
57_R	302_F	0.781	0.26
28_D	352_Q	0.780	0.26
498_Y	509_G	0.779	0.26
41_I	54_E	0.777	0.26
87_L	93_D	0.775	0.26
85_R	258_Q	0.775	0.26
437_L	451_N	0.773	0.26
41_I	51_N	0.773	0.26
256_P	278_W	0.764	0.25
107_G	128_D	0.763	0.25
84_L	280_S	0.763	0.25
93_D	122_D	0.762	0.25
482_F	503_R	0.761	0.25
173_H	286_R	0.760	0.25
266_Y	278_W	0.759	0.25
62_A	72_V	0.755	0.25
513_A	523_D	0.755	0.25
257_A	296_P	0.755	0.25
257_A	274_A	0.753	0.25
171_L	255_W	0.752	0.25
443_A	483_L	0.752	0.25
210_T	255_W	0.748	0.25
318_L	492_A	0.748	0.25
222_V	489_D	0.748	0.25
511_F	514_A	0.746	0.25
152_V	209_V	0.745	0.25
19_A	64_V	0.745	0.25
478_E	496_E	0.741	0.24
117_Y	355_D	0.741	0.24
170_L	257_A	0.739	0.24
24_D	462_E	0.738	0.24
35_I	139_Q	0.737	0.24
171_L	221_Y	0.735	0.24
215_D	430_A	0.734	0.24
391_D	435_D	0.733	0.24
305_D	400_T	0.732	0.24
165_E	168_R	0.730	0.24
173_H	368_A	0.728	0.24
278_W	296_P	0.727	0.24
183_E	191_E	0.726	0.24
51_N	268_P	0.725	0.24
87_L	108_A	0.724	0.24
165_E	180_V	0.723	0.24
130_Y	256_P	0.723	0.24
532_L	537_R	0.722	0.24
490_G	520_F	0.721	0.23
118_T	429_D	0.721	0.23
88_P	342_A	0.720	0.23
266_Y	296_P	0.719	0.23
54_E	181_L	0.715	0.23
326_L	354_V	0.714	0.23
144_R	487_D	0.714	0.23
188_V	192_Y	0.714	0.23
173_H	430_A	0.712	0.23
432_T	435_D	0.712	0.23
334_F	411_S	0.712	0.23
253_F	273_H	0.709	0.23
425_P	542_T	0.706	0.23
37_I	527_K	0.705	0.23
207_E	275_E	0.705	0.23
209_V	219_V	0.702	0.23
115_A	190_E	0.701	0.23
219_V	240_G	0.699	0.23
204_K	215_D	0.697	0.22
60_F	336_S	0.695	0.22
269_F	399_F	0.694	0.22
133_H	249_L	0.693	0.22
47_P	51_N	0.693	0.22
209_V	255_W	0.692	0.22
66_R	177_A	0.692	0.22
169_Y	542_T	0.692	0.22
324_A	360_M	0.691	0.22
381_R	384_P	0.689	0.22
59_Y	63_A	0.688	0.22
148_D	376_R	0.688	0.22
77_T	254_E	0.687	0.22
53_N	57_R	0.686	0.22
73_R	176_A	0.686	0.22
504_H	507_D	0.684	0.22
204_K	269_F	0.683	0.22
53_N	343_R	0.682	0.22
361_E	390_I	0.680	0.22
514_A	523_D	0.679	0.22
47_P	78_S	0.679	0.22
336_S	408_T	0.678	0.22
120_I	328_L	0.678	0.22
215_D	545_R	0.678	0.22
337_K	346_S	0.678	0.22
111_Q	190_E	0.676	0.22
27_L	412_A	0.676	0.22
404_V	531_F	0.676	0.22
454_F	533_A	0.676	0.22
337_K	356_E	0.674	0.22
476_L	484_D	0.673	0.21
213_D	377_E	0.672	0.21
120_I	242_A	0.671	0.21
66_R	439_R	0.670	0.21
46_V	51_N	0.670	0.21
451_N	456_Y	0.669	0.21
79_D	314_G	0.665	0.21
69_G	152_V	0.665	0.21
207_E	255_W	0.664	0.21
364_Y	383_Y	0.663	0.21
328_L	446_W	0.663	0.21
129_S	544_L	0.662	0.21
31_P	338_D	0.662	0.21
37_I	62_A	0.661	0.21
70_H	295_T	0.660	0.21
473_A	481_A	0.660	0.21
502_K	506_I	0.659	0.21
332_R	336_S	0.659	0.21
221_Y	255_W	0.659	0.21
45_G	48_H	0.659	0.21
45_G	50_G	0.659	0.21
500_A	510_A	0.658	0.21
83_P	198_I	0.656	0.21
403_A	447_A	0.656	0.21
114_G	281_G	0.655	0.21
119_E	203_G	0.654	0.21
54_E	58_G	0.653	0.21
62_A	350_L	0.653	0.21
195_F	243_T	0.652	0.21
204_K	236_C	0.651	0.21
362_R	396_R	0.651	0.21
327_E	395_V	0.651	0.21
397_I	424_I	0.650	0.21
111_Q	146_G	0.649	0.21
493_L	496_E	0.649	0.21
76_F	149_V	0.648	0.20
91_L	120_I	0.648	0.20
337_K	456_Y	0.648	0.20
52_M	151_M	0.647	0.20
215_D	537_R	0.647	0.20
207_E	239_E	0.647	0.20
241_T	485_D	0.645	0.20
118_T	153_S	0.644	0.20
35_I	65_L	0.644	0.20
475_A	479_L	0.644	0.20
237_G	276_G	0.644	0.20
252_R	308_P	0.643	0.20
42_S	117_Y	0.641	0.20
127_C	136_N	0.639	0.20
207_E	273_H	0.638	0.20
256_P	282_T	0.637	0.20
198_I	442_R	0.637	0.20
501_A	508_I	0.637	0.20
34_P	75_V	0.636	0.20
253_F	256_P	0.635	0.20
43_P	79_D	0.635	0.20
218_T	242_A	0.635	0.20
207_E	240_G	0.635	0.20
159_A	503_R	0.632	0.20
90_K	280_S	0.632	0.20
40_G	142_A	0.629	0.20
391_D	500_A	0.629	0.20
165_E	169_Y	0.628	0.20
303_T	308_P	0.626	0.20
359_R	367_E	0.626	0.20
136_N	139_Q	0.625	0.20
47_P	131_G	0.625	0.20
376_R	474_A	0.623	0.20
143_D	290_G	0.623	0.20
256_P	276_G	0.623	0.20
51_N	316_V	0.622	0.19
333_Y	410_D	0.620	0.19
69_G	532_L	0.620	0.19
68_R	281_G	0.620	0.19
532_L	544_L	0.619	0.19
156_E	391_D	0.619	0.19
78_S	343_R	0.619	0.19
79_D	258_Q	0.618	0.19
22_A	534_K	0.618	0.19
173_H	471_A	0.618	0.19
199_C	298_V	0.618	0.19
324_A	484_D	0.617	0.19
16_L	375_E	0.617	0.19
40_G	85_R	0.616	0.19
146_G	170_L	0.616	0.19
352_Q	507_D	0.615	0.19
335_F	344_D	0.615	0.19
257_A	442_R	0.615	0.19
417_I	470_D	0.613	0.19
199_C	379_A	0.612	0.19
171_L	275_E	0.609	0.19
194_P	358_D	0.609	0.19
285_S	296_P	0.608	0.19
271_K	407_M	0.607	0.19
182_G	185_Q	0.607	0.19
460_R	523_D	0.607	0.19
114_G	207_E	0.606	0.19
247_G	409_E	0.606	0.19
211_D	476_L	0.605	0.19
57_R	343_R	0.604	0.19
183_E	406_G	0.603	0.19
53_N	131_G	0.602	0.19
361_E	394_R	0.601	0.19
470_D	506_I	0.599	0.19
295_T	528_L	0.599	0.19
274_A	281_G	0.599	0.19
183_E	189_D	0.599	0.19
186_D	249_L	0.597	0.19
196_N	208_T	0.596	0.19
364_Y	377_E	0.596	0.19
327_E	439_R	0.596	0.19
78_S	135_S	0.595	0.18
110_G	481_A	0.595	0.18
156_E	484_D	0.595	0.18
375_E	510_A	0.594	0.18
15_R	375_E	0.594	0.18
14_G	465_A	0.593	0.18
471_A	497_I	0.593	0.18
146_G	175_T	0.593	0.18
131_G	307_E	0.591	0.18
323_L	511_F	0.590	0.18
479_L	497_I	0.589	0.18
425_P	428_A	0.589	0.18
43_P	254_E	0.589	0.18
538_E	542_T	0.587	0.18
69_G	496_E	0.586	0.18
251_W	294_P	0.585	0.18
324_A	445_E	0.584	0.18
180_V	209_V	0.584	0.18
77_T	154_N	0.584	0.18
487_D	493_L	0.584	0.18
83_P	196_N	0.583	0.18
237_G	247_G	0.583	0.18
149_V	440_V	0.583	0.18
478_E	500_A	0.582	0.18
90_K	135_S	0.582	0.18
88_P	343_R	0.581	0.18
493_L	544_L	0.581	0.18
150_E	398_P	0.581	0.18
322_V	326_L	0.580	0.18
276_G	280_S	0.578	0.18
130_Y	317_I	0.578	0.18
536_D	539_F	0.577	0.18
192_Y	302_F	0.577	0.18
252_R	303_T	0.577	0.18
46_V	135_S	0.576	0.18
211_D	239_E	0.576	0.18
214_A	221_Y	0.576	0.18
459_A	522_E	0.575	0.18
213_D	220_E	0.575	0.18
168_R	172_E	0.574	0.18
418_A	425_P	0.574	0.18
411_S	417_I	0.574	0.18
39_G	58_G	0.573	0.18
25_R	298_V	0.572	0.18
112_N	238_H	0.571	0.18
325_L	350_L	0.570	0.18
141_S	345_F	0.570	0.18
168_R	213_D	0.569	0.18
411_S	416_E	0.569	0.18
483_L	532_L	0.568	0.18
392_A	486_E	0.565	0.17
347_I	456_Y	0.564	0.17
292_E	389_D	0.564	0.17
327_E	522_E	0.562	0.17
139_Q	352_Q	0.562	0.17
479_L	542_T	0.562	0.17
75_V	305_D	0.561	0.17
362_R	366_G	0.561	0.17
127_C	523_D	0.561	0.17
69_G	295_T	0.560	0.17
33_E	389_D	0.560	0.17
53_N	336_S	0.559	0.17
39_G	258_Q	0.559	0.17
42_S	527_K	0.559	0.17
39_G	85_R	0.559	0.17
92_A	122_D	0.558	0.17
173_H	510_A	0.557	0.17
26_V	125_G	0.556	0.17
61_V	257_A	0.555	0.17
170_L	275_E	0.555	0.17
274_A	280_S	0.554	0.17
54_E	117_Y	0.554	0.17
41_I	135_S	0.554	0.17
46_V	250_P	0.554	0.17
398_P	500_A	0.554	0.17
247_G	399_F	0.553	0.17
23_A	146_G	0.552	0.17
170_L	266_Y	0.552	0.17
383_Y	390_I	0.551	0.17
128_D	470_D	0.550	0.17
374_D	497_I	0.550	0.17
417_I	446_W	0.549	0.17
80_D	153_S	0.548	0.17
240_G	247_G	0.548	0.17
173_H	249_L	0.548	0.17
135_S	342_A	0.548	0.17
396_R	509_G	0.546	0.17
368_A	476_L	0.545	0.17
114_G	236_C	0.545	0.17
43_P	54_E	0.544	0.17
93_D	219_V	0.544	0.17
324_A	328_L	0.544	0.17
479_L	544_L	0.542	0.17
140_S	144_R	0.541	0.17
260_R	331_V	0.541	0.17
36_V	73_R	0.541	0.17
69_G	221_Y	0.540	0.17
241_T	246_E	0.540	0.17
135_S	302_F	0.539	0.17
69_G	324_A	0.538	0.17
477_D	545_R	0.537	0.16
171_L	207_E	0.537	0.16
84_L	281_G	0.536	0.16
172_E	212_V	0.536	0.16
180_V	321_D	0.536	0.16
120_I	128_D	0.536	0.16
143_D	149_V	0.535	0.16
165_E	490_G	0.533	0.16
506_I	509_G	0.532	0.16
207_E	276_G	0.532	0.16
419_R	448_R	0.532	0.16
479_L	511_F	0.531	0.16
502_K	524_Q	0.531	0.16
71_E	128_D	0.531	0.16
400_T	528_L	0.531	0.16
134_F	353_L	0.530	0.16
150_E	290_G	0.530	0.16
417_I	425_P	0.530	0.16
382_V	487_D	0.528	0.16
174_V	219_V	0.528	0.16
131_G	322_V	0.528	0.16
332_R	385_L	0.527	0.16
406_G	412_A	0.527	0.16
85_R	181_L	0.526	0.16
211_D	328_L	0.525	0.16
318_L	515_G	0.525	0.16
338_D	456_Y	0.524	0.16
53_N	145_L	0.524	0.16
198_I	205_V	0.523	0.16
493_L	522_E	0.523	0.16
128_D	222_V	0.523	0.16
88_P	252_R	0.523	0.16
515_G	519_F	0.523	0.16
319_V	529_G	0.522	0.16
142_A	147_V	0.521	0.16
239_E	266_Y	0.521	0.16
240_G	246_E	0.521	0.16
284_I	521_D	0.521	0.16
398_P	401_F	0.521	0.16
80_D	155_T	0.520	0.16
375_E	392_A	0.520	0.16
74_Q	149_V	0.519	0.16
201_A	392_A	0.518	0.16
79_D	87_L	0.518	0.16
470_D	500_A	0.518	0.16
84_L	274_A	0.517	0.16
19_A	42_S	0.516	0.16
252_R	401_F	0.516	0.16
64_V	399_F	0.516	0.16
138_I	318_L	0.515	0.16
52_M	145_L	0.514	0.16
26_V	285_S	0.513	0.16
422_G	485_D	0.512	0.16
131_G	337_K	0.512	0.16
177_A	211_D	0.512	0.16
53_N	333_Y	0.512	0.16
49_L	320_Q	0.512	0.16
257_A	345_F	0.511	0.16
358_D	443_A	0.511	0.16
364_Y	378_R	0.511	0.16
290_G	497_I	0.511	0.16
79_D	86_G	0.511	0.16
37_I	83_P	0.510	0.16
44_S	48_H	0.509	0.16
44_S	50_G	0.509	0.16
131_G	419_R	0.508	0.16
337_K	530_P	0.508	0.16
418_A	498_Y	0.508	0.16
66_R	410_D	0.508	0.16
165_E	412_A	0.507	0.16
41_I	245_R	0.507	0.16
39_G	54_E	0.507	0.16
237_G	240_G	0.507	0.16
177_A	199_C	0.506	0.15
288_V	334_F	0.505	0.15
507_D	524_Q	0.505	0.15
362_R	443_A	0.504	0.15
120_I	134_F	0.503	0.15
145_L	527_K	0.503	0.15
76_F	126_C	0.503	0.15
357_F	545_R	0.501	0.15
59_Y	117_Y	0.501	0.15
84_L	278_W	0.501	0.15
269_F	293_P	0.501	0.15
75_V	91_L	0.501	0.15
41_I	85_R	0.500	0.15
420_R	425_P	0.500	0.15
496_E	524_Q	0.500	0.15

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1irxA	1	0.8905	100	0.617	Contact Map
2o5rA	1	0.8011	100	0.788	Contact Map
2cfoA	1	0.8066	100	0.81	Contact Map
4g6zA	1	0.6423	100	0.824	Contact Map
1j09A	1	0.7883	100	0.84	Contact Map
3afhA	1	0.7901	100	0.841	Contact Map
4griA	1	0.8011	100	0.844	Contact Map
3al0C	1	0.7901	100	0.846	Contact Map
2ja2A	1	0.7956	100	0.859	Contact Map
3fnrA	1	0.7099	100	0.865	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0134 seconds.