Q9HNC7 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HNC7 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HNC7	Sequences: MEHGAWEYRPILHGPLFARVNSLVFGVVGATDATARLVVALTGALLPLAAWLFRTRLRDAELIALGAALACNPVLVYYSRFMRKDLPLAACMLLTLGLLVRASDTRRPRYLYASAVTLGVAFATKESVLLWMVTWLGASVLVLDRHLLRARDTDGDALGAFRSLLRRAVAGARDWWHHGVLAAAVFLSVVVYFYAPRAGPGQEIGLWRALTGDFATLPAVVGEATLGSLHKAIDYWATGSIQRHAYLPYFTDTADTVIAGASGVAALAVVGFLWDRYAGAHPRGLVAFNFYCGVAALVGYPLANNFPVPWSTVHAIVPLTVPAAVGAAVVYRWGRSRLPAREPTILSEHTPMHAVRAVLAAAVLLSAVAAGGATLTETSYQAPHESPRGDPGSDVIYYAQAPADLRTVVTDIERAAASGGSDTDVLYAGAPLAMTESRVDRPPATGAWHARMPLPWYTESLDADVASVDDPTAVGDTPPPVVITTPALESQVGAAIGAGYERETHALDDIGDRTVVVFTATTE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	523 (461)
Sequences:	107 (96)
Seq/√Len:	4.4

HALSA - Q9HNC7 Q9HRM4 Q9HNK5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
13_H	126_E	4.782	0.94
13_H	125_K	4.059	0.87
81_F	400_Q	3.859	0.84
69_L	482_V	3.661	0.81
85_D	400_Q	3.449	0.77
125_K	300_Y	3.397	0.76
456_W	500_Y	3.044	0.67
24_V	34_T	2.941	0.64
88_L	124_T	2.799	0.60
84_K	127_S	2.775	0.59
85_D	314_H	2.741	0.58
83_R	305_N	2.722	0.57
126_E	300_Y	2.705	0.57
77_Y	85_D	2.698	0.57
224_A	228_S	2.595	0.54
126_E	236_W	2.567	0.53
20_V	193_F	2.557	0.52
94_L	98_L	2.522	0.51
10_P	309_P	2.442	0.49
13_H	236_W	2.418	0.48
81_F	85_D	2.399	0.48
266_A	294_V	2.348	0.46
450_A	455_P	2.342	0.46
37_L	119_G	2.328	0.46
83_R	292_C	2.294	0.44
245_A	305_N	2.272	0.44
458_T	483_I	2.254	0.43
24_V	38_V	2.242	0.43
67_A	71_C	2.221	0.42
115_A	257_V	2.216	0.42
13_H	300_Y	2.182	0.41
186_F	291_Y	2.173	0.41
77_Y	81_F	2.162	0.41
313_V	356_R	2.148	0.40
189_V	193_F	2.135	0.40
15_P	36_R	2.118	0.39
305_N	308_V	2.112	0.39
123_A	194_Y	2.079	0.38
77_Y	400_Q	2.065	0.38
189_V	194_Y	2.060	0.38
257_V	319_L	2.046	0.37
270_V	473_A	2.040	0.37
207_W	395_V	2.006	0.36
474_V	481_V	1.991	0.36
245_A	248_P	1.962	0.35
16_L	193_F	1.945	0.34
144_D	277_Y	1.939	0.34
85_D	305_N	1.939	0.34
96_L	193_F	1.937	0.34
93_L	354_A	1.928	0.34
83_R	314_H	1.928	0.34
79_S	323_A	1.914	0.33
134_T	308_V	1.906	0.33
66_G	218_P	1.902	0.33
43_G	81_F	1.882	0.33
83_R	318_P	1.873	0.32
100_V	324_A	1.864	0.32
193_F	250_F	1.844	0.32
299_G	481_V	1.828	0.31
85_D	318_P	1.824	0.31
61_E	74_V	1.792	0.30
27_V	41_L	1.777	0.30
249_Y	253_T	1.773	0.30
303_A	396_I	1.772	0.30
451_R	467_S	1.771	0.30
319_L	479_P	1.763	0.29
14_G	36_R	1.761	0.29
194_Y	236_W	1.741	0.29
72_N	261_A	1.729	0.29
53_F	97_G	1.725	0.29
292_C	318_P	1.719	0.28
313_V	405_L	1.718	0.28
489_E	502_R	1.700	0.28
35_A	303_A	1.692	0.28
81_F	104_D	1.671	0.27
318_P	400_Q	1.669	0.27
16_L	20_V	1.667	0.27
84_K	125_K	1.662	0.27
304_N	308_V	1.654	0.27
182_A	410_T	1.622	0.26
276_R	317_V	1.609	0.26
292_C	305_N	1.607	0.26
13_H	127_S	1.597	0.25
86_L	135_W	1.596	0.25
83_R	308_V	1.580	0.25
109_R	362_A	1.578	0.25
96_L	360_A	1.578	0.25
457_Y	500_Y	1.568	0.25
11_I	305_N	1.554	0.24
16_L	170_A	1.542	0.24
83_R	400_Q	1.529	0.24
106_R	115_A	1.529	0.24
246_Y	250_F	1.513	0.24
127_S	300_Y	1.513	0.24
195_A	285_L	1.510	0.23
133_V	193_F	1.509	0.23
248_P	308_V	1.502	0.23
78_Y	188_S	1.497	0.23
267_L	368_V	1.493	0.23
34_T	161_F	1.492	0.23
101_R	398_Y	1.486	0.23
266_A	297_L	1.476	0.23
29_G	398_Y	1.463	0.22
186_F	363_V	1.462	0.22
83_R	236_W	1.457	0.22
232_A	308_V	1.457	0.22
77_Y	83_R	1.447	0.22
215_A	426_L	1.443	0.22
37_L	46_L	1.442	0.22
77_Y	482_V	1.436	0.22
91_C	401_A	1.428	0.22
226_L	273_L	1.422	0.22
196_P	452_M	1.415	0.21
69_L	148_L	1.393	0.21
123_A	193_F	1.377	0.21
13_H	84_K	1.377	0.21
253_T	315_A	1.376	0.21
31_T	168_A	1.375	0.21
363_V	481_V	1.375	0.21
398_Y	508_D	1.371	0.21
88_L	127_S	1.368	0.21
88_L	181_L	1.366	0.20
24_V	297_L	1.362	0.20
96_L	450_A	1.350	0.20
135_W	193_F	1.348	0.20
355_V	454_L	1.341	0.20
158_L	226_L	1.337	0.20
125_K	236_W	1.336	0.20
267_L	415_A	1.334	0.20
43_G	75_L	1.318	0.20
59_D	62_L	1.315	0.19
84_K	126_E	1.313	0.19
16_L	31_T	1.304	0.19
303_A	393_S	1.296	0.19
28_V	488_L	1.296	0.19
15_P	310_W	1.294	0.19
36_R	310_W	1.294	0.19
319_L	503_E	1.292	0.19
148_L	355_V	1.290	0.19
79_S	125_K	1.290	0.19
198_A	205_G	1.289	0.19
6_W	303_A	1.281	0.19
310_W	453_P	1.281	0.19
13_H	508_D	1.279	0.19
197_R	301_P	1.277	0.19
268_A	341_R	1.274	0.19
21_N	113_A	1.272	0.19
357_A	380_Y	1.263	0.18
78_Y	397_Y	1.259	0.18
245_A	260_G	1.257	0.18
89_A	326_G	1.249	0.18
101_R	291_Y	1.249	0.18
17_F	84_K	1.241	0.18
463_A	467_S	1.238	0.18
180_V	441_R	1.236	0.18
16_L	194_Y	1.233	0.18
119_G	131_W	1.231	0.18
114_S	454_L	1.231	0.18
84_K	296_A	1.230	0.18
127_S	305_N	1.229	0.18
294_V	359_L	1.226	0.18
18_A	44_A	1.222	0.18
262_S	364_L	1.216	0.18
116_V	355_V	1.208	0.18
34_T	366_S	1.207	0.17
454_L	507_L	1.203	0.17
235_Y	240_S	1.202	0.17
126_E	235_Y	1.195	0.17
83_R	304_N	1.193	0.17
93_L	337_R	1.191	0.17
93_L	99_L	1.184	0.17
96_L	437_S	1.184	0.17
127_S	296_A	1.184	0.17
66_G	73_P	1.175	0.17
134_T	394_D	1.172	0.17
54_R	109_R	1.165	0.17
380_Y	400_Q	1.162	0.17
249_Y	305_N	1.158	0.17
286_V	481_V	1.153	0.17
32_D	41_L	1.143	0.16
162_R	258_I	1.142	0.16
467_S	510_I	1.142	0.16
363_V	473_A	1.141	0.16
18_A	84_K	1.141	0.16
100_V	265_A	1.140	0.16
90_A	189_V	1.138	0.16
129_L	246_Y	1.136	0.16
52_L	324_A	1.133	0.16
10_P	303_A	1.132	0.16
307_P	311_S	1.127	0.16
6_W	309_P	1.124	0.16
12_L	452_M	1.120	0.16
65_L	320_T	1.115	0.16
303_A	394_D	1.115	0.16
32_D	83_R	1.114	0.16
47_P	301_P	1.112	0.16
183_A	354_A	1.107	0.16
119_G	355_V	1.106	0.16
179_G	481_V	1.105	0.16
271_G	288_F	1.103	0.16
247_L	302_L	1.103	0.16
144_D	276_R	1.101	0.16
309_P	314_H	1.100	0.16
236_W	296_A	1.097	0.16
14_G	126_E	1.086	0.15
113_A	130_L	1.085	0.15
28_V	54_R	1.080	0.15
158_L	263_G	1.079	0.15
40_A	83_R	1.077	0.15
120_V	393_S	1.077	0.15
245_A	249_Y	1.077	0.15
357_A	408_V	1.075	0.15
125_K	194_Y	1.073	0.15
181_L	271_G	1.065	0.15
129_L	245_A	1.063	0.15
111_L	505_H	1.060	0.15
85_D	467_S	1.058	0.15
78_Y	141_L	1.052	0.15
185_V	365_L	1.051	0.15
79_S	288_F	1.049	0.15
293_G	322_P	1.049	0.15
161_F	164_L	1.048	0.15
106_R	225_T	1.043	0.15
314_H	324_A	1.042	0.15
451_R	455_P	1.036	0.15
97_G	136_L	1.030	0.15
32_D	54_R	1.023	0.14
74_V	312_T	1.023	0.14
397_Y	452_M	1.013	0.14
274_W	298_V	1.011	0.14
58_R	392_G	1.007	0.14
10_P	85_D	1.006	0.14
185_V	481_V	1.003	0.14
79_S	127_S	1.001	0.14
78_Y	399_A	1.000	0.14
257_V	265_A	0.997	0.14
14_G	310_W	0.996	0.14
7_E	99_L	0.993	0.14
25_F	400_Q	0.990	0.14
177_H	478_P	0.987	0.14
260_G	311_S	0.986	0.14
132_M	492_V	0.984	0.14
27_V	60_A	0.984	0.14
68_A	288_F	0.984	0.14
9_R	452_M	0.981	0.14
71_C	224_A	0.979	0.14
36_R	453_P	0.977	0.14
15_P	453_P	0.977	0.14
73_P	236_W	0.976	0.14
150_A	154_D	0.967	0.14
77_Y	318_P	0.966	0.14
76_V	447_A	0.964	0.14
6_W	113_A	0.963	0.14
28_V	266_A	0.960	0.14
101_R	312_T	0.958	0.14
27_V	332_R	0.956	0.13
57_L	313_V	0.953	0.13
360_A	495_A	0.952	0.13
62_L	512_D	0.949	0.13
23_L	290_F	0.949	0.13
94_L	296_A	0.945	0.13
40_A	54_R	0.944	0.13
58_R	494_A	0.944	0.13
54_R	83_R	0.942	0.13
408_V	481_V	0.941	0.13
271_G	313_V	0.941	0.13
143_L	160_A	0.940	0.13
20_V	179_G	0.937	0.13
245_A	510_I	0.937	0.13
283_R	372_G	0.935	0.13
13_H	36_R	0.935	0.13
191_V	268_A	0.934	0.13
6_W	508_D	0.931	0.13
360_A	481_V	0.930	0.13
47_P	50_A	0.930	0.13
81_F	318_P	0.929	0.13
180_V	328_A	0.928	0.13
328_A	442_P	0.926	0.13
180_V	234_D	0.925	0.13
249_Y	410_T	0.923	0.13
120_V	448_W	0.922	0.13
135_W	251_T	0.919	0.13
118_L	297_L	0.917	0.13
87_P	156_D	0.917	0.13
451_R	508_D	0.916	0.13
61_E	452_M	0.912	0.13
189_V	331_Y	0.912	0.13
82_M	127_S	0.911	0.13
142_V	449_H	0.910	0.13
25_F	316_I	0.909	0.13
13_H	235_Y	0.905	0.13
295_A	379_S	0.902	0.13
249_Y	304_N	0.899	0.13
67_A	496_I	0.898	0.13
8_Y	14_G	0.895	0.13
220_V	244_H	0.892	0.13
127_S	397_Y	0.892	0.13
97_G	261_A	0.891	0.13
331_Y	481_V	0.890	0.13
86_L	97_G	0.889	0.13
180_V	338_L	0.886	0.13
3_H	401_A	0.886	0.13
414_R	474_V	0.885	0.13
44_A	94_L	0.879	0.12
113_A	116_V	0.878	0.12
226_L	229_L	0.876	0.12
272_F	291_Y	0.873	0.12
467_S	508_D	0.870	0.12
397_Y	401_A	0.869	0.12
445_T	467_S	0.865	0.12
129_L	311_S	0.857	0.12
147_L	296_A	0.856	0.12
76_V	264_V	0.855	0.12
357_A	365_L	0.855	0.12
37_L	43_G	0.852	0.12
67_A	369_A	0.852	0.12
141_L	291_Y	0.850	0.12
6_W	12_L	0.850	0.12
117_T	130_L	0.848	0.12
125_K	508_D	0.845	0.12
22_S	117_T	0.844	0.12
134_T	221_V	0.843	0.12
357_A	367_A	0.843	0.12
29_G	36_R	0.843	0.12
15_P	29_G	0.843	0.12
365_L	501_E	0.842	0.12
41_L	94_L	0.837	0.12
244_H	248_P	0.834	0.12
85_D	308_V	0.833	0.12
377_E	383_P	0.829	0.12
41_L	479_P	0.827	0.12
261_A	459_E	0.827	0.12
270_V	326_G	0.825	0.12
119_G	458_T	0.821	0.12
405_L	442_P	0.821	0.12
111_L	115_A	0.820	0.12
30_A	462_D	0.820	0.12
113_A	225_T	0.819	0.12
272_F	286_V	0.818	0.12
205_G	376_T	0.818	0.12
311_S	394_D	0.818	0.12
471_P	502_R	0.817	0.12
236_W	300_Y	0.813	0.12
161_F	364_L	0.808	0.12
137_G	305_N	0.808	0.12
22_S	92_M	0.807	0.11
6_W	189_V	0.806	0.11
135_W	219_A	0.803	0.11
96_L	119_G	0.803	0.11
6_W	225_T	0.801	0.11
167_R	444_A	0.801	0.11
270_V	356_R	0.798	0.11
33_A	107_R	0.798	0.11
137_G	299_G	0.795	0.11
13_H	240_S	0.792	0.11
86_L	461_L	0.791	0.11
17_F	303_A	0.790	0.11
126_E	508_D	0.790	0.11
301_P	401_A	0.790	0.11
221_V	470_D	0.789	0.11
29_G	307_P	0.789	0.11
246_Y	305_N	0.789	0.11
30_A	263_G	0.788	0.11
114_S	177_H	0.787	0.11
37_L	77_Y	0.785	0.11
260_G	275_D	0.784	0.11
275_D	287_A	0.781	0.11
324_A	504_T	0.781	0.11
399_A	502_R	0.778	0.11
8_Y	231_K	0.778	0.11
148_L	267_L	0.778	0.11
261_A	328_A	0.777	0.11
137_G	300_Y	0.776	0.11
303_A	405_L	0.776	0.11
13_H	130_L	0.774	0.11
53_F	89_A	0.772	0.11
50_A	77_Y	0.772	0.11
75_L	182_A	0.772	0.11
57_L	83_R	0.772	0.11
252_D	256_T	0.770	0.11
105_T	317_V	0.768	0.11
268_A	293_G	0.766	0.11
225_T	269_V	0.765	0.11
254_A	295_A	0.764	0.11
136_L	188_S	0.763	0.11
316_I	401_A	0.762	0.11
245_A	394_D	0.761	0.11
302_L	364_L	0.761	0.11
375_L	494_A	0.761	0.11
248_P	252_D	0.758	0.11
13_H	194_Y	0.757	0.11
269_V	288_F	0.755	0.11
143_L	360_A	0.755	0.11
35_A	305_N	0.754	0.11
121_A	414_R	0.753	0.11
27_V	66_G	0.753	0.11
458_T	499_G	0.752	0.11
121_A	124_T	0.751	0.11
260_G	309_P	0.749	0.11
84_K	236_W	0.746	0.11
427_Y	444_A	0.746	0.11
321_V	502_R	0.744	0.11
45_L	180_V	0.744	0.11
52_L	57_L	0.742	0.11
247_L	260_G	0.741	0.11
262_S	405_L	0.738	0.11
256_T	481_V	0.738	0.11
60_A	139_S	0.737	0.11
166_R	436_E	0.736	0.11
27_V	234_D	0.735	0.11
180_V	327_A	0.735	0.11
86_L	99_L	0.733	0.11
33_A	119_G	0.732	0.11
82_M	129_L	0.732	0.11
135_W	413_E	0.732	0.11
52_L	293_G	0.731	0.11
245_A	304_N	0.731	0.11
167_R	468_V	0.731	0.11
4_G	401_A	0.730	0.11
75_L	455_P	0.730	0.11
310_W	456_W	0.728	0.11
90_A	286_V	0.728	0.11
53_F	136_L	0.727	0.11
318_P	395_V	0.726	0.11
126_E	240_S	0.725	0.11
457_Y	482_V	0.723	0.10
144_D	372_G	0.722	0.10
62_L	471_P	0.721	0.10
307_P	398_Y	0.719	0.10
63_I	185_V	0.718	0.10
83_R	296_A	0.716	0.10
228_S	510_I	0.715	0.10
333_W	367_A	0.714	0.10
43_G	182_A	0.713	0.10
341_R	391_P	0.713	0.10
51_W	106_R	0.711	0.10
132_M	180_V	0.710	0.10
463_A	468_V	0.710	0.10
301_P	322_P	0.710	0.10
253_T	311_S	0.710	0.10
77_Y	101_R	0.709	0.10
180_V	295_A	0.709	0.10
123_A	170_A	0.709	0.10
79_S	267_L	0.708	0.10
35_A	398_Y	0.708	0.10
61_E	283_R	0.707	0.10
130_L	294_V	0.706	0.10
119_G	410_T	0.706	0.10
12_L	236_W	0.704	0.10
41_L	357_A	0.704	0.10
161_F	234_D	0.704	0.10
107_R	221_V	0.704	0.10
148_L	360_A	0.704	0.10
18_A	390_D	0.702	0.10
94_L	105_T	0.702	0.10
256_T	311_S	0.701	0.10
232_A	248_P	0.701	0.10
96_L	331_Y	0.697	0.10
28_V	375_L	0.697	0.10
269_V	364_L	0.696	0.10
38_V	287_A	0.694	0.10
163_S	437_S	0.692	0.10
289_N	301_P	0.692	0.10
111_L	143_L	0.688	0.10
94_L	504_T	0.686	0.10
239_G	311_S	0.685	0.10
264_V	301_P	0.685	0.10
267_L	440_D	0.684	0.10
393_S	396_I	0.683	0.10
12_L	305_N	0.683	0.10
331_Y	378_T	0.681	0.10
132_M	142_V	0.681	0.10
107_R	471_P	0.679	0.10
362_A	366_S	0.678	0.10
93_L	404_D	0.678	0.10
32_D	292_C	0.677	0.10
69_L	77_Y	0.677	0.10
12_L	126_E	0.676	0.10
14_G	453_P	0.676	0.10
364_L	498_A	0.676	0.10
262_S	404_D	0.676	0.10
75_L	410_T	0.674	0.10
29_G	393_S	0.673	0.10
236_W	240_S	0.672	0.10
58_R	74_V	0.672	0.10
8_Y	400_Q	0.671	0.10
123_A	165_L	0.671	0.10
301_P	459_E	0.667	0.10
248_P	309_P	0.666	0.10
307_P	510_I	0.664	0.10
80_R	310_W	0.664	0.10
16_L	25_F	0.663	0.10
82_M	85_D	0.660	0.10
219_A	266_A	0.660	0.10
150_A	483_I	0.660	0.10
368_V	417_A	0.656	0.10
25_F	79_S	0.653	0.10
126_E	130_L	0.653	0.10
27_V	113_A	0.652	0.10
225_T	266_A	0.650	0.10
68_A	476_D	0.649	0.10
39_V	283_R	0.648	0.10
41_L	215_A	0.647	0.10
228_S	249_Y	0.643	0.10
54_R	400_Q	0.642	0.10
175_W	492_V	0.641	0.10
114_S	405_L	0.640	0.10
394_D	439_V	0.639	0.10
12_L	297_L	0.638	0.10
85_D	304_N	0.638	0.10
359_L	410_T	0.637	0.10
230_H	297_L	0.637	0.10
97_G	283_R	0.636	0.10
168_A	183_A	0.633	0.10
457_Y	483_I	0.632	0.09
224_A	303_A	0.631	0.09
314_H	482_V	0.631	0.09
328_A	467_S	0.631	0.09
455_P	496_I	0.630	0.09
228_S	309_P	0.622	0.09
115_A	119_G	0.622	0.09
35_A	468_V	0.621	0.09
53_F	322_P	0.619	0.09
132_M	362_A	0.618	0.09
472_T	477_T	0.617	0.09
50_A	379_S	0.615	0.09
86_L	271_G	0.615	0.09
116_V	494_A	0.614	0.09
76_V	467_S	0.614	0.09
253_T	307_P	0.612	0.09
93_L	357_A	0.611	0.09
358_V	374_T	0.611	0.09
33_A	360_A	0.611	0.09
117_T	172_A	0.610	0.09
483_I	505_H	0.609	0.09
288_F	457_Y	0.609	0.09
16_L	302_L	0.609	0.09
292_C	400_Q	0.606	0.09
43_G	46_L	0.606	0.09
307_P	403_A	0.605	0.09
130_L	512_D	0.605	0.09
264_V	294_V	0.604	0.09
57_L	100_V	0.603	0.09
299_G	305_N	0.603	0.09
174_D	482_V	0.603	0.09
39_V	311_S	0.602	0.09
35_A	228_S	0.599	0.09
248_P	311_S	0.599	0.09
248_P	302_L	0.599	0.09
77_Y	80_R	0.598	0.09
252_D	309_P	0.598	0.09
335_R	436_E	0.598	0.09
112_Y	265_A	0.595	0.09
236_W	292_C	0.594	0.09
309_P	510_I	0.594	0.09
114_S	359_L	0.593	0.09
99_L	270_V	0.593	0.09
396_I	406_R	0.590	0.09
319_L	483_I	0.589	0.09
248_P	260_G	0.588	0.09
85_D	395_V	0.587	0.09
16_L	123_A	0.587	0.09
116_V	149_R	0.587	0.09
106_R	266_A	0.587	0.09
25_F	47_P	0.586	0.09
70_A	76_V	0.585	0.09
14_G	78_Y	0.585	0.09
236_W	400_Q	0.584	0.09
17_F	21_N	0.583	0.09
362_A	503_E	0.582	0.09
117_T	186_F	0.581	0.09
282_P	334_G	0.580	0.09
166_R	312_T	0.580	0.09
6_W	10_P	0.578	0.09
70_A	73_P	0.578	0.09
18_A	297_L	0.577	0.09
129_L	305_N	0.576	0.09
186_F	399_A	0.576	0.09
127_S	236_W	0.575	0.09
103_S	340_A	0.573	0.09
149_R	415_A	0.573	0.09
393_S	402_P	0.572	0.09
448_W	459_E	0.572	0.09
242_Q	260_G	0.571	0.09
270_V	474_V	0.570	0.09
149_R	362_A	0.570	0.09
178_H	465_V	0.570	0.09
396_I	449_H	0.569	0.09
256_T	309_P	0.567	0.09
190_V	473_A	0.567	0.09
190_V	268_A	0.567	0.09
190_V	428_A	0.566	0.09
69_L	93_L	0.566	0.09
187_L	205_G	0.564	0.09
40_A	80_R	0.562	0.09
483_I	502_R	0.561	0.09
235_Y	305_N	0.561	0.09
97_G	317_V	0.561	0.09
10_P	14_G	0.561	0.09
96_L	136_L	0.560	0.09
243_R	246_Y	0.560	0.09
25_F	246_Y	0.560	0.09
244_H	249_Y	0.558	0.09
308_V	401_A	0.558	0.09
25_F	235_Y	0.558	0.09
68_A	488_L	0.557	0.09
304_N	397_Y	0.557	0.09
87_P	138_A	0.557	0.09
91_C	95_T	0.556	0.09
46_L	329_V	0.556	0.09
28_V	366_S	0.553	0.09
250_F	256_T	0.552	0.09
102_A	268_A	0.551	0.09
69_L	115_A	0.548	0.09
7_E	87_P	0.547	0.09
169_V	417_A	0.547	0.09
73_P	80_R	0.545	0.09
82_M	246_Y	0.544	0.09
195_A	303_A	0.544	0.09
32_D	318_P	0.544	0.09
295_A	459_E	0.542	0.09
29_G	383_P	0.541	0.09
3_H	492_V	0.540	0.09
191_V	273_L	0.540	0.09
58_R	299_G	0.540	0.09
71_C	439_V	0.539	0.09
63_I	394_D	0.539	0.09
172_A	399_A	0.538	0.09
308_V	452_M	0.538	0.09
298_V	383_P	0.537	0.09
26_G	233_I	0.537	0.09
45_L	198_A	0.534	0.09
296_A	318_P	0.533	0.09
123_A	189_V	0.533	0.09
246_Y	308_V	0.533	0.09
106_R	178_H	0.532	0.08
176_W	192_Y	0.532	0.08
243_R	341_R	0.532	0.08
266_A	356_R	0.532	0.08
321_V	487_A	0.531	0.08
189_V	235_Y	0.529	0.08
24_V	114_S	0.528	0.08
62_L	175_W	0.528	0.08
332_R	427_Y	0.528	0.08
86_L	98_L	0.527	0.08
43_G	288_F	0.527	0.08
97_G	276_R	0.527	0.08
197_R	261_A	0.526	0.08
460_S	510_I	0.525	0.08
187_L	354_A	0.525	0.08
43_G	323_A	0.524	0.08
227_G	315_A	0.523	0.08
82_M	448_W	0.523	0.08
122_F	186_F	0.522	0.08
39_V	86_L	0.522	0.08
124_T	490_S	0.520	0.08
232_A	260_G	0.520	0.08
50_A	401_A	0.519	0.08
138_A	240_S	0.519	0.08
170_A	290_F	0.517	0.08
35_A	317_V	0.516	0.08
240_S	245_A	0.515	0.08
6_W	379_S	0.514	0.08
146_H	284_G	0.513	0.08
75_L	221_V	0.513	0.08
69_L	104_D	0.512	0.08
402_P	439_V	0.511	0.08
66_G	379_S	0.511	0.08
33_A	462_D	0.510	0.08
266_A	458_T	0.510	0.08
360_A	482_V	0.510	0.08
120_V	257_V	0.509	0.08
378_T	405_L	0.509	0.08
70_A	321_V	0.509	0.08
53_F	301_P	0.509	0.08
78_Y	263_G	0.507	0.08
44_A	198_A	0.507	0.08
138_A	394_D	0.506	0.08
285_L	371_G	0.506	0.08
65_L	321_V	0.506	0.08
33_A	143_L	0.506	0.08
132_M	231_K	0.505	0.08
368_V	473_A	0.504	0.08
111_L	361_A	0.503	0.08
88_L	138_A	0.503	0.08
375_L	437_S	0.502	0.08
16_L	125_K	0.502	0.08
80_R	83_R	0.502	0.08
190_V	224_A	0.502	0.08
102_A	285_L	0.501	0.08
442_P	510_I	0.500	0.08
161_F	312_T	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3wajA	1	0.8184	99.9	0.862	Contact Map
3rceA	1	0.8088	99.7	0.885	Contact Map
3k6vA	1	0.174	12.8	0.983	Contact Map
3tnyA	1	0.2199	6.1	0.985	Contact Map
4m7oA	1	0.1969	5.8	0.985	Contact Map
4mdyA	1	0.2275	5.4	0.985	Contact Map
4jccA	1	0.2237	5.1	0.986	Contact Map
1fxwF	1	0.2428	5	0.986	Contact Map
3gfvA	1	0.2237	5	0.986	Contact Map
2vozA	3	0.1931	4.8	0.986	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0132 seconds.