Q9HN61 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HN61 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HN61	Sequences: MRAHVVRSGVSTRTSALDALVFGVDVQSGDVRGDAPSYALVSFDGETVERDVVTRRKLLRLVADREPAIVATDNMYELAADKDQLVHLLRRLPDSTTLVQVTGDERPEPLSRVAKRHGVPYGKPAMEEAEAAARLAAHNVGYEVSAFTDETELKVARGRSTGGGGGWSADRFTRRIHGSVKRETRTVESTLDDAGLDYDREVTEKYGGYANAVFTVQARPENIPVSEHRAGDTRVEVEPVRRDGIEFRPLARRRDRVLVGIDPGTTTAVALVGLDGHVLDVMSTRTADTGDVIEWIIEHGRPALVAADVTPMPDTVEKIAASFDAPTWDPDTDLPVDEKQHRTREEGYDDDHQRDAMAAALYAYDHYRETIERATRETPPTLDEGDVAARVLDGEPLQAVLSDLEETDDPEPDEPTHDPRELTDDERRIKDLEAQVERLQAHVSDLDAELDAKDATIEEYEDELSEARREERQEARERREVTQLEWENDRLETELEEQRERADELEAKLERLKDLWKLDHSNLGDVGGEGRDLVAVKPVDQFTVDAIETADDEYGIASGDVVYLRDASGAGRRTAELLAGFDPRVVLRSGGLSDAADEVLFDHEIPVGPADGVTIREVDELAIANESEVESVVEDWKQRKAEREREQKETMVDSIISEHRADRG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	664 (633)
Sequences:	126 (97)
Seq/√Len:	3.8

HALSA - Q9HN61
SULSO - Q980T0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
350_D	353_Q	7.231	0.99
428_R	433_E	6.399	0.99
187_V	235_V	5.173	0.94
608_G	632_V	4.841	0.92
435_Q	440_Q	4.434	0.88
169_A	172_F	4.356	0.87
585_V	608_G	4.054	0.83
273_G	277_H	3.717	0.77
261_I	319_I	3.667	0.76
457_I	460_Y	3.482	0.71
261_I	293_I	3.477	0.71
153_L	216_V	3.062	0.61
97_T	143_E	3.042	0.60
495_L	498_Q	2.977	0.59
235_V	303_A	2.864	0.55
89_L	180_V	2.721	0.51
210_A	378_T	2.720	0.51
296_I	319_I	2.668	0.50
163_G	169_A	2.644	0.49
554_Y	562_V	2.612	0.48
490_R	566_D	2.594	0.48
79_A	85_L	2.570	0.47
412_P	605_I	2.566	0.47
109_P	293_I	2.526	0.46
271_L	279_L	2.503	0.45
237_V	492_E	2.475	0.44
104_D	172_F	2.464	0.44
38_Y	401_L	2.395	0.42
221_E	357_M	2.391	0.42
387_V	586_V	2.374	0.42
374_A	603_H	2.371	0.41
304_L	427_R	2.344	0.41
58_L	67_P	2.283	0.39
261_I	580_G	2.279	0.39
158_G	223_I	2.278	0.39
168_S	171_R	2.257	0.38
102_T	168_S	2.149	0.35
612_G	628_E	2.136	0.35
84_Q	87_H	2.134	0.35
237_V	501_R	2.132	0.35
375_T	532_D	2.128	0.35
272_V	278_V	2.084	0.34
456_T	460_Y	2.076	0.34
558_S	562_V	2.068	0.33
550_A	564_L	2.065	0.33
42_S	65_R	2.059	0.33
390_R	400_V	2.047	0.33
269_V	319_I	2.030	0.32
304_L	392_L	2.023	0.32
353_Q	371_I	2.008	0.32
192_D	198_Y	1.993	0.32
195_G	558_S	1.985	0.31
405_E	605_I	1.982	0.31
223_I	400_V	1.981	0.31
198_Y	579_A	1.970	0.31
184_T	278_V	1.962	0.31
428_R	431_D	1.955	0.31
271_L	296_I	1.949	0.30
542_F	574_T	1.943	0.30
119_V	237_V	1.921	0.30
192_D	662_D	1.910	0.30
474_E	586_V	1.862	0.28
88_L	250_L	1.857	0.28
26_V	38_Y	1.832	0.28
21_V	91_R	1.824	0.28
374_A	612_G	1.820	0.27
143_E	186_T	1.818	0.27
221_E	364_Y	1.808	0.27
488_N	495_L	1.808	0.27
475_A	478_R	1.799	0.27
95_S	303_A	1.799	0.27
285_R	309_V	1.794	0.27
612_G	615_I	1.790	0.27
453_K	457_I	1.788	0.27
97_T	225_V	1.788	0.27
219_R	222_N	1.777	0.26
24_V	257_V	1.775	0.26
418_D	563_Y	1.768	0.26
181_K	591_G	1.755	0.26
235_V	562_V	1.748	0.26
98_L	157_R	1.728	0.25
70_V	459_E	1.726	0.25
319_I	384_E	1.714	0.25
70_V	374_A	1.708	0.25
450_L	654_S	1.705	0.25
235_V	374_A	1.698	0.25
635_D	655_I	1.694	0.25
162_G	178_G	1.693	0.25
213_V	484_L	1.684	0.24
43_F	84_Q	1.684	0.24
40_L	394_G	1.679	0.24
230_A	304_L	1.674	0.24
128_E	167_W	1.674	0.24
64_D	223_I	1.668	0.24
350_D	371_I	1.641	0.24
153_L	402_S	1.641	0.24
537_K	560_D	1.639	0.24
415_P	558_S	1.617	0.23
451_D	464_L	1.607	0.23
356_A	497_E	1.595	0.23
296_I	547_I	1.586	0.22
307_A	624_A	1.583	0.22
291_D	374_A	1.576	0.22
323_F	537_K	1.575	0.22
269_V	281_V	1.570	0.22
119_V	509_L	1.565	0.22
221_E	437_E	1.563	0.22
210_A	353_Q	1.561	0.22
312_M	327_T	1.560	0.22
235_V	400_V	1.559	0.22
143_E	563_Y	1.556	0.22
21_V	215_T	1.552	0.22
364_Y	457_I	1.551	0.22
158_G	176_I	1.550	0.22
48_V	332_T	1.549	0.22
388_A	400_V	1.546	0.22
531_R	563_Y	1.527	0.21
195_G	283_S	1.514	0.21
175_R	234_R	1.507	0.21
433_E	562_V	1.505	0.21
153_L	492_E	1.504	0.21
554_Y	561_V	1.496	0.21
169_A	266_T	1.488	0.21
139_N	659_H	1.486	0.21
384_E	563_Y	1.484	0.21
155_V	187_V	1.480	0.20
175_R	278_V	1.479	0.20
487_E	492_E	1.478	0.20
585_V	632_V	1.474	0.20
57_K	131_A	1.466	0.20
163_G	172_F	1.466	0.20
387_V	403_D	1.457	0.20
304_L	394_G	1.457	0.20
231_G	356_A	1.453	0.20
539_V	645_R	1.448	0.20
199_D	338_E	1.448	0.20
403_D	461_E	1.446	0.20
36_P	361_L	1.444	0.20
54_T	58_L	1.434	0.20
21_V	447_D	1.431	0.20
433_E	440_Q	1.427	0.19
46_E	453_K	1.427	0.19
67_P	265_T	1.427	0.19
364_Y	539_V	1.424	0.19
162_G	180_V	1.424	0.19
37_S	176_I	1.424	0.19
480_E	535_A	1.423	0.19
233_T	297_I	1.417	0.19
350_D	380_P	1.417	0.19
270_A	356_A	1.416	0.19
142_Y	556_I	1.414	0.19
198_Y	222_N	1.414	0.19
455_A	605_I	1.411	0.19
67_P	283_S	1.409	0.19
135_L	596_A	1.403	0.19
265_T	283_S	1.396	0.19
199_D	362_Y	1.389	0.19
26_V	258_L	1.381	0.19
541_Q	562_V	1.379	0.19
233_T	460_Y	1.379	0.19
553_E	556_I	1.369	0.18
428_R	440_Q	1.367	0.18
21_V	176_I	1.361	0.18
108_E	116_R	1.347	0.18
317_E	321_A	1.347	0.18
329_D	562_V	1.343	0.18
481_V	489_D	1.342	0.18
128_E	177_H	1.340	0.18
156_A	223_I	1.334	0.18
147_F	160_S	1.324	0.18
176_I	345_E	1.319	0.18
423_T	435_Q	1.319	0.18
38_Y	412_P	1.316	0.18
634_E	655_I	1.314	0.18
188_E	321_A	1.309	0.17
86_V	562_V	1.307	0.17
235_V	463_E	1.298	0.17
281_V	401_L	1.294	0.17
135_L	140_V	1.291	0.17
364_Y	460_Y	1.287	0.17
69_I	394_G	1.285	0.17
291_D	405_E	1.285	0.17
210_A	350_D	1.279	0.17
371_I	392_L	1.279	0.17
169_A	375_T	1.277	0.17
319_I	514_D	1.276	0.17
54_T	392_L	1.275	0.17
267_T	356_A	1.275	0.17
346_E	357_M	1.270	0.17
195_G	376_R	1.265	0.17
376_R	585_V	1.262	0.17
58_L	356_A	1.261	0.17
296_I	532_D	1.261	0.17
43_F	65_R	1.260	0.17
410_P	481_V	1.255	0.17
40_L	557_A	1.255	0.17
213_V	470_E	1.254	0.17
265_T	350_D	1.252	0.17
558_S	563_Y	1.245	0.16
318_K	394_G	1.239	0.16
498_Q	506_E	1.239	0.16
168_S	309_V	1.238	0.16
304_L	326_P	1.234	0.16
40_L	510_E	1.233	0.16
514_D	549_T	1.230	0.16
256_R	544_V	1.228	0.16
86_V	273_G	1.226	0.16
74_N	542_F	1.221	0.16
375_T	388_A	1.220	0.16
561_V	629_V	1.219	0.16
273_G	291_D	1.219	0.16
223_I	235_V	1.218	0.16
192_D	507_A	1.217	0.16
240_V	481_V	1.211	0.16
412_P	507_A	1.209	0.16
97_T	430_K	1.208	0.16
58_L	432_L	1.206	0.16
557_A	642_E	1.203	0.16
70_V	498_Q	1.200	0.16
70_V	615_I	1.199	0.16
225_V	586_V	1.197	0.16
144_V	283_S	1.195	0.16
488_N	498_Q	1.194	0.16
338_E	357_M	1.191	0.16
415_P	649_E	1.190	0.16
261_I	455_A	1.188	0.16
258_L	652_V	1.170	0.15
26_V	156_A	1.168	0.15
73_D	77_E	1.165	0.15
638_Q	641_A	1.164	0.15
159_R	208_G	1.162	0.15
269_V	445_D	1.162	0.15
124_P	487_E	1.162	0.15
188_E	285_R	1.160	0.15
26_V	452_A	1.159	0.15
116_R	518_L	1.158	0.15
44_D	499_R	1.157	0.15
112_R	643_R	1.155	0.15
105_E	116_R	1.155	0.15
199_D	223_I	1.151	0.15
542_F	564_L	1.147	0.15
145_S	547_I	1.144	0.15
272_V	392_L	1.139	0.15
601_F	640_K	1.133	0.15
118_G	327_T	1.133	0.15
338_E	362_Y	1.130	0.15
494_E	499_R	1.128	0.15
272_V	652_V	1.128	0.15
243_D	461_E	1.126	0.15
611_D	627_S	1.125	0.15
49_E	64_D	1.120	0.15
235_V	545_D	1.120	0.15
99_V	224_P	1.118	0.15
452_A	580_G	1.118	0.15
601_F	608_G	1.115	0.15
615_I	654_S	1.112	0.14
75_M	251_A	1.109	0.14
556_I	633_V	1.105	0.14
188_E	371_I	1.105	0.14
350_D	379_P	1.103	0.14
296_I	473_Q	1.102	0.14
186_T	535_A	1.101	0.14
310_T	329_D	1.099	0.14
160_S	323_F	1.099	0.14
178_G	285_R	1.098	0.14
201_E	350_D	1.097	0.14
230_A	396_P	1.096	0.14
258_L	544_V	1.094	0.14
65_R	394_G	1.094	0.14
634_E	649_E	1.093	0.14
155_V	259_V	1.091	0.14
277_H	547_I	1.090	0.14
604_E	615_I	1.089	0.14
237_V	545_D	1.085	0.14
62_V	70_V	1.083	0.14
69_I	304_L	1.078	0.14
171_R	338_E	1.076	0.14
259_V	318_K	1.075	0.14
252_R	261_I	1.075	0.14
130_E	134_R	1.073	0.14
599_V	605_I	1.072	0.14
152_E	184_T	1.069	0.14
348_Y	379_P	1.067	0.14
547_I	562_V	1.065	0.14
417_H	420_R	1.065	0.14
102_T	309_V	1.063	0.14
39_A	131_A	1.060	0.14
24_V	455_A	1.058	0.14
190_T	406_E	1.057	0.14
371_I	396_P	1.056	0.14
154_K	285_R	1.055	0.14
69_I	97_T	1.050	0.14
456_T	461_E	1.049	0.14
326_P	343_T	1.049	0.14
73_D	166_G	1.045	0.14
73_D	165_G	1.045	0.14
128_E	560_D	1.043	0.14
144_V	232_D	1.038	0.13
55_R	80_A	1.037	0.13
124_P	406_E	1.036	0.13
257_V	600_L	1.029	0.13
143_E	248_R	1.027	0.13
70_V	630_E	1.025	0.13
72_T	304_L	1.019	0.13
201_E	353_Q	1.018	0.13
148_T	632_V	1.018	0.13
327_T	358_A	1.018	0.13
61_L	65_R	1.015	0.13
195_G	350_D	1.012	0.13
55_R	641_A	1.011	0.13
162_G	246_E	1.011	0.13
216_V	389_A	1.011	0.13
219_R	247_F	1.011	0.13
204_E	344_R	1.007	0.13
192_D	402_S	1.005	0.13
307_A	367_Y	1.003	0.13
192_D	288_D	1.003	0.13
342_R	371_I	1.002	0.13
431_D	435_Q	1.002	0.13
192_D	213_V	1.001	0.13
247_F	390_R	1.000	0.13
136_A	316_V	0.996	0.13
219_R	223_I	0.994	0.13
332_T	366_H	0.994	0.13
556_I	573_R	0.992	0.13
258_L	419_P	0.992	0.13
147_F	249_P	0.991	0.13
356_A	446_L	0.989	0.13
206_Y	224_P	0.986	0.13
575_A	619_D	0.986	0.13
561_V	604_E	0.985	0.13
449_E	452_A	0.983	0.13
357_M	394_G	0.981	0.13
214_F	334_L	0.981	0.13
481_V	484_L	0.981	0.13
563_Y	589_S	0.980	0.13
541_Q	588_R	0.978	0.13
153_L	272_V	0.975	0.13
70_V	252_R	0.972	0.13
75_M	84_Q	0.971	0.13
192_D	383_D	0.970	0.13
251_A	269_V	0.969	0.13
31_V	210_A	0.968	0.13
65_R	195_G	0.968	0.13
25_D	77_E	0.967	0.13
547_I	615_I	0.962	0.12
185_R	242_R	0.961	0.12
477_E	509_L	0.961	0.12
143_E	562_V	0.960	0.12
258_L	385_G	0.959	0.12
170_D	570_A	0.957	0.12
39_A	488_N	0.955	0.12
228_H	233_T	0.954	0.12
303_A	381_T	0.952	0.12
258_L	649_E	0.951	0.12
118_G	135_L	0.950	0.12
400_V	629_V	0.947	0.12
258_L	403_D	0.945	0.12
225_V	358_A	0.944	0.12
209_Y	615_I	0.944	0.12
196_L	464_L	0.944	0.12
279_L	655_I	0.944	0.12
392_L	509_L	0.943	0.12
42_S	49_E	0.943	0.12
564_L	644_E	0.938	0.12
500_E	586_V	0.937	0.12
298_E	461_E	0.937	0.12
407_T	486_W	0.935	0.12
87_H	235_V	0.932	0.12
487_E	490_R	0.929	0.12
146_A	194_A	0.928	0.12
110_L	379_P	0.924	0.12
97_T	186_T	0.924	0.12
450_L	470_E	0.923	0.12
257_V	617_E	0.923	0.12
61_L	247_F	0.922	0.12
132_A	436_V	0.922	0.12
490_R	494_E	0.920	0.12
573_R	628_E	0.920	0.12
128_E	317_E	0.918	0.12
198_Y	453_K	0.918	0.12
269_V	296_I	0.916	0.12
24_V	155_V	0.915	0.12
323_F	350_D	0.915	0.12
72_T	207_G	0.914	0.12
553_E	589_S	0.913	0.12
75_M	290_G	0.912	0.12
40_L	534_V	0.911	0.12
222_N	645_R	0.908	0.12
305_V	504_E	0.907	0.12
149_D	404_L	0.907	0.12
195_G	346_E	0.906	0.12
278_V	346_E	0.905	0.12
24_V	533_L	0.905	0.12
242_R	292_V	0.898	0.12
374_A	641_A	0.896	0.12
271_L	632_V	0.896	0.12
195_G	488_N	0.895	0.12
149_D	296_I	0.893	0.12
290_G	293_I	0.892	0.12
49_E	304_L	0.889	0.12
356_A	505_L	0.889	0.12
133_A	165_G	0.884	0.12
133_A	166_G	0.884	0.12
586_V	658_E	0.883	0.12
242_R	391_V	0.880	0.11
39_A	54_T	0.879	0.11
255_D	267_T	0.879	0.11
29_G	36_P	0.879	0.11
233_T	450_L	0.878	0.11
290_G	350_D	0.877	0.11
357_M	430_K	0.873	0.11
434_A	647_Q	0.873	0.11
142_Y	559_G	0.871	0.11
44_D	288_D	0.871	0.11
223_I	604_E	0.871	0.11
536_V	596_A	0.870	0.11
495_L	582_D	0.869	0.11
132_A	427_R	0.869	0.11
152_E	553_E	0.869	0.11
155_V	414_E	0.869	0.11
57_K	280_D	0.869	0.11
277_H	402_S	0.867	0.11
273_G	372_E	0.865	0.11
304_L	452_A	0.864	0.11
158_G	479_R	0.861	0.11
392_L	652_V	0.861	0.11
234_R	301_R	0.858	0.11
309_V	400_V	0.858	0.11
171_R	214_F	0.857	0.11
178_G	636_W	0.857	0.11
23_G	26_V	0.856	0.11
321_A	398_Q	0.853	0.11
167_W	266_T	0.852	0.11
273_G	303_A	0.852	0.11
215_T	219_R	0.852	0.11
274_L	303_A	0.850	0.11
81_D	511_R	0.850	0.11
118_G	388_A	0.849	0.11
365_D	497_E	0.845	0.11
281_V	385_G	0.845	0.11
20_L	43_F	0.844	0.11
176_I	484_L	0.842	0.11
305_V	439_L	0.840	0.11
101_V	232_D	0.840	0.11
442_H	636_W	0.840	0.11
88_L	655_I	0.838	0.11
364_Y	403_D	0.837	0.11
255_D	392_L	0.836	0.11
333_D	432_L	0.836	0.11
188_E	445_D	0.836	0.11
550_A	562_V	0.835	0.11
413_D	630_E	0.834	0.11
24_V	117_H	0.834	0.11
537_K	569_G	0.834	0.11
236_E	288_D	0.833	0.11
73_D	133_A	0.832	0.11
49_E	550_A	0.829	0.11
278_V	372_E	0.829	0.11
171_R	268_A	0.827	0.11
30_D	50_R	0.827	0.11
138_H	153_L	0.827	0.11
27_Q	74_N	0.825	0.11
193_D	304_L	0.825	0.11
171_R	191_L	0.824	0.11
275_D	646_E	0.822	0.11
132_A	479_R	0.821	0.11
74_N	562_V	0.820	0.11
168_S	214_F	0.819	0.11
68_A	652_V	0.819	0.11
244_G	301_R	0.818	0.11
489_D	499_R	0.816	0.11
364_Y	461_E	0.812	0.11
374_A	455_A	0.812	0.11
430_K	654_S	0.808	0.11
272_V	583_P	0.808	0.11
118_G	499_R	0.808	0.11
78_L	118_G	0.806	0.11
139_N	342_R	0.805	0.11
179_S	211_N	0.805	0.11
128_E	569_G	0.804	0.11
580_G	649_E	0.803	0.11
70_V	455_A	0.800	0.11
24_V	321_A	0.799	0.11
273_G	542_F	0.798	0.11
244_G	486_W	0.798	0.11
237_V	468_R	0.796	0.11
138_H	158_G	0.794	0.11
374_A	433_E	0.793	0.11
119_V	587_L	0.791	0.11
353_Q	410_P	0.790	0.10
155_V	328_W	0.790	0.10
319_I	558_S	0.788	0.10
93_P	270_A	0.788	0.10
448_A	558_S	0.785	0.10
351_D	560_D	0.784	0.10
534_V	572_R	0.783	0.10
439_L	443_V	0.782	0.10
219_R	237_V	0.781	0.10
543_T	613_V	0.780	0.10
47_T	503_D	0.779	0.10
102_T	171_R	0.779	0.10
128_E	351_D	0.779	0.10
21_V	211_N	0.778	0.10
504_E	507_A	0.778	0.10
320_A	369_E	0.777	0.10
214_F	359_A	0.775	0.10
142_Y	598_E	0.773	0.10
175_R	201_E	0.772	0.10
461_E	579_A	0.769	0.10
394_G	477_E	0.768	0.10
521_S	621_L	0.765	0.10
377_E	397_L	0.765	0.10
52_V	194_A	0.764	0.10
443_V	551_D	0.763	0.10
323_F	560_D	0.762	0.10
90_R	576_E	0.761	0.10
208_G	394_G	0.761	0.10
351_D	537_K	0.758	0.10
430_K	462_D	0.757	0.10
253_R	301_R	0.757	0.10
57_K	79_A	0.756	0.10
135_L	240_V	0.756	0.10
179_S	447_D	0.755	0.10
514_D	618_V	0.753	0.10
208_G	283_S	0.751	0.10
94_D	247_F	0.749	0.10
54_T	146_A	0.748	0.10
187_V	487_E	0.748	0.10
258_L	273_G	0.748	0.10
364_Y	650_T	0.747	0.10
183_E	235_V	0.745	0.10
271_L	561_V	0.745	0.10
83_D	652_V	0.744	0.10
172_F	322_S	0.740	0.10
135_L	575_A	0.739	0.10
89_L	274_L	0.739	0.10
293_I	544_V	0.739	0.10
292_V	315_T	0.739	0.10
338_E	558_S	0.738	0.10
128_E	266_T	0.738	0.10
371_I	374_A	0.737	0.10
473_Q	481_V	0.737	0.10
20_L	45_G	0.736	0.10
449_E	654_S	0.736	0.10
364_Y	488_N	0.735	0.10
273_G	293_I	0.735	0.10
135_L	311_P	0.735	0.10
242_R	568_S	0.734	0.10
255_D	268_A	0.733	0.10
125_A	258_L	0.731	0.10
159_R	606_P	0.731	0.10
315_T	365_D	0.731	0.10
27_Q	52_V	0.730	0.10
305_V	552_D	0.729	0.10
138_H	655_I	0.728	0.10
209_Y	564_L	0.725	0.10
67_P	351_D	0.725	0.10
329_D	336_V	0.724	0.10
46_E	80_A	0.724	0.10
278_V	303_A	0.724	0.10
481_V	562_V	0.722	0.10
454_D	468_R	0.719	0.10
256_R	376_R	0.718	0.10
531_R	562_V	0.718	0.10
201_E	217_Q	0.718	0.10
62_V	620_E	0.717	0.10
233_T	488_N	0.715	0.10
521_S	625_N	0.711	0.10
190_T	444_S	0.711	0.10
103_G	114_A	0.710	0.10
280_D	305_V	0.709	0.10
67_P	322_S	0.709	0.10
153_L	227_E	0.708	0.10
448_A	644_E	0.707	0.10
78_L	622_A	0.706	0.10
110_L	266_T	0.706	0.10
61_L	436_V	0.705	0.10
591_G	611_D	0.704	0.10
223_I	651_M	0.704	0.10
269_V	437_E	0.704	0.10
241_R	519_D	0.704	0.10
156_A	545_D	0.703	0.10
235_V	638_Q	0.703	0.10
397_L	500_E	0.702	0.10
374_A	504_E	0.702	0.10
57_K	399_A	0.702	0.10
109_P	155_V	0.701	0.10
437_E	451_D	0.700	0.10
22_F	389_A	0.700	0.10
500_E	550_A	0.699	0.10
278_V	376_R	0.698	0.10
21_V	329_D	0.698	0.10
259_V	512_L	0.697	0.10
464_L	508_K	0.697	0.10
141_G	355_D	0.697	0.10
141_G	339_K	0.697	0.10
141_G	360_A	0.697	0.10
141_G	352_H	0.697	0.10
300_G	339_K	0.697	0.10
141_G	308_D	0.697	0.10
141_G	300_G	0.697	0.10
129_A	352_H	0.697	0.10
129_A	339_K	0.697	0.10
352_H	360_A	0.697	0.10
129_A	308_D	0.697	0.10
129_A	300_G	0.697	0.10
129_A	264_G	0.697	0.10
129_A	262_D	0.697	0.10
339_K	360_A	0.697	0.10
339_K	355_D	0.697	0.10
339_K	352_H	0.697	0.10
129_A	355_D	0.697	0.10
308_D	360_A	0.697	0.10
308_D	355_D	0.697	0.10
141_G	264_G	0.697	0.10
141_G	262_D	0.697	0.10
300_G	308_D	0.697	0.10
300_G	352_H	0.697	0.10
300_G	355_D	0.697	0.10
300_G	360_A	0.697	0.10
352_H	355_D	0.697	0.10
355_D	360_A	0.697	0.10
129_A	360_A	0.697	0.10
308_D	339_K	0.697	0.10
129_A	141_G	0.697	0.10
264_G	352_H	0.697	0.10
264_G	360_A	0.697	0.10
262_D	300_G	0.697	0.10
264_G	339_K	0.697	0.10
264_G	308_D	0.697	0.10
264_G	300_G	0.697	0.10
264_G	355_D	0.697	0.10
262_D	360_A	0.697	0.10
262_D	355_D	0.697	0.10
262_D	352_H	0.697	0.10
262_D	308_D	0.697	0.10
262_D	339_K	0.697	0.10
308_D	352_H	0.697	0.10
542_F	568_S	0.694	0.10
159_R	283_S	0.693	0.10
75_M	223_I	0.693	0.10
461_E	489_D	0.692	0.09
25_D	174_R	0.692	0.09
582_D	655_I	0.690	0.09
235_V	256_R	0.689	0.09
101_V	306_A	0.688	0.09
131_A	265_T	0.688	0.09
66_E	240_V	0.688	0.09
630_E	655_I	0.688	0.09
448_A	628_E	0.687	0.09
49_E	261_I	0.687	0.09
296_I	514_D	0.685	0.09
437_E	503_D	0.685	0.09
193_D	329_D	0.683	0.09
479_R	621_L	0.683	0.09
186_T	655_I	0.683	0.09
44_D	241_R	0.683	0.09
128_E	162_G	0.682	0.09
74_N	130_E	0.682	0.09
456_T	561_V	0.680	0.09
154_K	377_E	0.680	0.09
90_R	222_N	0.679	0.09
532_D	558_S	0.679	0.09
87_H	237_V	0.679	0.09
271_L	654_S	0.678	0.09
364_Y	495_L	0.677	0.09
546_A	646_E	0.677	0.09
45_G	172_F	0.677	0.09
329_D	376_R	0.676	0.09
161_T	492_E	0.676	0.09
179_S	186_T	0.676	0.09
109_P	622_A	0.675	0.09
128_E	289_T	0.674	0.09
416_T	495_L	0.673	0.09
209_Y	227_E	0.672	0.09
185_R	311_P	0.668	0.09
63_A	150_E	0.668	0.09
303_A	364_Y	0.667	0.09
75_M	488_N	0.667	0.09
75_M	589_S	0.667	0.09
62_V	540_D	0.666	0.09
102_T	214_F	0.665	0.09
81_D	520_H	0.665	0.09
196_L	333_D	0.665	0.09
428_R	489_D	0.664	0.09
431_D	440_Q	0.663	0.09
552_D	587_L	0.662	0.09
183_E	187_V	0.660	0.09
135_L	212_A	0.660	0.09
410_P	497_E	0.659	0.09
271_L	489_D	0.658	0.09
33_G	118_G	0.657	0.09
124_P	488_N	0.657	0.09
109_P	587_L	0.657	0.09
401_L	489_D	0.656	0.09
91_R	138_H	0.655	0.09
80_A	584_R	0.654	0.09
169_A	585_V	0.652	0.09
258_L	645_R	0.651	0.09
365_D	520_H	0.650	0.09
149_D	387_V	0.650	0.09
414_E	580_G	0.648	0.09
602_D	612_G	0.647	0.09
217_Q	305_V	0.647	0.09
120_P	348_Y	0.647	0.09
130_E	373_R	0.647	0.09
322_S	342_R	0.647	0.09
395_E	651_M	0.645	0.09
26_V	200_R	0.645	0.09
462_D	632_V	0.645	0.09
462_D	655_I	0.644	0.09
240_V	332_T	0.644	0.09
305_V	365_D	0.643	0.09
396_P	401_L	0.643	0.09
408_D	413_D	0.642	0.09
583_P	621_L	0.642	0.09
46_E	84_Q	0.641	0.09
229_R	464_L	0.638	0.09
356_A	656_I	0.638	0.09
336_V	441_A	0.638	0.09
57_K	99_V	0.637	0.09
70_V	499_R	0.636	0.09
445_D	474_E	0.633	0.09
233_T	419_P	0.632	0.09
364_Y	558_S	0.632	0.09
49_E	61_L	0.632	0.09
331_D	336_V	0.631	0.09
269_V	482_T	0.630	0.09
420_R	423_T	0.629	0.09
550_A	553_E	0.628	0.09
75_M	635_D	0.626	0.09
269_V	585_V	0.626	0.09
237_V	504_E	0.625	0.09
40_L	47_T	0.623	0.09
161_T	244_G	0.623	0.09
135_L	242_R	0.622	0.09
36_P	46_E	0.621	0.09
475_A	504_E	0.620	0.09
441_A	531_R	0.619	0.09
64_D	615_I	0.619	0.09
135_L	622_A	0.618	0.09
114_A	313_P	0.618	0.09
296_I	457_I	0.617	0.09
44_D	123_K	0.617	0.09
434_A	539_V	0.617	0.09
167_W	194_A	0.617	0.09
167_W	351_D	0.617	0.09
485_E	605_I	0.616	0.09
317_E	398_Q	0.615	0.09
87_H	594_D	0.615	0.09
440_Q	655_I	0.615	0.09
65_R	70_V	0.615	0.09
284_T	287_A	0.613	0.09
58_L	510_E	0.612	0.09
66_E	368_R	0.612	0.09
76_Y	245_I	0.611	0.09
217_Q	350_D	0.611	0.09
70_V	95_S	0.610	0.09
153_L	368_R	0.609	0.09
325_A	439_L	0.608	0.09
383_D	439_L	0.606	0.09
110_L	294_E	0.606	0.09
291_D	589_S	0.605	0.09
156_A	245_I	0.604	0.09
259_V	302_P	0.603	0.09
200_R	327_T	0.603	0.09
21_V	331_D	0.603	0.09
162_G	311_P	0.602	0.09
135_L	660_R	0.600	0.09
247_F	364_Y	0.597	0.09
304_L	321_A	0.597	0.09
96_T	146_A	0.595	0.09
409_D	589_S	0.595	0.09
435_Q	562_V	0.594	0.09
24_V	295_W	0.594	0.09
113_V	294_E	0.593	0.09
26_V	97_T	0.592	0.09
278_V	440_Q	0.591	0.09
221_E	599_V	0.591	0.09
40_L	297_I	0.590	0.09
153_L	547_I	0.590	0.09
573_R	605_I	0.589	0.09
172_F	278_V	0.589	0.09
168_S	330_P	0.587	0.09
237_V	633_V	0.586	0.09
460_Y	477_E	0.586	0.09
574_T	595_A	0.586	0.09
39_A	294_E	0.584	0.08
100_Q	208_G	0.584	0.08
46_E	88_L	0.583	0.08
403_D	557_A	0.583	0.08
510_E	603_H	0.582	0.08
161_T	387_V	0.581	0.08
54_T	268_A	0.581	0.08
148_T	662_D	0.581	0.08
562_V	595_A	0.581	0.08
75_M	427_R	0.581	0.08
305_V	485_E	0.581	0.08
118_G	212_A	0.581	0.08
602_D	650_T	0.580	0.08
506_E	646_E	0.579	0.08
615_I	632_V	0.578	0.08
141_G	174_R	0.577	0.08
81_D	226_S	0.577	0.08
174_R	300_G	0.577	0.08
174_R	262_D	0.577	0.08
174_R	264_G	0.577	0.08
174_R	352_H	0.577	0.08
174_R	360_A	0.577	0.08
129_A	174_R	0.577	0.08
174_R	308_D	0.577	0.08
174_R	339_K	0.577	0.08
174_R	355_D	0.577	0.08
269_V	387_V	0.576	0.08
487_E	566_D	0.576	0.08
550_A	554_Y	0.575	0.08
604_E	637_K	0.574	0.08
195_G	240_V	0.573	0.08
83_D	258_L	0.571	0.08
225_V	502_A	0.571	0.08
413_D	652_V	0.570	0.08
90_R	531_R	0.569	0.08
138_H	381_T	0.569	0.08
560_D	569_G	0.568	0.08
258_L	559_G	0.568	0.08
53_V	257_V	0.568	0.08
70_V	532_D	0.568	0.08
135_L	447_D	0.567	0.08
271_L	453_K	0.566	0.08
148_T	357_M	0.566	0.08
570_A	575_A	0.566	0.08
81_D	662_D	0.565	0.08
153_L	268_A	0.564	0.08
65_R	90_R	0.563	0.08
235_V	495_L	0.563	0.08
20_L	495_L	0.563	0.08
321_A	371_I	0.562	0.08
258_L	641_A	0.562	0.08
161_T	225_V	0.562	0.08
25_D	73_D	0.562	0.08
531_R	615_I	0.561	0.08
171_R	309_V	0.561	0.08
303_A	331_D	0.561	0.08
191_L	214_F	0.560	0.08
290_G	505_L	0.558	0.08
161_T	288_D	0.558	0.08
323_F	569_G	0.558	0.08
103_G	128_E	0.556	0.08
464_L	584_R	0.555	0.08
115_K	240_V	0.555	0.08
74_N	212_A	0.555	0.08
566_D	619_D	0.555	0.08
115_K	378_T	0.553	0.08
247_F	416_T	0.552	0.08
275_D	543_T	0.552	0.08
178_G	348_Y	0.551	0.08
222_N	431_D	0.549	0.08
31_V	381_T	0.548	0.08
549_T	580_G	0.547	0.08
64_D	357_M	0.547	0.08
158_G	384_E	0.547	0.08
558_S	628_E	0.546	0.08
218_A	389_A	0.545	0.08
220_P	370_T	0.545	0.08
94_D	221_E	0.545	0.08
418_D	641_A	0.544	0.08
332_T	644_E	0.544	0.08
631_S	635_D	0.543	0.08
22_F	42_S	0.542	0.08
498_Q	561_V	0.542	0.08
227_E	547_I	0.540	0.08
45_G	452_A	0.540	0.08
318_K	401_L	0.538	0.08
29_G	79_A	0.538	0.08
163_G	175_R	0.536	0.08
23_G	133_A	0.535	0.08
641_A	655_I	0.535	0.08
325_A	391_V	0.535	0.08
54_T	97_T	0.534	0.08
271_L	357_M	0.533	0.08
227_E	648_K	0.533	0.08
195_G	256_R	0.533	0.08
140_V	155_V	0.533	0.08
220_P	516_W	0.533	0.08
53_V	113_V	0.532	0.08
279_L	434_A	0.532	0.08
147_F	325_A	0.532	0.08
562_V	604_E	0.531	0.08
58_L	315_T	0.530	0.08
265_T	312_M	0.530	0.08
31_V	213_V	0.529	0.08
184_T	284_T	0.529	0.08
40_L	304_L	0.529	0.08
558_S	573_R	0.528	0.08
453_K	646_E	0.528	0.08
329_D	648_K	0.528	0.08
287_A	394_G	0.527	0.08
93_P	153_L	0.527	0.08
38_Y	290_G	0.525	0.08
23_G	77_E	0.525	0.08
128_E	571_G	0.524	0.08
21_V	343_T	0.524	0.08
387_V	505_L	0.524	0.08
549_T	553_E	0.524	0.08
20_L	42_S	0.523	0.08
119_V	172_F	0.522	0.08
99_V	511_R	0.522	0.08
309_V	316_V	0.521	0.08
229_R	356_A	0.521	0.08
401_L	418_D	0.521	0.08
251_A	257_V	0.520	0.08
101_V	309_V	0.518	0.08
199_D	358_A	0.518	0.08
381_T	498_Q	0.517	0.08
67_P	266_T	0.517	0.08
461_E	539_V	0.517	0.08
149_D	393_D	0.517	0.08
293_I	609_P	0.515	0.08
279_L	328_W	0.514	0.08
226_S	307_A	0.514	0.08
75_M	402_S	0.513	0.08
217_Q	268_A	0.513	0.08
539_V	613_V	0.512	0.08
224_P	320_A	0.512	0.08
103_G	323_F	0.512	0.08
192_D	466_E	0.511	0.08
535_A	538_P	0.510	0.08
169_A	531_R	0.510	0.08
232_D	537_K	0.510	0.08
492_E	587_L	0.510	0.08
71_A	77_E	0.509	0.08
542_F	575_A	0.509	0.08
498_Q	549_T	0.509	0.08
593_S	596_A	0.509	0.08
60_R	499_R	0.509	0.08
500_E	592_L	0.508	0.08
460_Y	478_R	0.508	0.08
106_R	113_V	0.507	0.08
253_R	387_V	0.507	0.08
322_S	429_I	0.506	0.08
449_E	582_D	0.506	0.08
47_T	364_Y	0.506	0.08
115_K	577_L	0.504	0.08
291_D	450_L	0.504	0.08
183_E	621_L	0.504	0.08
224_P	373_R	0.504	0.08
291_D	416_T	0.502	0.08
29_G	85_L	0.501	0.08
179_S	558_S	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1hjrA	2	0.1747	99.2	0.947	Contact Map
4ep4A	2	0.1792	97.9	0.965	Contact Map
1nu0A	1	0.1657	97.6	0.967	Contact Map
4y66A	1	0.2922	97.3	0.969	Contact Map
1vhxA	2	0.1747	97	0.97	Contact Map
4ktwA	2	0.1642	96.8	0.971	Contact Map
1iv0A	1	0.122	95.6	0.974	Contact Map
4rsiB	1	0.3599	92.9	0.977	Contact Map
1l8dA	2	0.1431	92.8	0.977	Contact Map
4c46A	3	0.1114	92.7	0.977	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0155 seconds.