CAPPA - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

CAPPA - Phosphoenolpyruvate carboxylase

UniProt:	Q9HN43	Sequences: MVDVPRLMSTQHPDNATLPFFTAGDVIEGEDEIQEAYYVYSHLGCDEQMWDFEGKEGDEYAVKKLLSRYDEFFADHQLGTDVRLTVRGPNPDVEGSEAKILLEILESIPRSFDAARRFAGEYGLETTAPIFEVIVPMVTDADQLNAVHEYYERFVTGKADEAVWDGRTVEEWVGEFDPASITVIPLIEEREAMLAADDIVREYATAHDQDAVRVFLARSDPALNYGCLAADLINKVALQRLYEMSEATGVDVHPILGAGSAPFRGNLTPERAAATADAYSEVETFTVQSAFKYDYPVETVRDGVATLRDADLGAPPFPIDEARALAVIDRTADAYADQVDAIAGTVNRLSSYVPDRRARKLHVGLFGYAREVGENALPRAIGYTASLYAVGCPPTLLGAHALTDDDAAFVREAFPAYFDHLADAARYFNPRCTDVLDLDDDTLAAAVERVDVTPNSEHRAATDDAIDALQRGDDDALRSAIRRGARERQFLG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	492 (470)
Sequences:	108 (94)
Seq/√Len:	4.3

HALSA - CAPPA
SULSO - CAPPA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
414_F	420_H	4.111	0.87
200_V	241_L	3.849	0.83
46_D	308_R	3.767	0.82
261_A	490_F	3.742	0.82
7_L	308_R	3.697	0.81
221_P	230_A	3.612	0.79
200_V	298_E	3.119	0.68
32_E	35_E	2.946	0.63
249_G	349_L	2.877	0.61
101_L	130_I	2.696	0.56
197_D	240_R	2.690	0.55
57_G	363_V	2.659	0.55
231_D	414_F	2.602	0.53
353_V	385_A	2.591	0.52
200_V	446_A	2.584	0.52
193_M	240_R	2.581	0.52
58_D	65_L	2.567	0.52
488_R	492_G	2.505	0.50
218_R	230_A	2.418	0.47
232_L	328_I	2.393	0.46
252_V	410_V	2.349	0.45
130_I	390_V	2.330	0.45
57_G	61_A	2.246	0.42
273_A	372_V	2.239	0.42
256_L	487_E	2.231	0.42
138_V	278_A	2.230	0.42
216_L	451_D	2.226	0.42
218_R	221_P	2.140	0.39
325_L	417_Y	2.131	0.39
239_Q	489_Q	2.130	0.39
308_R	375_N	2.096	0.38
50_W	58_D	2.090	0.38
197_D	247_A	2.058	0.37
202_E	205_T	2.048	0.36
223_L	331_T	2.043	0.36
230_A	361_L	2.009	0.35
245_S	349_L	2.005	0.35
278_A	395_T	2.004	0.35
228_L	243_E	1.998	0.35
52_F	86_V	1.962	0.34
84_L	482_R	1.951	0.34
11_Q	14_D	1.936	0.33
106_E	158_K	1.930	0.33
221_P	365_L	1.868	0.32
58_D	61_A	1.863	0.31
129_P	300_V	1.849	0.31
50_W	65_L	1.812	0.30
26_V	358_A	1.811	0.30
183_V	203_Y	1.788	0.30
7_L	307_L	1.746	0.28
144_L	246_E	1.740	0.28
63_K	98_A	1.730	0.28
426_R	441_D	1.729	0.28
195_A	198_D	1.702	0.27
9_S	292_K	1.702	0.27
272_A	306_T	1.685	0.27
100_I	482_R	1.685	0.27
216_L	234_N	1.677	0.27
465_A	484_G	1.668	0.27
238_L	254_P	1.667	0.27
224_N	366_F	1.662	0.26
149_E	189_E	1.657	0.26
241_L	406_D	1.633	0.26
352_Y	444_A	1.633	0.26
65_L	73_F	1.627	0.26
304_V	308_R	1.626	0.26
45_C	427_Y	1.618	0.25
104_I	223_L	1.616	0.25
57_G	361_L	1.612	0.25
224_N	365_L	1.606	0.25
195_A	240_R	1.593	0.25
214_V	390_V	1.572	0.24
206_A	287_V	1.555	0.24
116_R	177_D	1.543	0.24
324_A	448_E	1.540	0.24
61_A	65_L	1.534	0.24
33_I	382_G	1.525	0.23
62_V	84_L	1.510	0.23
223_L	227_C	1.501	0.23
40_Y	146_A	1.496	0.23
130_I	346_V	1.491	0.23
236_V	363_V	1.491	0.23
240_R	422_A	1.487	0.23
80_T	271_R	1.484	0.22
84_L	217_A	1.481	0.22
8_M	14_D	1.468	0.22
8_M	13_P	1.468	0.22
8_M	11_Q	1.468	0.22
8_M	12_H	1.468	0.22
216_L	491_L	1.459	0.22
404_D	410_V	1.447	0.22
109_P	155_V	1.446	0.22
50_W	131_F	1.445	0.22
296_P	416_A	1.442	0.22
58_D	73_F	1.439	0.22
349_L	427_Y	1.439	0.22
64_K	360_K	1.436	0.21
198_D	252_V	1.431	0.21
90_N	135_V	1.429	0.21
349_L	426_R	1.425	0.21
19_P	58_D	1.425	0.21
342_I	350_S	1.425	0.21
190_R	233_I	1.424	0.21
352_Y	427_Y	1.421	0.21
205_T	309_D	1.420	0.21
227_C	414_F	1.414	0.21
231_D	421_L	1.414	0.21
109_P	151_Y	1.413	0.21
7_L	46_D	1.407	0.21
277_D	386_S	1.402	0.21
235_K	278_A	1.394	0.21
72_F	277_D	1.393	0.21
50_W	356_R	1.384	0.20
10_T	14_D	1.377	0.20
10_T	13_P	1.377	0.20
266_N	423_D	1.373	0.20
91_P	151_Y	1.373	0.20
21_F	56_E	1.372	0.20
179_A	373_G	1.372	0.20
64_K	99_K	1.366	0.20
287_V	382_G	1.364	0.20
78_L	428_F	1.362	0.20
375_N	396_L	1.361	0.20
45_C	429_N	1.359	0.20
330_R	406_D	1.350	0.20
258_A	361_L	1.348	0.20
66_L	84_L	1.348	0.20
58_D	291_F	1.337	0.20
285_F	292_K	1.334	0.19
360_K	366_F	1.333	0.19
214_V	241_L	1.332	0.19
287_V	475_D	1.326	0.19
230_A	363_V	1.326	0.19
40_Y	305_A	1.323	0.19
52_F	104_I	1.310	0.19
67_S	386_S	1.306	0.19
309_D	392_C	1.286	0.19
65_L	131_F	1.286	0.19
39_V	154_F	1.284	0.19
7_L	45_C	1.283	0.19
90_N	217_A	1.272	0.18
211_A	392_C	1.269	0.18
111_S	157_G	1.269	0.18
302_D	411_R	1.267	0.18
275_T	285_F	1.265	0.18
76_H	118_F	1.262	0.18
132_E	368_Y	1.258	0.18
364_G	369_A	1.250	0.18
19_P	65_L	1.250	0.18
323_R	447_V	1.249	0.18
52_F	137_M	1.246	0.18
32_E	36_A	1.242	0.18
287_V	313_G	1.241	0.18
221_P	377_L	1.239	0.18
65_L	291_F	1.234	0.18
16_A	195_A	1.233	0.18
187_I	480_A	1.232	0.18
273_A	451_D	1.232	0.18
295_Y	321_E	1.230	0.18
293_Y	429_N	1.226	0.18
270_E	487_E	1.225	0.17
144_L	203_Y	1.221	0.17
271_R	274_A	1.219	0.17
50_W	291_F	1.216	0.17
82_V	236_V	1.216	0.17
144_L	448_E	1.215	0.17
48_Q	63_K	1.211	0.17
58_D	362_H	1.208	0.17
221_P	224_N	1.208	0.17
5_P	8_M	1.208	0.17
64_K	224_N	1.203	0.17
157_G	285_F	1.202	0.17
82_V	142_D	1.194	0.17
251_D	333_D	1.194	0.17
138_V	395_T	1.190	0.17
28_E	173_V	1.190	0.17
137_M	491_L	1.190	0.17
216_L	241_L	1.190	0.17
48_Q	98_A	1.189	0.17
232_L	386_S	1.181	0.17
4_V	7_L	1.177	0.17
327_V	375_N	1.175	0.17
348_R	355_D	1.171	0.17
35_E	367_G	1.167	0.17
464_D	484_G	1.162	0.16
58_D	356_R	1.161	0.16
243_E	339_V	1.158	0.16
16_A	482_R	1.158	0.16
73_F	362_H	1.157	0.16
301_R	353_V	1.150	0.16
19_P	50_W	1.147	0.16
299_T	302_D	1.144	0.16
155_V	406_D	1.139	0.16
334_A	400_H	1.138	0.16
198_D	287_V	1.138	0.16
211_A	251_D	1.136	0.16
317_F	397_L	1.131	0.16
37_Y	58_D	1.128	0.16
140_D	187_I	1.127	0.16
223_L	491_L	1.127	0.16
138_V	383_Y	1.127	0.16
75_D	451_D	1.124	0.16
137_M	384_T	1.119	0.16
383_Y	395_T	1.117	0.16
58_D	64_K	1.117	0.16
80_T	434_D	1.117	0.16
62_V	78_L	1.109	0.16
116_R	385_A	1.104	0.15
52_F	489_Q	1.104	0.15
305_A	309_D	1.103	0.15
32_E	367_G	1.102	0.15
154_F	266_N	1.096	0.15
109_P	225_Y	1.095	0.15
193_M	216_L	1.095	0.15
52_F	59_E	1.094	0.15
110_R	292_K	1.093	0.15
76_H	444_A	1.090	0.15
115_A	238_L	1.090	0.15
9_S	129_P	1.089	0.15
252_V	426_R	1.086	0.15
40_Y	46_D	1.084	0.15
80_T	201_R	1.083	0.15
342_I	414_F	1.082	0.15
30_E	155_V	1.077	0.15
84_L	380_A	1.073	0.15
131_F	235_K	1.073	0.15
37_Y	42_H	1.072	0.15
278_A	414_F	1.066	0.15
278_A	420_H	1.066	0.15
198_D	302_D	1.066	0.15
38_Y	43_L	1.061	0.15
221_P	366_F	1.061	0.15
202_E	348_R	1.058	0.15
138_V	339_V	1.058	0.15
56_E	137_M	1.056	0.15
65_L	362_H	1.051	0.15
39_V	479_S	1.047	0.15
248_T	267_L	1.038	0.14
101_L	481_I	1.036	0.14
110_R	172_W	1.023	0.14
228_L	410_V	1.020	0.14
101_L	490_F	1.019	0.14
58_D	129_P	1.017	0.14
132_E	370_R	1.017	0.14
63_K	91_P	1.016	0.14
142_D	305_A	1.015	0.14
73_F	356_R	1.011	0.14
27_I	144_L	1.007	0.14
234_N	261_A	1.007	0.14
46_D	415_P	1.007	0.14
332_A	413_A	1.006	0.14
50_W	362_H	1.003	0.14
4_V	252_V	1.002	0.14
253_H	385_A	1.002	0.14
287_V	450_V	1.001	0.14
116_R	270_E	1.000	0.14
291_F	362_H	0.997	0.14
32_E	269_P	0.996	0.14
92_D	143_Q	0.995	0.14
241_L	491_L	0.995	0.14
273_A	310_A	0.991	0.14
9_S	103_E	0.989	0.14
46_D	183_V	0.988	0.14
279_Y	384_T	0.987	0.14
31_D	64_K	0.979	0.14
131_F	291_F	0.977	0.14
133_V	183_V	0.975	0.14
50_W	73_F	0.964	0.13
28_E	223_L	0.963	0.13
356_R	362_H	0.962	0.13
210_D	249_G	0.959	0.13
222_A	354_P	0.958	0.13
222_A	393_P	0.958	0.13
354_P	393_P	0.958	0.13
384_T	433_T	0.958	0.13
58_D	217_A	0.956	0.13
50_W	61_A	0.955	0.13
4_V	184_I	0.953	0.13
155_V	225_Y	0.950	0.13
159_A	462_T	0.949	0.13
410_V	420_H	0.946	0.13
235_K	362_H	0.945	0.13
45_C	285_F	0.940	0.13
292_K	360_K	0.935	0.13
65_L	356_R	0.935	0.13
385_A	491_L	0.932	0.13
392_C	432_C	0.931	0.13
144_L	273_A	0.928	0.13
16_A	433_T	0.927	0.13
320_D	324_A	0.924	0.13
103_E	151_Y	0.923	0.13
149_E	384_T	0.922	0.13
267_L	287_V	0.921	0.13
50_W	151_Y	0.918	0.13
228_L	396_L	0.916	0.13
140_D	160_D	0.915	0.13
151_Y	362_H	0.912	0.13
141_A	201_R	0.911	0.13
49_M	286_T	0.911	0.13
143_Q	332_A	0.909	0.13
286_T	335_Y	0.908	0.13
37_Y	65_L	0.907	0.13
434_D	485_A	0.906	0.13
200_V	328_I	0.902	0.13
100_I	154_F	0.901	0.13
115_A	118_F	0.897	0.12
104_I	212_V	0.897	0.12
193_M	319_I	0.896	0.12
189_E	375_N	0.895	0.12
83_R	290_A	0.894	0.12
21_F	490_F	0.891	0.12
73_F	291_F	0.891	0.12
29_G	103_E	0.889	0.12
224_N	343_A	0.887	0.12
47_E	53_E	0.886	0.12
47_E	51_D	0.886	0.12
47_E	54_G	0.886	0.12
47_E	55_K	0.886	0.12
51_D	55_K	0.886	0.12
51_D	54_G	0.886	0.12
429_N	458_H	0.886	0.12
225_Y	285_F	0.885	0.12
73_F	134_I	0.883	0.12
315_P	349_L	0.882	0.12
218_R	458_H	0.881	0.12
99_K	109_P	0.881	0.12
20_F	490_F	0.881	0.12
196_A	340_D	0.881	0.12
427_Y	477_L	0.880	0.12
31_D	62_V	0.879	0.12
449_R	464_D	0.873	0.12
385_A	484_G	0.868	0.12
196_A	333_D	0.865	0.12
326_A	330_R	0.864	0.12
4_V	211_A	0.864	0.12
200_V	396_L	0.861	0.12
48_Q	56_E	0.860	0.12
56_E	98_A	0.860	0.12
62_V	361_L	0.857	0.12
65_L	76_H	0.857	0.12
9_S	15_N	0.852	0.12
349_L	392_C	0.850	0.12
141_A	322_A	0.850	0.12
252_V	434_D	0.849	0.12
65_L	269_P	0.846	0.12
231_D	420_H	0.845	0.12
280_S	416_A	0.843	0.12
335_Y	491_L	0.841	0.12
363_V	366_F	0.839	0.12
214_V	335_Y	0.837	0.12
83_R	308_R	0.837	0.12
58_D	131_F	0.834	0.12
211_A	253_H	0.834	0.12
206_A	212_V	0.833	0.12
152_E	425_A	0.832	0.12
205_T	315_P	0.832	0.12
251_D	352_Y	0.828	0.12
40_Y	313_G	0.828	0.12
102_L	268_T	0.827	0.12
37_Y	290_A	0.826	0.12
230_A	366_F	0.825	0.12
420_H	449_R	0.822	0.12
33_I	202_E	0.822	0.12
488_R	491_L	0.822	0.12
302_D	372_V	0.821	0.12
252_V	293_Y	0.821	0.12
440_D	450_V	0.819	0.11
33_I	93_V	0.818	0.11
72_F	397_L	0.818	0.11
174_G	178_P	0.817	0.11
307_L	483_R	0.816	0.11
183_V	324_A	0.816	0.11
58_D	134_I	0.816	0.11
198_D	392_C	0.815	0.11
83_R	271_R	0.814	0.11
194_L	434_D	0.814	0.11
228_L	421_L	0.813	0.11
45_C	229_A	0.812	0.11
246_E	273_A	0.811	0.11
298_E	320_D	0.811	0.11
57_G	65_L	0.811	0.11
401_A	427_Y	0.809	0.11
96_S	223_L	0.808	0.11
61_A	278_A	0.808	0.11
37_Y	50_W	0.806	0.11
151_Y	291_F	0.804	0.11
189_E	244_M	0.804	0.11
65_L	300_V	0.803	0.11
269_P	367_G	0.802	0.11
10_T	15_N	0.800	0.11
29_G	178_P	0.799	0.11
325_L	468_A	0.798	0.11
318_P	386_S	0.798	0.11
65_L	134_I	0.797	0.11
74_A	121_E	0.797	0.11
49_M	215_F	0.794	0.11
232_L	263_F	0.793	0.11
121_E	341_A	0.793	0.11
187_I	196_A	0.791	0.11
347_N	377_L	0.789	0.11
395_T	414_F	0.789	0.11
21_F	340_D	0.787	0.11
50_W	84_L	0.787	0.11
328_I	421_L	0.786	0.11
413_A	425_A	0.786	0.11
131_F	217_A	0.785	0.11
23_A	324_A	0.783	0.11
326_A	345_T	0.782	0.11
72_F	267_L	0.779	0.11
273_A	298_E	0.778	0.11
34_Q	273_A	0.776	0.11
98_A	176_F	0.776	0.11
302_D	309_D	0.775	0.11
218_R	229_A	0.775	0.11
200_V	455_N	0.775	0.11
246_E	250_V	0.774	0.11
324_A	409_F	0.774	0.11
67_S	433_T	0.773	0.11
269_P	356_R	0.771	0.11
339_V	472_G	0.770	0.11
86_V	100_I	0.769	0.11
64_K	361_L	0.769	0.11
266_N	436_L	0.769	0.11
178_P	360_K	0.767	0.11
295_Y	444_A	0.767	0.11
64_K	366_F	0.766	0.11
74_A	299_T	0.764	0.11
212_V	417_Y	0.763	0.11
9_S	360_K	0.762	0.11
68_R	346_V	0.760	0.11
5_P	14_D	0.759	0.11
5_P	11_Q	0.759	0.11
5_P	13_P	0.759	0.11
5_P	12_H	0.759	0.11
38_Y	238_L	0.757	0.11
131_F	269_P	0.757	0.11
182_T	337_D	0.757	0.11
113_D	178_P	0.755	0.11
244_M	248_T	0.752	0.11
19_P	356_R	0.751	0.11
300_V	356_R	0.750	0.11
221_P	347_N	0.749	0.11
422_A	477_L	0.748	0.11
73_F	235_K	0.745	0.11
301_R	350_S	0.745	0.11
50_W	217_A	0.745	0.11
309_D	411_R	0.745	0.11
296_P	325_L	0.742	0.11
73_F	131_F	0.742	0.11
84_L	448_E	0.739	0.11
245_S	352_Y	0.738	0.11
248_T	468_A	0.737	0.11
347_N	365_L	0.734	0.10
62_V	217_A	0.733	0.10
91_P	97_E	0.733	0.10
244_M	252_V	0.731	0.10
212_V	338_Q	0.731	0.10
233_I	266_N	0.731	0.10
270_E	299_T	0.731	0.10
246_E	251_D	0.729	0.10
21_F	48_Q	0.725	0.10
95_G	384_T	0.723	0.10
327_V	489_Q	0.718	0.10
197_D	422_A	0.717	0.10
230_A	458_H	0.717	0.10
151_Y	225_Y	0.715	0.10
190_R	331_T	0.714	0.10
67_S	267_L	0.713	0.10
93_V	137_M	0.712	0.10
193_M	285_F	0.711	0.10
64_K	130_I	0.711	0.10
106_E	111_S	0.709	0.10
121_E	441_D	0.709	0.10
76_H	319_I	0.708	0.10
235_K	364_G	0.708	0.10
20_F	137_M	0.707	0.10
58_D	62_V	0.706	0.10
329_D	456_S	0.706	0.10
16_A	207_H	0.706	0.10
19_P	73_F	0.704	0.10
242_Y	386_S	0.703	0.10
193_M	230_A	0.701	0.10
281_E	404_D	0.700	0.10
151_Y	360_K	0.699	0.10
21_F	216_L	0.696	0.10
291_F	356_R	0.695	0.10
321_E	325_L	0.694	0.10
269_P	291_F	0.694	0.10
183_V	375_N	0.693	0.10
103_E	292_K	0.693	0.10
114_A	233_I	0.692	0.10
201_R	247_A	0.691	0.10
69_Y	424_A	0.690	0.10
287_V	472_G	0.690	0.10
80_T	98_A	0.689	0.10
25_D	478_R	0.689	0.10
203_Y	236_V	0.689	0.10
355_D	384_T	0.688	0.10
218_R	279_Y	0.688	0.10
88_G	114_A	0.685	0.10
105_L	490_F	0.685	0.10
463_D	467_D	0.683	0.10
343_A	366_F	0.683	0.10
52_F	93_V	0.679	0.10
298_E	326_A	0.678	0.10
29_G	38_Y	0.678	0.10
245_S	251_D	0.677	0.10
52_F	149_E	0.676	0.10
242_Y	390_V	0.675	0.10
326_A	397_L	0.674	0.10
65_L	129_P	0.673	0.10
149_E	351_S	0.669	0.10
256_L	392_C	0.669	0.10
86_V	192_A	0.667	0.10
293_Y	349_L	0.662	0.10
58_D	151_Y	0.662	0.10
63_K	102_L	0.660	0.10
305_A	369_A	0.658	0.10
40_Y	74_A	0.657	0.10
230_A	258_A	0.656	0.10
368_Y	395_T	0.655	0.10
28_E	242_Y	0.654	0.10
450_V	468_A	0.654	0.10
206_A	349_L	0.654	0.10
313_G	321_E	0.654	0.10
455_N	481_I	0.654	0.10
73_F	129_P	0.651	0.10
16_A	465_A	0.648	0.10
196_A	431_R	0.648	0.10
38_Y	292_K	0.647	0.10
21_F	27_I	0.646	0.10
64_K	69_Y	0.645	0.10
27_I	410_V	0.645	0.10
144_L	469_L	0.644	0.10
149_E	160_D	0.644	0.10
317_F	485_A	0.644	0.10
217_A	223_L	0.643	0.10
272_A	349_L	0.642	0.09
406_D	417_Y	0.642	0.09
64_K	113_D	0.641	0.09
91_P	147_V	0.641	0.09
189_E	192_A	0.641	0.09
40_Y	308_R	0.640	0.09
48_Q	176_F	0.638	0.09
273_A	306_T	0.637	0.09
151_Y	356_R	0.636	0.09
29_G	174_G	0.636	0.09
172_W	176_F	0.634	0.09
283_E	349_L	0.634	0.09
210_D	418_F	0.632	0.09
332_A	344_G	0.630	0.09
371_E	431_R	0.629	0.09
104_I	112_F	0.629	0.09
64_K	356_R	0.628	0.09
21_F	101_L	0.628	0.09
31_D	65_L	0.626	0.09
283_E	312_L	0.626	0.09
58_D	300_V	0.625	0.09
192_A	478_R	0.623	0.09
61_A	131_F	0.623	0.09
313_G	385_A	0.622	0.09
292_K	312_L	0.620	0.09
212_V	272_A	0.620	0.09
266_N	296_P	0.619	0.09
355_D	470_Q	0.618	0.09
20_F	48_Q	0.617	0.09
64_K	178_P	0.615	0.09
99_K	178_P	0.615	0.09
121_E	451_D	0.614	0.09
19_P	362_H	0.613	0.09
131_F	211_A	0.613	0.09
327_V	445_A	0.613	0.09
131_F	362_H	0.612	0.09
231_D	431_R	0.611	0.09
135_V	346_V	0.610	0.09
301_R	417_Y	0.610	0.09
64_K	91_P	0.610	0.09
22_T	96_S	0.607	0.09
72_F	78_L	0.604	0.09
130_I	225_Y	0.604	0.09
240_R	243_E	0.604	0.09
129_P	292_K	0.602	0.09
174_G	194_L	0.602	0.09
333_D	444_A	0.602	0.09
77_Q	485_A	0.602	0.09
103_E	113_D	0.601	0.09
45_C	301_R	0.601	0.09
118_F	485_A	0.600	0.09
48_Q	110_R	0.600	0.09
193_M	234_N	0.599	0.09
326_A	417_Y	0.598	0.09
323_R	408_A	0.598	0.09
142_D	441_D	0.597	0.09
45_C	243_E	0.597	0.09
201_R	390_V	0.596	0.09
39_V	155_V	0.596	0.09
231_D	387_L	0.594	0.09
109_P	157_G	0.594	0.09
4_V	313_G	0.591	0.09
141_A	307_L	0.591	0.09
115_A	203_Y	0.590	0.09
240_R	413_A	0.588	0.09
151_Y	174_G	0.588	0.09
6_R	29_G	0.587	0.09
433_T	436_L	0.587	0.09
358_A	485_A	0.585	0.09
253_H	272_A	0.583	0.09
36_A	46_D	0.580	0.09
350_S	421_L	0.578	0.09
33_I	338_Q	0.578	0.09
198_D	451_D	0.577	0.09
33_I	147_V	0.577	0.09
73_F	217_A	0.577	0.09
276_A	475_D	0.577	0.09
8_M	410_V	0.577	0.09
67_S	450_V	0.575	0.09
137_M	161_E	0.575	0.09
7_L	337_D	0.575	0.09
368_Y	398_G	0.574	0.09
421_L	441_D	0.572	0.09
140_D	304_V	0.572	0.09
152_E	457_E	0.572	0.09
151_Y	178_P	0.570	0.09
194_L	274_A	0.567	0.09
93_V	396_L	0.567	0.09
306_T	487_E	0.564	0.09
232_L	324_A	0.563	0.09
420_H	487_E	0.563	0.09
99_K	224_N	0.562	0.09
96_S	331_T	0.562	0.09
65_L	217_A	0.560	0.09
74_A	251_D	0.560	0.09
423_D	482_R	0.559	0.09
411_R	418_F	0.559	0.09
224_N	360_K	0.559	0.09
318_P	434_D	0.558	0.09
189_E	232_L	0.558	0.09
249_G	431_R	0.557	0.09
132_E	395_T	0.557	0.09
80_T	108_I	0.556	0.09
453_T	456_S	0.556	0.09
56_E	101_L	0.556	0.09
370_R	395_T	0.554	0.09
307_L	411_R	0.551	0.09
151_Y	361_L	0.549	0.09
395_T	420_H	0.547	0.09
418_F	468_A	0.547	0.09
19_P	32_E	0.547	0.09
485_A	492_G	0.546	0.09
485_A	488_R	0.546	0.09
29_G	99_K	0.546	0.09
319_I	445_A	0.546	0.09
39_V	301_R	0.545	0.09
101_L	137_M	0.543	0.09
154_F	358_A	0.542	0.09
247_A	324_A	0.541	0.08
214_V	237_A	0.541	0.08
15_N	129_P	0.540	0.08
86_V	137_M	0.536	0.08
313_G	353_V	0.535	0.08
43_L	187_I	0.535	0.08
212_V	287_V	0.535	0.08
56_E	103_E	0.532	0.08
336_A	420_H	0.531	0.08
65_L	151_Y	0.530	0.08
99_K	370_R	0.530	0.08
152_E	183_V	0.530	0.08
92_D	140_D	0.530	0.08
210_D	290_A	0.529	0.08
375_N	392_C	0.529	0.08
154_F	196_A	0.528	0.08
101_L	456_S	0.528	0.08
310_A	471_R	0.526	0.08
305_A	396_L	0.525	0.08
429_N	462_T	0.523	0.08
211_A	231_D	0.517	0.08
248_T	373_G	0.516	0.08
247_A	442_T	0.516	0.08
157_G	330_R	0.515	0.08
410_V	457_E	0.515	0.08
200_V	355_D	0.512	0.08
90_N	303_G	0.511	0.08
42_H	154_F	0.511	0.08
365_L	377_L	0.511	0.08
155_V	348_R	0.511	0.08
263_F	354_P	0.510	0.08
263_F	393_P	0.510	0.08
222_A	263_F	0.510	0.08
58_D	76_H	0.510	0.08
250_V	346_V	0.509	0.08
103_E	366_F	0.509	0.08
145_N	324_A	0.507	0.08
145_N	209_Q	0.506	0.08
129_P	291_F	0.506	0.08
224_N	377_L	0.506	0.08
205_T	333_D	0.504	0.08
56_E	63_K	0.504	0.08
90_N	363_V	0.504	0.08
105_L	397_L	0.503	0.08
146_A	490_F	0.502	0.08
206_A	444_A	0.501	0.08
144_L	304_V	0.501	0.08
86_V	384_T	0.501	0.08
481_I	490_F	0.500	0.08
315_P	451_D	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3odmA	6	0.9309	100	0.449	Contact Map
1jqnA	3	0.811	100	0.792	Contact Map
4bxhA	3	0.872	100	0.793	Contact Map
4roqA	5	0.565	97.6	0.962	Contact Map
3qllA	3	0.4106	97.4	0.963	Contact Map
1u5hA	3	0.4126	97.3	0.964	Contact Map
3qz6A	5	0.5102	96.8	0.967	Contact Map
4l9zA	5	0.5549	96.8	0.967	Contact Map
3r4iA	5	0.5854	96.7	0.967	Contact Map
4l80A	5	0.5955	96.7	0.967	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0132 seconds.