Q9HMY2 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HMY2 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HMY2	Sequences: MDTDGPPVPALAERAAACADALRDADSVLVASHIDADGLTSAGIASTALERAAIPHEVVFSKQLDDEEIADIAGANHGTVLFTDFGSGQLDAITAHERAGEFTPVIADHHQPAENAATDYHLNPLLEGVDGGTELSGAGATYVLARALLGTDATDLAALAVVGAVGDRQTVDGELVGANTRVAADGVEAGVLDTATGLALYGTQTRPLPRLLEYASELYIPGITNDHQGAIRFLDALDVDLHDGGDWRTWASLDHDERRTVVSALVKRAVRTGVPSAEVTTLVGTTYTLTDEEPGTALRDASEFATLLNATARYERADVGLAVCMGDRGDALERARSLREEHRQTLSEGVSWVTREGVTVEDDLQWFHADDRIRETIVGIVAGMALSGDETENDRPIVAFAAKDDEPAVKVSARATARVVDAGVDLAVVVREAAAAAGGDGGGHEAAAGATVPAGNERAFLDAASGVLAAQRGGD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	475 (442)
Sequences:	220 (168)
Seq/√Len:	8.0

HALSA - Q9HMY2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
415_A	424_V	5.165	1.00
32_S	42_A	4.556	0.99
51_R	155_D	4.409	0.99
212_L	223_I	3.706	0.96
223_I	230_A	3.512	0.94
30_V	46_S	3.478	0.94
186_G	456_N	3.461	0.94
456_N	459_A	3.449	0.94
429_V	467_V	3.416	0.93
142_Y	185_D	3.336	0.92
121_H	126_L	3.037	0.88
368_H	457_E	2.967	0.87
292_E	328_R	2.836	0.84
433_A	437_A	2.723	0.82
363_D	469_A	2.634	0.79
197_G	339_R	2.507	0.76
138_A	163_G	2.487	0.75
48_A	145_A	2.400	0.72
169_Q	179_N	2.390	0.72
135_L	139_G	2.372	0.71
429_V	464_A	2.350	0.71
202_G	206_R	2.325	0.70
39_L	317_A	2.322	0.70
423_G	471_Q	2.292	0.69
45_A	81_L	2.275	0.68
141_T	434_A	2.274	0.68
139_G	182_V	2.233	0.67
157_A	182_V	2.232	0.66
300_D	343_R	2.180	0.65
424_V	468_L	2.168	0.64
197_G	258_R	2.103	0.62
220_I	319_V	2.096	0.61
429_V	471_Q	2.052	0.60
142_Y	146_R	2.012	0.58
360_V	392_E	2.010	0.58
303_E	306_T	2.005	0.58
378_V	384_M	2.000	0.58
422_A	472_R	1.986	0.57
436_A	463_A	1.952	0.56
237_L	260_T	1.923	0.54
51_R	153_A	1.918	0.54
292_E	299_R	1.906	0.54
137_G	367_F	1.887	0.53
218_L	225_N	1.880	0.53
364_L	424_V	1.843	0.51
48_A	148_L	1.841	0.51
411_V	450_A	1.838	0.51
320_G	324_C	1.833	0.51
105_V	264_A	1.821	0.50
41_S	141_T	1.818	0.50
82_F	93_I	1.785	0.49
88_G	309_N	1.776	0.48
159_L	324_C	1.757	0.48
80_V	289_L	1.740	0.47
264_A	456_N	1.738	0.47
312_A	321_L	1.699	0.45
203_T	416_T	1.693	0.45
45_A	83_T	1.685	0.45
162_V	308_L	1.681	0.45
202_G	306_T	1.651	0.43
161_V	298_L	1.634	0.43
11_L	127_E	1.621	0.42
39_L	324_C	1.604	0.41
207_P	323_V	1.602	0.41
426_L	448_A	1.600	0.41
20_D	436_A	1.598	0.41
29_L	57_E	1.598	0.41
83_T	319_V	1.596	0.41
88_G	323_V	1.594	0.41
178_A	190_G	1.577	0.40
298_L	326_G	1.571	0.40
207_P	343_R	1.569	0.40
143_V	392_E	1.568	0.40
39_L	465_S	1.567	0.40
342_H	384_M	1.544	0.39
64_L	233_F	1.538	0.39
58_V	421_D	1.533	0.39
32_S	178_A	1.525	0.38
106_I	266_V	1.525	0.38
82_F	136_S	1.525	0.38
404_D	461_L	1.523	0.38
412_S	444_H	1.511	0.38
412_S	443_G	1.511	0.38
412_S	442_G	1.511	0.38
414_R	444_H	1.511	0.38
414_R	443_G	1.511	0.38
414_R	442_G	1.511	0.38
396_P	423_G	1.504	0.38
46_S	56_H	1.504	0.38
132_G	300_D	1.502	0.37
183_A	240_D	1.500	0.37
162_V	310_A	1.495	0.37
420_V	446_A	1.493	0.37
34_I	313_R	1.492	0.37
184_A	188_E	1.489	0.37
22_L	61_S	1.488	0.37
309_N	313_R	1.485	0.37
202_G	401_A	1.480	0.37
39_L	43_G	1.477	0.36
279_V	312_A	1.467	0.36
89_Q	201_Y	1.466	0.36
155_D	396_P	1.457	0.36
159_L	335_A	1.457	0.36
61_S	68_E	1.449	0.35
180_T	285_T	1.447	0.35
362_D	381_V	1.436	0.35
54_I	157_A	1.426	0.35
202_G	303_E	1.419	0.34
78_G	340_E	1.416	0.34
146_R	151_T	1.395	0.33
36_A	335_A	1.395	0.33
299_R	310_A	1.393	0.33
145_A	155_D	1.377	0.33
121_H	320_G	1.373	0.33
213_E	230_A	1.370	0.33
93_I	452_V	1.370	0.33
237_L	432_E	1.369	0.33
106_I	228_Q	1.364	0.32
69_I	161_V	1.358	0.32
424_V	427_A	1.353	0.32
112_P	124_P	1.343	0.32
305_A	468_L	1.335	0.31
137_G	142_Y	1.327	0.31
22_L	81_L	1.325	0.31
112_P	132_G	1.320	0.31
446_A	465_S	1.312	0.30
192_L	238_D	1.312	0.30
237_L	319_V	1.310	0.30
48_A	52_A	1.301	0.30
69_I	304_F	1.298	0.30
130_D	315_E	1.296	0.30
39_L	300_D	1.288	0.30
28_V	54_I	1.286	0.30
39_L	146_R	1.281	0.29
233_F	264_A	1.281	0.29
144_L	302_S	1.262	0.29
105_V	432_E	1.259	0.29
265_L	275_P	1.256	0.29
107_A	137_G	1.252	0.28
112_P	346_L	1.251	0.28
12_A	452_V	1.251	0.28
31_A	162_V	1.247	0.28
42_A	121_H	1.243	0.28
129_V	353_V	1.240	0.28
137_G	173_G	1.237	0.28
18_C	122_L	1.222	0.27
415_A	419_V	1.220	0.27
339_R	365_Q	1.217	0.27
207_P	303_E	1.216	0.27
188_E	452_V	1.216	0.27
212_L	343_R	1.215	0.27
300_D	401_A	1.215	0.27
322_A	358_V	1.209	0.27
446_A	471_Q	1.200	0.27
360_V	395_R	1.198	0.27
43_G	106_I	1.196	0.27
423_G	446_A	1.189	0.26
162_V	320_G	1.182	0.26
45_A	107_A	1.179	0.26
16_A	470_A	1.179	0.26
308_L	312_A	1.166	0.26
137_G	342_H	1.149	0.25
153_A	327_D	1.148	0.25
316_R	319_V	1.145	0.25
15_A	252_S	1.144	0.25
135_L	142_Y	1.141	0.25
363_D	465_S	1.139	0.25
29_L	59_V	1.137	0.25
55_P	119_D	1.136	0.25
420_V	471_Q	1.136	0.25
278_E	334_R	1.134	0.25
200_L	464_A	1.134	0.25
252_S	383_G	1.132	0.25
404_D	466_G	1.128	0.24
365_Q	397_I	1.127	0.24
430_V	464_A	1.119	0.24
186_G	417_A	1.119	0.24
299_R	328_R	1.118	0.24
367_F	383_G	1.117	0.24
212_L	238_D	1.115	0.24
130_D	445_E	1.112	0.24
33_H	37_D	1.106	0.24
144_L	420_V	1.105	0.24
164_A	169_Q	1.095	0.24
48_A	153_A	1.095	0.24
207_P	306_T	1.093	0.23
419_V	424_V	1.091	0.23
226_D	392_E	1.085	0.23
212_L	292_E	1.083	0.23
128_G	438_G	1.078	0.23
465_S	469_A	1.077	0.23
49_L	131_G	1.070	0.23
165_V	319_V	1.069	0.23
206_R	401_A	1.063	0.23
177_G	326_G	1.061	0.23
364_L	468_L	1.058	0.22
208_L	459_A	1.056	0.22
135_L	152_D	1.054	0.22
289_L	292_E	1.053	0.22
252_S	369_A	1.053	0.22
301_A	424_V	1.047	0.22
205_T	306_T	1.043	0.22
134_E	364_L	1.038	0.22
15_A	112_P	1.036	0.22
412_S	441_G	1.029	0.22
414_R	441_G	1.029	0.22
441_G	444_H	1.029	0.22
206_R	378_V	1.027	0.22
157_A	189_A	1.024	0.21
224_T	417_A	1.024	0.21
426_L	439_G	1.023	0.21
177_G	310_A	1.023	0.21
208_L	212_L	1.023	0.21
88_G	303_E	1.021	0.21
364_L	461_L	1.008	0.21
413_A	426_L	1.005	0.21
416_T	429_V	1.004	0.21
439_G	460_F	1.003	0.21
227_H	230_A	1.003	0.21
236_A	270_V	1.002	0.21
378_V	382_A	1.001	0.21
261_V	431_R	0.996	0.21
168_R	208_L	0.994	0.21
35_D	38_G	0.993	0.21
32_S	280_T	0.993	0.21
201_Y	401_A	0.991	0.21
143_V	256_D	0.990	0.21
58_V	130_D	0.987	0.20
60_F	384_M	0.984	0.20
120_Y	430_V	0.984	0.20
49_L	54_I	0.984	0.20
364_L	465_S	0.982	0.20
164_A	303_E	0.982	0.20
334_R	346_L	0.979	0.20
139_G	311_T	0.977	0.20
328_R	343_R	0.976	0.20
157_A	191_V	0.975	0.20
124_P	179_N	0.971	0.20
207_P	287_Y	0.967	0.20
54_I	191_V	0.966	0.20
197_G	377_I	0.965	0.20
148_L	153_A	0.961	0.20
106_I	214_Y	0.960	0.20
362_D	465_S	0.959	0.20
177_G	395_R	0.957	0.20
428_V	431_R	0.956	0.20
134_E	286_T	0.956	0.20
306_T	384_M	0.955	0.20
136_S	310_A	0.954	0.20
36_A	163_G	0.953	0.20
22_L	208_L	0.950	0.20
34_I	60_F	0.950	0.20
60_F	83_T	0.944	0.19
82_F	106_I	0.944	0.19
43_G	405_D	0.943	0.19
87_S	112_P	0.934	0.19
44_I	145_A	0.930	0.19
111_Q	425_D	0.926	0.19
73_A	311_T	0.925	0.19
15_A	19_A	0.922	0.19
207_P	328_R	0.922	0.19
200_L	402_A	0.921	0.19
158_A	185_D	0.919	0.19
404_D	459_A	0.919	0.19
334_R	452_V	0.918	0.19
137_G	311_T	0.912	0.19
206_R	303_E	0.911	0.19
362_D	466_G	0.907	0.18
29_L	87_S	0.903	0.18
365_Q	383_G	0.902	0.18
308_L	423_G	0.898	0.18
58_V	321_L	0.897	0.18
265_L	457_E	0.897	0.18
462_D	466_G	0.894	0.18
190_G	324_C	0.893	0.18
31_A	308_L	0.892	0.18
160_A	309_N	0.890	0.18
303_E	326_G	0.890	0.18
140_A	429_V	0.889	0.18
252_S	462_D	0.889	0.18
22_L	45_A	0.887	0.18
432_E	461_L	0.886	0.18
415_A	468_L	0.886	0.18
22_L	261_V	0.886	0.18
81_L	138_A	0.885	0.18
51_R	145_A	0.882	0.18
410_K	447_A	0.882	0.18
24_D	189_A	0.879	0.18
296_T	304_F	0.878	0.18
412_S	449_G	0.878	0.18
443_G	449_G	0.878	0.18
442_G	449_G	0.878	0.18
444_H	449_G	0.878	0.18
414_R	449_G	0.878	0.18
49_L	91_D	0.874	0.18
24_D	188_E	0.869	0.17
30_V	418_R	0.868	0.17
22_L	361_E	0.864	0.17
323_V	335_A	0.862	0.17
121_H	200_L	0.862	0.17
85_F	313_R	0.861	0.17
138_A	161_V	0.861	0.17
57_E	218_L	0.860	0.17
129_V	192_L	0.860	0.17
60_F	397_I	0.859	0.17
431_R	455_G	0.857	0.17
164_A	183_A	0.856	0.17
395_R	436_A	0.855	0.17
463_A	466_G	0.855	0.17
212_L	320_G	0.855	0.17
165_V	384_M	0.853	0.17
61_S	72_I	0.853	0.17
26_D	239_V	0.850	0.17
299_R	339_R	0.850	0.17
83_T	159_L	0.848	0.17
224_T	395_R	0.848	0.17
33_H	441_G	0.847	0.17
200_L	413_A	0.846	0.17
226_D	422_A	0.845	0.17
17_A	143_V	0.845	0.17
63_Q	313_R	0.844	0.17
30_V	43_G	0.842	0.17
253_L	455_G	0.841	0.17
127_E	185_D	0.840	0.17
314_Y	345_T	0.838	0.17
297_A	305_A	0.836	0.17
83_T	285_T	0.836	0.17
273_G	320_G	0.835	0.17
60_F	342_H	0.835	0.17
338_L	346_L	0.834	0.17
64_L	415_A	0.834	0.17
11_L	130_D	0.833	0.17
124_P	413_A	0.827	0.17
81_L	213_E	0.825	0.16
145_A	156_L	0.825	0.16
69_I	266_V	0.825	0.16
396_P	438_G	0.824	0.16
106_I	243_D	0.823	0.16
179_N	441_G	0.823	0.16
142_Y	252_S	0.821	0.16
156_L	396_P	0.816	0.16
183_A	230_A	0.813	0.16
82_F	210_R	0.813	0.16
62_K	380_I	0.812	0.16
85_F	125_L	0.812	0.16
69_I	413_A	0.812	0.16
361_E	366_W	0.810	0.16
146_R	472_R	0.807	0.16
193_D	230_A	0.807	0.16
183_A	452_V	0.806	0.16
162_V	324_C	0.806	0.16
280_T	358_V	0.803	0.16
22_L	28_V	0.802	0.16
139_G	160_A	0.801	0.16
170_T	203_T	0.798	0.16
79_T	366_W	0.798	0.16
264_A	446_A	0.797	0.16
285_T	319_V	0.796	0.16
175_L	384_M	0.796	0.16
21_A	215_A	0.795	0.16
334_R	461_L	0.794	0.16
16_A	277_A	0.792	0.16
137_G	266_V	0.791	0.16
85_F	202_G	0.791	0.16
208_L	213_E	0.789	0.16
422_A	434_A	0.785	0.16
203_T	267_K	0.784	0.16
45_A	214_Y	0.784	0.16
52_A	140_A	0.784	0.16
160_A	164_A	0.783	0.16
60_F	314_Y	0.782	0.16
33_H	38_G	0.779	0.15
267_K	431_R	0.778	0.15
35_D	44_I	0.775	0.15
134_E	472_R	0.772	0.15
300_D	433_A	0.769	0.15
304_F	328_R	0.767	0.15
395_R	458_R	0.765	0.15
277_A	432_E	0.764	0.15
12_A	402_A	0.764	0.15
222_G	365_Q	0.763	0.15
208_L	257_E	0.763	0.15
234_L	379_G	0.763	0.15
59_V	66_D	0.759	0.15
201_Y	225_N	0.755	0.15
88_G	139_G	0.753	0.15
219_Y	351_S	0.753	0.15
324_C	335_A	0.752	0.15
13_E	66_D	0.752	0.15
123_N	179_N	0.751	0.15
309_N	368_H	0.751	0.15
123_N	130_D	0.750	0.15
309_N	410_K	0.746	0.15
107_A	141_T	0.746	0.15
134_E	176_V	0.744	0.15
28_V	369_A	0.742	0.15
301_A	338_L	0.742	0.15
197_G	328_R	0.742	0.15
19_A	23_R	0.741	0.15
367_F	399_A	0.740	0.15
106_I	119_D	0.740	0.15
124_P	166_G	0.740	0.15
120_Y	140_A	0.739	0.15
285_T	366_W	0.738	0.15
122_L	144_L	0.737	0.15
37_D	86_G	0.726	0.14
92_A	261_V	0.726	0.14
36_A	160_A	0.725	0.14
81_L	107_A	0.722	0.14
180_T	435_A	0.719	0.14
60_F	319_V	0.719	0.14
26_D	54_I	0.719	0.14
265_L	427_A	0.718	0.14
449_G	460_F	0.717	0.14
232_R	452_V	0.717	0.14
204_Q	312_A	0.716	0.14
39_L	160_A	0.716	0.14
416_T	446_A	0.716	0.14
346_L	353_V	0.716	0.14
136_S	297_A	0.714	0.14
84_D	167_D	0.713	0.14
84_D	110_H	0.713	0.14
84_D	109_H	0.713	0.14
84_D	108_D	0.713	0.14
109_H	167_D	0.713	0.14
110_H	167_D	0.713	0.14
108_D	167_D	0.713	0.14
419_V	423_G	0.713	0.14
261_V	362_D	0.712	0.14
203_T	373_I	0.711	0.14
175_L	342_H	0.709	0.14
49_L	193_D	0.709	0.14
310_A	320_G	0.706	0.14
145_A	301_A	0.706	0.14
62_K	375_E	0.706	0.14
26_D	432_E	0.706	0.14
106_I	111_Q	0.704	0.14
83_T	311_T	0.704	0.14
34_I	139_G	0.703	0.14
434_A	472_R	0.702	0.14
298_L	328_R	0.702	0.14
23_R	337_S	0.702	0.14
106_I	348_E	0.702	0.14
155_D	327_D	0.700	0.14
94_T	411_V	0.700	0.14
372_R	433_A	0.699	0.14
114_E	220_I	0.699	0.14
139_G	157_A	0.698	0.14
420_V	423_G	0.698	0.14
416_T	423_G	0.697	0.14
22_L	366_W	0.696	0.14
319_V	461_L	0.695	0.14
160_A	308_L	0.693	0.14
313_R	379_G	0.693	0.14
25_A	54_I	0.691	0.14
46_S	225_N	0.690	0.14
36_A	159_L	0.689	0.14
366_W	450_A	0.688	0.14
396_P	429_V	0.688	0.14
30_V	195_A	0.687	0.14
43_G	310_A	0.686	0.14
28_V	458_R	0.683	0.14
122_L	317_A	0.682	0.14
423_G	465_S	0.682	0.14
19_A	80_V	0.682	0.14
327_D	371_D	0.679	0.13
155_D	165_V	0.678	0.13
83_T	339_R	0.677	0.13
314_Y	399_A	0.676	0.13
140_A	234_L	0.675	0.13
43_G	324_C	0.670	0.13
152_D	157_A	0.667	0.13
183_A	366_W	0.666	0.13
71_D	310_A	0.666	0.13
383_G	419_V	0.665	0.13
210_R	297_A	0.664	0.13
138_A	260_T	0.664	0.13
166_G	311_T	0.661	0.13
386_L	402_A	0.658	0.13
34_I	205_T	0.658	0.13
289_L	374_R	0.656	0.13
16_A	398_V	0.656	0.13
31_A	61_S	0.655	0.13
415_A	448_A	0.654	0.13
367_F	430_V	0.653	0.13
462_D	470_A	0.651	0.13
300_D	373_I	0.651	0.13
160_A	426_L	0.651	0.13
279_V	472_R	0.648	0.13
31_A	80_V	0.646	0.13
30_V	464_A	0.646	0.13
300_D	320_G	0.646	0.13
273_G	425_D	0.643	0.13
192_L	425_D	0.642	0.13
448_A	460_F	0.641	0.13
42_A	333_E	0.640	0.13
395_R	446_A	0.640	0.13
44_I	282_L	0.638	0.13
425_D	445_E	0.637	0.13
75_A	79_T	0.637	0.13
242_H	267_K	0.636	0.13
64_L	379_G	0.635	0.13
58_V	141_T	0.634	0.13
164_A	175_L	0.633	0.13
31_A	312_A	0.633	0.13
88_G	292_E	0.629	0.13
22_L	285_T	0.626	0.12
30_V	59_V	0.625	0.12
156_L	169_Q	0.624	0.12
192_L	435_A	0.624	0.12
201_Y	303_E	0.624	0.12
156_L	471_Q	0.622	0.12
145_A	182_V	0.619	0.12
134_E	179_N	0.617	0.12
119_D	188_E	0.617	0.12
59_V	258_R	0.616	0.12
350_V	380_I	0.615	0.12
117_A	435_A	0.615	0.12
138_A	409_V	0.614	0.12
467_V	471_Q	0.613	0.12
69_I	130_D	0.613	0.12
50_E	137_G	0.612	0.12
258_R	328_R	0.611	0.12
151_T	270_V	0.611	0.12
112_P	353_V	0.608	0.12
112_P	221_P	0.607	0.12
135_L	351_S	0.607	0.12
207_P	353_V	0.607	0.12
46_S	148_L	0.607	0.12
426_L	447_A	0.606	0.12
35_D	412_S	0.606	0.12
35_D	442_G	0.606	0.12
35_D	443_G	0.606	0.12
35_D	444_H	0.606	0.12
35_D	414_R	0.606	0.12
285_T	339_R	0.605	0.12
136_S	411_V	0.601	0.12
419_V	472_R	0.601	0.12
111_Q	121_H	0.598	0.12
95_A	256_D	0.597	0.12
28_V	158_A	0.597	0.12
85_F	464_A	0.597	0.12
165_V	214_Y	0.597	0.12
137_G	312_A	0.596	0.12
254_D	257_E	0.595	0.12
145_A	263_S	0.594	0.12
92_A	172_D	0.594	0.12
30_V	168_R	0.593	0.12
214_Y	434_A	0.592	0.12
250_W	376_T	0.591	0.12
93_I	374_R	0.589	0.12
182_V	264_A	0.588	0.12
52_A	157_A	0.588	0.12
361_E	461_L	0.587	0.12
466_G	470_A	0.585	0.12
239_V	432_E	0.581	0.12
76_N	223_I	0.578	0.12
90_L	399_A	0.576	0.12
130_D	370_D	0.575	0.12
56_H	262_V	0.575	0.12
136_S	320_G	0.572	0.12
111_Q	190_G	0.569	0.11
57_E	304_F	0.568	0.11
183_A	385_A	0.567	0.11
208_L	347_S	0.567	0.11
337_S	434_A	0.567	0.11
104_P	210_R	0.567	0.11
342_H	346_L	0.566	0.11
162_V	227_H	0.566	0.11
210_R	305_A	0.566	0.11
194_T	288_T	0.566	0.11
81_L	285_T	0.565	0.11
28_V	186_G	0.565	0.11
112_P	323_V	0.563	0.11
442_G	447_A	0.562	0.11
443_G	447_A	0.562	0.11
414_R	447_A	0.562	0.11
412_S	447_A	0.562	0.11
444_H	447_A	0.562	0.11
89_Q	134_E	0.562	0.11
278_E	452_V	0.558	0.11
90_L	105_V	0.558	0.11
320_G	448_A	0.557	0.11
342_H	353_V	0.554	0.11
266_V	416_T	0.553	0.11
84_D	449_G	0.549	0.11
110_H	449_G	0.549	0.11
414_R	439_G	0.549	0.11
412_S	439_G	0.549	0.11
109_H	449_G	0.549	0.11
108_D	449_G	0.549	0.11
167_D	449_G	0.549	0.11
439_G	444_H	0.549	0.11
439_G	443_G	0.549	0.11
439_G	442_G	0.549	0.11
320_G	335_A	0.549	0.11
197_G	207_P	0.549	0.11
132_G	445_E	0.548	0.11
32_S	136_S	0.546	0.11
38_G	156_L	0.546	0.11
458_R	462_D	0.546	0.11
41_S	259_R	0.545	0.11
266_V	301_A	0.545	0.11
198_L	424_V	0.544	0.11
61_S	238_D	0.543	0.11
20_D	301_A	0.542	0.11
333_E	422_A	0.542	0.11
426_L	452_V	0.542	0.11
206_R	306_T	0.541	0.11
367_F	415_A	0.539	0.11
311_T	324_C	0.538	0.11
165_V	342_H	0.537	0.11
30_V	333_E	0.537	0.11
61_S	432_E	0.537	0.11
298_L	332_L	0.536	0.11
48_A	322_A	0.536	0.11
13_E	217_E	0.536	0.11
157_A	160_A	0.535	0.11
333_E	432_E	0.535	0.11
356_E	395_R	0.534	0.11
214_Y	353_V	0.533	0.11
83_T	137_G	0.533	0.11
350_V	354_T	0.532	0.11
64_L	377_I	0.531	0.11
60_F	285_T	0.531	0.11
164_A	207_P	0.529	0.11
39_L	466_G	0.527	0.11
140_A	228_Q	0.527	0.11
75_A	464_A	0.526	0.11
431_R	435_A	0.525	0.11
332_L	352_W	0.523	0.11
387_S	430_V	0.522	0.11
303_E	378_V	0.521	0.11
39_L	340_E	0.519	0.11
104_P	186_G	0.517	0.11
175_L	339_R	0.517	0.11
17_A	24_D	0.517	0.11
106_I	395_R	0.517	0.11
142_Y	284_G	0.517	0.11
366_W	440_D	0.517	0.11
379_G	385_A	0.516	0.11
143_V	264_A	0.515	0.11
156_L	379_G	0.515	0.11
137_G	321_L	0.515	0.11
128_G	184_A	0.515	0.11
340_E	435_A	0.514	0.11
65_D	289_L	0.514	0.11
81_L	141_T	0.513	0.11
225_N	402_A	0.511	0.11
203_T	431_R	0.509	0.11
64_L	163_G	0.508	0.11
58_V	92_A	0.506	0.10
181_R	398_V	0.505	0.10
360_V	466_G	0.505	0.10
364_L	458_R	0.505	0.10
262_V	465_S	0.504	0.10
168_R	197_G	0.503	0.10
72_I	237_L	0.502	0.10
121_H	124_P	0.502	0.10
165_V	345_T	0.502	0.10
161_V	201_Y	0.502	0.10
163_G	225_N	0.501	0.10
19_A	48_A	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zxrA	1	0.6926	100	0.71	Contact Map
4ls9A	2	0.6295	99.9	0.842	Contact Map
4py9A	2	0.6568	99.9	0.855	Contact Map
3devA	2	0.64	99.9	0.858	Contact Map
1wpnA	2	0.3474	99.5	0.908	Contact Map
2hawA	2	0.5726	98.8	0.931	Contact Map
1k20A	2	0.5747	98	0.946	Contact Map
4rpaA	3	0.5811	98	0.947	Contact Map
2zvfA	2	0.3558	97	0.956	Contact Map
3g98A	1	0.2295	96.8	0.957	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0123 seconds.