Q9HMW7 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HMW7 - Glycine-tRNA synthetase

UniProt:	Q9HMW7	Sequences: MSETVSELARRRGFFFQASEAYGGAAGFYTYGPEGAALKRNIEDAWRDRFVTREGNMEIDSPTVTPEPVFQASGHLDDFDDMLVECPDCGESHRADHVIEDNTDVEDAESMPTDEVEALIADHELVCPACGGPLAGQSVTGFNLMFDTTIGPGDGDPGYLRPETAQGMFTEFPRLKEYARNQLPFGVAQVGTGYRNEISPRNALLRTREFTMAELEFFVDPAGDGPALDRVADVELPLYPVDAQQAAGEEYLRLTPQEALAEGVVGGEWVAYFLARSKQWFERVGVDMDRFRFRQHLPGELAHYASDCWDAEGEVDGDWVELEGVASRTDYDLSKHDEHADDSFTVFQAYDEPKTVERASVDPEMSYLGPEFGGAAGDVADALAALAARDRAAFDGDEVTVDVDGEAYTVPTERTGFEVAEETESGRHIIPHVVEPAFGIGRAVYTALAHSYEADEVDGEPRDVLRLPAEVAPTTVGVFPLMDKDGLGERAREIAAELRAAGLAVTYDDSGNIGRRYRRQDEVGTPYCVTVDYEALEEGAVTLRDRDTTTQVRVPIAEVAETLVGLRDGELRFEAL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	576 (566)
Sequences:	504 (310)
Seq/√Len:	13.0

HALSA - Q9HMW7
SULSO - Q97ZX9

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
490_R	535_A	5.529	1.00
235_E	253_R	5.346	1.00
71_Q	77_D	4.425	1.00
56_N	186_G	4.278	1.00
126_V	133_P	3.989	1.00
256_P	265_V	3.928	1.00
193_G	212_M	3.662	0.99
256_P	275_A	3.503	0.99
238_L	265_V	3.448	0.99
281_F	311_A	3.377	0.98
277_S	325_V	3.177	0.98
186_G	217_F	3.096	0.97
482_M	533_Y	3.084	0.97
56_N	217_F	3.017	0.97
355_T	423_T	2.998	0.97
453_E	466_R	2.985	0.97
348_Q	427_R	2.978	0.96
313_G	322_L	2.976	0.96
411_P	414_R	2.959	0.96
271_A	512_N	2.851	0.95
8_L	465_L	2.713	0.94
42_I	471_V	2.707	0.94
236_L	275_A	2.704	0.94
286_V	313_G	2.691	0.94
258_E	262_E	2.681	0.94
159_Y	502_G	2.662	0.93
229_D	232_A	2.655	0.93
99_I	125_L	2.643	0.93
545_D	548_T	2.637	0.93
508_D	519_R	2.608	0.93
117_E	139_V	2.607	0.93
350_Y	426_G	2.583	0.92
320_V	451_S	2.490	0.91
236_L	265_V	2.453	0.90
480_P	516_R	2.447	0.90
347_F	426_G	2.416	0.89
6_S	13_G	2.364	0.88
348_Q	429_I	2.309	0.87
67_E	159_Y	2.304	0.87
240_P	243_A	2.278	0.86
377_G	381_D	2.273	0.86
183_L	429_I	2.268	0.86
207_T	441_G	2.258	0.86
379_V	408_Y	2.245	0.85
227_A	230_R	2.229	0.85
121_A	133_P	2.186	0.84
11_R	522_E	2.178	0.84
401_V	405_G	2.167	0.83
357_E	419_V	2.166	0.83
453_E	464_V	2.152	0.83
20_E	174_R	2.144	0.83
373_G	377_G	2.126	0.82
228_L	260_L	2.120	0.82
112_P	115_E	2.109	0.82
174_R	462_R	2.106	0.81
115_E	118_A	2.089	0.81
541_V	559_V	2.041	0.79
65_T	212_M	2.025	0.79
213_A	440_I	1.993	0.78
236_L	256_P	1.991	0.78
118_A	122_D	1.989	0.77
254_L	264_V	1.978	0.77
64_V	148_T	1.951	0.76
48_D	502_G	1.949	0.76
414_R	418_E	1.931	0.75
487_L	491_A	1.930	0.75
357_E	421_E	1.913	0.75
72_A	340_A	1.906	0.74
510_S	519_R	1.897	0.74
305_A	308_C	1.893	0.74
287_D	290_R	1.886	0.73
286_V	446_T	1.870	0.73
65_T	70_F	1.870	0.73
237_P	278_K	1.865	0.73
121_A	138_S	1.855	0.72
251_Y	383_L	1.846	0.72
174_R	189_Q	1.829	0.71
142_F	152_P	1.809	0.70
256_P	271_A	1.807	0.70
99_I	120_I	1.807	0.70
51_V	188_A	1.789	0.69
258_E	261_A	1.785	0.69
478_V	535_A	1.773	0.69
63_T	194_Y	1.765	0.68
382_A	385_A	1.741	0.67
28_F	95_A	1.739	0.67
168_M	437_A	1.730	0.67
147_D	157_P	1.730	0.67
18_A	62_P	1.720	0.66
16_F	180_R	1.696	0.65
168_M	189_Q	1.693	0.65
534_E	538_E	1.685	0.65
292_R	312_E	1.669	0.64
387_A	390_D	1.669	0.64
232_A	261_A	1.658	0.63
176_K	181_N	1.646	0.63
234_V	256_P	1.644	0.63
427_R	464_V	1.639	0.62
50_F	438_F	1.633	0.62
170_T	189_Q	1.631	0.62
520_Q	525_T	1.629	0.62
284_V	447_A	1.626	0.62
265_V	275_A	1.621	0.61
237_P	253_R	1.614	0.61
287_D	450_H	1.592	0.60
554_V	559_V	1.584	0.60
322_L	443_A	1.576	0.59
345_T	430_I	1.576	0.59
295_Q	307_D	1.574	0.59
13_G	180_R	1.546	0.58
411_P	415_T	1.531	0.57
234_V	278_K	1.512	0.56
185_F	213_A	1.507	0.56
255_T	258_E	1.503	0.55
434_V	529_V	1.500	0.55
295_Q	309_W	1.487	0.55
72_A	183_L	1.484	0.54
59_I	552_V	1.481	0.54
234_V	275_A	1.479	0.54
294_R	309_W	1.468	0.54
70_F	159_Y	1.466	0.53
477_G	525_T	1.458	0.53
494_I	556_I	1.454	0.53
327_S	434_V	1.448	0.53
477_G	520_Q	1.447	0.52
281_F	443_A	1.440	0.52
93_H	136_G	1.440	0.52
315_V	320_V	1.438	0.52
50_F	177_E	1.437	0.52
149_T	154_D	1.435	0.52
44_D	48_D	1.433	0.52
54_E	217_F	1.428	0.51
220_D	348_Q	1.428	0.51
72_A	335_K	1.426	0.51
168_M	187_V	1.423	0.51
16_F	20_E	1.419	0.51
117_E	138_S	1.418	0.51
402_D	410_V	1.415	0.51
194_Y	506_T	1.413	0.51
224_D	268_E	1.410	0.51
84_V	370_P	1.405	0.50
219_V	472_A	1.404	0.50
28_F	65_T	1.401	0.50
294_R	312_E	1.400	0.50
238_L	264_V	1.398	0.50
87_P	137_Q	1.397	0.50
182_Q	559_V	1.393	0.50
281_F	323_E	1.393	0.50
38_L	236_L	1.391	0.50
232_A	257_Q	1.387	0.49
13_G	16_F	1.384	0.49
241_V	298_P	1.380	0.49
240_P	252_L	1.379	0.49
38_L	447_A	1.368	0.48
469_A	527_Y	1.366	0.48
63_T	97_H	1.362	0.48
482_M	489_E	1.356	0.48
54_E	443_A	1.354	0.48
413_E	417_F	1.348	0.47
379_V	382_A	1.347	0.47
38_L	474_T	1.344	0.47
400_T	405_G	1.329	0.46
343_S	428_H	1.324	0.46
217_F	269_W	1.323	0.46
410_V	414_R	1.322	0.46
87_P	133_P	1.321	0.46
40_R	59_I	1.320	0.46
145_M	307_D	1.309	0.45
102_N	125_L	1.307	0.45
331_Y	381_D	1.304	0.45
534_E	553_R	1.290	0.44
269_W	322_L	1.280	0.44
558_E	561_E	1.273	0.43
296_H	307_D	1.272	0.43
89_C	130_C	1.269	0.43
296_H	308_C	1.267	0.43
145_M	296_H	1.259	0.43
125_L	536_L	1.256	0.43
400_T	403_V	1.254	0.42
86_C	89_C	1.254	0.42
539_G	556_I	1.243	0.42
367_Y	370_P	1.242	0.42
292_R	309_W	1.237	0.42
356_V	529_V	1.228	0.41
482_M	486_G	1.228	0.41
70_F	77_D	1.225	0.41
15_F	204_L	1.218	0.41
145_M	295_Q	1.212	0.40
60_D	212_M	1.212	0.40
291_F	311_A	1.207	0.40
268_E	515_R	1.205	0.40
100_E	471_V	1.201	0.40
482_M	511_G	1.196	0.39
252_L	548_T	1.190	0.39
236_L	529_V	1.186	0.39
5_V	465_L	1.181	0.39
277_S	323_E	1.178	0.39
287_D	372_F	1.175	0.38
554_V	562_T	1.174	0.38
225_G	327_S	1.172	0.38
294_R	307_D	1.170	0.38
296_H	309_W	1.169	0.38
114_D	407_A	1.160	0.38
86_C	132_G	1.158	0.38
61_S	187_V	1.147	0.37
104_D	108_A	1.144	0.37
295_Q	308_C	1.140	0.37
268_E	327_S	1.137	0.37
405_G	413_E	1.136	0.37
229_D	268_E	1.136	0.37
462_R	549_T	1.135	0.36
145_M	309_W	1.134	0.36
277_S	449_A	1.131	0.36
17_Q	25_A	1.120	0.36
305_A	327_S	1.118	0.36
408_Y	412_T	1.110	0.35
335_K	339_H	1.106	0.35
70_F	93_H	1.103	0.35
28_F	64_V	1.103	0.35
127_C	132_G	1.103	0.35
292_R	295_Q	1.100	0.35
320_V	465_L	1.099	0.35
408_Y	411_P	1.098	0.35
313_G	524_G	1.097	0.35
401_V	407_A	1.096	0.35
464_V	477_G	1.095	0.35
277_S	426_G	1.094	0.35
181_N	562_T	1.091	0.34
487_L	533_Y	1.089	0.34
402_D	563_L	1.086	0.34
173_P	342_D	1.083	0.34
70_F	373_G	1.082	0.34
381_D	515_R	1.082	0.34
410_V	417_F	1.078	0.34
145_M	294_R	1.078	0.34
219_V	327_S	1.073	0.34
42_I	284_V	1.071	0.33
448_L	568_D	1.071	0.33
183_L	189_Q	1.069	0.33
402_D	405_G	1.064	0.33
99_I	116_V	1.060	0.33
41_N	475_T	1.060	0.33
392_A	396_G	1.058	0.33
11_R	20_E	1.057	0.33
372_F	379_V	1.056	0.33
168_M	174_R	1.056	0.33
369_G	376_A	1.055	0.33
337_D	342_D	1.054	0.33
355_T	464_V	1.051	0.33
64_V	350_Y	1.051	0.33
541_V	554_V	1.051	0.33
258_E	552_V	1.049	0.32
494_I	560_A	1.047	0.32
99_I	497_E	1.045	0.32
284_V	322_L	1.044	0.32
261_A	268_E	1.042	0.32
157_P	343_S	1.035	0.32
29_Y	331_Y	1.034	0.32
110_S	299_G	1.034	0.32
234_V	279_Q	1.034	0.32
193_G	202_N	1.034	0.32
418_E	422_E	1.032	0.32
220_D	277_S	1.029	0.32
391_R	525_T	1.028	0.31
19_S	344_F	1.028	0.31
51_V	264_V	1.026	0.31
220_D	223_G	1.022	0.31
47_R	143_N	1.018	0.31
39_K	427_R	1.018	0.31
110_S	116_V	1.014	0.31
17_Q	275_A	1.014	0.31
372_F	382_A	1.013	0.31
114_D	118_A	1.013	0.31
346_V	476_V	1.011	0.31
297_L	479_F	1.009	0.31
122_D	261_A	1.007	0.31
48_D	465_L	1.006	0.30
159_Y	291_F	1.001	0.30
364_E	418_E	1.001	0.30
490_R	536_L	0.999	0.30
383_L	552_V	0.995	0.30
63_T	426_G	0.994	0.30
481_L	546_R	0.993	0.30
24_G	93_H	0.992	0.30
309_W	312_E	0.988	0.30
152_P	311_A	0.982	0.29
502_G	570_E	0.979	0.29
40_R	60_D	0.978	0.29
466_R	543_L	0.973	0.29
403_V	410_V	0.968	0.29
170_T	267_G	0.968	0.29
375_A	408_Y	0.963	0.29
236_L	509_D	0.962	0.29
39_K	187_V	0.961	0.29
358_R	422_E	0.959	0.28
564_V	568_D	0.959	0.28
456_E	459_G	0.958	0.28
7_E	174_R	0.954	0.28
416_G	496_A	0.953	0.28
445_Y	498_L	0.949	0.28
313_G	447_A	0.947	0.28
378_D	381_D	0.943	0.28
83_L	91_E	0.942	0.28
127_C	130_C	0.941	0.28
84_V	92_S	0.938	0.28
102_N	106_E	0.937	0.28
51_V	416_G	0.934	0.27
190_V	265_V	0.933	0.27
97_H	193_G	0.926	0.27
185_F	309_W	0.924	0.27
70_F	78_D	0.924	0.27
351_D	360_S	0.923	0.27
398_E	401_V	0.922	0.27
538_E	553_R	0.918	0.27
376_A	424_E	0.917	0.27
159_Y	372_F	0.917	0.27
54_E	186_G	0.916	0.27
39_K	72_A	0.915	0.27
68_P	84_V	0.915	0.27
381_D	558_E	0.911	0.26
448_L	467_L	0.910	0.26
39_K	60_D	0.908	0.26
393_A	397_D	0.907	0.26
292_R	308_C	0.907	0.26
43_E	154_D	0.907	0.26
97_H	426_G	0.907	0.26
180_R	347_F	0.906	0.26
50_F	215_L	0.905	0.26
257_Q	261_A	0.902	0.26
370_P	376_A	0.901	0.26
170_T	363_P	0.895	0.26
168_M	553_R	0.894	0.26
10_R	553_R	0.893	0.26
295_Q	312_E	0.893	0.26
452_Y	503_L	0.892	0.26
177_E	462_R	0.891	0.26
65_T	269_W	0.887	0.25
313_G	474_T	0.887	0.25
256_P	452_Y	0.886	0.25
207_T	329_T	0.886	0.25
294_R	308_C	0.886	0.25
97_H	445_Y	0.884	0.25
492_R	534_E	0.882	0.25
16_F	205_L	0.880	0.25
318_D	449_A	0.877	0.25
63_T	103_T	0.876	0.25
349_A	478_V	0.872	0.25
213_A	225_G	0.871	0.25
334_S	338_E	0.866	0.25
13_G	86_C	0.866	0.25
204_L	207_T	0.862	0.24
408_Y	552_V	0.861	0.24
448_L	451_S	0.859	0.24
344_F	394_F	0.859	0.24
54_E	492_R	0.858	0.24
78_D	339_H	0.858	0.24
217_F	441_G	0.857	0.24
14_F	38_L	0.854	0.24
21_A	122_D	0.853	0.24
348_Q	464_V	0.852	0.24
202_N	320_V	0.852	0.24
148_T	460_E	0.851	0.24
305_A	326_A	0.849	0.24
93_H	129_A	0.849	0.24
360_S	503_L	0.848	0.24
317_G	341_D	0.847	0.24
338_E	341_D	0.844	0.24
76_L	83_L	0.844	0.24
239_Y	464_V	0.844	0.24
62_P	99_I	0.841	0.24
97_H	183_L	0.839	0.24
415_T	420_A	0.839	0.24
179_A	215_L	0.839	0.24
38_L	91_E	0.838	0.24
292_R	307_D	0.834	0.23
232_A	410_V	0.834	0.23
341_D	535_A	0.833	0.23
89_C	137_Q	0.833	0.23
369_G	372_F	0.828	0.23
101_D	558_E	0.826	0.23
41_N	84_V	0.822	0.23
40_R	190_V	0.821	0.23
477_G	523_V	0.821	0.23
245_Q	297_L	0.820	0.23
503_L	564_V	0.817	0.23
368_L	380_A	0.817	0.23
292_R	296_H	0.817	0.23
474_T	523_V	0.816	0.23
489_E	533_Y	0.815	0.23
464_V	523_V	0.813	0.23
423_T	548_T	0.813	0.23
330_D	374_G	0.811	0.23
399_V	405_G	0.811	0.23
10_R	13_G	0.810	0.23
271_A	376_A	0.809	0.22
52_T	55_G	0.809	0.22
286_V	572_R	0.808	0.22
501_A	531_V	0.806	0.22
114_D	229_D	0.804	0.22
270_V	327_S	0.803	0.22
355_T	421_E	0.802	0.22
136_G	548_T	0.802	0.22
334_S	523_V	0.801	0.22
57_M	179_A	0.799	0.22
101_D	104_D	0.799	0.22
225_G	228_L	0.798	0.22
363_P	383_L	0.797	0.22
269_W	301_L	0.793	0.22
176_K	346_V	0.792	0.22
266_G	549_T	0.792	0.22
45_A	470_E	0.791	0.22
140_T	220_D	0.789	0.22
385_A	471_V	0.789	0.22
289_D	531_V	0.785	0.22
495_A	550_T	0.783	0.22
100_E	361_V	0.782	0.22
106_E	125_L	0.780	0.21
97_H	199_S	0.779	0.21
182_Q	452_Y	0.779	0.21
21_A	80_D	0.779	0.21
70_F	76_L	0.779	0.21
5_V	9_A	0.778	0.21
429_I	552_V	0.778	0.21
125_L	571_L	0.776	0.21
99_I	119_L	0.776	0.21
299_G	325_V	0.776	0.21
254_L	262_E	0.775	0.21
479_F	525_T	0.775	0.21
484_K	492_R	0.774	0.21
193_G	374_G	0.773	0.21
159_Y	539_G	0.771	0.21
365_M	487_L	0.770	0.21
504_A	525_T	0.768	0.21
382_A	386_L	0.768	0.21
123_H	256_P	0.767	0.21
157_P	190_V	0.766	0.21
534_E	540_A	0.765	0.21
34_E	207_T	0.765	0.21
477_G	528_C	0.764	0.21
145_M	194_Y	0.761	0.21
482_M	487_L	0.760	0.21
541_V	560_A	0.759	0.21
111_M	116_V	0.758	0.21
109_E	239_Y	0.757	0.21
137_Q	313_G	0.756	0.21
496_A	571_L	0.756	0.21
137_Q	515_R	0.756	0.21
347_F	428_H	0.756	0.21
145_M	292_R	0.755	0.21
84_V	137_Q	0.755	0.21
479_F	531_V	0.754	0.21
93_H	127_C	0.754	0.21
93_H	182_Q	0.754	0.21
38_L	448_L	0.752	0.20
126_V	371_E	0.751	0.20
86_C	127_C	0.750	0.20
111_M	340_A	0.749	0.20
6_S	10_R	0.748	0.20
257_Q	260_L	0.748	0.20
194_Y	309_W	0.748	0.20
194_Y	535_A	0.746	0.20
51_V	118_A	0.746	0.20
47_R	205_L	0.745	0.20
159_Y	358_R	0.745	0.20
301_L	443_A	0.744	0.20
70_F	548_T	0.743	0.20
164_T	450_H	0.743	0.20
229_D	501_A	0.743	0.20
40_R	531_V	0.742	0.20
21_A	35_G	0.741	0.20
143_N	152_P	0.740	0.20
164_T	169_F	0.740	0.20
481_L	491_A	0.738	0.20
56_N	215_L	0.736	0.20
171_E	179_A	0.735	0.20
199_S	277_S	0.735	0.20
231_V	263_G	0.735	0.20
194_Y	296_H	0.733	0.20
535_A	552_V	0.731	0.20
241_V	251_Y	0.731	0.20
362_D	368_L	0.730	0.20
266_G	363_P	0.729	0.20
180_R	511_G	0.727	0.20
296_H	305_A	0.727	0.20
18_A	21_A	0.726	0.20
330_D	474_T	0.723	0.20
89_C	127_C	0.723	0.20
301_L	308_C	0.722	0.19
212_M	441_G	0.722	0.19
99_I	525_T	0.722	0.19
415_T	418_E	0.720	0.19
233_D	561_E	0.720	0.19
228_L	327_S	0.720	0.19
85_E	375_A	0.719	0.19
254_L	265_V	0.714	0.19
121_A	416_G	0.714	0.19
494_I	541_V	0.714	0.19
223_G	487_L	0.714	0.19
61_S	238_L	0.712	0.19
98_V	125_L	0.712	0.19
535_A	558_E	0.710	0.19
171_E	455_D	0.710	0.19
8_L	23_G	0.709	0.19
202_N	317_G	0.709	0.19
417_F	420_A	0.708	0.19
137_Q	423_T	0.708	0.19
486_G	535_A	0.707	0.19
283_R	470_E	0.705	0.19
360_S	418_E	0.705	0.19
552_V	562_T	0.703	0.19
12_R	26_A	0.703	0.19
482_M	537_E	0.702	0.19
482_M	510_S	0.702	0.19
230_R	496_A	0.699	0.19
412_T	417_F	0.698	0.19
361_V	410_V	0.698	0.19
98_V	512_N	0.696	0.19
467_L	559_V	0.694	0.19
481_L	547_D	0.694	0.19
149_T	474_T	0.694	0.19
126_V	131_G	0.693	0.19
159_Y	331_Y	0.692	0.19
45_A	469_A	0.692	0.19
228_L	268_E	0.691	0.18
180_R	350_Y	0.690	0.18
235_E	416_G	0.689	0.18
516_R	540_A	0.689	0.18
125_L	421_E	0.688	0.18
533_Y	549_T	0.688	0.18
474_T	515_R	0.688	0.18
101_D	132_G	0.688	0.18
65_T	69_V	0.684	0.18
12_R	35_G	0.683	0.18
159_Y	367_Y	0.683	0.18
142_F	198_I	0.682	0.18
552_V	556_I	0.681	0.18
296_H	312_E	0.681	0.18
50_F	276_R	0.680	0.18
8_L	467_L	0.679	0.18
320_V	484_K	0.678	0.18
427_R	523_V	0.677	0.18
220_D	350_Y	0.677	0.18
95_A	100_E	0.676	0.18
127_C	432_H	0.675	0.18
173_P	525_T	0.674	0.18
351_D	493_E	0.674	0.18
91_E	258_E	0.674	0.18
340_A	491_A	0.673	0.18
235_E	255_T	0.673	0.18
306_S	487_L	0.673	0.18
65_T	267_G	0.672	0.18
18_A	367_Y	0.672	0.18
233_D	255_T	0.671	0.18
399_V	402_D	0.670	0.18
340_A	426_G	0.670	0.18
175_L	312_E	0.670	0.18
174_R	183_L	0.668	0.18
152_P	158_G	0.668	0.18
102_N	554_V	0.667	0.18
217_F	273_F	0.667	0.18
265_V	359_A	0.666	0.18
250_E	407_A	0.666	0.18
44_D	559_V	0.666	0.18
86_C	130_C	0.666	0.18
224_D	261_A	0.664	0.18
21_A	30_T	0.663	0.18
339_H	467_L	0.660	0.18
236_L	255_T	0.660	0.18
389_R	393_A	0.660	0.18
159_Y	525_T	0.658	0.17
407_A	414_R	0.658	0.17
541_V	553_R	0.656	0.17
26_A	485_D	0.656	0.17
98_V	459_G	0.656	0.17
358_R	467_L	0.655	0.17
52_T	329_T	0.655	0.17
228_L	443_A	0.653	0.17
356_V	378_D	0.653	0.17
356_V	539_G	0.653	0.17
261_A	290_R	0.652	0.17
100_E	109_E	0.652	0.17
199_S	567_R	0.652	0.17
5_V	448_L	0.651	0.17
277_S	297_L	0.650	0.17
38_L	72_A	0.650	0.17
55_G	494_I	0.649	0.17
194_Y	307_D	0.649	0.17
211_T	426_G	0.647	0.17
307_D	312_E	0.645	0.17
527_Y	566_L	0.644	0.17
89_C	132_G	0.643	0.17
516_R	519_R	0.643	0.17
50_F	160_L	0.643	0.17
149_T	275_A	0.641	0.17
494_I	535_A	0.640	0.17
535_A	541_V	0.639	0.17
29_Y	361_V	0.638	0.17
110_S	157_P	0.636	0.17
259_A	372_F	0.636	0.17
188_A	204_L	0.636	0.17
142_F	545_D	0.635	0.17
235_E	460_E	0.634	0.17
330_D	334_S	0.633	0.17
84_V	189_Q	0.633	0.17
524_G	538_E	0.633	0.17
340_A	543_L	0.632	0.17
301_L	323_E	0.630	0.17
409_T	539_G	0.628	0.17
34_E	523_V	0.628	0.17
363_P	368_L	0.627	0.17
98_V	136_G	0.627	0.17
99_I	227_A	0.627	0.17
415_T	467_L	0.626	0.17
460_E	558_E	0.625	0.16
212_M	340_A	0.624	0.16
36_A	52_T	0.624	0.16
259_A	369_G	0.624	0.16
145_M	312_E	0.623	0.16
330_D	432_H	0.623	0.16
57_M	171_E	0.622	0.16
124_E	258_E	0.621	0.16
275_A	329_T	0.620	0.16
204_L	441_G	0.620	0.16
153_G	157_P	0.620	0.16
224_D	289_D	0.619	0.16
305_A	434_V	0.618	0.16
461_P	467_L	0.618	0.16
175_L	228_L	0.617	0.16
223_G	348_Q	0.617	0.16
544_R	551_Q	0.616	0.16
88_D	133_P	0.616	0.16
383_L	563_L	0.616	0.16
21_A	344_F	0.616	0.16
263_G	388_A	0.615	0.16
89_C	491_A	0.614	0.16
471_V	537_E	0.613	0.16
296_H	327_S	0.613	0.16
38_L	391_R	0.613	0.16
80_D	85_E	0.613	0.16
159_Y	406_E	0.612	0.16
63_T	277_S	0.612	0.16
71_Q	153_G	0.611	0.16
213_A	481_L	0.611	0.16
194_Y	294_R	0.610	0.16
143_N	308_C	0.610	0.16
194_Y	295_Q	0.610	0.16
193_G	274_L	0.609	0.16
39_K	211_T	0.609	0.16
50_F	56_N	0.608	0.16
264_V	545_D	0.608	0.16
145_M	308_C	0.605	0.16
508_D	516_R	0.603	0.16
543_L	552_V	0.602	0.16
263_G	343_S	0.602	0.16
375_A	406_E	0.601	0.16
83_L	92_S	0.601	0.16
103_T	249_E	0.601	0.16
41_N	375_A	0.600	0.16
83_L	188_A	0.599	0.16
147_D	229_D	0.597	0.16
220_D	516_R	0.596	0.16
29_Y	112_P	0.596	0.16
99_I	113_T	0.596	0.16
88_D	458_D	0.595	0.16
100_E	251_Y	0.594	0.16
254_L	467_L	0.592	0.16
18_A	238_L	0.592	0.16
11_R	23_G	0.592	0.16
195_R	436_P	0.590	0.15
131_G	571_L	0.590	0.15
341_D	381_D	0.590	0.15
189_Q	211_T	0.588	0.15
25_A	154_D	0.588	0.15
533_Y	543_L	0.588	0.15
337_D	545_D	0.587	0.15
231_V	257_Q	0.585	0.15
410_V	413_E	0.583	0.15
215_L	455_D	0.582	0.15
350_Y	421_E	0.581	0.15
479_F	523_V	0.580	0.15
383_L	529_V	0.579	0.15
168_M	479_F	0.579	0.15
480_P	508_D	0.579	0.15
316_D	449_A	0.579	0.15
229_D	492_R	0.579	0.15
97_H	192_T	0.578	0.15
159_Y	493_E	0.578	0.15
43_E	153_G	0.577	0.15
39_K	249_E	0.577	0.15
168_M	247_A	0.577	0.15
31_Y	106_E	0.577	0.15
100_E	429_I	0.576	0.15
7_E	153_G	0.575	0.15
466_R	547_D	0.574	0.15
543_L	554_V	0.574	0.15
349_A	390_D	0.573	0.15
452_Y	500_A	0.572	0.15
82_M	113_T	0.572	0.15
127_C	370_P	0.572	0.15
110_S	219_V	0.571	0.15
408_Y	415_T	0.571	0.15
229_D	485_D	0.570	0.15
178_Y	311_A	0.570	0.15
129_A	251_Y	0.570	0.15
160_L	358_R	0.570	0.15
494_I	512_N	0.566	0.15
39_K	479_F	0.565	0.15
438_F	512_N	0.564	0.15
145_M	193_G	0.564	0.15
29_Y	394_F	0.563	0.15
62_P	72_A	0.562	0.15
452_Y	494_I	0.562	0.15
480_P	519_R	0.561	0.15
234_V	563_L	0.561	0.15
43_E	440_I	0.561	0.15
93_H	101_D	0.560	0.15
334_S	561_E	0.560	0.15
34_E	49_R	0.560	0.15
227_A	301_L	0.560	0.15
125_L	265_V	0.559	0.15
11_R	61_S	0.559	0.15
329_T	438_F	0.559	0.15
7_E	477_G	0.559	0.15
19_S	30_T	0.559	0.15
82_M	476_V	0.559	0.15
229_D	352_E	0.559	0.15
72_A	339_H	0.559	0.15
426_G	481_L	0.558	0.15
126_V	540_A	0.557	0.15
408_Y	414_R	0.555	0.15
193_G	325_V	0.555	0.15
290_R	487_L	0.555	0.15
31_Y	59_I	0.554	0.15
29_Y	98_V	0.554	0.15
127_C	180_R	0.553	0.15
467_L	512_N	0.553	0.15
277_S	503_L	0.553	0.15
238_L	364_E	0.553	0.15
170_T	481_L	0.551	0.14
101_D	178_Y	0.551	0.14
42_I	572_R	0.550	0.14
229_D	320_V	0.550	0.14
308_C	327_S	0.550	0.14
287_D	322_L	0.550	0.14
43_E	193_G	0.549	0.14
409_T	419_V	0.548	0.14
419_V	422_E	0.547	0.14
99_I	314_E	0.547	0.14
17_Q	368_L	0.546	0.14
182_Q	256_P	0.545	0.14
405_G	414_R	0.545	0.14
294_R	450_H	0.544	0.14
49_R	366_S	0.543	0.14
295_Q	327_S	0.543	0.14
9_A	444_V	0.543	0.14
320_V	398_E	0.541	0.14
10_R	241_V	0.541	0.14
376_A	510_S	0.541	0.14
103_T	119_L	0.541	0.14
35_G	311_A	0.541	0.14
14_F	305_A	0.540	0.14
72_A	432_H	0.540	0.14
44_D	515_R	0.540	0.14
180_R	426_G	0.538	0.14
307_D	327_S	0.538	0.14
405_G	410_V	0.538	0.14
49_R	62_P	0.536	0.14
258_E	385_A	0.536	0.14
540_A	567_R	0.536	0.14
141_G	381_D	0.535	0.14
398_E	402_D	0.535	0.14
367_Y	413_E	0.535	0.14
482_M	543_L	0.535	0.14
237_P	320_V	0.534	0.14
212_M	295_Q	0.533	0.14
62_P	451_S	0.533	0.14
174_R	177_E	0.532	0.14
59_I	345_T	0.532	0.14
80_D	83_L	0.531	0.14
192_T	440_I	0.531	0.14
222_A	569_G	0.530	0.14
31_Y	465_L	0.530	0.14
337_D	446_T	0.529	0.14
28_F	212_M	0.529	0.14
308_C	312_E	0.529	0.14
410_V	416_G	0.528	0.14
284_V	468_P	0.528	0.14
348_Q	351_D	0.528	0.14
359_A	419_V	0.526	0.14
414_R	420_A	0.526	0.14
340_A	350_Y	0.526	0.14
524_G	541_V	0.525	0.14
485_D	492_R	0.525	0.14
120_I	341_D	0.525	0.14
65_T	441_G	0.524	0.14
341_D	362_D	0.524	0.14
37_A	320_V	0.523	0.14
17_Q	361_V	0.523	0.14
296_H	450_H	0.523	0.14
295_Q	450_H	0.522	0.14
346_V	525_T	0.522	0.14
510_S	533_Y	0.521	0.14
92_S	346_V	0.520	0.14
400_T	404_D	0.520	0.14
351_D	511_G	0.520	0.14
517_Y	521_D	0.518	0.14
514_G	517_Y	0.518	0.14
514_G	521_D	0.518	0.14
366_S	430_I	0.517	0.14
283_R	432_H	0.517	0.14
139_V	489_E	0.516	0.14
373_G	474_T	0.516	0.14
451_S	524_G	0.515	0.14
476_V	525_T	0.514	0.14
375_A	378_D	0.514	0.14
189_Q	363_P	0.514	0.14
309_W	327_S	0.514	0.14
31_Y	454_A	0.514	0.14
232_A	379_V	0.513	0.14
259_A	434_V	0.512	0.13
14_F	34_E	0.512	0.13
398_E	417_F	0.512	0.13
390_D	571_L	0.511	0.13
478_V	570_E	0.511	0.13
441_G	455_D	0.511	0.13
138_S	245_Q	0.509	0.13
563_L	569_G	0.509	0.13
286_V	376_A	0.509	0.13
45_A	287_D	0.508	0.13
207_T	276_R	0.508	0.13
413_E	419_V	0.506	0.13
141_G	180_R	0.505	0.13
405_G	412_T	0.505	0.13
371_E	402_D	0.504	0.13
213_A	309_W	0.504	0.13
263_G	289_D	0.504	0.13
402_D	561_E	0.503	0.13
160_L	459_G	0.503	0.13
190_V	471_V	0.503	0.13
24_G	193_G	0.503	0.13
452_Y	484_K	0.502	0.13
406_E	557_A	0.501	0.13
108_A	264_V	0.501	0.13
401_V	496_A	0.501	0.13
118_A	411_P	0.500	0.13
308_C	450_H	0.500	0.13
565_G	570_E	0.500	0.13
117_E	531_V	0.500	0.13
52_T	499_R	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zt5A	2	0.8628	100	0.446	Contact Map
1atiA	2	0.7274	100	0.611	Contact Map
1g5hA	2	0.6927	100	0.7	Contact Map
3iklA	2	0.6163	100	0.721	Contact Map
3a32A	2	0.7135	100	0.761	Contact Map
3ialA	2	0.651	100	0.799	Contact Map
1nyrA	2	0.6962	100	0.8	Contact Map
2i4lA	2	0.7101	100	0.801	Contact Map
3uh0A	2	0.684	100	0.805	Contact Map
4hwtA	2	0.6806	100	0.806	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0146 seconds.