TNAA - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

TNAA - Probable tryptophanase

UniProt:	Q9HMV2	Sequences: MRSHTATMVDRIEDTSRADREAALADAGHNVFELASDDVAVDLLTDSGTGTMSNDQWAAMLQGDEAYAGSASFEDLAVAAEDVMGFQHIIPAHQGRGAENVLYGAVLSAGDTVLNNAHFDTTRAHVAANDATPVDCPVDGARDPDTDAPFKGNFSVERARRVVDDVGADAVPVVVLTITNNSMAGQPVSIENTREVAAFADDIDATFVIDACRFAENAHFVQQREPGYEHDSVAAIAREQLSYADACVMSGKKDGLVNVGGFVGLHDDGRLHEQCRQRGILYEGFSTYGGMSGRDMAAFAVGLREAVEPPYVAERVAQVQRLADALTDRDVPIYQPAGGHAVYIDANAALPHLPREQFPGQAFVCELYREGGVRAVELGRFAFPDTDRRDLVRLALPRRTYGPDHLDHVADTAAAVCERGTDVTGLEIVSEPELTELRHFSAALQPVA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	448 (440)
Sequences:	480 (288)
Seq/√Len:	13.7

ECOLI - TNAA
HALSA - TNAA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
427_E	445_Q	6.405	1.00
174_V	200_A	6.282	1.00
197_A	201_D	5.772	1.00
59_A	301_V	5.383	1.00
371_G	412_T	4.224	1.00
160_R	202_D	4.081	1.00
4_H	314_E	4.073	1.00
208_V	246_A	3.825	1.00
163_V	167_G	3.680	0.99
87_Q	266_H	3.646	0.99
190_I	228_Y	3.607	0.99
417_C	420_G	3.555	0.99
191_E	195_E	3.500	0.99
111_D	172_P	3.494	0.99
163_V	205_A	3.443	0.99
349_A	420_G	3.307	0.98
24_L	365_C	3.199	0.98
160_R	164_D	3.055	0.97
138_V	148_A	3.042	0.97
24_L	369_R	3.036	0.97
114_L	172_P	2.998	0.97
223_Q	320_Q	2.931	0.97
31_V	364_V	2.922	0.97
79_A	304_R	2.901	0.96
176_L	193_T	2.808	0.96
108_S	111_D	2.692	0.95
82_D	304_R	2.685	0.95
231_D	235_A	2.678	0.94
6_A	402_G	2.678	0.94
156_V	199_F	2.676	0.94
178_I	240_Q	2.647	0.94
227_G	231_D	2.598	0.93
17_R	21_E	2.588	0.93
139_D	158_R	2.519	0.92
322_L	410_A	2.453	0.91
323_A	337_A	2.417	0.91
222_Q	309_P	2.390	0.90
349_A	417_C	2.356	0.89
366_E	419_R	2.348	0.89
127_A	133_P	2.329	0.89
228_Y	231_D	2.328	0.89
190_I	221_V	2.305	0.88
147_D	335_Q	2.269	0.88
113_V	172_P	2.255	0.87
226_P	229_E	2.175	0.85
327_T	335_Q	2.169	0.85
222_Q	236_I	2.157	0.85
100_N	129_N	2.156	0.85
36_S	66_A	2.150	0.84
320_Q	324_D	2.143	0.84
7_T	10_D	2.099	0.83
228_Y	239_E	2.093	0.83
26_D	38_D	2.089	0.83
28_G	443_A	2.069	0.82
59_A	72_S	2.058	0.82
259_V	292_S	2.012	0.80
327_T	333_I	1.987	0.79
344_I	413_A	1.915	0.77
55_D	62_Q	1.913	0.77
381_F	444_L	1.891	0.76
380_R	390_D	1.880	0.75
325_A	407_D	1.856	0.74
194_R	239_E	1.838	0.74
195_E	198_A	1.822	0.73
35_A	38_D	1.799	0.72
204_D	331_V	1.727	0.69
123_R	135_D	1.722	0.68
239_E	242_S	1.719	0.68
163_V	171_V	1.717	0.68
156_V	195_E	1.705	0.68
111_D	170_A	1.656	0.65
57_W	258_N	1.654	0.65
329_R	414_A	1.650	0.65
114_L	162_V	1.639	0.64
211_A	241_L	1.621	0.64
120_D	439_H	1.613	0.63
414_A	418_E	1.610	0.63
378_L	382_A	1.595	0.62
337_A	342_V	1.584	0.62
144_P	348_A	1.583	0.62
52_M	298_A	1.561	0.61
72_S	301_V	1.560	0.61
52_M	258_N	1.552	0.60
75_D	297_A	1.542	0.60
291_M	296_M	1.538	0.59
218_A	240_Q	1.536	0.59
220_F	339_G	1.534	0.59
80_A	89_I	1.533	0.59
140_G	153_N	1.530	0.59
29_H	446_P	1.515	0.58
221_V	240_Q	1.512	0.58
37_D	71_A	1.493	0.57
59_A	257_V	1.489	0.57
72_S	75_D	1.478	0.56
23_A	34_L	1.467	0.56
103_Y	173_V	1.464	0.55
167_G	205_A	1.456	0.55
161_R	165_D	1.451	0.55
88_H	268_D	1.448	0.55
193_T	197_A	1.419	0.53
86_F	244_A	1.413	0.53
16_S	19_D	1.392	0.52
154_F	199_F	1.383	0.51
124_A	281_L	1.370	0.50
23_A	38_D	1.340	0.49
204_D	330_D	1.339	0.49
258_N	298_A	1.335	0.49
32_F	44_L	1.295	0.46
105_A	275_C	1.293	0.46
31_V	375_A	1.290	0.46
258_N	295_D	1.288	0.46
215_A	237_A	1.286	0.46
163_V	168_A	1.281	0.46
90_I	97_G	1.274	0.45
59_A	75_D	1.272	0.45
50_G	400_T	1.262	0.45
232_S	235_A	1.259	0.45
160_R	203_I	1.244	0.44
83_V	163_V	1.239	0.43
215_A	312_V	1.238	0.43
52_M	57_W	1.238	0.43
163_V	199_F	1.235	0.43
114_L	126_V	1.220	0.42
123_R	180_N	1.218	0.42
233_V	237_A	1.217	0.42
115_N	212_C	1.207	0.42
112_T	134_V	1.205	0.42
101_V	278_R	1.203	0.42
346_A	363_F	1.196	0.41
73_F	77_A	1.195	0.41
125_H	282_Y	1.195	0.41
65_E	293_G	1.192	0.41
76_L	272_H	1.188	0.41
331_V	413_A	1.180	0.40
35_A	74_E	1.179	0.40
233_V	307_V	1.179	0.40
241_L	255_G	1.177	0.40
215_A	255_G	1.175	0.40
84_M	307_V	1.171	0.40
110_G	392_V	1.162	0.39
53_S	399_R	1.159	0.39
87_Q	268_D	1.157	0.39
22_A	26_D	1.152	0.39
375_A	394_L	1.148	0.39
358_F	389_R	1.137	0.38
251_G	299_F	1.137	0.38
384_P	387_D	1.137	0.38
415_A	418_E	1.131	0.38
370_E	419_R	1.131	0.38
166_V	169_D	1.129	0.38
193_T	196_V	1.127	0.38
120_D	177_T	1.119	0.37
257_V	299_F	1.117	0.37
255_G	306_A	1.113	0.37
409_V	413_A	1.112	0.37
55_D	301_V	1.111	0.37
4_H	441_S	1.101	0.36
350_L	362_A	1.100	0.36
70_S	400_T	1.093	0.36
81_E	87_Q	1.088	0.36
364_V	392_V	1.086	0.36
150_F	263_V	1.081	0.35
80_A	264_G	1.080	0.35
171_V	198_A	1.077	0.35
143_D	348_A	1.075	0.35
57_W	295_D	1.073	0.35
190_I	240_Q	1.069	0.35
107_L	131_A	1.064	0.35
102_L	248_V	1.040	0.33
183_M	383_F	1.036	0.33
190_I	227_G	1.030	0.33
345_D	348_A	1.024	0.33
111_D	114_L	1.023	0.33
238_R	304_R	1.022	0.33
191_E	229_E	1.020	0.32
194_R	227_G	1.020	0.32
103_Y	439_H	1.014	0.32
226_P	320_Q	1.014	0.32
112_T	166_V	1.012	0.32
209_I	244_A	1.006	0.32
112_T	162_V	0.998	0.31
413_A	420_G	0.997	0.31
378_L	439_H	0.997	0.31
429_V	445_Q	0.994	0.31
34_L	38_D	0.994	0.31
214_F	237_A	0.992	0.31
403_P	407_D	0.990	0.31
280_I	395_A	0.989	0.31
237_A	255_G	0.986	0.31
163_V	166_V	0.983	0.31
174_V	205_A	0.982	0.31
190_I	242_S	0.980	0.31
430_S	443_A	0.974	0.30
419_R	422_D	0.972	0.30
75_D	79_A	0.968	0.30
25_A	229_E	0.963	0.30
177_T	214_F	0.963	0.30
294_R	298_A	0.963	0.30
205_A	407_D	0.962	0.30
15_T	23_A	0.961	0.30
79_A	255_G	0.961	0.30
382_A	439_H	0.960	0.30
59_A	297_A	0.960	0.30
259_V	291_M	0.958	0.30
115_N	126_V	0.952	0.29
101_V	444_L	0.950	0.29
317_A	403_P	0.948	0.29
118_H	175_V	0.945	0.29
325_A	411_D	0.943	0.29
153_N	191_E	0.942	0.29
221_V	248_V	0.939	0.29
365_C	371_G	0.938	0.29
211_A	247_C	0.935	0.29
325_A	410_A	0.933	0.28
120_D	378_L	0.932	0.28
88_H	272_H	0.932	0.28
332_P	373_V	0.931	0.28
166_V	172_P	0.931	0.28
206_T	373_V	0.930	0.28
53_S	305_E	0.928	0.28
154_F	176_L	0.928	0.28
177_T	439_H	0.927	0.28
50_G	256_L	0.927	0.28
193_T	207_F	0.922	0.28
216_E	315_R	0.919	0.28
100_N	282_Y	0.918	0.28
371_G	408_H	0.915	0.28
22_A	25_A	0.910	0.27
254_D	315_R	0.908	0.27
321_R	407_D	0.905	0.27
344_I	392_V	0.902	0.27
137_P	141_A	0.899	0.27
408_H	412_T	0.898	0.27
22_A	168_A	0.894	0.27
396_L	406_L	0.891	0.27
168_A	421_T	0.890	0.27
212_C	299_F	0.887	0.27
66_A	124_A	0.886	0.26
85_G	410_A	0.885	0.26
219_H	326_L	0.883	0.26
178_I	207_F	0.879	0.26
190_I	239_E	0.877	0.26
271_L	329_R	0.875	0.26
16_S	373_V	0.875	0.26
373_V	376_V	0.873	0.26
10_D	63_G	0.865	0.26
197_A	207_F	0.861	0.25
233_V	313_A	0.861	0.25
197_A	243_Y	0.860	0.25
221_V	228_Y	0.857	0.25
37_D	268_D	0.856	0.25
88_H	317_A	0.854	0.25
157_E	202_D	0.853	0.25
298_A	332_P	0.851	0.25
413_A	416_V	0.850	0.25
97_G	426_L	0.847	0.25
173_V	207_F	0.842	0.25
235_A	310_P	0.841	0.25
57_W	294_R	0.837	0.24
28_G	430_S	0.830	0.24
21_E	369_R	0.829	0.24
58_A	72_S	0.829	0.24
354_P	357_Q	0.829	0.24
292_S	295_D	0.827	0.24
112_T	163_V	0.827	0.24
33_E	443_A	0.827	0.24
76_L	89_I	0.826	0.24
74_E	78_V	0.825	0.24
15_T	372_G	0.819	0.24
108_S	207_F	0.817	0.24
410_A	414_A	0.815	0.24
213_R	340_H	0.815	0.24
150_F	225_E	0.813	0.24
285_F	380_R	0.808	0.23
83_V	307_V	0.807	0.23
247_C	264_G	0.806	0.23
77_A	276_R	0.805	0.23
218_A	237_A	0.801	0.23
7_T	63_G	0.798	0.23
101_V	408_H	0.798	0.23
313_A	427_E	0.798	0.23
118_H	126_V	0.798	0.23
115_N	383_F	0.797	0.23
156_V	196_V	0.794	0.23
213_R	315_R	0.790	0.23
140_G	148_A	0.790	0.23
344_I	423_V	0.789	0.23
267_D	270_R	0.788	0.23
194_R	232_S	0.787	0.23
33_E	163_V	0.786	0.22
107_L	173_V	0.786	0.22
145_D	348_A	0.786	0.22
194_R	228_Y	0.784	0.22
6_A	11_R	0.784	0.22
233_V	312_V	0.784	0.22
112_T	171_V	0.784	0.22
367_L	392_V	0.781	0.22
100_N	125_H	0.780	0.22
396_L	414_A	0.779	0.22
396_L	409_V	0.778	0.22
190_I	231_D	0.774	0.22
172_P	281_L	0.774	0.22
6_A	10_D	0.772	0.22
366_E	369_R	0.769	0.22
15_T	19_D	0.768	0.22
276_R	423_V	0.768	0.22
353_L	423_V	0.767	0.22
193_T	243_Y	0.766	0.22
286_S	441_S	0.763	0.22
36_S	218_A	0.761	0.22
24_L	419_R	0.758	0.21
312_V	316_V	0.756	0.21
239_E	243_Y	0.756	0.21
170_A	232_S	0.755	0.21
118_H	133_P	0.755	0.21
118_H	136_C	0.754	0.21
83_V	304_R	0.753	0.21
163_V	414_A	0.752	0.21
331_V	375_A	0.752	0.21
131_A	348_A	0.751	0.21
237_A	241_L	0.748	0.21
81_E	109_A	0.748	0.21
213_R	254_D	0.743	0.21
298_A	345_D	0.740	0.21
222_Q	235_A	0.739	0.21
317_A	324_D	0.737	0.21
268_D	423_V	0.736	0.21
251_G	378_L	0.734	0.21
17_R	370_E	0.732	0.21
344_I	367_L	0.732	0.21
63_G	293_G	0.731	0.20
42_D	47_S	0.730	0.20
28_G	196_V	0.730	0.20
182_S	439_H	0.730	0.20
177_T	180_N	0.729	0.20
167_G	171_V	0.727	0.20
173_V	176_L	0.725	0.20
341_A	350_L	0.725	0.20
275_C	400_T	0.724	0.20
42_D	46_D	0.724	0.20
117_A	408_H	0.722	0.20
5_T	14_D	0.721	0.20
72_S	395_A	0.720	0.20
76_L	90_I	0.718	0.20
52_M	294_R	0.718	0.20
57_W	61_L	0.717	0.20
323_A	342_V	0.717	0.20
350_L	423_V	0.715	0.20
258_N	294_R	0.710	0.20
351_P	421_T	0.708	0.20
120_D	376_V	0.708	0.20
272_H	276_R	0.706	0.20
84_M	241_L	0.705	0.20
22_A	170_A	0.705	0.20
195_E	274_Q	0.704	0.20
7_T	342_V	0.704	0.20
190_I	328_D	0.702	0.19
69_G	346_A	0.701	0.19
342_V	373_V	0.700	0.19
227_G	348_A	0.699	0.19
367_L	413_A	0.698	0.19
308_E	364_V	0.698	0.19
362_A	423_V	0.697	0.19
207_F	244_A	0.696	0.19
171_V	206_T	0.696	0.19
355_R	380_R	0.693	0.19
72_S	216_E	0.692	0.19
25_A	427_E	0.691	0.19
59_A	347_N	0.690	0.19
212_C	383_F	0.690	0.19
345_D	371_G	0.689	0.19
332_P	345_D	0.689	0.19
211_A	392_V	0.688	0.19
110_G	150_F	0.685	0.19
52_M	56_Q	0.685	0.19
242_S	266_H	0.683	0.19
236_I	339_G	0.682	0.19
230_H	357_Q	0.681	0.19
230_H	433_E	0.680	0.19
274_Q	418_E	0.679	0.19
230_H	427_E	0.677	0.19
134_V	396_L	0.677	0.19
93_H	283_E	0.674	0.19
118_H	285_F	0.674	0.19
36_S	364_V	0.674	0.19
57_W	65_E	0.672	0.19
263_V	275_C	0.671	0.18
131_A	156_V	0.671	0.18
256_L	311_Y	0.670	0.18
353_L	421_T	0.666	0.18
320_Q	337_A	0.664	0.18
57_W	298_A	0.663	0.18
331_V	418_E	0.663	0.18
231_D	239_E	0.661	0.18
52_M	332_P	0.659	0.18
238_R	242_S	0.659	0.18
114_L	154_F	0.658	0.18
8_M	143_D	0.657	0.18
318_Q	406_L	0.656	0.18
246_A	263_V	0.655	0.18
104_G	128_A	0.655	0.18
180_N	212_C	0.655	0.18
169_D	274_Q	0.655	0.18
161_R	170_A	0.654	0.18
180_N	207_F	0.654	0.18
15_T	37_D	0.653	0.18
198_A	418_E	0.653	0.18
126_V	173_V	0.653	0.18
197_A	200_A	0.652	0.18
141_A	394_L	0.652	0.18
90_I	272_H	0.650	0.18
84_M	275_C	0.650	0.18
256_L	259_V	0.649	0.18
36_S	139_D	0.649	0.18
179_T	216_E	0.648	0.18
247_C	444_L	0.648	0.18
141_A	383_F	0.648	0.18
85_G	247_C	0.648	0.18
120_D	182_S	0.648	0.18
49_T	200_A	0.648	0.18
14_D	208_V	0.647	0.18
5_T	219_H	0.647	0.18
212_C	266_H	0.644	0.18
132_T	385_D	0.644	0.18
395_A	406_L	0.644	0.18
179_T	341_A	0.643	0.18
50_G	200_A	0.641	0.18
103_Y	378_L	0.641	0.18
190_I	413_A	0.641	0.18
346_A	390_D	0.641	0.18
361_Q	381_F	0.640	0.17
157_E	161_R	0.640	0.17
347_N	355_R	0.639	0.17
79_A	242_S	0.638	0.17
133_P	439_H	0.637	0.17
403_P	406_L	0.637	0.17
41_V	433_E	0.636	0.17
321_R	403_P	0.636	0.17
86_F	441_S	0.636	0.17
21_E	25_A	0.636	0.17
346_A	352_H	0.635	0.17
370_E	412_T	0.635	0.17
241_L	311_Y	0.634	0.17
78_V	153_N	0.634	0.17
101_V	137_P	0.634	0.17
168_A	203_I	0.633	0.17
326_L	345_D	0.633	0.17
182_S	378_L	0.632	0.17
103_Y	396_L	0.632	0.17
120_D	382_A	0.631	0.17
120_D	180_N	0.631	0.17
230_H	445_Q	0.631	0.17
341_A	441_S	0.630	0.17
351_P	437_L	0.630	0.17
103_Y	120_D	0.629	0.17
25_A	433_E	0.629	0.17
78_V	199_F	0.628	0.17
115_N	408_H	0.628	0.17
247_C	262_F	0.627	0.17
365_C	369_R	0.627	0.17
73_F	373_V	0.624	0.17
300_A	322_L	0.624	0.17
8_M	60_M	0.624	0.17
53_S	68_A	0.622	0.17
212_C	376_V	0.621	0.17
377_E	392_V	0.620	0.17
316_V	319_V	0.618	0.17
79_A	83_V	0.617	0.17
183_M	343_Y	0.617	0.17
188_V	311_Y	0.617	0.17
92_A	221_V	0.616	0.17
375_A	392_V	0.616	0.17
113_V	370_E	0.616	0.17
176_L	196_V	0.616	0.17
73_F	370_E	0.616	0.17
258_N	342_V	0.615	0.17
15_T	39_V	0.614	0.17
29_H	444_L	0.614	0.17
227_G	331_V	0.613	0.17
97_G	395_A	0.613	0.17
5_T	10_D	0.613	0.17
175_V	212_C	0.612	0.17
143_D	146_T	0.612	0.17
364_V	375_A	0.612	0.17
367_L	412_T	0.612	0.17
97_G	159_A	0.610	0.17
147_D	232_S	0.609	0.17
111_D	262_F	0.609	0.17
274_Q	277_Q	0.608	0.17
212_C	434_L	0.608	0.17
198_A	227_G	0.607	0.16
12_I	26_D	0.607	0.16
58_A	198_A	0.606	0.16
318_Q	396_L	0.605	0.16
329_R	409_V	0.605	0.16
101_V	430_S	0.604	0.16
186_Q	379_G	0.603	0.16
246_A	265_L	0.602	0.16
352_H	362_A	0.600	0.16
200_A	207_F	0.600	0.16
154_F	207_F	0.598	0.16
179_T	405_H	0.596	0.16
45_T	345_D	0.596	0.16
219_H	223_Q	0.596	0.16
40_A	54_N	0.596	0.16
278_R	394_L	0.595	0.16
164_D	194_R	0.595	0.16
333_I	337_A	0.594	0.16
199_F	369_R	0.593	0.16
92_A	391_L	0.592	0.16
13_E	40_A	0.591	0.16
319_V	396_L	0.590	0.16
159_A	196_V	0.590	0.16
271_L	394_L	0.589	0.16
312_V	439_H	0.588	0.16
228_Y	240_Q	0.588	0.16
212_C	382_A	0.585	0.16
65_E	252_K	0.584	0.16
295_D	323_A	0.584	0.16
191_E	226_P	0.584	0.16
7_T	323_A	0.583	0.16
219_H	239_E	0.582	0.16
212_C	392_V	0.582	0.16
334_Y	391_L	0.578	0.16
120_D	280_I	0.578	0.16
168_A	171_V	0.578	0.16
159_A	184_A	0.575	0.16
194_R	243_Y	0.575	0.16
72_S	135_D	0.575	0.16
237_A	307_V	0.575	0.16
136_C	162_V	0.574	0.16
76_L	282_Y	0.573	0.16
192_N	290_G	0.573	0.16
177_T	378_L	0.572	0.15
24_L	39_V	0.572	0.15
333_I	380_R	0.571	0.15
18_A	195_E	0.570	0.15
315_R	340_H	0.570	0.15
175_V	208_V	0.570	0.15
82_D	238_R	0.569	0.15
249_M	405_H	0.569	0.15
319_V	403_P	0.568	0.15
226_P	444_L	0.568	0.15
73_F	265_L	0.566	0.15
10_D	65_E	0.566	0.15
56_Q	305_E	0.565	0.15
165_D	169_D	0.565	0.15
325_A	328_D	0.565	0.15
50_G	341_A	0.565	0.15
128_A	432_P	0.564	0.15
154_F	234_A	0.563	0.15
252_K	258_N	0.563	0.15
133_P	378_L	0.563	0.15
32_F	379_G	0.562	0.15
376_V	439_H	0.561	0.15
164_D	419_R	0.560	0.15
292_S	368_Y	0.559	0.15
117_A	355_R	0.559	0.15
349_A	421_T	0.558	0.15
78_V	81_E	0.558	0.15
66_A	431_E	0.557	0.15
89_I	135_D	0.557	0.15
109_A	230_H	0.557	0.15
66_A	280_I	0.556	0.15
228_Y	354_P	0.555	0.15
305_E	399_R	0.555	0.15
149_P	224_R	0.554	0.15
180_N	439_H	0.554	0.15
73_F	131_A	0.554	0.15
349_A	355_R	0.554	0.15
113_V	126_V	0.554	0.15
314_E	441_S	0.554	0.15
16_S	272_H	0.553	0.15
45_T	368_Y	0.552	0.15
274_Q	324_D	0.552	0.15
92_A	277_Q	0.552	0.15
344_I	434_L	0.548	0.15
49_T	216_E	0.548	0.15
198_A	274_Q	0.548	0.15
120_D	312_V	0.545	0.15
261_G	294_R	0.545	0.15
25_A	29_H	0.543	0.15
140_G	150_F	0.542	0.15
198_A	273_E	0.540	0.15
177_T	312_V	0.540	0.15
263_V	422_D	0.539	0.15
358_F	380_R	0.539	0.15
134_V	166_V	0.538	0.15
252_K	293_G	0.537	0.15
362_A	434_L	0.536	0.14
43_L	340_H	0.536	0.14
141_A	363_F	0.536	0.14
120_D	212_C	0.536	0.14
93_H	399_R	0.535	0.14
103_Y	221_V	0.535	0.14
172_P	383_F	0.534	0.14
8_M	421_T	0.534	0.14
161_R	227_G	0.533	0.14
146_T	219_H	0.532	0.14
328_D	418_E	0.531	0.14
157_E	160_R	0.531	0.14
352_H	359_P	0.531	0.14
39_V	45_T	0.530	0.14
126_V	420_G	0.529	0.14
343_Y	383_F	0.529	0.14
140_G	146_T	0.528	0.14
14_D	310_P	0.527	0.14
173_V	197_A	0.527	0.14
108_S	421_T	0.526	0.14
214_F	306_A	0.525	0.14
147_D	324_D	0.524	0.14
165_D	198_A	0.524	0.14
66_A	241_L	0.524	0.14
86_F	209_I	0.523	0.14
26_D	170_A	0.523	0.14
276_R	286_S	0.523	0.14
65_E	258_N	0.522	0.14
331_V	373_V	0.520	0.14
139_D	201_D	0.520	0.14
25_A	74_E	0.519	0.14
254_D	340_H	0.517	0.14
337_A	395_A	0.516	0.14
112_T	170_A	0.515	0.14
37_D	171_V	0.515	0.14
26_D	226_P	0.514	0.14
244_A	434_L	0.513	0.14
223_Q	274_Q	0.513	0.14
246_A	279_G	0.513	0.14
212_C	262_F	0.511	0.14
115_N	180_N	0.510	0.14
58_A	388_R	0.510	0.14
112_T	203_I	0.510	0.14
302_G	398_R	0.510	0.14
112_T	353_L	0.509	0.14
105_A	274_Q	0.508	0.14
212_C	380_R	0.508	0.14
252_K	315_R	0.508	0.14
18_A	21_E	0.508	0.14
230_H	320_Q	0.507	0.14
178_I	188_V	0.507	0.14
57_W	345_D	0.507	0.14
326_L	339_G	0.507	0.14
246_A	311_Y	0.506	0.14
104_G	247_C	0.505	0.14
357_Q	427_E	0.504	0.14
135_D	180_N	0.504	0.14
157_E	169_D	0.504	0.14
61_L	232_S	0.503	0.14
388_R	418_E	0.503	0.14
70_S	431_E	0.503	0.14
148_A	153_N	0.503	0.14
14_D	40_A	0.502	0.14
191_E	223_Q	0.502	0.14
4_H	8_M	0.502	0.14
138_V	153_N	0.501	0.14
214_F	218_A	0.501	0.14
75_D	301_V	0.501	0.14
188_V	241_L	0.500	0.14
69_G	390_D	0.500	0.14
314_E	349_A	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2ez2A	4	0.9911	100	0.685	Contact Map
2oqxA	4	0.9844	100	0.694	Contact Map
1ax4A	4	0.9911	100	0.752	Contact Map
4iw7A	2	0.7143	100	0.861	Contact Map
1jg8A	4	0.7411	100	0.865	Contact Map
4lnjA	4	0.7165	99.9	0.885	Contact Map
1v72A	4	0.7277	99.9	0.888	Contact Map
3wgcA	4	0.7143	99.9	0.888	Contact Map
3b46A	2	0.8571	99.9	0.889	Contact Map
1svvA	4	0.7277	99.9	0.892	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0126 seconds.