Q9HMF6 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HMF6 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HMF6	Sequences: MVVPLSDGHTGLALNDNIYNRRVVMRTPTRVTPTPTDPSTFLFPVEEAARVHTDRLTTAKPSMVFLRDDATGDPLDALTEPQSVTVSHDDPRLLEFQTPVRTYVRVPGGTTTTVTMTLDDVTVSFPDAHDLQIGVRSQHSHPIGEITTTTDPVDVMAAVEQFGAALQTPSPERSWPTLRGHPPRLTVGQPDSTTHSLSRPDVDVTVGVPPELGAVYAVTPLAFYLGARLEPSSTPSVTAGGHQIATFPRDTLGRAAGALLKHVFTLDCVVRSVGLYDLDTPARDTLTAAFDWTRDDLQRLYDMPLAARLQAYTEYPQETVLAAAPRWRHTVMVADDPRPIEHLSFLANDLAVVRTLPDATPDSAPALSAAVDEFMRSTTDTASDTRGHGVIPDEFVAVPETDTMETSYIGPGVPVGNTKLIADAYDARFSHSSTDSVSVNVVCNEDDMWDEYSEFSLYGNRDGLEFDVSVTRNATRAELADVLTSMGDTDFFHYIGHVRDGTQFVCTDGALSFDQIAATTTPPRVFLLNGCSSYELGRAFIDAGSQAGIITVRPIGNDAAMLIGQNIARFVNQGFSPRSALAIVQRYGRADDKYMVLGDGGYQVAQSKSGIPVVAHLTTASSDSSQRYRFSVEMFPSEHDSLGGIYSPNFDALSQQLYAGCTPTVTAAAQEVQSFLDLDSQMPVVLDGSLHWAPPLEVSPCSTDP	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	705 (666)
Sequences:	137 (111)
Seq/√Len:	4.3

HALSA - Q9HMF6 Q9HPP7 Q9HPY6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
208_V	218_V	5.991	0.99
149_T	154_D	4.734	0.94
331_V	351_A	3.733	0.81
107_P	111_T	3.562	0.78
317_Q	545_S	3.468	0.76
150_T	187_V	3.327	0.73
206_V	218_V	3.194	0.69
155_V	212_L	2.951	0.63
474_A	482_V	2.934	0.62
345_F	426_D	2.890	0.61
204_V	305_L	2.843	0.60
483_L	576_S	2.822	0.59
171_P	308_R	2.819	0.59
147_T	188_G	2.787	0.58
59_A	693_A	2.775	0.58
146_I	161_Q	2.741	0.57
208_V	308_R	2.720	0.56
156_M	231_P	2.645	0.54
151_D	154_D	2.628	0.53
217_A	220_P	2.574	0.52
208_V	252_L	2.566	0.51
214_A	217_A	2.564	0.51
13_A	22_R	2.527	0.50
218_V	237_V	2.515	0.50
311_A	541_I	2.500	0.50
411_P	421_I	2.406	0.47
444_N	448_M	2.405	0.47
444_N	451_E	2.328	0.44
309_L	687_D	2.306	0.44
512_S	536_L	2.304	0.44
149_T	269_V	2.303	0.44
528_L	540_F	2.268	0.43
184_R	345_F	2.254	0.42
146_I	314_E	2.250	0.42
547_A	577_P	2.200	0.41
334_A	541_I	2.172	0.40
497_H	529_N	2.124	0.38
208_V	229_L	2.123	0.38
11_G	27_T	2.111	0.38
44_P	180_G	2.106	0.38
597_L	676_L	2.095	0.38
419_K	534_Y	2.062	0.37
497_H	594_Y	2.056	0.36
448_M	451_E	2.046	0.36
101_R	136_R	2.042	0.36
444_N	531_C	2.039	0.36
315_Y	690_L	2.025	0.36
111_T	566_N	2.020	0.35
531_C	564_G	2.013	0.35
497_H	564_G	2.009	0.35
497_H	531_C	2.005	0.35
112_T	653_L	2.005	0.35
44_P	142_P	1.998	0.35
178_L	557_N	1.995	0.35
340_I	357_P	1.986	0.35
529_N	533_S	1.969	0.34
163_G	347_A	1.956	0.34
235_P	238_T	1.951	0.34
101_R	177_T	1.901	0.32
528_L	545_S	1.899	0.32
14_L	429_F	1.889	0.32
258_A	439_V	1.884	0.32
497_H	533_S	1.877	0.32
208_V	237_V	1.877	0.32
272_S	283_R	1.874	0.32
531_C	551_T	1.853	0.31
149_T	290_F	1.846	0.31
103_Y	557_N	1.844	0.31
181_H	345_F	1.837	0.31
526_F	594_Y	1.824	0.30
151_D	172_E	1.815	0.30
206_V	547_A	1.808	0.30
255_A	308_R	1.803	0.30
102_T	232_S	1.792	0.29
451_E	531_C	1.779	0.29
12_L	340_I	1.773	0.29
87_S	174_S	1.772	0.29
160_E	490_D	1.771	0.29
228_R	541_I	1.763	0.29
127_D	216_Y	1.752	0.28
274_G	301_Y	1.752	0.28
301_Y	606_Q	1.736	0.28
458_Y	548_G	1.734	0.28
444_N	533_S	1.721	0.28
444_N	529_N	1.711	0.27
94_L	309_L	1.707	0.27
12_L	208_V	1.707	0.27
529_N	564_G	1.705	0.27
451_E	497_H	1.701	0.27
531_C	594_Y	1.697	0.27
497_H	560_A	1.694	0.27
549_I	587_Y	1.689	0.27
206_V	632_V	1.684	0.27
637_S	690_L	1.669	0.26
160_E	169_P	1.668	0.26
251_T	307_A	1.667	0.26
41_F	216_Y	1.667	0.26
207_G	662_T	1.661	0.26
444_N	497_H	1.651	0.26
529_N	560_A	1.651	0.26
220_P	241_G	1.650	0.26
175_W	455_F	1.647	0.26
545_S	567_I	1.647	0.26
462_D	653_L	1.645	0.26
270_V	308_R	1.642	0.26
451_E	533_S	1.640	0.26
128_A	306_A	1.627	0.26
139_H	180_G	1.619	0.25
124_S	146_I	1.615	0.25
197_L	206_V	1.614	0.25
531_C	560_A	1.609	0.25
258_A	287_T	1.605	0.25
144_G	321_L	1.605	0.25
159_V	219_T	1.604	0.25
46_E	353_V	1.598	0.25
169_P	206_V	1.596	0.25
419_K	467_D	1.592	0.25
202_V	226_G	1.587	0.25
617_L	630_F	1.585	0.25
286_L	580_A	1.573	0.24
444_N	564_G	1.573	0.24
197_L	355_T	1.570	0.24
146_I	150_T	1.570	0.24
155_V	162_F	1.563	0.24
86_V	216_Y	1.554	0.24
61_P	98_T	1.554	0.24
231_P	251_T	1.554	0.24
139_H	143_I	1.553	0.24
146_I	322_A	1.548	0.24
457_L	556_G	1.546	0.24
298_Q	688_G	1.543	0.24
147_T	291_D	1.527	0.23
41_F	200_P	1.524	0.23
73_D	201_D	1.523	0.23
630_F	675_F	1.521	0.23
43_F	99_P	1.501	0.23
252_L	492_F	1.497	0.23
346_L	422_A	1.496	0.23
451_E	529_N	1.490	0.23
108_G	541_I	1.490	0.23
533_S	564_G	1.475	0.22
268_C	529_N	1.472	0.22
184_R	237_V	1.471	0.22
268_C	533_S	1.471	0.22
417_N	575_F	1.470	0.22
174_S	224_Y	1.461	0.22
305_L	583_I	1.458	0.22
25_M	525_V	1.452	0.22
333_V	356_L	1.452	0.22
156_M	346_L	1.451	0.22
126_P	315_Y	1.450	0.22
533_S	560_A	1.444	0.22
117_T	175_W	1.440	0.21
171_P	188_G	1.438	0.21
120_D	146_I	1.436	0.21
237_V	672_V	1.432	0.21
155_V	208_V	1.430	0.21
529_N	594_Y	1.430	0.21
441_V	491_F	1.426	0.21
162_F	208_V	1.425	0.21
332_M	427_A	1.423	0.21
223_F	441_V	1.423	0.21
584_V	688_G	1.416	0.21
533_S	594_Y	1.413	0.21
46_E	133_I	1.409	0.21
564_G	594_Y	1.407	0.21
526_F	531_C	1.406	0.21
496_G	509_G	1.405	0.21
450_D	584_V	1.403	0.21
162_F	275_L	1.402	0.21
311_A	665_V	1.402	0.21
353_V	483_L	1.399	0.21
247_F	351_A	1.398	0.21
530_G	540_F	1.392	0.21
483_L	686_L	1.387	0.20
225_L	479_L	1.379	0.20
175_W	498_V	1.368	0.20
174_S	693_A	1.354	0.20
458_Y	493_H	1.350	0.20
111_T	155_V	1.345	0.20
185_L	211_E	1.344	0.20
448_M	531_C	1.339	0.19
450_D	530_G	1.338	0.19
243_Q	360_T	1.337	0.19
211_E	214_A	1.335	0.19
56_L	500_D	1.331	0.19
318_E	477_A	1.327	0.19
458_Y	506_C	1.325	0.19
444_N	534_Y	1.322	0.19
209_P	511_L	1.320	0.19
618_T	631_S	1.320	0.19
98_T	411_P	1.319	0.19
526_F	529_N	1.318	0.19
155_V	468_V	1.317	0.19
268_C	451_E	1.316	0.19
532_S	549_I	1.315	0.19
483_L	614_V	1.312	0.19
529_N	551_T	1.310	0.19
139_H	167_Q	1.310	0.19
560_A	594_Y	1.308	0.19
222_A	688_G	1.306	0.19
557_N	561_M	1.304	0.19
529_N	568_A	1.302	0.19
448_M	533_S	1.296	0.19
317_Q	543_A	1.296	0.19
444_N	594_Y	1.287	0.19
497_H	548_G	1.282	0.18
425_Y	475_T	1.281	0.18
468_V	576_S	1.275	0.18
271_R	537_G	1.272	0.18
477_A	480_A	1.272	0.18
94_L	677_D	1.257	0.18
427_A	464_L	1.254	0.18
497_H	526_F	1.252	0.18
270_V	297_L	1.251	0.18
181_H	575_F	1.251	0.18
262_H	565_Q	1.249	0.18
298_Q	483_L	1.245	0.18
240_G	298_Q	1.244	0.18
67_R	95_E	1.242	0.18
105_R	308_R	1.242	0.18
123_V	321_L	1.237	0.18
92_R	223_F	1.235	0.18
209_P	506_C	1.235	0.18
533_S	568_A	1.234	0.18
11_G	31_V	1.232	0.18
522_P	525_V	1.231	0.18
175_W	217_A	1.229	0.18
531_C	534_Y	1.224	0.17
128_A	583_I	1.216	0.17
175_W	239_A	1.214	0.17
268_C	497_H	1.214	0.17
241_G	311_A	1.213	0.17
373_E	691_H	1.212	0.17
185_L	502_T	1.208	0.17
44_P	136_R	1.208	0.17
336_D	523_P	1.207	0.17
139_H	178_L	1.201	0.17
303_M	453_S	1.201	0.17
376_R	575_F	1.194	0.17
362_D	366_A	1.188	0.17
197_L	208_V	1.184	0.17
605_A	609_S	1.184	0.17
201_D	214_A	1.183	0.17
277_D	492_F	1.182	0.17
84_V	165_A	1.180	0.17
162_F	185_L	1.180	0.17
177_T	341_E	1.178	0.17
246_T	340_I	1.178	0.17
48_A	66_L	1.174	0.17
506_C	528_L	1.174	0.17
208_V	228_R	1.174	0.17
136_R	177_T	1.173	0.17
111_T	483_L	1.166	0.16
328_R	403_T	1.165	0.16
448_M	497_H	1.164	0.16
683_P	692_W	1.164	0.16
167_Q	571_V	1.161	0.16
331_V	514_D	1.157	0.16
124_S	632_V	1.156	0.16
115_T	547_A	1.153	0.16
330_T	333_V	1.152	0.16
540_F	545_S	1.150	0.16
435_D	475_T	1.150	0.16
204_V	583_I	1.144	0.16
181_H	557_N	1.143	0.16
181_H	474_A	1.142	0.16
148_T	207_G	1.141	0.16
451_E	594_Y	1.139	0.16
503_Q	528_L	1.139	0.16
253_G	355_T	1.139	0.16
497_H	551_T	1.138	0.16
110_T	597_L	1.137	0.16
123_V	302_D	1.137	0.16
125_F	684_V	1.136	0.16
419_K	444_N	1.128	0.16
101_R	321_L	1.127	0.16
126_P	146_I	1.126	0.16
526_F	533_S	1.125	0.16
181_H	635_F	1.124	0.16
451_E	564_G	1.123	0.16
560_A	564_G	1.123	0.16
157_A	432_S	1.118	0.16
318_E	435_D	1.115	0.16
100_V	585_Q	1.111	0.16
427_A	561_M	1.110	0.16
41_F	416_G	1.108	0.15
200_P	226_G	1.108	0.15
468_V	580_A	1.108	0.15
201_D	279_D	1.101	0.15
148_T	545_S	1.101	0.15
353_V	581_L	1.101	0.15
370_A	527_L	1.099	0.15
129_H	672_V	1.099	0.15
350_L	683_P	1.099	0.15
594_Y	692_W	1.099	0.15
23_V	259_L	1.095	0.15
153_V	619_T	1.093	0.15
260_L	574_G	1.091	0.15
333_V	429_F	1.091	0.15
34_T	230_E	1.087	0.15
329_H	534_Y	1.087	0.15
268_C	531_C	1.083	0.15
459_G	466_F	1.082	0.15
19_Y	483_L	1.079	0.15
169_P	420_L	1.078	0.15
209_P	528_L	1.078	0.15
19_Y	139_H	1.076	0.15
551_T	564_G	1.074	0.15
328_R	351_A	1.069	0.15
242_H	308_R	1.065	0.15
168_T	180_G	1.064	0.15
376_R	448_M	1.063	0.15
448_M	529_N	1.061	0.15
526_F	568_A	1.060	0.15
318_E	696_L	1.057	0.15
476_R	507_T	1.049	0.15
411_P	667_A	1.048	0.15
129_H	199_R	1.047	0.15
335_D	541_I	1.047	0.15
653_L	695_P	1.046	0.15
101_R	174_S	1.042	0.14
533_S	551_T	1.042	0.14
458_Y	496_G	1.041	0.14
444_N	560_A	1.041	0.14
573_Q	695_P	1.037	0.14
503_Q	540_F	1.036	0.14
191_D	306_A	1.032	0.14
107_P	566_N	1.031	0.14
449_W	583_I	1.028	0.14
246_T	476_R	1.028	0.14
146_I	502_T	1.021	0.14
17_N	473_N	1.020	0.14
341_E	483_L	1.020	0.14
459_G	547_A	1.020	0.14
90_D	597_L	1.019	0.14
16_D	44_P	1.018	0.14
320_V	324_A	1.015	0.14
594_Y	683_P	1.015	0.14
299_R	690_L	1.014	0.14
551_T	594_Y	1.012	0.14
529_N	548_G	1.010	0.14
191_D	672_V	1.007	0.14
628_Y	650_F	1.006	0.14
402_D	410_G	1.006	0.14
159_V	484_T	1.004	0.14
229_L	672_V	1.002	0.14
439_V	668_A	1.001	0.14
427_A	465_E	0.999	0.14
157_A	191_D	0.998	0.14
105_R	499_R	0.998	0.14
628_Y	669_A	0.997	0.14
423_D	539_A	0.995	0.14
511_L	580_A	0.992	0.14
374_F	448_M	0.991	0.14
53_T	566_N	0.991	0.14
458_Y	497_H	0.991	0.14
220_P	424_A	0.987	0.14
56_L	71_T	0.986	0.14
239_A	561_M	0.985	0.14
155_V	478_E	0.985	0.14
459_G	512_S	0.984	0.14
219_T	479_L	0.983	0.14
154_D	162_F	0.980	0.14
448_M	557_N	0.980	0.14
220_P	286_L	0.979	0.14
408_Y	529_N	0.978	0.14
493_H	548_G	0.978	0.14
526_F	548_G	0.974	0.13
268_C	448_M	0.971	0.13
455_F	498_V	0.970	0.13
345_F	557_N	0.968	0.13
217_A	239_A	0.967	0.13
444_N	526_F	0.967	0.13
53_T	228_R	0.966	0.13
200_P	216_Y	0.964	0.13
98_T	254_R	0.961	0.13
266_L	343_L	0.961	0.13
408_Y	531_C	0.958	0.13
626_Q	687_D	0.958	0.13
328_R	604_V	0.957	0.13
254_R	353_V	0.956	0.13
107_P	204_V	0.956	0.13
147_T	150_T	0.956	0.13
224_Y	550_I	0.950	0.13
239_A	265_T	0.950	0.13
152_P	424_A	0.949	0.13
451_E	560_A	0.948	0.13
362_D	392_P	0.948	0.13
79_T	195_H	0.948	0.13
195_H	676_L	0.948	0.13
534_Y	690_L	0.947	0.13
306_A	683_P	0.947	0.13
136_R	272_S	0.946	0.13
371_V	375_M	0.946	0.13
202_V	467_D	0.945	0.13
621_S	654_S	0.945	0.13
48_A	224_Y	0.943	0.13
180_G	265_T	0.943	0.13
376_R	444_N	0.941	0.13
137_S	160_E	0.940	0.13
308_R	381_T	0.939	0.13
351_A	483_L	0.937	0.13
106_V	351_A	0.935	0.13
533_S	548_G	0.935	0.13
448_M	564_G	0.934	0.13
84_V	605_A	0.933	0.13
185_L	605_A	0.933	0.13
72_G	105_R	0.932	0.13
407_S	519_T	0.931	0.13
191_D	635_F	0.930	0.13
412_G	450_D	0.929	0.13
211_E	304_P	0.928	0.13
159_V	236_S	0.927	0.13
467_D	532_S	0.925	0.13
103_Y	437_V	0.925	0.13
188_G	425_Y	0.924	0.13
424_A	464_L	0.923	0.13
14_L	144_G	0.921	0.13
67_R	141_H	0.920	0.13
531_C	557_N	0.920	0.13
317_Q	439_V	0.917	0.13
68_D	604_V	0.916	0.13
296_D	426_D	0.916	0.13
449_W	660_G	0.915	0.13
301_Y	551_T	0.911	0.13
87_S	527_L	0.909	0.13
265_T	561_M	0.907	0.13
125_F	682_M	0.906	0.13
555_I	594_Y	0.906	0.13
162_F	216_Y	0.905	0.13
55_R	172_E	0.902	0.13
291_D	441_V	0.900	0.12
52_H	109_G	0.899	0.12
479_L	506_C	0.897	0.12
55_R	86_V	0.896	0.12
192_S	259_L	0.895	0.12
575_F	594_Y	0.894	0.12
668_A	671_E	0.893	0.12
36_T	53_T	0.892	0.12
181_H	448_M	0.892	0.12
374_F	444_N	0.891	0.12
424_A	596_V	0.889	0.12
303_M	601_G	0.889	0.12
533_S	557_N	0.885	0.12
181_H	209_P	0.884	0.12
100_V	286_L	0.881	0.12
14_L	292_W	0.880	0.12
330_T	354_R	0.880	0.12
444_N	557_N	0.879	0.12
247_F	251_T	0.879	0.12
499_R	525_V	0.879	0.12
166_L	466_F	0.878	0.12
216_Y	232_S	0.876	0.12
493_H	496_G	0.876	0.12
533_S	537_G	0.875	0.12
12_L	264_F	0.874	0.12
418_T	498_V	0.874	0.12
496_G	692_W	0.874	0.12
523_P	527_L	0.872	0.12
56_L	86_V	0.866	0.12
125_F	225_L	0.866	0.12
95_E	440_N	0.865	0.12
46_E	194_T	0.864	0.12
190_P	672_V	0.863	0.12
617_L	675_F	0.862	0.12
496_G	683_P	0.858	0.12
497_H	534_Y	0.857	0.12
529_N	534_Y	0.856	0.12
170_S	414_P	0.855	0.12
56_L	228_R	0.855	0.12
89_D	649_N	0.855	0.12
332_M	561_M	0.855	0.12
11_G	165_A	0.853	0.12
185_L	483_L	0.852	0.12
11_G	169_P	0.851	0.12
654_S	687_D	0.851	0.12
258_A	691_H	0.851	0.12
109_G	306_A	0.849	0.12
112_T	318_E	0.849	0.12
411_P	518_A	0.848	0.12
531_C	568_A	0.848	0.12
50_R	130_D	0.848	0.12
468_V	671_E	0.847	0.12
252_L	359_A	0.847	0.12
268_C	594_Y	0.846	0.12
11_G	17_N	0.845	0.12
555_I	560_A	0.844	0.12
46_E	53_T	0.843	0.12
280_T	467_D	0.842	0.12
506_C	548_G	0.841	0.12
110_T	513_F	0.841	0.12
246_T	530_G	0.841	0.12
666_T	670_Q	0.840	0.12
52_H	193_T	0.838	0.12
448_M	534_Y	0.838	0.12
145_E	274_G	0.838	0.12
191_D	309_L	0.837	0.12
217_A	241_G	0.837	0.12
548_G	692_W	0.837	0.12
546_Q	559_A	0.837	0.12
135_V	431_H	0.836	0.12
459_G	572_N	0.836	0.12
34_T	340_I	0.835	0.12
20_N	546_Q	0.834	0.12
482_V	619_T	0.833	0.12
189_Q	192_S	0.831	0.12
144_G	171_P	0.829	0.12
408_Y	606_Q	0.824	0.12
444_N	551_T	0.824	0.12
262_H	541_I	0.822	0.11
103_Y	177_T	0.821	0.11
470_V	696_L	0.821	0.11
555_I	603_Q	0.821	0.11
241_G	668_A	0.821	0.11
497_H	568_A	0.821	0.11
136_R	181_H	0.820	0.11
419_K	448_M	0.819	0.11
58_T	612_P	0.819	0.11
28_P	35_P	0.818	0.11
472_R	505_V	0.818	0.11
597_L	643_G	0.817	0.11
103_Y	180_G	0.815	0.11
98_T	596_V	0.814	0.11
546_Q	596_V	0.814	0.11
224_Y	563_I	0.813	0.11
496_G	526_F	0.813	0.11
191_D	427_A	0.812	0.11
458_Y	529_N	0.812	0.11
12_L	79_T	0.812	0.11
458_Y	531_C	0.812	0.11
444_N	474_A	0.812	0.11
158_A	183_P	0.811	0.11
109_G	191_D	0.811	0.11
290_F	470_V	0.811	0.11
329_H	529_N	0.811	0.11
198_S	206_V	0.809	0.11
19_Y	577_P	0.809	0.11
298_Q	500_D	0.809	0.11
112_T	439_V	0.806	0.11
121_V	213_G	0.806	0.11
509_G	526_F	0.805	0.11
109_G	243_Q	0.805	0.11
557_N	564_G	0.805	0.11
320_V	677_D	0.804	0.11
498_V	556_G	0.803	0.11
475_T	552_V	0.802	0.11
444_N	568_A	0.801	0.11
121_V	538_R	0.800	0.11
160_E	164_A	0.800	0.11
537_G	594_Y	0.799	0.11
262_H	626_Q	0.799	0.11
399_P	409_I	0.797	0.11
91_P	368_S	0.796	0.11
70_A	477_A	0.796	0.11
568_A	594_Y	0.795	0.11
401_T	667_A	0.792	0.11
131_L	189_Q	0.792	0.11
324_A	518_A	0.791	0.11
165_A	468_V	0.791	0.11
159_V	213_G	0.789	0.11
185_L	320_V	0.789	0.11
216_Y	530_G	0.788	0.11
90_D	507_T	0.787	0.11
193_T	320_V	0.785	0.11
44_P	274_G	0.784	0.11
107_P	695_P	0.784	0.11
209_P	479_L	0.782	0.11
290_F	595_M	0.780	0.11
135_V	202_V	0.780	0.11
233_S	567_I	0.779	0.11
491_F	542_D	0.778	0.11
207_G	231_P	0.776	0.11
160_E	168_T	0.774	0.11
275_L	347_A	0.773	0.11
531_C	548_G	0.773	0.11
576_S	579_S	0.772	0.11
137_S	162_F	0.770	0.11
268_C	564_G	0.768	0.11
108_G	155_V	0.768	0.11
127_D	251_T	0.766	0.11
181_H	444_N	0.765	0.11
209_P	458_Y	0.765	0.11
617_L	668_A	0.763	0.11
186_T	274_G	0.761	0.11
259_L	480_A	0.761	0.11
427_A	498_V	0.760	0.11
526_F	551_T	0.760	0.11
108_G	356_L	0.758	0.11
537_G	551_T	0.758	0.11
301_Y	451_E	0.757	0.11
495_I	530_G	0.757	0.11
28_P	228_R	0.756	0.11
23_V	42_L	0.756	0.11
63_M	461_R	0.756	0.11
336_D	546_Q	0.756	0.11
146_I	162_F	0.753	0.11
302_D	387_G	0.752	0.11
146_I	199_R	0.751	0.11
237_V	479_L	0.751	0.11
208_V	348_N	0.750	0.11
250_D	621_S	0.750	0.11
455_F	550_I	0.749	0.11
45_V	660_G	0.747	0.11
258_A	557_N	0.747	0.11
54_D	237_V	0.747	0.11
166_L	443_C	0.747	0.11
94_L	170_S	0.747	0.11
532_S	547_A	0.746	0.11
308_R	473_N	0.745	0.11
525_V	532_S	0.745	0.11
523_P	584_V	0.744	0.11
537_G	560_A	0.743	0.11
209_P	444_N	0.743	0.11
485_S	553_R	0.743	0.11
56_L	473_N	0.741	0.11
462_D	495_I	0.741	0.11
496_G	594_Y	0.741	0.11
87_S	469_S	0.741	0.11
159_V	217_A	0.740	0.11
165_A	405_E	0.740	0.11
320_V	347_A	0.740	0.11
86_V	153_V	0.739	0.11
161_Q	347_A	0.739	0.11
493_H	506_C	0.739	0.11
264_F	509_G	0.737	0.10
408_Y	497_H	0.737	0.10
87_S	92_R	0.736	0.10
268_C	560_A	0.736	0.10
569_R	670_Q	0.735	0.10
153_V	340_I	0.735	0.10
214_A	220_P	0.735	0.10
251_T	462_D	0.733	0.10
103_Y	136_R	0.733	0.10
90_D	131_L	0.732	0.10
540_F	548_G	0.731	0.10
136_R	178_L	0.730	0.10
349_D	474_A	0.728	0.10
126_P	302_D	0.726	0.10
229_L	261_K	0.724	0.10
171_P	296_D	0.724	0.10
239_A	541_I	0.723	0.10
290_F	661_C	0.723	0.10
458_Y	564_G	0.723	0.10
513_F	525_V	0.723	0.10
82_Q	617_L	0.722	0.10
246_T	612_P	0.722	0.10
326_R	667_A	0.722	0.10
52_H	665_V	0.722	0.10
184_R	426_D	0.722	0.10
353_V	632_V	0.721	0.10
414_P	419_K	0.721	0.10
307_A	673_Q	0.720	0.10
230_E	680_S	0.717	0.10
314_E	566_N	0.717	0.10
35_P	507_T	0.716	0.10
130_D	372_D	0.716	0.10
93_L	342_H	0.715	0.10
125_F	696_L	0.714	0.10
146_I	347_A	0.714	0.10
269_V	416_G	0.714	0.10
161_Q	199_R	0.712	0.10
217_A	362_D	0.712	0.10
167_Q	519_T	0.712	0.10
243_Q	309_L	0.711	0.10
458_Y	528_L	0.711	0.10
143_I	341_E	0.710	0.10
351_A	614_V	0.709	0.10
162_F	436_S	0.708	0.10
418_T	545_S	0.707	0.10
531_C	537_G	0.706	0.10
53_T	156_M	0.706	0.10
245_A	279_D	0.705	0.10
648_P	684_V	0.705	0.10
144_G	426_D	0.703	0.10
457_L	588_G	0.702	0.10
551_T	560_A	0.702	0.10
283_R	287_T	0.700	0.10
14_L	336_D	0.700	0.10
159_V	465_E	0.700	0.10
281_P	347_A	0.699	0.10
448_M	594_Y	0.699	0.10
11_G	233_S	0.699	0.10
660_G	666_T	0.699	0.10
157_A	346_L	0.698	0.10
129_H	311_A	0.697	0.10
216_Y	582_A	0.697	0.10
146_I	185_L	0.696	0.10
420_L	503_Q	0.695	0.10
89_D	150_T	0.694	0.10
129_H	233_S	0.693	0.10
401_T	556_G	0.692	0.10
526_F	540_F	0.690	0.10
41_F	204_V	0.688	0.10
204_V	349_D	0.687	0.10
148_T	572_N	0.687	0.10
203_D	368_S	0.687	0.10
172_E	274_G	0.686	0.10
175_W	320_V	0.684	0.10
207_G	311_A	0.684	0.10
86_V	125_F	0.684	0.10
403_T	418_T	0.684	0.10
167_Q	191_D	0.682	0.10
534_Y	682_M	0.682	0.10
175_W	605_A	0.680	0.10
564_G	568_A	0.679	0.10
104_V	109_G	0.678	0.10
164_A	273_V	0.676	0.10
86_V	265_T	0.675	0.10
155_V	237_V	0.674	0.10
86_V	225_L	0.674	0.10
269_V	397_A	0.673	0.10
235_P	240_G	0.673	0.10
462_D	691_H	0.672	0.10
392_P	469_S	0.672	0.10
481_D	515_Q	0.671	0.10
408_Y	444_N	0.671	0.10
479_L	528_L	0.670	0.10
506_C	564_G	0.669	0.10
324_A	626_Q	0.664	0.10
576_S	609_S	0.663	0.10
159_V	215_V	0.663	0.10
98_T	236_S	0.663	0.10
529_N	537_G	0.662	0.10
503_Q	536_L	0.662	0.10
208_V	346_L	0.661	0.10
141_H	308_R	0.660	0.10
251_T	427_A	0.659	0.10
154_D	425_Y	0.656	0.10
537_G	575_F	0.655	0.10
133_I	681_Q	0.655	0.10
98_T	541_I	0.655	0.10
210_P	667_A	0.652	0.10
388_H	617_L	0.652	0.10
46_E	146_I	0.651	0.10
419_K	531_C	0.651	0.10
513_F	522_P	0.651	0.10
284_D	439_V	0.650	0.10
433_S	689_S	0.650	0.10
20_N	545_S	0.645	0.10
320_V	353_V	0.644	0.09
480_A	515_Q	0.644	0.09
286_L	585_Q	0.643	0.09
154_D	157_A	0.642	0.09
217_A	455_F	0.642	0.09
226_G	605_A	0.639	0.09
557_N	572_N	0.638	0.09
135_V	286_L	0.637	0.09
211_E	302_D	0.637	0.09
621_S	627_R	0.637	0.09
14_L	430_S	0.636	0.09
591_D	687_D	0.636	0.09
70_A	202_V	0.635	0.09
630_F	694_P	0.635	0.09
136_R	142_P	0.635	0.09
144_G	403_T	0.635	0.09
148_T	220_P	0.632	0.09
64_V	272_S	0.631	0.09
159_V	347_A	0.630	0.09
136_R	282_A	0.630	0.09
231_P	483_L	0.629	0.09
117_T	285_T	0.629	0.09
448_M	560_A	0.628	0.09
25_M	499_R	0.626	0.09
143_I	635_F	0.626	0.09
165_A	283_R	0.625	0.09
451_E	551_T	0.625	0.09
451_E	526_F	0.625	0.09
245_A	630_F	0.624	0.09
22_R	27_T	0.623	0.09
21_R	335_D	0.623	0.09
481_D	507_T	0.622	0.09
90_D	104_V	0.622	0.09
626_Q	670_Q	0.622	0.09
265_T	320_V	0.620	0.09
419_K	451_E	0.619	0.09
249_R	462_D	0.619	0.09
423_D	604_V	0.619	0.09
684_V	687_D	0.617	0.09
451_E	496_G	0.617	0.09
534_Y	594_Y	0.617	0.09
72_G	283_R	0.616	0.09
316_P	410_G	0.615	0.09
53_T	475_T	0.614	0.09
330_T	657_L	0.614	0.09
175_W	185_L	0.613	0.09
268_C	444_N	0.613	0.09
109_G	169_P	0.612	0.09
637_S	644_G	0.612	0.09
153_V	542_D	0.611	0.09
151_D	642_L	0.611	0.09
572_N	578_R	0.611	0.09
25_M	33_P	0.611	0.09
19_Y	151_D	0.609	0.09
462_D	478_E	0.608	0.09
36_T	380_D	0.607	0.09
133_I	196_S	0.607	0.09
139_H	164_A	0.607	0.09
263_V	675_F	0.605	0.09
561_M	565_Q	0.605	0.09
140_S	516_I	0.605	0.09
314_E	621_S	0.605	0.09
340_I	469_S	0.605	0.09
312_Y	528_L	0.604	0.09
204_V	615_A	0.604	0.09
310_Q	481_D	0.603	0.09
399_P	415_V	0.603	0.09
497_H	555_I	0.603	0.09
240_G	255_A	0.603	0.09
166_L	283_R	0.603	0.09
443_C	459_G	0.602	0.09
526_F	560_A	0.601	0.09
202_V	232_S	0.601	0.09
267_D	312_Y	0.600	0.09
577_P	583_I	0.600	0.09
598_G	643_G	0.599	0.09
233_S	302_D	0.599	0.09
215_V	502_T	0.599	0.09
103_Y	280_T	0.598	0.09
85_T	565_Q	0.596	0.09
56_L	505_V	0.596	0.09
172_E	483_L	0.596	0.09
94_L	285_T	0.594	0.09
44_P	280_T	0.593	0.09
19_Y	25_M	0.593	0.09
146_I	259_L	0.593	0.09
215_V	230_E	0.593	0.09
106_V	110_T	0.592	0.09
451_E	534_Y	0.591	0.09
676_L	684_V	0.590	0.09
317_Q	672_V	0.590	0.09
14_L	254_R	0.588	0.09
156_M	418_T	0.588	0.09
420_L	457_L	0.588	0.09
24_V	27_T	0.587	0.09
264_F	496_G	0.587	0.09
448_M	495_I	0.587	0.09
392_P	482_V	0.586	0.09
126_P	275_L	0.585	0.09
226_G	576_S	0.585	0.09
12_L	242_H	0.584	0.09
546_Q	583_I	0.582	0.09
206_V	246_T	0.582	0.09
478_E	526_F	0.581	0.09
16_D	137_S	0.581	0.09
162_F	504_F	0.581	0.09
551_T	555_I	0.580	0.09
102_T	534_Y	0.579	0.09
12_L	429_F	0.579	0.09
159_V	483_L	0.578	0.09
209_P	548_G	0.578	0.09
164_A	232_S	0.577	0.09
251_T	523_P	0.576	0.09
204_V	422_A	0.575	0.09
253_G	284_D	0.573	0.09
389_G	394_E	0.573	0.09
172_E	466_F	0.573	0.09
19_Y	164_A	0.572	0.09
109_G	204_V	0.572	0.09
577_P	581_L	0.572	0.09
167_Q	491_F	0.571	0.09
53_T	604_V	0.571	0.09
188_G	302_D	0.571	0.09
164_A	244_I	0.570	0.09
48_A	481_D	0.570	0.09
126_P	541_I	0.570	0.09
234_T	605_A	0.570	0.09
496_G	548_G	0.570	0.09
154_D	403_T	0.569	0.09
373_E	555_I	0.568	0.09
56_L	587_Y	0.568	0.09
176_P	271_R	0.567	0.09
44_P	139_H	0.566	0.09
97_Q	438_S	0.566	0.09
39_S	55_R	0.564	0.09
408_Y	533_S	0.564	0.09
183_P	235_P	0.564	0.09
485_S	617_L	0.564	0.09
280_T	301_Y	0.563	0.09
371_V	457_L	0.562	0.09
457_L	498_V	0.561	0.09
443_C	466_F	0.561	0.09
339_P	618_T	0.559	0.09
35_P	252_L	0.558	0.09
41_F	354_R	0.558	0.09
331_V	690_L	0.558	0.09
296_D	528_L	0.555	0.09
130_D	257_G	0.555	0.09
458_Y	533_S	0.554	0.09
621_S	687_D	0.554	0.09
104_V	238_T	0.554	0.09
566_N	695_P	0.553	0.09
209_P	448_M	0.553	0.09
221_L	224_Y	0.553	0.09
259_L	558_D	0.553	0.09
206_V	237_V	0.553	0.09
393_D	411_P	0.552	0.09
619_T	626_Q	0.551	0.09
36_T	39_S	0.551	0.09
59_A	550_I	0.551	0.09
532_S	567_I	0.550	0.09
497_H	537_G	0.550	0.09
200_P	571_V	0.549	0.09
437_V	492_F	0.548	0.09
68_D	148_T	0.547	0.09
100_V	365_P	0.547	0.09
443_C	451_E	0.546	0.09
236_S	259_L	0.545	0.09
56_L	562_L	0.545	0.09
310_Q	358_D	0.545	0.09
187_V	190_P	0.543	0.08
361_P	525_V	0.543	0.08
526_F	564_G	0.543	0.08
73_D	96_F	0.542	0.08
660_G	684_V	0.542	0.08
204_V	629_R	0.541	0.08
495_I	526_F	0.540	0.08
123_V	632_V	0.539	0.08
473_N	499_R	0.538	0.08
265_T	658_Y	0.537	0.08
408_Y	548_G	0.537	0.08
269_V	580_A	0.536	0.08
150_T	446_D	0.535	0.08
219_T	545_S	0.534	0.08
207_G	657_L	0.534	0.08
76_D	576_S	0.532	0.08
185_L	246_T	0.532	0.08
316_P	540_F	0.532	0.08
246_T	301_Y	0.531	0.08
206_V	363_S	0.530	0.08
465_E	491_F	0.530	0.08
10_T	117_T	0.529	0.08
329_H	419_K	0.529	0.08
332_M	406_T	0.529	0.08
455_F	565_Q	0.529	0.08
193_T	665_V	0.529	0.08
98_T	208_V	0.528	0.08
223_F	478_E	0.528	0.08
225_L	266_L	0.528	0.08
370_A	567_I	0.528	0.08
31_V	51_V	0.527	0.08
526_F	692_W	0.526	0.08
143_I	273_V	0.525	0.08
194_T	570_F	0.525	0.08
240_G	372_D	0.525	0.08
81_P	423_D	0.525	0.08
11_G	29_T	0.525	0.08
73_D	666_T	0.523	0.08
317_Q	495_I	0.523	0.08
449_W	695_P	0.522	0.08
56_L	133_I	0.522	0.08
101_R	178_L	0.521	0.08
133_I	155_V	0.520	0.08
307_A	670_Q	0.520	0.08
461_R	606_Q	0.520	0.08
442_V	548_G	0.520	0.08
212_L	569_R	0.519	0.08
592_D	597_L	0.519	0.08
483_L	646_Y	0.519	0.08
333_V	355_T	0.518	0.08
280_T	374_F	0.518	0.08
211_E	686_L	0.517	0.08
458_Y	526_F	0.517	0.08
512_S	547_A	0.517	0.08
172_E	320_V	0.517	0.08
292_W	417_N	0.516	0.08
129_H	386_R	0.515	0.08
253_G	300_L	0.515	0.08
528_L	548_G	0.515	0.08
100_V	604_V	0.514	0.08
101_R	167_Q	0.513	0.08
499_R	502_T	0.513	0.08
304_P	656_Q	0.513	0.08
139_H	547_A	0.512	0.08
140_S	450_D	0.512	0.08
523_P	591_D	0.512	0.08
444_N	467_D	0.511	0.08
282_A	571_V	0.511	0.08
58_T	86_V	0.510	0.08
175_W	561_M	0.510	0.08
131_L	442_V	0.510	0.08
351_A	406_T	0.509	0.08
190_P	229_L	0.508	0.08
642_L	665_V	0.508	0.08
301_Y	531_C	0.508	0.08
476_R	671_E	0.508	0.08
54_D	392_P	0.506	0.08
86_V	399_P	0.506	0.08
431_H	483_L	0.505	0.08
104_V	270_V	0.504	0.08
174_S	453_S	0.504	0.08
403_T	539_A	0.504	0.08
311_A	334_A	0.503	0.08
379_T	626_Q	0.503	0.08
313_T	523_P	0.503	0.08
497_H	557_N	0.502	0.08
215_V	290_F	0.501	0.08
160_E	570_F	0.501	0.08
168_T	308_R	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1pyoA	2	0.1801	96.9	0.972	Contact Map
3p45A	3	0.1489	96.4	0.974	Contact Map
2h54A	1	0.1872	96.4	0.974	Contact Map
1m72A	2	0.2851	96	0.975	Contact Map
2dkoA	2	0.1674	95.8	0.975	Contact Map
3sirA	2	0.261	95.7	0.975	Contact Map
4jr2A	2	0.2695	95.6	0.976	Contact Map
3e4cA	2	0.2965	95	0.977	Contact Map
4jb8A	2	0.1603	94.3	0.977	Contact Map
2j32A	3	0.2766	94.2	0.977	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0188 seconds.