Q9HMC1 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HMC1 - RNase L inhibitor homolog

UniProt:	Q9HMC1	Sequences: MADDSIAVVDLDRCQPDRCNYECSNYCPPNRTGKECITLRGEDAGDGDPDQVHISEEICLGESCGICVEKCPFDAIEIINLPQELDDQPTHRYGENSFSLYGLPVPESGKVTGLLGPNGIGKSTAVDLLAGEVTPNLGRHESPPDWDEVVDEYRGTELQDYLAAVRDGDVDVAKKPQYVDEIPAQFDGNTRQLLEATDERGVLDDLVDRLSIRPVMDQAIDSLSGGELQRVALAATLARDADFYFVDELTPYLDIGQRVTAARLVRELAEDADKAVLVVEHDLAVLDMLADSIHVAYGEPSVYGVVTPPKSVRNGINEYLRGYLENENMRVRPEAIEFEEHAPRSASRRDTLVSYPDMTKSYGDGEFTLSVEGGDINRNEVLGVVGPNGIGKSTFAQLLAGGLEPSSVGGEAGAALDVGLDIAYKPQYVEADQQMRVDAFLSSVTDDVGTSYWQTEIADPLQLDPIMEQRLPDLSGGERQRVAIAATLSKDADLYLLDEPSAHLDVEQRVLATRAIRRFAENNESTVMVIDHDIYMIDLVSDRLMVFDGEPAEHGQASPPQAMRSGMNEFLANLDVTFRRDERLGRPRINKPDSQLDKQQKRDGEYYYTT	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	610 (534)
Sequences:	273 (159)
Seq/√Len:	6.9

HALSA - Q9HMC1
SULSO - Q980K5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
367_F	374_G	6.504	1.00
376_I	379_N	6.419	1.00
367_F	379_N	5.397	0.99
367_F	372_E	5.337	0.99
374_G	379_N	5.202	0.99
551_P	557_A	4.723	0.99
367_F	371_V	4.576	0.98
371_V	374_G	4.562	0.98
367_F	376_I	4.300	0.97
372_E	379_N	4.086	0.96
549_G	557_A	3.952	0.95
183_P	188_G	3.685	0.93
177_Q	180_D	3.528	0.91
372_E	376_I	3.522	0.91
370_S	374_G	3.386	0.90
548_D	557_A	3.292	0.88
371_V	379_N	3.221	0.87
175_K	179_V	2.997	0.83
175_K	180_D	2.989	0.83
336_I	339_E	2.947	0.82
370_S	379_N	2.917	0.81
367_F	370_S	2.899	0.80
549_G	553_E	2.867	0.80
31_R	529_V	2.854	0.79
175_K	178_Y	2.742	0.76
208_D	213_R	2.719	0.76
56_E	59_C	2.699	0.75
176_P	179_V	2.684	0.75
374_G	378_R	2.531	0.70
370_S	376_I	2.437	0.67
177_Q	182_I	2.357	0.64
175_K	182_I	2.351	0.64
371_V	376_I	2.350	0.64
548_D	551_P	2.348	0.64
56_E	61_G	2.298	0.62
178_Y	183_P	2.280	0.62
321_R	547_F	2.263	0.61
374_G	377_N	2.230	0.60
549_G	552_A	2.219	0.59
139_R	148_E	2.192	0.58
363_G	379_N	2.189	0.58
177_Q	183_P	2.151	0.57
21_Y	41_G	2.142	0.57
365_G	374_G	2.090	0.55
197_T	295_V	2.072	0.54
176_P	180_D	2.044	0.53
18_R	22_E	2.041	0.53
432_D	487_T	2.014	0.52
83_Q	321_R	2.011	0.52
181_E	422_I	2.002	0.51
339_E	342_A	1.990	0.51
336_I	342_A	1.979	0.50
176_P	182_I	1.972	0.50
54_I	59_C	1.971	0.50
363_G	374_G	1.971	0.50
551_P	554_H	1.969	0.50
368_T	376_I	1.959	0.50
332_R	338_F	1.955	0.50
338_F	342_A	1.948	0.49
554_H	557_A	1.934	0.49
30_N	52_V	1.927	0.48
363_G	367_F	1.919	0.48
182_I	232_A	1.915	0.48
117_P	120_I	1.867	0.46
179_V	182_I	1.853	0.46
58_I	61_G	1.848	0.45
360_K	379_N	1.843	0.45
368_T	374_G	1.839	0.45
360_K	363_G	1.807	0.44
553_E	557_A	1.804	0.44
341_H	344_R	1.800	0.44
18_R	73_F	1.789	0.43
338_F	341_H	1.785	0.43
35_E	38_T	1.779	0.43
396_A	496_L	1.776	0.43
89_P	484_I	1.774	0.43
180_D	183_P	1.744	0.42
341_H	345_S	1.734	0.41
183_P	186_F	1.729	0.41
206_L	264_L	1.729	0.41
368_T	379_N	1.727	0.41
195_E	203_L	1.719	0.41
360_K	367_F	1.718	0.41
331_V	336_I	1.717	0.41
30_N	38_T	1.713	0.40
551_P	555_G	1.690	0.40
549_G	554_H	1.689	0.40
54_I	61_G	1.686	0.39
239_R	428_Y	1.672	0.39
363_G	372_E	1.663	0.39
17_D	52_V	1.662	0.39
110_K	430_E	1.646	0.38
183_P	187_D	1.646	0.38
552_A	557_A	1.640	0.38
456_E	522_N	1.638	0.38
445_T	448_V	1.637	0.38
83_Q	95_E	1.634	0.38
367_F	378_R	1.632	0.38
83_Q	110_K	1.626	0.37
367_F	377_N	1.625	0.37
385_V	396_A	1.621	0.37
549_G	555_G	1.611	0.37
550_E	557_A	1.604	0.37
57_E	467_M	1.603	0.36
110_K	510_V	1.603	0.36
444_V	448_V	1.594	0.36
240_D	274_K	1.555	0.35
12_D	15_Q	1.550	0.35
52_V	58_I	1.550	0.35
83_Q	424_Y	1.543	0.34
336_I	340_E	1.523	0.34
432_D	435_M	1.516	0.33
339_E	343_P	1.511	0.33
175_K	183_P	1.489	0.33
207_V	216_M	1.484	0.32
380_E	543_R	1.483	0.32
372_E	377_N	1.481	0.32
371_V	378_R	1.464	0.32
360_K	374_G	1.461	0.32
307_T	481_R	1.437	0.31
332_R	336_I	1.422	0.30
26_Y	30_N	1.410	0.30
188_G	424_Y	1.408	0.30
20_N	35_E	1.402	0.30
442_S	458_A	1.402	0.30
207_V	213_R	1.397	0.30
198_D	202_V	1.395	0.30
315_G	507_E	1.394	0.29
277_L	284_A	1.380	0.29
56_E	60_L	1.371	0.29
110_K	432_D	1.357	0.28
191_R	203_L	1.349	0.28
13_R	41_G	1.348	0.28
83_Q	94_G	1.346	0.28
295_V	419_G	1.345	0.28
13_R	20_N	1.343	0.28
368_T	373_G	1.331	0.28
454_Q	458_A	1.331	0.28
295_V	310_K	1.322	0.27
198_D	201_G	1.322	0.27
21_Y	30_N	1.320	0.27
390_I	525_S	1.316	0.27
362_Y	374_G	1.302	0.27
237_L	264_L	1.296	0.26
32_T	165_V	1.290	0.26
49_P	108_S	1.283	0.26
21_Y	52_V	1.280	0.26
110_K	513_T	1.276	0.26
191_R	195_E	1.275	0.26
302_V	310_K	1.272	0.26
367_F	373_G	1.266	0.26
362_Y	379_N	1.264	0.26
389_G	536_M	1.258	0.25
422_I	547_F	1.256	0.25
434_Q	472_P	1.250	0.25
54_I	58_I	1.249	0.25
87_D	484_I	1.248	0.25
234_A	238_A	1.247	0.25
88_Q	485_A	1.242	0.25
551_P	556_Q	1.226	0.24
340_E	343_P	1.220	0.24
442_S	446_D	1.217	0.24
290_A	531_D	1.214	0.24
140_H	408_V	1.212	0.24
9_V	482_V	1.210	0.24
9_V	31_R	1.208	0.24
397_Q	424_Y	1.208	0.24
365_G	372_E	1.207	0.24
194_L	215_V	1.207	0.24
420_L	455_T	1.206	0.24
178_Y	182_I	1.206	0.24
270_E	274_K	1.200	0.24
372_E	378_R	1.199	0.24
255_I	547_F	1.198	0.24
396_A	424_Y	1.190	0.23
88_Q	189_N	1.190	0.23
52_V	56_E	1.190	0.23
94_G	188_G	1.187	0.23
84_E	321_R	1.183	0.23
181_E	547_F	1.179	0.23
220_I	463_L	1.169	0.23
73_F	484_I	1.166	0.23
20_N	73_F	1.163	0.23
368_T	372_E	1.159	0.23
207_V	380_E	1.159	0.23
439_A	487_T	1.159	0.23
336_I	343_P	1.151	0.22
269_A	276_V	1.148	0.22
424_Y	442_S	1.145	0.22
18_R	511_L	1.144	0.22
22_E	35_E	1.138	0.22
550_E	553_E	1.138	0.22
193_L	235_A	1.137	0.22
55_S	543_R	1.133	0.22
350_D	464_D	1.133	0.22
278_V	397_Q	1.131	0.22
552_A	555_G	1.127	0.22
16_P	19_C	1.119	0.22
14_C	19_C	1.119	0.22
458_A	529_V	1.117	0.22
94_G	323_Y	1.102	0.21
177_Q	188_G	1.097	0.21
53_H	408_V	1.095	0.21
183_P	424_Y	1.088	0.21
550_E	554_H	1.087	0.21
301_S	466_I	1.081	0.21
336_I	341_H	1.074	0.20
452_Y	522_N	1.073	0.20
342_A	345_S	1.070	0.20
243_F	260_T	1.065	0.20
444_V	447_D	1.064	0.20
337_E	342_A	1.062	0.20
338_F	343_P	1.062	0.20
181_E	494_L	1.059	0.20
308_P	461_L	1.058	0.20
207_V	250_T	1.058	0.20
362_Y	367_F	1.052	0.20
186_F	424_Y	1.051	0.20
270_E	273_D	1.045	0.20
293_I	484_I	1.040	0.20
83_Q	310_K	1.039	0.20
219_A	222_S	1.037	0.20
25_N	461_L	1.036	0.20
20_N	26_Y	1.031	0.19
340_E	345_S	1.025	0.19
167_D	410_G	1.021	0.19
365_G	379_N	1.021	0.19
339_E	344_R	1.021	0.19
55_S	61_G	1.019	0.19
22_E	73_F	1.013	0.19
233_L	405_P	1.008	0.19
19_C	27_C	1.006	0.19
16_P	28_P	1.006	0.19
19_C	28_P	1.006	0.19
14_C	27_C	1.006	0.19
16_P	27_C	1.006	0.19
14_C	28_P	1.006	0.19
23_C	27_C	1.003	0.19
23_C	28_P	1.003	0.19
397_Q	450_T	1.001	0.19
493_D	507_E	1.000	0.19
35_E	470_R	1.000	0.19
361_S	369_L	0.998	0.19
176_P	188_G	0.995	0.19
330_R	334_E	0.993	0.19
110_K	431_A	0.990	0.18
10_D	20_N	0.989	0.18
366_E	374_G	0.984	0.18
398_L	513_T	0.979	0.18
339_E	346_A	0.974	0.18
371_V	377_N	0.972	0.18
94_G	260_T	0.971	0.18
83_Q	547_F	0.969	0.18
206_L	238_A	0.963	0.18
20_N	30_N	0.957	0.18
26_Y	41_G	0.955	0.18
38_T	53_H	0.953	0.18
398_L	424_Y	0.950	0.18
339_E	345_S	0.949	0.18
20_N	52_V	0.943	0.17
363_G	370_S	0.943	0.17
25_N	473_D	0.941	0.17
369_L	379_N	0.939	0.17
66_I	289_L	0.936	0.17
86_D	346_A	0.935	0.17
261_A	481_R	0.933	0.17
165_V	186_F	0.932	0.17
21_Y	26_Y	0.932	0.17
162_L	262_A	0.931	0.17
421_D	493_D	0.930	0.17
11_L	51_Q	0.927	0.17
370_S	377_N	0.925	0.17
341_H	347_S	0.922	0.17
366_E	373_G	0.916	0.17
368_T	371_V	0.915	0.17
344_R	354_S	0.913	0.17
10_D	18_R	0.913	0.17
484_I	490_K	0.913	0.17
83_Q	323_Y	0.913	0.17
127_D	266_R	0.911	0.17
548_D	555_G	0.911	0.17
446_D	454_Q	0.911	0.17
229_Q	480_Q	0.911	0.17
343_P	347_S	0.909	0.17
552_A	556_Q	0.907	0.17
154_R	159_Q	0.906	0.17
209_R	361_S	0.901	0.17
537_I	544_L	0.899	0.16
323_Y	490_K	0.898	0.16
11_L	38_T	0.897	0.16
334_E	339_E	0.897	0.16
19_C	23_C	0.894	0.16
16_P	23_C	0.894	0.16
14_C	23_C	0.894	0.16
369_L	376_I	0.892	0.16
458_A	467_M	0.892	0.16
52_V	59_C	0.891	0.16
289_L	507_E	0.890	0.16
32_T	344_R	0.889	0.16
112_T	389_G	0.888	0.16
160_D	172_V	0.887	0.16
89_P	396_A	0.886	0.16
244_Y	300_P	0.885	0.16
307_T	400_A	0.885	0.16
25_N	38_T	0.883	0.16
338_F	345_S	0.879	0.16
173_A	274_K	0.877	0.16
89_P	424_Y	0.875	0.16
257_Q	331_V	0.873	0.16
52_V	61_G	0.873	0.16
206_L	439_A	0.869	0.16
360_K	372_E	0.868	0.16
164_A	321_R	0.867	0.16
165_V	198_D	0.867	0.16
35_E	39_L	0.865	0.16
375_D	408_V	0.863	0.16
360_K	365_G	0.862	0.16
141_E	484_I	0.860	0.16
364_D	411_E	0.859	0.16
310_K	326_N	0.859	0.16
165_V	172_V	0.858	0.16
185_Q	494_L	0.857	0.16
219_A	464_D	0.854	0.16
369_L	374_G	0.854	0.16
434_Q	467_M	0.848	0.15
110_K	511_L	0.846	0.15
284_A	537_I	0.846	0.15
520_A	527_V	0.845	0.15
235_A	485_A	0.844	0.15
481_R	508_Q	0.843	0.15
196_A	463_L	0.842	0.15
362_Y	365_G	0.841	0.15
182_I	188_G	0.840	0.15
36_C	39_L	0.839	0.15
49_P	202_V	0.838	0.15
55_S	59_C	0.838	0.15
404_E	408_V	0.836	0.15
114_L	521_E	0.836	0.15
230_R	482_V	0.836	0.15
87_D	198_D	0.836	0.15
83_Q	510_V	0.836	0.15
8_V	13_R	0.834	0.15
244_Y	276_V	0.834	0.15
362_Y	376_I	0.832	0.15
335_A	338_F	0.830	0.15
20_N	40_R	0.829	0.15
12_D	162_L	0.828	0.15
153_Y	157_E	0.826	0.15
13_R	35_E	0.825	0.15
141_E	324_L	0.820	0.15
402_G	408_V	0.820	0.15
33_G	37_I	0.818	0.15
167_D	387_P	0.818	0.15
99_S	389_G	0.817	0.15
295_V	323_Y	0.816	0.15
216_M	434_Q	0.814	0.15
439_A	443_S	0.814	0.15
49_P	58_I	0.812	0.15
21_Y	50_D	0.812	0.15
171_D	293_I	0.811	0.15
18_R	173_A	0.808	0.15
342_A	346_A	0.806	0.15
26_Y	53_H	0.805	0.15
21_Y	493_D	0.804	0.15
288_M	306_V	0.804	0.15
435_M	487_T	0.802	0.15
12_D	31_R	0.800	0.15
210_L	268_L	0.800	0.15
20_N	41_G	0.799	0.14
130_A	285_V	0.799	0.14
133_V	289_L	0.799	0.14
100_L	104_P	0.798	0.14
52_V	60_L	0.797	0.14
323_Y	445_T	0.797	0.14
8_V	26_Y	0.797	0.14
330_R	336_I	0.796	0.14
142_S	549_G	0.794	0.14
341_H	346_A	0.792	0.14
430_E	510_V	0.792	0.14
175_K	188_G	0.792	0.14
206_L	485_A	0.788	0.14
369_L	403_L	0.787	0.14
230_R	257_Q	0.787	0.14
25_N	29_P	0.787	0.14
66_I	133_V	0.787	0.14
66_I	232_A	0.786	0.14
323_Y	396_A	0.783	0.14
142_S	408_V	0.780	0.14
74_D	202_V	0.779	0.14
358_M	363_G	0.778	0.14
273_D	512_A	0.778	0.14
32_T	195_E	0.777	0.14
18_R	395_F	0.776	0.14
55_S	58_I	0.775	0.14
241_A	244_Y	0.775	0.14
94_G	302_V	0.774	0.14
301_S	467_M	0.774	0.14
205_D	267_E	0.773	0.14
445_T	490_K	0.773	0.14
353_V	436_R	0.772	0.14
33_G	36_C	0.772	0.14
83_Q	446_D	0.771	0.14
116_G	121_G	0.768	0.14
112_T	277_L	0.767	0.14
443_S	447_D	0.766	0.14
83_Q	89_P	0.766	0.14
337_E	343_P	0.764	0.14
94_G	264_L	0.763	0.14
26_Y	32_T	0.761	0.14
366_E	371_V	0.759	0.14
21_Y	35_E	0.758	0.14
98_F	104_P	0.757	0.14
32_T	57_E	0.757	0.14
33_G	55_S	0.756	0.14
87_D	448_V	0.752	0.14
286_L	478_E	0.752	0.14
306_V	315_G	0.752	0.14
8_V	24_S	0.751	0.14
195_E	207_V	0.751	0.14
15_Q	29_P	0.749	0.14
25_N	39_L	0.749	0.14
82_P	92_R	0.749	0.14
39_L	58_I	0.749	0.14
397_Q	402_G	0.748	0.14
141_E	461_L	0.744	0.13
250_T	497_L	0.744	0.13
30_N	545_M	0.744	0.13
68_V	83_Q	0.743	0.13
278_V	301_S	0.743	0.13
368_T	378_R	0.742	0.13
255_I	522_N	0.742	0.13
26_Y	52_V	0.741	0.13
49_P	55_S	0.741	0.13
83_Q	181_E	0.739	0.13
90_T	196_A	0.737	0.13
115_L	544_L	0.735	0.13
440_F	443_S	0.735	0.13
430_E	487_T	0.734	0.13
49_P	195_E	0.734	0.13
79_I	90_T	0.733	0.13
463_L	514_R	0.733	0.13
11_L	207_V	0.732	0.13
147_D	235_A	0.729	0.13
340_E	344_R	0.728	0.13
190_T	194_L	0.728	0.13
74_D	473_D	0.728	0.13
455_T	462_Q	0.727	0.13
170_V	549_G	0.726	0.13
10_D	13_R	0.725	0.13
110_K	422_I	0.724	0.13
114_L	319_Y	0.721	0.13
18_R	32_T	0.717	0.13
330_R	335_A	0.716	0.13
503_H	530_I	0.714	0.13
185_Q	188_G	0.714	0.13
26_Y	66_I	0.713	0.13
181_E	192_Q	0.712	0.13
471_L	514_R	0.707	0.13
8_V	21_Y	0.702	0.13
15_Q	170_V	0.702	0.13
403_L	462_Q	0.701	0.13
204_D	368_T	0.700	0.13
335_A	343_P	0.700	0.13
388_N	501_S	0.699	0.13
383_G	538_D	0.697	0.13
186_F	295_V	0.696	0.13
32_T	206_L	0.696	0.13
17_D	20_N	0.695	0.13
94_G	502_A	0.694	0.13
26_Y	38_T	0.694	0.13
213_R	463_L	0.693	0.13
343_P	346_A	0.693	0.13
17_D	21_Y	0.690	0.13
363_G	371_V	0.689	0.13
31_R	263_R	0.688	0.13
126_V	319_Y	0.686	0.12
250_T	337_E	0.685	0.12
11_L	549_G	0.684	0.12
9_V	23_C	0.683	0.12
213_R	273_D	0.681	0.12
431_A	510_V	0.681	0.12
107_E	112_T	0.680	0.12
151_D	219_A	0.680	0.12
41_G	53_H	0.680	0.12
84_E	105_V	0.679	0.12
399_L	403_L	0.679	0.12
338_F	344_R	0.679	0.12
53_H	267_E	0.678	0.12
105_V	221_D	0.677	0.12
25_N	210_L	0.676	0.12
110_K	523_N	0.675	0.12
171_D	295_V	0.675	0.12
21_Y	38_T	0.674	0.12
17_D	34_K	0.673	0.12
257_Q	460_P	0.672	0.12
195_E	216_M	0.672	0.12
215_V	241_A	0.672	0.12
151_D	447_D	0.671	0.12
185_Q	236_T	0.671	0.12
55_S	305_V	0.670	0.12
360_K	371_V	0.670	0.12
550_E	555_G	0.670	0.12
257_Q	508_Q	0.669	0.12
111_V	481_R	0.668	0.12
195_E	263_R	0.668	0.12
164_A	237_L	0.667	0.12
355_Y	374_G	0.666	0.12
181_E	237_L	0.665	0.12
363_G	368_T	0.664	0.12
51_Q	77_E	0.664	0.12
264_L	419_G	0.661	0.12
73_F	368_T	0.660	0.12
99_S	531_D	0.659	0.12
122_K	248_E	0.659	0.12
55_S	65_G	0.657	0.12
249_L	288_M	0.657	0.12
310_K	537_I	0.657	0.12
273_D	299_E	0.657	0.12
319_Y	381_V	0.656	0.12
30_N	53_H	0.655	0.12
31_R	403_L	0.655	0.12
307_T	508_Q	0.653	0.12
411_E	494_L	0.652	0.12
13_R	511_L	0.652	0.12
220_I	443_S	0.650	0.12
52_V	55_S	0.650	0.12
54_I	60_L	0.649	0.12
330_R	338_F	0.649	0.12
263_R	375_D	0.649	0.12
22_E	38_T	0.648	0.12
51_Q	60_L	0.648	0.12
26_Y	29_P	0.647	0.12
204_D	378_R	0.647	0.12
399_L	412_A	0.646	0.12
356_P	361_S	0.646	0.12
307_T	546_V	0.646	0.12
431_A	529_V	0.645	0.12
389_G	544_L	0.645	0.12
155_G	159_Q	0.644	0.12
20_N	25_N	0.643	0.12
22_E	395_F	0.642	0.12
342_A	351_T	0.642	0.12
298_G	328_N	0.640	0.12
232_A	486_A	0.640	0.12
40_R	50_D	0.639	0.12
404_E	517_R	0.639	0.12
52_V	274_K	0.639	0.12
35_E	41_G	0.636	0.12
21_Y	73_F	0.636	0.12
230_R	481_R	0.635	0.12
10_D	21_Y	0.632	0.12
449_G	458_A	0.632	0.12
312_V	315_G	0.632	0.12
77_E	86_D	0.631	0.12
197_T	310_K	0.630	0.12
188_G	324_L	0.630	0.12
397_Q	428_Y	0.630	0.12
308_P	494_L	0.629	0.12
8_V	50_D	0.628	0.12
215_V	361_S	0.626	0.12
68_V	424_Y	0.624	0.11
235_A	264_L	0.623	0.11
290_A	319_Y	0.623	0.11
285_V	306_V	0.623	0.11
161_Y	178_Y	0.623	0.11
302_V	547_F	0.622	0.11
79_I	307_T	0.622	0.11
94_G	310_K	0.622	0.11
11_L	26_Y	0.621	0.11
389_G	552_A	0.621	0.11
509_R	533_D	0.620	0.11
68_V	396_A	0.620	0.11
234_A	243_F	0.619	0.11
483_A	546_V	0.619	0.11
235_A	462_Q	0.618	0.11
134_T	149_V	0.618	0.11
126_V	381_V	0.617	0.11
27_C	33_G	0.617	0.11
28_P	33_G	0.617	0.11
74_D	86_D	0.616	0.11
22_E	27_C	0.615	0.11
22_E	28_P	0.615	0.11
358_M	374_G	0.615	0.11
305_V	526_T	0.614	0.11
449_G	473_D	0.614	0.11
11_L	20_N	0.613	0.11
210_L	419_G	0.612	0.11
375_D	549_G	0.612	0.11
335_A	407_S	0.611	0.11
453_W	457_I	0.611	0.11
83_Q	442_S	0.610	0.11
196_A	215_V	0.610	0.11
21_Y	39_L	0.609	0.11
68_V	441_L	0.609	0.11
347_S	353_V	0.608	0.11
94_G	97_S	0.606	0.11
101_Y	261_A	0.604	0.11
115_L	432_D	0.604	0.11
20_N	57_E	0.603	0.11
361_S	378_R	0.603	0.11
136_N	328_N	0.602	0.11
347_S	356_P	0.601	0.11
257_Q	540_V	0.601	0.11
230_R	307_T	0.600	0.11
94_G	299_E	0.600	0.11
229_Q	281_H	0.599	0.11
141_E	169_D	0.598	0.11
396_A	530_I	0.597	0.11
258_R	287_D	0.596	0.11
13_R	40_R	0.595	0.11
285_V	522_N	0.595	0.11
111_V	489_S	0.595	0.11
8_V	20_N	0.595	0.11
107_E	123_S	0.595	0.11
87_D	234_A	0.595	0.11
213_R	270_E	0.595	0.11
366_E	376_I	0.595	0.11
199_E	395_F	0.593	0.11
205_D	493_D	0.592	0.11
20_N	243_F	0.592	0.11
25_N	105_V	0.592	0.11
531_D	544_L	0.592	0.11
477_G	480_Q	0.591	0.11
18_R	189_N	0.590	0.11
270_E	409_G	0.590	0.11
323_Y	465_P	0.588	0.11
25_N	30_N	0.588	0.11
164_A	380_E	0.586	0.11
11_L	77_E	0.586	0.11
53_H	439_A	0.585	0.11
197_T	203_L	0.585	0.11
361_S	461_L	0.585	0.11
32_T	439_A	0.584	0.11
322_G	328_N	0.584	0.11
15_Q	237_L	0.583	0.11
155_G	161_Y	0.580	0.11
26_Y	447_D	0.579	0.11
236_T	449_G	0.578	0.11
8_V	51_Q	0.577	0.11
276_V	527_V	0.577	0.11
362_Y	372_E	0.576	0.11
18_R	35_E	0.574	0.11
446_D	469_Q	0.574	0.11
35_E	40_R	0.574	0.11
83_Q	264_L	0.573	0.11
31_R	162_L	0.573	0.11
441_L	494_L	0.572	0.11
436_R	439_A	0.572	0.11
142_S	221_D	0.572	0.11
11_L	264_L	0.572	0.11
86_D	165_V	0.571	0.11
340_E	346_A	0.570	0.11
20_N	95_E	0.570	0.11
395_F	399_L	0.569	0.11
344_R	348_R	0.568	0.11
13_R	465_P	0.568	0.11
89_P	522_N	0.568	0.11
456_E	489_S	0.567	0.11
125_A	455_T	0.567	0.11
32_T	299_E	0.567	0.11
21_Y	40_R	0.567	0.11
13_R	18_R	0.566	0.11
363_G	376_I	0.566	0.11
496_L	516_I	0.566	0.11
198_D	324_L	0.565	0.11
323_Y	424_Y	0.564	0.11
11_L	53_H	0.564	0.11
18_R	431_A	0.564	0.11
169_D	357_D	0.564	0.11
77_E	485_A	0.564	0.11
11_L	361_S	0.563	0.11
164_A	494_L	0.563	0.11
302_V	454_Q	0.562	0.11
73_F	186_F	0.561	0.11
194_L	234_A	0.561	0.11
126_V	524_E	0.559	0.11
308_P	324_L	0.559	0.11
220_I	436_R	0.558	0.11
441_L	445_T	0.558	0.11
118_N	257_Q	0.558	0.11
235_A	446_D	0.557	0.10
90_T	172_V	0.557	0.10
145_D	395_F	0.556	0.10
203_L	207_V	0.556	0.10
89_P	445_T	0.556	0.10
145_D	263_R	0.555	0.10
287_D	501_S	0.554	0.10
318_E	325_E	0.554	0.10
280_E	502_A	0.554	0.10
365_G	368_T	0.553	0.10
364_D	377_N	0.552	0.10
369_L	378_R	0.552	0.10
94_G	235_A	0.552	0.10
156_T	159_Q	0.551	0.10
260_T	299_E	0.551	0.10
35_E	466_I	0.550	0.10
111_V	165_V	0.550	0.10
494_L	529_V	0.550	0.10
11_L	57_E	0.550	0.10
228_L	297_Y	0.550	0.10
399_L	488_L	0.549	0.10
105_V	464_D	0.548	0.10
87_D	485_A	0.547	0.10
103_L	113_G	0.547	0.10
25_N	40_R	0.547	0.10
30_N	66_I	0.546	0.10
365_G	376_I	0.546	0.10
431_A	494_L	0.546	0.10
10_D	41_G	0.545	0.10
531_D	538_D	0.545	0.10
83_Q	237_L	0.544	0.10
355_Y	358_M	0.544	0.10
194_L	203_L	0.544	0.10
165_V	424_Y	0.544	0.10
115_L	326_N	0.543	0.10
308_P	448_V	0.543	0.10
77_E	397_Q	0.543	0.10
145_D	470_R	0.543	0.10
78_I	495_Y	0.543	0.10
534_I	541_S	0.542	0.10
344_R	347_S	0.542	0.10
57_E	465_P	0.542	0.10
194_L	241_A	0.540	0.10
355_Y	360_K	0.539	0.10
384_V	534_I	0.539	0.10
340_E	349_R	0.538	0.10
198_D	323_Y	0.538	0.10
531_D	535_Y	0.538	0.10
13_R	264_L	0.538	0.10
243_F	347_S	0.537	0.10
40_R	53_H	0.537	0.10
88_Q	462_Q	0.537	0.10
212_I	218_Q	0.537	0.10
260_T	295_V	0.536	0.10
535_Y	544_L	0.536	0.10
74_D	412_A	0.535	0.10
203_L	216_M	0.533	0.10
93_Y	297_Y	0.532	0.10
380_E	485_A	0.531	0.10
226_G	291_D	0.531	0.10
105_V	299_E	0.531	0.10
234_A	430_E	0.530	0.10
156_T	524_E	0.530	0.10
66_I	507_E	0.530	0.10
336_I	344_R	0.530	0.10
20_N	74_D	0.529	0.10
251_P	281_H	0.529	0.10
52_V	169_D	0.528	0.10
26_Y	485_A	0.528	0.10
181_E	512_A	0.528	0.10
32_T	193_L	0.528	0.10
305_V	460_P	0.527	0.10
35_E	53_H	0.526	0.10
145_D	220_I	0.526	0.10
13_R	22_E	0.525	0.10
136_N	317_N	0.525	0.10
441_L	458_A	0.524	0.10
84_E	94_G	0.524	0.10
451_S	524_E	0.524	0.10
26_Y	84_E	0.524	0.10
32_T	485_A	0.523	0.10
79_I	324_L	0.523	0.10
233_L	447_D	0.522	0.10
13_R	33_G	0.522	0.10
10_D	35_E	0.522	0.10
358_M	367_F	0.521	0.10
84_E	97_S	0.521	0.10
39_L	60_L	0.520	0.10
11_L	18_R	0.517	0.10
110_K	181_E	0.516	0.10
281_H	480_Q	0.515	0.10
165_V	442_S	0.514	0.10
24_S	439_A	0.514	0.10
158_L	483_A	0.513	0.10
20_N	38_T	0.512	0.10
12_D	19_C	0.511	0.10
12_D	16_P	0.511	0.10
361_S	490_K	0.511	0.10
366_E	379_N	0.510	0.10
55_S	526_T	0.509	0.10
12_D	20_N	0.508	0.10
24_S	36_C	0.508	0.10
17_D	41_G	0.508	0.10
123_S	158_L	0.507	0.10
21_Y	24_S	0.506	0.10
17_D	40_R	0.505	0.10
243_F	435_M	0.505	0.10
37_I	52_V	0.505	0.10
77_E	449_G	0.505	0.10
280_E	320_L	0.504	0.10
101_Y	383_G	0.504	0.10
200_R	467_M	0.503	0.10
364_D	412_A	0.503	0.10
16_P	33_G	0.502	0.10
14_C	33_G	0.502	0.10
19_C	33_G	0.502	0.10
21_Y	311_S	0.502	0.10
186_F	395_F	0.502	0.10
49_P	184_A	0.501	0.10
192_Q	240_D	0.501	0.10
237_L	267_E	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3bk7A	1	0.9656	100	0.407	Contact Map
3j16B	1	0.9639	100	0.408	Contact Map
1yqtA	1	0.8377	100	0.594	Contact Map
3ozxA	1	0.8344	100	0.595	Contact Map
4f4cA	1	0.859	100	0.675	Contact Map
4q9hA	1	0.8869	100	0.677	Contact Map
4finA	2	0.759	100	0.707	Contact Map
2iw3A	2	0.777	100	0.712	Contact Map
3ux8A	2	0.7	100	0.725	Contact Map
2vf7A	2	0.7656	100	0.761	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0147 seconds.