Q9HMB8 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HMB8 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HMB8	Sequences: MNVVPDTSVVVDGRISRGVEDGTYEGATVYVPEAVVGEVEAQANGGRQTGWDALEELQRLVELADDGAITVEYVGERADEDDIKRAAAGAIDAIIRDVAAAHDATFVTSDIVQAEVAEGKGIDVEFLEPLEPDFEALAIEEYLDEDTMSLHLKAGMVPKAKRGDVGEIEYQAIGEDALDESLVREYATEIVSTAKRADDAFIELSEDGMTIAQVRDLRIAISEPPFSERVEITAVRPIVKTTMDDYTQADALRERLLERDRGVLIAGAPGAGKSTFAQAVAEFLADAGNVVKTMEKPRDLQLDEEVTQYTALSGSMEKTADSLLMVRPDYTIYDEVRKTDDFEVFSDMRLAGVGMVGVVHATRPIDALQRLVGRVELGMIPQIVDTVVYIEAGNVETVYDVTTEVKVPEGLMEEDLARPVIQVRDFETNVPAYELYTFNRQVVTVPLDGESGGAGESGVDKLAKQEVEREIQAATRDRVAVDIRGPNDAVVYVSDDDISHVIGKGGGRIADIENRLGIDIDVRTLDERPTESAADPDSDTDDAQAGEIVTPEITSRHIIVPMGDDRAGETVEVQADGEYLFTATVGRGGDIKVSRGSTIAEELERAIDTERMITVVPNA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	619 (592)
Sequences:	158 (113)
Seq/√Len:	4.7

HALSA - Q9HMB8
SULSO - Q7LXU1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
265_I	277_A	6.222	0.99
397_T	432_A	5.321	0.97
276_F	390_I	3.662	0.83
142_Y	174_G	3.450	0.79
467_V	491_V	3.093	0.70
579_Y	582_T	2.983	0.67
274_S	300_L	2.793	0.62
241_T	371_L	2.789	0.62
11_V	29_V	2.756	0.61
409_E	422_Q	2.735	0.60
260_D	284_L	2.706	0.59
94_I	212_A	2.657	0.58
599_I	602_E	2.612	0.56
152_L	158_P	2.548	0.54
165_V	260_D	2.539	0.54
474_A	512_I	2.532	0.54
165_V	284_L	2.524	0.53
241_T	438_F	2.522	0.53
422_Q	431_P	2.515	0.53
261_R	284_L	2.464	0.52
112_V	116_V	2.463	0.52
333_Y	338_K	2.434	0.51
294_M	316_M	2.416	0.50
174_G	179_D	2.410	0.50
142_Y	186_Y	2.384	0.49
139_I	234_A	2.380	0.49
165_V	261_R	2.379	0.49
179_D	182_L	2.273	0.46
296_K	310_T	2.269	0.45
9_V	14_R	2.252	0.45
470_E	492_Y	2.229	0.44
206_E	318_K	2.217	0.44
486_P	603_L	2.199	0.43
314_G	395_V	2.141	0.42
253_R	576_D	2.112	0.41
423_V	512_I	2.094	0.40
294_M	319_T	2.085	0.40
175_E	428_T	2.066	0.39
11_V	191_V	2.064	0.39
53_A	119_G	2.061	0.39
59_R	202_I	2.051	0.39
390_I	395_V	2.026	0.38
26_G	266_A	2.015	0.38
296_K	311_A	2.008	0.38
165_V	289_N	1.999	0.37
179_D	395_V	1.986	0.37
19_V	591_I	1.968	0.36
265_I	591_I	1.968	0.36
29_V	191_V	1.960	0.36
4_V	104_A	1.949	0.36
409_E	431_P	1.946	0.36
239_V	333_Y	1.925	0.35
38_E	92_D	1.921	0.35
31_V	191_V	1.918	0.35
86_A	89_G	1.903	0.35
76_E	254_E	1.899	0.34
58_Q	118_E	1.894	0.34
446_P	597_S	1.873	0.34
311_A	325_M	1.864	0.33
248_Q	591_I	1.852	0.33
156_M	179_D	1.844	0.33
106_F	189_E	1.839	0.33
113_Q	513_E	1.838	0.33
248_Q	395_V	1.830	0.32
19_V	613_I	1.829	0.32
57_L	71_V	1.817	0.32
122_I	400_D	1.816	0.32
343_E	431_P	1.801	0.32
10_V	58_Q	1.784	0.31
554_T	598_T	1.776	0.31
59_R	62_E	1.768	0.31
325_M	561_P	1.764	0.31
284_L	289_N	1.764	0.31
190_I	221_I	1.755	0.30
214_V	221_I	1.733	0.30
38_E	91_I	1.730	0.30
61_V	388_V	1.729	0.30
154_A	204_L	1.722	0.30
211_I	411_L	1.695	0.29
238_I	603_L	1.692	0.29
84_K	106_F	1.690	0.29
219_I	235_V	1.680	0.28
144_D	147_T	1.679	0.28
30_Y	51_W	1.678	0.28
7_T	92_D	1.672	0.28
226_F	503_G	1.669	0.28
38_E	44_N	1.663	0.28
463_A	504_K	1.650	0.28
179_D	186_Y	1.644	0.28
61_V	109_S	1.634	0.27
503_G	506_G	1.627	0.27
441_Q	474_A	1.622	0.27
29_V	64_A	1.616	0.27
103_D	107_V	1.606	0.27
274_S	442_V	1.604	0.27
144_D	162_R	1.603	0.27
382_Q	571_V	1.602	0.27
2_N	395_V	1.601	0.27
31_V	114_A	1.601	0.27
85_R	438_F	1.601	0.27
40_E	96_R	1.597	0.26
387_V	446_P	1.595	0.26
333_Y	384_V	1.590	0.26
572_E	597_S	1.585	0.26
3_V	464_K	1.584	0.26
49_T	315_S	1.581	0.26
165_V	184_R	1.573	0.26
373_G	376_E	1.572	0.26
39_V	116_V	1.570	0.26
122_I	188_T	1.559	0.26
10_V	57_L	1.558	0.25
4_V	116_V	1.552	0.25
314_G	332_I	1.541	0.25
311_A	445_V	1.535	0.25
81_D	85_R	1.529	0.25
116_V	491_V	1.529	0.25
413_E	567_A	1.522	0.25
232_I	420_V	1.521	0.25
123_D	202_I	1.517	0.25
256_L	282_E	1.514	0.24
390_I	441_Q	1.509	0.24
72_E	343_E	1.509	0.24
167_E	480_A	1.505	0.24
162_R	220_A	1.504	0.24
223_E	512_I	1.501	0.24
173_I	217_L	1.492	0.24
10_V	167_E	1.488	0.24
10_V	447_L	1.487	0.24
256_L	318_K	1.486	0.24
114_A	118_E	1.479	0.24
182_L	474_A	1.478	0.24
77_R	89_G	1.473	0.24
156_M	525_L	1.466	0.23
251_A	284_L	1.465	0.23
24_Y	27_A	1.461	0.23
178_L	268_A	1.459	0.23
333_Y	348_M	1.453	0.23
240_K	322_S	1.448	0.23
66_D	103_D	1.447	0.23
220_A	348_M	1.444	0.23
350_L	362_T	1.443	0.23
32_P	226_F	1.437	0.23
109_S	568_G	1.436	0.23
240_K	282_E	1.435	0.23
288_G	431_P	1.435	0.23
424_R	431_P	1.424	0.22
489_A	518_I	1.420	0.22
149_S	436_Y	1.417	0.22
199_D	423_V	1.391	0.22
19_V	29_V	1.386	0.22
261_R	289_N	1.385	0.22
47_R	401_V	1.377	0.21
54_L	481_V	1.373	0.21
244_D	389_Y	1.372	0.21
294_M	348_M	1.369	0.21
280_V	345_F	1.366	0.21
310_T	445_V	1.366	0.21
595_R	601_E	1.362	0.21
202_I	526_D	1.344	0.21
42_Q	91_I	1.343	0.21
394_N	501_V	1.331	0.20
9_V	127_L	1.323	0.20
276_F	365_I	1.322	0.20
379_M	610_E	1.320	0.20
60_L	518_I	1.320	0.20
37_G	175_E	1.312	0.20
286_D	412_M	1.311	0.20
300_L	326_V	1.304	0.20
41_A	392_A	1.300	0.20
266_A	613_I	1.298	0.20
39_V	85_R	1.296	0.20
38_E	75_G	1.296	0.20
373_G	493_V	1.294	0.20
5_P	40_E	1.293	0.20
187_A	212_A	1.289	0.20
153_K	229_R	1.279	0.19
377_L	380_I	1.278	0.19
568_G	578_E	1.276	0.19
260_D	289_N	1.275	0.19
105_T	123_D	1.275	0.19
154_A	296_K	1.274	0.19
21_D	482_D	1.272	0.19
77_R	90_A	1.271	0.19
101_A	591_I	1.270	0.19
443_V	493_V	1.264	0.19
248_Q	388_V	1.263	0.19
86_A	91_I	1.262	0.19
50_G	377_L	1.257	0.19
71_V	106_F	1.254	0.19
40_E	294_M	1.254	0.19
471_I	518_I	1.250	0.19
312_L	506_G	1.249	0.19
398_V	432_A	1.244	0.19
106_F	217_L	1.243	0.19
38_E	513_E	1.239	0.19
302_L	502_I	1.239	0.19
239_V	310_T	1.237	0.19
89_G	113_Q	1.230	0.18
333_Y	441_Q	1.226	0.18
76_E	97_D	1.225	0.18
194_A	235_V	1.222	0.18
10_V	71_V	1.219	0.18
10_V	61_V	1.218	0.18
54_L	518_I	1.216	0.18
336_V	371_L	1.215	0.18
559_I	567_A	1.212	0.18
50_G	99_A	1.211	0.18
588_G	598_T	1.210	0.18
129_P	400_D	1.210	0.18
109_S	399_Y	1.202	0.18
278_Q	549_V	1.202	0.18
212_A	470_E	1.201	0.18
165_V	280_V	1.199	0.18
478_R	560_V	1.199	0.18
376_E	398_V	1.197	0.18
445_V	458_G	1.195	0.18
129_P	477_D	1.194	0.18
553_I	595_R	1.194	0.18
106_F	195_K	1.193	0.18
99_A	369_Q	1.192	0.18
94_I	318_K	1.182	0.18
220_A	443_V	1.182	0.18
4_V	232_I	1.179	0.18
258_E	433_Y	1.177	0.18
154_A	206_E	1.176	0.17
304_E	315_S	1.176	0.17
180_E	249_A	1.176	0.17
271_A	362_T	1.173	0.17
388_V	523_R	1.172	0.17
332_I	512_I	1.171	0.17
266_A	515_R	1.170	0.17
438_F	445_V	1.168	0.17
311_A	348_M	1.164	0.17
109_S	222_S	1.164	0.17
170_Y	290_V	1.158	0.17
11_V	383_I	1.158	0.17
176_D	578_E	1.158	0.17
316_M	338_K	1.158	0.17
186_Y	290_V	1.158	0.17
241_T	333_Y	1.155	0.17
7_T	42_Q	1.155	0.17
217_L	567_A	1.154	0.17
107_V	336_V	1.153	0.17
41_A	438_F	1.145	0.17
54_L	356_V	1.144	0.17
33_E	506_G	1.142	0.17
371_L	384_V	1.142	0.17
4_V	489_A	1.141	0.17
38_E	113_Q	1.141	0.17
44_N	95_I	1.135	0.17
31_V	167_E	1.133	0.17
11_V	86_A	1.132	0.17
71_V	135_E	1.129	0.17
481_V	489_A	1.126	0.17
591_I	597_S	1.120	0.17
296_K	440_R	1.115	0.16
4_V	183_V	1.114	0.16
141_E	287_A	1.113	0.16
10_V	118_E	1.111	0.16
317_E	346_S	1.108	0.16
91_I	108_T	1.108	0.16
48_Q	227_S	1.108	0.16
227_S	395_V	1.106	0.16
283_F	399_Y	1.105	0.16
561_P	590_D	1.104	0.16
186_Y	364_P	1.102	0.16
76_E	82_D	1.100	0.16
457_S	460_D	1.099	0.16
101_A	234_A	1.096	0.16
31_V	484_R	1.096	0.16
157_V	283_F	1.093	0.16
98_V	332_I	1.093	0.16
37_G	90_A	1.090	0.16
113_Q	208_G	1.089	0.16
7_T	78_A	1.086	0.16
71_V	429_N	1.083	0.16
253_R	284_L	1.082	0.16
130_L	591_I	1.081	0.16
104_A	235_V	1.081	0.16
59_R	467_V	1.078	0.16
220_A	521_D	1.075	0.16
586_G	610_E	1.072	0.16
31_V	388_V	1.070	0.16
353_V	427_E	1.070	0.16
103_D	240_K	1.067	0.16
34_A	77_R	1.066	0.16
62_E	238_I	1.059	0.15
369_Q	379_M	1.058	0.15
38_E	86_A	1.056	0.15
19_V	395_V	1.055	0.15
521_D	571_V	1.049	0.15
197_A	215_R	1.048	0.15
391_E	401_V	1.048	0.15
559_I	579_Y	1.047	0.15
87_A	388_V	1.044	0.15
387_V	432_A	1.042	0.15
72_E	215_R	1.042	0.15
39_V	346_S	1.033	0.15
95_I	113_Q	1.032	0.15
208_G	309_Y	1.028	0.15
264_L	387_V	1.028	0.15
86_A	117_A	1.028	0.15
317_E	414_E	1.025	0.15
149_S	416_L	1.024	0.15
179_D	467_V	1.024	0.15
416_L	436_Y	1.024	0.15
40_E	316_M	1.023	0.15
363_R	441_Q	1.022	0.15
220_A	345_F	1.021	0.15
93_A	200_A	1.020	0.15
148_M	279_A	1.016	0.15
286_D	448_D	1.015	0.15
15_I	39_V	1.014	0.15
31_V	559_I	1.014	0.15
571_V	597_S	1.012	0.15
11_V	576_D	1.010	0.15
154_A	229_R	1.008	0.15
200_A	514_N	1.006	0.15
34_A	89_G	1.006	0.15
271_A	363_R	1.004	0.15
385_D	415_D	1.002	0.15
190_I	214_V	1.001	0.15
217_L	549_V	0.999	0.15
378_G	385_D	0.995	0.14
16_S	356_V	0.994	0.14
7_T	99_A	0.993	0.14
144_D	239_V	0.989	0.14
63_L	118_E	0.989	0.14
356_V	451_S	0.989	0.14
151_H	436_Y	0.989	0.14
23_T	179_D	0.989	0.14
74_V	481_V	0.987	0.14
226_F	309_Y	0.986	0.14
261_R	280_V	0.984	0.14
548_I	560_V	0.983	0.14
122_I	190_I	0.982	0.14
405_V	416_L	0.975	0.14
268_A	487_N	0.975	0.14
190_I	212_A	0.974	0.14
29_V	201_F	0.973	0.14
372_V	493_V	0.959	0.14
155_G	433_Y	0.954	0.14
339_T	353_V	0.951	0.14
339_T	374_R	0.948	0.14
377_L	426_F	0.948	0.14
303_D	555_S	0.946	0.14
271_A	441_Q	0.944	0.14
71_V	198_D	0.944	0.14
43_A	423_V	0.942	0.14
523_R	557_H	0.942	0.14
179_D	206_E	0.941	0.14
44_N	316_M	0.939	0.14
346_S	503_G	0.938	0.14
31_V	238_I	0.937	0.14
317_E	339_T	0.934	0.14
572_E	587_R	0.934	0.14
183_V	565_D	0.934	0.14
224_P	562_M	0.931	0.13
127_L	383_I	0.929	0.13
286_D	348_M	0.927	0.13
279_A	362_T	0.924	0.13
311_A	413_E	0.923	0.13
84_K	198_D	0.922	0.13
142_Y	317_E	0.922	0.13
11_V	215_R	0.921	0.13
35_V	332_I	0.920	0.13
181_S	259_R	0.920	0.13
202_I	212_A	0.918	0.13
39_V	333_Y	0.918	0.13
226_F	353_V	0.916	0.13
142_Y	205_S	0.909	0.13
372_V	522_V	0.909	0.13
385_D	416_L	0.908	0.13
26_G	490_V	0.908	0.13
144_D	278_Q	0.907	0.13
36_V	338_K	0.906	0.13
201_F	477_D	0.905	0.13
123_D	181_S	0.904	0.13
147_T	443_V	0.903	0.13
34_A	95_I	0.901	0.13
107_V	183_V	0.898	0.13
114_A	124_V	0.898	0.13
186_Y	400_D	0.897	0.13
310_T	344_V	0.895	0.13
244_D	286_D	0.894	0.13
366_D	386_T	0.894	0.13
399_Y	568_G	0.894	0.13
470_E	474_A	0.893	0.13
151_H	416_L	0.893	0.13
362_T	549_V	0.892	0.13
145_E	199_D	0.889	0.13
55_E	196_R	0.888	0.13
391_E	501_V	0.888	0.13
117_A	428_T	0.888	0.13
161_K	386_T	0.886	0.13
369_Q	376_E	0.885	0.13
294_M	374_R	0.883	0.13
57_L	517_G	0.882	0.13
5_P	264_L	0.882	0.13
266_A	389_Y	0.882	0.13
407_V	411_L	0.882	0.13
467_V	528_R	0.879	0.13
365_I	573_V	0.878	0.13
331_T	436_Y	0.878	0.13
149_S	331_T	0.878	0.13
67_G	356_V	0.878	0.13
462_L	487_N	0.877	0.13
209_M	439_N	0.876	0.13
353_V	415_D	0.874	0.13
39_V	53_A	0.874	0.13
489_A	581_F	0.873	0.13
356_V	383_I	0.872	0.13
249_A	427_E	0.871	0.13
525_L	528_R	0.871	0.13
95_I	235_V	0.871	0.13
11_V	336_V	0.868	0.13
252_L	426_F	0.866	0.13
42_Q	92_D	0.865	0.13
261_R	557_H	0.864	0.13
142_Y	346_S	0.863	0.13
9_V	101_A	0.862	0.13
30_Y	74_V	0.862	0.13
115_E	234_A	0.862	0.13
364_P	571_V	0.860	0.12
137_L	504_K	0.859	0.12
183_V	189_E	0.858	0.12
415_D	493_V	0.857	0.12
103_D	480_A	0.856	0.12
332_I	356_V	0.854	0.12
17_R	491_V	0.854	0.12
22_G	258_E	0.853	0.12
36_V	509_I	0.853	0.12
37_G	441_Q	0.852	0.12
61_V	283_F	0.851	0.12
350_L	371_L	0.850	0.12
75_G	306_V	0.849	0.12
256_L	364_P	0.848	0.12
157_V	177_A	0.847	0.12
226_F	312_L	0.845	0.12
69_I	210_T	0.843	0.12
155_G	364_P	0.843	0.12
175_E	179_D	0.843	0.12
316_M	374_R	0.842	0.12
7_T	12_D	0.842	0.12
96_R	113_Q	0.841	0.12
127_L	450_E	0.841	0.12
64_A	181_S	0.841	0.12
314_G	521_D	0.840	0.12
7_T	503_G	0.839	0.12
60_L	466_E	0.837	0.12
200_A	215_R	0.836	0.12
382_Q	442_V	0.835	0.12
24_Y	29_V	0.834	0.12
15_I	227_S	0.833	0.12
82_D	193_T	0.833	0.12
159_K	413_E	0.833	0.12
404_E	444_T	0.832	0.12
38_E	42_Q	0.832	0.12
99_A	104_A	0.831	0.12
310_T	368_L	0.831	0.12
179_D	318_K	0.828	0.12
40_E	236_R	0.828	0.12
7_T	11_V	0.828	0.12
403_T	445_V	0.827	0.12
10_V	127_L	0.825	0.12
4_V	8_S	0.824	0.12
26_G	74_V	0.823	0.12
2_N	401_V	0.823	0.12
234_A	376_E	0.821	0.12
170_Y	595_R	0.821	0.12
508_R	592_K	0.819	0.12
115_E	469_R	0.818	0.12
294_M	339_T	0.818	0.12
67_G	205_S	0.817	0.12
71_V	90_A	0.816	0.12
405_V	436_Y	0.816	0.12
149_S	405_V	0.816	0.12
16_S	31_V	0.815	0.12
204_L	296_K	0.815	0.12
122_I	263_V	0.812	0.12
84_K	483_I	0.812	0.12
192_S	423_V	0.811	0.12
226_F	326_V	0.808	0.12
59_R	263_V	0.807	0.12
24_Y	574_Q	0.803	0.12
151_H	161_K	0.802	0.12
44_N	91_I	0.801	0.12
17_R	514_N	0.796	0.12
574_Q	588_G	0.794	0.12
266_A	283_F	0.794	0.12
568_G	585_V	0.793	0.12
290_V	395_V	0.789	0.12
259_R	433_Y	0.789	0.12
459_V	593_V	0.788	0.12
68_A	135_E	0.786	0.12
421_I	443_V	0.786	0.12
42_Q	95_I	0.785	0.11
299_D	378_G	0.785	0.11
210_T	230_V	0.783	0.11
438_F	597_S	0.780	0.11
232_I	353_V	0.780	0.11
242_T	457_S	0.778	0.11
12_D	29_V	0.778	0.11
156_M	159_K	0.777	0.11
91_I	488_D	0.777	0.11
263_V	439_N	0.776	0.11
333_Y	557_H	0.776	0.11
274_S	515_R	0.776	0.11
405_V	433_Y	0.775	0.11
217_L	403_T	0.775	0.11
57_L	109_S	0.772	0.11
276_F	416_L	0.771	0.11
376_E	380_I	0.770	0.11
385_D	436_Y	0.769	0.11
149_S	385_D	0.769	0.11
103_D	123_D	0.767	0.11
54_L	116_V	0.767	0.11
44_N	306_V	0.766	0.11
384_V	391_E	0.766	0.11
310_T	333_Y	0.766	0.11
413_E	561_P	0.762	0.11
465_Q	518_I	0.762	0.11
44_N	75_G	0.761	0.11
235_V	301_Q	0.760	0.11
302_L	346_S	0.758	0.11
234_A	316_M	0.758	0.11
11_V	64_A	0.756	0.11
596_G	601_E	0.754	0.11
74_V	177_A	0.754	0.11
13_G	142_Y	0.753	0.11
371_L	438_F	0.753	0.11
411_L	445_V	0.753	0.11
425_D	428_T	0.752	0.11
252_L	422_Q	0.750	0.11
153_K	227_S	0.750	0.11
136_A	217_L	0.749	0.11
593_V	605_R	0.749	0.11
557_H	572_E	0.748	0.11
222_S	227_S	0.748	0.11
252_L	390_I	0.747	0.11
176_D	591_I	0.747	0.11
304_E	443_V	0.746	0.11
59_R	464_K	0.746	0.11
31_V	457_S	0.745	0.11
48_Q	137_L	0.745	0.11
58_Q	469_R	0.744	0.11
232_I	512_I	0.744	0.11
142_Y	178_L	0.743	0.11
114_A	423_V	0.743	0.11
109_S	283_F	0.740	0.11
90_A	429_N	0.739	0.11
171_Q	177_A	0.737	0.11
135_E	139_I	0.736	0.11
268_A	278_Q	0.735	0.11
78_A	94_I	0.735	0.11
29_V	576_D	0.734	0.11
198_D	482_D	0.733	0.11
78_A	91_I	0.733	0.11
529_P	574_Q	0.733	0.11
380_I	385_D	0.732	0.11
344_V	565_D	0.731	0.11
326_V	509_I	0.728	0.11
124_V	139_I	0.728	0.11
353_V	495_D	0.728	0.11
178_L	182_L	0.728	0.11
268_A	391_E	0.727	0.11
49_T	193_T	0.726	0.11
260_D	280_V	0.724	0.11
362_T	374_R	0.723	0.11
105_T	482_D	0.723	0.11
222_S	338_K	0.721	0.11
75_G	95_I	0.717	0.11
127_L	500_H	0.716	0.11
127_L	191_V	0.716	0.11
421_I	613_I	0.716	0.11
305_E	504_K	0.715	0.11
31_V	243_M	0.712	0.11
284_L	556_R	0.712	0.11
175_E	186_Y	0.712	0.11
95_I	232_I	0.710	0.11
442_V	572_E	0.710	0.11
252_L	513_E	0.709	0.11
102_H	245_D	0.708	0.11
30_Y	41_A	0.707	0.11
127_L	421_I	0.705	0.11
182_L	214_V	0.704	0.11
529_P	551_P	0.704	0.11
71_V	499_S	0.704	0.11
7_T	506_G	0.703	0.10
140_E	205_S	0.702	0.10
159_K	311_A	0.701	0.10
311_A	561_P	0.700	0.10
148_M	224_P	0.700	0.10
301_Q	502_I	0.699	0.10
333_Y	375_V	0.697	0.10
71_V	132_P	0.694	0.10
122_I	156_M	0.694	0.10
82_D	229_R	0.692	0.10
388_V	594_S	0.692	0.10
91_I	94_I	0.690	0.10
66_D	263_V	0.690	0.10
141_E	199_D	0.689	0.10
229_R	303_D	0.689	0.10
71_V	175_E	0.689	0.10
446_P	571_V	0.688	0.10
336_V	348_M	0.688	0.10
89_G	95_I	0.687	0.10
229_R	424_R	0.684	0.10
277_A	586_G	0.683	0.10
198_D	250_D	0.683	0.10
276_F	340_D	0.682	0.10
128_E	173_I	0.681	0.10
278_Q	311_A	0.681	0.10
363_R	606_A	0.680	0.10
67_G	124_V	0.680	0.10
240_K	376_E	0.678	0.10
94_I	195_K	0.678	0.10
9_V	196_R	0.677	0.10
169_E	429_N	0.676	0.10
35_V	93_A	0.676	0.10
344_V	458_G	0.676	0.10
322_S	564_D	0.676	0.10
120_K	319_T	0.674	0.10
36_V	173_I	0.674	0.10
42_Q	506_G	0.673	0.10
384_V	442_V	0.673	0.10
91_I	95_I	0.672	0.10
5_P	581_F	0.671	0.10
312_L	503_G	0.671	0.10
214_V	217_L	0.670	0.10
127_L	564_D	0.669	0.10
124_V	447_L	0.668	0.10
9_V	500_H	0.668	0.10
581_F	584_T	0.668	0.10
325_M	526_D	0.668	0.10
279_A	549_V	0.666	0.10
412_M	467_V	0.666	0.10
412_M	512_I	0.666	0.10
16_S	30_Y	0.665	0.10
241_T	245_D	0.664	0.10
165_V	422_Q	0.663	0.10
195_K	605_R	0.663	0.10
261_R	320_A	0.662	0.10
375_V	451_S	0.662	0.10
336_V	516_L	0.662	0.10
16_S	258_E	0.661	0.10
11_V	306_V	0.661	0.10
245_D	587_R	0.661	0.10
323_L	446_P	0.661	0.10
123_D	183_V	0.660	0.10
209_M	302_L	0.658	0.10
99_A	235_V	0.658	0.10
144_D	364_P	0.656	0.10
575_A	593_V	0.656	0.10
12_D	339_T	0.656	0.10
266_A	555_S	0.655	0.10
280_V	289_N	0.655	0.10
278_Q	302_L	0.655	0.10
17_R	493_V	0.653	0.10
44_N	92_D	0.653	0.10
252_L	380_I	0.652	0.10
38_E	117_A	0.652	0.10
45_G	605_R	0.652	0.10
321_D	331_T	0.650	0.10
441_Q	513_E	0.650	0.10
394_N	600_A	0.648	0.10
114_A	489_A	0.646	0.10
283_F	586_G	0.645	0.10
139_I	215_R	0.644	0.10
151_H	378_G	0.644	0.10
443_V	446_P	0.644	0.10
168_I	263_V	0.643	0.10
222_S	283_F	0.643	0.10
279_A	519_D	0.643	0.10
464_K	468_E	0.642	0.10
260_D	383_I	0.641	0.10
7_T	95_I	0.640	0.10
183_V	567_A	0.639	0.10
531_E	609_T	0.639	0.10
208_G	441_Q	0.637	0.10
96_R	234_A	0.636	0.10
264_L	271_A	0.633	0.10
439_N	444_T	0.632	0.10
112_V	131_E	0.631	0.10
190_I	613_I	0.630	0.10
47_R	106_F	0.629	0.10
13_G	113_Q	0.629	0.10
9_V	78_A	0.629	0.10
126_F	186_Y	0.628	0.10
251_A	261_R	0.628	0.10
28_T	399_Y	0.627	0.10
296_K	368_L	0.626	0.10
92_D	95_I	0.626	0.10
36_V	125_E	0.626	0.10
201_F	471_I	0.625	0.10
125_E	423_V	0.624	0.10
113_Q	520_I	0.622	0.10
294_M	441_Q	0.621	0.10
185_E	383_I	0.620	0.10
103_D	487_N	0.620	0.10
571_V	585_V	0.619	0.10
33_E	382_Q	0.617	0.10
228_E	490_V	0.617	0.10
95_I	506_G	0.616	0.10
80_E	85_R	0.616	0.10
244_D	398_V	0.615	0.10
186_Y	561_P	0.614	0.09
166_G	416_L	0.611	0.09
227_S	290_V	0.611	0.09
120_K	571_V	0.610	0.09
338_K	348_M	0.610	0.09
214_V	510_A	0.610	0.09
52_D	205_S	0.610	0.09
212_A	491_V	0.610	0.09
290_V	600_A	0.609	0.09
168_I	220_A	0.608	0.09
76_E	448_D	0.607	0.09
362_T	383_I	0.605	0.09
151_H	405_V	0.602	0.09
150_L	234_A	0.602	0.09
401_V	470_E	0.602	0.09
294_M	326_V	0.601	0.09
114_A	345_F	0.600	0.09
149_S	415_D	0.599	0.09
415_D	436_Y	0.599	0.09
356_V	432_A	0.598	0.09
103_D	257_L	0.598	0.09
55_E	240_K	0.597	0.09
42_Q	236_R	0.596	0.09
88_A	265_I	0.595	0.09
338_K	584_T	0.593	0.09
37_G	44_N	0.592	0.09
230_V	512_I	0.592	0.09
84_K	576_D	0.592	0.09
20_E	304_E	0.590	0.09
81_D	560_V	0.589	0.09
441_Q	498_I	0.588	0.09
598_T	609_T	0.587	0.09
354_G	410_G	0.586	0.09
14_R	127_L	0.585	0.09
139_I	350_L	0.584	0.09
244_D	482_D	0.583	0.09
41_A	85_R	0.583	0.09
40_E	44_N	0.582	0.09
284_L	403_T	0.582	0.09
104_A	112_V	0.581	0.09
280_V	594_S	0.581	0.09
144_D	512_I	0.580	0.09
75_G	113_Q	0.580	0.09
170_Y	553_I	0.580	0.09
189_E	574_Q	0.580	0.09
5_P	124_V	0.576	0.09
33_E	339_T	0.576	0.09
76_E	127_L	0.575	0.09
37_G	40_E	0.574	0.09
139_I	210_T	0.573	0.09
19_V	87_A	0.573	0.09
73_Y	109_S	0.573	0.09
176_D	451_S	0.572	0.09
250_D	451_S	0.572	0.09
397_T	446_P	0.572	0.09
277_A	482_D	0.571	0.09
226_F	316_M	0.569	0.09
489_A	512_I	0.569	0.09
69_I	392_A	0.568	0.09
348_M	584_T	0.568	0.09
76_E	250_D	0.568	0.09
99_A	376_E	0.567	0.09
278_Q	442_V	0.566	0.09
350_L	466_E	0.566	0.09
10_V	107_V	0.565	0.09
153_K	307_T	0.565	0.09
70_T	395_V	0.564	0.09
382_Q	446_P	0.564	0.09
375_V	585_V	0.562	0.09
555_S	604_E	0.562	0.09
151_H	377_L	0.561	0.09
142_Y	452_G	0.560	0.09
350_L	438_F	0.557	0.09
151_H	385_D	0.557	0.09
264_L	356_V	0.556	0.09
31_V	395_V	0.556	0.09
558_I	601_E	0.556	0.09
271_A	278_Q	0.555	0.09
34_A	113_Q	0.554	0.09
35_V	119_G	0.554	0.09
49_T	333_Y	0.553	0.09
581_F	593_V	0.553	0.09
30_Y	395_V	0.553	0.09
178_L	217_L	0.553	0.09
34_A	471_I	0.552	0.09
365_I	390_I	0.552	0.09
122_I	242_T	0.550	0.09
397_T	553_I	0.550	0.09
289_N	600_A	0.549	0.09
554_T	588_G	0.549	0.09
513_E	522_V	0.549	0.09
121_G	517_G	0.548	0.09
245_D	475_T	0.546	0.09
220_A	446_P	0.546	0.09
391_E	482_D	0.546	0.09
547_E	565_D	0.545	0.09
31_V	132_P	0.544	0.09
581_F	585_V	0.542	0.09
103_D	283_F	0.541	0.09
82_D	303_D	0.541	0.09
205_S	214_V	0.541	0.09
77_R	506_G	0.540	0.09
356_V	483_I	0.538	0.09
90_A	306_V	0.538	0.09
249_A	595_R	0.538	0.09
388_V	596_G	0.538	0.09
222_S	348_M	0.537	0.09
561_P	586_G	0.537	0.09
396_E	430_V	0.536	0.09
154_A	325_M	0.535	0.09
99_A	444_T	0.535	0.09
220_A	336_V	0.535	0.09
114_A	157_V	0.534	0.09
106_F	576_D	0.533	0.09
145_E	236_R	0.533	0.09
378_G	415_D	0.532	0.09
30_Y	102_H	0.531	0.09
83_I	174_G	0.531	0.09
208_G	226_F	0.531	0.09
278_Q	336_V	0.530	0.09
15_I	75_G	0.530	0.09
498_I	577_G	0.529	0.09
93_A	600_A	0.529	0.09
283_F	593_V	0.529	0.09
380_I	421_I	0.529	0.09
157_V	171_Q	0.528	0.09
201_F	309_Y	0.528	0.09
51_W	126_F	0.527	0.09
564_D	569_E	0.527	0.09
118_E	169_E	0.526	0.09
391_E	504_K	0.526	0.09
44_N	77_R	0.526	0.09
555_S	568_G	0.525	0.09
132_P	467_V	0.525	0.09
151_H	415_D	0.524	0.09
258_E	330_Y	0.524	0.09
57_L	384_V	0.523	0.09
11_V	15_I	0.521	0.09
238_I	510_A	0.520	0.09
217_L	304_E	0.518	0.09
231_E	292_K	0.518	0.09
232_I	271_A	0.517	0.08
243_M	588_G	0.516	0.08
131_E	181_S	0.516	0.08
174_G	178_L	0.516	0.08
399_Y	442_V	0.516	0.08
322_S	397_T	0.515	0.08
182_L	288_G	0.514	0.08
552_E	558_I	0.514	0.08
16_S	499_S	0.514	0.08
364_P	558_I	0.514	0.08
279_A	485_G	0.513	0.08
159_K	186_Y	0.512	0.08
151_H	410_G	0.511	0.08
226_F	319_T	0.511	0.08
5_P	504_K	0.510	0.08
76_E	181_S	0.510	0.08
279_A	365_I	0.510	0.08
515_R	604_E	0.510	0.08
316_M	344_V	0.509	0.08
63_L	116_V	0.509	0.08
311_A	333_Y	0.509	0.08
169_E	613_I	0.509	0.08
11_V	89_G	0.508	0.08
547_E	560_V	0.507	0.08
182_L	610_E	0.507	0.08
40_E	374_R	0.506	0.08
123_D	191_V	0.506	0.08
149_S	166_G	0.506	0.08
166_G	436_Y	0.506	0.08
568_G	595_R	0.505	0.08
242_T	528_R	0.505	0.08
28_T	602_E	0.505	0.08
258_E	390_I	0.505	0.08
403_T	411_L	0.504	0.08
209_M	411_L	0.504	0.08
28_T	560_V	0.503	0.08
3_V	259_R	0.502	0.08
21_D	519_D	0.501	0.08
317_E	332_I	0.501	0.08
228_E	364_P	0.501	0.08
391_E	493_V	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3i8oA	2	0.2246	99.9	0.916	Contact Map
4bwyA	3	0.3845	99.8	0.928	Contact Map
4blqA	3	0.3764	99.8	0.931	Contact Map
2ewvA	3	0.5137	99.8	0.932	Contact Map
3jvvA	3	0.5105	99.7	0.934	Contact Map
4cr2I	1	0.4798	99.7	0.937	Contact Map
4ihqA	3	0.7141	99.7	0.938	Contact Map
3ix7A	2	0.2003	99.7	0.938	Contact Map
2oap1	3	0.7108	99.6	0.939	Contact Map
2gzaA	3	0.4637	99.6	0.942	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.015 seconds.