Q9HHM1 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HHM1 - Vng6327h

UniProt:	Q9HHM1	Sequences: MITLIVLSIGGGTGAYLIGKLIARGDFTLPVSAIQTAAVAGFITFLSLGIQRTSSVNERLDTGYLLTTVGAHEAALGLVFTVYRQVAVPVFLPALAVAVGLALGSQTPATAVTVGVAVVGFVTLAALLGVVLSLATKLATSRSPRLRRYKNYTYVLTFILGFLIWITILQGPLSNQGACDWLQVVPPGWFVDLALFGLTDVPTEPARGLSALGVTVVGFPVLMGTTIALTERVWTADRVSGSVLHRSRSLVGTGLAEWLFAGWVSRPVLTVARKRWLQERRVPIGLLFQGYLLMLAPLVFLPIFAAGEVPGVALVGLVFLSAVGTALAFGAELVGTEYASLPMTLTSVSGRHFIRGTVFAGITISGPFTLLVVLLLGLGSPLVGVELLVLGVVGIVLIACSVVVSAMLGLDAPYYAIRAEAIPFTDITAYTESGGVFKWGKVFAVVGLVCIPAYMVYGARFVGGPVATALGASMPVVRIGALIVTSLFAIAVAALAYRRAVARFNEYTLP	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	510 (493)
Sequences:	111 (94)
Seq/√Len:	4.2

HALSA - Q9HHM1 Q9HS00 Q9HNY2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
271_V	356_G	4.435	0.91
19_G	360_A	4.359	0.90
42_F	414_Y	3.625	0.78
355_R	497_Y	3.486	0.76
97_V	408_L	3.394	0.73
363_T	451_I	3.070	0.65
399_A	487_L	3.058	0.65
332_E	413_P	3.032	0.64
264_V	359_F	2.964	0.62
361_G	496_A	2.949	0.62
347_S	484_V	2.733	0.56
22_I	117_A	2.716	0.55
123_T	209_L	2.702	0.55
204_E	208_G	2.675	0.54
323_V	338_Y	2.642	0.53
66_L	234_W	2.608	0.52
133_S	336_T	2.523	0.49
476_V	480_G	2.469	0.48
52_R	82_V	2.434	0.47
14_G	97_V	2.431	0.47
351_R	473_S	2.401	0.46
430_Y	433_S	2.401	0.46
19_G	104_G	2.370	0.45
35_Q	337_E	2.324	0.44
60_L	498_R	2.321	0.43
42_F	323_V	2.265	0.42
87_A	462_V	2.259	0.42
277_L	280_R	2.242	0.41
136_T	294_M	2.240	0.41
210_S	303_I	2.229	0.41
66_L	367_P	2.226	0.41
32_S	503_R	2.214	0.40
125_A	446_V	2.207	0.40
158_F	401_S	2.198	0.40
209_L	221_V	2.188	0.40
68_T	484_V	2.148	0.38
427_I	430_Y	2.147	0.38
366_G	370_L	2.122	0.38
278_Q	332_E	2.115	0.38
375_L	378_L	2.084	0.37
203_T	208_G	2.082	0.37
363_T	455_M	2.062	0.36
82_V	336_T	2.007	0.35
347_S	456_V	1.983	0.34
69_V	353_F	1.965	0.33
278_Q	413_P	1.946	0.33
19_G	407_M	1.916	0.32
331_A	413_P	1.898	0.32
425_T	433_S	1.889	0.31
113_T	304_F	1.885	0.31
133_S	332_E	1.861	0.31
69_V	330_G	1.827	0.30
75_A	501_V	1.819	0.30
292_L	323_V	1.817	0.30
338_Y	425_T	1.808	0.29
160_L	209_L	1.780	0.29
152_Y	391_G	1.764	0.28
92_L	160_L	1.763	0.28
133_S	278_Q	1.728	0.27
67_T	305_A	1.727	0.27
147_R	292_L	1.715	0.27
159_I	316_G	1.714	0.27
222_L	291_Y	1.706	0.27
195_L	212_L	1.705	0.27
7_L	501_V	1.703	0.27
228_A	481_A	1.696	0.27
345_L	496_A	1.637	0.25
383_V	391_G	1.630	0.25
36_T	188_G	1.626	0.25
248_R	375_L	1.614	0.25
113_T	197_G	1.606	0.25
133_S	413_P	1.603	0.25
52_R	197_G	1.603	0.25
425_T	432_E	1.601	0.25
118_V	232_R	1.580	0.24
87_A	203_T	1.576	0.24
323_V	414_Y	1.573	0.24
38_A	219_F	1.568	0.24
132_L	164_I	1.566	0.24
58_E	279_E	1.552	0.23
123_T	252_G	1.550	0.23
68_T	337_E	1.546	0.23
159_I	205_P	1.534	0.23
170_Q	300_F	1.534	0.23
19_G	195_L	1.522	0.23
317_L	322_A	1.517	0.23
300_F	378_L	1.512	0.23
11_G	394_G	1.511	0.23
15_A	492_V	1.508	0.23
194_A	210_S	1.503	0.22
209_L	213_G	1.502	0.22
63_G	420_E	1.501	0.22
192_D	337_E	1.494	0.22
125_A	444_A	1.489	0.22
207_R	344_T	1.486	0.22
238_R	329_F	1.484	0.22
272_A	448_L	1.477	0.22
191_V	347_S	1.477	0.22
216_V	408_L	1.474	0.22
432_E	442_V	1.473	0.22
368_F	435_G	1.471	0.22
377_G	484_V	1.469	0.22
98_A	102_A	1.465	0.22
354_I	477_V	1.461	0.22
380_S	429_A	1.454	0.21
155_V	490_I	1.454	0.21
350_G	414_Y	1.454	0.21
42_F	124_L	1.450	0.21
269_L	384_G	1.448	0.21
235_T	299_V	1.446	0.21
191_V	277_L	1.437	0.21
121_F	365_S	1.437	0.21
189_W	210_S	1.437	0.21
378_L	475_P	1.436	0.21
323_V	415_Y	1.436	0.21
224_G	395_I	1.429	0.21
209_L	378_L	1.427	0.21
277_L	330_G	1.426	0.21
192_D	313_A	1.425	0.21
278_Q	331_A	1.422	0.21
25_G	195_L	1.419	0.21
19_G	236_A	1.413	0.21
192_D	353_F	1.411	0.21
289_Q	327_L	1.407	0.21
368_F	472_A	1.406	0.21
157_T	401_S	1.401	0.20
39_V	451_I	1.397	0.20
232_R	259_L	1.396	0.20
36_T	126_A	1.392	0.20
244_L	462_V	1.391	0.20
74_A	264_V	1.390	0.20
43_I	221_V	1.387	0.20
128_L	193_L	1.387	0.20
331_A	334_V	1.383	0.20
265_S	452_P	1.375	0.20
18_I	354_I	1.371	0.20
43_I	146_L	1.371	0.20
43_I	354_I	1.367	0.20
304_F	501_V	1.360	0.20
85_Q	108_P	1.360	0.20
323_V	332_E	1.356	0.20
213_G	219_F	1.352	0.19
271_V	367_P	1.332	0.19
428_T	433_S	1.330	0.19
325_T	371_L	1.327	0.19
292_L	412_A	1.321	0.19
173_L	212_L	1.318	0.19
117_A	155_V	1.316	0.19
346_T	350_G	1.311	0.19
52_R	148_R	1.310	0.19
161_G	284_I	1.306	0.19
143_S	344_T	1.304	0.19
115_G	389_V	1.304	0.19
160_L	359_F	1.303	0.19
294_M	499_R	1.297	0.18
121_F	140_T	1.294	0.18
108_P	487_L	1.283	0.18
470_L	491_A	1.281	0.18
189_W	507_Y	1.279	0.18
244_L	247_S	1.277	0.18
159_I	263_W	1.271	0.18
112_V	202_P	1.271	0.18
47_S	117_A	1.266	0.18
366_G	451_I	1.265	0.18
192_D	344_T	1.263	0.18
272_A	356_G	1.262	0.18
39_V	48_L	1.253	0.18
42_F	338_Y	1.246	0.18
46_L	396_V	1.246	0.18
196_F	208_G	1.244	0.18
388_L	454_Y	1.237	0.17
488_F	491_A	1.236	0.17
335_G	409_G	1.234	0.17
164_I	391_G	1.232	0.17
159_I	180_D	1.229	0.17
78_L	295_L	1.228	0.17
81_T	148_R	1.223	0.17
214_V	486_S	1.218	0.17
150_K	240_S	1.218	0.17
462_V	505_N	1.216	0.17
141_S	373_V	1.215	0.17
19_G	137_K	1.213	0.17
182_L	473_S	1.210	0.17
237_D	392_V	1.209	0.17
214_V	484_V	1.208	0.17
116_V	258_W	1.203	0.17
190_F	363_T	1.198	0.17
330_G	374_L	1.190	0.17
67_T	321_S	1.187	0.17
64_Y	158_F	1.187	0.17
137_K	309_V	1.183	0.17
278_Q	335_G	1.181	0.16
76_L	98_A	1.176	0.16
132_L	358_V	1.173	0.16
157_T	392_V	1.171	0.16
56_V	131_V	1.170	0.16
60_L	120_G	1.169	0.16
65_L	150_K	1.168	0.16
154_Y	345_L	1.166	0.16
161_G	167_T	1.166	0.16
216_V	392_V	1.165	0.16
215_T	258_W	1.158	0.16
82_V	133_S	1.158	0.16
38_A	280_R	1.144	0.16
280_R	286_L	1.140	0.16
71_A	76_L	1.140	0.16
43_I	216_V	1.140	0.16
133_S	333_L	1.134	0.16
149_Y	461_F	1.134	0.16
103_L	112_V	1.131	0.16
376_L	401_S	1.129	0.16
160_L	447_G	1.129	0.16
22_I	472_A	1.117	0.15
318_V	337_E	1.116	0.15
189_W	192_D	1.114	0.15
462_V	467_A	1.113	0.15
108_P	480_G	1.113	0.15
428_T	432_E	1.113	0.15
345_L	355_R	1.111	0.15
289_Q	332_E	1.111	0.15
9_I	290_G	1.110	0.15
94_A	368_F	1.108	0.15
345_L	370_L	1.107	0.15
187_P	344_T	1.103	0.15
118_V	247_S	1.101	0.15
372_V	388_L	1.100	0.15
332_E	338_Y	1.097	0.15
107_T	337_E	1.097	0.15
35_Q	70_G	1.092	0.15
61_D	78_L	1.091	0.15
46_L	279_E	1.089	0.15
59_R	393_V	1.088	0.15
345_L	376_L	1.084	0.15
14_G	391_G	1.083	0.15
183_Q	496_A	1.082	0.15
56_V	117_A	1.077	0.15
427_I	434_G	1.076	0.15
280_R	356_G	1.074	0.15
332_E	415_Y	1.072	0.15
219_F	475_P	1.071	0.15
214_V	225_T	1.069	0.15
106_Q	237_D	1.068	0.15
54_S	133_S	1.067	0.15
299_V	481_A	1.067	0.15
424_F	432_E	1.064	0.15
159_I	213_G	1.058	0.15
207_R	325_T	1.056	0.15
67_T	410_L	1.055	0.15
193_L	492_V	1.053	0.14
17_L	480_G	1.053	0.14
33_A	304_F	1.052	0.14
190_F	217_V	1.043	0.14
292_L	307_G	1.042	0.14
209_L	379_G	1.040	0.14
60_L	376_L	1.035	0.14
150_K	377_G	1.032	0.14
346_T	496_A	1.031	0.14
64_Y	357_T	1.030	0.14
294_M	431_T	1.029	0.14
38_A	173_L	1.024	0.14
135_A	209_L	1.024	0.14
165_W	222_L	1.020	0.14
77_G	129_G	1.019	0.14
76_L	501_V	1.013	0.14
52_R	188_G	1.012	0.14
84_R	392_V	1.010	0.14
227_I	360_A	1.008	0.14
116_V	316_G	1.006	0.14
351_R	356_G	1.006	0.14
167_T	237_D	1.005	0.14
12_G	100_G	1.004	0.14
185_V	407_M	1.004	0.14
161_G	320_L	0.998	0.14
330_G	354_I	0.998	0.14
21_L	242_S	0.996	0.14
79_V	279_E	0.992	0.14
276_W	436_V	0.990	0.14
292_L	332_E	0.986	0.14
69_V	105_S	0.986	0.14
46_L	455_M	0.984	0.13
42_F	292_L	0.982	0.13
63_G	199_T	0.981	0.13
85_Q	131_V	0.980	0.13
81_T	85_Q	0.978	0.13
35_Q	190_F	0.976	0.13
133_S	331_A	0.976	0.13
80_F	384_G	0.975	0.13
407_M	411_D	0.972	0.13
230_T	354_I	0.970	0.13
353_F	478_R	0.969	0.13
70_G	435_G	0.968	0.13
46_L	116_V	0.966	0.13
216_V	325_T	0.965	0.13
121_F	297_P	0.956	0.13
112_V	238_R	0.956	0.13
217_V	498_R	0.954	0.13
8_S	400_C	0.954	0.13
118_V	467_A	0.951	0.13
191_V	425_T	0.948	0.13
81_T	106_Q	0.946	0.13
80_F	83_Y	0.945	0.13
269_L	363_T	0.943	0.13
191_V	240_S	0.942	0.13
338_Y	343_M	0.941	0.13
160_L	290_G	0.938	0.13
169_L	476_V	0.933	0.13
388_L	492_V	0.924	0.13
122_V	184_V	0.923	0.13
39_V	367_P	0.921	0.13
187_P	225_T	0.920	0.13
237_D	382_L	0.916	0.13
139_A	353_F	0.915	0.13
10_G	358_V	0.915	0.13
112_V	392_V	0.912	0.13
86_V	248_R	0.909	0.12
46_L	95_L	0.904	0.12
147_R	336_T	0.904	0.12
9_I	347_S	0.903	0.12
128_L	426_D	0.903	0.12
297_P	394_G	0.903	0.12
35_Q	373_V	0.903	0.12
365_S	395_I	0.901	0.12
129_G	234_W	0.899	0.12
389_V	490_I	0.896	0.12
141_S	318_V	0.893	0.12
301_L	412_A	0.892	0.12
114_V	187_P	0.888	0.12
153_T	294_M	0.888	0.12
253_T	498_R	0.887	0.12
139_A	163_L	0.884	0.12
21_L	467_A	0.884	0.12
154_Y	226_T	0.882	0.12
173_L	472_A	0.882	0.12
70_G	93_P	0.881	0.12
180_D	207_R	0.881	0.12
18_I	361_G	0.879	0.12
67_T	192_D	0.879	0.12
211_A	227_I	0.871	0.12
23_A	211_A	0.870	0.12
368_F	488_F	0.870	0.12
114_V	504_F	0.867	0.12
153_T	379_G	0.863	0.12
401_S	430_Y	0.862	0.12
114_V	388_L	0.862	0.12
338_Y	423_P	0.862	0.12
297_P	369_T	0.861	0.12
199_T	331_A	0.860	0.12
85_Q	269_L	0.857	0.12
222_L	477_V	0.857	0.12
374_L	483_I	0.855	0.12
332_E	335_G	0.854	0.12
222_L	276_W	0.853	0.12
107_T	318_V	0.852	0.12
119_V	211_A	0.847	0.12
69_V	456_V	0.846	0.12
344_T	455_M	0.844	0.12
258_W	416_A	0.843	0.12
35_Q	110_T	0.842	0.12
102_A	230_T	0.839	0.12
150_K	421_A	0.836	0.12
432_E	436_V	0.835	0.12
16_Y	276_W	0.834	0.12
32_S	490_I	0.832	0.12
365_S	491_A	0.832	0.12
68_T	343_M	0.831	0.11
215_T	220_P	0.828	0.11
289_Q	320_L	0.828	0.11
104_G	360_A	0.827	0.11
228_A	303_I	0.826	0.11
353_F	410_L	0.824	0.11
214_V	461_F	0.824	0.11
10_G	347_S	0.821	0.11
170_Q	247_S	0.817	0.11
9_I	99_V	0.816	0.11
258_W	463_G	0.813	0.11
119_V	471_G	0.811	0.11
339_A	449_V	0.810	0.11
424_F	433_S	0.808	0.11
38_A	238_R	0.808	0.11
156_L	386_E	0.806	0.11
69_V	478_R	0.802	0.11
188_G	429_A	0.801	0.11
96_A	160_L	0.800	0.11
228_A	321_S	0.800	0.11
96_A	261_A	0.797	0.11
333_L	406_A	0.794	0.11
8_S	410_L	0.792	0.11
22_I	101_L	0.791	0.11
208_G	378_L	0.791	0.11
35_Q	141_S	0.790	0.11
191_V	394_G	0.788	0.11
249_S	254_G	0.787	0.11
12_G	329_F	0.787	0.11
45_F	128_L	0.786	0.11
286_L	307_G	0.786	0.11
217_V	371_L	0.785	0.11
378_L	488_F	0.784	0.11
189_W	341_L	0.784	0.11
265_S	378_L	0.783	0.11
92_L	240_S	0.783	0.11
139_A	155_V	0.782	0.11
9_I	155_V	0.780	0.11
355_R	376_L	0.780	0.11
117_A	354_I	0.777	0.11
113_T	215_T	0.777	0.11
52_R	336_T	0.777	0.11
158_F	288_F	0.776	0.11
235_T	491_A	0.774	0.11
259_L	490_I	0.773	0.11
301_L	492_V	0.772	0.11
123_T	451_I	0.770	0.11
65_L	401_S	0.769	0.11
138_L	452_P	0.767	0.11
74_A	369_T	0.766	0.11
74_A	324_G	0.765	0.11
424_F	430_Y	0.764	0.11
157_T	313_A	0.763	0.11
157_T	365_S	0.763	0.11
47_S	298_L	0.762	0.11
112_V	393_V	0.761	0.11
239_V	324_G	0.760	0.11
213_G	462_V	0.757	0.11
208_G	462_V	0.756	0.11
50_I	270_T	0.756	0.11
173_L	247_S	0.756	0.11
160_L	311_G	0.753	0.11
276_W	337_E	0.753	0.11
31_V	377_G	0.752	0.11
452_P	480_G	0.751	0.11
43_I	376_L	0.749	0.11
277_L	493_A	0.748	0.11
112_V	366_G	0.748	0.11
41_G	182_L	0.744	0.10
28_T	317_L	0.744	0.10
155_V	251_V	0.744	0.10
362_I	408_L	0.743	0.10
331_A	338_Y	0.739	0.10
88_V	205_P	0.738	0.10
347_S	396_V	0.737	0.10
97_V	334_V	0.736	0.10
242_S	475_P	0.736	0.10
261_A	271_V	0.733	0.10
294_M	319_F	0.732	0.10
88_V	404_V	0.730	0.10
46_L	248_R	0.729	0.10
289_Q	361_G	0.729	0.10
80_F	460_R	0.729	0.10
144_P	319_F	0.729	0.10
197_G	234_W	0.725	0.10
296_A	372_V	0.724	0.10
182_L	351_R	0.724	0.10
279_E	338_Y	0.723	0.10
127_L	291_Y	0.723	0.10
245_H	465_P	0.723	0.10
224_G	291_Y	0.722	0.10
170_Q	339_A	0.722	0.10
218_G	306_A	0.720	0.10
276_W	485_T	0.719	0.10
173_L	374_L	0.719	0.10
483_I	488_F	0.718	0.10
133_S	338_Y	0.718	0.10
424_F	436_V	0.717	0.10
15_A	100_G	0.715	0.10
25_G	104_G	0.715	0.10
186_P	409_G	0.714	0.10
157_T	352_H	0.713	0.10
84_R	361_G	0.712	0.10
275_R	348_V	0.711	0.10
266_R	473_S	0.709	0.10
75_A	357_T	0.709	0.10
58_E	430_Y	0.708	0.10
340_S	344_T	0.708	0.10
204_E	260_F	0.705	0.10
37_A	236_A	0.704	0.10
359_F	453_A	0.704	0.10
58_E	372_V	0.703	0.10
8_S	194_A	0.702	0.10
221_V	375_L	0.702	0.10
189_W	338_Y	0.701	0.10
244_L	394_G	0.700	0.10
66_L	230_T	0.700	0.10
214_V	384_G	0.698	0.10
225_T	394_G	0.696	0.10
219_F	445_V	0.694	0.10
100_G	447_G	0.694	0.10
328_A	381_P	0.692	0.10
157_T	210_S	0.692	0.10
116_V	242_S	0.690	0.10
413_P	433_S	0.690	0.10
129_G	480_G	0.690	0.10
33_A	119_V	0.689	0.10
310_P	507_Y	0.688	0.10
30_P	93_P	0.688	0.10
182_L	356_G	0.685	0.10
297_P	327_L	0.685	0.10
195_L	360_A	0.683	0.10
82_V	332_E	0.683	0.10
35_Q	299_V	0.683	0.10
333_L	498_R	0.683	0.10
323_V	425_T	0.683	0.10
181_W	217_V	0.682	0.10
216_V	259_L	0.681	0.10
13_T	357_T	0.680	0.10
127_L	222_L	0.680	0.10
262_G	376_L	0.680	0.10
37_A	498_R	0.679	0.10
289_Q	495_L	0.677	0.10
30_P	34_I	0.677	0.10
59_R	379_G	0.676	0.10
14_G	19_G	0.676	0.10
128_L	149_Y	0.676	0.10
188_G	440_G	0.675	0.10
43_I	472_A	0.675	0.10
348_V	383_V	0.672	0.10
178_A	360_A	0.672	0.10
50_I	362_I	0.671	0.10
358_V	398_I	0.670	0.10
39_V	185_V	0.669	0.10
228_A	324_G	0.668	0.10
283_P	331_A	0.668	0.10
86_V	93_P	0.665	0.10
425_T	443_F	0.664	0.10
139_A	484_V	0.664	0.10
279_E	425_T	0.663	0.10
78_L	234_W	0.663	0.10
479_I	495_L	0.662	0.10
166_I	391_G	0.662	0.10
422_I	425_T	0.661	0.10
94_A	193_L	0.659	0.10
99_V	121_F	0.659	0.10
35_Q	344_T	0.658	0.10
421_A	451_I	0.657	0.10
333_L	365_S	0.655	0.10
371_L	472_A	0.655	0.10
374_L	391_G	0.654	0.10
180_D	389_V	0.652	0.09
302_P	346_T	0.652	0.09
332_E	336_T	0.649	0.09
114_V	209_L	0.648	0.09
124_L	269_L	0.648	0.09
83_Y	100_G	0.648	0.09
31_V	103_L	0.648	0.09
376_L	416_A	0.646	0.09
70_G	189_W	0.643	0.09
97_V	376_L	0.641	0.09
116_V	503_R	0.640	0.09
20_K	135_A	0.640	0.09
278_Q	409_G	0.640	0.09
100_G	481_A	0.636	0.09
297_P	358_V	0.636	0.09
79_V	198_L	0.632	0.09
190_F	352_H	0.632	0.09
227_I	312_V	0.632	0.09
309_V	462_V	0.631	0.09
314_L	322_A	0.631	0.09
105_S	221_V	0.630	0.09
18_I	359_F	0.630	0.09
23_A	460_R	0.628	0.09
186_P	335_G	0.627	0.09
310_P	496_A	0.627	0.09
156_L	221_V	0.627	0.09
61_D	109_A	0.627	0.09
116_V	446_V	0.627	0.09
192_D	350_G	0.626	0.09
91_F	347_S	0.626	0.09
118_V	155_V	0.625	0.09
112_V	173_L	0.625	0.09
28_T	221_V	0.625	0.09
338_Y	412_A	0.624	0.09
197_G	225_T	0.623	0.09
92_L	213_G	0.620	0.09
371_L	447_G	0.620	0.09
375_L	379_G	0.620	0.09
75_A	110_T	0.620	0.09
66_L	292_L	0.617	0.09
117_A	207_R	0.615	0.09
205_P	309_V	0.615	0.09
289_Q	307_G	0.615	0.09
155_V	215_T	0.613	0.09
42_F	425_T	0.613	0.09
42_F	412_A	0.612	0.09
243_V	404_V	0.611	0.09
132_L	217_V	0.609	0.09
380_S	397_L	0.608	0.09
278_Q	338_Y	0.608	0.09
53_T	325_T	0.608	0.09
18_I	111_A	0.608	0.09
140_T	275_R	0.607	0.09
347_S	504_F	0.605	0.09
234_W	367_P	0.605	0.09
29_L	205_P	0.602	0.09
71_A	289_Q	0.601	0.09
331_A	409_G	0.600	0.09
347_S	490_I	0.599	0.09
274_K	346_T	0.597	0.09
416_A	433_S	0.597	0.09
339_A	387_L	0.596	0.09
347_S	447_G	0.596	0.09
15_A	68_T	0.595	0.09
176_Q	390_L	0.594	0.09
64_Y	235_T	0.594	0.09
210_S	383_V	0.594	0.09
99_V	412_A	0.593	0.09
40_A	125_A	0.593	0.09
24_R	475_P	0.593	0.09
173_L	300_F	0.592	0.09
101_L	114_V	0.592	0.09
22_I	136_T	0.592	0.09
391_G	401_S	0.591	0.09
25_G	387_L	0.591	0.09
45_F	80_F	0.590	0.09
159_I	176_Q	0.589	0.09
75_A	81_T	0.588	0.09
119_V	304_F	0.587	0.09
52_R	344_T	0.587	0.09
323_V	423_P	0.585	0.09
195_L	198_L	0.585	0.09
50_I	67_T	0.585	0.09
10_G	264_V	0.584	0.09
242_S	271_V	0.584	0.09
92_L	370_L	0.583	0.09
112_V	506_E	0.582	0.09
296_A	442_V	0.582	0.09
199_T	332_E	0.581	0.09
190_F	368_F	0.580	0.09
60_L	398_I	0.580	0.09
173_L	395_I	0.580	0.09
98_A	316_G	0.580	0.09
139_A	142_R	0.579	0.09
99_V	498_R	0.579	0.09
68_T	353_F	0.578	0.09
58_E	310_P	0.577	0.09
76_L	376_L	0.574	0.09
150_K	339_A	0.573	0.09
43_I	415_Y	0.573	0.09
407_M	410_L	0.572	0.09
186_P	281_R	0.570	0.09
91_F	295_L	0.568	0.09
36_T	489_A	0.568	0.09
82_V	278_Q	0.567	0.09
226_T	351_R	0.567	0.09
87_A	366_G	0.566	0.09
24_R	289_Q	0.566	0.09
199_T	320_L	0.566	0.09
145_R	299_V	0.565	0.09
311_G	321_S	0.564	0.09
281_R	409_G	0.563	0.09
204_E	386_E	0.562	0.09
216_V	446_V	0.561	0.09
294_M	352_H	0.559	0.09
197_G	410_L	0.559	0.09
123_T	207_R	0.559	0.09
228_A	232_R	0.557	0.09
69_V	322_A	0.557	0.09
234_W	507_Y	0.556	0.09
432_E	443_F	0.556	0.09
20_K	230_T	0.555	0.09
24_R	202_P	0.555	0.09
369_T	373_V	0.555	0.09
143_S	402_V	0.554	0.09
230_T	350_G	0.554	0.09
167_T	303_I	0.552	0.09
142_R	321_S	0.551	0.09
296_A	484_V	0.551	0.09
43_I	53_T	0.551	0.09
155_V	262_G	0.548	0.08
283_P	409_G	0.548	0.08
331_A	335_G	0.547	0.08
100_G	322_A	0.547	0.08
106_Q	264_V	0.546	0.08
53_T	365_S	0.546	0.08
103_L	205_P	0.545	0.08
96_A	134_L	0.544	0.08
255_L	447_G	0.543	0.08
41_G	362_I	0.542	0.08
70_G	196_F	0.542	0.08
63_G	179_C	0.541	0.08
425_T	489_A	0.539	0.08
425_T	430_Y	0.537	0.08
321_S	449_V	0.536	0.08
103_L	437_F	0.536	0.08
76_L	102_A	0.535	0.08
47_S	163_L	0.535	0.08
90_V	368_F	0.535	0.08
43_I	94_A	0.534	0.08
154_Y	406_A	0.534	0.08
99_V	406_A	0.534	0.08
422_I	433_S	0.533	0.08
203_T	220_P	0.532	0.08
46_L	313_A	0.532	0.08
267_P	429_A	0.531	0.08
54_S	374_L	0.531	0.08
150_K	157_T	0.531	0.08
211_A	340_S	0.531	0.08
329_F	380_S	0.530	0.08
64_Y	73_E	0.530	0.08
120_G	195_L	0.530	0.08
61_D	167_T	0.529	0.08
28_T	313_A	0.529	0.08
92_L	103_L	0.529	0.08
123_T	487_L	0.526	0.08
223_M	373_V	0.526	0.08
304_F	472_A	0.524	0.08
197_G	498_R	0.521	0.08
236_A	445_V	0.521	0.08
54_S	159_I	0.520	0.08
466_V	487_L	0.518	0.08
29_L	74_A	0.518	0.08
197_G	212_L	0.517	0.08
40_A	169_L	0.516	0.08
134_L	181_W	0.515	0.08
43_I	210_S	0.514	0.08
9_I	327_L	0.514	0.08
39_V	467_A	0.514	0.08
86_V	378_L	0.513	0.08
34_I	213_G	0.512	0.08
75_A	174_S	0.510	0.08
191_V	377_G	0.508	0.08
60_L	155_V	0.507	0.08
162_F	166_I	0.507	0.08
280_R	341_L	0.506	0.08
69_V	348_V	0.506	0.08
236_A	388_L	0.505	0.08
273_R	338_Y	0.504	0.08
409_G	413_P	0.504	0.08
156_L	376_L	0.504	0.08
113_T	174_S	0.503	0.08
332_E	409_G	0.503	0.08
315_V	481_A	0.503	0.08
22_I	304_F	0.502	0.08
315_V	426_D	0.502	0.08
68_T	504_F	0.502	0.08
33_A	391_G	0.501	0.08
43_I	242_S	0.501	0.08
375_L	391_G	0.501	0.08
285_G	338_Y	0.501	0.08
208_G	223_M	0.501	0.08
117_A	440_G	0.500	0.08
391_G	472_A	0.500	0.08
192_D	268_V	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2m20A	2	0.102	2.2	0.986	Contact Map
2d46A	1	0.1176	1.3	0.988	Contact Map
3s6pE	5	0.1412	1.2	0.988	Contact Map
2ygvE	1	0.0392	0.9	0.989	Contact Map
1jb0M	1	0.0471	0.9	0.989	Contact Map
2qqpB	5	0.1314	0.8	0.989	Contact Map
3g2eA	4	0.1039	0.8	0.989	Contact Map
4ub6R	1	0.0588	0.8	0.989	Contact Map
3qe7A	2	0.1373	0.7	0.99	Contact Map
2lcnA	1	0.0373	0.6	0.99	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0133 seconds.