Q9HHI4 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HHI4 - Vng6379c

UniProt:	Q9HHI4	Sequences: MSADTRRQKAERIRHLLDTEGDAVHENTQVFNEGRYESTANLDDYDELKNEARAIKEDAIERLPELIDQVTEAVEANGGSVYVADDAADANRYMEEVVDGRDVVKSKSMTSEEIEVNESLEARGGDVWETDLAEFVLQVADEAPSHIVAPAIHKSREEIATLFNEVFDPEEPLETAEELTRFAREYLGEKILDAEVGMTGANFVTADTGTLALVTSEGNARKCVQATDTHVAVAGVEKLVPSVEDLQPFVELIGRSGTGQDITSYVSLFTPPSDSPTFGGNELESGDDREFHLVLIDNGRMEMREDDQLRETLYCIRCSACANSCANFQHVGGHAFGGETYSGGIATGWEAGVHGEDSAAEFNDLCTGCSRCVNQCPVNIDIPWINTVVRDRINRGKDGDLDFLVEGLTPDEEPGGVDLQKRLFGNFDTLAKLGSAFAPLSNWAARTGPARSLLERTLGVDSRRELPEFERESLVEWFEKRGPRVGRDEARRQVALYPDAYTNYVRTERGKAAVRVLEALDIRVDVPPAGESGRAPLSQGMVSTAQSNANAVYDAIAPAIAAGHDVVVIEPSDLAMFHREYERLLPEDDYAALQEHSYELMEYVYGLLENGADIDVLPGGGDERIAYHSHCQQRTLDLEPYTVAVLEDCGFDVTTSDVECCGMAGSFGYKSEYYELSVDVGETLVDQFTTEDTADRTVVASGTSCLEQLDALLTRRPAHPVRLLDTQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	727 (680)
Sequences:	179 (129)
Seq/√Len:	4.9

ECOLI - YKGF
BACSU - LUTB
HALSA - Q9HHI4

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
52_A	252_L	5.771	0.99
93_Y	97_V	5.076	0.97
630_H	700_A	5.053	0.97
477_W	511_K	4.944	0.97
62_R	65_E	4.929	0.97
82_Y	89_D	4.919	0.97
92_R	96_E	4.224	0.92
688_F	709_L	4.191	0.92
436_A	473_S	4.121	0.91
58_D	62_R	4.002	0.89
103_V	125_G	3.669	0.85
320_A	377_P	3.580	0.83
210_T	270_T	3.512	0.82
667_F	676_L	3.508	0.82
38_S	257_G	3.449	0.81
116_V	198_M	3.362	0.79
306_D	392_R	3.246	0.76
104_V	130_T	3.221	0.76
216_S	319_S	3.129	0.73
82_Y	93_Y	3.122	0.73
57_E	314_Y	3.114	0.73
599_E	701_S	3.051	0.71
688_F	698_V	3.035	0.71
199_T	224_V	2.999	0.70
390_R	630_H	2.939	0.68
344_G	382_I	2.917	0.68
557_A	589_D	2.872	0.66
49_K	216_S	2.838	0.65
49_K	149_A	2.642	0.60
82_Y	97_V	2.509	0.55
381_D	384_W	2.508	0.55
74_V	79_G	2.487	0.55
534_R	538_S	2.423	0.53
106_S	130_T	2.335	0.50
487_R	490_A	2.323	0.49
331_V	340_T	2.249	0.47
96_E	100_G	2.149	0.44
69_Q	185_E	2.147	0.44
87_A	267_S	2.114	0.43
179_L	723_L	2.114	0.43
428_D	432_K	2.113	0.43
110_T	629_S	2.104	0.42
594_Q	597_S	2.085	0.42
220_A	367_T	2.082	0.42
434_G	457_T	2.078	0.42
63_L	236_V	2.072	0.41
357_D	450_A	2.059	0.41
623_E	697_T	2.038	0.40
624_R	654_T	2.028	0.40
64_P	83_V	2.019	0.40
211_L	604_V	1.999	0.39
162_L	320_A	1.994	0.39
149_A	264_S	1.990	0.39
149_A	216_S	1.989	0.39
529_A	562_A	1.986	0.39
88_A	92_R	1.971	0.38
147_I	711_A	1.971	0.38
127_V	383_P	1.954	0.38
497_Y	581_Y	1.952	0.38
497_Y	566_V	1.940	0.37
37_E	40_A	1.931	0.37
632_Q	702_G	1.914	0.37
62_R	585_L	1.903	0.36
468_E	594_Q	1.888	0.36
110_T	322_A	1.877	0.35
597_S	603_Y	1.863	0.35
157_E	566_V	1.843	0.34
432_K	435_S	1.840	0.34
250_V	255_R	1.826	0.34
500_A	531_E	1.816	0.34
111_S	625_I	1.811	0.34
73_A	76_A	1.799	0.33
86_D	557_A	1.781	0.33
216_S	254_G	1.775	0.32
294_V	494_V	1.769	0.32
71_T	75_E	1.756	0.32
629_S	656_S	1.751	0.32
431_A	435_S	1.720	0.31
603_Y	607_L	1.705	0.31
64_P	301_M	1.696	0.30
205_T	267_S	1.694	0.30
112_E	134_E	1.677	0.30
646_L	651_F	1.675	0.30
390_R	700_A	1.674	0.30
213_L	544_T	1.673	0.30
493_Q	562_A	1.654	0.29
428_D	431_A	1.651	0.29
125_G	190_K	1.649	0.29
36_Y	52_A	1.641	0.29
516_V	600_L	1.639	0.29
89_D	92_R	1.638	0.29
626_A	695_D	1.633	0.29
147_I	342_S	1.624	0.28
87_A	90_A	1.622	0.28
438_A	442_N	1.619	0.28
11_E	237_E	1.614	0.28
24_V	293_L	1.610	0.28
68_D	71_T	1.607	0.28
626_A	693_T	1.606	0.28
115_E	340_T	1.606	0.28
110_T	142_E	1.598	0.28
534_R	572_S	1.592	0.28
59_A	66_L	1.588	0.27
512_A	722_R	1.585	0.27
267_S	296_I	1.581	0.27
594_Q	725_D	1.576	0.27
722_R	725_D	1.574	0.27
148_V	258_T	1.564	0.27
379_N	572_S	1.562	0.27
44_D	47_E	1.556	0.27
182_F	664_A	1.552	0.27
142_E	154_K	1.543	0.26
130_T	223_C	1.542	0.26
254_G	257_G	1.542	0.26
442_N	445_A	1.541	0.26
441_S	444_A	1.539	0.26
216_S	257_G	1.539	0.26
698_V	709_L	1.537	0.26
212_A	268_L	1.537	0.26
49_K	319_S	1.529	0.26
38_S	49_K	1.526	0.26
224_V	227_T	1.518	0.26
41_N	688_F	1.514	0.26
109_M	215_T	1.506	0.25
438_A	441_S	1.493	0.25
90_A	294_V	1.490	0.25
663_M	704_S	1.484	0.25
100_G	623_E	1.482	0.25
40_A	257_G	1.472	0.25
69_Q	103_V	1.465	0.24
73_A	242_S	1.455	0.24
309_L	385_I	1.454	0.24
566_V	581_Y	1.437	0.24
547_S	612_A	1.430	0.24
38_S	216_S	1.425	0.23
46_D	49_K	1.420	0.23
49_K	379_N	1.419	0.23
141_D	572_S	1.416	0.23
375_Q	469_F	1.416	0.23
14_R	375_Q	1.413	0.23
90_A	663_M	1.408	0.23
711_A	717_P	1.406	0.23
151_A	264_S	1.404	0.23
149_A	257_G	1.402	0.23
135_F	152_I	1.400	0.23
70_V	239_L	1.400	0.23
322_A	354_H	1.387	0.23
309_L	352_G	1.385	0.23
19_T	541_M	1.385	0.23
86_D	293_L	1.384	0.23
152_I	263_T	1.383	0.22
676_L	688_F	1.381	0.22
664_A	704_S	1.378	0.22
591_A	714_T	1.373	0.22
504_Y	531_E	1.372	0.22
149_A	152_I	1.368	0.22
167_F	664_A	1.357	0.22
439_P	521_D	1.350	0.22
110_T	656_S	1.348	0.22
38_S	211_L	1.346	0.22
111_S	116_V	1.342	0.22
199_T	220_A	1.339	0.22
38_S	507_T	1.338	0.22
216_S	264_S	1.335	0.21
204_V	254_G	1.335	0.21
313_L	700_A	1.331	0.21
38_S	264_S	1.327	0.21
97_V	593_L	1.319	0.21
45_Y	336_F	1.318	0.21
320_A	496_L	1.314	0.21
152_I	264_S	1.312	0.21
95_E	123_R	1.312	0.21
513_A	656_S	1.312	0.21
380_I	385_I	1.308	0.21
259_G	294_V	1.308	0.21
570_E	702_G	1.308	0.21
63_L	512_A	1.307	0.21
241_P	667_F	1.306	0.21
74_V	293_L	1.303	0.21
326_A	535_A	1.299	0.21
60_I	378_V	1.297	0.21
567_V	594_Q	1.295	0.21
513_A	569_I	1.294	0.21
138_Q	292_H	1.287	0.20
111_S	195_E	1.286	0.20
303_M	585_L	1.273	0.20
44_D	151_A	1.272	0.20
196_V	231_V	1.268	0.20
494_V	567_V	1.261	0.20
517_L	524_V	1.257	0.20
626_A	629_S	1.255	0.20
494_V	725_D	1.254	0.20
12_R	262_I	1.249	0.20
22_D	26_E	1.244	0.20
224_V	269_F	1.244	0.20
262_I	700_A	1.241	0.19
179_L	549_A	1.236	0.19
570_E	632_Q	1.232	0.19
684_L	703_T	1.225	0.19
245_D	257_G	1.223	0.19
93_Y	669_Y	1.220	0.19
437_F	657_D	1.220	0.19
66_L	380_I	1.219	0.19
322_A	344_G	1.219	0.19
204_V	234_A	1.219	0.19
681_G	712_L	1.215	0.19
41_N	94_M	1.213	0.19
99_D	716_R	1.213	0.19
13_I	86_D	1.209	0.19
256_S	320_A	1.208	0.19
94_M	302_E	1.201	0.19
344_G	371_R	1.198	0.19
307_D	471_R	1.192	0.18
525_D	563_G	1.189	0.18
109_M	334_H	1.187	0.18
116_V	507_T	1.181	0.18
208_T	242_S	1.181	0.18
67_I	71_T	1.180	0.18
175_T	293_L	1.179	0.18
552_V	632_Q	1.175	0.18
706_L	717_P	1.172	0.18
633_Q	673_Y	1.171	0.18
72_E	86_D	1.171	0.18
20_E	367_T	1.170	0.18
220_A	348_G	1.166	0.18
513_A	653_V	1.165	0.18
516_V	724_L	1.160	0.18
86_D	294_V	1.159	0.18
97_V	110_T	1.159	0.18
500_A	532_S	1.158	0.18
119_S	594_Q	1.157	0.18
499_D	684_L	1.154	0.18
23_A	106_S	1.154	0.18
424_F	667_F	1.152	0.18
566_V	597_S	1.151	0.18
379_N	382_I	1.149	0.18
205_T	216_S	1.148	0.18
255_R	581_Y	1.147	0.18
98_V	430_L	1.144	0.18
256_S	497_Y	1.143	0.18
168_D	511_K	1.143	0.18
699_V	723_L	1.141	0.18
211_L	682_E	1.136	0.17
215_T	345_I	1.133	0.17
94_M	294_V	1.132	0.17
64_P	161_T	1.132	0.17
472_E	546_Q	1.131	0.17
79_G	293_L	1.131	0.17
390_R	629_S	1.128	0.17
513_A	686_D	1.128	0.17
335_A	680_V	1.128	0.17
226_A	257_G	1.125	0.17
231_V	239_L	1.121	0.17
85_D	557_A	1.115	0.17
602_E	622_D	1.114	0.17
259_G	363_N	1.109	0.17
259_G	381_D	1.109	0.17
566_V	593_L	1.108	0.17
125_G	683_T	1.108	0.17
135_F	186_Y	1.107	0.17
464_R	667_F	1.106	0.17
243_V	494_V	1.104	0.17
199_T	352_G	1.102	0.17
475_V	503_N	1.101	0.17
190_K	319_S	1.101	0.17
535_A	552_V	1.101	0.17
532_S	573_D	1.098	0.17
104_V	230_H	1.097	0.17
243_V	256_S	1.097	0.17
234_A	340_T	1.095	0.17
110_T	460_V	1.095	0.17
438_A	444_A	1.094	0.17
499_D	570_E	1.093	0.17
17_L	210_T	1.092	0.17
195_E	227_T	1.090	0.17
9_K	439_P	1.090	0.17
474_L	673_Y	1.088	0.17
240_V	290_E	1.086	0.17
38_S	149_A	1.086	0.17
123_R	587_E	1.081	0.16
38_S	111_S	1.081	0.16
42_L	96_E	1.080	0.16
11_E	68_D	1.079	0.16
128_W	135_F	1.078	0.16
505_V	604_V	1.077	0.16
112_E	258_T	1.073	0.16
134_E	258_T	1.073	0.16
139_V	494_V	1.072	0.16
104_V	223_C	1.070	0.16
51_E	496_L	1.067	0.16
49_K	257_G	1.064	0.16
252_L	316_I	1.061	0.16
255_R	622_D	1.061	0.16
319_S	572_S	1.059	0.16
589_D	592_A	1.058	0.16
614_I	622_D	1.052	0.16
42_L	244_E	1.052	0.16
93_Y	140_A	1.051	0.16
600_L	721_V	1.044	0.16
302_E	637_D	1.043	0.16
89_D	97_V	1.041	0.16
167_F	541_M	1.039	0.16
208_T	257_G	1.039	0.16
82_Y	425_G	1.038	0.16
19_T	155_S	1.037	0.16
554_D	682_E	1.036	0.16
699_V	720_P	1.036	0.16
138_Q	313_L	1.035	0.16
10_A	13_I	1.034	0.16
538_S	572_S	1.033	0.16
521_D	524_V	1.030	0.16
351_A	510_G	1.029	0.16
99_D	547_S	1.028	0.16
436_A	458_L	1.028	0.16
620_G	646_L	1.028	0.16
111_S	243_V	1.028	0.16
339_E	355_G	1.026	0.15
68_D	526_V	1.025	0.15
211_L	725_D	1.023	0.15
67_I	295_L	1.023	0.15
185_E	226_A	1.022	0.15
646_L	715_R	1.022	0.15
36_Y	47_E	1.022	0.15
89_D	498_P	1.021	0.15
156_R	187_L	1.020	0.15
192_L	572_S	1.020	0.15
147_I	506_R	1.018	0.15
221_R	265_Y	1.018	0.15
23_A	135_F	1.017	0.15
419_L	493_Q	1.015	0.15
48_L	104_V	1.014	0.15
499_D	532_S	1.014	0.15
494_V	651_F	1.014	0.15
655_T	699_V	1.012	0.15
211_L	257_G	1.011	0.15
531_E	548_N	1.009	0.15
97_V	635_T	1.006	0.15
440_L	508_E	1.005	0.15
167_F	572_S	1.004	0.15
137_L	601_M	1.004	0.15
424_F	676_L	1.003	0.15
240_V	500_A	1.001	0.15
504_Y	643_V	0.999	0.15
377_P	510_G	0.999	0.15
28_T	267_S	0.999	0.15
40_A	100_G	0.998	0.15
412_E	474_L	0.997	0.15
112_E	345_I	0.996	0.15
134_E	345_I	0.996	0.15
489_E	586_P	0.995	0.15
316_I	340_T	0.994	0.15
320_A	389_V	0.993	0.15
368_G	571_P	0.992	0.15
390_R	394_N	0.990	0.15
103_V	251_E	0.988	0.15
93_Y	351_A	0.988	0.15
160_A	699_V	0.986	0.15
686_D	714_T	0.984	0.15
79_G	513_A	0.984	0.15
29_Q	32_N	0.983	0.15
683_T	692_D	0.980	0.15
246_L	328_F	0.979	0.15
232_A	575_A	0.977	0.15
424_F	501_Y	0.976	0.15
545_A	567_V	0.975	0.15
125_G	198_M	0.974	0.15
477_W	481_R	0.971	0.15
266_V	584_L	0.970	0.15
423_L	434_G	0.969	0.15
100_G	654_T	0.969	0.15
159_I	638_L	0.967	0.15
52_A	248_P	0.966	0.15
347_T	572_S	0.965	0.14
216_S	227_T	0.964	0.14
112_E	117_N	0.963	0.14
117_N	134_E	0.963	0.14
320_A	497_Y	0.963	0.14
306_D	383_P	0.960	0.14
261_D	709_L	0.957	0.14
142_E	322_A	0.955	0.14
606_G	641_Y	0.954	0.14
290_E	675_E	0.953	0.14
668_G	674_Y	0.953	0.14
87_A	359_A	0.953	0.14
46_D	125_G	0.951	0.14
138_Q	266_V	0.950	0.14
361_E	693_T	0.949	0.14
67_I	236_V	0.948	0.14
75_E	97_V	0.946	0.14
137_L	257_G	0.945	0.14
347_T	704_S	0.943	0.14
120_L	127_V	0.943	0.14
390_R	675_E	0.943	0.14
26_E	135_F	0.942	0.14
89_D	577_F	0.942	0.14
97_V	351_A	0.939	0.14
342_S	382_I	0.939	0.14
531_E	573_D	0.936	0.14
317_R	345_I	0.934	0.14
355_G	380_I	0.934	0.14
438_A	515_R	0.929	0.14
384_W	438_A	0.928	0.14
257_G	342_S	0.927	0.14
521_D	525_D	0.925	0.14
509_R	534_R	0.923	0.14
112_E	144_P	0.923	0.14
134_E	144_P	0.923	0.14
80_S	488_D	0.922	0.14
311_E	598_Y	0.920	0.14
69_Q	594_Q	0.920	0.14
293_L	473_S	0.920	0.14
79_G	291_F	0.918	0.14
474_L	508_E	0.917	0.14
73_A	77_N	0.916	0.14
198_M	233_V	0.915	0.14
354_H	379_N	0.915	0.14
266_V	472_E	0.912	0.14
97_V	231_V	0.912	0.14
10_A	497_Y	0.911	0.14
49_K	244_E	0.911	0.14
573_D	712_L	0.911	0.14
390_R	656_S	0.911	0.14
162_L	319_S	0.910	0.14
100_G	255_R	0.909	0.14
83_V	98_V	0.908	0.14
383_P	392_R	0.907	0.14
656_S	688_F	0.905	0.14
179_L	182_F	0.905	0.14
599_E	704_S	0.905	0.14
231_V	475_V	0.905	0.14
475_V	530_G	0.904	0.14
658_V	683_T	0.903	0.14
504_Y	711_A	0.902	0.14
625_I	723_L	0.897	0.13
41_N	709_L	0.895	0.13
365_L	517_L	0.893	0.13
309_L	673_Y	0.893	0.13
69_Q	76_A	0.892	0.13
221_R	332_G	0.892	0.13
499_D	531_E	0.892	0.13
100_G	122_A	0.890	0.13
499_D	703_T	0.889	0.13
155_S	365_L	0.888	0.13
227_T	230_H	0.886	0.13
389_V	583_R	0.886	0.13
89_D	243_V	0.885	0.13
233_V	339_E	0.883	0.13
77_N	191_I	0.882	0.13
10_A	168_D	0.882	0.13
259_G	332_G	0.880	0.13
539_Q	606_G	0.880	0.13
61_E	69_Q	0.879	0.13
124_G	440_L	0.879	0.13
309_L	633_Q	0.878	0.13
370_S	378_V	0.878	0.13
64_P	644_A	0.875	0.13
339_E	354_H	0.875	0.13
276_P	666_S	0.874	0.13
203_F	240_V	0.872	0.13
595_E	652_D	0.871	0.13
201_A	389_V	0.869	0.13
98_V	196_V	0.869	0.13
225_Q	500_A	0.869	0.13
66_L	512_A	0.868	0.13
513_A	584_L	0.868	0.13
231_V	451_R	0.867	0.13
149_A	224_V	0.867	0.13
62_R	374_N	0.866	0.13
261_D	267_S	0.864	0.13
61_E	646_L	0.864	0.13
479_E	488_D	0.863	0.13
26_E	589_D	0.862	0.13
122_A	193_D	0.862	0.13
371_R	630_H	0.862	0.13
222_K	339_E	0.861	0.13
289_R	667_F	0.859	0.13
213_L	220_A	0.858	0.13
90_A	94_M	0.858	0.13
129_E	197_G	0.858	0.13
497_Y	633_Q	0.858	0.13
76_A	713_L	0.857	0.13
326_A	500_A	0.856	0.13
295_L	463_R	0.856	0.13
112_E	333_G	0.856	0.13
134_E	333_G	0.856	0.13
196_V	503_N	0.852	0.13
532_S	684_L	0.852	0.13
262_I	379_N	0.852	0.13
486_G	676_L	0.852	0.13
106_S	223_C	0.850	0.13
161_T	242_S	0.850	0.13
498_P	526_V	0.849	0.13
663_M	668_G	0.849	0.13
23_A	553_Y	0.849	0.13
110_T	319_S	0.847	0.13
128_W	379_N	0.842	0.13
500_A	573_D	0.841	0.13
77_N	274_D	0.839	0.13
151_A	254_G	0.837	0.13
149_A	319_S	0.836	0.13
10_A	718_A	0.835	0.13
335_A	510_G	0.835	0.13
545_A	644_A	0.834	0.13
21_G	339_E	0.833	0.13
109_M	144_P	0.831	0.12
201_A	650_G	0.830	0.12
167_F	182_F	0.829	0.12
494_V	531_E	0.827	0.12
432_K	453_L	0.826	0.12
581_Y	680_V	0.826	0.12
233_V	593_L	0.825	0.12
494_V	564_H	0.825	0.12
65_E	646_L	0.823	0.12
268_L	344_G	0.822	0.12
61_E	164_N	0.820	0.12
373_V	383_P	0.820	0.12
111_S	319_S	0.820	0.12
160_A	698_V	0.820	0.12
201_A	637_D	0.820	0.12
486_G	594_Q	0.819	0.12
100_G	123_R	0.818	0.12
242_S	245_D	0.816	0.12
19_T	351_A	0.816	0.12
76_A	124_G	0.813	0.12
38_S	205_T	0.811	0.12
144_P	317_R	0.811	0.12
316_I	666_S	0.810	0.12
63_L	301_M	0.810	0.12
136_V	159_I	0.810	0.12
10_A	89_D	0.809	0.12
316_I	505_V	0.809	0.12
389_V	629_S	0.809	0.12
208_T	693_T	0.807	0.12
216_S	226_A	0.805	0.12
500_A	684_L	0.805	0.12
211_L	245_D	0.804	0.12
12_R	47_E	0.804	0.12
149_A	254_G	0.803	0.12
336_F	510_G	0.803	0.12
52_A	377_P	0.801	0.12
428_D	530_G	0.800	0.12
294_V	305_E	0.800	0.12
578_H	664_A	0.799	0.12
27_N	149_A	0.799	0.12
158_E	591_A	0.799	0.12
473_S	503_N	0.798	0.12
256_S	377_P	0.798	0.12
27_N	148_V	0.797	0.12
457_T	551_A	0.797	0.12
535_A	632_Q	0.797	0.12
330_H	680_V	0.796	0.12
614_I	692_D	0.796	0.12
499_D	702_G	0.795	0.12
419_L	689_T	0.794	0.12
237_E	316_I	0.793	0.12
75_E	572_S	0.793	0.12
473_S	530_G	0.792	0.12
601_M	633_Q	0.792	0.12
179_L	292_H	0.791	0.12
10_A	294_V	0.790	0.12
448_G	491_R	0.789	0.12
590_Y	594_Q	0.788	0.12
215_T	220_A	0.788	0.12
98_V	638_L	0.788	0.12
34_G	49_K	0.787	0.12
110_T	569_I	0.787	0.12
569_I	572_S	0.785	0.12
63_L	621_G	0.782	0.12
602_E	701_S	0.782	0.12
208_T	578_H	0.781	0.12
657_D	692_D	0.781	0.12
349_W	367_T	0.779	0.12
294_V	572_S	0.779	0.12
82_Y	110_T	0.778	0.12
426_N	634_R	0.778	0.12
354_H	357_D	0.777	0.12
118_E	521_D	0.776	0.12
52_A	494_V	0.776	0.12
208_T	262_I	0.775	0.12
531_E	684_L	0.773	0.12
258_T	345_I	0.773	0.12
569_I	655_T	0.773	0.12
423_L	652_D	0.772	0.12
210_T	223_C	0.771	0.12
536_P	676_L	0.770	0.12
272_P	723_L	0.769	0.12
424_F	536_P	0.769	0.12
112_E	253_I	0.767	0.12
134_E	253_I	0.767	0.12
490_A	493_Q	0.766	0.12
66_L	187_L	0.765	0.12
388_V	391_D	0.764	0.12
426_N	431_A	0.764	0.12
208_T	245_D	0.763	0.12
311_E	415_G	0.763	0.12
382_I	567_V	0.763	0.12
514_V	670_K	0.761	0.12
450_A	469_F	0.759	0.11
320_A	572_S	0.758	0.11
503_N	530_G	0.758	0.11
97_V	290_E	0.757	0.11
326_A	531_E	0.757	0.11
236_V	301_M	0.756	0.11
193_D	694_A	0.755	0.11
568_V	574_L	0.755	0.11
179_L	266_V	0.755	0.11
30_V	37_E	0.755	0.11
28_T	155_S	0.754	0.11
89_D	93_Y	0.754	0.11
685_V	715_R	0.753	0.11
562_A	716_R	0.751	0.11
295_L	655_T	0.750	0.11
245_D	263_T	0.749	0.11
60_I	389_V	0.748	0.11
10_A	101_R	0.747	0.11
452_S	504_Y	0.746	0.11
240_V	244_E	0.745	0.11
127_V	424_F	0.745	0.11
76_A	620_G	0.743	0.11
604_V	670_K	0.743	0.11
226_A	694_A	0.741	0.11
356_E	557_A	0.740	0.11
172_P	205_T	0.740	0.11
49_K	264_S	0.739	0.11
111_S	233_V	0.739	0.11
668_G	704_S	0.738	0.11
344_G	379_N	0.738	0.11
479_E	716_R	0.735	0.11
90_A	120_L	0.734	0.11
383_P	670_K	0.734	0.11
199_T	446_R	0.734	0.11
322_A	629_S	0.733	0.11
513_A	676_L	0.731	0.11
506_R	531_E	0.730	0.11
87_A	294_V	0.730	0.11
136_V	163_F	0.729	0.11
139_V	287_D	0.729	0.11
47_E	441_S	0.728	0.11
76_A	486_G	0.728	0.11
96_E	125_G	0.726	0.11
567_V	651_F	0.725	0.11
498_P	568_V	0.725	0.11
51_E	248_P	0.724	0.11
158_E	347_T	0.723	0.11
455_E	511_K	0.722	0.11
550_N	553_Y	0.722	0.11
42_L	223_C	0.722	0.11
45_Y	49_K	0.721	0.11
249_F	294_V	0.721	0.11
180_T	668_G	0.720	0.11
229_T	395_R	0.720	0.11
463_R	563_G	0.720	0.11
329_Q	571_P	0.720	0.11
354_H	358_S	0.719	0.11
221_R	337_G	0.718	0.11
63_L	682_E	0.717	0.11
342_S	347_T	0.715	0.11
30_V	226_A	0.714	0.11
40_A	243_V	0.714	0.11
177_E	697_T	0.713	0.11
158_E	721_V	0.712	0.11
541_M	659_E	0.710	0.11
257_G	261_D	0.709	0.11
490_A	521_D	0.709	0.11
245_D	578_H	0.708	0.11
47_E	480_K	0.707	0.11
594_Q	615_D	0.707	0.11
317_R	333_G	0.705	0.11
255_R	636_L	0.704	0.11
94_M	236_V	0.702	0.11
469_F	481_R	0.702	0.11
490_A	644_A	0.702	0.11
124_G	160_A	0.701	0.11
256_S	453_L	0.699	0.11
268_L	371_R	0.697	0.11
142_E	155_S	0.696	0.11
255_R	258_T	0.695	0.11
163_F	183_A	0.695	0.11
165_E	521_D	0.694	0.11
90_A	299_G	0.694	0.11
590_Y	652_D	0.693	0.11
111_S	396_G	0.692	0.11
506_R	674_Y	0.691	0.11
428_D	452_S	0.690	0.11
506_R	711_A	0.690	0.11
233_V	698_V	0.689	0.11
49_K	143_A	0.689	0.11
90_A	469_F	0.687	0.11
112_E	317_R	0.687	0.11
134_E	317_R	0.687	0.11
375_Q	543_S	0.686	0.11
532_S	702_G	0.685	0.11
103_V	127_V	0.685	0.11
147_I	504_Y	0.684	0.11
68_D	86_D	0.682	0.11
454_L	470_E	0.682	0.11
46_D	488_D	0.682	0.11
52_A	303_M	0.682	0.11
296_I	724_L	0.681	0.11
211_L	263_T	0.681	0.11
63_L	291_F	0.680	0.11
120_L	313_L	0.678	0.10
23_A	34_G	0.678	0.10
167_F	496_L	0.677	0.10
531_E	643_V	0.677	0.10
112_E	297_D	0.676	0.10
134_E	297_D	0.676	0.10
640_P	644_A	0.676	0.10
382_I	607_L	0.675	0.10
306_D	385_I	0.674	0.10
502_T	569_I	0.674	0.10
152_I	342_S	0.674	0.10
103_V	479_E	0.673	0.10
574_L	597_S	0.673	0.10
137_L	199_T	0.671	0.10
357_D	698_V	0.669	0.10
207_D	621_G	0.668	0.10
494_V	714_T	0.668	0.10
513_A	567_V	0.667	0.10
180_T	328_F	0.667	0.10
74_V	382_I	0.667	0.10
342_S	365_L	0.666	0.10
90_A	359_A	0.666	0.10
30_V	257_G	0.664	0.10
184_R	337_G	0.663	0.10
586_P	680_V	0.663	0.10
470_E	476_E	0.663	0.10
688_F	695_D	0.663	0.10
110_T	699_V	0.662	0.10
136_V	252_L	0.659	0.10
330_H	679_D	0.659	0.10
204_V	667_F	0.659	0.10
70_V	81_V	0.658	0.10
76_A	636_L	0.656	0.10
82_Y	140_A	0.656	0.10
293_L	685_V	0.656	0.10
33_E	441_S	0.654	0.10
428_D	435_S	0.653	0.10
705_C	719_H	0.653	0.10
42_L	149_A	0.652	0.10
76_A	612_A	0.652	0.10
100_G	647_E	0.651	0.10
468_E	626_A	0.650	0.10
667_F	720_P	0.650	0.10
217_E	235_G	0.648	0.10
574_L	603_Y	0.647	0.10
499_D	573_D	0.647	0.10
316_I	498_P	0.646	0.10
701_S	704_S	0.646	0.10
31_F	254_G	0.645	0.10
521_D	556_I	0.645	0.10
156_R	439_P	0.644	0.10
190_K	204_V	0.642	0.10
556_I	696_R	0.642	0.10
98_V	232_A	0.641	0.10
38_S	254_G	0.640	0.10
114_I	365_L	0.640	0.10
9_K	33_E	0.639	0.10
151_A	263_T	0.637	0.10
274_D	572_S	0.636	0.10
47_E	62_R	0.635	0.10
12_R	16_L	0.634	0.10
109_M	317_R	0.633	0.10
347_T	663_M	0.632	0.10
34_G	152_I	0.632	0.10
199_T	595_E	0.632	0.10
526_V	710_D	0.631	0.10
480_K	594_Q	0.630	0.10
109_M	184_R	0.629	0.10
371_R	534_R	0.628	0.10
169_P	440_L	0.628	0.10
447_T	455_E	0.628	0.10
472_E	494_V	0.627	0.10
302_E	614_I	0.627	0.10
47_E	648_D	0.627	0.10
502_T	572_S	0.626	0.10
87_A	95_E	0.626	0.10
68_D	415_G	0.625	0.10
568_V	577_F	0.625	0.10
664_A	668_G	0.625	0.10
567_V	625_I	0.624	0.10
119_S	193_D	0.623	0.10
303_M	309_L	0.621	0.10
432_K	475_V	0.621	0.10
127_V	203_F	0.621	0.10
234_A	666_S	0.621	0.10
240_V	270_T	0.621	0.10
26_E	379_N	0.619	0.10
11_E	433_L	0.618	0.10
536_P	666_S	0.618	0.10
11_E	688_F	0.617	0.10
200_G	300_R	0.617	0.10
202_N	300_R	0.617	0.10
54_A	207_D	0.617	0.10
225_Q	254_G	0.617	0.10
268_L	319_S	0.616	0.10
122_A	517_L	0.615	0.10
272_P	584_L	0.615	0.10
493_Q	518_E	0.614	0.10
39_T	320_A	0.614	0.10
180_T	704_S	0.613	0.10
28_T	296_I	0.612	0.10
379_N	566_V	0.612	0.10
461_D	698_V	0.612	0.10
430_L	599_E	0.611	0.10
257_G	264_S	0.611	0.10
106_S	694_A	0.610	0.10
685_V	689_T	0.609	0.10
423_L	430_L	0.609	0.10
357_D	524_V	0.606	0.10
189_E	701_S	0.606	0.10
98_V	599_E	0.606	0.10
116_V	296_I	0.606	0.10
438_A	443_W	0.604	0.10
199_T	309_L	0.604	0.10
312_T	666_S	0.603	0.10
27_N	31_F	0.603	0.10
158_E	379_N	0.602	0.10
385_I	551_A	0.602	0.10
440_L	543_S	0.601	0.10
109_M	112_E	0.601	0.10
109_M	134_E	0.601	0.10
172_P	587_E	0.600	0.10
96_E	290_E	0.599	0.10
205_T	257_G	0.599	0.10
53_R	353_V	0.598	0.10
557_A	592_A	0.598	0.10
432_K	473_S	0.598	0.10
388_V	670_K	0.598	0.10
295_L	344_G	0.598	0.10
10_A	305_E	0.596	0.10
502_T	510_G	0.596	0.10
118_E	367_T	0.596	0.10
497_Y	580_E	0.596	0.10
509_R	538_S	0.596	0.10
205_T	536_P	0.596	0.10
53_R	706_L	0.594	0.10
554_D	562_A	0.593	0.09
434_G	493_Q	0.591	0.09
52_A	309_L	0.591	0.09
13_I	529_A	0.590	0.09
552_V	702_G	0.590	0.09
110_T	655_T	0.589	0.09
258_T	297_D	0.588	0.09
452_S	476_E	0.588	0.09
109_M	148_V	0.588	0.09
532_S	703_T	0.588	0.09
183_A	187_L	0.587	0.09
374_N	692_D	0.586	0.09
212_A	259_G	0.585	0.09
220_A	340_T	0.585	0.09
556_I	683_T	0.585	0.09
489_E	579_R	0.584	0.09
316_I	518_E	0.584	0.09
573_D	681_G	0.584	0.09
445_A	667_F	0.582	0.09
217_E	343_G	0.581	0.09
290_E	644_A	0.581	0.09
171_E	179_L	0.580	0.09
371_R	700_A	0.580	0.09
139_V	722_R	0.578	0.09
103_V	686_D	0.578	0.09
567_V	620_G	0.577	0.09
49_K	254_G	0.576	0.09
80_S	357_D	0.576	0.09
11_E	513_A	0.575	0.09
111_S	148_V	0.575	0.09
125_G	638_L	0.575	0.09
415_G	594_Q	0.575	0.09
177_E	287_D	0.575	0.09
67_I	629_S	0.574	0.09
310_R	612_A	0.573	0.09
145_S	323_N	0.572	0.09
94_M	198_M	0.571	0.09
600_L	724_L	0.571	0.09
154_K	593_L	0.571	0.09
493_Q	519_A	0.571	0.09
326_A	532_S	0.570	0.09
493_Q	525_D	0.569	0.09
604_V	668_G	0.568	0.09
678_V	682_E	0.568	0.09
531_E	702_G	0.568	0.09
189_E	213_L	0.567	0.09
72_E	118_E	0.566	0.09
39_T	114_I	0.565	0.09
284_E	567_V	0.565	0.09
423_L	458_L	0.565	0.09
491_R	697_T	0.564	0.09
524_V	597_S	0.564	0.09
579_R	586_P	0.563	0.09
535_A	570_E	0.561	0.09
76_A	305_E	0.560	0.09
254_G	444_A	0.560	0.09
624_R	715_R	0.560	0.09
316_I	510_G	0.560	0.09
637_D	652_D	0.560	0.09
62_R	641_Y	0.560	0.09
68_D	621_G	0.559	0.09
157_E	469_F	0.559	0.09
500_A	702_G	0.559	0.09
75_E	139_V	0.559	0.09
59_A	270_T	0.559	0.09
313_L	378_V	0.558	0.09
93_Y	593_L	0.558	0.09
193_D	689_T	0.558	0.09
154_K	195_E	0.557	0.09
289_R	381_D	0.556	0.09
65_E	620_G	0.555	0.09
184_R	221_R	0.555	0.09
136_V	352_G	0.554	0.09
599_E	653_V	0.552	0.09
382_I	663_M	0.552	0.09
69_Q	696_R	0.552	0.09
39_T	149_A	0.552	0.09
144_P	258_T	0.552	0.09
453_L	504_Y	0.552	0.09
474_L	550_N	0.551	0.09
25_H	39_T	0.551	0.09
42_L	152_I	0.551	0.09
235_G	343_G	0.551	0.09
144_P	334_H	0.549	0.09
581_Y	636_L	0.549	0.09
65_E	651_F	0.549	0.09
248_P	351_A	0.548	0.09
81_V	290_E	0.548	0.09
231_V	507_T	0.547	0.09
177_E	460_V	0.547	0.09
122_A	546_Q	0.546	0.09
306_D	685_V	0.546	0.09
103_V	223_C	0.546	0.09
123_R	479_E	0.545	0.09
482_G	686_D	0.545	0.09
428_D	475_V	0.544	0.09
179_L	262_I	0.543	0.09
329_Q	653_V	0.542	0.09
307_D	679_D	0.542	0.09
60_I	63_L	0.541	0.09
144_P	215_T	0.541	0.09
136_V	204_V	0.541	0.09
599_E	664_A	0.541	0.09
256_S	304_R	0.540	0.09
191_I	385_I	0.539	0.09
504_Y	530_G	0.539	0.09
414_P	724_L	0.539	0.09
14_R	335_A	0.538	0.09
204_V	506_R	0.538	0.09
187_L	377_P	0.537	0.09
448_G	468_E	0.537	0.09
80_S	250_V	0.537	0.09
589_D	641_Y	0.536	0.09
189_E	464_R	0.536	0.09
311_E	551_A	0.535	0.09
474_L	514_V	0.535	0.09
627_Y	676_L	0.535	0.09
137_L	236_V	0.534	0.09
180_T	684_L	0.533	0.09
122_A	234_A	0.532	0.09
350_E	712_L	0.532	0.09
571_P	634_R	0.531	0.09
460_V	653_V	0.530	0.09
682_E	685_V	0.530	0.09
465_E	629_S	0.530	0.09
31_F	147_I	0.529	0.09
482_G	591_A	0.528	0.09
252_L	320_A	0.527	0.09
138_Q	179_L	0.526	0.09
359_A	379_N	0.525	0.09
446_R	474_L	0.524	0.09
208_T	212_A	0.524	0.09
255_R	383_P	0.524	0.09
274_D	595_E	0.523	0.09
126_D	392_R	0.523	0.09
567_V	603_Y	0.522	0.09
616_V	710_D	0.520	0.09
53_R	377_P	0.518	0.09
76_A	584_L	0.518	0.09
140_A	365_L	0.518	0.09
472_E	480_K	0.518	0.09
33_E	472_E	0.518	0.09
203_F	383_P	0.517	0.09
97_V	393_I	0.516	0.09
14_R	301_M	0.516	0.09
269_F	664_A	0.514	0.09
295_L	382_I	0.514	0.09
324_S	642_T	0.514	0.09
499_D	632_Q	0.514	0.09
546_Q	587_E	0.514	0.09
93_Y	675_E	0.513	0.09
243_V	257_G	0.513	0.09
58_D	482_G	0.513	0.09
342_S	363_N	0.513	0.09
59_A	392_R	0.512	0.09
162_L	167_F	0.512	0.09
346_A	684_L	0.512	0.09
166_V	700_A	0.512	0.09
342_S	635_T	0.512	0.09
501_Y	505_V	0.512	0.09
117_N	258_T	0.511	0.09
39_T	268_L	0.511	0.09
25_H	29_Q	0.509	0.09
291_F	655_T	0.509	0.09
197_G	217_E	0.509	0.09
22_D	80_S	0.508	0.09
391_D	566_V	0.508	0.09
494_V	722_R	0.508	0.09
92_R	236_V	0.507	0.09
69_Q	73_A	0.506	0.09
118_E	259_G	0.506	0.09
625_I	721_V	0.505	0.09
221_R	237_E	0.505	0.09
184_R	215_T	0.505	0.09
229_T	291_F	0.505	0.09
135_F	231_V	0.504	0.09
531_E	703_T	0.504	0.09
97_V	669_Y	0.504	0.09
65_E	429_T	0.503	0.09
573_D	684_L	0.503	0.09
254_G	506_R	0.502	0.09
272_P	295_L	0.502	0.09
556_I	563_G	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3cf4A	2	0.7689	100	0.75	Contact Map
3kwlA	1	0.5722	100	0.837	Contact Map
2g40A	2	0.2228	100	0.888	Contact Map
3c8yA	1	0.5378	99.9	0.932	Contact Map
2h88B	1	0.2916	99.5	0.953	Contact Map
1kf6B	1	0.2999	99.3	0.956	Contact Map
4ysxB	1	0.3081	99.1	0.96	Contact Map
2wdqB	1	0.2861	99.1	0.96	Contact Map
2bs2B	1	0.2875	99	0.962	Contact Map
1hfeL	2	0.4237	98.8	0.965	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0165 seconds.