ARSA - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

ARSA - Putative arsenical pump-driving ATPase

UniProt:	O52027	Sequences: MTATQTPAKEVVEPNSEDTEFVFFSGKGGVGKSTVSCATATWLADNDYDTLLVTTDPAPNLSDIFNQDIGHEVTAIDDVPNLSAIEIDPDVAAEEYRQETIEPMRALLGDEEIQTVEEQLNSPCVEEIAAFDNFVDFMDSPEYDVVVFDTAPTGHTIRLMELPSDWNAELEKGGSTCIGPAASMDDKKADYERAIDTLSDESRTSFAFVGKPESSSIDEIERSASDLAELGISSQLLVVNGYLPESVCEDPFFEGKRADEQAVIDRVESTFDQQALATYPLQPGEIAGLELLSDVGGVLYDGEEATVDVDAATRRATNEDTVDFDTFTDADAVAEELVPVEETRYLFFTGKGGVGKSTIASTTAVSLAEAGYETLVVTTDPAAHLADIFEQPVGHEPTSVGQANLDAARIDQERALEEYRTQVLDHVREMYDEKDDTQIDVEAAVANVEEELESPCAEEMAALEKFVSYFEEDGYDIVVFDTAPTGHTLRLLELPSDWKGFMDLGSLTKGAAPANGGKYDEVIETMQDPSRSSFAFVMYPEFTPMMEAYRAAMDLQDQVGIETSVVVANYLLPEDYGDNAFFENRRAQQAEYLEEISERFDVPMMLAPLRQEEPVGLDDLREFGADVTGLDGVGEDDREEVTVS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	644 (562)
Sequences:	347 (240)
Seq/√Len:	10.1

HALSA - ARSA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
556_Q	562_E	4.926	1.00
45_D	293_S	4.736	1.00
528_D	531_R	4.719	1.00
432_D	435_D	4.514	1.00
19_T	205_S	4.261	0.99
359_I	567_V	4.254	0.99
568_A	593_L	3.825	0.98
98_Q	102_E	3.645	0.98
545_M	596_I	3.559	0.97
36_S	170_L	3.513	0.97
449_E	453_E	3.389	0.96
335_E	370_A	3.322	0.96
422_Q	464_E	3.273	0.96
67_Q	77_D	3.240	0.95
493_E	527_Q	3.180	0.95
417_E	420_R	3.144	0.95
493_E	499_K	3.087	0.94
417_E	421_T	3.015	0.93
538_M	596_I	3.015	0.93
338_V	372_Y	2.978	0.93
106_A	110_D	2.922	0.92
51_L	87_I	2.920	0.92
342_E	372_Y	2.899	0.92
101_I	113_I	2.840	0.91
359_I	607_A	2.745	0.89
123_P	494_L	2.693	0.88
210_G	217_I	2.662	0.88
348_F	460_M	2.647	0.87
337_L	346_L	2.497	0.84
94_E	98_Q	2.462	0.83
281_L	285_E	2.437	0.82
63_D	260_E	2.391	0.81
499_K	527_Q	2.391	0.81
48_Y	145_V	2.315	0.79
416_L	458_E	2.289	0.78
363_T	535_A	2.222	0.76
91_V	94_E	2.211	0.76
375_L	408_A	2.198	0.75
431_Y	435_D	2.173	0.74
379_T	525_T	2.170	0.74
41_T	612_E	2.133	0.73
375_L	469_Y	2.126	0.73
83_S	143_Y	2.112	0.72
120_L	489_L	2.071	0.70
344_R	347_F	2.054	0.70
107_L	112_E	2.028	0.69
220_I	237_L	2.018	0.68
194_A	495_P	2.018	0.68
86_E	157_I	1.992	0.67
415_A	465_K	1.975	0.67
574_E	577_G	1.965	0.66
377_V	480_F	1.959	0.66
180_P	458_E	1.944	0.65
415_A	418_E	1.942	0.65
282_Q	296_G	1.926	0.65
467_V	522_V	1.916	0.64
180_P	412_Q	1.913	0.64
535_A	567_V	1.908	0.64
143_Y	324_F	1.904	0.64
424_L	449_E	1.882	0.63
69_I	86_E	1.871	0.62
140_S	203_R	1.845	0.61
165_D	415_A	1.842	0.61
373_E	476_D	1.823	0.60
132_D	497_D	1.786	0.59
217_I	267_V	1.774	0.58
242_Y	567_V	1.760	0.57
346_L	479_V	1.742	0.57
61_L	86_E	1.723	0.56
536_F	540_P	1.713	0.55
86_E	260_E	1.691	0.54
117_E	181_A	1.690	0.54
505_G	508_T	1.689	0.54
210_G	216_S	1.676	0.54
333_V	605_M	1.672	0.53
116_V	416_L	1.667	0.53
369_E	621_R	1.666	0.53
344_R	477_I	1.661	0.53
21_F	197_T	1.660	0.53
503_D	540_P	1.649	0.52
180_P	448_V	1.648	0.52
45_D	584_N	1.647	0.52
496_S	522_V	1.642	0.52
239_V	269_S	1.635	0.52
126_E	527_Q	1.629	0.51
216_S	239_V	1.620	0.51
41_T	79_V	1.619	0.51
377_V	568_A	1.619	0.51
132_D	171_E	1.618	0.51
215_S	239_V	1.616	0.51
100_T	175_S	1.610	0.50
412_Q	458_E	1.608	0.50
117_E	460_M	1.585	0.49
246_S	479_V	1.582	0.49
62_S	260_E	1.582	0.49
220_I	286_I	1.580	0.49
571_L	574_E	1.577	0.49
159_L	180_P	1.563	0.48
467_V	524_E	1.549	0.48
573_P	590_A	1.548	0.48
345_Y	519_Y	1.542	0.47
57_P	547_E	1.542	0.47
296_G	473_D	1.535	0.47
361_S	389_F	1.530	0.47
499_K	502_M	1.530	0.47
71_H	133_N	1.528	0.47
104_M	116_V	1.518	0.46
552_A	563_T	1.511	0.46
347_F	477_I	1.511	0.46
65_F	139_D	1.503	0.46
225_S	230_L	1.486	0.45
169_E	536_F	1.473	0.44
540_P	574_E	1.461	0.44
62_S	86_E	1.459	0.44
74_T	100_T	1.450	0.43
430_M	435_D	1.434	0.42
507_L	510_G	1.434	0.42
194_A	345_Y	1.425	0.42
98_Q	105_R	1.424	0.42
36_S	174_G	1.413	0.41
467_V	496_S	1.408	0.41
48_Y	242_Y	1.407	0.41
255_G	343_T	1.401	0.41
117_E	415_A	1.399	0.41
165_D	293_S	1.386	0.40
464_E	508_T	1.382	0.40
117_E	449_E	1.374	0.40
525_T	531_R	1.371	0.40
345_Y	464_E	1.369	0.40
112_E	460_M	1.359	0.39
338_V	370_A	1.359	0.39
73_V	83_S	1.356	0.39
65_F	531_R	1.352	0.39
104_M	126_E	1.349	0.39
109_G	116_V	1.344	0.38
496_S	524_E	1.343	0.38
328_T	332_A	1.342	0.38
239_V	593_L	1.338	0.38
86_E	174_G	1.333	0.38
65_F	260_E	1.326	0.38
174_G	177_C	1.324	0.38
193_R	218_D	1.319	0.37
366_S	370_A	1.318	0.37
188_K	416_L	1.312	0.37
213_E	527_Q	1.309	0.37
345_Y	527_Q	1.309	0.37
65_F	243_L	1.307	0.37
408_A	469_Y	1.304	0.37
147_V	212_P	1.302	0.37
440_D	448_V	1.301	0.37
108_L	191_Y	1.297	0.36
141_P	201_E	1.286	0.36
130_A	241_G	1.282	0.36
488_T	547_E	1.279	0.36
63_D	546_M	1.278	0.36
81_N	334_A	1.276	0.35
588_Q	597_S	1.275	0.35
167_N	474_G	1.270	0.35
62_S	65_F	1.268	0.35
337_L	536_F	1.263	0.35
221_E	270_T	1.261	0.35
65_F	579_N	1.257	0.35
61_L	157_I	1.252	0.34
63_D	86_E	1.251	0.34
188_K	191_Y	1.249	0.34
109_G	191_Y	1.243	0.34
126_E	522_V	1.241	0.34
412_Q	448_V	1.241	0.34
106_A	501_F	1.239	0.34
87_I	159_L	1.233	0.34
285_E	542_F	1.233	0.34
281_L	416_L	1.228	0.33
64_I	191_Y	1.227	0.33
519_Y	527_Q	1.224	0.33
552_A	556_Q	1.223	0.33
101_I	106_A	1.217	0.33
614_P	620_L	1.209	0.33
174_G	606_L	1.208	0.33
90_D	379_T	1.208	0.33
57_P	488_T	1.207	0.33
379_T	480_F	1.204	0.32
143_Y	146_V	1.199	0.32
453_E	502_M	1.196	0.32
132_D	585_R	1.188	0.32
467_V	521_E	1.188	0.32
342_E	409_R	1.187	0.32
169_E	225_S	1.180	0.32
448_V	458_E	1.175	0.31
146_V	418_E	1.172	0.31
224_A	235_Q	1.171	0.31
470_F	523_I	1.168	0.31
362_T	616_G	1.167	0.31
36_S	606_L	1.166	0.31
86_E	609_L	1.165	0.31
215_S	289_L	1.160	0.31
427_V	522_V	1.153	0.30
431_Y	448_V	1.143	0.30
175_S	586_R	1.143	0.30
100_T	161_E	1.143	0.30
243_L	257_R	1.142	0.30
224_A	234_S	1.142	0.30
146_V	421_T	1.141	0.30
474_G	521_E	1.141	0.30
109_G	181_A	1.139	0.30
186_D	548_A	1.139	0.30
135_V	613_E	1.137	0.30
109_G	460_M	1.137	0.30
267_V	271_F	1.131	0.30
117_E	130_A	1.130	0.30
496_S	527_Q	1.130	0.30
140_S	362_T	1.130	0.30
126_E	188_K	1.125	0.29
372_Y	432_D	1.120	0.29
522_V	527_Q	1.116	0.29
203_R	324_F	1.111	0.29
504_L	507_L	1.111	0.29
201_E	207_A	1.111	0.29
87_I	525_T	1.108	0.29
103_P	191_Y	1.107	0.29
49_D	182_A	1.106	0.29
123_P	159_L	1.105	0.29
86_E	104_M	1.104	0.29
362_T	620_L	1.102	0.29
572_L	610_R	1.101	0.28
123_P	412_Q	1.098	0.28
41_T	45_D	1.095	0.28
159_L	458_E	1.093	0.28
53_V	574_E	1.093	0.28
251_P	611_Q	1.092	0.28
366_S	479_V	1.091	0.28
524_E	592_Y	1.087	0.28
104_M	522_V	1.081	0.28
36_S	592_Y	1.080	0.28
348_F	519_Y	1.078	0.28
385_L	546_M	1.074	0.27
139_D	194_A	1.072	0.27
62_S	546_M	1.066	0.27
103_P	108_L	1.065	0.27
283_P	420_R	1.063	0.27
123_P	282_Q	1.060	0.27
291_L	477_I	1.053	0.27
146_V	228_A	1.052	0.27
116_V	480_F	1.051	0.27
19_T	236_L	1.047	0.26
63_D	592_Y	1.046	0.26
95_E	170_L	1.045	0.26
34_T	361_S	1.043	0.26
171_E	286_I	1.039	0.26
521_E	528_D	1.038	0.26
98_Q	195_I	1.037	0.26
368_A	603_P	1.033	0.26
97_R	500_G	1.032	0.26
521_E	524_E	1.031	0.26
359_I	535_A	1.030	0.26
228_A	581_F	1.025	0.26
138_M	170_L	1.024	0.26
75_A	252_F	1.020	0.26
71_H	385_L	1.020	0.26
522_V	592_Y	1.019	0.25
242_Y	278_T	1.018	0.25
101_I	560_G	1.016	0.25
471_E	523_I	1.015	0.25
112_E	115_T	1.013	0.25
86_E	213_E	1.012	0.25
138_M	563_T	1.011	0.25
283_P	425_D	1.011	0.25
182_A	257_R	1.007	0.25
467_V	527_Q	0.999	0.25
65_F	76_I	0.999	0.25
110_D	114_Q	0.998	0.25
87_I	345_Y	0.997	0.25
538_M	545_M	0.995	0.25
62_S	157_I	0.991	0.25
103_P	117_E	0.991	0.25
68_D	201_E	0.991	0.25
414_R	568_A	0.987	0.24
185_D	420_R	0.981	0.24
100_T	173_G	0.979	0.24
71_H	295_V	0.979	0.24
41_T	68_D	0.977	0.24
146_V	593_L	0.977	0.24
185_D	536_F	0.975	0.24
117_E	165_D	0.974	0.24
200_D	267_V	0.970	0.24
470_F	570_Y	0.964	0.24
109_G	586_R	0.964	0.24
20_E	45_D	0.961	0.24
336_E	603_P	0.959	0.23
217_I	263_V	0.958	0.23
146_V	567_V	0.957	0.23
433_E	502_M	0.957	0.23
427_V	467_V	0.956	0.23
182_A	531_R	0.954	0.23
111_E	232_I	0.954	0.23
139_D	492_L	0.953	0.23
428_R	431_Y	0.952	0.23
214_S	473_D	0.952	0.23
112_E	117_E	0.950	0.23
104_M	609_L	0.948	0.23
492_L	547_E	0.946	0.23
143_Y	390_E	0.946	0.23
130_A	165_D	0.944	0.23
61_L	464_E	0.942	0.23
104_M	213_E	0.942	0.23
108_L	188_K	0.940	0.23
65_F	206_F	0.940	0.23
157_I	174_G	0.938	0.23
347_F	533_S	0.937	0.23
472_E	476_D	0.934	0.23
52_L	194_A	0.931	0.23
207_A	548_A	0.931	0.23
388_I	496_S	0.931	0.23
159_L	448_V	0.930	0.22
220_I	570_Y	0.928	0.22
91_V	293_S	0.927	0.22
73_V	86_E	0.924	0.22
66_N	78_D	0.924	0.22
553_M	621_R	0.922	0.22
383_A	409_R	0.920	0.22
101_I	117_E	0.917	0.22
116_V	550_R	0.917	0.22
210_G	239_V	0.913	0.22
64_I	109_G	0.913	0.22
327_F	404_N	0.912	0.22
63_D	550_R	0.911	0.22
594_E	598_E	0.911	0.22
418_E	497_D	0.909	0.22
76_I	185_D	0.908	0.22
575_D	586_R	0.908	0.22
181_A	191_Y	0.905	0.22
120_L	495_P	0.904	0.22
379_T	523_I	0.903	0.22
180_P	563_T	0.903	0.22
159_L	412_Q	0.902	0.22
224_A	470_F	0.902	0.22
174_G	592_Y	0.902	0.22
66_N	607_A	0.901	0.22
64_I	181_A	0.900	0.22
84_A	529_P	0.898	0.21
53_V	585_R	0.898	0.21
453_E	465_K	0.897	0.21
619_D	623_F	0.897	0.21
165_D	174_G	0.896	0.21
620_L	623_F	0.895	0.21
379_T	497_D	0.892	0.21
435_D	448_V	0.891	0.21
123_P	281_L	0.891	0.21
302_G	332_A	0.889	0.21
76_I	453_E	0.889	0.21
113_I	117_E	0.888	0.21
256_K	527_Q	0.887	0.21
418_E	449_E	0.886	0.21
37_C	488_T	0.886	0.21
42_W	542_F	0.886	0.21
116_V	460_M	0.885	0.21
361_S	388_I	0.885	0.21
207_A	334_A	0.884	0.21
37_C	57_P	0.876	0.21
348_F	522_V	0.874	0.21
137_F	180_P	0.870	0.21
283_P	417_E	0.870	0.21
103_P	109_G	0.869	0.21
181_A	460_M	0.868	0.21
109_G	117_E	0.865	0.20
296_G	365_V	0.862	0.20
341_E	530_S	0.862	0.20
123_P	190_D	0.861	0.20
113_I	216_S	0.860	0.20
41_T	575_D	0.859	0.20
416_L	495_P	0.858	0.20
366_S	500_G	0.858	0.20
174_G	577_G	0.857	0.20
188_K	296_G	0.857	0.20
49_D	259_D	0.855	0.20
148_F	451_E	0.853	0.20
61_L	174_G	0.853	0.20
105_R	191_Y	0.852	0.20
365_V	372_Y	0.851	0.20
480_F	523_I	0.849	0.20
143_Y	473_D	0.849	0.20
449_E	460_M	0.848	0.20
72_E	372_Y	0.847	0.20
385_L	389_F	0.847	0.20
102_E	286_I	0.847	0.20
194_A	485_T	0.846	0.20
36_S	531_R	0.846	0.20
97_R	101_I	0.844	0.20
189_A	241_G	0.844	0.20
329_D	362_T	0.844	0.20
165_D	465_K	0.843	0.20
358_T	478_V	0.843	0.20
51_L	608_P	0.842	0.20
71_H	253_F	0.842	0.20
334_A	568_A	0.841	0.20
81_N	571_L	0.841	0.20
217_I	423_V	0.841	0.20
414_R	418_E	0.840	0.20
193_R	342_E	0.839	0.20
130_A	415_A	0.838	0.20
473_D	480_F	0.837	0.20
21_F	435_D	0.836	0.20
229_E	290_E	0.835	0.20
69_I	164_S	0.834	0.20
180_P	416_L	0.832	0.19
81_N	510_G	0.830	0.19
292_L	405_L	0.830	0.19
225_S	528_D	0.830	0.19
617_L	621_R	0.829	0.19
362_T	366_S	0.829	0.19
467_V	592_Y	0.825	0.19
91_V	279_Y	0.825	0.19
345_Y	473_D	0.824	0.19
225_S	535_A	0.824	0.19
245_E	267_V	0.824	0.19
117_E	424_L	0.822	0.19
580_A	585_R	0.821	0.19
107_L	460_M	0.821	0.19
104_M	112_E	0.820	0.19
256_K	568_A	0.819	0.19
235_Q	465_K	0.819	0.19
496_S	606_L	0.818	0.19
232_I	596_I	0.817	0.19
41_T	289_L	0.817	0.19
123_P	132_D	0.816	0.19
595_E	600_F	0.815	0.19
348_F	475_Y	0.815	0.19
112_E	379_T	0.815	0.19
295_V	572_L	0.814	0.19
203_R	213_E	0.814	0.19
335_E	479_V	0.814	0.19
21_F	492_L	0.812	0.19
83_S	110_D	0.811	0.19
212_P	228_A	0.809	0.19
159_L	469_Y	0.809	0.19
412_Q	563_T	0.806	0.19
259_D	435_D	0.806	0.19
45_D	100_T	0.805	0.19
165_D	220_I	0.805	0.19
409_R	494_L	0.805	0.19
505_G	510_G	0.804	0.19
611_Q	615_V	0.803	0.19
61_L	205_S	0.803	0.19
189_A	598_E	0.802	0.19
136_D	283_P	0.799	0.19
421_T	425_D	0.798	0.19
264_I	346_L	0.797	0.19
420_R	528_D	0.796	0.18
165_D	460_M	0.795	0.18
428_R	435_D	0.793	0.18
41_T	113_I	0.792	0.18
108_L	502_M	0.792	0.18
270_T	322_V	0.791	0.18
132_D	216_S	0.789	0.18
107_L	507_L	0.789	0.18
237_L	497_D	0.789	0.18
113_I	588_Q	0.788	0.18
182_A	600_F	0.787	0.18
167_N	500_G	0.786	0.18
496_S	521_E	0.786	0.18
505_G	550_R	0.785	0.18
495_P	581_F	0.784	0.18
65_F	546_M	0.784	0.18
81_N	392_P	0.783	0.18
86_E	522_V	0.782	0.18
107_L	286_I	0.781	0.18
181_A	570_Y	0.781	0.18
202_S	331_D	0.781	0.18
282_Q	416_L	0.780	0.18
61_L	213_E	0.780	0.18
40_A	52_L	0.778	0.18
137_F	428_R	0.777	0.18
120_L	161_E	0.775	0.18
220_I	348_F	0.772	0.18
404_N	504_L	0.772	0.18
157_I	205_S	0.770	0.18
50_T	168_A	0.768	0.18
344_R	458_E	0.768	0.18
161_E	285_E	0.765	0.18
87_I	464_E	0.763	0.18
67_Q	76_I	0.759	0.17
372_Y	404_N	0.759	0.17
415_A	449_E	0.759	0.17
106_A	181_A	0.759	0.17
165_D	237_L	0.756	0.17
106_A	449_E	0.756	0.17
62_S	565_V	0.755	0.17
524_E	527_Q	0.754	0.17
285_E	586_R	0.754	0.17
62_S	592_Y	0.753	0.17
90_D	213_E	0.752	0.17
65_F	257_R	0.752	0.17
363_T	598_E	0.751	0.17
37_C	547_E	0.750	0.17
88_D	596_I	0.749	0.17
260_E	480_F	0.749	0.17
147_V	192_E	0.748	0.17
297_G	346_L	0.748	0.17
290_E	346_L	0.748	0.17
101_I	147_V	0.747	0.17
85_I	388_I	0.747	0.17
167_N	407_A	0.746	0.17
61_L	260_E	0.746	0.17
147_V	330_A	0.745	0.17
75_A	340_V	0.745	0.17
120_L	194_A	0.743	0.17
64_I	103_P	0.743	0.17
519_Y	524_E	0.742	0.17
431_Y	493_E	0.742	0.17
86_E	244_P	0.740	0.17
605_M	608_P	0.740	0.17
319_E	553_M	0.740	0.17
161_E	502_M	0.739	0.17
422_Q	426_H	0.739	0.17
345_Y	496_S	0.737	0.17
105_R	108_L	0.737	0.17
20_E	170_L	0.735	0.17
53_V	292_L	0.735	0.17
574_E	586_R	0.735	0.17
132_D	418_E	0.733	0.17
49_D	267_V	0.732	0.17
306_T	587_A	0.730	0.17
61_L	104_M	0.729	0.17
577_G	580_A	0.726	0.17
84_A	428_R	0.725	0.17
146_V	318_N	0.724	0.17
146_V	408_A	0.724	0.17
161_E	489_L	0.723	0.17
77_D	594_E	0.723	0.17
251_P	305_A	0.723	0.17
341_E	590_A	0.721	0.16
345_Y	522_V	0.721	0.16
406_D	472_E	0.720	0.16
53_V	137_F	0.720	0.16
110_D	225_S	0.719	0.16
64_I	108_L	0.719	0.16
369_E	578_D	0.718	0.16
182_A	285_E	0.718	0.16
37_C	84_A	0.717	0.16
363_T	510_G	0.717	0.16
66_N	200_D	0.716	0.16
407_A	552_A	0.714	0.16
616_G	620_L	0.713	0.16
537_V	567_V	0.712	0.16
210_G	363_T	0.711	0.16
529_P	535_A	0.710	0.16
252_F	586_R	0.710	0.16
289_L	385_L	0.710	0.16
292_L	407_A	0.709	0.16
180_P	431_Y	0.709	0.16
171_E	337_L	0.708	0.16
273_Q	304_E	0.708	0.16
147_V	427_V	0.706	0.16
49_D	568_A	0.705	0.16
53_V	406_D	0.705	0.16
363_T	594_E	0.705	0.16
568_A	598_E	0.705	0.16
501_F	606_L	0.703	0.16
247_V	477_I	0.703	0.16
63_D	157_I	0.703	0.16
104_M	467_V	0.702	0.16
181_A	195_I	0.702	0.16
104_M	524_E	0.701	0.16
243_L	344_R	0.701	0.16
607_A	617_L	0.701	0.16
111_E	337_L	0.700	0.16
132_D	197_T	0.697	0.16
115_T	458_E	0.693	0.16
217_I	453_E	0.693	0.16
65_F	69_I	0.690	0.16
79_V	375_L	0.688	0.16
200_D	432_D	0.687	0.16
206_F	213_E	0.687	0.16
173_G	592_Y	0.686	0.16
361_S	477_I	0.685	0.16
116_V	234_S	0.685	0.16
70_G	86_E	0.685	0.16
201_E	340_V	0.685	0.16
427_V	524_E	0.685	0.16
76_I	113_I	0.685	0.16
52_L	282_Q	0.684	0.16
24_F	279_Y	0.684	0.16
237_L	415_A	0.684	0.16
64_I	288_G	0.683	0.16
126_E	496_S	0.682	0.16
178_I	183_S	0.681	0.15
170_L	345_Y	0.680	0.15
403_A	502_M	0.680	0.15
257_R	261_Q	0.678	0.15
412_Q	494_L	0.677	0.15
330_A	362_T	0.676	0.15
51_L	88_D	0.676	0.15
49_D	203_R	0.674	0.15
68_D	346_L	0.673	0.15
251_P	577_G	0.673	0.15
177_C	222_R	0.672	0.15
61_L	609_L	0.671	0.15
35_V	238_V	0.670	0.15
412_Q	416_L	0.669	0.15
37_C	195_I	0.668	0.15
101_I	110_D	0.668	0.15
63_D	73_V	0.668	0.15
458_E	533_S	0.666	0.15
169_E	176_T	0.665	0.15
361_S	383_A	0.665	0.15
537_V	574_E	0.665	0.15
36_S	230_L	0.664	0.15
180_P	533_S	0.663	0.15
494_L	533_S	0.661	0.15
428_R	448_V	0.661	0.15
132_D	600_F	0.660	0.15
135_V	346_L	0.660	0.15
616_G	623_F	0.660	0.15
165_D	497_D	0.659	0.15
117_E	191_Y	0.659	0.15
35_V	286_I	0.656	0.15
20_E	111_E	0.656	0.15
528_D	567_V	0.652	0.15
116_V	592_Y	0.652	0.15
159_L	177_C	0.651	0.15
63_D	565_V	0.650	0.15
109_G	112_E	0.650	0.15
499_K	563_T	0.648	0.15
280_P	430_M	0.647	0.15
170_L	504_L	0.646	0.15
265_D	433_E	0.645	0.15
112_E	165_D	0.645	0.15
84_A	435_D	0.645	0.15
535_A	619_D	0.644	0.15
568_A	612_E	0.644	0.15
61_L	186_D	0.644	0.15
112_E	474_G	0.641	0.15
333_V	573_P	0.641	0.15
499_K	519_Y	0.639	0.15
596_I	605_M	0.639	0.15
295_V	328_T	0.639	0.15
216_S	480_F	0.639	0.15
139_D	424_L	0.638	0.14
331_D	370_A	0.635	0.14
175_S	289_L	0.634	0.14
81_N	347_F	0.634	0.14
388_I	477_I	0.633	0.14
66_N	169_E	0.632	0.14
136_D	608_P	0.632	0.14
191_Y	501_F	0.627	0.14
174_G	505_G	0.626	0.14
146_V	417_E	0.625	0.14
37_C	112_E	0.625	0.14
495_P	546_M	0.625	0.14
51_L	548_A	0.621	0.14
76_I	495_P	0.619	0.14
552_A	600_F	0.617	0.14
500_G	528_D	0.617	0.14
260_E	550_R	0.616	0.14
200_D	221_E	0.616	0.14
297_G	434_K	0.616	0.14
116_V	510_G	0.615	0.14
146_V	260_E	0.615	0.14
185_D	540_P	0.615	0.14
109_G	348_F	0.614	0.14
130_A	460_M	0.614	0.14
62_S	69_I	0.614	0.14
100_T	285_E	0.614	0.14
90_D	159_L	0.613	0.14
542_F	572_L	0.612	0.14
365_V	431_Y	0.609	0.14
407_A	473_D	0.609	0.14
86_E	205_S	0.608	0.14
36_S	197_T	0.608	0.14
221_E	268_E	0.607	0.14
102_E	507_L	0.607	0.14
138_M	259_D	0.606	0.14
332_A	610_R	0.606	0.14
132_D	556_Q	0.604	0.14
480_F	525_T	0.604	0.14
500_G	531_R	0.604	0.14
146_V	423_V	0.604	0.14
36_S	429_E	0.603	0.14
170_L	174_G	0.603	0.14
236_L	260_E	0.601	0.14
169_E	177_C	0.601	0.14
36_S	40_A	0.599	0.14
71_H	346_L	0.597	0.14
427_V	496_S	0.596	0.14
598_E	618_D	0.595	0.14
99_E	458_E	0.594	0.14
618_D	621_R	0.594	0.14
237_L	473_D	0.594	0.14
104_M	550_R	0.593	0.13
57_P	492_L	0.593	0.13
201_E	267_V	0.593	0.13
504_L	508_T	0.592	0.13
422_Q	449_E	0.592	0.13
90_D	420_R	0.592	0.13
113_I	469_Y	0.591	0.13
61_L	505_G	0.591	0.13
347_F	468_S	0.590	0.13
256_K	282_Q	0.590	0.13
187_K	253_F	0.588	0.13
86_E	173_G	0.585	0.13
51_L	333_V	0.585	0.13
161_E	613_E	0.584	0.13
247_V	580_A	0.583	0.13
495_P	499_K	0.581	0.13
20_E	189_A	0.580	0.13
282_Q	540_P	0.580	0.13
233_S	323_D	0.580	0.13
417_E	424_L	0.576	0.13
534_F	583_E	0.576	0.13
126_E	467_V	0.574	0.13
553_M	567_V	0.574	0.13
359_I	606_L	0.573	0.13
254_E	553_M	0.573	0.13
107_L	415_A	0.572	0.13
519_Y	609_L	0.571	0.13
196_D	424_L	0.570	0.13
111_E	195_I	0.570	0.13
73_V	157_I	0.570	0.13
34_T	536_F	0.570	0.13
84_A	135_V	0.570	0.13
294_D	497_D	0.569	0.13
266_R	275_A	0.569	0.13
73_V	137_F	0.566	0.13
88_D	229_E	0.566	0.13
141_P	218_D	0.566	0.13
552_A	599_R	0.565	0.13
87_I	546_M	0.565	0.13
99_E	137_F	0.564	0.13
37_C	170_L	0.563	0.13
69_I	157_I	0.561	0.13
189_A	212_P	0.561	0.13
86_E	523_I	0.560	0.13
281_L	286_I	0.559	0.13
135_V	171_E	0.559	0.13
61_L	69_I	0.558	0.13
385_L	595_E	0.558	0.13
112_E	290_E	0.558	0.13
157_I	260_E	0.558	0.13
243_L	260_E	0.557	0.13
53_V	564_S	0.556	0.13
426_H	429_E	0.556	0.13
359_I	537_V	0.556	0.13
181_A	492_L	0.556	0.13
577_G	600_F	0.556	0.13
169_E	208_F	0.554	0.13
37_C	206_F	0.554	0.13
191_Y	420_R	0.553	0.13
112_E	415_A	0.553	0.13
502_M	527_Q	0.553	0.13
369_E	610_R	0.553	0.13
104_M	496_S	0.552	0.13
87_I	173_G	0.552	0.13
167_N	434_K	0.552	0.13
200_D	359_I	0.551	0.13
100_T	146_V	0.549	0.13
187_K	409_R	0.548	0.13
406_D	572_L	0.548	0.13
202_S	329_D	0.547	0.13
323_D	530_S	0.547	0.13
497_D	562_E	0.547	0.13
412_Q	431_Y	0.546	0.12
334_A	527_Q	0.546	0.12
504_L	509_K	0.544	0.12
64_I	105_R	0.543	0.12
137_F	533_S	0.543	0.12
377_V	489_L	0.543	0.12
616_G	619_D	0.542	0.12
493_E	561_I	0.541	0.12
428_R	432_D	0.541	0.12
404_N	594_E	0.540	0.12
210_G	553_M	0.540	0.12
473_D	613_E	0.539	0.12
77_D	210_G	0.538	0.12
428_R	601_D	0.538	0.12
87_I	608_P	0.538	0.12
116_V	508_T	0.537	0.12
86_E	467_V	0.537	0.12
142_E	146_V	0.537	0.12
168_A	284_G	0.536	0.12
302_G	390_E	0.536	0.12
61_L	550_R	0.536	0.12
289_L	346_L	0.535	0.12
556_Q	601_D	0.535	0.12
94_E	110_D	0.533	0.12
171_E	254_E	0.531	0.12
330_A	359_I	0.530	0.12
546_M	592_Y	0.528	0.12
221_E	404_N	0.527	0.12
143_Y	332_A	0.527	0.12
49_D	572_L	0.526	0.12
251_P	568_A	0.526	0.12
415_A	581_F	0.525	0.12
101_I	596_I	0.525	0.12
196_D	322_V	0.524	0.12
265_D	275_A	0.524	0.12
51_L	563_T	0.524	0.12
189_A	429_E	0.524	0.12
138_M	564_S	0.523	0.12
173_G	610_R	0.523	0.12
86_E	164_S	0.522	0.12
191_Y	586_R	0.522	0.12
549_Y	595_E	0.521	0.12
99_E	453_E	0.521	0.12
287_A	565_V	0.521	0.12
370_A	594_E	0.521	0.12
108_L	501_F	0.520	0.12
488_T	492_L	0.520	0.12
251_P	297_G	0.519	0.12
213_E	609_L	0.518	0.12
348_F	379_T	0.517	0.12
176_T	222_R	0.516	0.12
157_I	609_L	0.514	0.12
542_F	592_Y	0.513	0.12
255_G	623_F	0.513	0.12
522_V	542_F	0.512	0.12
237_L	460_M	0.512	0.12
261_Q	579_N	0.511	0.12
107_L	267_V	0.511	0.12
203_R	612_E	0.510	0.12
428_R	440_D	0.510	0.12
593_L	596_I	0.510	0.12
143_Y	273_Q	0.510	0.12
279_Y	340_V	0.509	0.12
252_F	535_A	0.509	0.12
147_V	426_H	0.508	0.12
571_L	582_F	0.508	0.12
187_K	465_K	0.508	0.12
406_D	580_A	0.508	0.12
112_E	130_A	0.508	0.12
51_L	525_T	0.507	0.12
139_D	453_E	0.507	0.12
392_P	568_A	0.507	0.12
332_A	389_F	0.505	0.12
259_D	365_V	0.505	0.12
333_V	565_V	0.504	0.12
114_Q	196_D	0.504	0.12
137_F	412_Q	0.504	0.12
76_I	587_A	0.503	0.12
73_V	570_Y	0.503	0.12
531_R	592_Y	0.502	0.12
349_T	534_F	0.501	0.12
157_I	519_Y	0.501	0.12
135_V	175_S	0.500	0.12
102_E	592_Y	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1ihuA	3	0.8307	100	0.667	Contact Map
3io3A	2	0.3525	100	0.82	Contact Map
2wojA	2	0.4627	100	0.82	Contact Map
3iqwA	2	0.396	100	0.822	Contact Map
2wooA	5	0.4441	100	0.831	Contact Map
3igfA	2	0.486	100	0.859	Contact Map
3zq6A	2	0.4379	100	0.868	Contact Map
3ug7A	4	0.4488	100	0.87	Contact Map
3kjhA	2	0.368	99.8	0.93	Contact Map
4jlvA	1	0.2842	99.8	0.934	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0145 seconds.