ARSM - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

ARSM - Putative arsenite methyltransferase

UniProt:	O52025	Sequences: MELWTHPTPAAPRLATSTRTRWRRTSRCSQPWATTPGTNSSDASRTPTTASASATSKPQSASARARSVRRSPDCTPRAWSRGARKDRGATTNRPRRPKFCSKRSTTCEATMSNDNETMVADRDPEETREMVRERYAGIATSGQDCCGDVGLDVSGDGGCCSDETEASGSERLGYDADDVASVADGADLGLGCGNPKAFAAMAPGETVLDLGSGAGFDCFLAAQEVGPDGHVIGVDMTPEMISKARENVAKNDAENVEFRLGEIGHLPVADESVNVVISNCVVNLAPEKQRVFDDTYRVLRPGGRVAISDVVQTAPFPDDVQMDPDSLTGCVAGASTVDDLKAMLDEAGFEAVEIAPKDESTEFISDWDADRDLGEYLVSATIEARKPARDD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	391 (314)
Sequences:	154 (144)
Seq/√Len:	8.1

HALSA - ARSM

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
351_A	385_R	6.394	1.00
195_P	199_A	3.712	0.96
196_K	200_A	3.526	0.95
305_V	344_L	3.437	0.94
204_G	207_V	3.208	0.91
217_D	279_N	3.123	0.90
169_S	172_L	3.086	0.89
154_S	158_G	2.898	0.86
179_V	182_V	2.880	0.86
309_D	362_E	2.833	0.85
179_V	183_A	2.827	0.85
207_V	221_A	2.776	0.83
194_N	200_A	2.765	0.83
222_A	256_V	2.658	0.81
212_S	218_C	2.564	0.78
360_S	364_I	2.521	0.77
172_L	177_D	2.493	0.76
179_V	184_D	2.482	0.76
234_V	263_I	2.422	0.74
154_S	162_D	2.403	0.73
207_V	229_G	2.277	0.69
196_K	199_A	2.276	0.69
195_P	200_A	2.256	0.68
217_D	306_A	2.151	0.64
197_A	200_A	2.147	0.64
184_D	191_G	2.091	0.62
167_S	171_R	2.039	0.60
279_N	306_A	1.971	0.57
212_S	277_I	1.943	0.56
340_L	362_E	1.920	0.55
269_A	272_S	1.879	0.53
168_G	172_L	1.868	0.53
217_D	360_S	1.837	0.52
174_Y	177_D	1.819	0.51
206_T	230_H	1.813	0.51
177_D	183_A	1.782	0.49
183_A	237_T	1.765	0.49
162_D	165_E	1.756	0.48
124_P	384_A	1.744	0.48
306_A	360_S	1.716	0.47
194_N	199_A	1.685	0.45
167_S	172_L	1.680	0.45
189_G	192_C	1.672	0.45
317_P	358_D	1.652	0.44
195_P	198_F	1.650	0.44
256_V	351_A	1.592	0.42
272_S	298_V	1.588	0.41
327_L	332_A	1.576	0.41
279_N	360_S	1.566	0.41
162_D	170_E	1.563	0.40
272_S	300_R	1.563	0.40
182_V	191_G	1.561	0.40
267_P	308_S	1.552	0.40
213_G	255_N	1.548	0.40
217_D	364_I	1.547	0.40
170_E	193_G	1.536	0.39
359_E	375_E	1.534	0.39
201_M	275_V	1.531	0.39
217_D	255_N	1.509	0.38
168_G	171_R	1.509	0.38
92_N	115_N	1.494	0.38
171_R	177_D	1.489	0.38
197_A	225_V	1.486	0.37
259_R	266_L	1.482	0.37
222_A	255_N	1.480	0.37
214_A	240_M	1.472	0.37
255_N	279_N	1.462	0.36
177_D	184_D	1.458	0.36
358_D	374_G	1.453	0.36
222_A	385_R	1.449	0.36
268_V	273_V	1.444	0.36
67_S	70_R	1.431	0.35
358_D	367_W	1.416	0.35
182_V	185_G	1.408	0.34
320_V	323_D	1.399	0.34
183_A	191_G	1.396	0.34
189_G	193_G	1.394	0.34
288_K	360_S	1.389	0.34
181_S	256_V	1.376	0.33
240_M	254_E	1.374	0.33
211_G	233_G	1.367	0.33
215_G	301_P	1.354	0.32
212_S	237_T	1.344	0.32
267_P	304_R	1.343	0.32
167_S	177_D	1.341	0.32
306_A	364_I	1.340	0.32
194_N	197_A	1.331	0.32
208_L	227_P	1.329	0.32
159_C	162_D	1.324	0.31
268_V	294_D	1.312	0.31
219_F	243_K	1.301	0.31
179_V	191_G	1.294	0.30
169_S	177_D	1.278	0.30
359_E	362_E	1.276	0.30
341_K	345_D	1.271	0.30
255_N	258_F	1.264	0.29
217_D	288_K	1.254	0.29
153_V	156_D	1.251	0.29
153_V	210_L	1.247	0.29
371_R	374_G	1.245	0.29
128_R	132_R	1.241	0.28
285_A	309_D	1.228	0.28
155_G	162_D	1.224	0.28
209_D	233_G	1.223	0.28
197_A	201_M	1.220	0.28
172_L	191_G	1.213	0.28
205_E	229_G	1.210	0.27
294_D	385_R	1.209	0.27
161_S	165_E	1.208	0.27
169_S	191_G	1.207	0.27
165_E	174_Y	1.197	0.27
217_D	241_I	1.191	0.27
157_G	162_D	1.190	0.27
214_A	239_E	1.188	0.27
188_L	191_G	1.162	0.26
286_P	385_R	1.162	0.26
238_P	254_E	1.155	0.26
264_G	308_S	1.155	0.26
153_V	158_G	1.154	0.26
181_S	187_D	1.151	0.26
217_D	304_R	1.142	0.25
187_D	193_G	1.133	0.25
177_D	191_G	1.130	0.25
278_S	291_V	1.129	0.25
217_D	220_L	1.128	0.25
154_S	160_C	1.127	0.25
212_S	239_E	1.114	0.24
169_S	184_D	1.109	0.24
254_E	376_Y	1.105	0.24
241_I	277_I	1.105	0.24
94_P	100_C	1.099	0.24
218_C	277_I	1.093	0.24
279_N	288_K	1.093	0.24
230_H	305_V	1.092	0.24
349_F	387_P	1.081	0.23
217_D	277_I	1.072	0.23
68_V	72_P	1.072	0.23
241_I	364_I	1.067	0.23
225_V	286_P	1.056	0.23
168_G	198_F	1.056	0.23
179_V	185_G	1.055	0.23
358_D	376_Y	1.048	0.22
305_V	384_A	1.047	0.22
279_N	304_R	1.047	0.22
294_D	297_R	1.044	0.22
127_T	346_E	1.042	0.22
328_T	332_A	1.041	0.22
119_V	125_E	1.040	0.22
196_K	381_T	1.039	0.22
234_V	281_V	1.036	0.22
270_D	297_R	1.035	0.22
218_C	287_E	1.034	0.22
212_S	306_A	1.034	0.22
180_A	187_D	1.031	0.22
274_N	301_P	1.029	0.22
215_G	303_G	1.025	0.22
370_D	374_G	1.025	0.22
334_A	339_D	1.011	0.21
361_T	378_V	1.008	0.21
279_N	364_I	1.008	0.21
64_R	68_V	1.007	0.21
339_D	361_T	1.005	0.21
297_R	375_E	1.003	0.21
319_D	323_D	1.001	0.21
292_F	340_L	0.996	0.21
233_G	387_P	0.994	0.21
232_I	355_A	0.990	0.21
159_C	363_F	0.989	0.21
171_R	175_D	0.988	0.21
153_V	157_G	0.988	0.21
219_F	277_I	0.987	0.21
190_L	193_G	0.984	0.21
222_A	351_A	0.982	0.21
153_V	162_D	0.981	0.21
177_D	182_V	0.978	0.20
220_L	311_V	0.977	0.20
291_V	309_D	0.976	0.20
152_D	271_E	0.971	0.20
297_R	300_R	0.967	0.20
65_A	70_R	0.965	0.20
294_D	379_S	0.959	0.20
253_A	276_V	0.958	0.20
284_L	358_D	0.957	0.20
81_R	86_D	0.955	0.20
223_Q	238_P	0.950	0.20
255_N	306_A	0.945	0.20
216_F	229_G	0.940	0.19
269_A	300_R	0.936	0.19
211_G	281_V	0.935	0.19
101_S	114_D	0.933	0.19
269_A	299_L	0.926	0.19
84_R	115_N	0.924	0.19
92_N	99_F	0.920	0.19
292_F	307_I	0.913	0.19
367_W	374_G	0.913	0.19
304_R	385_R	0.912	0.19
319_D	330_C	0.912	0.19
328_T	331_V	0.908	0.19
329_G	332_A	0.906	0.19
215_G	274_N	0.904	0.19
154_S	165_E	0.903	0.19
223_Q	261_G	0.901	0.18
154_S	157_G	0.897	0.18
269_A	352_V	0.896	0.18
220_L	364_I	0.895	0.18
372_D	384_A	0.891	0.18
214_A	223_Q	0.890	0.18
315_P	333_G	0.890	0.18
211_G	301_P	0.889	0.18
243_K	298_V	0.888	0.18
218_C	349_F	0.887	0.18
225_V	361_T	0.882	0.18
75_T	81_R	0.880	0.18
241_I	360_S	0.860	0.17
169_S	179_V	0.857	0.17
384_A	387_P	0.857	0.17
85_K	89_A	0.856	0.17
165_E	169_S	0.854	0.17
357_K	378_V	0.847	0.17
201_M	229_G	0.843	0.17
123_D	126_E	0.839	0.17
255_N	288_K	0.838	0.17
162_D	167_S	0.835	0.17
85_K	90_T	0.832	0.17
321_Q	325_D	0.827	0.17
183_A	212_S	0.821	0.17
237_T	240_M	0.821	0.17
132_R	152_D	0.819	0.17
292_F	385_R	0.819	0.17
209_D	236_M	0.818	0.17
371_R	377_L	0.817	0.16
172_L	189_G	0.812	0.16
89_A	92_N	0.811	0.16
233_G	306_A	0.810	0.16
134_R	140_T	0.808	0.16
285_A	291_V	0.801	0.16
353_E	377_L	0.799	0.16
90_T	115_N	0.799	0.16
280_C	359_E	0.797	0.16
172_L	183_A	0.796	0.16
235_D	255_N	0.794	0.16
184_D	258_F	0.792	0.16
155_G	158_G	0.792	0.16
294_D	298_V	0.791	0.16
232_I	281_V	0.788	0.16
229_G	309_D	0.787	0.16
232_I	259_R	0.784	0.16
196_K	201_M	0.784	0.16
225_V	354_I	0.780	0.16
219_F	298_V	0.778	0.16
275_V	306_A	0.773	0.16
75_T	87_R	0.773	0.16
208_L	299_L	0.772	0.15
97_P	113_N	0.772	0.15
168_G	177_D	0.771	0.15
221_A	290_R	0.767	0.15
369_A	374_G	0.766	0.15
220_L	279_N	0.764	0.15
208_L	256_V	0.761	0.15
235_D	306_A	0.760	0.15
169_S	182_V	0.759	0.15
258_F	304_R	0.757	0.15
81_R	98_K	0.756	0.15
185_G	296_Y	0.756	0.15
110_T	128_R	0.754	0.15
221_A	380_A	0.753	0.15
241_I	279_N	0.751	0.15
185_G	191_G	0.748	0.15
175_D	298_V	0.746	0.15
165_E	172_L	0.745	0.15
200_A	204_G	0.745	0.15
335_S	339_D	0.743	0.15
79_W	353_E	0.740	0.15
281_V	307_I	0.739	0.15
319_D	324_P	0.739	0.15
172_L	184_D	0.738	0.15
216_F	240_M	0.737	0.15
87_R	100_C	0.737	0.15
151_L	256_V	0.736	0.15
154_S	166_A	0.734	0.15
372_D	375_E	0.732	0.15
309_D	340_L	0.731	0.15
307_I	379_S	0.731	0.15
220_L	360_S	0.730	0.15
327_L	331_V	0.722	0.14
271_E	300_R	0.720	0.14
241_I	306_A	0.718	0.14
215_G	348_G	0.717	0.14
298_V	309_D	0.716	0.14
256_V	303_G	0.713	0.14
175_D	183_A	0.711	0.14
224_E	257_E	0.708	0.14
153_V	159_C	0.708	0.14
157_G	172_L	0.706	0.14
132_R	368_D	0.705	0.14
280_C	286_P	0.705	0.14
97_P	101_S	0.702	0.14
91_T	101_S	0.701	0.14
284_L	341_K	0.701	0.14
227_P	279_N	0.700	0.14
320_V	352_V	0.698	0.14
223_Q	360_S	0.697	0.14
209_D	258_F	0.696	0.14
82_G	108_E	0.696	0.14
167_S	175_D	0.695	0.14
130_M	133_E	0.695	0.14
159_C	163_E	0.694	0.14
320_V	324_P	0.692	0.14
127_T	140_T	0.692	0.14
239_E	352_V	0.692	0.14
78_A	309_D	0.690	0.14
309_D	359_E	0.689	0.14
340_L	385_R	0.687	0.14
66_R	69_R	0.684	0.14
177_D	189_G	0.683	0.14
207_V	350_E	0.680	0.14
191_G	240_M	0.679	0.14
225_V	304_R	0.673	0.13
194_N	198_F	0.672	0.13
272_S	297_R	0.672	0.13
102_K	109_A	0.668	0.13
84_R	113_N	0.666	0.13
209_D	215_G	0.665	0.13
287_E	382_I	0.663	0.13
162_D	172_L	0.662	0.13
101_S	106_T	0.661	0.13
171_R	174_Y	0.659	0.13
96_R	99_F	0.658	0.13
84_R	101_S	0.657	0.13
314_A	381_T	0.655	0.13
83_A	342_A	0.654	0.13
260_L	365_S	0.652	0.13
119_V	141_S	0.651	0.13
204_G	269_A	0.645	0.13
196_K	304_R	0.645	0.13
174_Y	184_D	0.645	0.13
208_L	229_G	0.644	0.13
157_G	165_E	0.644	0.13
308_S	363_F	0.643	0.13
378_V	381_T	0.643	0.13
309_D	323_D	0.642	0.13
243_K	362_E	0.642	0.13
262_E	365_S	0.641	0.13
377_L	381_T	0.641	0.13
322_M	327_L	0.637	0.13
211_G	215_G	0.635	0.13
296_Y	317_P	0.635	0.13
84_R	89_A	0.635	0.13
86_D	357_K	0.634	0.13
91_T	99_F	0.634	0.13
276_V	329_G	0.631	0.13
237_T	241_I	0.630	0.13
273_V	292_F	0.629	0.13
83_A	103_R	0.625	0.13
215_G	235_D	0.617	0.12
348_G	387_P	0.617	0.12
213_G	237_T	0.616	0.12
198_F	260_L	0.615	0.12
73_D	77_R	0.615	0.12
309_D	373_L	0.614	0.12
208_L	285_A	0.612	0.12
157_G	169_S	0.612	0.12
259_R	267_P	0.611	0.12
96_R	303_G	0.610	0.12
102_K	112_S	0.608	0.12
119_V	123_D	0.608	0.12
208_L	348_G	0.608	0.12
362_E	373_L	0.607	0.12
279_N	309_D	0.607	0.12
288_K	291_V	0.605	0.12
368_D	376_Y	0.605	0.12
235_D	360_S	0.604	0.12
64_R	69_R	0.604	0.12
214_A	279_N	0.603	0.12
220_L	277_I	0.601	0.12
269_A	294_D	0.601	0.12
222_A	273_V	0.600	0.12
83_A	104_S	0.600	0.12
280_C	340_L	0.598	0.12
341_K	383_E	0.598	0.12
231_V	347_A	0.595	0.12
192_C	222_A	0.595	0.12
227_P	348_G	0.593	0.12
139_A	142_G	0.592	0.12
162_D	177_D	0.592	0.12
177_D	188_L	0.588	0.12
304_R	350_E	0.588	0.12
281_V	344_L	0.588	0.12
277_I	306_A	0.585	0.12
170_E	362_E	0.582	0.12
292_F	313_T	0.581	0.12
148_D	156_D	0.581	0.12
227_P	235_D	0.576	0.12
115_N	131_V	0.575	0.12
317_P	376_Y	0.575	0.12
370_D	373_L	0.573	0.12
220_L	278_S	0.572	0.12
256_V	260_L	0.572	0.12
215_G	258_F	0.571	0.12
281_V	355_A	0.568	0.12
86_D	92_N	0.567	0.12
175_D	184_D	0.566	0.12
206_T	272_S	0.565	0.12
172_L	175_D	0.565	0.12
221_A	256_V	0.563	0.11
320_V	361_T	0.562	0.11
153_V	161_S	0.561	0.11
375_E	379_S	0.561	0.11
218_C	254_E	0.560	0.11
281_V	358_D	0.560	0.11
268_V	307_I	0.557	0.11
254_E	364_I	0.557	0.11
199_A	275_V	0.555	0.11
349_F	386_K	0.555	0.11
130_M	152_D	0.553	0.11
269_A	332_A	0.549	0.11
217_D	275_V	0.547	0.11
184_D	218_C	0.547	0.11
213_G	222_A	0.546	0.11
272_S	381_T	0.545	0.11
159_C	309_D	0.543	0.11
149_V	153_V	0.543	0.11
187_D	239_E	0.543	0.11
288_K	309_D	0.541	0.11
74_C	84_R	0.541	0.11
107_C	115_N	0.540	0.11
268_V	274_N	0.540	0.11
189_G	264_G	0.538	0.11
180_A	184_D	0.538	0.11
94_P	97_P	0.537	0.11
273_V	294_D	0.535	0.11
319_D	322_M	0.534	0.11
209_D	348_G	0.533	0.11
319_D	329_G	0.532	0.11
279_N	362_E	0.531	0.11
367_W	370_D	0.530	0.11
320_V	330_C	0.530	0.11
162_D	267_P	0.529	0.11
215_G	302_G	0.528	0.11
77_R	142_G	0.527	0.11
107_C	110_T	0.527	0.11
169_S	174_Y	0.526	0.11
93_R	98_K	0.525	0.11
84_R	94_P	0.525	0.11
169_S	175_D	0.525	0.11
171_R	236_M	0.524	0.11
375_E	380_A	0.524	0.11
256_V	278_S	0.523	0.11
64_R	70_R	0.523	0.11
203_P	380_A	0.521	0.11
222_A	231_V	0.520	0.11
229_G	304_R	0.519	0.11
158_G	220_L	0.518	0.11
153_V	303_G	0.518	0.11
119_V	130_M	0.518	0.11
115_N	143_Q	0.514	0.11
89_A	299_L	0.512	0.11
363_F	371_R	0.512	0.11
95_R	124_P	0.511	0.11
214_A	218_C	0.511	0.11
281_V	328_T	0.510	0.11
91_T	114_D	0.508	0.11
282_V	355_A	0.507	0.11
104_S	108_E	0.507	0.11
241_I	304_R	0.507	0.11
80_S	104_S	0.507	0.11
304_R	360_S	0.505	0.11
159_C	234_V	0.504	0.11
212_S	386_K	0.503	0.11
205_E	228_D	0.501	0.10
239_E	277_I	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4fsdA	1	0.532	100	0.644	Contact Map
3f4kA	2	0.5601	100	0.67	Contact Map
3g5tA	1	0.5601	100	0.683	Contact Map
3gu3A	2	0.5294	100	0.686	Contact Map
2yqzA	1	0.5448	100	0.699	Contact Map
1vl5A	1	0.4987	100	0.702	Contact Map
3egeA	1	0.509	100	0.705	Contact Map
2o57A	2	0.5985	100	0.705	Contact Map
4pneA	2	0.5831	100	0.709	Contact Map
4obxA	2	0.5013	100	0.711	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0106 seconds.