YGIQ - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YGIQ - UPF0313 protein YgiQ

UniProt:	Q46861	Sequences: MSSISLIQPDRDLFSWPQYWAACFGPAPFLPMSREEMDQLGWDSCDIILVTGDAYVDHPSFGMAICGRMLEAQGFRVGIIAQPDWSSKDDFMRLGKPNLFFGVTAGNMDSMINRYTADRRLRHDDAYTPDNVAGKRPDRATLVYTQRCKEAWKDVPVILGGIEASLRRTAHYDYWSDTVRRSVLVDSKADMLMFGNGERPLVEVAHRLAMGEPISEIRDVRNTAIIVKEALPGWSGVDSTRLDTPGKIDPIPHPYGEDLPCADNKPVAPKKQEAKAVTVQPPRPKPWEKTYVLLPSFEKVKGDKVLYAHASRILHHETNPGCARALMQKHGDRYVWINPPAIPLSTEEMDSVFALPYKRVPHPAYGNARIPAYEMIRFSVNIMRGCFGGCSFCSITEHEGRIIQSRSEDSIINEIEAIRDTVPGFTGVISDLGGPTANMYMLRCKSPRAEQTCRRLSCVYPDICPHMDTNHEPTINLYRRARDLKGIKKILIASGVRYDIAVEDPRYIKELATHHVGGYLKIAPEHTEEGPLSKMMKPGMGSYDRFKELFDTYSKQAGKEQYLIPYFISAHPGTRDEDMVNLALWLKKHRFRLDQVQNFYPSPLANSTTMYYTGKNPLAKIGYKSEDVFVPKGDKQRRLHKALLRYHDPANWPLIRQALEAMGKKHLIGSRRDCLVPAPTIEEMREARRQNRNTRPALTKHTPMATQRQTPATAKKASSTQSRPVNAGAKKRPKAAVGR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13019
Length:	739 (690)
Sequences:	248 (103)
Seq/√Len:	3.9

ECOLI - YGIQ

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
100_F	205_A	8.421	1.00
44_S	98_N	6.085	0.98
412_I	480_R	5.407	0.96
90_D	93_R	5.022	0.94
217_I	220_V	4.958	0.93
643_L	655_I	4.795	0.92
440_Y	471_H	4.208	0.86
81_A	129_P	4.185	0.85
409_D	412_I	3.881	0.81
349_M	354_A	3.868	0.80
112_I	600_Y	3.783	0.79
47_I	205_A	3.773	0.79
88_K	92_M	3.681	0.77
20_W	25_G	3.625	0.76
207_R	212_E	3.347	0.69
418_I	429_I	3.283	0.68
409_D	480_R	3.247	0.67
158_I	191_M	3.143	0.64
203_E	220_V	3.115	0.63
428_V	489_K	3.062	0.62
456_L	606_N	3.056	0.62
471_H	475_I	3.044	0.61
408_E	480_R	3.023	0.61
193_M	204_V	2.969	0.59
460_Y	533_S	2.863	0.56
471_H	504_D	2.831	0.55
21_A	25_G	2.824	0.55
508_I	549_L	2.776	0.54
609_T	613_T	2.720	0.52
141_T	159_L	2.662	0.50
149_K	157_V	2.633	0.50
440_Y	504_D	2.624	0.49
65_I	69_M	2.593	0.49
158_I	204_V	2.592	0.48
560_E	592_R	2.568	0.48
534_K	626_E	2.541	0.47
130_D	368_A	2.492	0.46
487_I	490_I	2.488	0.45
241_R	623_Y	2.455	0.45
428_V	491_L	2.433	0.44
29_F	363_P	2.423	0.44
231_L	609_T	2.404	0.43
412_I	484_L	2.390	0.43
20_W	24_F	2.386	0.43
475_I	504_D	2.381	0.42
218_R	227_V	2.367	0.42
117_A	600_Y	2.352	0.42
56_V	65_I	2.341	0.41
204_V	220_V	2.331	0.41
114_R	133_A	2.323	0.41
21_A	24_F	2.301	0.40
373_Y	602_S	2.245	0.39
123_H	133_A	2.241	0.39
360_V	373_Y	2.238	0.39
610_M	617_P	2.220	0.38
353_F	602_S	2.207	0.38
112_I	117_A	2.187	0.37
672_R	681_I	2.166	0.37
672_R	680_T	2.162	0.36
208_L	214_I	2.105	0.35
47_I	100_F	2.103	0.35
117_A	487_I	2.094	0.35
159_L	187_S	2.031	0.33
354_A	440_Y	2.025	0.33
411_I	441_M	2.021	0.33
288_E	422_V	2.015	0.33
299_K	623_Y	2.011	0.33
112_I	253_H	2.008	0.32
152_W	187_S	1.999	0.32
509_K	556_Q	1.997	0.32
527_T	540_M	1.961	0.31
49_L	104_T	1.935	0.31
200_P	341_A	1.933	0.31
234_W	405_S	1.921	0.30
373_Y	423_P	1.882	0.29
142_L	183_V	1.864	0.29
161_G	337_I	1.857	0.29
188_K	333_R	1.850	0.29
293_L	334_Y	1.847	0.29
112_I	684_M	1.842	0.28
65_I	602_S	1.832	0.28
17_P	24_F	1.829	0.28
56_V	602_S	1.828	0.28
354_A	413_N	1.826	0.28
51_T	104_T	1.825	0.28
103_V	148_C	1.808	0.28
130_D	133_A	1.805	0.28
220_V	377_R	1.802	0.28
171_H	491_L	1.783	0.27
322_C	496_V	1.780	0.27
23_C	112_I	1.778	0.27
185_V	226_I	1.772	0.27
318_T	606_N	1.772	0.27
14_F	351_S	1.770	0.27
487_I	615_K	1.745	0.26
241_R	299_K	1.739	0.26
17_P	23_C	1.735	0.26
120_R	634_D	1.729	0.26
197_G	200_P	1.723	0.26
194_F	201_L	1.720	0.26
20_W	23_C	1.713	0.26
193_M	197_G	1.712	0.25
291_Y	474_T	1.711	0.25
56_V	227_V	1.709	0.25
65_I	471_H	1.704	0.25
452_T	540_M	1.703	0.25
615_K	621_I	1.701	0.25
155_V	490_I	1.690	0.25
322_C	466_H	1.682	0.25
193_M	200_P	1.664	0.24
680_T	683_E	1.661	0.24
314_L	604_L	1.656	0.24
448_R	455_R	1.648	0.24
580_V	643_L	1.636	0.24
17_P	672_R	1.625	0.24
23_C	600_Y	1.623	0.24
218_R	456_L	1.610	0.23
322_C	449_A	1.606	0.23
531_P	574_T	1.604	0.23
446_S	490_I	1.604	0.23
56_V	493_A	1.599	0.23
670_S	678_A	1.598	0.23
519_Y	564_I	1.597	0.23
360_V	423_P	1.559	0.22
17_P	112_I	1.554	0.22
253_H	600_Y	1.550	0.22
100_F	318_T	1.543	0.22
217_I	551_D	1.540	0.22
450_E	574_T	1.535	0.22
49_L	253_H	1.523	0.22
655_I	664_K	1.514	0.21
188_K	475_I	1.514	0.21
56_V	134_G	1.511	0.21
615_K	627_D	1.510	0.21
481_A	490_I	1.497	0.21
496_V	569_S	1.496	0.21
349_M	440_Y	1.484	0.21
148_C	349_M	1.482	0.21
496_V	549_L	1.475	0.21
200_P	322_C	1.471	0.21
593_L	602_S	1.468	0.21
22_A	25_G	1.468	0.21
154_D	508_I	1.464	0.20
213_P	216_E	1.448	0.20
90_D	560_E	1.445	0.20
449_A	496_V	1.444	0.20
100_F	531_P	1.440	0.20
503_E	542_S	1.436	0.20
490_I	676_V	1.433	0.20
415_I	481_A	1.430	0.20
237_V	286_P	1.425	0.20
17_P	374_E	1.423	0.20
93_R	177_D	1.414	0.20
153_K	493_A	1.411	0.19
242_L	305_V	1.402	0.19
225_I	337_I	1.398	0.19
250_P	286_P	1.385	0.19
569_S	598_N	1.384	0.19
283_R	621_I	1.384	0.19
408_E	476_N	1.376	0.19
293_L	322_C	1.376	0.19
19_Y	44_S	1.374	0.19
208_L	423_P	1.372	0.19
373_Y	504_D	1.371	0.19
500_I	662_M	1.361	0.19
16_W	203_E	1.353	0.18
145_T	226_I	1.352	0.18
193_M	314_L	1.345	0.18
541_G	544_D	1.344	0.18
334_Y	540_M	1.344	0.18
32_M	364_A	1.342	0.18
171_H	605_A	1.341	0.18
634_D	638_R	1.338	0.18
405_S	593_L	1.336	0.18
609_T	638_R	1.331	0.18
378_F	422_V	1.329	0.18
158_I	632_K	1.325	0.18
574_T	631_P	1.320	0.18
171_H	374_E	1.315	0.18
130_D	134_G	1.314	0.18
120_R	636_Q	1.311	0.18
29_F	358_K	1.301	0.18
417_A	421_T	1.295	0.17
29_F	608_T	1.294	0.17
204_V	632_K	1.292	0.17
241_R	624_K	1.292	0.17
231_L	468_D	1.290	0.17
503_E	602_S	1.289	0.17
552_T	556_Q	1.284	0.17
128_T	415_I	1.284	0.17
555_K	560_E	1.282	0.17
32_M	234_W	1.280	0.17
299_K	624_K	1.276	0.17
450_E	640_H	1.274	0.17
421_T	424_G	1.273	0.17
200_P	231_L	1.272	0.17
250_P	674_C	1.268	0.17
291_Y	504_D	1.267	0.17
335_V	402_I	1.266	0.17
171_H	428_V	1.260	0.17
553_Y	621_I	1.257	0.17
689_R	692_R	1.255	0.17
148_C	602_S	1.252	0.17
171_H	593_L	1.249	0.17
236_G	293_L	1.249	0.17
19_Y	98_N	1.249	0.17
484_L	590_R	1.247	0.17
201_L	455_R	1.247	0.17
616_N	626_E	1.247	0.17
358_K	363_P	1.246	0.17
474_T	540_M	1.244	0.17
402_I	450_E	1.243	0.17
120_R	462_D	1.242	0.17
374_E	474_T	1.239	0.17
314_L	614_G	1.237	0.17
177_D	630_V	1.230	0.16
148_C	373_Y	1.230	0.16
437_A	527_T	1.227	0.16
186_D	611_Y	1.224	0.16
616_N	619_A	1.222	0.16
474_T	679_P	1.222	0.16
183_V	465_P	1.218	0.16
251_I	335_V	1.218	0.16
496_V	598_N	1.212	0.16
274_A	277_V	1.206	0.16
100_F	129_P	1.206	0.16
560_E	672_R	1.203	0.16
227_V	314_L	1.199	0.16
18_Q	21_A	1.198	0.16
318_T	415_I	1.197	0.16
12_D	351_S	1.192	0.16
643_L	666_H	1.189	0.16
380_V	419_R	1.189	0.16
643_L	664_K	1.188	0.16
157_V	676_V	1.188	0.16
450_E	605_A	1.184	0.16
283_R	487_I	1.184	0.16
358_K	504_D	1.180	0.16
604_L	630_V	1.179	0.16
205_A	531_P	1.176	0.16
374_E	672_R	1.172	0.16
252_P	256_G	1.169	0.15
121_L	493_A	1.169	0.15
200_P	236_G	1.169	0.15
176_S	183_V	1.165	0.15
123_H	287_W	1.164	0.15
17_P	681_I	1.163	0.15
123_H	474_T	1.163	0.15
540_M	543_Y	1.162	0.15
100_F	345_S	1.161	0.15
487_I	549_L	1.159	0.15
236_G	466_H	1.159	0.15
148_C	624_K	1.154	0.15
145_T	503_E	1.153	0.15
92_M	157_V	1.153	0.15
467_M	613_T	1.152	0.15
130_D	236_G	1.152	0.15
90_D	152_W	1.151	0.15
313_I	609_T	1.150	0.15
187_S	408_E	1.145	0.15
200_P	293_L	1.138	0.15
377_R	643_L	1.134	0.15
123_H	503_E	1.133	0.15
593_L	605_A	1.131	0.15
630_V	650_A	1.129	0.15
29_F	140_A	1.128	0.15
119_R	171_H	1.125	0.15
194_F	314_L	1.123	0.15
72_A	534_K	1.120	0.15
114_R	132_V	1.119	0.15
293_L	341_A	1.110	0.15
466_H	496_V	1.107	0.15
17_P	22_A	1.107	0.15
193_M	405_S	1.104	0.15
35_E	69_M	1.102	0.15
205_A	318_T	1.092	0.14
236_G	322_C	1.088	0.14
449_A	466_H	1.088	0.14
172_Y	177_D	1.086	0.14
50_V	485_K	1.081	0.14
156_P	186_D	1.077	0.14
364_A	484_L	1.076	0.14
655_I	666_H	1.075	0.14
304_K	466_H	1.071	0.14
462_D	593_L	1.070	0.14
201_L	548_E	1.067	0.14
500_I	556_Q	1.066	0.14
455_R	544_D	1.058	0.14
291_Y	335_V	1.056	0.14
437_A	488_K	1.051	0.14
548_E	552_T	1.044	0.14
207_R	217_I	1.038	0.14
672_R	683_E	1.037	0.14
358_K	608_T	1.037	0.14
100_F	238_D	1.036	0.14
17_P	623_Y	1.036	0.14
20_W	26_P	1.032	0.14
449_A	549_L	1.031	0.14
651_N	655_I	1.031	0.14
321_G	325_A	1.030	0.14
18_Q	409_D	1.028	0.13
304_K	322_C	1.027	0.13
142_L	194_F	1.026	0.13
623_Y	681_I	1.026	0.13
96_K	154_D	1.024	0.13
24_F	681_I	1.023	0.13
467_M	544_D	1.022	0.13
72_A	605_A	1.020	0.13
322_C	569_S	1.017	0.13
491_L	517_G	1.016	0.13
231_L	334_Y	1.013	0.13
154_D	332_D	1.012	0.13
112_I	580_V	1.012	0.13
112_I	353_F	1.011	0.13
27_A	31_P	1.010	0.13
474_T	504_D	1.007	0.13
456_L	634_D	1.005	0.13
217_I	616_N	1.004	0.13
193_M	353_F	1.004	0.13
92_M	149_K	1.004	0.13
148_C	632_K	1.002	0.13
132_V	368_A	1.001	0.13
13_L	288_E	1.001	0.13
65_I	633_G	1.000	0.13
66_C	639_L	0.998	0.13
476_N	580_V	0.997	0.13
306_L	636_Q	0.996	0.13
153_K	631_P	0.995	0.13
443_R	474_T	0.992	0.13
503_E	632_K	0.990	0.13
353_F	503_E	0.988	0.13
467_M	513_T	0.987	0.13
96_K	155_V	0.987	0.13
159_L	676_V	0.983	0.13
49_L	674_C	0.983	0.13
448_R	613_T	0.982	0.13
39_Q	412_I	0.982	0.13
471_H	490_I	0.982	0.13
18_Q	22_A	0.982	0.13
80_I	555_K	0.981	0.13
157_V	183_V	0.981	0.13
253_H	337_I	0.978	0.13
236_G	291_Y	0.978	0.13
643_L	672_R	0.978	0.13
200_P	466_H	0.977	0.13
131_N	602_S	0.976	0.13
194_F	282_P	0.975	0.13
292_V	519_Y	0.974	0.13
377_R	655_I	0.974	0.13
187_S	676_V	0.972	0.13
402_I	639_L	0.969	0.13
18_Q	614_G	0.969	0.13
446_S	542_S	0.963	0.13
56_V	153_K	0.959	0.13
96_K	509_K	0.958	0.13
103_V	157_V	0.957	0.13
318_T	456_L	0.953	0.13
341_A	446_S	0.949	0.12
560_E	680_T	0.946	0.12
171_H	318_T	0.944	0.12
252_P	311_S	0.942	0.12
625_S	665_K	0.942	0.12
251_I	619_A	0.939	0.12
633_G	638_R	0.938	0.12
283_R	665_K	0.938	0.12
415_I	608_T	0.938	0.12
49_L	237_V	0.938	0.12
545_R	654_L	0.937	0.12
157_V	242_L	0.936	0.12
316_H	358_K	0.935	0.12
430_S	517_G	0.934	0.12
275_K	292_V	0.934	0.12
90_D	650_A	0.932	0.12
200_P	304_K	0.931	0.12
377_R	424_G	0.931	0.12
171_H	633_G	0.930	0.12
216_E	660_E	0.929	0.12
471_H	553_Y	0.925	0.12
242_L	643_L	0.925	0.12
240_T	624_K	0.924	0.12
322_C	506_R	0.924	0.12
321_G	628_V	0.922	0.12
325_A	628_V	0.922	0.12
341_A	512_A	0.921	0.12
287_W	474_T	0.920	0.12
476_N	480_R	0.920	0.12
230_A	378_F	0.920	0.12
203_E	424_G	0.919	0.12
276_A	281_P	0.916	0.12
56_V	120_R	0.915	0.12
56_V	318_T	0.915	0.12
234_W	445_K	0.914	0.12
363_P	378_F	0.914	0.12
377_R	674_C	0.912	0.12
119_R	640_H	0.910	0.12
169_T	314_L	0.908	0.12
133_A	373_Y	0.905	0.12
318_T	598_N	0.904	0.12
170_A	179_V	0.903	0.12
119_R	224_A	0.902	0.12
112_I	124_D	0.899	0.12
124_D	600_Y	0.899	0.12
141_T	183_V	0.899	0.12
378_F	424_G	0.897	0.12
263_D	612_Y	0.896	0.12
191_M	337_I	0.895	0.12
369_R	460_Y	0.895	0.12
474_T	623_Y	0.894	0.12
207_R	219_D	0.887	0.12
148_C	220_V	0.887	0.12
409_D	417_A	0.885	0.12
200_P	232_P	0.884	0.12
426_T	491_L	0.883	0.12
322_C	341_A	0.882	0.12
24_F	672_R	0.881	0.12
23_C	374_E	0.881	0.12
622_G	625_S	0.881	0.12
142_L	490_I	0.875	0.12
159_L	456_L	0.875	0.12
89_D	297_F	0.874	0.12
181_R	186_D	0.873	0.12
225_I	378_F	0.872	0.12
227_V	602_S	0.870	0.12
374_E	468_D	0.868	0.11
349_M	415_I	0.868	0.11
17_P	20_W	0.867	0.11
318_T	493_A	0.867	0.11
553_Y	635_K	0.867	0.11
90_D	367_N	0.867	0.11
119_R	628_V	0.867	0.11
201_L	655_I	0.866	0.11
65_I	600_Y	0.865	0.11
28_P	31_P	0.864	0.11
466_H	655_I	0.863	0.11
569_S	664_K	0.862	0.11
208_L	217_I	0.859	0.11
188_K	487_I	0.859	0.11
90_D	252_P	0.858	0.11
217_I	377_R	0.857	0.11
203_E	447_P	0.857	0.11
242_L	321_G	0.855	0.11
241_R	296_S	0.854	0.11
609_T	681_I	0.854	0.11
543_Y	547_K	0.854	0.11
542_S	612_Y	0.854	0.11
353_F	373_Y	0.853	0.11
545_R	548_E	0.851	0.11
467_M	490_I	0.851	0.11
250_P	551_D	0.850	0.11
134_G	493_A	0.850	0.11
291_Y	681_I	0.848	0.11
200_P	569_S	0.848	0.11
660_E	665_K	0.847	0.11
529_E	533_S	0.847	0.11
17_P	679_P	0.846	0.11
657_Q	661_A	0.846	0.11
408_E	670_S	0.846	0.11
493_A	517_G	0.845	0.11
593_L	598_N	0.845	0.11
204_V	621_I	0.844	0.11
87_S	90_D	0.844	0.11
169_T	311_S	0.841	0.11
337_I	661_A	0.841	0.11
391_S	459_V	0.839	0.11
56_V	156_P	0.838	0.11
513_T	569_S	0.838	0.11
351_S	354_A	0.835	0.11
17_P	377_R	0.826	0.11
275_K	279_V	0.825	0.11
321_G	450_E	0.824	0.11
552_T	555_K	0.822	0.11
615_K	620_K	0.822	0.11
48_I	80_I	0.821	0.11
351_S	440_Y	0.820	0.11
228_K	318_T	0.820	0.11
592_R	680_T	0.820	0.11
101_F	164_A	0.819	0.11
152_W	590_R	0.818	0.11
476_N	527_T	0.818	0.11
231_L	313_I	0.817	0.11
134_G	233_G	0.817	0.11
415_I	440_Y	0.814	0.11
103_V	409_D	0.813	0.11
304_K	335_V	0.813	0.11
409_D	413_N	0.810	0.11
25_G	374_E	0.806	0.11
158_I	208_L	0.801	0.11
588_K	614_G	0.801	0.11
443_R	462_D	0.800	0.11
342_I	346_T	0.800	0.11
26_P	620_K	0.799	0.11
19_Y	22_A	0.798	0.11
542_S	551_D	0.798	0.11
200_P	617_P	0.797	0.11
231_L	285_K	0.796	0.11
360_V	493_A	0.796	0.11
508_I	540_M	0.795	0.11
233_G	552_T	0.794	0.11
485_K	671_R	0.793	0.11
277_V	624_K	0.793	0.11
294_L	621_I	0.793	0.11
226_I	508_I	0.792	0.11
552_T	625_S	0.792	0.11
291_Y	540_M	0.791	0.11
155_V	631_P	0.790	0.11
242_L	693_N	0.788	0.11
32_M	93_R	0.786	0.11
145_T	149_K	0.785	0.11
69_M	504_D	0.784	0.11
412_I	417_A	0.783	0.11
284_P	413_N	0.782	0.11
119_R	297_F	0.782	0.11
185_V	332_D	0.781	0.11
592_R	672_R	0.779	0.10
142_L	333_R	0.778	0.10
322_C	664_K	0.775	0.10
447_P	614_G	0.774	0.10
112_I	679_P	0.774	0.10
119_R	503_E	0.774	0.10
79_I	639_L	0.774	0.10
220_V	613_T	0.773	0.10
449_A	506_R	0.773	0.10
158_I	214_I	0.772	0.10
304_K	449_A	0.771	0.10
236_G	506_R	0.770	0.10
600_Y	684_M	0.770	0.10
223_T	338_N	0.769	0.10
301_K	620_K	0.767	0.10
291_Y	598_N	0.765	0.10
621_I	627_D	0.765	0.10
472_E	475_I	0.764	0.10
405_S	440_Y	0.763	0.10
184_L	617_P	0.762	0.10
493_A	629_F	0.762	0.10
415_I	612_Y	0.762	0.10
50_V	96_K	0.760	0.10
148_C	353_F	0.760	0.10
142_L	154_D	0.758	0.10
658_A	662_M	0.758	0.10
226_I	314_L	0.757	0.10
232_P	377_R	0.757	0.10
272_Q	409_D	0.757	0.10
205_A	238_D	0.757	0.10
378_F	460_Y	0.755	0.10
29_F	360_V	0.754	0.10
428_V	484_L	0.752	0.10
141_T	176_S	0.752	0.10
214_I	281_P	0.752	0.10
374_E	679_P	0.752	0.10
17_P	600_Y	0.751	0.10
301_K	624_K	0.751	0.10
81_A	475_I	0.751	0.10
292_V	409_D	0.750	0.10
92_M	293_L	0.748	0.10
322_C	598_N	0.748	0.10
217_I	337_I	0.748	0.10
260_P	549_L	0.747	0.10
341_A	466_H	0.747	0.10
81_A	409_D	0.746	0.10
692_R	695_R	0.746	0.10
169_T	620_K	0.745	0.10
455_R	631_P	0.743	0.10
171_H	575_R	0.742	0.10
112_I	683_E	0.741	0.10
13_L	243_D	0.741	0.10
240_T	245_P	0.740	0.10
275_K	278_T	0.740	0.10
92_M	413_N	0.739	0.10
428_V	605_A	0.739	0.10
129_P	380_V	0.737	0.10
92_M	598_N	0.737	0.10
133_A	633_G	0.736	0.10
49_L	691_N	0.736	0.10
493_A	636_Q	0.734	0.10
227_V	230_A	0.734	0.10
205_A	345_S	0.733	0.10
462_D	508_I	0.733	0.10
405_S	471_H	0.732	0.10
86_S	674_C	0.731	0.10
183_V	405_S	0.729	0.10
153_K	638_R	0.728	0.10
210_M	690_Q	0.728	0.10
236_G	449_A	0.728	0.10
661_A	694_T	0.727	0.10
351_S	455_R	0.726	0.10
121_L	301_K	0.726	0.10
118_D	553_Y	0.726	0.10
452_T	614_G	0.725	0.10
236_G	341_A	0.725	0.10
133_A	244_T	0.724	0.10
327_M	533_S	0.724	0.10
459_V	502_V	0.724	0.10
411_I	450_E	0.723	0.10
14_F	638_R	0.723	0.10
241_R	613_T	0.722	0.10
426_T	517_G	0.722	0.10
135_K	509_K	0.721	0.10
224_A	574_T	0.721	0.10
193_M	341_A	0.720	0.10
141_T	164_A	0.719	0.10
298_E	305_V	0.719	0.10
450_E	488_K	0.718	0.10
215_S	620_K	0.717	0.10
231_L	493_A	0.717	0.10
544_D	547_K	0.717	0.10
286_P	412_I	0.717	0.10
17_P	680_T	0.712	0.10
72_A	217_I	0.711	0.10
191_M	253_H	0.711	0.10
590_R	593_L	0.711	0.10
540_M	670_S	0.711	0.10
56_V	465_P	0.707	0.10
48_I	158_I	0.706	0.10
65_I	685_R	0.704	0.10
287_W	465_P	0.704	0.10
84_D	625_S	0.702	0.10
506_R	604_L	0.702	0.10
332_D	631_P	0.702	0.10
227_V	415_I	0.701	0.10
437_A	450_E	0.701	0.10
152_W	288_E	0.701	0.10
206_H	356_P	0.701	0.10
197_G	204_V	0.700	0.10
185_V	214_I	0.700	0.10
360_V	602_S	0.700	0.10
217_I	297_F	0.700	0.10
549_L	613_T	0.699	0.10
228_K	333_R	0.699	0.10
232_P	630_V	0.699	0.10
152_W	551_D	0.698	0.10
488_K	640_H	0.695	0.10
123_H	598_N	0.694	0.10
200_P	496_V	0.694	0.10
422_V	503_E	0.694	0.10
592_R	683_E	0.691	0.10
158_I	327_M	0.690	0.10
47_I	552_T	0.690	0.10
542_S	619_A	0.687	0.10
154_D	161_G	0.686	0.10
580_V	664_K	0.686	0.10
123_H	483_D	0.684	0.10
187_S	422_V	0.684	0.10
373_Y	377_R	0.684	0.10
50_V	413_N	0.684	0.10
475_I	624_K	0.683	0.09
358_K	373_Y	0.683	0.09
123_H	602_S	0.683	0.09
531_P	680_T	0.682	0.09
527_T	676_V	0.682	0.09
475_I	553_Y	0.682	0.09
531_P	640_H	0.680	0.09
217_I	226_I	0.680	0.09
200_P	358_K	0.680	0.09
242_L	628_V	0.679	0.09
332_D	491_L	0.678	0.09
415_I	555_K	0.678	0.09
17_P	684_M	0.678	0.09
185_V	193_M	0.677	0.09
373_Y	424_G	0.677	0.09
194_F	481_A	0.676	0.09
153_K	465_P	0.676	0.09
354_A	357_Y	0.675	0.09
133_A	227_V	0.675	0.09
276_A	279_V	0.675	0.09
171_H	408_E	0.674	0.09
509_K	529_E	0.673	0.09
493_A	588_K	0.672	0.09
197_G	381_N	0.671	0.09
491_L	575_R	0.671	0.09
232_P	286_P	0.671	0.09
159_L	253_H	0.669	0.09
491_L	633_G	0.668	0.09
250_P	447_P	0.667	0.09
135_K	289_K	0.667	0.09
685_R	690_Q	0.667	0.09
129_P	509_K	0.666	0.09
141_T	316_H	0.666	0.09
293_L	303_D	0.665	0.09
17_P	21_A	0.665	0.09
14_F	27_A	0.664	0.09
188_K	491_L	0.664	0.09
242_L	446_S	0.662	0.09
176_S	429_I	0.661	0.09
15_S	631_P	0.661	0.09
104_T	176_S	0.659	0.09
186_D	208_L	0.659	0.09
69_M	132_V	0.658	0.09
305_V	345_S	0.658	0.09
161_G	630_V	0.657	0.09
229_E	334_Y	0.657	0.09
574_T	640_H	0.657	0.09
20_W	672_R	0.657	0.09
193_M	467_M	0.656	0.09
463_I	503_E	0.656	0.09
69_M	202_V	0.656	0.09
17_P	474_T	0.655	0.09
460_Y	692_R	0.655	0.09
257_E	260_P	0.654	0.09
553_Y	556_Q	0.654	0.09
200_P	363_P	0.653	0.09
236_G	455_R	0.653	0.09
484_L	502_V	0.653	0.09
354_A	421_T	0.653	0.09
347_E	685_R	0.652	0.09
121_L	440_Y	0.652	0.09
660_E	678_A	0.651	0.09
218_R	440_Y	0.649	0.09
670_S	679_P	0.648	0.09
441_M	474_T	0.646	0.09
18_Q	132_V	0.645	0.09
289_K	590_R	0.644	0.09
27_A	30_L	0.643	0.09
421_T	509_K	0.643	0.09
148_C	248_I	0.642	0.09
38_D	411_I	0.642	0.09
441_M	640_H	0.640	0.09
231_L	496_V	0.639	0.09
188_K	250_P	0.639	0.09
135_K	158_I	0.639	0.09
391_S	606_N	0.638	0.09
449_A	664_K	0.638	0.09
695_R	699_T	0.636	0.09
56_V	186_D	0.635	0.09
12_D	347_E	0.635	0.09
220_V	650_A	0.635	0.09
123_H	540_M	0.634	0.09
472_E	476_N	0.634	0.09
117_A	124_D	0.633	0.09
158_I	186_D	0.633	0.09
275_K	632_K	0.633	0.09
332_D	605_A	0.633	0.09
643_L	680_T	0.633	0.09
112_I	575_R	0.632	0.09
149_K	293_L	0.632	0.09
257_E	265_K	0.632	0.09
178_T	612_Y	0.631	0.09
178_T	202_V	0.631	0.09
351_S	493_A	0.630	0.09
688_R	692_R	0.629	0.09
184_L	187_S	0.629	0.09
44_S	157_V	0.629	0.09
465_P	613_T	0.628	0.09
440_Y	553_Y	0.628	0.09
134_G	161_G	0.627	0.09
590_R	671_R	0.627	0.09
487_I	665_K	0.626	0.09
291_Y	316_H	0.626	0.09
606_N	632_K	0.625	0.09
17_P	440_Y	0.624	0.09
218_R	373_Y	0.624	0.09
86_S	614_G	0.623	0.09
263_D	277_V	0.622	0.09
98_N	405_S	0.622	0.09
200_P	449_A	0.621	0.09
21_A	26_P	0.621	0.09
297_F	633_G	0.620	0.09
289_K	509_K	0.620	0.09
131_N	360_V	0.620	0.09
153_K	602_S	0.619	0.09
284_P	548_E	0.619	0.09
65_I	493_A	0.619	0.09
104_T	257_E	0.619	0.09
325_A	626_E	0.618	0.09
142_L	226_I	0.618	0.09
56_V	600_Y	0.617	0.09
17_P	241_R	0.616	0.09
117_A	200_P	0.615	0.09
200_P	248_I	0.615	0.09
29_F	200_P	0.614	0.09
105_A	124_D	0.614	0.09
161_G	225_I	0.614	0.09
154_D	157_V	0.613	0.09
242_L	417_A	0.613	0.09
282_P	625_S	0.612	0.09
120_R	257_E	0.610	0.09
177_D	549_L	0.609	0.09
123_H	676_V	0.608	0.09
640_H	674_C	0.608	0.09
306_L	451_Q	0.608	0.09
145_T	157_V	0.607	0.09
509_K	673_D	0.605	0.09
191_M	204_V	0.605	0.09
12_D	631_P	0.604	0.09
119_R	321_G	0.604	0.09
267_V	273_E	0.604	0.09
357_Y	543_Y	0.604	0.09
161_G	297_F	0.603	0.09
449_A	459_V	0.602	0.09
49_L	661_A	0.602	0.09
302_G	329_K	0.602	0.09
560_E	683_E	0.602	0.09
411_I	682_E	0.601	0.09
334_Y	613_T	0.600	0.09
204_V	651_N	0.600	0.09
148_C	204_V	0.600	0.09
296_S	617_P	0.599	0.09
123_H	131_N	0.599	0.09
540_M	593_L	0.598	0.09
367_N	551_D	0.597	0.09
169_T	443_R	0.597	0.09
208_L	354_A	0.596	0.09
440_Y	679_P	0.596	0.09
269_P	367_N	0.595	0.09
92_M	145_T	0.595	0.09
133_A	483_D	0.594	0.09
287_W	341_A	0.594	0.09
436_T	469_T	0.594	0.09
428_V	446_S	0.594	0.09
377_R	422_V	0.593	0.09
124_D	214_I	0.593	0.09
378_F	534_K	0.593	0.09
609_T	683_E	0.591	0.09
90_D	636_Q	0.591	0.09
286_P	422_V	0.591	0.09
345_S	592_R	0.591	0.09
218_R	225_I	0.591	0.09
200_P	506_R	0.590	0.09
184_L	189_A	0.588	0.09
200_P	287_W	0.587	0.09
360_V	456_L	0.587	0.09
50_V	237_V	0.586	0.09
490_I	695_R	0.586	0.09
145_T	337_I	0.586	0.09
191_M	242_L	0.586	0.09
22_A	335_V	0.585	0.09
231_L	342_I	0.585	0.09
252_P	292_V	0.585	0.09
267_V	632_K	0.584	0.09
112_I	251_I	0.583	0.09
374_E	673_D	0.583	0.09
241_R	421_T	0.583	0.09
609_T	680_T	0.583	0.09
142_L	422_V	0.582	0.09
134_G	634_D	0.582	0.09
580_V	662_M	0.580	0.09
314_L	593_L	0.579	0.09
291_Y	506_R	0.579	0.09
50_V	616_N	0.578	0.09
401_R	578_D	0.578	0.09
377_R	580_V	0.577	0.08
119_R	188_K	0.577	0.08
56_V	373_Y	0.577	0.08
141_T	490_I	0.576	0.08
246_G	254_P	0.576	0.08
21_A	34_R	0.576	0.08
240_T	487_I	0.575	0.08
291_Y	443_R	0.575	0.08
316_H	378_F	0.573	0.08
674_C	680_T	0.573	0.08
643_L	674_C	0.573	0.08
141_T	447_P	0.573	0.08
614_G	630_V	0.572	0.08
672_R	679_P	0.571	0.08
590_R	625_S	0.571	0.08
17_P	25_G	0.570	0.08
248_I	251_I	0.570	0.08
443_R	496_V	0.570	0.08
13_L	508_I	0.568	0.08
226_I	296_S	0.568	0.08
672_R	684_M	0.568	0.08
440_Y	545_R	0.568	0.08
629_F	636_Q	0.568	0.08
131_N	236_G	0.567	0.08
314_L	503_E	0.567	0.08
378_F	421_T	0.567	0.08
512_A	680_T	0.567	0.08
314_L	355_L	0.567	0.08
135_K	237_V	0.566	0.08
142_L	188_K	0.566	0.08
590_R	598_N	0.565	0.08
54_A	186_D	0.565	0.08
259_L	483_D	0.565	0.08
423_P	504_D	0.564	0.08
134_G	468_D	0.564	0.08
69_M	118_D	0.563	0.08
450_E	531_P	0.563	0.08
249_D	608_T	0.562	0.08
135_K	620_K	0.562	0.08
171_H	244_T	0.562	0.08
220_V	621_I	0.562	0.08
346_T	519_Y	0.562	0.08
322_C	655_I	0.561	0.08
569_S	606_N	0.561	0.08
159_L	345_S	0.560	0.08
152_W	621_I	0.560	0.08
650_A	676_V	0.560	0.08
337_I	620_K	0.559	0.08
161_G	203_E	0.559	0.08
465_P	493_A	0.559	0.08
134_G	422_V	0.559	0.08
96_K	369_R	0.558	0.08
20_W	98_N	0.558	0.08
242_L	622_G	0.557	0.08
283_R	292_V	0.557	0.08
218_R	602_S	0.557	0.08
267_V	271_K	0.556	0.08
233_G	638_R	0.556	0.08
208_L	292_V	0.555	0.08
415_I	490_I	0.555	0.08
313_I	611_Y	0.554	0.08
551_D	630_V	0.552	0.08
293_L	466_H	0.552	0.08
408_E	421_T	0.552	0.08
105_A	140_A	0.552	0.08
228_K	423_P	0.551	0.08
342_I	619_A	0.551	0.08
232_P	236_G	0.550	0.08
247_K	374_E	0.549	0.08
103_V	592_R	0.549	0.08
10_D	609_T	0.548	0.08
100_F	111_M	0.548	0.08
413_N	670_S	0.547	0.08
212_E	534_K	0.547	0.08
156_P	517_G	0.547	0.08
327_M	590_R	0.546	0.08
18_Q	377_R	0.546	0.08
592_R	655_I	0.546	0.08
220_V	265_K	0.546	0.08
13_L	504_D	0.545	0.08
541_G	643_L	0.545	0.08
354_A	358_K	0.545	0.08
413_N	692_R	0.545	0.08
56_V	230_A	0.545	0.08
65_I	154_D	0.544	0.08
90_D	177_D	0.544	0.08
140_A	608_T	0.543	0.08
281_P	284_P	0.543	0.08
202_V	678_A	0.543	0.08
114_R	292_V	0.541	0.08
465_P	676_V	0.541	0.08
177_D	292_V	0.541	0.08
227_V	233_G	0.540	0.08
374_E	377_R	0.540	0.08
658_A	680_T	0.538	0.08
448_R	465_P	0.537	0.08
80_I	94_L	0.537	0.08
373_Y	474_T	0.537	0.08
231_L	286_P	0.537	0.08
148_C	631_P	0.537	0.08
460_Y	472_E	0.536	0.08
491_L	593_L	0.536	0.08
411_I	640_H	0.536	0.08
575_R	658_A	0.535	0.08
120_R	650_A	0.535	0.08
471_H	556_Q	0.535	0.08
214_I	217_I	0.534	0.08
650_A	654_L	0.534	0.08
487_I	529_E	0.534	0.08
358_K	670_S	0.533	0.08
217_I	480_R	0.533	0.08
218_R	237_V	0.533	0.08
158_I	313_I	0.533	0.08
129_P	560_E	0.533	0.08
145_T	148_C	0.533	0.08
96_K	620_K	0.532	0.08
321_G	533_S	0.532	0.08
678_A	692_R	0.531	0.08
397_E	459_V	0.531	0.08
207_R	447_P	0.530	0.08
148_C	354_A	0.530	0.08
22_A	679_P	0.529	0.08
298_E	354_A	0.529	0.08
121_L	474_T	0.528	0.08
104_T	253_H	0.526	0.08
88_K	466_H	0.525	0.08
104_T	600_Y	0.525	0.08
236_G	496_V	0.525	0.08
536_M	618_L	0.525	0.08
142_L	185_V	0.525	0.08
490_I	621_I	0.525	0.08
686_E	698_L	0.524	0.08
373_Y	632_K	0.524	0.08
287_W	598_N	0.524	0.08
120_R	316_H	0.524	0.08
154_D	602_S	0.523	0.08
24_F	673_D	0.522	0.08
32_M	437_A	0.522	0.08
574_T	680_T	0.521	0.08
131_N	483_D	0.520	0.08
201_L	358_K	0.520	0.08
44_S	117_A	0.520	0.08
229_E	650_A	0.520	0.08
528_E	581_N	0.520	0.08
100_F	527_T	0.519	0.08
201_L	496_V	0.519	0.08
503_E	545_R	0.519	0.08
158_I	611_Y	0.518	0.08
130_D	176_S	0.518	0.08
268_A	555_K	0.518	0.08
430_S	493_A	0.518	0.08
314_L	475_I	0.518	0.08
220_V	311_S	0.517	0.08
405_S	504_D	0.517	0.08
157_V	661_A	0.517	0.08
623_Y	672_R	0.517	0.08
259_L	271_K	0.517	0.08
158_I	220_V	0.516	0.08
351_S	555_K	0.516	0.08
440_Y	490_I	0.516	0.08
157_V	620_K	0.516	0.08
301_K	630_V	0.515	0.08
69_M	201_L	0.515	0.08
226_I	602_S	0.515	0.08
234_W	534_K	0.515	0.08
402_I	441_M	0.515	0.08
26_P	112_I	0.514	0.08
227_V	373_Y	0.514	0.08
443_R	472_E	0.514	0.08
363_P	504_D	0.513	0.08
293_L	467_M	0.510	0.08
483_D	598_N	0.510	0.08
552_T	635_K	0.510	0.08
87_S	147_R	0.510	0.08
614_G	657_Q	0.510	0.08
373_Y	682_E	0.509	0.08
605_A	640_H	0.509	0.08
201_L	609_T	0.509	0.08
446_S	577_E	0.509	0.08
496_V	680_T	0.509	0.08
224_A	628_V	0.508	0.08
313_I	638_R	0.508	0.08
263_D	269_P	0.507	0.08
200_P	377_R	0.507	0.08
684_M	689_R	0.507	0.08
490_I	545_R	0.506	0.08
391_S	615_K	0.506	0.08
200_P	512_A	0.505	0.08
254_P	470_N	0.504	0.08
118_D	624_K	0.504	0.08
194_F	256_G	0.504	0.08
449_A	606_N	0.503	0.08
380_V	467_M	0.502	0.08
374_E	542_S	0.502	0.08
96_K	545_R	0.500	0.08
177_D	620_K	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qgqA	1	0.3545	99.6	0.961	Contact Map
4jc0A	1	0.5413	99.4	0.966	Contact Map
3iixA	1	0.456	99.2	0.968	Contact Map
4u0oB	1	0.3627	98.9	0.972	Contact Map
1r30A	2	0.3857	98.9	0.972	Contact Map
3t7vA	1	0.4344	98.6	0.975	Contact Map
2z2uA	1	0.3694	98.3	0.977	Contact Map
4r33A	2	0.475	98.3	0.977	Contact Map
3rfaA	1	0.4493	98.3	0.977	Contact Map
1oltA	1	0.4506	98.2	0.978	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0166 seconds.