YGFT - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YGFT - Uncharacterized protein YgfT

UniProt:	Q46820	Sequences: MNKFIAAEAAECIGCHACEIACAVAHNQENWPLSHSDFRPRIHVVGKGQAANPVACHHCNNAPCVTACPVNALTFQSDSVQLDEQKCIGCKRCAIACPFGVVEMVDTIAQKCDLCNQRSSGTQACIEVCPTQALRLMDDKGLQQIKVARQRKTAAGKASSDAQPSRSAALLPVNSRKGADKISASERKTHFGEIYCGLDPQQATYESDRCVYCAEKANCNWHCPLHNAIPDYIRLVQEGKIIEAAELCHQTSSLPEICGRVCPQDRLCEGACTLKDHSGAVSIGNLERYITDTALAMGWRPDVSKVVPRSEKVAVIGAGPAGLGCADILARAGVQVDVFDRHPEIGGMLTFGIPPFKLDKTVLSQRREIFTAMGIDFHLNCEIGRDITFSDLTSEYDAVFIGVGTYGMMRADLPHEDAPGVIQALPFLTAHTRQLMGLPESEEYPLTDVEGKRVVVLGGGDTTMDCLRTSIRLNAASVTCAYRRDEVSMPGSRKEVVNAREEGVEFQFNVQPQYIACDEDGRLTAVGLIRTAMGEPGPDGRRRPRPVAGSEFELPADVLIMAFGFQAHAMPWLQGSGIKLDKWGLIQTGDVGYLPTQTHLKKVFAGGDAVHGADLVVTAMAAGRQAARDMLTLFDTKAS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13070
Length:	639 (488)
Sequences:	193 (128)
Seq/√Len:	5.8

ECOLI - YGFT AEGA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
514_Y	527_G	5.278	0.99
338_V	377_F	4.721	0.97
604_F	633_L	4.353	0.96
236_V	290_I	4.310	0.95
398_A	630_M	3.858	0.92
499_A	503_G	3.498	0.87
418_A	517_C	3.406	0.85
455_V	556_A	3.300	0.83
392_L	518_D	3.265	0.83
252_S	258_C	3.222	0.82
176_R	269_E	3.123	0.80
400_F	606_G	3.055	0.78
309_R	334_V	3.045	0.78
597_Q	604_F	2.934	0.75
469_T	611_H	2.859	0.73
206_E	286_L	2.727	0.69
203_A	236_V	2.709	0.69
611_H	622_A	2.699	0.68
337_D	378_H	2.660	0.67
525_A	553_E	2.523	0.63
316_I	399_V	2.511	0.62
183_S	577_G	2.510	0.62
523_L	559_L	2.439	0.60
462_T	467_L	2.370	0.58
325_C	329_L	2.353	0.57
233_I	283_I	2.309	0.56
339_F	396_Y	2.293	0.55
198_L	207_S	2.279	0.55
307_V	633_L	2.269	0.54
315_V	518_D	2.263	0.54
377_F	469_T	2.221	0.53
422_I	560_I	2.215	0.52
329_L	398_A	2.188	0.51
325_C	398_A	2.181	0.51
199_D	532_A	2.161	0.50
569_A	572_W	2.132	0.49
502_E	506_F	2.124	0.49
203_A	286_L	2.111	0.49
240_K	243_E	2.100	0.48
381_C	620_M	2.093	0.48
175_S	532_A	2.037	0.46
311_E	598_T	2.032	0.46
579_K	587_Q	2.023	0.46
203_A	206_E	1.982	0.44
503_G	506_F	1.967	0.44
313_V	398_A	1.965	0.44
516_A	525_A	1.954	0.43
453_R	505_E	1.937	0.43
616_V	619_A	1.934	0.43
516_A	527_G	1.918	0.42
495_E	501_E	1.901	0.41
283_I	435_L	1.893	0.41
280_A	402_G	1.876	0.41
353_I	358_L	1.874	0.41
491_G	494_K	1.817	0.39
186_E	192_G	1.812	0.38
461_D	617_V	1.798	0.38
233_I	286_L	1.781	0.37
515_I	520_D	1.751	0.36
315_V	417_D	1.747	0.36
427_F	588_T	1.746	0.36
350_T	364_S	1.739	0.36
258_C	625_Q	1.708	0.35
148_A	555_P	1.687	0.34
368_E	372_A	1.687	0.34
530_R	550_S	1.681	0.34
601_K	632_T	1.667	0.34
313_V	525_A	1.667	0.34
194_I	426_P	1.646	0.33
313_V	633_L	1.642	0.33
185_S	388_T	1.638	0.33
345_I	350_T	1.633	0.33
606_G	626_A	1.627	0.33
251_T	624_R	1.624	0.32
378_H	402_G	1.622	0.32
345_I	462_T	1.621	0.32
388_T	391_D	1.618	0.32
420_G	603_V	1.610	0.32
145_I	149_R	1.610	0.32
395_E	505_E	1.602	0.32
143_Q	383_I	1.602	0.32
243_E	453_R	1.597	0.32
254_L	400_F	1.593	0.31
487_V	491_G	1.586	0.31
257_I	567_A	1.584	0.31
470_S	533_M	1.583	0.31
214_A	365_Q	1.583	0.31
372_A	520_D	1.571	0.31
191_F	329_L	1.537	0.30
581_D	585_L	1.533	0.30
461_D	615_L	1.528	0.30
349_L	469_T	1.517	0.29
588_T	611_H	1.503	0.29
202_Q	381_C	1.491	0.28
195_Y	285_N	1.484	0.28
284_G	356_F	1.472	0.28
495_E	503_G	1.471	0.28
453_R	555_P	1.467	0.28
332_A	631_L	1.455	0.27
495_E	499_A	1.452	0.27
457_L	552_F	1.448	0.27
414_P	514_Y	1.445	0.27
244_A	462_T	1.444	0.27
338_V	452_K	1.432	0.27
598_T	605_A	1.424	0.27
236_V	337_D	1.406	0.26
147_V	283_I	1.404	0.26
313_V	562_A	1.403	0.26
510_V	550_S	1.402	0.26
486_E	500_R	1.401	0.26
427_F	603_V	1.401	0.26
206_E	446_L	1.386	0.26
240_K	392_L	1.386	0.26
510_V	528_L	1.385	0.26
470_S	547_V	1.384	0.26
444_Y	622_A	1.383	0.26
250_Q	581_D	1.381	0.25
393_T	602_K	1.378	0.25
167_S	518_D	1.378	0.25
394_S	399_V	1.370	0.25
161_D	414_P	1.366	0.25
241_I	289_Y	1.365	0.25
261_V	562_A	1.360	0.25
257_I	334_V	1.347	0.25
235_L	452_K	1.341	0.24
507_Q	622_A	1.335	0.24
264_Q	284_G	1.334	0.24
390_S	522_R	1.330	0.24
499_A	506_F	1.327	0.24
334_V	631_L	1.319	0.24
415_H	547_V	1.310	0.24
217_A	252_S	1.304	0.23
315_V	515_I	1.295	0.23
383_I	478_V	1.293	0.23
183_S	241_I	1.290	0.23
263_P	287_E	1.285	0.23
490_P	494_K	1.284	0.23
254_L	305_K	1.280	0.23
183_S	387_I	1.278	0.23
481_A	526_V	1.270	0.23
217_A	258_C	1.270	0.23
226_H	399_V	1.269	0.23
148_A	399_V	1.261	0.22
497_V	611_H	1.260	0.22
168_A	183_S	1.252	0.22
178_G	198_L	1.245	0.22
559_L	601_K	1.242	0.22
236_V	252_S	1.241	0.22
442_E	476_A	1.240	0.22
396_Y	630_M	1.236	0.22
552_F	562_A	1.232	0.22
313_V	402_G	1.229	0.22
206_E	233_I	1.224	0.22
394_S	518_D	1.218	0.21
183_S	548_A	1.218	0.21
338_V	611_H	1.218	0.21
353_I	475_A	1.217	0.21
349_L	358_L	1.216	0.21
324_G	595_P	1.211	0.21
499_A	502_E	1.206	0.21
239_G	524_T	1.205	0.21
182_I	190_H	1.203	0.21
315_V	636_T	1.202	0.21
495_E	502_E	1.201	0.21
401_I	577_G	1.196	0.21
467_L	585_L	1.192	0.21
264_Q	356_F	1.192	0.21
402_G	606_G	1.192	0.21
148_A	152_K	1.190	0.21
498_N	501_E	1.188	0.21
518_D	522_R	1.187	0.21
596_T	622_A	1.185	0.21
368_E	520_D	1.183	0.21
391_D	396_Y	1.180	0.21
185_S	399_V	1.180	0.21
147_V	339_F	1.180	0.21
187_R	352_G	1.168	0.20
157_K	390_S	1.165	0.20
240_K	453_R	1.163	0.20
284_G	416_E	1.163	0.20
206_E	620_M	1.163	0.20
280_A	514_Y	1.162	0.20
335_Q	401_I	1.161	0.20
249_H	370_F	1.160	0.20
215_E	628_R	1.158	0.20
519_E	630_M	1.157	0.20
427_F	561_M	1.154	0.20
310_S	532_A	1.154	0.20
160_S	522_R	1.146	0.20
311_E	397_D	1.136	0.20
562_A	599_H	1.136	0.20
401_I	576_S	1.133	0.19
257_I	309_R	1.131	0.19
327_D	432_T	1.129	0.19
235_L	240_K	1.122	0.19
483_R	489_M	1.115	0.19
248_C	290_I	1.113	0.19
253_S	258_C	1.112	0.19
441_S	444_Y	1.107	0.19
252_S	365_Q	1.105	0.19
252_S	566_Q	1.104	0.19
155_A	159_S	1.104	0.19
416_E	482_Y	1.103	0.19
376_D	620_M	1.101	0.19
417_D	621_A	1.100	0.19
198_L	562_A	1.100	0.19
244_A	314_A	1.095	0.19
155_A	442_E	1.095	0.19
495_E	498_N	1.094	0.19
231_D	275_K	1.093	0.19
421_V	524_T	1.092	0.19
281_V	620_M	1.088	0.18
407_G	588_T	1.088	0.18
248_C	251_T	1.087	0.18
285_N	439_P	1.079	0.18
600_L	603_V	1.079	0.18
408_M	415_H	1.078	0.18
172_P	630_M	1.075	0.18
278_S	437_G	1.074	0.18
239_G	619_A	1.073	0.18
357_K	615_L	1.072	0.18
188_K	290_I	1.064	0.18
177_K	520_D	1.061	0.18
207_S	502_E	1.056	0.18
427_F	449_V	1.055	0.18
270_G	603_V	1.053	0.18
513_Q	529_I	1.051	0.18
462_T	565_F	1.047	0.18
349_L	382_E	1.044	0.18
184_A	336_V	1.043	0.18
376_D	522_R	1.042	0.18
254_L	609_A	1.032	0.17
316_I	625_Q	1.029	0.17
534_G	542_R	1.023	0.17
339_F	513_Q	1.021	0.17
341_R	461_D	1.021	0.17
187_R	193_E	1.021	0.17
159_S	162_A	1.020	0.17
376_D	414_P	1.019	0.17
516_A	553_E	1.019	0.17
348_M	617_V	1.016	0.17
315_V	322_G	1.013	0.17
387_I	519_E	1.011	0.17
232_Y	258_C	1.010	0.17
149_R	153_T	1.008	0.17
202_Q	316_I	1.007	0.17
408_M	423_Q	1.003	0.17
227_N	366_R	1.003	0.17
187_R	260_R	1.002	0.17
468_R	503_G	1.001	0.17
421_V	455_V	1.000	0.17
520_D	526_V	0.996	0.17
357_K	366_R	0.994	0.17
551_E	563_F	0.992	0.17
288_R	468_R	0.991	0.17
361_T	376_D	0.990	0.17
264_Q	287_E	0.987	0.16
275_K	397_D	0.987	0.16
151_R	395_E	0.985	0.16
361_T	527_G	0.984	0.16
173_V	368_E	0.984	0.16
387_I	580_L	0.981	0.16
604_F	629_D	0.981	0.16
602_K	630_M	0.977	0.16
191_F	598_T	0.972	0.16
258_C	622_A	0.971	0.16
203_A	233_I	0.971	0.16
227_N	565_F	0.967	0.16
398_A	527_G	0.966	0.16
176_R	459_G	0.966	0.16
205_Y	604_F	0.965	0.16
264_Q	416_E	0.964	0.16
316_I	573_L	0.963	0.16
366_R	615_L	0.962	0.16
391_D	522_R	0.954	0.16
281_V	377_F	0.951	0.16
331_R	616_V	0.950	0.16
192_G	576_S	0.949	0.16
339_F	383_I	0.946	0.16
489_M	606_G	0.945	0.16
322_G	352_G	0.944	0.16
165_S	383_I	0.943	0.16
482_Y	499_A	0.942	0.16
516_A	524_T	0.941	0.16
170_L	173_V	0.940	0.16
590_D	595_P	0.939	0.16
236_V	372_A	0.939	0.16
316_I	378_H	0.935	0.15
315_V	391_D	0.933	0.15
405_T	602_K	0.931	0.15
562_A	598_T	0.931	0.15
252_S	293_T	0.927	0.15
200_P	395_E	0.924	0.15
520_D	601_K	0.923	0.15
606_G	609_A	0.920	0.15
449_V	452_K	0.919	0.15
170_L	276_D	0.917	0.15
193_E	384_G	0.916	0.15
359_D	494_K	0.915	0.15
251_T	611_H	0.914	0.15
356_F	613_A	0.912	0.15
378_H	473_L	0.911	0.15
188_K	385_R	0.911	0.15
559_L	611_H	0.910	0.15
598_T	603_V	0.908	0.15
468_R	502_E	0.908	0.15
221_W	340_D	0.908	0.15
501_E	506_F	0.906	0.15
211_V	348_M	0.906	0.15
217_A	554_L	0.905	0.15
386_D	621_A	0.904	0.15
457_L	602_K	0.902	0.15
233_I	519_E	0.901	0.15
179_A	197_G	0.901	0.15
176_R	469_T	0.897	0.15
483_R	534_G	0.892	0.15
483_R	490_P	0.890	0.15
284_G	613_A	0.889	0.15
405_T	425_L	0.886	0.15
254_L	402_G	0.886	0.15
391_D	599_H	0.885	0.15
424_A	598_T	0.884	0.15
490_P	606_G	0.884	0.15
146_K	549_G	0.884	0.15
471_I	504_V	0.879	0.14
178_G	313_V	0.878	0.14
547_V	550_S	0.876	0.14
495_E	512_P	0.876	0.14
383_I	518_D	0.874	0.14
357_K	461_D	0.873	0.14
248_C	280_A	0.872	0.14
226_H	279_G	0.871	0.14
195_Y	198_L	0.871	0.14
193_E	352_G	0.870	0.14
588_T	629_D	0.869	0.14
227_N	263_P	0.867	0.14
246_E	281_V	0.867	0.14
220_N	617_V	0.866	0.14
427_F	470_S	0.864	0.14
185_S	387_I	0.863	0.14
396_Y	538_P	0.862	0.14
401_I	591_V	0.861	0.14
150_Q	153_T	0.861	0.14
375_I	616_V	0.860	0.14
350_T	367_R	0.860	0.14
368_E	457_L	0.859	0.14
470_S	591_V	0.857	0.14
313_V	630_M	0.855	0.14
407_G	488_S	0.853	0.14
368_E	371_T	0.852	0.14
260_R	352_G	0.852	0.14
274_L	581_D	0.848	0.14
253_S	291_T	0.848	0.14
214_A	252_S	0.848	0.14
186_E	401_I	0.847	0.14
464_M	468_R	0.846	0.14
214_A	559_L	0.845	0.14
603_V	626_A	0.842	0.14
391_D	413_L	0.841	0.14
256_E	348_M	0.839	0.14
146_K	315_V	0.837	0.14
381_C	387_I	0.837	0.14
495_E	506_F	0.837	0.14
585_L	622_A	0.834	0.14
158_A	162_A	0.833	0.14
183_S	372_A	0.833	0.14
490_P	506_F	0.832	0.14
177_K	514_Y	0.831	0.14
498_N	503_G	0.831	0.14
413_L	516_A	0.829	0.14
359_D	366_R	0.827	0.14
469_T	531_T	0.826	0.14
315_V	389_F	0.825	0.14
261_V	321_A	0.823	0.14
483_R	506_F	0.819	0.13
362_V	368_E	0.818	0.13
233_I	328_I	0.816	0.13
389_F	529_I	0.815	0.13
337_D	514_Y	0.812	0.13
206_E	235_L	0.807	0.13
166_R	183_S	0.807	0.13
173_V	590_D	0.807	0.13
484_R	536_P	0.806	0.13
344_E	462_T	0.806	0.13
541_R	610_V	0.805	0.13
393_T	600_L	0.804	0.13
499_A	504_V	0.803	0.13
217_A	585_L	0.801	0.13
183_S	339_F	0.801	0.13
207_S	630_M	0.800	0.13
562_A	619_A	0.800	0.13
254_L	489_M	0.796	0.13
571_P	620_M	0.794	0.13
598_T	619_A	0.793	0.13
309_R	567_A	0.792	0.13
160_S	477_S	0.791	0.13
625_Q	629_D	0.790	0.13
210_C	213_C	0.790	0.13
210_C	564_G	0.790	0.13
213_C	564_G	0.790	0.13
367_R	597_Q	0.790	0.13
338_V	469_T	0.789	0.13
248_C	302_D	0.788	0.13
284_G	287_E	0.787	0.13
424_A	431_H	0.786	0.13
267_L	617_V	0.786	0.13
378_H	395_E	0.785	0.13
398_A	409_M	0.785	0.13
153_T	383_I	0.785	0.13
177_K	339_F	0.784	0.13
528_L	630_M	0.781	0.13
208_D	300_R	0.781	0.13
157_K	633_L	0.777	0.13
522_R	580_L	0.775	0.13
514_Y	524_T	0.774	0.13
462_T	611_H	0.769	0.13
236_V	414_P	0.767	0.13
496_V	503_G	0.766	0.13
325_C	344_E	0.765	0.13
506_F	606_G	0.762	0.13
207_S	311_E	0.761	0.13
356_F	568_H	0.761	0.13
254_L	365_Q	0.761	0.13
612_G	616_V	0.759	0.13
456_V	530_R	0.756	0.12
400_F	490_P	0.755	0.12
148_A	157_K	0.755	0.12
203_A	589_G	0.754	0.12
335_Q	376_D	0.753	0.12
190_H	441_S	0.751	0.12
228_A	231_D	0.751	0.12
142_L	515_I	0.750	0.12
327_D	466_C	0.750	0.12
527_G	551_E	0.749	0.12
194_I	578_I	0.747	0.12
402_G	437_G	0.746	0.12
377_F	504_V	0.745	0.12
487_V	490_P	0.745	0.12
187_R	322_G	0.744	0.12
184_A	206_E	0.744	0.12
206_E	310_S	0.742	0.12
217_A	467_L	0.741	0.12
287_E	356_F	0.741	0.12
483_R	486_E	0.740	0.12
283_I	296_A	0.739	0.12
283_I	340_D	0.738	0.12
372_A	381_C	0.738	0.12
244_A	469_T	0.738	0.12
253_S	469_T	0.737	0.12
526_V	543_R	0.736	0.12
212_Y	257_I	0.736	0.12
440_E	443_E	0.732	0.12
318_A	340_D	0.728	0.12
534_G	541_R	0.728	0.12
212_Y	217_A	0.726	0.12
185_S	442_E	0.724	0.12
361_T	394_S	0.720	0.12
578_I	603_V	0.720	0.12
226_H	419_P	0.718	0.12
532_A	579_K	0.717	0.12
180_D	202_Q	0.717	0.12
321_A	524_T	0.715	0.12
469_T	565_F	0.715	0.12
175_S	373_M	0.715	0.12
227_N	615_L	0.714	0.12
255_P	287_E	0.714	0.12
193_E	260_R	0.713	0.12
250_Q	548_A	0.713	0.12
464_M	495_E	0.711	0.12
356_F	416_E	0.711	0.12
496_V	501_E	0.709	0.12
364_S	367_R	0.709	0.12
419_P	560_I	0.707	0.12
232_Y	287_E	0.707	0.12
165_S	579_K	0.707	0.12
231_D	558_V	0.703	0.12
149_R	280_A	0.702	0.12
228_A	304_S	0.701	0.12
400_F	626_A	0.701	0.12
396_Y	625_Q	0.700	0.12
552_F	609_A	0.696	0.12
253_S	280_A	0.696	0.12
418_A	457_L	0.695	0.12
525_A	555_P	0.694	0.12
258_C	566_Q	0.694	0.12
376_D	449_V	0.691	0.12
482_Y	534_G	0.691	0.12
168_A	368_E	0.689	0.11
325_C	331_R	0.688	0.11
254_L	606_G	0.688	0.11
588_T	622_A	0.687	0.11
155_A	632_T	0.683	0.11
142_L	145_I	0.681	0.11
192_G	240_K	0.681	0.11
184_A	394_S	0.681	0.11
235_L	238_E	0.676	0.11
405_T	429_T	0.675	0.11
148_A	155_A	0.675	0.11
466_C	617_V	0.675	0.11
148_A	316_I	0.675	0.11
249_H	273_T	0.673	0.11
484_R	534_G	0.667	0.11
431_H	611_H	0.667	0.11
516_A	575_G	0.665	0.11
478_V	581_D	0.665	0.11
182_I	206_E	0.665	0.11
418_A	603_V	0.663	0.11
162_A	388_T	0.663	0.11
334_V	480_C	0.661	0.11
353_I	512_P	0.661	0.11
467_L	478_V	0.659	0.11
377_F	462_T	0.659	0.11
286_L	337_D	0.658	0.11
214_A	424_A	0.654	0.11
170_L	622_A	0.653	0.11
257_I	332_A	0.651	0.11
394_S	450_E	0.650	0.11
439_P	443_E	0.650	0.11
161_D	307_V	0.649	0.11
334_V	486_E	0.648	0.11
300_R	364_S	0.646	0.11
241_I	302_D	0.645	0.11
192_G	271_A	0.645	0.11
234_R	257_I	0.644	0.11
477_S	562_A	0.644	0.11
339_F	442_E	0.643	0.11
336_V	516_A	0.643	0.11
504_V	526_V	0.641	0.11
258_C	590_D	0.637	0.11
529_I	546_P	0.636	0.11
288_R	495_E	0.635	0.11
230_P	352_G	0.635	0.11
475_A	542_R	0.634	0.11
290_I	299_W	0.634	0.11
353_I	360_K	0.634	0.11
507_Q	513_Q	0.632	0.11
415_H	448_D	0.632	0.11
492_S	615_L	0.632	0.11
536_P	542_R	0.629	0.11
206_E	232_Y	0.629	0.11
158_A	183_S	0.629	0.11
261_V	420_G	0.628	0.11
232_Y	286_L	0.628	0.11
366_R	565_F	0.628	0.11
180_D	200_P	0.627	0.11
240_K	388_T	0.627	0.11
207_S	280_A	0.626	0.11
269_E	611_H	0.625	0.11
222_H	370_F	0.625	0.11
383_I	394_S	0.625	0.11
199_D	629_D	0.624	0.11
201_Q	234_R	0.623	0.11
149_R	396_Y	0.622	0.11
416_E	484_R	0.621	0.11
497_V	633_L	0.620	0.11
151_R	518_D	0.619	0.11
282_S	286_L	0.618	0.11
232_Y	282_S	0.618	0.11
587_Q	601_K	0.616	0.10
339_F	412_D	0.616	0.10
413_L	417_D	0.616	0.10
297_M	475_A	0.616	0.10
157_K	271_A	0.616	0.10
245_A	363_L	0.615	0.10
527_G	586_I	0.615	0.10
193_E	292_D	0.614	0.10
352_G	627_A	0.614	0.10
202_Q	584_G	0.614	0.10
449_V	560_I	0.613	0.10
500_R	503_G	0.613	0.10
386_D	400_F	0.612	0.10
527_G	591_V	0.610	0.10
371_T	440_E	0.610	0.10
227_N	357_K	0.610	0.10
561_M	620_M	0.608	0.10
183_S	538_P	0.608	0.10
343_P	446_L	0.607	0.10
151_R	189_T	0.606	0.10
161_D	583_W	0.605	0.10
164_P	361_T	0.603	0.10
349_L	475_A	0.602	0.10
481_A	501_E	0.602	0.10
185_S	200_P	0.601	0.10
158_A	161_D	0.600	0.10
284_G	568_H	0.597	0.10
267_L	461_D	0.597	0.10
366_R	568_H	0.594	0.10
479_T	487_V	0.592	0.10
316_I	562_A	0.592	0.10
324_G	514_Y	0.591	0.10
163_Q	442_E	0.591	0.10
156_G	518_D	0.589	0.10
280_A	315_V	0.589	0.10
184_A	248_C	0.589	0.10
513_Q	562_A	0.589	0.10
252_S	529_I	0.588	0.10
348_M	609_A	0.587	0.10
157_K	376_D	0.585	0.10
269_E	469_T	0.585	0.10
579_K	599_H	0.585	0.10
220_N	231_D	0.584	0.10
227_N	290_I	0.584	0.10
385_R	532_A	0.583	0.10
338_V	504_V	0.583	0.10
331_R	421_V	0.582	0.10
195_Y	375_I	0.581	0.10
455_V	573_L	0.581	0.10
380_N	394_S	0.580	0.10
212_Y	234_R	0.578	0.10
214_A	280_A	0.578	0.10
344_E	469_T	0.578	0.10
206_E	295_L	0.578	0.10
410_R	568_H	0.577	0.10
225_L	267_L	0.576	0.10
241_I	373_M	0.576	0.10
168_A	361_T	0.576	0.10
417_D	524_T	0.576	0.10
345_I	497_V	0.576	0.10
376_D	453_R	0.575	0.10
150_Q	157_K	0.574	0.10
198_L	214_A	0.572	0.10
484_R	503_G	0.570	0.10
343_P	568_H	0.570	0.10
164_P	169_A	0.570	0.10
423_Q	488_S	0.570	0.10
187_R	269_E	0.569	0.10
385_R	589_G	0.568	0.10
373_M	376_D	0.565	0.10
394_S	514_Y	0.564	0.10
336_V	634_F	0.563	0.10
537_G	541_R	0.562	0.10
543_R	583_W	0.561	0.10
263_P	284_G	0.561	0.10
177_K	527_G	0.561	0.10
156_G	240_K	0.560	0.10
381_C	589_G	0.559	0.10
143_Q	587_Q	0.559	0.10
264_Q	482_Y	0.558	0.10
155_A	160_S	0.557	0.10
554_L	609_A	0.555	0.10
264_Q	613_A	0.555	0.10
423_Q	611_H	0.553	0.10
251_T	338_V	0.552	0.10
325_C	462_T	0.551	0.10
273_T	471_I	0.551	0.10
388_T	599_H	0.550	0.10
532_A	595_P	0.549	0.10
483_R	542_R	0.549	0.10
199_D	437_G	0.549	0.10
336_V	375_I	0.548	0.10
179_A	232_Y	0.548	0.10
155_A	580_L	0.548	0.10
240_K	457_L	0.548	0.10
463_T	502_E	0.545	0.10
302_D	340_D	0.545	0.10
316_I	528_L	0.545	0.10
160_S	189_T	0.544	0.10
484_R	489_M	0.544	0.10
283_I	533_M	0.542	0.10
509_N	512_P	0.541	0.10
514_Y	586_I	0.541	0.10
198_L	245_A	0.538	0.10
148_A	518_D	0.534	0.09
244_A	251_T	0.532	0.09
568_H	613_A	0.532	0.09
300_R	632_T	0.532	0.09
615_L	618_T	0.532	0.09
409_M	531_T	0.531	0.09
243_E	402_G	0.531	0.09
212_Y	318_A	0.529	0.09
518_D	545_R	0.529	0.09
157_K	170_L	0.528	0.09
322_G	383_I	0.528	0.09
357_K	491_G	0.527	0.09
492_S	614_D	0.527	0.09
244_A	299_W	0.527	0.09
389_F	574_Q	0.527	0.09
160_S	321_A	0.527	0.09
235_L	243_E	0.527	0.09
233_I	499_A	0.526	0.09
462_T	630_M	0.526	0.09
484_R	491_G	0.526	0.09
442_E	518_D	0.525	0.09
383_I	399_V	0.525	0.09
495_E	542_R	0.525	0.09
285_N	565_F	0.523	0.09
407_G	537_G	0.522	0.09
252_S	532_A	0.521	0.09
207_S	463_T	0.521	0.09
341_R	426_P	0.520	0.09
310_S	339_F	0.520	0.09
377_F	450_E	0.516	0.09
343_P	425_L	0.516	0.09
330_A	599_H	0.516	0.09
554_L	625_Q	0.516	0.09
214_A	324_G	0.516	0.09
263_P	624_R	0.516	0.09
341_R	357_K	0.516	0.09
284_G	482_Y	0.515	0.09
150_Q	301_P	0.514	0.09
249_H	301_P	0.514	0.09
153_T	526_V	0.513	0.09
477_S	633_L	0.512	0.09
186_E	442_E	0.511	0.09
195_Y	613_A	0.511	0.09
286_L	336_V	0.511	0.09
357_K	565_F	0.511	0.09
339_F	520_D	0.510	0.09
392_L	579_K	0.510	0.09
419_P	426_P	0.509	0.09
252_S	507_Q	0.509	0.09
348_M	432_T	0.508	0.09
310_S	474_N	0.508	0.09
318_A	325_C	0.507	0.09
466_C	565_F	0.507	0.09
601_K	604_F	0.507	0.09
519_E	578_I	0.506	0.09
306_V	373_M	0.506	0.09
199_D	579_K	0.506	0.09
243_E	469_T	0.506	0.09
170_L	409_M	0.504	0.09
255_P	349_L	0.504	0.09
263_P	475_A	0.504	0.09
478_V	562_A	0.504	0.09
401_I	590_D	0.504	0.09
457_L	600_L	0.503	0.09
461_D	491_G	0.503	0.09
294_A	312_K	0.503	0.09
513_Q	516_A	0.503	0.09
236_V	336_V	0.502	0.09
397_D	424_A	0.501	0.09
519_E	522_R	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4ylfB	1	0.7214	100	0.587	Contact Map
1gteA	4	0.77	100	0.592	Contact Map
2vdcG	1	0.6964	100	0.597	Contact Map
1cjcA	1	0.4914	100	0.817	Contact Map
1lqtA	1	0.4898	100	0.827	Contact Map
1mo9A	2	0.5133	100	0.837	Contact Map
1hyuA	2	0.6995	100	0.843	Contact Map
3ctyA	2	0.4491	100	0.847	Contact Map
1vdcA	2	0.4679	100	0.849	Contact Map
2q0lA	2	0.4476	100	0.852	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0125 seconds.