YNJE - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YNJE - Thiosulfate sulfurtransferase YnjE

UniProt:	P78067	Sequences: MKRVSQMTALAMALGLACASSWAAELAKPLTLDQLQQQNGKAIDTRPSAFYNGWPQTLNGPSGHELAALNLSASWLDKMSTEQLNAWIKQHNLKTDAPVALYGNDKDVDAVKTRLQKAGLTHISILSDALSEPSRLQKLPHFEQLVYPQWLHDLQQGKEVTAKPAGDWKVIEAAWGAPKLYLISHIPGADYIDTNEVESEPLWNKVSDEQLKAMLAKHGIRHDTTVILYGRDVYAAARVAQIMLYAGVKDVRLLDGGWQTWSDAGLPVERGTPPKVKAEPDFGVKIPAQPQLMLDMEQARGLLHRQDASLVSIRSWPEFIGTTSGYSYIKPKGEIAGARWGHAGSDSTHMEDFHNPDGTMRSADDITAMWKAWNIKPEQQVSFYCGTGWRASETFMYARAMGWKNVSVYDGGWYEWSSDPKNPVATGERGPDSSK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG14007
Length:	435 (408)
Sequences:	138 (98)
Seq/√Len:	4.9

ECOLI - YNJE

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
152_H	156_Q	4.899	0.96
345_S	351_E	4.229	0.92
338_A	409_Y	4.054	0.90
237_A	253_L	3.652	0.84
387_T	410_D	3.159	0.74
31_T	100_A	3.125	0.73
395_F	408_V	3.098	0.72
91_H	365_D	3.063	0.71
411_G	415_E	3.057	0.71
66_L	136_L	2.864	0.66
387_T	411_G	2.836	0.65
317_P	322_T	2.748	0.62
71_L	103_G	2.584	0.57
189_A	228_L	2.582	0.57
329_I	411_G	2.516	0.55
331_P	340_W	2.499	0.54
147_Y	266_L	2.426	0.52
194_T	198_E	2.398	0.51
123_I	249_K	2.387	0.51
204_N	387_T	2.314	0.49
150_W	387_T	2.308	0.48
93_L	120_L	2.302	0.48
193_D	293_M	2.250	0.46
97_A	273_P	2.249	0.46
212_K	216_A	2.240	0.46
204_N	410_D	2.238	0.46
329_I	387_T	2.235	0.46
229_Y	411_G	2.211	0.45
326_Y	412_G	2.192	0.45
229_Y	329_I	2.146	0.43
43_I	69_L	2.121	0.42
150_W	229_Y	2.118	0.42
284_V	288_A	2.116	0.42
150_W	411_G	2.097	0.42
28_K	126_L	2.078	0.41
361_R	365_D	2.070	0.41
70_N	362_S	2.019	0.39
157_G	160_V	2.017	0.39
229_Y	387_T	2.007	0.39
174_A	191_Y	1.962	0.38
110_A	123_I	1.938	0.37
213_A	353_F	1.932	0.37
208_D	369_M	1.918	0.36
150_W	186_I	1.896	0.36
33_D	405_N	1.896	0.36
153_D	158_K	1.886	0.35
84_L	311_V	1.884	0.35
104_N	107_D	1.874	0.35
126_L	334_E	1.867	0.35
319_F	322_T	1.826	0.34
171_I	335_I	1.815	0.33
139_L	392_S	1.811	0.33
91_H	300_R	1.788	0.32
204_N	329_I	1.782	0.32
354_H	393_E	1.781	0.32
126_L	339_R	1.777	0.32
26_L	31_T	1.774	0.32
101_L	169_K	1.764	0.32
205_K	295_D	1.746	0.31
93_L	167_D	1.737	0.31
138_K	228_L	1.736	0.31
184_S	379_Q	1.721	0.31
229_Y	410_D	1.712	0.30
51_Y	76_L	1.690	0.30
335_I	414_Y	1.666	0.29
203_W	328_Y	1.660	0.29
224_T	387_T	1.648	0.29
246_A	290_P	1.631	0.28
334_E	417_S	1.618	0.28
266_L	334_E	1.612	0.28
48_S	355_N	1.604	0.28
215_L	243_M	1.599	0.27
283_G	412_G	1.598	0.27
43_I	99_V	1.557	0.26
203_W	326_Y	1.542	0.26
150_W	329_I	1.540	0.26
208_D	360_M	1.523	0.26
42_A	98_P	1.509	0.25
266_L	303_L	1.504	0.25
329_I	410_D	1.501	0.25
104_N	161_T	1.494	0.25
154_L	227_I	1.492	0.25
108_V	379_Q	1.486	0.25
45_T	111_V	1.484	0.25
268_V	396_M	1.471	0.24
322_T	371_K	1.466	0.24
121_T	159_E	1.464	0.24
28_K	427_G	1.460	0.24
172_E	225_T	1.457	0.24
48_S	70_N	1.457	0.24
269_E	273_P	1.438	0.24
283_G	290_P	1.436	0.23
304_H	368_A	1.420	0.23
236_A	408_V	1.419	0.23
246_A	312_S	1.415	0.23
206_V	340_W	1.411	0.23
384_Y	411_G	1.407	0.23
186_I	224_T	1.406	0.23
65_E	255_D	1.403	0.23
186_I	229_Y	1.401	0.23
53_G	63_G	1.400	0.23
44_D	63_G	1.400	0.23
329_I	414_Y	1.392	0.22
115_L	407_S	1.391	0.22
243_M	392_S	1.388	0.22
176_G	391_A	1.381	0.22
316_W	320_I	1.378	0.22
62_S	138_K	1.372	0.22
208_D	382_S	1.364	0.22
215_L	350_M	1.363	0.22
50_F	136_L	1.362	0.22
55_P	115_L	1.358	0.22
50_F	66_L	1.355	0.22
394_T	400_A	1.353	0.22
28_K	429_R	1.352	0.22
139_L	246_A	1.346	0.21
70_N	356_P	1.333	0.21
150_W	204_N	1.327	0.21
54_W	417_S	1.326	0.21
360_M	397_Y	1.319	0.21
44_D	53_G	1.317	0.21
205_K	354_H	1.314	0.21
24_A	249_K	1.313	0.21
246_A	403_W	1.311	0.21
150_W	410_D	1.310	0.21
316_W	346_D	1.309	0.21
130_L	136_L	1.291	0.20
119_G	283_G	1.287	0.20
169_K	176_G	1.268	0.20
364_D	368_A	1.260	0.20
142_F	257_G	1.255	0.20
142_F	298_Q	1.254	0.20
49_A	129_A	1.252	0.19
242_I	408_V	1.251	0.19
109_D	140_P	1.249	0.19
43_I	291_Q	1.248	0.19
348_T	363_A	1.241	0.19
204_N	411_G	1.234	0.19
208_D	397_Y	1.229	0.19
26_L	34_Q	1.225	0.19
187_P	336_A	1.224	0.19
104_N	273_P	1.220	0.19
352_D	411_G	1.219	0.19
328_Y	412_G	1.215	0.19
248_V	282_F	1.213	0.19
58_L	281_D	1.212	0.19
94_K	249_K	1.211	0.19
126_L	129_A	1.210	0.19
281_D	380_Q	1.189	0.18
315_S	411_G	1.179	0.18
172_E	397_Y	1.178	0.18
191_Y	195_N	1.178	0.18
101_L	201_P	1.177	0.18
151_L	265_G	1.177	0.18
27_A	140_P	1.175	0.18
61_P	136_L	1.163	0.18
289_Q	294_L	1.163	0.18
352_D	414_Y	1.156	0.18
170_V	228_L	1.154	0.18
207_S	377_P	1.153	0.18
245_Y	393_E	1.144	0.17
50_F	56_Q	1.140	0.17
201_P	341_G	1.138	0.17
255_D	374_N	1.134	0.17
188_G	229_Y	1.134	0.17
302_L	380_Q	1.134	0.17
66_L	138_K	1.129	0.17
363_A	369_M	1.125	0.17
103_G	193_D	1.124	0.17
249_K	421_K	1.123	0.17
173_A	340_W	1.116	0.17
332_K	427_G	1.116	0.17
142_F	374_N	1.112	0.17
192_I	218_H	1.110	0.17
192_I	239_V	1.103	0.17
45_T	101_L	1.102	0.17
187_P	303_L	1.099	0.17
384_Y	415_E	1.096	0.17
150_W	224_T	1.093	0.17
329_I	352_D	1.090	0.16
331_P	336_A	1.085	0.16
105_D	190_D	1.084	0.16
277_K	297_E	1.077	0.16
245_Y	360_M	1.076	0.16
169_K	313_I	1.075	0.16
119_G	325_G	1.073	0.16
383_F	412_G	1.070	0.16
46_R	63_G	1.070	0.16
92_N	132_E	1.070	0.16
313_I	352_D	1.062	0.16
129_A	311_V	1.058	0.16
324_S	386_G	1.058	0.16
204_N	229_Y	1.057	0.16
360_M	393_E	1.052	0.16
88_I	263_D	1.047	0.16
157_G	235_A	1.047	0.16
215_L	312_S	1.044	0.16
51_Y	290_P	1.043	0.16
422_N	427_G	1.026	0.15
104_N	227_I	1.025	0.15
384_Y	410_D	1.024	0.15
61_P	429_R	1.023	0.15
229_Y	352_D	1.022	0.15
94_K	277_K	1.021	0.15
228_L	291_Q	1.021	0.15
300_R	322_T	1.018	0.15
105_D	108_V	1.017	0.15
352_D	387_T	1.006	0.15
46_R	53_G	0.997	0.15
158_K	311_V	0.995	0.15
312_S	392_S	0.994	0.15
300_R	303_L	0.993	0.15
194_T	417_S	0.990	0.15
238_R	389_W	0.989	0.15
282_F	290_P	0.988	0.15
343_A	382_S	0.982	0.15
224_T	377_P	0.976	0.15
362_S	395_F	0.969	0.14
67_A	76_L	0.968	0.14
177_A	273_P	0.966	0.14
320_I	427_G	0.963	0.14
203_W	412_G	0.961	0.14
248_V	325_G	0.959	0.14
260_T	311_V	0.957	0.14
96_D	115_L	0.956	0.14
257_G	370_W	0.950	0.14
172_E	239_V	0.948	0.14
28_K	31_T	0.947	0.14
355_N	393_E	0.947	0.14
309_S	384_Y	0.939	0.14
310_L	337_G	0.937	0.14
286_I	332_K	0.935	0.14
60_G	123_I	0.935	0.14
103_G	191_Y	0.933	0.14
311_V	426_T	0.933	0.14
132_E	364_D	0.931	0.14
194_T	412_G	0.928	0.14
158_K	165_A	0.926	0.14
309_S	379_Q	0.925	0.14
111_V	399_R	0.924	0.14
344_G	387_T	0.917	0.14
209_E	404_K	0.916	0.14
41_K	168_W	0.915	0.14
115_L	341_G	0.914	0.14
310_L	341_G	0.912	0.14
99_V	292_L	0.911	0.14
146_V	402_G	0.911	0.14
286_I	290_P	0.910	0.14
345_S	349_H	0.910	0.14
181_Y	402_G	0.908	0.13
92_N	242_I	0.905	0.13
54_W	184_S	0.904	0.13
125_I	166_G	0.897	0.13
346_D	349_H	0.894	0.13
324_S	412_G	0.894	0.13
218_H	381_V	0.893	0.13
193_D	259_Q	0.889	0.13
321_G	416_W	0.888	0.13
344_G	370_W	0.888	0.13
298_Q	340_W	0.888	0.13
224_T	410_D	0.888	0.13
240_A	393_E	0.886	0.13
298_Q	336_A	0.885	0.13
302_L	305_R	0.880	0.13
54_W	181_Y	0.880	0.13
149_Q	153_D	0.879	0.13
229_Y	315_S	0.879	0.13
384_Y	387_T	0.878	0.13
206_V	331_P	0.874	0.13
248_V	359_T	0.872	0.13
283_G	328_Y	0.868	0.13
204_N	384_Y	0.868	0.13
66_L	379_Q	0.864	0.13
212_K	286_I	0.863	0.13
212_K	285_K	0.862	0.13
27_A	322_T	0.859	0.13
133_P	317_P	0.852	0.13
327_S	414_Y	0.852	0.13
208_D	394_T	0.849	0.13
67_A	153_D	0.849	0.13
37_Q	159_E	0.849	0.13
95_T	143_E	0.846	0.13
116_Q	398_A	0.844	0.13
22_W	51_Y	0.844	0.13
65_E	100_A	0.843	0.13
156_Q	209_E	0.841	0.13
377_P	410_D	0.840	0.13
55_P	307_D	0.839	0.12
54_W	245_Y	0.839	0.12
188_G	329_I	0.838	0.12
264_A	281_D	0.832	0.12
207_S	343_A	0.830	0.12
343_A	352_D	0.828	0.12
151_L	207_S	0.828	0.12
164_P	209_E	0.823	0.12
99_V	115_L	0.822	0.12
58_L	112_K	0.821	0.12
255_D	289_Q	0.818	0.12
73_A	110_A	0.817	0.12
376_K	379_Q	0.814	0.12
23_A	30_L	0.812	0.12
411_G	414_Y	0.811	0.12
81_T	338_A	0.810	0.12
312_S	381_V	0.806	0.12
194_T	337_G	0.800	0.12
170_V	353_F	0.799	0.12
174_A	195_N	0.798	0.12
54_W	240_A	0.797	0.12
127_S	132_E	0.795	0.12
139_L	191_Y	0.795	0.12
203_W	325_G	0.794	0.12
31_T	136_L	0.794	0.12
283_G	326_Y	0.793	0.12
130_L	265_G	0.789	0.12
41_K	99_V	0.789	0.12
106_K	131_S	0.787	0.12
319_F	364_D	0.786	0.12
230_G	355_N	0.786	0.12
58_L	62_S	0.785	0.12
145_L	237_A	0.784	0.12
370_W	390_R	0.784	0.12
117_K	275_K	0.783	0.12
30_L	34_Q	0.780	0.12
283_G	325_G	0.778	0.12
298_Q	331_P	0.777	0.12
216_A	280_P	0.776	0.12
343_A	362_S	0.774	0.12
172_E	254_L	0.774	0.12
381_V	403_W	0.774	0.12
150_W	352_D	0.773	0.12
318_E	390_R	0.772	0.12
191_Y	312_S	0.772	0.12
67_A	186_I	0.770	0.12
332_K	419_D	0.770	0.12
279_E	429_R	0.770	0.12
27_A	76_L	0.768	0.12
199_S	387_T	0.768	0.12
94_K	221_R	0.767	0.12
138_K	259_Q	0.766	0.12
59_N	66_L	0.765	0.11
150_W	415_E	0.764	0.11
204_N	346_D	0.763	0.11
66_L	424_V	0.760	0.11
188_G	281_D	0.759	0.11
42_A	95_T	0.759	0.11
370_W	398_A	0.757	0.11
154_L	163_K	0.757	0.11
109_D	125_I	0.756	0.11
249_K	275_K	0.755	0.11
245_Y	355_N	0.753	0.11
70_N	397_Y	0.752	0.11
223_D	228_L	0.751	0.11
254_L	403_W	0.750	0.11
148_P	217_K	0.749	0.11
169_K	397_Y	0.749	0.11
212_K	409_Y	0.747	0.11
72_S	175_W	0.747	0.11
148_P	266_L	0.744	0.11
154_L	226_V	0.744	0.11
52_N	194_T	0.743	0.11
138_K	173_A	0.743	0.11
61_P	320_I	0.742	0.11
145_L	220_I	0.741	0.11
297_E	422_N	0.741	0.11
242_I	293_M	0.740	0.11
316_W	341_G	0.740	0.11
131_S	319_F	0.738	0.11
239_V	243_M	0.736	0.11
146_V	252_R	0.733	0.11
295_D	387_T	0.732	0.11
26_L	135_R	0.731	0.11
120_L	163_K	0.731	0.11
205_K	313_I	0.730	0.11
49_A	147_Y	0.728	0.11
74_S	217_K	0.726	0.11
43_I	215_L	0.726	0.11
146_V	186_I	0.725	0.11
282_F	325_G	0.723	0.11
337_G	361_R	0.723	0.11
71_L	75_W	0.722	0.11
170_V	402_G	0.722	0.11
36_Q	168_W	0.719	0.11
233_V	408_V	0.715	0.11
71_L	268_V	0.715	0.11
326_Y	383_F	0.715	0.11
35_L	170_V	0.714	0.11
107_D	193_D	0.712	0.11
207_S	419_D	0.712	0.11
211_L	398_A	0.707	0.11
93_L	174_A	0.707	0.11
332_K	345_S	0.703	0.11
324_S	328_Y	0.700	0.11
235_A	269_E	0.700	0.11
37_Q	51_Y	0.699	0.11
198_E	311_V	0.699	0.11
26_L	37_Q	0.697	0.11
265_G	337_G	0.695	0.11
139_L	312_S	0.693	0.11
265_G	301_G	0.693	0.11
52_N	265_G	0.692	0.11
75_W	357_D	0.691	0.11
96_D	121_T	0.691	0.11
38_Q	122_H	0.689	0.11
211_L	337_G	0.689	0.11
332_K	346_D	0.687	0.11
37_Q	140_P	0.687	0.11
289_Q	391_A	0.686	0.11
344_G	352_D	0.685	0.10
295_D	313_I	0.684	0.10
293_M	394_T	0.683	0.10
200_E	384_Y	0.682	0.10
246_A	286_I	0.682	0.10
172_E	269_E	0.681	0.10
211_L	422_N	0.681	0.10
198_E	251_V	0.678	0.10
213_A	285_K	0.677	0.10
93_L	122_H	0.677	0.10
247_G	357_D	0.676	0.10
346_D	411_G	0.676	0.10
42_A	209_E	0.674	0.10
340_W	384_Y	0.674	0.10
360_M	395_F	0.672	0.10
35_L	281_D	0.672	0.10
154_L	315_S	0.670	0.10
386_G	416_W	0.670	0.10
138_K	405_N	0.669	0.10
173_A	268_V	0.666	0.10
387_T	415_E	0.666	0.10
229_Y	313_I	0.665	0.10
102_Y	282_F	0.665	0.10
321_G	417_S	0.664	0.10
204_N	224_T	0.663	0.10
251_V	318_E	0.661	0.10
119_G	391_A	0.660	0.10
329_I	384_Y	0.658	0.10
173_A	194_T	0.658	0.10
261_W	333_G	0.656	0.10
175_W	193_D	0.656	0.10
26_L	366_I	0.655	0.10
111_V	409_Y	0.655	0.10
60_G	285_K	0.654	0.10
281_D	296_M	0.651	0.10
355_N	398_A	0.650	0.10
148_P	223_D	0.650	0.10
155_Q	281_D	0.649	0.10
300_R	422_N	0.648	0.10
83_Q	209_E	0.648	0.10
235_A	343_A	0.647	0.10
31_T	41_K	0.645	0.10
215_L	392_S	0.645	0.10
33_D	37_Q	0.645	0.10
103_G	139_L	0.644	0.10
23_A	26_L	0.641	0.10
68_A	389_W	0.638	0.10
175_W	327_S	0.635	0.10
79_M	403_W	0.634	0.10
100_A	190_D	0.633	0.10
199_S	410_D	0.630	0.10
298_Q	372_A	0.629	0.10
89_K	404_K	0.625	0.10
71_L	89_K	0.624	0.10
26_L	29_P	0.624	0.10
115_L	167_D	0.624	0.10
40_G	137_Q	0.623	0.10
175_W	391_A	0.622	0.10
277_K	285_K	0.620	0.10
102_Y	247_G	0.620	0.10
190_D	268_V	0.620	0.10
22_W	25_E	0.620	0.10
350_M	394_T	0.619	0.10
224_T	245_Y	0.616	0.10
193_D	336_A	0.616	0.10
312_S	329_I	0.615	0.10
324_S	346_D	0.614	0.10
312_S	403_W	0.613	0.10
232_D	384_Y	0.613	0.10
240_A	245_Y	0.613	0.10
56_Q	227_I	0.607	0.10
24_A	34_Q	0.607	0.10
171_I	290_P	0.607	0.10
155_Q	188_G	0.606	0.10
245_Y	354_H	0.606	0.10
150_W	344_G	0.604	0.10
245_Y	398_A	0.603	0.10
21_S	35_L	0.603	0.10
247_G	389_W	0.603	0.10
329_I	346_D	0.603	0.10
91_H	361_R	0.601	0.10
159_E	297_E	0.599	0.10
319_F	323_T	0.598	0.09
205_K	230_G	0.597	0.09
367_T	401_M	0.595	0.09
172_E	201_P	0.595	0.09
224_T	392_S	0.594	0.09
325_G	386_G	0.589	0.09
188_G	406_V	0.589	0.09
246_A	392_S	0.587	0.09
258_W	275_K	0.586	0.09
225_T	346_D	0.586	0.09
147_Y	403_W	0.585	0.09
256_G	359_T	0.584	0.09
54_W	393_E	0.583	0.09
224_T	411_G	0.583	0.09
313_I	394_T	0.582	0.09
151_L	286_I	0.581	0.09
33_D	39_N	0.581	0.09
143_E	292_L	0.581	0.09
118_A	139_L	0.579	0.09
262_S	276_V	0.578	0.09
205_K	224_T	0.578	0.09
62_S	300_R	0.577	0.09
203_W	283_G	0.576	0.09
136_L	302_L	0.575	0.09
144_Q	207_S	0.575	0.09
68_A	383_F	0.574	0.09
23_A	95_T	0.573	0.09
188_G	220_I	0.569	0.09
310_L	369_M	0.567	0.09
29_P	32_L	0.567	0.09
59_N	123_I	0.567	0.09
43_I	127_S	0.566	0.09
315_S	415_E	0.565	0.09
241_Q	396_M	0.564	0.09
313_I	401_M	0.562	0.09
140_P	155_Q	0.562	0.09
245_Y	257_G	0.561	0.09
244_L	396_M	0.561	0.09
396_M	410_D	0.560	0.09
99_V	120_L	0.560	0.09
52_N	255_D	0.560	0.09
60_G	125_I	0.560	0.09
245_Y	407_S	0.559	0.09
188_G	228_L	0.559	0.09
198_E	389_W	0.557	0.09
66_L	137_Q	0.557	0.09
332_K	422_N	0.557	0.09
119_G	248_V	0.556	0.09
248_V	412_G	0.556	0.09
52_N	310_L	0.556	0.09
186_I	320_I	0.556	0.09
198_E	417_S	0.555	0.09
169_K	175_W	0.554	0.09
350_M	400_A	0.554	0.09
229_Y	384_Y	0.554	0.09
171_I	307_D	0.553	0.09
69_L	127_S	0.553	0.09
42_A	401_M	0.550	0.09
70_N	339_R	0.549	0.09
194_T	203_W	0.549	0.09
28_K	61_P	0.548	0.09
109_D	249_K	0.547	0.09
195_N	395_F	0.546	0.09
191_Y	231_R	0.546	0.09
159_E	322_T	0.546	0.09
163_K	168_W	0.545	0.09
222_H	284_V	0.545	0.09
26_L	55_P	0.545	0.09
27_A	306_Q	0.542	0.09
329_I	415_E	0.541	0.09
330_K	379_Q	0.539	0.09
198_E	361_R	0.539	0.09
39_N	305_R	0.539	0.09
348_T	408_V	0.538	0.09
31_T	254_L	0.537	0.09
201_P	352_D	0.537	0.09
198_E	266_L	0.536	0.09
313_I	353_F	0.536	0.09
66_L	288_A	0.534	0.09
112_K	136_L	0.533	0.09
75_W	391_A	0.532	0.09
124_S	350_M	0.528	0.09
201_P	204_N	0.528	0.09
160_V	429_R	0.527	0.09
186_I	387_T	0.526	0.09
185_H	416_W	0.526	0.09
255_D	354_H	0.526	0.09
344_G	411_G	0.525	0.09
171_I	348_T	0.525	0.09
136_L	306_Q	0.525	0.09
195_N	205_K	0.525	0.09
282_F	328_Y	0.522	0.09
340_W	411_G	0.521	0.09
329_I	344_G	0.521	0.09
194_T	310_L	0.520	0.09
195_N	244_L	0.519	0.09
65_E	71_L	0.519	0.09
303_L	361_R	0.516	0.09
277_K	353_F	0.516	0.09
72_S	192_I	0.516	0.09
52_N	311_V	0.516	0.09
218_H	270_R	0.515	0.09
257_G	271_G	0.515	0.09
23_A	31_T	0.514	0.09
222_H	249_K	0.513	0.09
118_A	381_V	0.511	0.09
67_A	151_L	0.511	0.09
230_G	293_M	0.510	0.09
35_L	105_D	0.510	0.09
87_W	365_D	0.509	0.09
194_T	311_V	0.509	0.09
315_S	378_E	0.509	0.09
345_S	353_F	0.509	0.09
370_W	388_G	0.507	0.09
84_L	115_L	0.506	0.09
204_N	344_G	0.505	0.09
27_A	33_D	0.504	0.09
95_T	398_A	0.503	0.08
39_N	47_P	0.503	0.08
224_T	295_D	0.501	0.08
197_V	239_V	0.500	0.08
167_D	227_I	0.500	0.08
181_Y	240_A	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2wlrA	1	0.9356	100	0.573	Contact Map
1rhsA	1	0.6391	100	0.732	Contact Map
1urhA	1	0.5747	100	0.733	Contact Map
1yt8A	1	0.8	100	0.734	Contact Map
3aayA	1	0.6184	100	0.738	Contact Map
1uarA	1	0.6161	100	0.739	Contact Map
1e0cA	1	0.6138	100	0.741	Contact Map
3hzuA	2	0.6529	100	0.744	Contact Map
3utnX	1	0.6391	100	0.744	Contact Map
4jgtA	1	0.6161	100	0.744	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0123 seconds.